FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4092, 466 aa 1>>>pF1KE4092 466 - 466 aa - 466 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2473+/-0.000316; mu= 13.7576+/- 0.020 mean_var=80.4376+/-16.527, 0's: 0 Z-trim(116.9): 199 B-trim: 1760 in 1/54 Lambda= 0.143003 statistics sampled from 28147 (28375) to 28147 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.693), E-opt: 0.2 (0.333), width: 16 Scan time: 10.000 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001287664 (OMIM: 614532) ras-GEF domain-contain ( 472) 2099 442.4 1.2e-123 XP_016863302 (OMIM: 614532) PREDICTED: ras-GEF dom ( 473) 2087 440.0 6.8e-123 NP_689758 (OMIM: 614532) ras-GEF domain-containing ( 473) 2087 440.0 6.8e-123 NP_001287665 (OMIM: 614532) ras-GEF domain-contain ( 431) 1786 377.8 3.1e-104 XP_016863301 (OMIM: 614532) PREDICTED: ras-GEF dom ( 432) 1774 375.4 1.7e-103 NP_660356 (OMIM: 614531) ras-GEF domain-containing ( 481) 1653 350.4 6.2e-96 NP_001269791 (OMIM: 614531) ras-GEF domain-contain ( 489) 1653 350.4 6.3e-96 XP_011537802 (OMIM: 614531) PREDICTED: ras-GEF dom ( 401) 1472 313.1 9.2e-85 XP_005271866 (OMIM: 614531) PREDICTED: ras-GEF dom ( 401) 1472 313.1 9.2e-85 NP_055062 (OMIM: 609530) rap guanine nucleotide ex (1499) 350 81.8 1.4e-14 XP_016864348 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1524) 350 81.8 1.5e-14 XP_011530729 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1540) 350 81.8 1.5e-14 XP_016864346 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1544) 350 81.8 1.5e-14 XP_016864347 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1544) 350 81.8 1.5e-14 XP_006714485 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1585) 350 81.8 1.5e-14 XP_011530728 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1585) 350 81.8 1.5e-14 XP_011530727 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1589) 350 81.8 1.5e-14 XP_016864345 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1652) 350 81.8 1.6e-14 XP_005263418 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1654) 350 81.8 1.6e-14 XP_005263417 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1660) 350 81.8 1.6e-14 XP_006714484 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1685) 350 81.8 1.6e-14 XP_005263416 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1693) 350 81.8 1.6e-14 XP_006714483 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1695) 350 81.8 1.6e-14 XP_005263415 (OMIM: 609530) PREDICTED: rap guanine (1701) 350 81.8 1.6e-14 NP_001157861 (OMIM: 610499) rap guanine nucleotide (1391) 318 75.2 1.3e-12 NP_001157860 (OMIM: 610499) rap guanine nucleotide (1504) 318 75.2 1.4e-12 NP_001157859 (OMIM: 610499) rap guanine nucleotide (1509) 318 75.2 1.4e-12 NP_057424 (OMIM: 610499) rap guanine nucleotide ex (1601) 318 75.2 1.5e-12 NP_001157858 (OMIM: 610499) rap guanine nucleotide (1609) 318 75.2 1.5e-12 NP_722522 (OMIM: 606600) ras-specific guanine nucl ( 489) 307 72.7 2.5e-12 NP_001139120 (OMIM: 606600) ras-specific guanine n (1257) 307 72.9 5.7e-12 XP_016877945 (OMIM: 606600) PREDICTED: ras-specifi (1260) 307 72.9 5.8e-12 XP_016877944 (OMIM: 606600) PREDICTED: ras-specifi (1270) 307 72.9 5.8e-12 NP_002882 (OMIM: 606600) ras-specific guanine nucl (1273) 307 72.9 5.8e-12 XP_016865171 (OMIM: 606614) PREDICTED: ras-specifi (1142) 293 70.0 3.9e-11 NP_008840 (OMIM: 606614) ras-specific guanine nucl (1237) 293 70.0 4.2e-11 NP_001269830 (OMIM: 606058) rap guanine nucleotide ( 791) 282 67.7 1.4e-10 NP_001269829 (OMIM: 606058) rap guanine nucleotide ( 840) 282 67.7 1.4e-10 XP_006712268 (OMIM: 606058) PREDICTED: rap guanine ( 