FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1833, 351 aa 1>>>pF1KE1833 351 - 351 aa - 351 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0733+/-0.000909; mu= 18.1576+/- 0.055 mean_var=76.7930+/-15.123, 0's: 0 Z-trim(107.1): 30 B-trim: 38 in 1/49 Lambda= 0.146357 statistics sampled from 9360 (9389) to 9360 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.657), E-opt: 0.2 (0.288), width: 16 Scan time: 2.290 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS43368.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5 ( 351) 2477 532.4 2.1e-151 CCDS75311.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5 ( 369) 2324 500.2 1.2e-141 CCDS7494.1 WNT8B gene_id:7479|Hs108|chr10 ( 351) 1626 352.8 2.6e-97 CCDS8776.1 WNT1 gene_id:7471|Hs108|chr12 ( 370) 876 194.4 1.3e-49 CCDS8510.1 WNT5B gene_id:81029|Hs108|chr12 ( 359) 868 192.7 4e-49 CCDS58835.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 ( 365) 854 189.8 3.1e-48 CCDS46850.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 ( 380) 854 189.8 3.2e-48 CCDS33667.1 WNT7B gene_id:7477|Hs108|chr22 ( 349) 840 186.8 2.4e-47 CCDS11505.1 WNT3 gene_id:7473|Hs108|chr17 ( 355) 840 186.8 2.4e-47 CCDS1564.1 WNT3A gene_id:89780|Hs108|chr1 ( 352) 837 186.2 3.7e-47 CCDS2616.1 WNT7A gene_id:7476|Hs108|chr3 ( 349) 821 182.8 3.8e-46 CCDS5771.1 WNT2 gene_id:7472|Hs108|chr7 ( 360) 751 168.0 1.1e-41 CCDS223.1 WNT4 gene_id:54361|Hs108|chr1 ( 351) 746 166.9 2.2e-41 CCDS76188.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 299) 732 163.9 1.5e-40 CCDS846.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 372) 732 164.0 1.8e-40 CCDS847.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 391) 732 164.0 1.9e-40 CCDS31045.1 WNT9A gene_id:7483|Hs108|chr1 ( 365) 674 151.8 8.7e-37 CCDS5780.1 WNT16 gene_id:51384|Hs108|chr7 ( 355) 615 139.3 4.8e-33 CCDS5781.1 WNT16 gene_id:51384|Hs108|chr7 ( 365) 615 139.3 4.9e-33 CCDS8242.1 WNT11 gene_id:7481|Hs108|chr11 ( 354) 607 137.6 1.5e-32 CCDS11506.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17 ( 357) 596 135.3 7.7e-32 CCDS2426.1 WNT10A gene_id:80326|Hs108|chr2 ( 417) 568 129.4 5.2e-30 CCDS82147.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17 ( 329) 562 128.1 1.1e-29 CCDS2425.1 WNT6 gene_id:7475|Hs108|chr2 ( 365) 492 113.3 3.2e-25 CCDS8775.1 WNT10B gene_id:7480|Hs108|chr12 ( 389) 437 101.7 1.1e-21 >>CCDS43368.