FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3204, 473 aa 1>>>pF1KE3204 473 - 473 aa - 473 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5646+/-0.000847; mu= 16.7820+/- 0.051 mean_var=74.3801+/-14.519, 0's: 0 Z-trim(106.9): 33 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.148712 statistics sampled from 9251 (9266) to 9251 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.665), E-opt: 0.2 (0.285), width: 16 Scan time: 2.950 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4202.1 CDC25C gene_id:995|Hs108|chr5 ( 473) 3188 693.4 1.3e-199 CCDS4203.1 CDC25C gene_id:995|Hs108|chr5 ( 400) 2184 478.0 7.9e-135 CCDS74701.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20 ( 489) 918 206.4 5.5e-53 CCDS74700.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20 ( 516) 910 204.7 1.9e-52 CCDS13066.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20 ( 539) 910 204.7 1.9e-52 CCDS13065.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20 ( 566) 910 204.7 2e-52 CCDS13067.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20 ( 580) 910 204.8 2.1e-52 CCDS2761.1 CDC25A gene_id:993|Hs108|chr3 ( 484) 860 194.0 3e-49 CCDS2760.1 CDC25A gene_id:993|Hs108|chr3 ( 524) 860 194.0 3.2e-49 >>CCDS4202.1 CDC25C gene_id:995|Hs108|chr5 (473 aa) initn: 3188 init1: 3188 opt: 3188 Z-score: 3697.1 bits: 693.4 E(32554): 1.3e-199 Smith-Waterman score: 3188; 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