FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1955, 513 aa 1>>>pF1KE1955 513 - 513 aa - 513 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3906+/-0.000768; mu= 6.4858+/- 0.047 mean_var=197.9787+/-39.921, 0's: 0 Z-trim(116.5): 47 B-trim: 85 in 1/50 Lambda= 0.091152 statistics sampled from 17067 (17114) to 17067 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.809), E-opt: 0.2 (0.526), width: 16 Scan time: 4.000 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4503.1 BMP6 gene_id:654|Hs108|chr6 ( 513) 3570 481.5 9.7e-136 CCDS4958.1 BMP5 gene_id:653|Hs108|chr6 ( 454) 1643 228.0 1.7e-59 CCDS13455.1 BMP7 gene_id:655|Hs108|chr20 ( 431) 1591 221.2 1.9e-57 CCDS444.1 BMP8B gene_id:656|Hs108|chr1 ( 402) 1153 163.6 3.9e-40 CCDS437.1 BMP8A gene_id:353500|Hs108|chr1 ( 402) 1152 163.4 4.2e-40 CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20 ( 396) 497 77.3 3.6e-14 CCDS13254.1 GDF5 gene_id:8200|Hs108|chr20 ( 501) 497 77.4 4.3e-14 CCDS9715.1 BMP4 gene_id:652|Hs108|chr14 ( 408) 492 76.6 5.7e-14 CCDS8581.1 GDF3 gene_id:9573|Hs108|chr12 ( 364) 444 70.3 4.2e-12 CCDS1701.1 GDF7 gene_id:151449|Hs108|chr2 ( 450) 438 69.6 8.5e-12 CCDS34926.1 GDF6 gene_id:392255|Hs108|chr8 ( 455) 437 69.5 9.4e-12 >>CCDS4503.1 BMP6 gene_id:654|Hs108|chr6 (513 aa) initn: 3570 init1: 3570 opt: 3570 Z-score: 2550.4 bits: 481.5 E(32554): 9.7e-136 Smith-Waterman score: 3570; 99.8% identity (100.0% similar) in 513 aa overlap (1-513:1-513) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MPGLGRRAQWLCWWWGLLCSCCGPPPLQPPLPAAAAAAAGGQLLGDGGSPGRTEQPPPSP :::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 MPGLGRRAQWLCWWWGLLCSCCGPPPLRPPLPAAAAAAAGGQLLGDGGSPGRTEQPPPSP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 QSSSGFLYRRLKTQEKREMQKEILSVLGLPHRPRPLHGLQQPQPPALRQQEEQQQQQQLP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 QSSSGFLYRRLKTQEKREMQKEILSVLGLPHRPRPLHGLQQPQPPALRQQEEQQQQQQLP 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 RGEPPPGRLKSAPLFMLDLYNALSADNDEDGASEGERQQSWPHEAASSSQRRQPPPGAAH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 RGEPPPGRLKSAPLFMLDLYNALSADNDEDGASEGERQQSWPHEAASSSQRRQPPPGAAH 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 PLNRKSLLAPGSGSGGASPLTSAQDSAFLNDADMVMSFVNLVEYDKEFSPRQRHHKEFKF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 PLNRKSLLAPGSGSGGASPLTSAQDSAFLNDADMVMSFVNLVEYDKEFSPRQRHHKEFKF 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 NLSQIPEGEVVTAAEFRIYKDCVMGSFKNQTFLISIYQVLQEHQHRDSDLFLLDTRVVWA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 NLSQIPEGEVVTAAEFRIYKDCVMGSFKNQTFLISIYQVLQEHQHRDSDLFLLDTRVVWA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 