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5 (351 aa) initn: 2477 init1: 2477 opt: 2477 Z-score: 2831.6 bits: 532.4 E(32554): 2.1e-151 Smith-Waterman score: 2477; 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CCDS74 RTCKCHGVSGSCTTQTCWLQLPEFREVGAHLKEKYHAALKVDLLQG---AGNSAAGRGAI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 AEAFLPSAEAELIFLEESPDYCTCNSSLGIYGTEGRECLQNSHNTSRWERRSCGRLCTEC :..: . ::. ::.::::: :..::. ::::::::. .. .::::::: ::: .: CCDS74 ADTFRSISTRELVHLEDSPDYCLENKTLGLLGTEGRECLRRGRALGRWERRSCRRLCGDC 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 GLQVEERKTEVISSCNCKFQWCCTVKCDQCRHVVSKYYCARS--P--GSAQSLGKGSA :: ::::..:..:::::::.:::.:.:.:::. :.::.:.:. : :.:.. :. CCDS74 GLAVEERRAETVSSCNCKFHWCCAVRCEQCRRRVTKYFCSRAERPRGGAAHKPGRKP 300 310 320 330 340 350 >>CCDS8776.1 WNT1 gene_id:7471|Hs108|chr12 (370 aa) initn: 672 init1: 428 opt: 876 Z-score: 1004.4 bits: 194.4 E(32554): 1.3e-49 Smith-Waterman score: 876; 42.4% identity (65.3% similar) in 297 aa overlap (42-336:81-369) 20 30 40 50 60 70 pF1KE1 GICCAAFSASAWSVNNFLITGPKAYLTYTTSVALGAQSGIEECKFQFAWERWNCPENALQ ::. : ::...:::.:: .::::: CCDS87 KSLQLVLEPSLQLLSRKQRRLIRQNPGILHSVSGGLQSAVRECKWQFRNRRWNCPTAPGP 60 70 80 90 100 110 80 90 100 110 120 130 pF1KE1 LSTHNRLRSATRETSFIHAISSAGVMYIITKNCSMGDFENCGCDGSNNGKTGGHGWIWGG . . . :::.:: ::.:::: . ....:: :..:.: :: : :: : ::: CCDS87 HLFGKIVNRGCRETAFIFAITSAGVTHSVARSCSEGSIESCTCDYRRRGP-GGPDWHWGG 120 130 140 150 160 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 CSDNVEFGERISKLFVDSLEKGKDARALMNLHNNRAGRLAVRATMKRTCKCHGISGSCSI ::::..::. ... :::: :::.: : :::::::.::: .: . :.. :::::.::::.. CCDS87 CSDNIDFGRLFGREFVDSGEKGRDLRFLMNLHNNEAGRTTVFSEMRQECKCHGMSGSCTV 170 180 190 200 210 220 200 210 220 230 240 pF1KE1 QTCWLQLAEFREMGDYLKAKYDQALKIEMDKRQLRAGNSAEGHWVPAE--AFLPSAEAEL .:::..: .: .:: :. ..: : .. . .: .. :: . : : : . .: CCDS87 RTCWMRLPTLRAVGDVLRDRFDGASRVLYGNRGSNRASRAELLRLEPEDPAHKPPSPHDL 230 240 250 260 270 280 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 IFLEESPDYCTCNSSLGIYGTEGRECLQNSHNTSRWERRSCGRLCTECGLQVEERKTEVI ...:.::..:: .. :: :: :: : :.: .: :: :: . : .: CCDS87 VYFEKSPNFCTYSGRLGTAGTAGRAC-----NSSSPALDGCELLC--CGRGHRTRTQRVT 290 300 310 320 330 340 310 320 330 340 350 pF1KE1 SSCNCKFQWCCTVKCDQCRHVVSKYYCARSPGSAQSLGKGSA ::: :.::: :.: .: :. . : CCDS87 ERCNCTFHWCCHVSCRNCTHTRVLHECL 350 360 370 >>CCDS8510.1 WNT5B gene_id:81029|Hs108|chr12 (359 aa) initn: 545 init1: 395 opt: 868 Z-score: 995.4 bits: 192.7 E(32554): 4e-49 Smith-Waterman score: 868; 41.6% identity (67.1% similar) in 310 aa overlap (36-336:65-358) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MLWAALGICCAAFSASAWSVNNFLITGPKAYLTYTTSVALGAQSGIEECKFQFAWERWNC : . . .. ::..::.::. :: .:::: CCDS85 QRPEMFIIGAQPVCSQLPGLSPGQRKLCQLYQEHMAYIGEGAKTGIKECQHQFRQRRWNC 40 50 60 70 80 90 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 PENALQLSTHNR-LRSATRETSFIHAISSAGVMYIITKNCSMGDFENCGCDGSNNGKTGG .: . :. .: .. ..:::.: ::.:.:::. :.. : :.. .:::. . : CCDS85 S-TADNASVFGRVMQIGSRETAFTHAVSAAGVVNAISRACREGELSTCGCSRTARPKDLP 100 110 120 130 140 150 130 140 150 160 170 pF1KE1 HGWIWGGCSDNVEFGERISKLFVDSLEKGKD--------ARALMNLHNNRAGRLAVRATM . :.::::.::::.: :..: :::. :. :. .:.::::.::.::: :: CCDS85 RDWLWGGCGDNVEYGYRFAKEFVDAREREKNFAKGSEEQGRVLMNLQNNEAGRRAVYKMA 160 170 180 190 200 210 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 KRTCKCHGISGSCSIQTCWLQLAEFREMGDYLKAKYDQALKIEMDKRQLRAGNSAEGHWV .:::::.:::::..::::::::::..:: :: :::.: . : : : . . : CCDS85 DVACKCHGVSGSCSLKTCWLQLAEFRKVGDRLKEKYDSAAAM----RVTRKG---RLELV 220 230 240 250 260 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 PAEAFLPSAEAELIFLEESPDYCTCNSSLGIYGTEGRECLQNSHNTSRWERRSCGRLCTE .. :. : .:.... ::::: : : : ::.:: : ..:.. . .: .: CCDS85 NSRFTQPTPE-DLVYVDPSPDYCLRNESTGSLGTQGRLCNKTSEGMD-----GCELMC-- 270 280 290 300 310 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 CGLQVEERKTEVISSCNCKFQWCCTVKCDQCRHVVSKYYCARSPGSAQSLGKGSA :: .. :. . :.:::.::: :.: .: ..:..: : CCDS85 CGRGYNQFKSVQVERCHCKFHWCCFVRCKKCTEIVDQYICK 320 330 340 350 >>CCDS58835.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 (365 aa) initn: 548 init1: 378 opt: 854 Z-score: 979.4 bits: 189.8 E(32554): 3.1e-48 Smith-Waterman score: 854; 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39.9% identity (67.5% similar) in 311 aa overlap (36-336:86-379) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MLWAALGICCAAFSASAWSVNNFLITGPKAYLTYTTSVALGAQSGIEECKFQFAWERWNC : . .. ::..::.::..:: .:::: CCDS46 QMSEVYIIGAQPLCSQLAGLSQGQKKLCHLYQDHMQYIGEGAKTGIKECQYQFRHRRWNC 60 70 80 90 100 110 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 PENALQLSTHNR-LRSATRETSFIHAISSAGVMYIITKNCSMGDFENCGCDGSNNGKTGG .. . :. .: .. ..:::.: .:.:.:::. ... : :.. .:::. . : CCDS46 S-TVDNTSVFGRVMQIGSRETAFTYAVSAAGVVNAMSRACREGELSTCGCSRAARPKDLP 120 130 140 150 160 170 130 140 150 160 170 pF1KE1 HGWIWGGCSDNVEFGERISKLFVDSLE------KG--KDARALMNLHNNRAGRLAVRATM . :.::::.::...: :..: :::. : :: ..:: :::::::.::: .: CCDS46 RDWLWGGCGDNIDYGYRFAKEFVDARERERIHAKGSYESARILMNLHNNEAGRRTVYNLA 180 190 200 210 220 230 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 KRTCKCHGISGSCSIQTCWLQLAEFREMGDYLKAKYDQALKIEMDKRQLRAGNSAEGHWV .:::::.:::::..:::::::.::..:: :: :::.: .....: :. : CCDS46 DVACKCHGVSGSCSLKTCWLQLADFRKVGDALKEKYDSAAAMRLNSR---------GKLV 240 250 260 270 280 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 PAEA-FLPSAEAELIFLEESPDYCTCNSSLGIYGTEGRECLQNSHNTSRWERRSCGRLCT ... : . .:.... :::::. : : : ::.:: : ..:.. . .: .: CCDS46 QVNSRFNSPTTQDLVYIDPSPDYCVRNESTGSLGTQGRLCNKTSEGMD-----GCELMC- 290 300 310 320 330 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 