FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4092, 466 aa 1>>>pF1KE4092 466 - 466 aa - 466 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6835+/-0.000724; mu= 11.2780+/- 0.044 mean_var=78.7764+/-15.839, 0's: 0 Z-trim(109.6): 70 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.144503 statistics sampled from 10901 (10972) to 10901 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.337), width: 16 Scan time: 3.170 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4452.1 RASGEF1C gene_id:255426|Hs108|chr5 ( 466) 3129 661.5 5.1e-190 CCDS75152.1 RASGEF1B gene_id:153020|Hs108|chr4 ( 472) 2099 446.8 2.3e-125 CCDS34022.1 RASGEF1B gene_id:153020|Hs108|chr4 ( 473) 2087 444.3 1.3e-124 CCDS75151.1 RASGEF1B gene_id:153020|Hs108|chr4 ( 431) 1786 381.5 9.1e-106 CCDS7202.2 RASGEF1A gene_id:221002|Hs108|chr10 ( 481) 1653 353.8 2.2e-97 CCDS60517.1 RASGEF1A gene_id:221002|Hs108|chr10 ( 489) 1653 353.8 2.3e-97 CCDS43277.1 RAPGEF2 gene_id:9693|Hs108|chr4 (1499) 350 82.2 4e-15 CCDS54898.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1391) 318 75.6 3.8e-13 CCDS54899.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1504) 318 75.6 4.1e-13 CCDS54901.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1509) 318 75.6 4.1e-13 CCDS34225.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1601) 318 75.6 4.3e-13 CCDS54900.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1609) 318 75.6 4.3e-13 CCDS42065.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 ( 489) 307 73.2 6.7e-13 CCDS45320.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 (1257) 307 73.3 1.7e-12 CCDS10309.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 (1273) 307 73.3 1.7e-12 CCDS4052.1 RASGRF2 gene_id:5924|Hs108|chr5 (1237) 293 70.3 1.2e-11 CCDS74604.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 791) 282 68.0 4e-11 CCDS63061.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 840) 282 68.0 4.2e-11 CCDS63060.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 858) 282 68.0 4.3e-11 CCDS42776.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 867) 282 68.0 4.3e-11 CCDS42775.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 (1011) 282 68.0 5e-11 >>CCDS4452.1 RASGEF1C gene_id:255426|Hs108|chr5 (466 aa) initn: 3129 init1: 3129 opt: 3129 Z-score: 3524.9 bits: 661.5 E(32554): 5.1e-190 Smith-Waterman score: 3129; 100.0% identity (100.0% similar) in 466 aa overlap (1-466:1-466) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MPQTLSASDMVTPGSLSPPPTEPTDGEQAGQPLLDGAPSSASLETLIQHLVPTADYYPEK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 MPQTLSASDMVTPGSLSPPPTEPTDGEQAGQPLLDGAPSSASLETLIQHLVPTADYYPEK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 AYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARVRKFGPKLLQLLAEWTET :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 AYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARVRKFGPKLLQLLAEWTET 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 FPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDEAYRKRMHQLLQALHQKLAALRQGPEGLVGADKPI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 FPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDEAYRKRMHQLLQALHQKLAALRQGPEGLVGADKPI 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 SYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFVQAFVNKDPLASTKPC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 SYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFVQAFVNKDPLASTKPC 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 FSDKTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFIDVARECFNIGNFNSLMA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 FSDKTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFIDVARECFNIGNFNSLMA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 IISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPTGNFCNYRTALRGAAHRSLTAHSSRE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 IISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPTGNFCNYRTALRGAAHRSLTAHSSRE 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 KIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVGEFITWKQVECPFEQDAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 KIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVGEFITWKQVECPFEQDAS 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 ITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSILGKT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 ITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSILGKT 430 440 450 460 >>CCDS75152.1 RASGEF1B gene_id:153020|Hs108|chr4 (472 aa) initn: 2103 init1: 1278 opt: 2099 Z-score: 2364.3 bits: 446.8 E(32554): 2.3e-125 Smith-Waterman score: 2099; 68.0% identity (85.4% similar) in 472 aa overlap (1-465:1-471) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MPQTLSASDMVTPGSLSPPPTEPTDGEQAGQPLLDGAPSSASLETLIQHLVPTADYYPEK :::: : : .. . . .. .: :. :.:::.:::::::..::::.. 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CCDS34 FPYDFRDERMMRNLKDLAHRIASGEEQTYRKNVQQMMQCLIRKLAALSQYEEVLAKISST 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 GADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFVQAFVNKDPL ..:. .::: ::.:... ::.:::::::::::.::::: .:::::::::::.:::: CCDS34 STDRLTVLKTKPQ-SIQRDIITVCNDPYTLAQQLTHIELERLNYIGPEEFVQAFVQKDPL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 ASTKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFIDVARECFNI . : :.:. :: ::::::.::::: ::::::::::.:::.::..::.::::::::::: CCDS34 DNDKSCYSERKKTRNLEAYVEWFNRLSYLVATEICMPVKKKHRARMIEYFIDVARECFNI 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 GNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPTGNFCNYRTALRGAAHRS ::::::::::::::::::::::::::::.:::: ::::::::..:: ::::::::::.:: CCDS34 GNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVKTAKFDILEHQMDPSSNFYNYRTALRGAAQRS 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 LTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVGEFITWKQVE ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::.:::::: CCDS34 LTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFWELAKQVSEFMTWKQVE 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 CPFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSILGKT ::::.: .: .:: :.:.::::.:::::::::.:::. ::.:::.::::.::. CCDS34 CPFERDRKILQYLLTVPVFSEDALYLASYESEGPENHIEKDRWKSLRSSLLGRV 420 430 440 450 460 470 >>CCDS75151.1 RASGEF1B gene_id:153020|Hs108|chr4 (431 aa) initn: 1894 init1: 1278 opt: 1786 Z-score: 2012.4 bits: 381.5 E(32554): 9.1e-106 Smith-Waterman score: 1812; 62.3% identity (77.8% similar) in 472 aa overlap (1-465:1-430) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MPQTLSASDMVTPGSLSPPPTEPTDGEQAGQPLLDGAPSSASLETLIQHLVPTADYYPEK :::: : : .. . . .. .: :. :.:::.:::::::..::::.. CCDS75 MPQTPPFSAMFDSSGYNRNLYQSAEDSCGGLYYHDNNLLSGSLEALIQHLVPNVDYYPDN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 AYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARVRKFGPKLLQLLAEWTET ..::..::.::::.::::: CCDS75 -----------------------------------------QMRKIAPKILQLLTEWTET 70 130 140 150 160 170 pF1KE4 FPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDEAYRKRMHQLLQALHQKLAALRQGPEGLV-----G :: ::..: . .:::.. ::: .:.::: ..:..: : .::::: : : :. . CCDS75 FPYDFRDERMMRNLKDLAHRIASGEETYRKNVQQMMQCLIRKLAALSQYEEVLAKISSTS 80 90 100 110 120 130 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 ADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFVQAFVNKDPLA .:. .::: ::.:... ::.:::::::::::.::::: .:::::::::::.:::: CCDS75 TDRLTVLKTKPQ-SIQRDIITVCNDPYTLAQQLTHIELERLNYIGPEEFVQAFVQKDPLD 140 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 STKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFIDVARECFNIG . : :.:. :: ::::::.::::: ::::::::::.:::.::..::.:::::::::::: CCDS75 NDKSCYSERKKTRNLEAYVEWFNRLSYLVATEICMPVKKKHRARMIEYFIDVARECFNIG 200 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 NFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPTGNFCNYRTALRGAAHRSL :::::::::::::::::::::::::::.:::: ::::::::..:: ::::::::::.::: CCDS75 NFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVKTAKFDILEHQMDPSSNFYNYRTALRGAAQRSL 260 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 TAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVGEFITWKQVEC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::.::::::: CCDS75 TAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFWELAKQVSEFMTWKQVEC 320 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 pF1KE4 PFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSILGKT :::.: .: .:: :.:.::::.:::::::::.:::. ::.:::.::::.::. CCDS75 PFERDRKILQYLLTVPVFSEDALYLASYESEGPENHIEKDRWKSLRSSLLGRV 380 390 400 410 420 430 >>CCDS7202.2 RASGEF1A gene_id:221002|Hs108|chr10 (481 aa) initn: 1610 init1: 1043 opt: 1653 Z-score: 1861.7 bits: 353.8 E(32554): 2.2e-97 Smith-Waterman score: 1674; 53.9% identity (80.1% similar) in 482 aa overlap (1-465:1-480) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MPQT-LSASDMVTP---GSLSPPPTEPTDGEQAGQPLL---DGAPSSASLETLIQHLVPT :::: . :... : :...: : : .:. : :: :.:::.:..::::: CCDS72 MPQTSVVFSSILGPSCSGQVQPGMGERGGGAGGGSGDLIFQDGHLISGSLEALMEHLVPT 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 ADYYPEKAYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARVRKFGPKLLQL .::::...::::::::::.:. :..::::: ..:.::.: . .::....:. :..:: CCDS72 VDYYPDRTYIFTFLLSSRVFMPPHDLLARVGQICVEQKQQLEAGPEKAKLKSFSAKIVQL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 pF1KE4 LAEWTETFPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDE---AYRKRMHQLLQALHQKLAA---LR : ::::.:: :::.:.....:: .. :.. ::: . .: . :. :.: .::: :. CCDS72 LKEWTEAFPYDFQDEKAMAELKAITHRVTQCDEENGTVKKAIAQMTQSLLLSLAARSQLQ 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 QGPEGLV--GADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFV . : : ..:: .:::::. ....:::: :: .:::::::.::.:. : ::... CCDS72 ELREKLRPPAVDKGPILKTKPPAA-QKDILGVCCDPLVLAQQLTHIELDRVSSIYPEDLM 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 QAFVNKDPLASTKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFI : . : : . . : .: :: .:::: .::: : .:::::.: .:::.:....:::: CCDS72 QIVSHMDSLDNHR-CRGDLTKTYSLEAYDNWFNCLSMLVATEVCRVVKKKHRTRMLEFFI 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 DVARECFNIGNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPTGNFCNYRT ::::::::::::::.::::::::.:::.::::::.::.:::: .:::.:::..::::::: CCDS72 DVARECFNIGNFNSMMAIISGMNLSPVARLKKTWSKVKTAKFDVLEHHMDPSSNFCNYRT 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 ALRGAAHRSLTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVG ::.::..:: :.::::::::: :.:..::::::.. .:.:::::.::.:: :...:. CCDS72 ALQGATQRSQMANSSREKIVIPVFNLFVKDIYFLHKIHTNHLPNGHINFKKFWEISRQIH 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 EFITWKQVECPFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSIL ::.:: :::::::.: .: :: ::::.::..:..::.:::.:::. ::. ::.::...: CCDS72 EFMTWTQVECPFEKDKKIQSYLLTAPIYSEEALFVASFESEGPENHMEKDSWKTLRTTLL 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 GKT .. CCDS72 NRA 480 >>CCDS60517.1 RASGEF1A gene_id:221002|Hs108|chr10 (489 aa) initn: 1610 init1: 1043 opt: 1653 Z-score: 1861.6 bits: 353.8 E(32554): 2.3e-97 Smith-Waterman score: 1674; 53.9% identity (80.1% similar) in 482 aa overlap (1-465:9-488) 10 20 30 40 pF1KE4 MPQT-LSASDMVTP---GSLSPPPTEPTDGEQAGQPLL---DGAPSSASLET :::: . :... : :...: : : .:. : :: :.:::. CCDS60 MFLEPQETMPQTSVVFSSILGPSCSGQVQPGMGERGGGAGGGSGDLIFQDGHLISGSLEA 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 LIQHLVPTADYYPEKAYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARVRK :..:::::.::::...::::::::::.:. :..::::: ..:.::.: . .::.... CCDS60 LMEHLVPTVDYYPDRTYIFTFLLSSRVFMPPHDLLARVGQICVEQKQQLEAGPEKAKLKS 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 FGPKLLQLLAEWTETFPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDE---AYRKRMHQLLQALHQK :. :..::: ::::.:: :::.:.....:: .. :.. ::: . .: . :. :.: . CCDS60 FSAKIVQLLKEWTEAFPYDFQDEKAMAELKAITHRVTQCDEENGTVKKAIAQMTQSLLLS 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 pF1KE4 LAA---LRQGPEGLV--GADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLR ::: :.. : : ..:: .:::::. ....:::: :: .:::::::.::.:. CCDS60 LAARSQLQELREKLRPPAVDKGPILKTKPPAA-QKDILGVCCDPLVLAQQLTHIELDRVS 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 HIGPEEFVQAFVNKDPLASTKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQR : ::...: . : : . . : .: :: .:::: .::: : .:::::.: .:::.: CCDS60 SIYPEDLMQIVSHMDSLDNHR-CRGDLTKTYSLEAYDNWFNCLSMLVATEVCRVVKKKHR 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 AQVIEFFIDVARECFNIGNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPT ....::::::::::::::::::.::::::::.:::.::::::.::.:::: .:::.:::. CCDS60 TRMLEFFIDVARECFNIGNFNSMMAIISGMNLSPVARLKKTWSKVKTAKFDVLEHHMDPS 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 GNFCNYRTALRGAAHRSLTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKF .:::::::::.::..:: :.::::::::: :.:..::::::.. .:.:::::.::.:: CCDS60 SNFCNYRTALQGATQRSQMANSSREKIVIPVFNLFVKDIYFLHKIHTNHLPNGHINFKKF 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 LELAKQVGEFITWKQVECPFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERW :...:. ::.:: :::::::.: .: :: ::::.::..:..::.:::.:::. ::. : CCDS60 WEISRQIHEFMTWTQVECPFEKDKKIQSYLLTAPIYSEEALFVASFESEGPENHMEKDSW 420 430 440 450 460 470 460 pF1KE4 KALRSSILGKT :.::...:.. CCDS60 KTLRTTLLNRA 480 >>CCDS43277.1 RAPGEF2 gene_id:9693|Hs108|chr4 (1499 aa) initn: 336 init1: 205 opt: 350 Z-score: 385.0 bits: 82.2 E(32554): 4e-15 Smith-Waterman score: 350; 33.2% identity (64.9% similar) in 202 aa overlap (204-402:721-904) 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 VGADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFVQAFVNKDP .: ::. ..: .:.: : :... . . CCDS43 METETLCSDEDAQELLRESQISLLQLSTVEVATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFK--- 700 710 720 730 740 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 LASTKPCFSDKTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFIDVARECFNIG : : : .::. . . .:. . ::.:: ... .: ..:. :: .: .: . CCDS43 LRSKTSC-----ANLKRFEEVINQETFWVASEILRETNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECK 750 760 770 780 790 800 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 NFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKV--RTAKFFI-LEHQMDPTGNFCNYRTALRGAAH ::::..:::::.:..::.::. :: :. . :.: :. .::. :. .::..: . CCDS43 NFNSMFAIISGLNLAPVARLRTTWEKLPNKYEKLFQDLQDLFDPSRNMAKYRNVLNS--- 810 820 830 840 850 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 RSLTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVGEFITWKQ .. . .::.: .. ::. ::.:: ... .: :::::. .::.. CCDS43 ------QNLQPPIIPLFPVIKKDLTFLHEGNDSKV-DGLVNFEKLRMIAKEIRHVGRMAS 860 870 880 890 900 910 420 430 440 450 460 pF1KE4 VECPFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSILGKT CCDS43 VNMDPALMFRTRKKKWRSLGSLSQGSTNATVLDVAQTGGHKKRVRRSSFLNAKKLYEDAQ 920 930 940 950 960 970 >>CCDS54898.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1391 aa) initn: 295 init1: 182 opt: 318 Z-score: 349.6 bits: 75.6 E(32554): 3.8e-13 Smith-Waterman score: 323; 29.0% identity (59.2% similar) in 262 aa overlap (204-463:864-1096) 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 VGADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFVQAFVNKDP .: ::. ... .:.: : :.. : CCDS54 METETLCSDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYI------DD 840 850 860 870 880 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 LASTKPCFSDKTSN--LEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFIDVARECFN : . ...::.: :. . :. . ::.:: :.. .: ..:. :: .: .: . CCDS54 LFK----LNSKTGNTHLKRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRE 890 900 910 920 930 940 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 IGNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPTGNFCNYRTALRGAAHR ::::..:::::.:.. :.::. :: :. .:. .: .: : :. : .: CCDS54 CKNFNSMFAIISGLNLASVARLRGTWEKL-PSKYE--KHLQDLQDIFDPSRNM---AKYR 950 960 970 980 990 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 SLTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVGEFITWKQV .. . .: . .::.: .. ::. ::.:: ... .: :::::. ..:.. . . .. CCDS54 NILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLHEGNDSKV-DGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSA 1000 1010 1020 1030 1040 1050 420 430 440 450 460 pF1KE4 ECPFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSILGKT . . : .: . .: .: .:. . : .. .: :::.: CCDS54 N------------MDPAMMFRQRSLSQGSTNSNMLDVQGGAHKKRARRSSLLNAKKLYED 1060 1070 1080 1090 1100 CCDS54 AQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEPAYGTLTKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSA 1110 1120 1130 1140 1150 1160 >>CCDS54899.