SEEGWLEFDITATSNLWVVTPQHNMGLQLSVVTRDGVHVHPRAAGLVGRDGPYDKQPFMV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 SEEGWLEFDITATSNLWVVTPQHNMGLQLSVVTRDGVHVHPRAAGLVGRDGPYDKQPFMV 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 AFFKVSEVHVRTTRSASSRRRQQSRNRSTQSQDVARVSSASDYNSSELKTACRKHELYVS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 AFFKVSEVHVRTTRSASSRRRQQSRNRSTQSQDVARVSSASDYNSSELKTACRKHELYVS 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 FQDLGWQDWIIAPKGYAANYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMNPEYVPKPCCAP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 FQDLGWQDWIIAPKGYAANYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMNPEYVPKPCCAP 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KE1 TKLNAISVLYFDDNSNVILKKYRNMVVRACGCH ::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 TKLNAISVLYFDDNSNVILKKYRNMVVRACGCH 490 500 510 >>CCDS4958.1 BMP5 gene_id:653|Hs108|chr6 (454 aa) initn: 1074 init1: 810 opt: 1643 Z-score: 1181.6 bits: 228.0 E(32554): 1.7e-59 Smith-Waterman score: 1742; 59.4% identity (79.6% similar) in 451 aa overlap (64-513:36-454) 40 50 60 70 80 90 pF1KE1 AAAAAAGGQLLGDGGSPGRTEQPPPSPQSSSGFLYRRLKTQEKREMQKEILSVLGLPHRP :.:.::::...:.::.:.::::.::::::: CCDS49 FLLKGIVGFLWSCWVLVGYAKGGLGDNHVHSSFIYRRLRNHERREIQREILSILGLPHRP 10 20 30 40 50 60 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 RPLHGLQQPQPPALRQQEEQQQQQQLPRGEPPPGRL-KSAPLFMLDLYNALSADNDEDGA ::. ::. .::::::::::::.. ... . CCDS49 RPFS----------------------------PGKQASSAPLFMLDLYNAMTNEENPE-E 70 80 90 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 SEGERQQSWPHEAASSSQRRQPPPGAAHPLNRKSLLAPGSGSGGASPLTSAQDSAFLNDA :: . : .:. .... : ..: : .: . . ::.: .:. ::::: CCDS49 SEYSVRASLAEET-RGARKGYPASPNGYP-RRIQLSRTTPLTTQSPPLASLHDTNFLNDA 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 pF1KE1 DMVMSFVNLVEYDKEFSPRQRHHKEFKFNLSQIPEGEVVTAAEFRIYKDCVMGSFKNQTF ::::::::::: ::.:: ..::.:::.:.:.:::.::.::::::::::: . :.:.:. CCDS49 DMVMSFVNLVERDKDFSHQRRHYKEFRFDLTQIPHGEAVTAAEFRIYKDRSNNRFENETI 160 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 LISIYQVLQEHQHRDSDLFLLDTRVVWASEEGWLEFDITATSNLWVVTPQHNMGLQLSVV :::::...:. .::.:::::::: . : . ::: ::::.::: ::..::.:.:::: . CCDS49 KISIYQIIKEYTNRDADLFLLDTRKAQALDVGWLVFDITVTSNHWVINPQNNLGLQLCAE 220 230 240 250 260 270 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 TRDGVHVHPRAAGLVGRDGPYDKQPFMVAFFKVSEVHVRTTRSASSRRRQQSRNRSTQSQ : :: .. ..::::::.:: .::::::::::.::: .:..: :...:..:.::.:.. : CCDS49 TGDGRSINVKSAGLVGRQGPQSKQPFMVAFFKASEVLLRSVR-AANKRKNQNRNKSSSHQ 280 290 300 310 320 330 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 DVARVSSASDYNSSELKTACRKHELYVSFQDLGWQDWIIAPKGYAANYCDGECSFPLNAH : .:.::..:::.:: : ::.::::::::.:::::::::::.:::: ::::::::::::: CCDS49 DSSRMSSVGDYNTSEQKQACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAFYCDGECSFPLNAH 340 350 360 370 380 390 460 470 480 490 500 510 pF1KE1 MNATNHAIVQTLVHLMNPEYVPKPCCAPTKLNAISVLYFDDNSNVILKKYRNMVVRACGC :::::::::::::::: :..:::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::: CCDS49 MNATNHAIVQTLVHLMFPDHVPKPCCAPTKLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRSCGC 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 H : CCDS49 H >>CCDS13455.1 BMP7 gene_id:655|Hs108|chr20 (431 aa) initn: 1829 init1: 1591 opt: 1591 Z-score: 1145.0 bits: 221.2 E(32554): 1.9e-57 Smith-Waterman score: 1772; 60.2% identity (78.9% similar) in 450 aa overlap (64-513:39-431) 40 50 60 70 80 90 pF1KE1 AAAAAAGGQLLGDGGSPGRTEQPPPSPQSSSGFLYRRLKTQEKREMQKEILSVLGLPHRP :.:..:::..::.::::.::::.::::::: CCDS13 AAPHSFVALWAPLFLLRSALADFSLDNEVHSSFIHRRLRSQERREMQREILSILGLPHRP 10 20 30 40 50 60 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 RPLHGLQQPQPPALRQQEEQQQQQQLPRGEPPPGRLKSAPLFMLDLYNALSADNDEDGAS :: : :: :. .:::.::::::::... :.:.. CCDS13 RP-H-LQ--------------------------GKHNSAPMFMLDLYNAMAV---EEGGG 70 80 90 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 EGERQQSWPHEAASSSQRRQPPPGAAHPLNRKSLLAPGSGSGGASPLTSAQDSAFLNDAD : . :.:..:. :.: .: ::.: ::: ::.::: CCDS13 PGGQGFSYPYKAVFSTQ------------------GP--------PLASLQDSHFLTDAD 100 110 120 130 220 230 240 250 260 270 pF1KE1 MVMSFVNLVEYDKEFSPRQRHHKEFKFNLSQIPEGEVVTAAEFRIYKDCVMGSFKNQTFL ::::::::::.:::: . ::.::.:.::.:::::.::::::::::: . : :.:: CCDS13 MVMSFVNLVEHDKEFFHPRYHHREFRFDLSKIPEGEAVTAAEFRIYKDYIRERFDNETFR 140 150 160 170 180 190 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 ISIYQVLQEHQHRDSDLFLLDTRVVWASEEGWLEFDITATSNLWVVTPQHNMGLQLSVVT ::.::::::: :.:::::::.:..:::::::: :::::::: :::.:.::.:::::: : CCDS13 ISVYQVLQEHLGRESDLFLLDSRTLWASEEGWLVFDITATSNHWVVNPRHNLGLQLSVET 200 210 220 230 240 250 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 RDGVHVHPRAAGLVGRDGPYDKQPFMVAFFKVSEVHVRTTRSASSRRRQQSRNRSTQSQD :: ..:. :::.:: :: .::::::::::..::: :. ::..:..:.:.:... ..:. CCDS13 LDGQSINPKLAGLIGRHGPQNKQPFMVAFFKATEVHFRSIRSTGSKQRSQNRSKTPKNQE 260 270 280 290 300 310 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 VARVSSASDYNSSELKTACRKHELYVSFQDLGWQDWIIAPKGYAANYCDGECSFPLNAHM . :...... .::. . ::.::::::::.:::::::::::.:::: ::.:::.::::..: CCDS13 ALRMANVAENSSSDQRQACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAYYCEGECAFPLNSYM 320 330 340 350 360 370 460 470 480 490 500 510 pF1KE1 NATNHAIVQTLVHLMNPEYVPKPCCAPTKLNAISVLYFDDNSNVILKKYRNMVVRACGCH :::::::::::::..::: :::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::::: CCDS13 NATNHAIVQTLVHFINPETVPKPCCAPTQLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRACGCH 380 390 400 410 420 430 >>CCDS444.1 