ECGLQVEERKTEVISSCNCKFQWCCTVKCDQCRHVVSKYYCARSPGSAQSLGKGSA :: .. :: :.:::.::: ::: .: ..:... : CCDS46 -CGRGYDQFKTVQTERCHCKFHWCCYVKCKKCTEIVDQFVCK 340 350 360 370 380 >>CCDS33667.1 WNT7B gene_id:7477|Hs108|chr22 (349 aa) initn: 744 init1: 387 opt: 840 Z-score: 963.6 bits: 186.8 E(32554): 2.4e-47 Smith-Waterman score: 840; 39.7% identity (67.8% similar) in 295 aa overlap (43-336:62-348) 20 30 40 50 60 70 pF1KE1 ICCAAFSASAWSVNNFLITGPKAYLTYTTSVALGAQSGIEECKFQFAWERWNCPENALQL .. ::: ::.::..:: . :::: . . CCDS33 LGANIICNKIPGLAPRQRAICQSRPDAIIVIGEGAQMGINECQYQFRFGRWNCSALGEKT 40 50 60 70 80 90 80 90 100 110 120 130 pF1KE1 STHNRLRSATRETSFIHAISSAGVMYIITKNCSMGDFENCGCDGSNNGKTG-GHGWIWGG ..:: ..::..: .::..::: . .: ::.:.. ::::: ..: . ..:: ::: CCDS33 VFGQELRVGSREAAFTYAITAAGVAHAVTAACSQGNLSNCGCDREKQGYYNQAEGWKWGG 100 110 120 130 140 150 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 CSDNVEFGERISKLFVDSLEKGKDARALMNLHNNRAGRLAVRATMKRTCKCHGISGSCSI :: .:..: .:. :::. : :.:: :::::::.::: ... :. :::::.::::. CCDS33 CSADVRYGIDFSRRFVDAREIKKNARRLMNLHNNEAGRKVLEDRMQLECKCHGVSGSCTT 160 170 180 190 200 210 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 QTCWLQLAEFREMGDYLKAKYDQALKIEMDKRQLRAGNSAEGHWVPAEAFLPSAEAELIF .::: : .:::.: :: ::. :...:. : : . . . ... :..:.. CCDS33 KTCWTTLPKFREVGHLLKEKYNAAVQVEV-VRASRLRQPTFLRIKQLRSYQKPMETDLVY 220 230 240 250 260 270 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 LEESPDYCTCNSSLGIYGTEGRECLQNSHNTSRWERRSCGRLCTECGLQVEERKTEVISS .:.::.:: ... : ::.:: : ..: ... .: .: :: . .. . . CCDS33 IEKSPNYCEEDAATGSVGTQGRLCNRTSPGAD-----GCDTMC--CGRGYNTHQYTKVWQ 280 290 300 310 320 320 330 340 350 pF1KE1 CNCKFQWCCTVKCDQCRHVVSKYYCARSPGSAQSLGKGSA :::::.::: :::. : . . . : CCDS33 CNCKFHWCCFVKCNTCSERTEVFTCK 330 340 >>CCDS11505.1 WNT3 gene_id:7473|Hs108|chr17 (355 aa) initn: 821 init1: 441 opt: 840 Z-score: 963.5 bits: 186.8 E(32554): 2.4e-47 Smith-Waterman score: 840; 39.5% identity (65.1% similar) in 304 aa overlap (34-336:60-354) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 LFMLWAALGICCAAFSASAWSVNNFLITGPKAYLTYTTSVALGAQSGIEECKFQFAWERW . :. ::: :.. ::.::. :: .:: CCDS11 ALGQQYTSLGSQPLLCGSIPGLVPKQLRFCRNYIEIMPSVAEGVKLGIQECQHQFRGRRW 30 40 50 60 70 80 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 NCPENALQLSTHNR-LRSATRETSFIHAISSAGVMYIITKNCSMGDFENCGCDGSNNGKT :: .:. . : .::::..:.:::.:::: . .:..:. : ::::. ..: CCDS11 NCTTIDDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAIASAGVAFAVTRSCAEGTSTICGCDSHHKGPP 90 100 110 120 130 140 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 GGHGWIWGGCSDNVEFGERISKLFVDSLEKGKDARALMNLHNNRAGRLAVRATMKRTCKC : .:: :::::....:: .:. :.:. :. :::. :: :::.::: .. :. ::: CCDS11 