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1504 aa) initn: 295 init1: 182 opt: 318 Z-score: 349.0 bits: 75.6 E(32554): 4.1e-13 Smith-Waterman score: 323; 29.0% identity (59.2% similar) in 262 aa overlap (204-463:864-1104) 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 VGADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFVQAFVNKDP .: ::. ... .:.: : :.. : CCDS54 METETLCSDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYI------DD 840 850 860 870 880 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 LASTKPCFSDKTSN--LEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFIDVARECFN : . ...::.: :. . :. . ::.:: :.. .: ..:. :: .: .: . CCDS54 LFK----LNSKTGNTHLKRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRE 890 900 910 920 930 940 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 IGNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPTGNFCNYRTALRGAAHR ::::..:::::.:.. :.::. :: :. .:. .: .: : :. : .: CCDS54 CKNFNSMFAIISGLNLASVARLRGTWEKL-PSKYE--KHLQDLQDIFDPSRNM---AKYR 950 960 970 980 990 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 SLTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVGEFITWKQV .. . .: . .::.: .. ::. ::.:: ... .: :::::. ..:.. . . .. CCDS54 NILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLHEGNDSKV-DGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSA 1000 1010 1020 1030 1040 1050 420 430 440 450 460 pF1KE4 ECPFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSILGKT . .: .. : .: .: .:. . : .. .: :::.: CCDS54 N----MDPAMMFRQRKKRWRSLGSLSQGSTNSNMLDVQGGAHKKRARRSSLLNAKKLYED 1060 1070 1080 1090 1100 1110 CCDS54 AQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEPAYGTLTKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSA 1120 1130 1140 1150 1160 1170 >>CCDS54901.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1509 aa) initn: 295 init1: 182 opt: 318 Z-score: 348.9 bits: 75.6 E(32554): 4.1e-13 Smith-Waterman score: 323; 29.0% identity (59.2% similar) in 262 aa overlap (204-463:869-1109) 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 VGADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFVQAFVNKDP .: ::. ... .:.: : :.. : CCDS54 METETLCSDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYI------DD 840 850 860 870 880 890 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 LASTKPCFSDKTSN--LEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFIDVARECFN : . ...::.: :. . :. . ::.:: :.. .: ..:. :: .: .: . CCDS54 LFK----LNSKTGNTHLKRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRE 900 910 920 930 940 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 IGNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPTGNFCNYRTALRGAAHR ::::..:::::.:.. :.::. :: :. .:. .: .: : :. : .: CCDS54 CKNFNSMFAIISGLNLASVARLRGTWEKL-PSKYE--KHLQDLQDIFDPSRNM---AKYR 950 960 970 980 990 1000 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 SLTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVGEFITWKQV .. . .: . .::.: .. ::. ::.:: ... .: :::::. ..:.. . . .. CCDS54 NILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLHEGNDSKV-DGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSA 1010 1020 1030 1040 1050 1060 420 430 440 450 460 pF1KE4 ECPFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSILGKT . .: .. : .: .: .:. . : .. .: :::.: CCDS54 N----MDPAMMFRQRKKRWRSLGSLSQGSTNSNMLDVQGGAHKKRARRSSLLNAKKLYED 1070 1080 1090 1100 1110 CCDS54 AQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEPAYGTLTKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSA 1120 1130 1140 1150 1160 1170 466 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 04:11:48 2016 done: Sun Nov 6 04:11:48 2016 Total Scan time: 3.170 Total Display time: 0.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]