Result of FASTA (ccds) for pFN21AE6737
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE6737, 866 aa
  1>>>pF1KE6737 866 - 866 aa - 866 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4393+/-0.00102; mu= 20.2042+/- 0.062
 mean_var=73.3534+/-14.761, 0's: 0 Z-trim(104.1): 28  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.149749
 statistics sampled from 7728 (7740) to 7728 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.238), width:  16
 Scan time:  3.230

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4044.1 DMGDH gene_id:29958|Hs108|chr5          ( 866) 5824 1268.3       0
CCDS45520.1 PDPR gene_id:55066|Hs108|chr16         ( 879) 1289 288.6 3.3e-77
CCDS82007.1 PDPR gene_id:55066|Hs108|chr16         ( 779) 1119 251.8 3.4e-66
CCDS6978.1 SARDH gene_id:1757|Hs108|chr9           ( 918)  572 133.7 1.5e-30
CCDS2797.1 AMT gene_id:275|Hs108|chr3              ( 403)  340 83.4 9.2e-16
CCDS54583.1 AMT gene_id:275|Hs108|chr3             ( 347)  326 80.3 6.6e-15
CCDS54585.1 AMT gene_id:275|Hs108|chr3             ( 386)  320 79.0 1.8e-14
CCDS54584.1 AMT gene_id:275|Hs108|chr3             ( 359)  273 68.9 1.9e-11


>>CCDS4044.1 DMGDH gene_id:29958|Hs108|chr5               (866 aa)
 initn: 5824 init1: 5824 opt: 5824  Z-score: 6794.7  bits: 1268.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5824; 100.0% identity (100.0% similar) in 866 aa overlap (1-866:1-866)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MLRPGAQLLRGLLLRSCPLQGSPGRPRSVCGREGEEKPPLSAETQWKDRAETVIIGGGCV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 MLRPGAQLLRGLLLRSCPLQGSPGRPRSVCGREGEEKPPLSAETQWKDRAETVIIGGGCV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 GVSLAYHLAKAGMKDVVLLEKSELTAGSTWHAAGLTTYFHPGINLKKIHYDSIKLYEKLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 GVSLAYHLAKAGMKDVVLLEKSELTAGSTWHAAGLTTYFHPGINLKKIHYDSIKLYEKLE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 EETGQVVGFHQPGSIRLATTPVRVDEFKYQMTRTGWHATEQYLIEPEKIQEMFPLLNMNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 EETGQVVGFHQPGSIRLATTPVRVDEFKYQMTRTGWHATEQYLIEPEKIQEMFPLLNMNK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 VLAGLYNPGDGHIDPYSLTMALAAGARKCGALLKYPAPVTSLKARSDGTWDVETPQGSMR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 VLAGLYNPGDGHIDPYSLTMALAAGARKCGALLKYPAPVTSLKARSDGTWDVETPQGSMR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 ANRIVNAAGFWAREVGKMIGLEHPLIPVQHQYVVTSTISEVKALKRELPVLRDLEGSYYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 ANRIVNAAGFWAREVGKMIGLEHPLIPVQHQYVVTSTISEVKALKRELPVLRDLEGSYYL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE6 RQERDGLLFGPYESQEKMKVQDSWVTNGVPPGFGKELFESDLDRIMEHIKAAMEMVPVLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 RQERDGLLFGPYESQEKMKVQDSWVTNGVPPGFGKELFESDLDRIMEHIKAAMEMVPVLK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE6 KADIINVVNGPITYSPDILPMVGPHQGVRNYWVAIGFGYGIIHAGGVGKYLSDWILHGEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 KADIINVVNGPITYSPDILPMVGPHQGVRNYWVAIGFGYGIIHAGGVGKYLSDWILHGEP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE6 PFDLIELDPNRYGKWTTTQYTEAKARESYGFNNIVGYPKEERFAGRPTQRVSGLYQRLES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 PFDLIELDPNRYGKWTTTQYTEAKARESYGFNNIVGYPKEERFAGRPTQRVSGLYQRLES
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE6 KCSMGFHAGWEQPHWFYKPGQDTQYRPSFRRTNWFEPVGSEYKQVMQRVAVTDLSPFGKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 KCSMGFHAGWEQPHWFYKPGQDTQYRPSFRRTNWFEPVGSEYKQVMQRVAVTDLSPFGKF
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE6 NIKGQDSIRLLDHLFANVIPKVGFTNISHMLTPKGRVYAELTVSHQSPGEFLLITGSGSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 NIKGQDSIRLLDHLFANVIPKVGFTNISHMLTPKGRVYAELTVSHQSPGEFLLITGSGSE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE6 LHDLRWIEEEAVKGGYDVEIKNITDELGVLGVAGPQARKVLQKLTSEDLSDDVFKFLQTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 LHDLRWIEEEAVKGGYDVEIKNITDELGVLGVAGPQARKVLQKLTSEDLSDDVFKFLQTK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE6 SLKVSNIPVTAIRISYTGELGWELYHRREDSVALYDAIMNAGQEEGIDNFGTYAMNALRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 SLKVSNIPVTAIRISYTGELGWELYHRREDSVALYDAIMNAGQEEGIDNFGTYAMNALRL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE6 EKAFRAWGLEMNCDTNPLEAGLEYFVKLNKPADFIGKQALKQIKAKGLKRRLVCLTLATD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 EKAFRAWGLEMNCDTNPLEAGLEYFVKLNKPADFIGKQALKQIKAKGLKRRLVCLTLATD
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE6 DVDPEGNESIWYNGKVVGNTTSGSYSYSIQKSLAFAYVPVQLSEVGQQVEVELLGKNYPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 DVDPEGNESIWYNGKVVGNTTSGSYSYSIQKSLAFAYVPVQLSEVGQQVEVELLGKNYPA
              790       800       810       820       830       840

