Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9418
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9418, 378 aa
1>>>pF1KE9418 378 - 378 aa - 378 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7361+/-0.000997; mu= 14.5286+/- 0.059
mean_var=84.1239+/-21.272, 0's: 0 Z-trim(105.0): 77 B-trim: 1030 in 2/47
Lambda= 0.139835
statistics sampled from 8115 (8196) to 8115 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16
Scan time: 2.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4661.1 MAS1L gene_id:116511|Hs108|chr6 ( 378) 2558 526.2 1.8e-149
CCDS5272.1 MAS1 gene_id:4142|Hs108|chr6 ( 325) 563 123.7 2.3e-28
CCDS41603.2 MRGPRE gene_id:116534|Hs108|chr11 ( 312) 473 105.5 6.6e-23
CCDS8188.1 MRGPRF gene_id:116535|Hs108|chr11 ( 343) 471 105.1 9.4e-23
CCDS7846.1 MRGPRX1 gene_id:259249|Hs108|chr11 ( 322) 465 103.9 2.1e-22
CCDS7830.1 MRGPRX3 gene_id:117195|Hs108|chr11 ( 322) 437 98.3 1e-20
CCDS7847.1 MRGPRX2 gene_id:117194|Hs108|chr11 ( 330) 426 96.1 5e-20
CCDS31625.1 MRGPRD gene_id:116512|Hs108|chr11 ( 321) 412 93.2 3.4e-19
CCDS7831.1 MRGPRX4 gene_id:117196|Hs108|chr11 ( 322) 412 93.2 3.4e-19
CCDS44520.1 MRGPRG gene_id:386746|Hs108|chr11 ( 289) 367 84.1 1.7e-16
>>CCDS4661.1 MAS1L gene_id:116511|Hs108|chr6 (378 aa)
initn: 2558 init1: 2558 opt: 2558 Z-score: 2796.7 bits: 526.2 E(32554): 1.8e-149
Smith-Waterman score: 2558; 100.0% identity (100.0% similar) in 378 aa overlap (1-378:1-378)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MVWGKICWFSQRAGWTVFAESQISLSCSLCLHSGDQEAQNPNLVSQLCGVFLQNETNETI
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CCDS46 MVWGKICWFSQRAGWTVFAESQISLSCSLCLHSGDQEAQNPNLVSQLCGVFLQNETNETI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 HMQMSMAVGQQALPLNIIAPKAVLVSLCGVLLNGTVFWLLCCGATNPYMVYILHLVAADV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HMQMSMAVGQQALPLNIIAPKAVLVSLCGVLLNGTVFWLLCCGATNPYMVYILHLVAADV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 IYLCCSAVGFLQVTLLTYHGVVFFIPDFLAILSPFSFEVCLCLLVAISTERCVCVLFPIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IYLCCSAVGFLQVTLLTYHGVVFFIPDFLAILSPFSFEVCLCLLVAISTERCVCVLFPIW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 YRCHRPKYTSNVVCTLIWGLPFCINIVKSLFLTYWKHVKACVIFLKLSGLFHAILSLVMC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YRCHRPKYTSNVVCTLIWGLPFCINIVKSLFLTYWKHVKACVIFLKLSGLFHAILSLVMC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 VSSLTLLIRFLCCSQQQKATRVYAVVQISAPMFLLWALPLSVAPLITDFKMFVTTSYLIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VSSLTLLIRFLCCSQQQKATRVYAVVQISAPMFLLWALPLSVAPLITDFKMFVTTSYLIS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 LFLIINSSANPIIYFFVGSLRKKRLKESLRVILQRALADKPEVGRNKKAAGIDPMEQPHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LFLIINSSANPIIYFFVGSLRKKRLKESLRVILQRALADKPEVGRNKKAAGIDPMEQPHS
310 320 330 340 350 360
370
pF1KE9 TQHVENLLPREHRVDVET
::::::::::::::::::
CCDS46 TQHVENLLPREHRVDVET
370
>>CCDS5272.1 MAS1 gene_id:4142|Hs108|chr6 (325 aa)
initn: 502 init1: 224 opt: 563 Z-score: 622.6 bits: 123.7 E(32554): 2.3e-28
Smith-Waterman score: 563; 32.5% identity (63.7% similar) in 317 aa overlap (45-347:4-313)
20 30 40 50 60 70
pF1KE9 WTVFAESQISLSCSLCLHSGDQEAQNPNLVSQLCGVFLQNETNETIHMQMSMAVGQQALP
:.. . ... :: . . :.. ... .:
CCDS52 MDGSNVTSFVVEEPTNISTGRNASVGNAHRQIP
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE9 LNIIAPKAVLVSLCGVLLNGTVFWLLCCGAT-NPYMVYILHLVAADVIYLCCS---AVGF
:. . .: : . :: ..:.:: ::. ::: :: ::. : : .. .