840) 282 67.7 1.4e-10 XP_016858686 (OMIM: 606058) PREDICTED: rap guanine ( 849) 282 67.7 1.4e-10 NP_001269828 (OMIM: 606058) rap guanine nucleotide ( 858) 282 67.7 1.5e-10 NP_001093867 (OMIM: 606058) rap guanine nucleotide ( 867) 282 67.7 1.5e-10 XP_011508807 (OMIM: 606058) PREDICTED: rap guanine ( 881) 282 67.7 1.5e-10 XP_016858685 (OMIM: 606058) PREDICTED: rap guanine ( 960) 282 67.7 1.6e-10 XP_005246303 (OMIM: 606058) PREDICTED: rap guanine ( 993) 282 67.7 1.7e-10 NP_008954 (OMIM: 606058) rap guanine nucleotide ex (1011) 282 67.7 1.7e-10 XP_011507644 (OMIM: 605667) PREDICTED: ral guanine ( 620) 267 64.5 9.3e-10 XP_016856245 (OMIM: 605667) PREDICTED: ral guanine ( 683) 267 64.5 1e-09 XP_011507643 (OMIM: 605667) PREDICTED: ral guanine ( 718) 267 64.5 1.1e-09 NP_001284601 (OMIM: 605667) ral guanine nucleotide ( 739) 267 64.5 1.1e-09 >>NP_001287664 (OMIM: 614532) ras-GEF domain-containing (472 aa) initn: 2103 init1: 1278 opt: 2099 Z-score: 2340.7 bits: 442.4 E(85289): 1.2e-123 Smith-Waterman score: 2099; 68.0% identity (85.4% similar) in 472 aa overlap (1-465:1-471) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MPQTLSASDMVTPGSLSPPPTEPTDGEQAGQPLLDGAPSSASLETLIQHLVPTADYYPEK :::: : : .. . . .. .: :. :.:::.:::::::..::::.. 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NP_689 FPYDFRDERMMRNLKDLAHRIASGEEQTYRKNVQQMMQCLIRKLAALSQYEEVLAKISST 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 GADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFVQAFVNKDPL ..:. .::: ::.:... ::.:::::::::::.::::: .:::::::::::.:::: NP_689 STDRLTVLKTKPQ-SIQRDIITVCNDPYTLAQQLTHIELERLNYIGPEEFVQAFVQKDPL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 ASTKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFIDVARECFNI . : :.:. :: ::::::.::::: ::::::::::.:::.::..::.::::::::::: NP_689 DNDKSCYSERKKTRNLEAYVEWFNRLSYLVATEICMPVKKKHRARMIEYFIDVARECFNI 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 GNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPTGNFCNYRTALRGAAHRS ::::::::::::::::::::::::::::.:::: ::::::::..:: ::::::::::.:: NP_689 GNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVKTAKFDILEHQMDPSSNFYNYRTALRGAAQRS 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 LTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVGEFITWKQVE ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::.:::::: NP_689 LTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFWELAKQVSEFMTWKQVE 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 CPFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSILGKT ::::.: .: .:: :.:.::::.:::::::::.:::. ::.:::.::::.::. NP_689 CPFERDRKILQYLLTVPVFSEDALYLASYESEGPENHIEKDRWKSLRSSLLGRV 420 430 440 450 460 470 >>NP_001287665 (OMIM: 614532) ras-GEF domain-containing (431 aa) initn: 1894 init1: 1278 opt: 1786 Z-score: 1992.4 bits: 377.8 E(85289): 3.1e-104 Smith-Waterman score: 1812; 62.3% identity (77.8% similar) in 472 aa overlap (1-465:1-430) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MPQTLSASDMVTPGSLSPPPTEPTDGEQAGQPLLDGAPSSASLETLIQHLVPTADYYPEK :::: : : .. . . .. .: :. :.:::.:::::::..::::.. NP_001 MPQTPPFSAMFDSSGYNRNLYQSAEDSCGGLYYHDNNLLSGSLEALIQHLVPNVDYYPDN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 AYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARVRKFGPKLLQLLAEWTET ..::..::.::::.::::: NP_001 -----------------------------------------QMRKIAPKILQLLTEWTET 70 130 140 150 160 170 pF1KE4 FPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDEAYRKRMHQLLQALHQKLAALRQGPEGLV-----G :: ::..: . .:::.. ::: .:.::: ..:..: : .::::: : : :. . NP_001 FPYDFRDERMMRNLKDLAHRIASGEETYRKNVQQMMQCLIRKLAALSQYEEVLAKISSTS 80 90 