              850       860      
pF1KE6 VIIQEPLVLTEPTRNRLQKKGGKDKT
       ::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 VIIQEPLVLTEPTRNRLQKKGGKDKT
              850       860      

>>CCDS45520.1 PDPR gene_id:55066|Hs108|chr16              (879 aa)
 initn: 998 init1: 424 opt: 1289  Z-score: 1499.6  bits: 288.6 E(32554): 3.3e-77
Smith-Waterman score: 1289; 32.2% identity (63.1% similar) in 800 aa overlap (49-828:42-827)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KE6 LQGSPGRPRSVCGREGEEKPPLSAETQWKDRAETVIIGGGCVGVSLAYHLAKAGMKDVVL
                                     .:..:: ::: .:.:.::::.: : ::.::
CCDS45 RQRASPGWQNWSSARNSTSAAEARSMALPTQAQVVICGGGITGTSVAYHLSKMGWKDIVL
              20        30        40        50        60        70 

       80        90        100       110       120       130       
pF1KE6 LEKSELTAGSTWHAAG-LTTYFHPGINLKKIHYDSIKLYEKLEEETGQVVGFHQPGSIRL
       ::...:.::::   :: :.:  :  :. :   : : ::: .::.:::  .:. . ::: :
CCDS45 LEQGRLAAGSTRFCAGILSTARHLTIEQKMADY-SNKLYYQLEQETGIQTGYTRTGSIFL
              80        90       100        110       120       130

       140       150       160       170       180       190       
pF1KE6 ATTPVRVDEFKYQMTRTGWHATEQYLIEPEKIQEMFPLLNMNKVLAGLYNPGDGHIDPYS
       : :  :.  .:   .  .  .  . .: :.:. :.  :::.. ...... : :. ..  .
CCDS45 AQTQDRLISLKRINAGLNVIGIPSEIISPKKVAELHHLLNVHDLVGAMHVPEDAVVSSAD
              140       150       160       170       180       190

       200       210       220       230       240       250       
pF1KE6 LTMALAAGARKCGALLKYPAPVTSLKARSDGTWDVETPQGSMRANRIVNAAGFWAREVGK
       ...:::..: . :. .   . :  . ...  .  ::: .:... . .:: :: :: :.: 
CCDS45 VALALASAASQNGVQIYDRTSVLHVMVKKGQVTGVETDKGQIECQYFVNCAGQWAYELG-
              200       210       220       230       240          

       260           270       280       290       300       310   
pF1KE6 MIGLEHPL-IPV---QHQYVVTSTISEVKALKRELPVLRDLEGSYYLRQERDGLLFGPYE
        .. :.:. ::.   .: :..:  .     :.   :.. : .:  :.:. . :.: : .:
CCDS45 -LSNEEPVSIPLHACEHFYLLTRPLET--PLQSSTPTIVDADGRIYIRNWQGGILSGGFE
      250       260       270         280       290       300      

           320       330       340       350       360       370   
pF1KE6 SQEKMKVQDSWVTNGVPPGFGKELFESDLDRIMEHIKAAMEMVPVLKKADIINVVNGPIT
       .. :        :.:      ..: : : :..   ... .. .: :.  .:...:: : :
CCDS45 KNPK-----PIFTEGKNQLEIQNLQE-DWDHFEPLLSSLLRRMPELETLEIMKLVNCPET
        310            320        330       340       350       360

           380       390        400       410       420       430  
pF1KE6 YSPDILPMVGPHQGVRNYWVAIGFGY-GIIHAGGVGKYLSDWILHGEPPFDLIELDPNRY
       ..::.  ..:   .:..:.:  :..  :.  .::.::::..:..:: :  .. ::: .:.
CCDS45 FTPDMRCIMGESPAVQGYFVLAGMNSAGLSFGGGAGKYLAEWMVHGYPSENVWELDLKRF
              370       380       390       400       410       420

             440       450       460       470       480           
pF1KE6 GKWTTTQ-YTEAKARESYGFNNIVGYPKEERFAGRPTQRVSGLYQRLESKCS--MGFHAG
       :   ... . . .. : . .   .  :. .  .::   :.: ::.::... .  :  : :
CCDS45 GALQSSRTFLRHRVMEVMPLMYDLKVPRWDFQTGRQL-RTSPLYDRLDAQGARWMEKH-G
              430       440       450        460       470         