BMP8B gene_id:656|Hs108|chr1 (402 aa) initn: 1376 init1: 948 opt: 1153 Z-score: 834.1 bits: 163.6 E(32554): 3.9e-40 Smith-Waterman score: 1282; 46.5% identity (68.4% similar) in 471 aa overlap (44-513:18-402) 20 30 40 50 60 70 pF1KE1 WWGLLCSCCGPPPLQPPLPAAAAAAAGGQLLGDGGSPGRTEQPPPSPQSSSGFLYRRLKT :: ::.:: . :: :: ::: . CCDS44 MTALPGPLWLLGLALCALG-GGGPG-LRPPPGCPQ-------RRLGA 10 20 30 80 90 100 110 120 130 pF1KE1 QEKREMQKEILSVLGLPHRPRPLHGLQQPQPPALRQQEEQQQQQQLPRGEPPPGRLKSAP .:.:..:.:::.::::: :::: ::: ..:: ::: CCDS44 RERRDVQREILAVLGLPGRPRP------RAPPA---------ASRLP---------ASAP 40 50 60 70 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 LFMLDLYNALSADNDEDGASEGERQQSWPHEAASSSQRRQPPPGAAHPLNRKSLLAPGSG :::::::.:...:.::::: : : :: CCDS44 LFMLDLYHAMAGDDDEDGA---------PAE------RR--------------------- 80 90 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 SGGASPLTSAQDSAFLNDADMVMSFVNLVEYDKEFSPRQRHHKEFKFNLSQIPEGEVVTA :. ::.::::::.:: :. .. .. : :::.:.:.::: ::.::: CCDS44 ---------------LGRADLVMSFVNMVERDRALGHQEPHWKEFRFDLTQIPAGEAVTA 100 110 120 130 140 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 AEFRIYKDCVMGSFKNQTFLISIYQVLQEHQHRDSDLFLLDTRVVWASEEGWLEFDITAT ::::::: . . :.:. .:..::.::...:.::::.:: ... :..:::: .:.::. CCDS44 AEFRIYKVPSI-HLLNRTLHVSMFQVVQEQSNRESDLFFLDLQTLRAGDEGWLVLDVTAA 150 160 170 180 190 200 320 330 340 350 360 370 pF1KE1 SNLWVVTPQHNMGLQLSVVTRDGVHVHPRAAGLVGRDGPYDKQPFMVAFFKVSEVHVRTT :. :.. ....::.: : :.:: : : :::.:. .: ..:::.:.::..: .:: CCDS44 SDCWLLKRHKDLGLRLYVETEDGHSVDPGLAGLLGQRAPRSQQPFVVTFFRASPSPIRTP 210 220 230 240 250 260 380 390 400 410 420 430 pF1KE1 RSASSRRRQQSRNRSTQSQDVARVSSA-SDYNSSELKTACRKHELYVSFQDLGWQDWIIA :.. ::.: . .:.. .. :. . .: ..:. . .::.:::::::::::: ::.:: CCDS44 RAVRPLRRRQPK-KSNELPQANRLPGIFDDVHGSHGRQVCRRHELYVSFQDLGWLDWVIA 270 280 290 300 310 320 440 450 460 470 480 490 pF1KE1 PKGYAANYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMNPEYVPKPCCAPTKLNAISVLYFD :.::.: ::.:::::::.. ::::::::.:.::::: :. ::: :::::::.: ::::.: CCDS44 PQGYSAYYCEGECSFPLDSCMNATNHAILQSLVHLMMPDAVPKACCAPTKLSATSVLYYD 330 340 350 360 370 380 500 510 pF1KE1 DNSNVILKKYRNMVVRACGCH ...::::.:.:::::.::::: CCDS44 SSNNVILRKHRNMVVKACGCH 390 400 >>CCDS437.1 BMP8A gene_id:353500|Hs108|chr1 (402 aa) initn: 1374 init1: 946 opt: 1152 Z-score: 833.4 bits: 163.4 E(32554): 4.2e-40 Smith-Waterman score: 1280; 46.5% identity (68.4% similar) in 471 aa overlap (44-513:18-402) 20 30 40 50 60 70 pF1KE1 WWGLLCSCCGPPPLQPPLPAAAAAAAGGQLLGDGGSPGRTEQPPPSPQSSSGFLYRRLKT :: ::.:: . :: :: ::: . CCDS43 MAARPGPLWLLGLTLCALG-GGGPG-LRPPPGCPQ-------RRLGA 10 20 30 80 90 100 110 120 130 pF1KE1 QEKREMQKEILSVLGLPHRPRPLHGLQQPQPPALRQQEEQQQQQQLPRGEPPPGRLKSAP .:.:..:.:::.::::: :::: ::: ..:: ::: CCDS43 