CCDS52 --IVHWVIMSISPVGFVENGILLWFLCFRMRRNPFTVYITHLSIADISLLFCIFILSIDY
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180
pF1KE9 -LQVTLLTYHGVVFFIPDFLAILSPFSFEVCLCLLVAISTERCVCVLFPIWYRCHRPKYT
:. : . : .. :.. :.... : ::.:::.:::. ::.:::::::::::
CCDS52 ALDYELSSGH---YYTIVTLSVTFLFGYNTGLYLLTAISVERCLSVLYPIWYRCHRPKYQ
100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 SNVVCTLIWGLPFCINIVKSLFLTYWKH-------VKACVIFLKLSGLFHAILSLVMCVS
: .::.:.:.: .. .. .. .. .: .::. . ... ... .: ::
CCDS52 SALVCALLWALSCLVTTMEYVMCIDREEESHSRNDCRAVIIFIAILSFL--VFTPLMLVS
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 SLTLLIRFLCCSQQQKATRVYAVVQISAPMFLLWALPLSVAPLI--TDFKMFVTTSYLIS
: :.... . ......: :.... .::..:.:. . :. .. : . ..
CCDS52 STILVVKIRKNTWASHSSKLYIVIMVTIIIFLIFAMPMRLLYLLYYEYWSTFGNLHHISL
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 LFLIINSSANPIIYFFVGSLRKKRLKESLRVILQRALADKPEVGRNKKAAGIDPMEQPHS
:: :::::::.::::::: .:::.::::.:.: ::. :. . :.:
CCDS52 LFSTINSSANPFIYFFVGSSKKKRFKESLKVVLTRAFKDEMQPRRQKDNCNTVTVETVV
270 280 290 300 310 320
370
pF1KE9 TQHVENLLPREHRVDVET
>>CCDS41603.2 MRGPRE gene_id:116534|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 455 init1: 259 opt: 473 Z-score: 524.7 bits: 105.5 E(32554): 6.6e-23
Smith-Waterman score: 473; 31.7% identity (62.7% similar) in 268 aa overlap (85-344:34-297)
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 ETNETIHMQMSMAVGQQALPLNIIAPKAVLVSLCGVLLNGTVFWLLCCGA-TNPYMVYIL
..: :.: ::.:.::: .. ::. .:.:
CCDS41 PREAGQHVGAANGAQEDVAFNLIILSLTEGLGLGGLLGNGAVLWLLSSNVYRNPFAIYLL
10 20 30 40 50 60
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 HLVAADVIYLCCSAVGFLQVTLLTYHGVVFFIPDFLAILSPFSFEVCLCLLVAISTERCV
.. ::.:.: : :... : :. :: : : . : : ::.:.:.:.:.
CCDS41 DVACADLIFLGCHMVAIVPDLLQGRLDFPGFVQTSLATLRFFCYIVGLSLLAAVSVEQCL
70 80 90 100 110 120
180 190 200 210 220
pF1KE9 CVLFPIWYRCHRPKYTSNVVCTLIWGLPFCINIVKS-----LFLTYWKHVKACVIFLKLS
.::: :: :.::.. .. ::.: :.: . .... : .: .:. : . ..
CCDS41 AALFPAWYSCRRPRHLTTCVCALTWALCLLLHLLLSGACTQFFGEPSRHL--CRTLWLVA
130 140 150 160 170 180
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 GLFHAILSLVMCVSSLTLLIRFLCCSQQQKATRVYAVVQISAPMFLLWALPLSVAPLITD
... :.: .:: .:: ::.: :. ... ... .::. .::... : .