     490       500          510       520       530       540      
pF1KE6 WEQPHWFYKPGQDT---QYRPSFRRTNWFEPVGSEYKQVMQRVAVTDLSPFGKFNIK--G
       .:.:..:  : .:    .   .: . .::. : :: :   . : : :.: : ::.:   :
CCDS45 FERPKYFVPPDKDLLALEQSKTFYKPDWFDIVESEVKCCKEAVCVIDMSSFTKFEITSTG
      480       490       500       510       520       530        

          550       560        570       580       590       600   
pF1KE6 QDSIRLLDHLFANVIP-KVGFTNISHMLTPKGRVYAELTVSHQSPGEFLLITGSGSELHD
       ......:..::.: .   ::    . ::.  :    . .... .   :..:. . ...: 
CCDS45 DQALEVLQYLFSNDLDVPVGHIVHTGMLNEGGGYENDCSIARLNKRSFFMISPTDQQVHC
      540       550       560       570       580       590        

           610       620       630       640       650       660   
pF1KE6 LRWIEEEAVKGGYDVEIKNITDELGVLGVAGPQARKVLQKLTSEDLSDDVFKFLQTKSLK
         :....  : . .. ....: .  .:.. ::.:  ::..:.   .. : :  :  : ..
CCDS45 WAWLKKHMPKDS-NLLLEDVTWKYTALNLIGPRAVDVLSELSYAPMTPDHFPSLFCKEMS
      600       610        620       630       640       650       

            670       680       690       700       710       720  
pF1KE6 VSNIP-VTAIRISYTGELGWELYHRREDSVALYDAIMNAGQEEGIDNFGTYAMNALRLEK
       :.    . .. ...::: :. ::   : .. .:. .:..::. :: : : ::. .::.::
CCDS45 VGYANGIRVMSMTHTGEPGFMLYIPIEYALHVYNEVMSVGQKYGIRNAGYYALRSLRIEK
       660       670       680       690       700       710       

            730       740       750       760       770       780  
pF1KE6 AFRAWGLEMNCDTNPLEAGLEYFVKLNKPADFIGKQALKQIKAKGLKRRLVCLTLATDDV
        :  :: ..:  :.::: : :  :::.:  ::::..:: : : .:. .::. . :   : 
CCDS45 FFAFWGQDINNLTTPLECGRESRVKLEKGMDFIGRDALLQQKQNGVYKRLTMFILDDHDS
       720       730       740       750       760       770       

                790       800       810       820       830        
pF1KE6 D----PEGNESIWYNGKVVGNTTSGSYSYSIQKSLAFAYVPVQLSEVGQQVEVELLGKNY
       :    :  .: :. ::. ::.:::..::::... . ...:     ..:..          
CCDS45 DLDLWPWWGEPIYRNGQYVGKTTSSAYSYSLERHVCLGFVHNFSEDTGEEQVVTADFINR
       780       790       800       810       820       830       

      840       850       860                    
pF1KE6 PAVIIQEPLVLTEPTRNRLQKKGGKDKT              
                                                 
CCDS45 GEYEIDIAGYRFQAKAKLYPVASLFTQKRRKDDMELSDLHGK
       840       850       860       870         

>>CCDS82007.1 PDPR gene_id:55066|Hs108|chr16              (779 aa)
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              90       100       110       120       130       140 
pF1KE6 SELTAGSTWHAAGLTTYFHPGINLKKIHYDSIKLYEKLEEETGQVVGFHQPGSIRLATTP
                                     : ::: .::.:::  .:. . ::: :: : 
CCDS82                           MADYSNKLYYQLEQETGIQTGYTRTGSIFLAQTQ
                                         10        20        30    

             150       160       170       180       190       200 
pF1KE6 VRVDEFKYQMTRTGWHATEQYLIEPEKIQEMFPLLNMNKVLAGLYNPGDGHIDPYSLTMA
        :.  .:   .  .  .  . .: :.:. :.  :::.. ...... : :. ..  ....:
CCDS82 DRLISLKRINAGLNVIGIPSEIISPKKVAELHHLLNVHDLVGAMHVPEDAVVSSADVALA
           40        50        60        70        80        90    

             210       220       230       240       250       260 
pF1KE6 LAAGARKCGALLKYPAPVTSLKARSDGTWDVETPQGSMRANRIVNAAGFWAREVGKMIGL
       ::..: . :. .   . :  . ...  .  ::: .:... . .:: :: :: :.:  .. 
CCDS82 LASAASQNGVQIYDRTSVLHVMVKKGQVTGVETDKGQIECQYFVNCAGQWAYELG--LSN
          100       110       120       130       140         150  

                 270       280       290       300       310       
pF1KE6 EHPL-IPV---QHQYVVTSTISEVKALKRELPVLRDLEGSYYLRQERDGLLFGPYESQEK
       :.:. ::.   .: :..:  .     :.   :.. : .:  :.:. . :.: : .:.. :
CCDS82 EEPVSIPLHACEHFYLLTRPLE--TPLQSSTPTIVDADGRIYIRNWQGGILSGGFEKNPK
            160       170         180       190       200       210