RERRDVQREILAVLGLPGRPRP------RAPPA---------ASRLP---------ASAP 40 50 60 70 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 LFMLDLYNALSADNDEDGASEGERQQSWPHEAASSSQRRQPPPGAAHPLNRKSLLAPGSG :::::::.:...:.::::: : : :: CCDS43 LFMLDLYHAMAGDDDEDGA---------PAE-----QR---------------------- 80 90 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 SGGASPLTSAQDSAFLNDADMVMSFVNLVEYDKEFSPRQRHHKEFKFNLSQIPEGEVVTA :. ::.::::::.:: :. .. .. : :::.:.:.::: ::.::: CCDS43 ---------------LGRADLVMSFVNMVERDRALGHQEPHWKEFRFDLTQIPAGEAVTA 100 110 120 130 140 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 AEFRIYKDCVMGSFKNQTFLISIYQVLQEHQHRDSDLFLLDTRVVWASEEGWLEFDITAT ::::::: . . :.:. .:..::.::...:.::::.:: ... :..:::: .:.::. CCDS43 AEFRIYKVPSI-HLLNRTLHVSMFQVVQEQSNRESDLFFLDLQTLRAGDEGWLVLDVTAA 150 160 170 180 190 200 320 330 340 350 360 370 pF1KE1 SNLWVVTPQHNMGLQLSVVTRDGVHVHPRAAGLVGRDGPYDKQPFMVAFFKVSEVHVRTT :. :.. ....::.: : :.:: : : :::.:. .: ..:::.:.::..: .:: CCDS43 SDCWLLKRHKDLGLRLYVETEDGHSVDPGLAGLLGQRAPRSQQPFVVTFFRASPSPIRTP 210 220 230 240 250 260 380 390 400 410 420 430 pF1KE1 RSASSRRRQQSRNRSTQSQDVARVSSA-SDYNSSELKTACRKHELYVSFQDLGWQDWIIA :.. ::.: . .:.. .. :. . .: .:. . .::.:::::::::::: ::.:: CCDS43 RAVRPLRRRQPK-KSNELPQANRLPGIFDDVRGSHGRQVCRRHELYVSFQDLGWLDWVIA 270 280 290 300 310 320 440 450 460 470 480 490 pF1KE1 PKGYAANYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMNPEYVPKPCCAPTKLNAISVLYFD :.::.: ::.:::::::.. ::::::::.:.:::::.:. ::: :::::::.: ::::.: CCDS43 PQGYSAYYCEGECSFPLDSCMNATNHAILQSLVHLMKPNAVPKACCAPTKLSATSVLYYD 330 340 350 360 370 380 500 510 pF1KE1 DNSNVILKKYRNMVVRACGCH ...::::.:.:::::.::::: CCDS43 SSNNVILRKHRNMVVKACGCH 390 400 >>CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20 (396 aa) initn: 703 init1: 313 opt: 497 Z-score: 368.0 bits: 77.3 E(32554): 3.6e-14 Smith-Waterman score: 637; 34.5% identity (59.9% similar) in 357 aa overlap (170-512:65-395) 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 YNALSADNDEDGASEGERQQSWPHEAASSSQRRQPPPGAAHPLNRKSLLAPGSGSGGASP :: : :. : .: ::. : :: CCDS13 AASSGRPSSQPSDEVLSEFELRLLSMFGLKQRPTPSRDAVVPPYMLDLYRRHSGQPG-SP 40 50 60 70 80 90 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 LTSAQDSAFLNDADMVMSFVNLVEYDKEFSPRQRHHKEFKFNLSQIPEGEVVTAAEFRIY . . . :. : :: . .. . ..: ::::.:: : .:.::.... CCDS13 APDHRLERAASRANTVRSFHHEESLEELPETSGKTTRRFFFNLSSIPTEEFITSAELQVF 100 110 120 130 140 150 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 KDCVMGSFKNQTFL---ISIYQVLQEHQHRDS--DLFLLDTRVVWASEEGWLEFDITATS .. .. .. :.. . :.::.... .. :::::.: . : ::.: . CCDS13 REQMQDALGNNSSFHHRINIYEIIKPATANSKFPVTRLLDTRLVNQNASRWESFDVTPAV 160 170 180 190 200 210 320 330 340 350 360 pF1KE1 NLWVVTPQHNMGLQLSVV---TRDGV-HVHPRAAGLVGRDGPYDKQ--PFMVAFF---KV :.. . : :. . :. ..:: . : : . . .: .: :..:.: : CCDS13 MRWTAQGHANHGFVVEVAHLEEKQGVSKRHVRISRSLHQDEHSWSQIRPLLVTFGHDGKG 220 230 240 250 260 270 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 SEVHVRTTRSASSRRRQQSRNRSTQSQDVARVSSASDYNSSELKTACRKHELYVSFQDLG .: : :.:. ..:.. ::..:..: :::.:.:.: CCDS13 HPLHKREKRQAKHKQRKR------------------------LKSSCKRHPLYVDFSDVG 280 290 300 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 WQDWIIAPKGYAANYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMNPEYVPKPCCAPTKLNA :.:::.:: :: : :: ::: ::: :.:.::::::::::. .: . .:: ::.::.:.: CCDS13 WNDWIVAPPGYHAFYCHGECPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSVNSK-IPKACCVPTELSA 310 320 330 340 350 360 490 500 510 pF1KE1 ISVLYFDDNSNVILKKYRNMVVRACGCH ::.::.:.: .:.::.:..:::..::: CCDS13 ISMLYLDENEKVVLKNYQDMVVEGCGCR 370 380 390 >>CCDS13254.1 GDF5 gene_id:8200|Hs108|chr20 (501 aa) initn: 543 init1: 451 opt: 497 Z-score: 366.6 bits: 77.4 E(32554): 4.3e-14 Smith-Waterman score: 560; 29.1% identity (52.7% similar) in 550 aa overlap (1-512:3-500) 10 20 30 pF1KE1 MPGLGRRAQWLCWWWGL--LCSCCGPPPL-QPPL---PAAAAAAA------------- .: : : : : .:. : : : : : :. : : : CCDS13 MRLPKLLTFLLWYLAWLDLEFICTVLGAPDLGQRPQGTRPGLAKAEAKERPPLARNVFRP 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KE1 GGQLLGDGGSPGRTEQPPPSPQSSSGFLYRRLKTQEKREMQKEILSVLGLPHRPRPLHGL ::. : :.. . .. . :. : : :: :.. :.. : :. :.: : CCDS13 GGHSYGGGATNANARAKGGTGQT--GGL-----TQPKKDEPKKLPPRPGGPE-PKPGH-- 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 QQPQPPALRQQEEQQ--QQQQLPRGEPPPGRLKSAPLFMLDLYNALSADNDEDGASEGER :: :: . . ::: :. :: . :.: .: : .: : CCDS13 ----PPQTRQATARTVTPKGQLPGGKAPP-KAGSVPSSFL-LKKA--------------R 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 QQSWPHEAASSSQRRQPPPGAAHP--LNRKSLLAPGSGSGGASPLTSAQDSAFLNDADMV . . :.: .. .::: . : :. :. .. .:: : :.. : : :. . CCDS13 EPGPPREP---KEPFRPPPITPHEYMLSLYRTLSDADRKGGNS---SVKLEAGL--ANTI 160 170 180 190 200 220 230 240 250 260 270 pF1KE1 MSFVNLVEYDKEFSPRQRHHKEFKFNLSQIPEGEVVTAAEFRIYKDCVMGSFKNQTFLIS ::.. . :. .: :... . :..: . : . . .::.:: . . : . . CCDS13 TSFIDKGQDDR--GPVVRKQR-YVFDISAL-EKDGLLGAELRILRKKPSDTAKPAAPGGG 210 220 230 240 250 280 290 300 310 320 pF1KE1 -IYQV-LQEHQHRDSDLFLLDTRVVWASE-EGWLEFDI---------TATSNLWVVTPQH :. :. . :::.: : . . :: ::: .: : . . .. CCDS13 RAAQLKLSSCPSGRQPAALLDVRSVPGLDGSGWEVFDIWKLFRNFKNSAQLCLELEAWER 260 270 280 290 300 310 330 340 350 360 370 380 pF1KE1 NMGLQLSVV--TRDGVHVHPRAAGLV-GRDGPYDKQPFMVAFFKVSEVHVRTTRSASSRR . ...: . : . .:: .: :: :: : :: .:...:. .. .. CCDS13 GRAVDLRGLGFDRAARQVHEKALFLVFGRTKKRD------LFF--NEIKARSGQDDKTVY 320 330 340 350 360 370 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 