Result of FASTA (omim) for pFN21AB0466
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB0466, 988 aa
  1>>>pF1KB0466 988 - 988 aa - 988 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.8661+/-0.000471; mu= -15.4731+/- 0.029
 mean_var=548.7422+/-113.996, 0's: 0 Z-trim(123.3): 49  B-trim: 1490 in 1/61
 Lambda= 0.054751
 statistics sampled from 42777 (42850) to 42777 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.767), E-opt: 0.2 (0.502), width:  16
 Scan time: 11.610

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_689618 (OMIM: 604279) junction-mediating and -r ( 988) 6486 527.7 1.2e-148
XP_005248487 (OMIM: 604279) PREDICTED: junction-me ( 947) 4501 370.9 1.8e-101
XP_011541457 (OMIM: 604279) PREDICTED: junction-me ( 956) 4304 355.3 8.6e-97
NP_001073904 (OMIM: 612393) WASP homolog-associate ( 809) 1176 108.2 1.8e-22
XP_005272478 (OMIM: 612393) PREDICTED: WASP homolo ( 596) 1055 98.5 1.1e-19
XP_016877412 (OMIM: 612393) PREDICTED: WASP homolo ( 507)  993 93.6 2.9e-18
XP_005272479 (OMIM: 612393) PREDICTED: WASP homolo ( 579)  907 86.8 3.5e-16
XP_005272480 (OMIM: 612393) PREDICTED: WASP homolo ( 579)  907 86.8 3.5e-16
XP_011519534 (OMIM: 612393) PREDICTED: WASP homolo ( 536)  727 72.6 6.3e-12


>>NP_689618 (OMIM: 604279) junction-mediating and -regul  (988 aa)
 initn: 6486 init1: 6486 opt: 6486  Z-score: 2790.0  bits: 527.7 E(85289): 1.2e-148
Smith-Waterman score: 6486; 99.9% identity (100.0% similar) in 988 aa overlap (1-988:1-988)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MSFALEETLESDWVAVRPHVFDEREKHKFVFIVAWNEIEGKFAITCHNRTAQRQRSGSRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 MSFALEETLESDWVAVRPHVFDEREKHKFVFIVAWNEIEGKFAITCHNRTAQRQRSGSRE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 QAGARGGAEAGGAASDGSRGPGSPAGRGRPEATASATLVRSPGPRRSSAWAEGGSPRSTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 QAGARGGAEAGGAASDGSRGPGSPAGRGRPEATASATLVRSPGPRRSSAWAEGGSPRSTR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 SLLGDPRLRSPGSKGAESRLRSPVRAKPIPGQKTSEADDAAGAAAAAARPAPREAQVSSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 SLLGDPRLRSPGSKGAESRLRSPVRAKPIPGQKTSEADDAAGAAAAAARPAPREAQVSSV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 RIVSASGTVSEEIEVLEMVKEDEAPLALSDAEQPPPATELESPAEECSWAGLFSFQDLRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 RIVSASGTVSEEIEVLEMVKEDEAPLALSDAEQPPPATELESPAEECSWAGLFSFQDLRA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 VHQQLCSVNSQLEPCLPVFPEEPSGMWTVLFGGAPEMTEQEIDTLCYQLQVYLGHGLDTC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 VHQQLCSVNSQLEPCLPVFPEEPSGMWTVLFGGAPEMTEQEIDTLCYQLQVYLGHGLDTC