       320       330       340       350       360       370       
pF1KE6 MKVQDSWVTNGVPPGFGKELFESDLDRIMEHIKAAMEMVPVLKKADIINVVNGPITYSPD
               :.:      ..: : : :..   ... .. .: :.  .:...:: : :..::
CCDS82 -----PIFTEGKNQLEIQNLQE-DWDHFEPLLSSLLRRMPELETLEIMKLVNCPETFTPD
                   220        230       240       250       260    

       380       390        400       410       420       430      
pF1KE6 ILPMVGPHQGVRNYWVAIGFGY-GIIHAGGVGKYLSDWILHGEPPFDLIELDPNRYGKWT
       .  ..:   .:..:.:  :..  :.  .::.::::..:..:: :  .. ::: .:.:   
CCDS82 MRCIMGESPAVQGYFVLAGMNSAGLSFGGGAGKYLAEWMVHGYPSENVWELDLKRFGALQ
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         440       450       460       470       480         490   
pF1KE6 TTQ-YTEAKARESYGFNNIVGYPKEERFAGRPTQRVSGLYQRLESKCS--MGFHAGWEQP
       ... . . .. : . .   .  :. .  .::   :.: ::.::... .  :  : :.:.:
CCDS82 SSRTFLRHRVMEVMPLMYDLKVPRWDFQTGRQL-RTSPLYDRLDAQGARWMEKH-GFERP
          330       340       350        360       370        380  

           500          510       520       530       540          
pF1KE6 HWFYKPGQDT---QYRPSFRRTNWFEPVGSEYKQVMQRVAVTDLSPFGKFNIK--GQDSI
       ..:  : .:    .   .: . .::. : :: :   . : : :.: : ::.:   :....
CCDS82 KYFVPPDKDLLALEQSKTFYKPDWFDIVESEVKCCKEAVCVIDMSSFTKFEITSTGDQAL
            390       400       410       420       430       440  

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pF1KE6 RLLDHLFANV--IPKVGFTNISHMLTPKGRVYAELTVSHQSPGEFLLITGSGSELHDLRW
       ..:..::.:   .: ::    . ::.  :    . .... .   :..:. . ...:   :
CCDS82 EVLQYLFSNDLDVP-VGHIVHTGMLNEGGGYENDCSIARLNKRSFFMISPTDQQVHCWAW
            450        460       470       480       490       500 

        610       620       630       640       650       660      
pF1KE6 IEEEAVKGGYDVEIKNITDELGVLGVAGPQARKVLQKLTSEDLSDDVFKFLQTKSLKVSN
       ....  : . .. ....: .  .:.. ::.:  ::..:.   .. : :  :  : ..:. 
CCDS82 LKKHMPKDS-NLLLEDVTWKYTALNLIGPRAVDVLSELSYAPMTPDHFPSLFCKEMSVGY
             510        520       530       540       550       560

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pF1KE6 IP-VTAIRISYTGELGWELYHRREDSVALYDAIMNAGQEEGIDNFGTYAMNALRLEKAFR
          . .. ...::: :. ::   : .. .:. .:..::. :: : : ::. .::.:: : 
CCDS82 ANGIRVMSMTHTGEPGFMLYIPIEYALHVYNEVMSVGQKYGIRNAGYYALRSLRIEKFFA
              570       580       590       600       610       620

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pF1KE6 AWGLEMNCDTNPLEAGLEYFVKLNKPADFIGKQALKQIKAKGLKRRLVCLTLATDDVD--
        :: ..:  :.::: : :  :::.:  ::::..:: : : .:. .::. . :   : :  
CCDS82 FWGQDINNLTTPLECGRESRVKLEKGMDFIGRDALLQQKQNGVYKRLTMFILDDHDSDLD
              630       640       650       660       670       680

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pF1KE6 --PEGNESIWYNGKVVGNTTSGSYSYSIQKSLAFAYVPVQLSEVGQQVEVELLGKNYPAV
         :  .: :. ::. ::.:::..::::... . ...:     ..:..             
CCDS82 LWPWWGEPIYRNGQYVGKTTSSAYSYSLERHVCLGFVHNFSEDTGEEQVVTADFINRGEY
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             850       860                    
pF1KE6 IIQEPLVLTEPTRNRLQKKGGKDKT              
                                              
CCDS82 EIDIAGYRFQAKAKLYPVASLFTQKRRKDDMELSDLHGK
              750       760       770         

>>CCDS6978.1 SARDH gene_id:1757|Hs108|chr9                (918 aa)
 initn: 1465 init1: 448 opt: 572  Z-score: 662.1  bits: 133.7 E(32554): 1.5e-30
Smith-Waterman score: 1514; 33.1% identity (61.9% similar) in 902 aa overlap (15-858:38-915)

                               10        20          30        40  
pF1KE6                 MLRPGAQLLRGLLLRSCPLQGS--PGRPRSVCGREGEEKPPLSA
                                     .: : : .   :.  :: . .:  .:  :.
CCDS69 LRVAAAHPRQSPTRGMGPCNLSSAAGPTAEKSVPYQRTLKEGQGTSVVA-QGPSRPLPST
        10        20        30        40        50         60      

