Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5811
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5811, 890 aa
1>>>pF1KE5811 890 - 890 aa - 890 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.0448+/-0.00113; mu= -7.6086+/- 0.069
mean_var=401.8836+/-82.111, 0's: 0 Z-trim(114.3): 37 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.063977
statistics sampled from 14839 (14871) to 14839 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.743), E-opt: 0.2 (0.457), width: 16
Scan time: 4.940
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3952.1 HCN1 gene_id:348980|Hs108|chr5 ( 890) 5969 565.6 1.4e-160
CCDS12035.1 HCN2 gene_id:610|Hs108|chr19 ( 889) 3344 323.4 1.2e-87
CCDS10248.1 HCN4 gene_id:10021|Hs108|chr15 (1203) 3342 323.3 1.7e-87
CCDS1108.1 HCN3 gene_id:57657|Hs108|chr1 ( 774) 2947 286.7 1.1e-76
CCDS11638.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs108|chr17 ( 994) 647 74.5 1.1e-12
CCDS62290.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs108|chr17 ( 958) 635 73.3 2.3e-12
CCDS31015.1 KCNH1 gene_id:3756|Hs108|chr1 ( 962) 612 71.2 1e-11
CCDS9756.1 KCNH5 gene_id:27133|Hs108|chr14 ( 988) 612 71.2 1e-11
CCDS2219.1 KCNH7 gene_id:90134|Hs108|chr2 (1196) 587 69.0 5.9e-11
CCDS42719.1 CNGA3 gene_id:1261|Hs108|chr2 ( 676) 576 67.8 7.7e-11
CCDS2034.1 CNGA3 gene_id:1261|Hs108|chr2 ( 694) 576 67.8 7.9e-11
>>CCDS3952.1 HCN1 gene_id:348980|Hs108|chr5 (890 aa)
initn: 5969 init1: 5969 opt: 5969 Z-score: 2996.6 bits: 565.6 E(32554): 1.4e-160
Smith-Waterman score: 5969; 100.0% identity (100.0% similar) in 890 aa overlap (1-890:1-890)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEGGGKPNSSSNSRDDGNSVFPAKASATGAGPAAAEKRLGTPPGGGGAGAKEHGNSVCFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 MEGGGKPNSSSNSRDDGNSVFPAKASATGAGPAAAEKRLGTPPGGGGAGAKEHGNSVCFK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VDGGGGGGGGGGGGEEPAGGFEDAEGPRRQYGFMQRQFTSMLQPGVNKFSLRMFGSQKAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 VDGGGGGGGGGGGGEEPAGGFEDAEGPRRQYGFMQRQFTSMLQPGVNKFSLRMFGSQKAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 EKEQERVKTAGFWIIHPYSDFRFYWDLIMLIMMVGNLVIIPVGITFFTEQTTTPWIIFNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 EKEQERVKTAGFWIIHPYSDFRFYWDLIMLIMMVGNLVIIPVGITFFTEQTTTPWIIFNV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ASDTVFLLDLIMNFRTGTVNEDSSEIILDPKVIKMNYLKSWFVVDFISSIPVDYIFLIVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 ASDTVFLLDLIMNFRTGTVNEDSSEIILDPKVIKMNYLKSWFVVDFISSIPVDYIFLIVE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 KGMDSEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 KGMDSEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIFN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 LIGMMLLLCHWDGCLQFLVPLLQDFPPDCWVSLNEMVNDSWGKQYSYALFKAMSHMLCIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 LIGMMLLLCHWDGCLQFLVPLLQDFPPDCWVSLNEMVNDSWGKQYSYALFKAMSHMLCIG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 YGAQAPVSMSDLWITMLSMIVGATCYAMFVGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 YGAQAPVSMSDLWITMLSMIVGATCYAMFVGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 HKLPADMRQKIHDYYEHRYQGKIFDEENILNELNDPLREEIVNFNCRKLVATMPLFANAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 HKLPADMRQKIHDYYEHRYQGKIFDEENILNELNDPLREEIVNFNCRKLVATMPLFANAD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 PNFVTAMLSKLRFEVFQPGDYIIREGAVGKKMYFIQHGVAGVITKSSKEMKLTDGSYFGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 PNFVTAMLSKLRFEVFQPGDYIIREGAVGKKMYFIQHGVAGVITKSSKEMKLTDGSYFGE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 ICLLTKGRRTASVRADTYCRLYSLSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVAIDRLDRIGKKNSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 