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 GWKILSQVLFTETDDPEEYYESLSELRQKGYEEVLQRARKRIQELLDKHKNTESMVELLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 GWKILSQVLFTETDDPEEYYESLSELRQKGYEEVLQRARKRIQELLDKHKNTESMVELLD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 LYQLEDEAYSSLAEATTELYQYLLQPFRDMRELAMLRRQQIKISMENDYLGPRRIESLQK
       :::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 LYQMEDEAYSSLAEATTELYQYLLQPFRDMRELAMLRRQQIKISMENDYLGPRRIESLQK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB0 EDADWQRKAHMAVLSIQDLTVKYFEITAKAQKAVYDRMRADQKKFGKASWAAAAERMEKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 EDADWQRKAHMAVLSIQDLTVKYFEITAKAQKAVYDRMRADQKKFGKASWAAAAERMEKL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB0 QYAVSKETLQMMRAKEICLEQRKHALKEEMQSLRGGTEAIARLDQLEADYYDLQLQLYEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 QYAVSKETLQMMRAKEICLEQRKHALKEEMQSLRGGTEAIARLDQLEADYYDLQLQLYEV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB0 QFEILKCEELLLTAQLESIKRLISEKRDEVVYYDTYESMEAMLEKEEMAASAYLQREELQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 QFEILKCEELLLTAQLESIKRLISEKRDEVVYYDTYESMEAMLEKEEMAASAYLQREELQ
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB0 KLQQKARQLEARRGRVSAKKSYLRNKKEICIAKHNEKIQQRTRIEDEYRTHHTVQLKREK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 KLQQKARQLEARRGRVSAKKSYLRNKKEICIAKHNEKIQQRTRIEDEYRTHHTVQLKREK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB0 LHDEEERKSAWVSQERQRTLDRLRTFKQRYPGQVILKSTRLRLAHARRKGAASPVLQEDH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 LHDEEERKSAWVSQERQRTLDRLRTFKQRYPGQVILKSTRLRLAHARRKGAASPVLQEDH
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB0 CDSLPSVLQVEEKTEEVGEGRVKRGPSQTTEPQSLVQLEDTSLTQLEATSLPLSGVTSEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 CDSLPSVLQVEEKTEEVGEGRVKRGPSQTTEPQSLVQLEDTSLTQLEATSLPLSGVTSEL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB0 PPTISLPLLNNNLEPCSVTINPLPSPLPPTPPPPPPPPPPPPPPPLPVAKDSGPETLEKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 PPTISLPLLNNNLEPCSVTINPLPSPLPPTPPPPPPPPPPPPPPPLPVAKDSGPETLEKD
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB0 LPRKEGNEKRIPKSASAPSAHLFDSSQLVSARKKLRKTAEGLQRRRVSSPMDEVLASLKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 LPRKEGNEKRIPKSASAPSAHLFDSSQLVSARKKLRKTAEGLQRRRVSSPMDEVLASLKR
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB0 GSFHLKKVEQRTLPPFPDEDDSNNILAQIRKGVKLKKVQKDVLRESFTLLPDTDPLTRSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 GSFHLKKVEQRTLPPFPDEDDSNNILAQIRKGVKLKKVQKDVLRESFTLLPDTDPLTRSI
              910       920       930       940       950       960