             50        60        70        80        90       100  
pF1KE6 ETQWKDRAETVIIGGGCVGVSLAYHLAKAGMKDVVLLEKSELTAGSTWHAAGLTTYFHPG
              :..:.:::: .: .  ::::: ::. .::::. .::.:.:::.:::   ..:.
CCDS69 -------ANVVVIGGGSLGCQTLYHLAKLGMSGAVLLERERLTSGTTWHTAGLLWQLRPS
                70        80        90       100       110         

             110       120       130       140       150       160 
pF1KE6 -INLKKIHYDSIKLYEKLEEETGQVVGFHQPGSIRLATTPVRVDEFKYQMTRTGWHATEQ
        .... . .    . ..::::::  .:. : :.. .:..  :.::.:  :.    ...:.
CCDS69 DVEVELLAHTRRVVSRELEEETGLHTGWIQNGGLFIASNRQRLDEYKRLMSLGKAYGVES
     120       130       140       150       160       170         

             170       180       190       200       210       220 
pF1KE6 YLIEPEKIQEMFPLLNMNKVLAGLYNPGDGHIDPYSLTMALAAGARKCGALLKYPAPVTS
       ... : . . ..::.:.. . . :: : :: .:: .   .:: .:   :: .    :::.
CCDS69 HVLSPAETKTLYPLMNVDDLYGTLYVPHDGTMDPAGTCTTLARAASARGAQVIENCPVTG
     180       190       200       210       220       230         

                  230       240       250       260       270      
pF1KE6 LKARSDG-----TWDVETPQGSMRANRIVNAAGFWAREVGKMIGLEHPLIPVQHQYVVTS
       ... .:      .  ::: .::...  .:: :: ::  ::.: :.. ::. ..: :::: 
CCDS69 IRVWTDDFGVRRVAGVETQHGSIQTPCVVNCAGVWASAVGRMAGVKVPLVAMHHAYVVTE
     240       250       260       270       280       290         

        280       290       300       310       320       330      
pF1KE6 TISEVKALKRELPVLRDLEGSYYLRQERDGLLFGPYESQEKMKVQDSWVTNGVPPGFGKE
        :  ..    ..: .:: ..: ::: . :.:  : ::..  .     :   .   .::  
CCDS69 RIEGIQ----NMPNVRDHDASVYLRLQGDALSVGGYEANPIF-----WEEVSDKFAFG--
     300           310       320       330            340          

        340       350       360       370       380       390      
pF1KE6 LFESDLDRIMEHIKAAMEMVPVLKKADIINVVNGPITYSPDILPMVGPHQGVRNYWVAIG
       ::. : . . .::..:.. ::::.:. : ..: :: ...::  :..:    .:..... :
CCDS69 LFDLDWEVFTQHIEGAINRVPVLEKTGIKSTVCGPESFTPDHKPLMGEAPELRGFFLGCG
      350       360       370       380       390       400        

         400       410       420       430         440       450   
pF1KE6 FGY-GIIHAGGVGKYLSDWILHGEPPFDLIELDPNRYGKWTTTQ--YTEAKARESYGFNN
       :.  :.. .:: :. :. ::.::.:  :.   :  :. .  : .  . . ...:::. : 
CCDS69 FNSAGMMLGGGCGQELAHWIIHGRPEKDMHGYDIRRFHHSLTDHPRWIRERSHESYAKNY
      410       420       430       440       450       460        

           460       470       480        490       500            
pF1KE6 IVGYPKEERFAGRPTQRVSGLYQRLESK-CSMGFHAGWEQPHWFYKPG------------
        : .:..: .:::  .: . :...: .. : .  . :::.: ::.  :            
CCDS69 SVVFPHDEPLAGRNMRR-DPLHEELLGQGCVFQERHGWERPGWFHPRGPAPVLEYDYYGA
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pF1KE6 ------QDTQYRPSF--RRTNWFEPVGSEYKQ--VMQR--VAVTDLSPFGKFNIKGQDSI
             .:  ::  .  . :  : :  .  :.  .  :  .:: :.: :::: . : :. 
CCDS69 YGSRAHEDYAYRRLLADEYTFAFPPHHDTIKKECLACRGAAAVFDMSYFGKFYLVGLDAR
       530       540       550       560       570       580       

      550        560       570       580                   590     
pF1KE6 RLLDHLF-ANVIPKVGFTNISHMLTPKGRVYAELTVS-----HQ-SP------GE-FLLI
       .  : :: :.:    : :  . ::. .: . ..::::     :: ::      :. . : 
CCDS69 KAADWLFSADVSRPPGSTVYTCMLNHRGGTESDLTVSRLAPSHQASPLAPAFEGDGYYLA
       590       600       610       620       630       640       