CCDS41 AVLLALLCCTMCGASLMLLLRVERGPQRPPPRGFPGLILLTVLLFLFCGLPFGIYWLSRN
190 200 210 220 230 240
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 FKMFVTTSYLISLFLI--INSSANPIIYFFVGSLRKKRLKESLRVILQRALADKPEVGRN
. .. . ::. .. .:.:..:: .:: . .:: ::..:::::.:. :.:
CCDS41 LLWYIPHYFYHFSFLMAAVHCAAKPVVYFCLGSAQGRRL--PLRLVLQRALGDEAELGAV
250 260 270 280 290
350 360 370
pF1KE9 KKAAGIDPMEQPHSTQHVENLLPREHRVDVET
CCDS41 RETSRRGLVDIAA
300 310
>>CCDS8188.1 MRGPRF gene_id:116535|Hs108|chr11 (343 aa)
initn: 441 init1: 232 opt: 471 Z-score: 521.9 bits: 105.1 E(32554): 9.4e-23
Smith-Waterman score: 471; 30.4% identity (58.5% similar) in 349 aa overlap (26-354:4-328)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MVWGKICWFSQRAGWTVFAESQISLSCSLCLHSGDQEAQNPNLVSQLCGVFLQNETNETI
.:: : :... . :.: .:. : .
CCDS81 MAGNCSWEAHPGNRNKMCPGL----------SEAPE-L
10 20
70 80 90 100 110
pF1KE9 HMQMSMAVGQQAL--PLNIIAPKAVLVSLCGVLLNGTVFWLLCCGAT-NPYMVYILHLVA
. . ... : :. : .. .:. :::.. :: :.:.. . ::. .:.:::..
CCDS81 YSRGFLTIEQIAMLPPPAVMNYIFLLLCLCGLVGNGLVLWFFGFSIKRNPFSIYFLHLAS
30 40 50 60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 ADVIYLCCSAVGFLQVTLLTYHGVVFFIPDFLA----ILSPFSFEVCLCLLVAISTERCV
::: :: .:: ..:. : . . :.. .:. : . . :: :.:.:::.
CCDS81 ADVGYLFSKAV----FSILNTGGFLGTFADYIRSVCRVLGLCMFLTGVSLLPAVSAERCA
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 CVLFPIWYRCHRPKYTSNVVCTLIWGLPF---CINIVKSLFLTYWKHVKACVIFLKLSGL
:.:: :: .::: : :::.:.: : . :.. .:: :: . .
CCDS81 SVIFPAWYWRRRPKRLSAVVCALLWVLSLLVTCLHNYFCVFLGRGAPGAAC----RHMDI
150 160 170 180 190
240 250 260 270 280
pF1KE9 FHAILSLVMC-----VSSLTLLIRFLC-CSQQQKATRVYAVVQISAPMFLLWALPLSVAP
: .:: ...: . :.:... : ..:..... :. . .::. .. :..
CCDS81 FLGILLFLLCCPLMVLPCLALILHVECRARRRQRSAKLNHVILAMVSVFLVSSIYLGIDW
200 210 220 230 240 250
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 LITDFKMFVTTS----YLISLFLIINSSANPIIYFFVGSLRKKRLKESLRVILQRALADK
.. : .: . :. .: . :::::.::.::..: ...:: : :::..:::: :
CCDS81 FL--FWVFQIPAPFPEYVTDLCICINSSAKPIVYFLAGRDKSQRLWEPLRVVFQRALRDG
260 270 280 290 300 310
350 360 370
pF1KE9 PEVGRNKKAAGIDPMEQPHSTQHVENLLPREHRVDVET
:.: .:.: :
CCDS81 AELG---EAGGSTPNTVTMEMQCPPGNAS
320 330 340
>>CCDS7846.1 MRGPRX1 gene_id:259249|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 593 init1: 223 opt: 465 Z-score: 515.8 bits: 103.9 E(32554): 2.1e-22
Smith-Waterman score: 609; 39.2% identity (67.8% similar) in 286 aa overlap (70-343:25-301)
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 NPNLVSQLCGVFLQNETNETIHMQMSMAVGQQALPLNIIAPKAVLVSLCGVLLNGTVFWL
.:.: :... . .::: :. :..:.::
CCDS78 MDPTISTLDTELTPINGTEETLCYKQTLSLTVL---TCIVSLVGLTGNAVVLWL
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 LCCGAT-NPYMVYILHLVAADVIYLCCSAVGFLQVTLLTYHGVVFFIPDFLAILSPFSFE
: : : . .:::.:.::: ..: : : .::.. .. : .: . ::.