              970       980        
pF1KB0 HEALRRIKEASPESEDEEEALPCTDWEN
       ::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 HEALRRIKEASPESEDEEEALPCTDWEN
              970       980        

>>XP_005248487 (OMIM: 604279) PREDICTED: junction-mediat  (947 aa)
 initn: 4750 init1: 4486 opt: 4501  Z-score: 1942.8  bits: 370.9 E(85289): 1.8e-101
Smith-Waterman score: 6122; 95.7% identity (95.9% similar) in 988 aa overlap (1-988:1-947)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MSFALEETLESDWVAVRPHVFDEREKHKFVFIVAWNEIEGKFAITCHNRTAQRQRSGSRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MSFALEETLESDWVAVRPHVFDEREKHKFVFIVAWNEIEGKFAITCHNRTAQRQRSGSRE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 QAGARGGAEAGGAASDGSRGPGSPAGRGRPEATASATLVRSPGPRRSSAWAEGGSPRSTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QAGARGGAEAGGAASDGSRGPGSPAGRGRPEATASATLVRSPGPRRSSAWAEGGSPRSTR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 SLLGDPRLRSPGSKGAESRLRSPVRAKPIPGQKTSEADDAAGAAAAAARPAPREAQVSSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SLLGDPRLRSPGSKGAESRLRSPVRAKPIPGQKTSEADDAAGAAAAAARPAPREAQVSSV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 RIVSASGTVSEEIEVLEMVKEDEAPLALSDAEQPPPATELESPAEECSWAGLFSFQDLRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RIVSASGTVSEEIEVLEMVKEDEAPLALSDAEQPPPATELESPAEECSWAGLFSFQDLRA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 VHQQLCSVNSQLEPCLPVFPEEPSGMWTVLFGGAPEMTEQEIDTLCYQLQVYLGHGLDTC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VHQQLCSVNSQLEPCLPVFPEEPSGMWTVLFGGAPEMTEQEIDTLCYQLQVYLGHGLDTC
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 GWKILSQVLFTETDDPEEYYESLSELRQKGYEEVLQRARKRIQELLDKHKNTESMVELLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GWKILSQVLFTETDDPEEYYESLSELRQKGYEEVLQRARKRIQELLDKHKNTESMVELLD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 LYQLEDEAYSSLAEATTELYQYLLQPFRDMRELAMLRRQQIKISMENDYLGPRRIESLQK
       :::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LYQMEDEAYSSLAEATTELYQYLLQPFRDMRELAMLRRQQIKISMENDYLGPRRIESLQK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB0 EDADWQRKAHMAVLSIQDLTVKYFEITAKAQKAVYDRMRADQKKFGKASWAAAAERMEKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EDADWQRKAHMAVLSIQDLTVKYFEITAKAQKAVYDRMRADQKKFGKASWAAAAERMEKL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB0 QYAVSKETLQMMRAKEICLEQRKHALKEEMQSLRGGTEAIARLDQLEADYYDLQLQLYEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QYAVSKETLQMMRAKEICLEQRKHALKEEMQSLRGGTEAIARLDQLEADYYDLQLQLYEV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB0 QFEILKCEELLLTAQLESIKRLISEKRDEVVYYDTYESMEAMLEKEEMAASAYLQREELQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QFEILKCEELLLTAQLESIKRLISEKRDEVVYYDTYESMEAMLEKEEMAASAYLQREELQ
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB0 KLQQKARQLEARRGRVSAKKSYLRNKKEICIAKHNEKIQQRTRIEDEYRTHHTVQLKREK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KLQQKARQLEARRGRVSAKKSYLRNKKEICIAKHNEKIQQRTRIEDEYRTHHTVQLKREK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB0 LHDEEERKSAWVSQERQRTLDRLRTFKQRYPGQVILKSTRLRLAHARRKGAASPVLQEDH
       ::::::::::::::::::::::::::::                                
XP_005 LHDEEERKSAWVSQERQRTLDRLRTFKQ--------------------------------
              670       680                                        

              730       740       750       760       770       780
pF1KB0 CDSLPSVLQVEEKTEEVGEGRVKRGPSQTTEPQSLVQLEDTSLTQLEATSLPLSGVTSEL
                :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ---------VEEKTEEVGEGRVKRGPSQTTEPQSLVQLEDTSLTQLEATSLPLSGVTSEL
               690       700       710       720       730         

              790       800       810       820       830       840
pF1KB0 PPTISLPLLNNNLEPCSVTINPLPSPLPPTPPPPPPPPPPPPPPPLPVAKDSGPETLEKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PPTISLPLLNNNLEPCSVTINPLPSPLPPTPPPPPPPPPPPPPPPLPVAKDSGPETLEKD
     740       750       760       770       780       790         