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pF1KE6 TGSGSELHDLRWIEEEAVKGGYDVEIKNITDELGVLGVAGPQARKVLQKLTSEDLSDDVF
        :..   :.   :         . .. . ...::.... :: .: .::.. . :::...:
CCDS69 MGGAVAQHNWSHITTVLQDQKSQCQLIDSSEDLGMISIQGPASRAILQEVLDADLSNEAF
       650       660       670       680       690       700       

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pF1KE6 KFLQTKSLKVSNIPVTAIRISYTGELGWELYHRREDSVALYDAIMNAGQEEGIDNFGTYA
        :   : :....  : :.:.:..:::::::.  . . : .: :.: :: ..:. : :  :
CCDS69 PFSTHKLLRAAGHLVRAMRLSFVGELGWELHIPKASCVPVYRAVMAAGAKHGLINAGYRA
       710       720       730       740       750       760       

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pF1KE6 MNALRLEKAFRAWGLEMNCDTNPLEAGLEYFVKLNKPADFIGKQALKQIKAKGLKRRLVC
       ...: .::..: :  ..  : .:::::: .  ::..:. :.:..::.: .: ::.:::::
CCDS69 IDSLSIEKGYRHWHADLRPDDSPLEAGLAFTCKLKSPVPFLGREALEQQRAAGLRRRLVC
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          780       790       800       810             820        
pF1KE6 LTLATDDVDPEGNESIWYNGKVVGNTTSGSYSYSIQKSLAFAYV------PVQLSEVGQ-
       .:.  : :   : :.:: ::.:::..  ......:.:..:..:.      ::.:. : . 
CCDS69 FTME-DKVPMFGLEAIWRNGQVVGHVRRADFGFAIDKTIAYGYIHDPSGGPVSLDFVKSG
       830        840       850       860       870       880      

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pF1KE6 QVEVELLGKNYPAVI-IQEPLVLTEPTRNRLQKKGGKDKT
       .  .: .: .: :   .. :.   .:. .:..        
CCDS69 DYALERMGVTYGAQAHLKSPF---DPNNKRVKGIY     
        890       900          910             

>>CCDS2797.1 AMT gene_id:275|Hs108|chr3                   (403 aa)
 initn: 175 init1: 104 opt: 340  Z-score: 396.5  bits: 83.4 E(32554): 9.2e-16
Smith-Waterman score: 343; 26.6% identity (55.4% similar) in 395 aa overlap (470-850:34-397)

     440       450       460       470        480       490        
pF1KE6 YTEAKARESYGFNNIVGYPKEERFAGRPTQRVSGLYQ-RLESKCSMGFHAGWEQPHWFYK
                                     : . ::. .:    .:   :::  :     
CCDS27 AVSVVARLGFRLQAFPPALCRPLSCAQEVLRRTPLYDFHLAHGGKMVAFAGWSLP-----
            10        20        30        40        50             

      500       510       520       530       540       550        
pF1KE6 PGQDTQYRPSFRRTNWFEPVGSEYKQVMQRVAVTDLSPFGKFNIKGQDSIRLLDHL----
           .::: :   ..          .. :. .. :.: . . .: :.: ..:.. :    
CCDS27 ----VQYRDSHTDSHL---------HTRQHCSLFDVSHMLQTKILGSDRVKLMESLVVGD
           60        70                 80        90       100     

          560       570       580       590       600          610 
pF1KE6 FANVIPKVGFTNISHMLTPKGRVYAELTVSHQSPGEFLLITGSGSELHDLRWIEE---EA
       .:.. :. :  ..: . .  : .  .: :.. : :.. .....:   .::  ...   : 
CCDS27 IAELRPNQG--TLSLFTNEAGGILDDLIVTNTSEGHLYVVSNAGCWEKDLALMQDKVREL
         110         120       130       140       150       160   

             620       630       640       650       660       670 
pF1KE6 VKGGYDVEIKNITDELGVLGVAGPQARKVLQKLTSEDLSDDVFKFLQTKSLKVSNIPVTA
        . : :: .. . . :  :.. :: : .:::  ...::    . :. .  ..: ..    
CCDS27 QNQGRDVGLEVLDNAL--LALQGPTAAQVLQAGVADDLRK--LPFMTSAVMEVFGVSGCR
           170         180       190       200         210         

              680       690       700       710       720       730
pF1KE6 I-RISYTGELGWELYHRREDSVALYDAIMNAGQEEGIDNFGTYAMNALRLEKAFRAWGLE
       . : .:::: : :.      .: :  ::..  .   .   :  : ..:::: ..  .: .
CCDS27 VTRCGYTGEDGVEISVPVAGAVHLATAILKNPE---VKLAGLAARDSLRLEAGLCLYGND
     220       230       240       250          260       270      

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pF1KE6 MNCDTNPLEAGLEYFVKLNKPA--DFIGKQAL-KQIKAKGLKRR--LVCLTLATDDVDPE
       ..  :.:.:..: . .   . :  :: : ...  :.:..  .::  :.:        .: 
CCDS27 IDEHTTPVEGSLSWTLGKRRRAAMDFPGAKVIVPQLKGRVQRRRVGLMCEGAPMRAHSPI
        280       290       300       310       320       330      