RQQSRNRSTQSQDVARVSSASDYNSSELKTACRKHELYVSFQDLGWQDWIIAPKGYAANY . .: . .: . . :..::. : .. :.:.:.:.::.:::::: : : . CCDS13 EYLFSQRRKRRAPLA--TRQGKRPSKNLKARCSRKALHVNFKDMGWDDWIIAPLEYEAFH 380 390 400 410 420 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 CDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMNPEYVPKPCCAPTKLNAISVLYFDDNSNVILK :.: : ::: .:.. ::::..:::.. :.:: .: ::.::.:. ::.:..:. .::. : CCDS13 CEGLCEFPLRSHLEPTNHAVIQTLMNSMDPESTPPTCCVPTRLSPISILFIDSANNVVYK 430 440 450 460 470 480 510 pF1KE1 KYRNMVVRACGCH .:..:::..::: CCDS13 QYEDMVVESCGCR 490 500 >>CCDS9715.1 BMP4 gene_id:652|Hs108|chr14 (408 aa) initn: 680 init1: 300 opt: 492 Z-score: 364.2 bits: 76.6 E(32554): 5.7e-14 Smith-Waterman score: 638; 36.5% identity (61.6% similar) in 359 aa overlap (170-512:69-407) 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 YNALSADNDEDGASEGERQQSWPHEAASSSQRRQPPPGAAHPLNRKSLLAPGSGSGGASP .: :: .:. : ..: :: CCDS97 QGHAGGRRSGQSHELLRDFEATLLQMFGLRRRPQPSKSAVIPDYMRDLYRLQSGEEEEEQ 40 50 60 70 80 90 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 LTSA---QDSAFLNDADMVMSFVNLVEYDKEFSPRQRHHKEFKF--NLSQIPEGEVVTAA . :. . :. : :: . : : : ... :.: :::.:::.::...: CCDS97 IHSTGLEYPERPASRANTVRSFHH--EEHLENIPGTSENSAFRFLFNLSSIPENEVISSA 100 110 120 130 140 150 260 270 280 290 300 pF1KE1 EFRIYKDCV-MGSFKNQTFL-ISIYQVLQEHQHR-DSDLF--LLDTRVVWASEEGWLEFD :.:.... : .: .. : :.::.:.. . . :. :::::.: . : :: CCDS97 ELRLFREQVDQGPDWERGFHRINIYEVMKPPAEVVPGHLITRLLDTRLVHHNVTRWETFD 160 170 180 190 200 210 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 ITATSNLWVVTPQHNMGLQLSVV------TRDGVHVHPRAAGLVGRDGPYDKQPFMVAFF .. . :. : :.:: . :. :..: ::. . : . . .:..:.: CCDS97 VSPAVLRWTREKQPNYGLAIEVTHLHQTRTHQGQHVRISRSLPQGSGNWAQLRPLLVTFG 220 230 240 250 260 270 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 KVSEVHVRTTRSASSRRRQQSRNRSTQSQDVARVSSASDYNSSELKTACRKHELYVSFQD . .. : : .:::. .:. . .:: : :.. ::.: :::.:.: CCDS97 HDGRGH------ALTRRRRAKRSPKHHSQ------RARKKNKN-----CRRHSLYVDFSD 280 290 300 310 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 LGWQDWIIAPKGYAANYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMNPEYVPKPCCAPTKL .::.:::.:: :: : :: :.: ::: :.:.::::::::::. .: .:: ::.::.: CCDS97 VGWNDWIVAPPGYQAFYCHGDCPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSVNSS-IPKACCVPTEL 320 330 340 350 360 370 490 500 510 pF1KE1 NAISVLYFDDNSNVILKKYRNMVVRACGCH .:::.::.:. ..:.::.:..:::..::: CCDS97 SAISMLYLDEYDKVVLKNYQEMVVEGCGCR 380 390 400 >>CCDS8581.1 GDF3 gene_id:9573|Hs108|chr12 (364 aa) initn: 442 init1: 284 opt: 444 Z-score: 330.8 bits: 70.3 E(32554): 4.2e-12 Smith-Waterman score: 499; 30.1% identity (58.5% similar) in 359 aa overlap (164-512:36-363) 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 