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XP_005 LPRKEGNEKRIPKSASAPSAHLFDSSQLVSARKKLRKTAEGLQRRRVSSPMDEVLASLKR
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XP_005 GSFHLKKVEQRTLPPFPDEDDSNNILAQIRKGVKLKKVQKDVLRESFTLLPDTDPLTRSI
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       ::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HEALRRIKEASPESEDEEEALPCTDWEN
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XP_011 GSFHLKKVEQRTLPPFPDEDDSNNILAQIRKGVKLKKVQKDVLRESFTLLPDTDPLTRSI
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XP_011 HEALRRIKEASPESEDEEEALPCTDWEN
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       :: . : ::   . ..::       .  ::  :.:... .    .:  :...... : ..
NP_001 LGAAADGCGGATVRDALFPAEGGAADC-ESPREFRERALRARWVEADARLRQVIQGHGKA
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       ..:: :...:: :::::. :. ..: ..:::::::: :::.: : . .:  :...: :::
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pF1KB0 RRIESLQKEDADWQRKAHMAVLSIQDLTVKYFEITAKAQKAVYDRMRADQKKFGKASWAA
       ::. .:.::  .: :.:. ::.::::.::.::. :.::  ..  .:. : :.::.:.::.
NP_001 RRVVALEKEAEEWTRRAEEAVVSIQDITVNYFKETVKALAGMQKEMEQDAKRFGQAAWAT
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       :  :.::::  ...::::.:::::.::....  .. .:..:    .    .:.:: ..:.
NP_001 AIPRLEKLQLMLARETLQLMRAKELCLNHKRAEIQGKMEDLPEQEKNTNVVDELEIQFYE
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       .::.::::.::::: ::.:::.::.:.::::.::.:::::::  :. : .   . ...  
NP_001 IQLELYEVKFEILKNEEILLTTQLDSLKRLIKEKQDEVVYYDPCENPEELKVIDCVVGLQ
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pF1KB0 YLQREELQKLQQKARQLEARRGRVSAKKSYLRNKKEICIAKHNEKIQQRTRIEDEYRTHH
         .  :...:... .:::..:::. ::.. ::..:. :  .:  ..::  .     : ::
NP_001 DDKNLEVKELRRQCQQLESKRGRICAKRASLRSRKDQCKENHRFRLQQAEESIRYSRQHH
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pF1KB0 TVQLKREKLHDEEERKSAWVSQERQRTLDRLRTFKQRYPGQVILKSTRLRLAHARRKGAA
       ..:.::.:...::..:. :..::::.::.:::.::..            :::.. :. ..
NP_001 SIQMKRDKIKEEEQKKKEWINQERQKTLQRLRSFKDK------------RLAQSVRNTSG
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pF1KB0 S-PVLQEDHCDSLPSVLQVEEKTEEVGEGRVKRGPSQTTEPQSLVQLEDTSLTQLEATSL
       : ::       .::: :. .          : .  :. :.    : : ...    .. : 
NP_001 SEPV-----APNLPSDLSQQMCLPASHAVSVIHPSSRKTRG---VPLSEAG----NVKSP
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         ..  ...:  . .:. .   .  : . . :  : :: :::::::::::::::: . ..
NP_001 KCQNCHGNIPVQVFVPVGD---QTHSKSSEELSLPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPLRALSS
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pF1KB0 SGPETLEKDLPRKEGNEKRIPKSASAPSAHLFDSSQLVSARKKLRKTAEGLQRRRVSSPM
       :.  . ...:        : : . . :   . .:          ..  ..:.     . :
NP_001 SSQAATHQNLGF------RAPVKDDQPRPLVCESPA--------ERPRDSLESFSCPGSM
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pF1KB0 DEVLASLKRGSFHLKKVEQRTLPPFPDEDDSNNILAQIRKGVKLKKVQKDVLRESFTLLP
       :::::::..:   :.:::  .. : :  . ...::: ::.:::::::. : :  . .  :
NP_001 DEVLASLRHGRAPLRKVEVPAVRP-PHASINEHILAAIRQGVKLKKVHPD-LGPNPSSKP
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pF1KB0 D----TDPLTRSIHEALRRIKEASPESEDEEEALPCTDWEN
            :. : :::. ::.:::..: .::.. .     .:. 
NP_001 TSNRRTSDLERSIKAALQRIKRVSADSEEDSDEQDPGQWDG
      770       780       790       800         

>>XP_005272478 (OMIM: 612393) PREDICTED: WASP homolog-as  (596 aa)
 initn: 1780 init1: 1055 opt: 1055  Z-score: 474.5  bits: 98.5 E(85289): 1.1e-19
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                                     :: :...:: :::::. :. ..: ..::::
XP_005                               MVALMNVYQEEDEAYQELVTVATMFFQYLL
                                             10        20        30