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pF1KE6 GNESIWYNGKVVGNTTSGSYSYSIQKSLAFAYVPVQLSEVGQQVEVELLGKNYPAVIIQE
        :    ..:  .:..:::  : :..:..:..::: . :. : .. ::.  :.  ::. . 
CCDS27 LN----MEGTKIGTVTSGCPSPSLKKNVAMGYVPCEYSRPGTMLLVEVRRKQQMAVVSKM
            340       350       360       370       380       390  

         850       860      
pF1KE6 PLVLTEPTRNRLQKKGGKDKT
       :.: :                
CCDS27 PFVPTNYYTLK          
            400             

>>CCDS54583.1 AMT gene_id:275|Hs108|chr3                  (347 aa)
 initn: 173 init1: 104 opt: 326  Z-score: 381.1  bits: 80.3 E(32554): 6.6e-15
Smith-Waterman score: 326; 27.6% identity (58.1% similar) in 322 aa overlap (542-850:33-341)

             520       530       540       550           560       
pF1KE6 TNWFEPVGSEYKQVMQRVAVTDLSPFGKFNIKGQDSIRLLDHL----FANVIPKVGFTNI
                                     : :.: ..:.. :    .:.. :. :  ..
CCDS54 RAVSVVARLGFRLQAFPPALCRPLSCAQTKILGSDRVKLMESLVVGDIAELRPNQG--TL
             10        20        30        40        50          60

       570       580       590       600          610       620    
pF1KE6 SHMLTPKGRVYAELTVSHQSPGEFLLITGSGSELHDLRWIEE---EAVKGGYDVEIKNIT
       : . .  : .  .: :.. : :.. .....:   .::  ...   :  . : :: .. . 
CCDS54 SLFTNEAGGILDDLIVTNTSEGHLYVVSNAGCWEKDLALMQDKVRELQNQGRDVGLEVLD
               70        80        90       100       110       120

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pF1KE6 DELGVLGVAGPQARKVLQKLTSEDLSDDVFKFLQTKSLKVSNIPVTAI-RISYTGELGWE
       . :  :.. :: : .:::  ...::    . :. .  ..: ..    . : .:::: : :
CCDS54 NAL--LALQGPTAAQVLQAGVADDLRK--LPFMTSAVMEVFGVSGCRVTRCGYTGEDGVE
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pF1KE6 LYHRREDSVALYDAIMNAGQEEGIDNFGTYAMNALRLEKAFRAWGLEMNCDTNPLEAGLE
       .      .: :  ::..  .   .   :  : ..:::: ..  .: ...  :.:.:..: 
CCDS54 ISVPVAGAVHLATAILKNPE---VKLAGLAARDSLRLEAGLCLYGNDIDEHTTPVEGSLS
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pF1KE6 YFVKLNKPA--DFIGKQAL-KQIKAKGLKRR--LVCLTLATDDVDPEGNESIWYNGKVVG
       . .   . :  :: : ...  :.:..  .::  :.:        .:  :    ..:  .:
CCDS54 WTLGKRRRAAMDFPGAKVIVPQLKGRVQRRRVGLMCEGAPMRAHSPILN----MEGTKIG
           240       250       260       270       280             

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pF1KE6 NTTSGSYSYSIQKSLAFAYVPVQLSEVGQQVEVELLGKNYPAVIIQEPLVLTEPTRNRLQ
       ..:::  : :..:..:..::: . :. : .. ::.  :.  ::. . :.: :        
CCDS54 TVTSGCPSPSLKKNVAMGYVPCEYSRPGTMLLVEVRRKQQMAVVSKMPFVPTNYYTLK  
     290       300       310       320       330       340         

      860      
pF1KE6 KKGGKDKT

>>CCDS54585.1 AMT gene_id:275|Hs108|chr3                  (386 aa)
 initn: 171 init1: 100 opt: 320  Z-score: 373.4  bits: 79.0 E(32554): 1.8e-14
Smith-Waterman score: 323; 26.5% identity (55.3% similar) in 378 aa overlap (470-833:34-380)

     440       450       460       470        480       490        
pF1KE6 YTEAKARESYGFNNIVGYPKEERFAGRPTQRVSGLYQ-RLESKCSMGFHAGWEQPHWFYK
                                     : . ::. .:    .:   :::  :     
CCDS54 AVSVVARLGFRLQAFPPALCRPLSCAQEVLRRTPLYDFHLAHGGKMVAFAGWSLP-----
            10        20        30        40        50             

      500       510       520       530       540       550        
pF1KE6 PGQDTQYRPSFRRTNWFEPVGSEYKQVMQRVAVTDLSPFGKFNIKGQDSIRLLDHL----
           .::: :   ..          .. :. .. :.: . . .: :.: ..:.. :    
CCDS54 ----VQYRDSHTDSHL---------HTRQHCSLFDVSHMLQTKILGSDRVKLMESLVVGD
           60        70                 80        90       100     