G-EGWKWGGCSEDADFGVLVSREFADARENRPDARSAMNKHNNEAGRTTILDHMHLKCKC 150 160 170 180 190 200 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 HGISGSCSIQTCWLQLAEFREMGDYLKAKYDQALKIEMDKRQLRAGNSAEGHWVPAEAFL ::.:::: ..::: .:: .::.:: :::.: .. ..:.. : .: . : CCDS11 HGLSGSCEVKTCWWAQPDFRAIGDFLKDKYDSASEMVVEKHRESRGW-VETLRAKYSLFK 210 220 230 240 250 260 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 PSAEAELIFLEESPDYCTCNSSLGIYGTEGRECLQNSHNTSRWERRSCGRLCTECGLQVE : .: .:.. :.::..: : : .::. : : .::. . .: :: :: . CCDS11 PPTERDLVYYENSPNFCEPNPETGSFGTRDRTCNVTSHGID-----GCDLLC--CGRGHN 270 280 290 300 310 320 310 320 330 340 350 pF1KE1 ERKTEVISSCNCKFQWCCTVKCDQCRHVVSKYYCARSPGSAQSLGKGSA : . .:.: :.::: :.:..: .. . . : CCDS11 TRTEKRKEKCHCIFHWCCYVSCQECIRIYDVHTCK 330 340 350 >>CCDS1564.1 WNT3A gene_id:89780|Hs108|chr1 (352 aa) initn: 825 init1: 466 opt: 837 Z-score: 960.2 bits: 186.2 E(32554): 3.7e-47 Smith-Waterman score: 837; 39.5% identity (64.4% similar) in 309 aa overlap (34-336:57-351) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 LFMLWAALGICCAAFSASAWSVNNFLITGPKAYLTYTTSVALGAQSGIEECKFQFAWERW . :. ::: : . ::.::. :: .:: CCDS15 AVGPQYSSLGSQPILCASIPGLVPKQLRFCRNYVEIMPSVAEGIKIGIQECQHQFRGRRW 30 40 50 60 70 80 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 NCPENALQLSTHNR-LRSATRETSFIHAISSAGVMYIITKNCSMGDFENCGCDGSNNGKT :: .:. . : .::::..:.:::.:::: . .:..:. : :::.. ..: . CCDS15 NCTTVHDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAIASAGVAFAVTRSCAEGTAAICGCSSRHQG-S 90 100 110 120 130 140 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 GGHGWIWGGCSDNVEFGERISKLFVDSLEKGKDARALMNLHNNRAGRLAVRATMKRTCKC :.:: :::::...::: .:. :.:. :. :::. :: :::.::: :. . :. ::: CCDS15 PGKGWKWGGCSEDIEFGGMVSREFADARENRPDARSAMNRHNNEAGRQAIASHMHLKCKC 150 160 170 180 190 200 190 200 210 220 230 pF1KE1 HGISGSCSIQTCWLQLAEFREMGDYLKAKYDQALKIEMDKRQLRAGNSAEGHWV----PA ::.:::: ..::: . .:: .::.:: :::.: .. ..:.. : :: : CCDS15 HGLSGSCEVKTCWWSQPDFRAIGDFLKDKYDSASEMVVEKHRESRG------WVETLRPR 210 220 230 240 250 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 EAFLP-SAEAELIFLEESPDYCTCNSSLGIYGTEGRECLQNSHNTSRWERRSCGRLCTEC ... .: .:.. : ::..: : : .::. : : .::. . .: :: : CCDS15 YTYFKVPTERDLVYYEASPNFCEPNPETGSFGTRDRTCNVSSHGID-----GCDLLC--C 260 270 280 290 300 310 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 GLQVEERKTEVISSCNCKFQWCCTVKCDQCRHVVSKYYCARSPGSAQSLGKGSA : . : . .: : :.::: :.:..: .: . . : CCDS15 GRGHNARAERRREKCRCVFHWCCYVSCQECTRVYDVHTCK 320 330 340 350 351 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 17:07:49 2016 done: Sun Nov 6 17:07:50 2016 Total Scan time: 2.290 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]