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pF1KB0 QPFRDMRELAMLRRQQIKISMENDYLGPRRIESLQKEDADWQRKAHMAVLSIQDLTVKYF
       :::: :::.: : . .:  :...: :::::. .:.::  .: :.:. ::.::::.::.::
XP_005 QPFRAMREVATLCKLDILKSLDEDDLGPRRVVALEKEAEEWTRRAEEAVVSIQDITVNYF
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pF1KB0 EITAKAQKAVYDRMRADQKKFGKASWAAAAERMEKLQYAVSKETLQMMRAKEICLEQRKH
       . :.::  ..  .:. : :.::.:.::.:  :.::::  ...::::.:::::.::.... 
XP_005 KETVKALAGMQKEMEQDAKRFGQAAWATAIPRLEKLQLMLARETLQLMRAKELCLNHKRA
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pF1KB0 ALKEEMQSLRGGTEAIARLDQLEADYYDLQLQLYEVQFEILKCEELLLTAQLESIKRLIS
        .. .:..:    .    .:.:: ..:..::.::::.::::: ::.:::.::.:.::::.
XP_005 EIQGKMEDLPEQEKNTNVVDELEIQFYEIQLELYEVKFEILKNEEILLTTQLDSLKRLIK
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pF1KB0 EKRDEVVYYDTYESMEAMLEKEEMAASAYLQREELQKLQQKARQLEARRGRVSAKKSYLR
       ::.:::::::  :. : .   . ...    .  :...:... .:::..:::. ::.. ::
XP_005 EKQDEVVYYDPCENPEELKVIDCVVGLQDDKNLEVKELRRQCQQLESKRGRICAKRASLR
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pF1KB0 NKKEICIAKHNEKIQQRTRIEDEYRTHHTVQLKREKLHDEEERKSAWVSQERQRTLDRLR
       ..:. :  .:  ..::  .     : ::..:.::.:...::..:. :..::::.::.:::
XP_005 SRKDQCKENHRFRLQQAEESIRYSRQHHSIQMKRDKIKEEEQKKKEWINQERQKTLQRLR
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pF1KB0 TFKQRYPGQVILKSTRLRLAHARRKGAASPVLQEDHCDSLPSVLQVEEKTEEVGEGRVKR
       .::..            :::.. :. ..:    :    .::: :. .          : .
XP_005 SFKDK------------RLAQSVRNTSGS----EPVAPNLPSDLSQQMCLPASHAVSVIH
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pF1KB0 GPSQTTEPQSLVQLEDTSLTQLEATSLPLSGVTSELPPTISLPLLNNNLEPCSVTINPLP
         :. :.    : : ...    .. :   ..  ...:  . .:. .   .  : . . : 
XP_005 PSSRKTRG---VPLSEAG----NVKSPKCQNCHGNIPVQVFVPVGD---QTHSKSSEELS
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pF1KB0 SPLPPTPPPPPPPPPPPPPPPLPVAKDSGPETLEKDLPRKEGNEKRIPKSASAPSAHLFD
        : :: :::::::::::::::: . ..:.  . ...:        : : . . :   . .
XP_005 LPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPLRALSSSSQAATHQNLGF------RAPVKDDQPRPLVCE
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pF1KB0 SSQLVSARKKLRKTAEGLQRRRVSSPMDEVLASLKRGSFHLKKVEQRTLPPFPDEDDSNN
       :          ..  ..:.     . ::::::::..:   :.:::  .. : :  . ...
XP_005 SPA--------ERPRDSLESFSCPGSMDEVLASLRHGRAPLRKVEVPAVRP-PHASINEH
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pF1KB0 ILAQIRKGVKLKKVQKDVLRESFTLLPD----TDPLTRSIHEALRRIKEASPESEDEEEA
       ::: ::.:::::::. : :  . .  :     :. : :::. ::.:::..: .::.. . 
XP_005 ILAAIRQGVKLKKVHPD-LGPNPSSKPTSNRRTSDLERSIKAALQRIKRVSADSEEDSDE
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pF1KB0 LPCTDWEN
           .:. 
XP_005 QDPGQWDG
      590      

>>XP_016877412 (OMIM: 612393) PREDICTED: WASP homolog-as  (507 aa)
 initn: 1242 init1: 891 opt: 993  Z-score: 449.0  bits: 93.6 E(85289): 2.9e-18
Smith-Waterman score: 1088; 40.0% identity (70.0% similar) in 443 aa overlap (214-645:63-503)