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pF1KE6 FANVIPKVGFTNISHMLTPKGRVYAELTVSHQSPGEFLLITGSGSELHDLRWIEE---EA
       .:.. :. :  ..: . .  : .  .: :.. : :.. .....:   .::  ...   : 
CCDS54 IAELRPNQG--TLSLFTNEAGGILDDLIVTNTSEGHLYVVSNAGCWEKDLALMQDKVREL
         110         120       130       140       150       160   

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pF1KE6 VKGGYDVEIKNITDELGVLGVAGPQARKVLQKLTSEDLSDDVFKFLQTKSLKVSNIPVTA
        . : :: .. . . :  :.. :: : .:::  ...::    . :. .  ..: ..    
CCDS54 QNQGRDVGLEVLDNAL--LALQGPTAAQVLQAGVADDLRK--LPFMTSAVMEVFGVSGCR
           170         180       190       200         210         

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pF1KE6 I-RISYTGELGWELYHRREDSVALYDAIMNAGQEEGIDNFGTYAMNALRLEKAFRAWGLE
       . : .:::: : :.      .: :  ::..  .   .   :  : ..:::: ..  .: .
CCDS54 VTRCGYTGEDGVEISVPVAGAVHLATAILKNPE---VKLAGLAARDSLRLEAGLCLYGND
     220       230       240       250          260       270      

              740       750         760        770         780     
pF1KE6 MNCDTNPLEAGLEYFVKLNKPA--DFIGKQAL-KQIKAKGLKRR--LVCLTLATDDVDPE
       ..  :.:.:..: . .   . :  :: : ...  :.:..  .::  :.:        .: 
CCDS54 IDEHTTPVEGSLSWTLGKRRRAAMDFPGAKVIVPQLKGRVQRRRVGLMCEGAPMRAHSPI
        280       290       300       310       320       330      

         790       800       810       820       830       840     
pF1KE6 GNESIWYNGKVVGNTTSGSYSYSIQKSLAFAYVPVQLSEVGQQVEVELLGKNYPAVIIQE
        :    ..:  .:..:::  : :..:..:..::: . :. : .. :::            
CCDS54 LN----MEGTKIGTVTSGCPSPSLKKNVAMGYVPCEYSRPGTMLLVELPSGPCF      
            340       350       360       370       380            

         850       860      
pF1KE6 PLVLTEPTRNRLQKKGGKDKT

>>CCDS54584.1 AMT gene_id:275|Hs108|chr3                  (359 aa)
 initn: 175 init1: 104 opt: 273  Z-score: 319.0  bits: 68.9 E(32554): 1.9e-11
Smith-Waterman score: 279; 28.7% identity (56.3% similar) in 293 aa overlap (566-850:80-353)

         540       550       560       570         580       590   
pF1KE6 PFGKFNIKGQDSIRLLDHLFANVIPKVGFTNISHMLTPK--GRVYAELTVSHQSPGEFLL
                                     ..::::  :  :   ..:  :        :
CCDS54 VAFAGWSLPVQYRDSHTDSHLHTRQHCSLFDVSHMLQTKILGSDRVKLMES--------L
      50        60        70        80        90       100         

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pF1KE6 ITGSGSELHDLRWIEEEAVKGGYDVEIKNITDELGVLGVAGPQARKVLQKLTSEDLSDDV
       ..:. .::.  .   .:  . : :: .. . . :  :.. :: : .:::  ...::    
CCDS54 VVGDIAELRPNQDKVRELQNQGRDVGLEVLDNAL--LALQGPTAAQVLQAGVADDLRK--
             110       120       130         140       150         

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pF1KE6 FKFLQTKSLKVSNIPVTAI-RISYTGELGWELYHRREDSVALYDAIMNAGQEEGIDNFGT
       . :. .  ..: ..    . : .:::: : :.      .: :  ::..  .   .   : 
CCDS54 LPFMTSAVMEVFGVSGCRVTRCGYTGEDGVEISVPVAGAVHLATAILKNPE---VKLAGL
       160       170       180       190       200          210    

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pF1KE6 YAMNALRLEKAFRAWGLEMNCDTNPLEAGLEYFVKLNKPA--DFIGKQAL-KQIKAKGLK
        : ..:::: ..  .: ...  :.:.:..: . .   . :  :: : ...  :.:..  .
CCDS54 AARDSLRLEAGLCLYGNDIDEHTTPVEGSLSWTLGKRRRAAMDFPGAKVIVPQLKGRVQR
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pF1KE6 RR--LVCLTLATDDVDPEGNESIWYNGKVVGNTTSGSYSYSIQKSLAFAYVPVQLSEVGQ
       ::  :.:        .:  :    ..:  .:..:::  : :..:..:..::: . :. : 
CCDS54 RRVGLMCEGAPMRAHSPILN----MEGTKIGTVTSGCPSPSLKKNVAMGYVPCEYSRPGT
          280       290           300       310       320       330

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pF1KE6 QVEVELLGKNYPAVIIQEPLVLTEPTRNRLQKKGGKDKT
       .. ::.  :.  ::. . :.: :                
CCDS54 MLLVEVRRKQQMAVVSKMPFVPTNYYTLK          
              340       350                   




866 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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