CCDS78 LGCRMRRNAFSIYILNLAAADFLFLS----GRLIYSLLSFISIPHTISKILYPVMMFSYF
60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 VCLCLLVAISTERCVCVLFPIWYRCHRPKYTSNVVCTLIWGLPFCINIVKSL---FLTYW
. : .: :.:::::. ::.::::::::: . : :::.:.:.: . .:.. . ::
CCDS78 AGLSFLSAVSTERCLSVLWPIWYRCHRPTHLSAVVCVLLWALSLLRSILEWMLCGFLFSG
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 KHVKACVI--FLKLSGLFHAILSLVMCVSSLTLLIRFLCCSQQQKATRVYAVVQISAPMF
: :. .. :. .: .:.: :::.::::.:: :.. ::.:... ... .:
CCDS78 ADSAWCQTSDFITVAWLI--FLCVVLCGSSLVLLIRILCGSRKIPLTRLYVTILLTVLVF
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320
pF1KE9 LLWALPLSVAPLI-----TDFKMFVTTSYLISLFL-IINSSANPIIYFFVGSLRKKRLKE
:: .::... .. .: ... .:.:.:: .::::::::::::::.:... ..
CCDS78 LLCGLPFGIQFFLFLWIHVDREVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQ
230 240 250 260 270 280
330 340 350 360 370
pF1KE9 SLRVILQRALADKPEVGRNKKAAGIDPMEQPHSTQHVENLLPREHRVDVET
.:...::::: : ::
CCDS78 NLKLVLQRALQDASEVDEGGGQLPEEILELSGSRLEQ
290 300 310 320
>>CCDS7830.1 MRGPRX3 gene_id:117195|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 561 init1: 186 opt: 437 Z-score: 485.3 bits: 98.3 E(32554): 1e-20
Smith-Waterman score: 593; 37.7% identity (68.3% similar) in 284 aa overlap (84-356:36-311)
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 NETNETIHMQMSMAVGQQALPLNIIAPKAVLVSLCGVLLNGTVFWLLCCGAT-NPYMVYI
.::: .. :..:.::: : : .::
CCDS78 PVLGTELTPINGREETPCYKQTLSFTGLTCIVSLVALTGNAVVLWLLGCRMRRNAVSIYI
10 20 30 40 50 60
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 LHLVAADVIYLCCSAVGFLQVTLLTYHGVVFFIPDFLAILSPFSFEVCLCLLVAISTERC
:.::::: ..: : . . : .. : .:. . : . . : .: :::::::
CCDS78 LNLVAADFLFLS----GHIICSPLRLINIRHPISKILSPVMTFPYFIGLSMLSAISTERC
70 80 90 100 110 120
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 VCVLFPIWYRCHRPKYTSNVVCTLIWGLPFCINIVKSLFLTYWKHVKACVIFLKLSGLFH
. .:.::::.:.::.: :.:.:.:.:.: . .:.. .: . : .. . : ..
CCDS78 LSILWPIWYHCRRPRYLSSVMCVLLWALSLLRSILEWMFCDFL-FSGANSVWCETSDFIT
130 140 150 160 170 180
240 250 260 270 280
pF1KE9 ----AILSLVMCVSSLTLLIRFLCCSQQQKATRVYAVVQISAPMFLLWALPLSVA-PLIT
..: .:.: :::.::.:.:: :... ::.:... ... .::: .::... :..