100 110 120 130 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 ADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFVQAFVNKDPLA .:. .::: ::.:... ::.:::::::::::.::::: .:::::::::::.:::: NP_001 TDRLTVLKTKPQ-SIQRDIITVCNDPYTLAQQLTHIELERLNYIGPEEFVQAFVQKDPLD 140 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 STKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFIDVARECFNIG . : :.:. :: ::::::.::::: ::::::::::.:::.::..::.:::::::::::: NP_001 NDKSCYSERKKTRNLEAYVEWFNRLSYLVATEICMPVKKKHRARMIEYFIDVARECFNIG 200 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 NFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPTGNFCNYRTALRGAAHRSL :::::::::::::::::::::::::::.:::: ::::::::..:: ::::::::::.::: NP_001 NFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVKTAKFDILEHQMDPSSNFYNYRTALRGAAQRSL 260 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 TAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVGEFITWKQVEC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::.::::::: NP_001 TAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFWELAKQVSEFMTWKQVEC 320 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 pF1KE4 PFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSILGKT :::.: .: .:: :.:.::::.:::::::::.:::. ::.:::.::::.::. NP_001 PFERDRKILQYLLTVPVFSEDALYLASYESEGPENHIEKDRWKSLRSSLLGRV 380 390 400 410 420 430 >>XP_016863301 (OMIM: 614532) PREDICTED: ras-GEF domain- (432 aa) initn: 1816 init1: 1278 opt: 1774 Z-score: 1979.0 bits: 375.4 E(85289): 1.7e-103 Smith-Waterman score: 1800; 62.2% identity (77.6% similar) in 473 aa overlap (1-465:1-431) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MPQTLSASDMVTPGSLSPPPTEPTDGEQAGQPLLDGAPSSASLETLIQHLVPTADYYPEK :::: : : .. . . .. .: :. :.:::.:::::::..::::.. XP_016 MPQTPPFSAMFDSSGYNRNLYQSAEDSCGGLYYHDNNLLSGSLEALIQHLVPNVDYYPDN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 AYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARVRKFGPKLLQLLAEWTET ..::..::.::::.::::: XP_016 -----------------------------------------QMRKIAPKILQLLTEWTET 70 130 140 150 160 170 pF1KE4 FPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDE-AYRKRMHQLLQALHQKLAALRQGPEGLV----- :: ::..: . .:::.. ::: .: .::: ..:..: : .::::: : : :. XP_016 FPYDFRDERMMRNLKDLAHRIASGEEQTYRKNVQQMMQCLIRKLAALSQYEEVLAKISST 80 90 100 110 120 130 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 GADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFVQAFVNKDPL ..:. .::: ::.:... ::.:::::::::::.::::: .:::::::::::.:::: XP_016 STDRLTVLKTKPQ-SIQRDIITVCNDPYTLAQQLTHIELERLNYIGPEEFVQAFVQKDPL 140 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 ASTKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFIDVARECFNI . : :.:. :: ::::::.::::: ::::::::::.:::.::..::.::::::::::: XP_016 DNDKSCYSERKKTRNLEAYVEWFNRLSYLVATEICMPVKKKHRARMIEYFIDVARECFNI 200 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 GNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPTGNFCNYRTALRGAAHRS ::::::::::::::::::::::::::::.:::: ::::::::..:: ::::::::::.:: XP_016 GNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVKTAKFDILEHQMDPSSNFYNYRTALRGAAQRS 260 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 LTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVGEFITWKQVE ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::.:::::: XP_016 LTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFWELAKQVSEFMTWKQVE 320 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 pF1KE4 CPFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSILGKT ::::.: .: .:: :.:.::::.:::::::::.:::. ::.:::.::::.::. XP_016 CPFERDRKILQYLLTVPVFSEDALYLASYESEGPENHIEKDRWKSLRSSLLGRV 