LFMLDLYNALSADNDEDGASEGERQQSWPHEAASSSQRRQPPPGAAHPLNRKSLLAPGSG . : : :. :: : . . . : . CCDS85 PDLAFSFLLILALGQAVQFQEYVFLQFLGLDKAPSPQKFQPVPYILKKIFQDREAA--AT 10 20 30 40 50 60 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 SGGASPLTSAQDSAFLNDADMVMSFVNLVEYDKEFSPRQRH-HKEFKFNLSQIPEGEVVT .: . : ... . ... . .. : :..: . .: . :::: : : : .: CCDS85 TGVSRDLCYVKELGVRGNVLRFLPDQGFFLYPKKISQASSCLQKLLYFNLSAIKEREQLT 70 80 90 100 110 120 260 270 280 290 300 pF1KE1 AAEFRIYKDCVMGSFKN-------QTFLISIYQVLQEHQHRDSDLFLLDTRVVWASEEGW :.. . : .:. : ::.. .: . . . .:.: . : : .: CCDS85 LAQLGL--DLGPNSYYNLGPELELALFLVQEPHVWGQTTPKPGKMFVLRS-VPWP--QGA 130 140 150 160 170 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 LEFDITATSNLWVVTPQHNMGLQLSVVTRDGVHVHPRAAGLVGRDGPYDKQPF-MVAFFK ..:.. ... : .:..:.:: : ..... ::. . :: : .. CCDS85 VHFNLLDVAKDWNDNPRKNFGLFLEILVKED------------RDSGVNFQPEDTCARLR 180 190 200 210 220 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 VSEVHVRT-TRSASSRRRQQSRNRSTQSQDVARVSSASDYNSSELKTACRKHELYVSFQD : .:. . . . . . ::.: . . : ..: :. :..:.:...:.: CCDS85 CS-LHASLLVVTLNPDQCHPSRKRRA-AIPVPKLSC---------KNLCHRHQLFINFRD 230 240 250 260 270 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 LGWQDWIIAPKGYAANYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMNPEYVPKPCCAPTKL :::. :::::::. :::: ::: : :. .:..:.:..:.:.: ..:: .:. : :::: CCDS85 LGWHKWIIAPKGFMANYCHGECPFSLTISLNSSNYAFMQALMHAVDPE-IPQAVCIPTKL 280 290 300 310 320 330 490 500 510 pF1KE1 NAISVLYFDDNSNVILKKYRNMVVRACGCH . ::.:: :.:.::::..:..::: ::: CCDS85 SPISMLYQDNNDNVILRHYEDMVVDECGCG 340 350 360 >>CCDS1701.1 GDF7 gene_id:151449|Hs108|chr2 (450 aa) initn: 493 init1: 435 opt: 438 Z-score: 325.3 bits: 69.6 E(32554): 8.5e-12 Smith-Waterman score: 438; 43.3% identity (77.6% similar) in 134 aa overlap (379-512:317-449) 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 RDGPYDKQPFMVAFFKVSEVHVRTTRSASSRRRQQSRNRSTQSQDVARVSSASDYNSSEL :::... .:.. . . ..:. .. . CCDS17 QARALGAALASEPLPDPGTGTASPRAVIGGRRRRRTALAGTRTAQ-GSGGGAGRGHGRRG 290 300 310 320 330 340 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 KTACRKHELYVSFQDLGWQDWIIAPKGYAANYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLM .. : .. :.:.:..:::.:::::: : : .:.: :.::: .:.. :::::.:::.. : CCDS17 RSRCSRKPLHVDFKELGWDDWIIAPLDYEAYHCEGLCDFPLRSHLEPTNHAIIQTLLNSM 350 360 370 380 390 400 470 480 490 500 510 pF1KE1 NPEYVPKPCCAPTKLNAISVLYFDDNSNVILKKYRNMVVRACGCH :. .: ::.:..:. ::.::.: .::. :.:..:::.:::: CCDS17 APDAAPASCCVPARLSPISILYIDAANNVVYKQYEDMVVEACGCR 410 420 430 440 450 513 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 16:59:55 2016 done: Sun Nov 6 16:59:55 2016 Total Scan time: 4.000 Total Display time: 0.090 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]