CCDS78 IAWLVFLCVVLCGSSLVLLVRILCGSRKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGIQWALFS
190 200 210 220 230 240
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 ----DFKMFVTTSYLISLFL-IINSSANPIIYFFVGSLRKKRLKESLRVILQRALADKPE
:.:.. .:.:.:: .::::::::::::::.:... ...:...::::: : ::
CCDS78 RIHLDWKVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDTPE
250 260 270 280 290 300
350 360 370
pF1KE9 VGRNKKAAGIDPMEQPHSTQHVENLLPREHRVDVET
: ...: :.:
CCDS78 VD---EGGGWLPQETLELSGSRLEQ
310 320
>>CCDS7847.1 MRGPRX2 gene_id:117194|Hs108|chr11 (330 aa)
initn: 532 init1: 271 opt: 426 Z-score: 473.1 bits: 96.1 E(32554): 5e-20
Smith-Waterman score: 551; 34.9% identity (65.8% similar) in 292 aa overlap (69-347:27-314)
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 QNPNLVSQLCGVFLQNETNETIHMQMSMAVGQQAL-PLNIIAPKAVLVSLCGVLLNGTVF
:...: :. .: ....: :.. :: :.
CCDS78 MDPTTPAWGTESTTVNGNDQALLLLCGKETLIPVFLI----LFIALVGLVGNGFVL
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 WLLCCGAT-NPYMVYILHLVAADVIYLCCSAVGFLQVTLLTYHGVVFFIPDFLAILSPFS
::: : . ::.: :..:: ..:: . .. : . .. . .:.:.. . .
CCDS78 WLLGFRMRRNAFSVYVLSLAGADFLFLCFQIINCLVYLSNFFCSISINFPSFFTTVMTCA
60 70 80 90 100 110
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 FEVCLCLLVAISTERCVCVLFPIWYRCHRPKYTSNVVCTLIWGLPFCINIVKSLFLTYW-
. . : .: ..:::::. ::.::::::.::.. : :::.:.:.: . ..:... : .
CCDS78 YLAGLSMLSTVSTERCLSVLWPIWYRCRRPRHLSAVVCVLLWALSLLLSILEGKFCGFLF
120 130 140 150 160 170
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 --KHVKACVIFLKLSGLFHAILSLVMCVSSLTLLIRFLCCSQQQKATRVYAVVQISAPMF
: : ... . .: .:.: :::.::.:.:: :. ::.: .. ... .:
CCDS78 SDGDSGWCQTFDFITAAWLIFLFMVLCGSSLALLVRILCGSRGLPLTRLYLTILLTVLVF
180 190 200 210 220 230
280 290 300 310 320
pF1KE9 LLWALPLSVAPLIT-----DFKMFVTTSYLISLFLI-INSSANPIIYFFVGSLRKK-RLK
:: .::... .. : .. . .:. : .::::::::::::::.::. ::.
CCDS78 LLCGLPFGIQWFLILWIWKDSDVLFCHIHPVSVVLSSLNSSANPIIYFFVGSFRKQWRLQ
240 250 260 270 280 290
330 340 350 360 370
pF1KE9 ES-LRVILQRALADKPEVGRNKKAAGIDPMEQPHSTQHVENLLPREHRVDVET
. :.. ::::: : :: ...
CCDS78 QPILKLALQRALQDIAEVDHSEGCFRQGTPEMSRSSLV
300 310 320 330
>>CCDS31625.1 MRGPRD gene_id:116512|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 433 init1: 257 opt: 412 Z-score: 458.0 bits: 93.2 E(32554): 3.4e-19
Smith-Waterman score: 529; 36.0% identity (65.4% similar) in 292 aa overlap (77-355:29-319)
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 LCGVFLQNETNETIHMQMSMAVGQQALPLNIIAPKAVLVSLCGVLLNGTVFWLLCCGA-T
... :... :::. :. :.:::
CCDS31 MNQTLNSSGTVESALNYSRGSTVHTAYLVLSSLAMFTCLCGMAGNSMVIWLLGFRMHR
10 20 30 40 50
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 NPYMVYILHLVAADVIYLCCSAVGFLQVTLLTYHGVVFFIPDFLAILSPFSFEVCLCLLV
::. .:::.:.:::...: : .. :.. ... . ... : :.. : : ::.
CCDS31 NPFCIYILNLAAADLLFLF-SMASTLSLETQPLVNTTDKVHELMKRLMYFAYTVGLSLLT
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