380 390 400 410 420 430 >>NP_660356 (OMIM: 614531) ras-GEF domain-containing fam (481 aa) initn: 1610 init1: 1043 opt: 1653 Z-score: 1843.3 bits: 350.4 E(85289): 6.2e-96 Smith-Waterman score: 1674; 53.9% identity (80.1% similar) in 482 aa overlap (1-465:1-480) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MPQT-LSASDMVTP---GSLSPPPTEPTDGEQAGQPLL---DGAPSSASLETLIQHLVPT :::: . :... : :...: : : .:. : :: :.:::.:..::::: NP_660 MPQTSVVFSSILGPSCSGQVQPGMGERGGGAGGGSGDLIFQDGHLISGSLEALMEHLVPT 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 ADYYPEKAYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARVRKFGPKLLQL .::::...::::::::::.:. :..::::: ..:.::.: . .::....:. :..:: NP_660 VDYYPDRTYIFTFLLSSRVFMPPHDLLARVGQICVEQKQQLEAGPEKAKLKSFSAKIVQL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 pF1KE4 LAEWTETFPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDE---AYRKRMHQLLQALHQKLAA---LR : ::::.:: :::.:.....:: .. :.. ::: . .: . :. :.: .::: :. NP_660 LKEWTEAFPYDFQDEKAMAELKAITHRVTQCDEENGTVKKAIAQMTQSLLLSLAARSQLQ 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 QGPEGLV--GADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFV . : : ..:: .:::::. ....:::: :: .:::::::.::.:. : ::... NP_660 ELREKLRPPAVDKGPILKTKPPAA-QKDILGVCCDPLVLAQQLTHIELDRVSSIYPEDLM 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 QAFVNKDPLASTKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFI : . : : . . : .: :: .:::: .::: : .:::::.: .:::.:....:::: NP_660 QIVSHMDSLDNHR-CRGDLTKTYSLEAYDNWFNCLSMLVATEVCRVVKKKHRTRMLEFFI 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 DVARECFNIGNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPTGNFCNYRT ::::::::::::::.::::::::.:::.::::::.::.:::: .:::.:::..::::::: NP_660 DVARECFNIGNFNSMMAIISGMNLSPVARLKKTWSKVKTAKFDVLEHHMDPSSNFCNYRT 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 ALRGAAHRSLTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVG ::.::..:: :.::::::::: :.:..::::::.. .:.:::::.::.:: :...:. NP_660 ALQGATQRSQMANSSREKIVIPVFNLFVKDIYFLHKIHTNHLPNGHINFKKFWEISRQIH 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 EFITWKQVECPFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSIL ::.:: :::::::.: .: :: ::::.::..:..::.:::.:::. ::. ::.::...: NP_660 EFMTWTQVECPFEKDKKIQSYLLTAPIYSEEALFVASFESEGPENHMEKDSWKTLRTTLL 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 GKT .. NP_660 NRA 480 >>NP_001269791 (OMIM: 614531) ras-GEF domain-containing (489 aa) initn: 1610 init1: 1043 opt: 1653 Z-score: 1843.2 bits: 350.4 E(85289): 6.3e-96 Smith-Waterman score: 1674; 53.9% identity (80.1% similar) in 482 aa overlap (1-465:9-488) 10 20 30 40 pF1KE4 MPQT-LSASDMVTP---GSLSPPPTEPTDGEQAGQPLL---DGAPSSASLET :::: . :... : :...: : : .:. : :: :.:::. NP_001 MFLEPQETMPQTSVVFSSILGPSCSGQVQPGMGERGGGAGGGSGDLIFQDGHLISGSLEA 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 LIQHLVPTADYYPEKAYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARVRK :..:::::.::::...::::::::::.:. :..::::: ..:.::.: . .::.... NP_001 LMEHLVPTVDYYPDRTYIFTFLLSSRVFMPPHDLLARVGQICVEQKQQLEAGPEKAKLKS 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 FGPKLLQLLAEWTETFPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDE---AYRKRMHQLLQALHQK :. :..::: ::::.:: :::.:.....:: .. :.. ::: . .: . :. :.: . NP_001 FSAKIVQLLKEWTEAFPYDFQDEKAMAELKAITHRVTQCDEENGTVKKAIAQMTQSLLLS 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 pF1KE4 LAA---LRQGPEGLV--GADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLR ::: :.. : : ..:: .:::::. ....:::: :: .:::::::.::.:. NP_001 LAARSQLQELREKLRPPAVDKGPILKTKPPAA-QKDILGVCCDPLVLAQQLTHIELDRVS 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 HIGPEEFVQAFVNKDPLASTKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQR : ::...: . : : . . : .: :: .:::: .::: : .:::::.: .:::.: NP_001 SIYPEDLMQIVSHMDSLDNHR-CRGDLTKTYSLEAYDNWFNCLSMLVATEVCRVVKKKHR 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 AQVIEFFIDVARECFNIGNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPT ....::::::::::::::::::.::::::::.:::.::::::.::.:::: .:::.:::. NP_001 TRMLEFFIDVARECFNIGNFNSMMAIISGMNLSPVARLKKTWSKVKTAKFDVLEHHMDPS 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 GNFCNYRTALRGAAHRSLTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKF .:::::::::.::..:: :.::::::::: :.:..::::::.. .:.:::::.::.:: NP_001 SNFCNYRTALQGATQRSQMANSSREKIVIPVFNLFVKDIYFLHKIHTNHLPNGHINFKKF 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 LELAKQVGEFITWKQVECPFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERW :...:. ::.:: :::::::.: .: :: ::::.::..:..::.:::.:::. ::. : NP_001 WEISRQIHEFMTWTQVECPFEKDKKIQSYLLTAPIYSEEALFVASFESEGPENHMEKDSW 420 430 440 450 460 470 460 pF1KE4 KALRSSILGKT :.::...:.. NP_001 KTLRTTLLNRA 480 >>XP_011537802 (OMIM: 614531) PREDICTED: ras-GEF domain- (401 aa) initn: 1429 init1: 1043 opt: 1472 Z-score: 1642.8 bits: 313.1 E(85289): 9.2e-85 Smith-Waterman score: 1472; 55.0% identity (81.8% similar) in 402 aa overlap (74-465:1-400) 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 ETLIQHLVPTADYYPEKAYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARV . :..::::: ..:.::.: . .::.. XP_011 MPPHDLLARVGQICVEQKQQLEAGPEKAKL 10 20 30 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 RKFGPKLLQLLAEWTETFPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDE---AYRKRMHQLLQALH ..:. :..::: ::::.:: :::.:.....:: .. :.. ::: . .: . :. :.: XP_011 KSFSAKIVQLLKEWTEAFPYDFQDEKAMAELKAITHRVTQCDEENGTVKKAIAQMTQSLL 40 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 pF1KE4 QKLAA---LRQGPEGLV--GADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELER .::: :.. : : ..:: .:::::. ....:::: :: .:::::::.::.: XP_011 LSLAARSQLQELREKLRPPAVDKGPILKTKPPAA-QKDILGVCCDPLVLAQQLTHIELDR 100 110 120 130 140 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 LRHIGPEEFVQAFVNKDPLASTKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKK . : ::...: . : : . . : .: :: .:::: .::: : .:::::.: .::: XP_011 VSSIYPEDLMQIVSHMDSLDNHR-CRGDLTKTYSLEAYDNWFNCLSMLVATEVCRVVKKK 150 160 170 180 190 200 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 QRAQVIEFFIDVARECFNIGNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMD .:....::::::::::::::::::.::::::::.:::.::::::.::.:::: .:::.:: XP_011 HRTRMLEFFIDVARECFNIGNFNSMMAIISGMNLSPVARLKKTWSKVKTAKFDVLEHHMD 210 220 230 240 250 260 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 PTGNFCNYRTALRGAAHRSLTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFE :..:::::::::.::..:: :.::::::::: :.:..::::::.. .:.:::::.::. XP_011 PSSNFCNYRTALQGATQRSQMANSSREKIVIPVFNLFVKDIYFLHKIHTNHLPNGHINFK 270 280 290 300 310 320 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 KFLELAKQVGEFITWKQVECPFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKE :: :...:. ::.:: :::::::.: .: :: ::::.::..:..::.:::.:::. ::. XP_011 KFWEISRQIHEFMTWTQVECPFEKDKKIQSYLLTAPIYSEEALFVASFESEGPENHMEKD 330 340 350 360 370 380 460 pF1KE4 RWKALRSSILGKT ::.::...:.. XP_011 SWKTLRTTLLNRA 390 400 >>XP_005271866 (OMIM: 614531) PREDICTED: ras-GEF domain- (401 aa) initn: 1429 init1: 1043 opt: 1472 Z-score: 1642.8 bits: 313.1 E(85289): 9.2e-85 Smith-Waterman score: 1472; 55.0% identity (81.8% similar) in 402 aa overlap (74-465:1-400) 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 ETLIQHLVPTADYYPEKAYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARV . :..::::: ..:.::.: . .::.. XP_005 MPPHDLLARVGQICVEQKQQLEAGPEKAKL 10 20 30 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 RKFGPKLLQLLAEWTETFPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDE---AYRKRMHQLLQALH ..:. :..::: ::::.:: :::.:.....:: .. :.. ::: . .: . :. :.: XP_005 KSFSAKIVQLLKEWTEAFPYDFQDEKAMAELKAITHRVTQCDEENGTVKKAIAQMTQSLL 40 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 pF1KE4 QKLAA---LRQGPEGLV--GADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELER .::: :.. : : ..:: .:::::. ....:::: :: .:::::::.::.: XP_005 LSLAARSQLQELREKLRPPAVDKGPILKTKPPAA-QKDILGVCCDPLVLAQQLTHIELDR 100 110 120 130 140 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 LRHIGPEEFVQAFVNKDPLASTKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKK . : ::...: . : : . . : .: :: .:::: .::: : .:::::.: .::: XP_005 VSSIYPEDLMQIVSHMDSLDNHR-CRGDLTKTYSLEAYDNWFNCLSMLVATEVCRVVKKK 150 160 170 180 190 200 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 QRAQVIEFFIDVARECFNIGNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMD .:....::::::::::::::::::.::::::::.:::.::::::.::.:::: .:::.:: XP_005 HRTRMLEFFIDVARECFNIGNFNSMMAIISGMNLSPVARLKKTWSKVKTAKFDVLEHHMD 210 220 230 240 250 260 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 PTGNFCNYRTALRGAAHRSLTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFE :..:::::::::.::..:: :.::::::::: :.:..::::::.. .:.:::::.::. XP_005 PSSNFCNYRTALQGATQRSQMANSSREKIVIPVFNLFVKDIYFLHKIHTNHLPNGHINFK 270 280 290 300 310 320 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 KFLELAKQVGEFITWKQVECPFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKE :: :...:. ::.:: :::::::.: .: :: ::::.::..:..::.:::.:::. ::. XP_005 KFWEISRQIHEFMTWTQVECPFEKDKKIQSYLLTAPIYSEEALFVASFESEGPENHMEKD 330 340 350 360 370 380 460 pF1KE4 RWKALRSSILGKT ::.::...:.. XP_005 SWKTLRTTLLNRA 390 400 >>NP_055062 (OMIM: 609530) rap guanine nucleotide exchan (1499 aa) initn: 336 init1: 205 opt: 350 Z-score: 382.6 bits: 81.8 E(85289): 1.4e-14 Smith-Waterman score: 350; 33.2% identity (64.9% similar) in 202 aa overlap (204-402:721-904) 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 VGADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFVQAFVNKDP .: ::. ..: .:.: : :... . . NP_055 METETLCSDEDAQELLRESQISLLQLSTVEVATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFK--- 700 710 720 730 740 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 LASTKPCFSDKTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFIDVARECFNIG : : : .::. . . .:. . ::.:: ... .: ..:. :: .: .: . NP_055 LRSKTSC-----ANLKRFEEVINQETFWVASEILRETNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECK 750 760 770 780 790 800 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 NFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKV--RTAKFFI-LEHQMDPTGNFCNYRTALRGAAH ::::..:::::.:..::.::. :: :. . :.: :. .::. :. .::..: . NP_055 NFNSMFAIISGLNLAPVARLRTTWEKLPNKYEKLFQDLQDLFDPSRNMAKYRNVLNS--- 810 820 830 840 850 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 RSLTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVGEFITWKQ .. . .::.: .. ::. ::.:: ... .: :::::. .::.. NP_055 ------QNLQPPIIPLFPVIKKDLTFLHEGNDSKV-DGLVNFEKLRMIAKEIRHVGRMAS 860 870 880 890 900 910 420 430 440 450 460 pF1KE4 VECPFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSILGKT NP_055 VNMDPALMFRTRKKKWRSLGSLSQGSTNATVLDVAQTGGHKKRVRRSSFLNAKKLYEDAQ 920 930 940 950 960 970 466 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 04:11:49 2016 done: Sun Nov 6 04:11:50 2016 Total Scan time: 10.000 Total Display time: 0.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]