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pF1KB0 QLCSVNSQLEPCLPVFPEEPS-----------GMWTVLFGGAPEMTEQEIDTLCYQLQVY
       :: ..   :: :.: .: : .           :.:..:.       :  .. :: ::. :
XP_016 QLAALWPPLERCFPRLPPELDVGGGGAWGLGLGLWALLWPTRAGPGEAALQELCGQLERY
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pF1KB0 LGHGLDTCGWKILSQVLFTETDDPEEYYESLSELRQKGYEEVLQRARKRIQELLDKHKNT
       :: . : ::   . ..::       .  ::  :.:... .    .:  :...... : ..
XP_016 LGAAADGCGGATVRDALFPAEGGAADC-ESPREFRERALRARWVEADARLRQVIQGHGKA
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pF1KB0 ESMVELLDLYQLEDEAYSSLAEATTELYQYLLQPFRDMRELAMLRRQQIKISMENDYLGP
       ..:: :...:: :::::. :. ..: ..:::::::: :::.: : . .:  :...: :::
XP_016 NTMVALMNVYQEEDEAYQELVTVATMFFQYLLQPFRAMREVATLCKLDILKSLDEDDLGP
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pF1KB0 RRIESLQKEDADWQRKAHMAVLSIQDLTVKYFEITAKAQKAVYDRMRADQKKFGKASWAA
       ::. .:.::  .: :.:. ::.::::.::.::. :.::  ..  .:. : :.::.:.::.
XP_016 RRVVALEKEAEEWTRRAEEAVVSIQDITVNYFKETVKALAGMQKEMEQDAKRFGQAAWAT
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pF1KB0 AAERMEKLQYAVSKETLQMMRAKEICLEQRKHALKEEMQSLRGGTEAIARLDQLEADYYD
       :  :.::::  ...::::.:::::.::....  .. .:..:    .    .:.:: ..:.
XP_016 AIPRLEKLQLMLARETLQLMRAKELCLNHKRAEIQGKMEDLPEQEKNTNVVDELEIQFYE
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pF1KB0 LQLQLYEVQFEILKCEELLLTAQLESIKRLISEKRDEVVYYDTYESMEAMLEKEEMAASA
       .::.::::.::::: ::.:::.::.:.::::.::.:::::::  :. : .   . ...  
XP_016 IQLELYEVKFEILKNEEILLTTQLDSLKRLIKEKQDEVVYYDPCENPEELKVIDCVVGLQ
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pF1KB0 YLQREELQKLQQKARQLEARRGRVSAKKSYLRNKKEICIAKHNEKIQQRTRIEDEYRTHH
         .  :...:... .:::..:::. ::.. ::..: :::   . ..:... ..       
XP_016 DDKNLEVKELRRQCQQLESKRGRICAKRASLRSRKVICIIPPG-SVQRKSSVQIATG   
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pF1KB0 TVQLKREKLHDEEERKSAWVSQERQRTLDRLRTFKQRYPGQVILKSTRLRLAHARRKGAA

>>XP_005272479 (OMIM: 612393) PREDICTED: WASP homolog-as  (579 aa)
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Smith-Waterman score: 1215; 37.2% identity (65.5% similar) in 600 aa overlap (393-987:22-578)

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XP_005          MKHTRNWLPWQPCSSSTYCSHLGLCEKLQLYKSLDEDDLGPRRVVALEKEA
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pF1KB0 ADWQRKAHMAVLSIQDLTVKYFEITAKAQKAVYDRMRADQKKFGKASWAAAAERMEKLQY
        .: :.:. ::.::::.::.::. :.::  ..  .:. : :.::.:.::.:  :.:::: 
XP_005 EEWTRRAEEAVVSIQDITVNYFKETVKALAGMQKEMEQDAKRFGQAAWATAIPRLEKLQL
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        ...::::.:::::.::....  .. .:..:    .    .:.:: ..:..::.::::.:
XP_005 MLARETLQLMRAKELCLNHKRAEIQGKMEDLPEQEKNTNVVDELEIQFYEIQLELYEVKF
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       :::: ::.:::.::.:.::::.::.:::::::  :. : .   . ...    .  :...:
XP_005 EILKNEEILLTTQLDSLKRLIKEKQDEVVYYDPCENPEELKVIDCVVGLQDDKNLEVKEL
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pF1KB0 QQKARQLEARRGRVSAKKSYLRNKKEICIAKHNEKIQQRTRIEDEYRTHHTVQLKREKLH
       ... .:::..:::. ::.. ::..:. :  .:  ..::  .     : ::..:.::.:..
XP_005 RRQCQQLESKRGRICAKRASLRSRKDQCKENHRFRLQQAEESIRYSRQHHSIQMKRDKIK
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pF1KB0 DEEERKSAWVSQERQRTLDRLRTFKQRYPGQVILKSTRLRLAHARRKGAAS-PVLQEDHC
       .::..:. :..::::.::.:::.::..            :::.. :. ..: ::      
XP_005 EEEQKKKEWINQERQKTLQRLRSFKDK------------RLAQSVRNTSGSEPV-----A
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pF1KB0 DSLPSVLQVEEKTEEVGEGRVKRGPSQTTEPQSLVQLEDTSLTQLEATSLPLSGVTSELP
        .::: :. .          : .  :. :.    : : ...    .. :   ..  ...:
XP_005 PNLPSDLSQQMCLPASHAVSVIHPSSRKTRG---VPLSEAG----NVKSPKCQNCHGNIP
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pF1KB0 PTISLPLLNNNLEPCSVTINPLPSPLPPTPPPPPPPPPPPPPPPLPVAKDSGPETLEKDL
         . .:. ...    :   . :  : :: :::::::::::::::: . ..:.  . ...:
XP_005 VQVFVPVGDQTHSKSS---EELSLPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPLRALSSSSQAATHQNL
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pF1KB0 PRKEGNEKRIPKSASAPSAHLFDSSQLVSARKKLRKTAEGLQRRRVSSPMDEVLASLKRG
               : : . . :   . .:          ..  ..:.     . ::::::::..:
XP_005 GF------RAPVKDDQPRPLVCESPA--------ERPRDSLESFSCPGSMDEVLASLRHG
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pF1KB0 SFHLKKVEQRTLPPFPDEDDSNNILAQIRKGVKLKKVQKDVLRESFTLLPD----TDPLT
          :.:::  .. : :  . ...::: ::.:::::::. : :  . .  :     :. : 
XP_005 RAPLRKVEVPAVRP-PHASINEHILAAIRQGVKLKKVHPD-LGPNPSSKPTSNRRTSDLE
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pF1KB0 RSIHEALRRIKEASPESEDEEEALPCTDWEN
       :::. ::.:::..: .::.. .     .:. 
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       ... .:::..:::. ::.. ::..:. :  .:  ..::  .     : ::..:.::.:..
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pF1KB0 DEEERKSAWVSQERQRTLDRLRTFKQRYPGQVILKSTRLRLAHARRKGAAS-PVLQEDHC
       .::..:. :..::::.::.:::.::..            :::.. :. ..: ::      
XP_005 EEEQKKKEWINQERQKTLQRLRSFKDK------------RLAQSVRNTSGSEPV-----A
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pF1KB0 DSLPSVLQVEEKTEEVGEGRVKRGPSQTTEPQSLVQLEDTSLTQLEATSLPLSGVTSELP
        .::: :. .          : .  :. :.    : : ...    .. :   ..  ...:
XP_005 PNLPSDLSQQMCLPASHAVSVIHPSSRKTRG---VPLSEAG----NVKSPKCQNCHGNIP
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pF1KB0 PTISLPLLNNNLEPCSVTINPLPSPLPPTPPPPPPPPPPPPPPPLPVAKDSGPETLEKDL
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XP_005 VQVFVPVGDQTHSKSS---EELSLPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPLRALSSSSQAATHQNL
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               : : . . :   . .:          ..  ..:.     . ::::::::..:
XP_005 GF------RAPVKDDQPRPLVCESPA--------ERPRDSLESFSCPGSMDEVLASLRHG
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pF1KB0 RSIHEALRRIKEASPESEDEEEALPCTDWEN
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XP_005 RSIKAALQRIKRVSADSEEDSDEQDPGQWDG
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pF1KB0 QYAVSKETLQMMRAKEICLEQRKHALKEEMQSLRGGTEAIARLDQLEADYYDLQLQLYEV
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pF1KB0 QFEILKCEELLLTAQLESIKRLISEKRDEVVYYDTYESMEAMLEKEEMAASAYLQREELQ
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XP_011 ERSIKAALQRIKRVSADSEEDSDEQDPGQWDG
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988 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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 start: Sun Nov  6 17:12:30 2016 done: Sun Nov  6 17:12:32 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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