ICLLTKGRRTASVRADTYCRLYSLSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVAIDRLDRIGKKNSI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 LLQKFQKDLNTGVFNNQENEILKQIVKHDREMVQAIAPINYPQMTTLNSTSSTTTPTSRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 LLQKFQKDLNTGVFNNQENEILKQIVKHDREMVQAIAPINYPQMTTLNSTSSTTTPTSRM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 RTQSPPVYTATSLSHSNLHSPSPSTQTPQPSAILSPCSYTTAVCSPPVQSPLAARTFHYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 RTQSPPVYTATSLSHSNLHSPSPSTQTPQPSAILSPCSYTTAVCSPPVQSPLAARTFHYA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE5 SPTASQLSLMQQQPQQQVQQSQPPQTQPQQPSPQPQTPGSSTPKNEVHKSTQALHNTNLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 SPTASQLSLMQQQPQQQVQQSQPPQTQPQQPSPQPQTPGSSTPKNEVHKSTQALHNTNLT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE5 REVRPLSASQPSLPHEVSTLISRPHPTVGESLASIPQPVTAVPGTGLQAGGRSTVPQRVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 REVRPLSASQPSLPHEVSTLISRPHPTVGESLASIPQPVTAVPGTGLQAGGRSTVPQRVT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KE5 LFRQMSSGAIPPNRGVPPAPPPPAAALPRESSSVLNTDPDAEKPRFASNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 LFRQMSSGAIPPNRGVPPAPPPPAAALPRESSSVLNTDPDAEKPRFASNL
850 860 870 880 890
>>CCDS12035.1 HCN2 gene_id:610|Hs108|chr19 (889 aa)
initn: 3294 init1: 3208 opt: 3344 Z-score: 1687.2 bits: 323.4 E(32554): 1.2e-87
Smith-Waterman score: 3392; 65.4% identity (78.3% similar) in 835 aa overlap (2-823:68-859)
10 20
pF1KE5 MEGGGKPNSSSNSRDD--GNSVFPAKASATG
::: : . :::. : :. ::..
CCDS12 PPPPAPPPGPGPAPPQHPPRAEALPPEAADEGG--PRGRLRSRDSSCGRPGTPGAASTAK
40 50 60 70 80 90
30 40 50 60 70 80
pF1KE5 AGPAAAEKRLGTP---PGGGGAGAKEHGNSVCFKVDGGGGGGGGGGGGEEPAGGFE--DA
..: . : : : :.: . :. : .: :. :...: . : : : ::. : :
CCDS12 GSPNGECGR-GEPQCSPAGPEGPAR--GPKVSFSCRGAASGPAPGPGPAEEAGSEEAGPA
100 110 120 130 140 150
90 100 110 120 130 140
pF1KE5 EGPR-RQYGFMQRQFTSMLQPGVNKFSLRMFGSQKAVEKEQERVKTAGFWIIHPYSDFRF
:: : .:::::: ..::::::::::::::::::::.::::::.:: :::::::::::
CCDS12 GEPRGSQASFMQRQFGALLQPGVNKFSLRMFGSQKAVEREQERVKSAGAWIIHPYSDFRF
160 170 180 190 200 210
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 YWDLIMLIMMVGNLVIIPVGITFFTEQTTTPWIIFNVASDTVFLLDLIMNFRTGTVNEDS
:::. ::..:::::.::::::::: ..::.:::.:::.::: ::.::..::::: : ::.
CCDS12 YWDFTMLLFMVGNLIIIPVGITFFKDETTAPWIVFNVVSDTFFLMDLVLNFRTGIVIEDN
220 230 240 250 260 270
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 SEIILDPKVIKMNYLKSWFVVDFISSIPVDYIFLIVEKGMDSEVYKTARALRIVRFTKIL
.::::::. :: .::..::::::.:::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS12 TEIILDPEKIKKKYLRTWFVVDFVSSIPVDYIFLIVEKGIDSEVYKTARALRIVRFTKIL
280 290 300 310 320 330
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 SLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::.:: :::.:::::::::::::::::.::
CCDS12 SLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVMRICNLISMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQ
340 350 360 370 380 390
330 340 350 360 370 380
pF1KE5 DFPPDCWVSLNEMVNDSWGKQYSYALFKAMSHMLCIGYGAQAPVSMSDLWITMLSMIVGA
::: .::::.: ::: ::.. ::.::::::::::::::: ::: ::.:.:.:::::::::
CCDS12 DFPRNCWVSINGMVNHSWSELYSFALFKAMSHMLCIGYGRQAPESMTDIWLTMLSMIVGA
400 410 420 430 440 450
390 400 410 420 430 440
pF1KE5 TCYAMFVGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPADMRQKIHDYYEHRYQGKI
::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.
CCDS12 TCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPADFRQKIHDYYEHRYQGKM
460 470 480 490 500 510
450 460 470 480 490 500
pF1KE5 FDEENILNELNDPLREEIVNFNCRKLVATMPLFANADPNFVTAMLSKLRFEVFQPGDYII
:::..::.::: ::::::::::::::::.::::::::::::::::.::.:::::::::::
CCDS12 FDEDSILGELNGPLREEIVNFNCRKLVASMPLFANADPNFVTAMLTKLKFEVFQPGDYII
520 530 540 550 560 570
510 520 530 540 550 560
pF1KE5 REGAVGKKMYFIQHGVAGVITKSSKEMKLTDGSYFGEICLLTKGRRTASVRADTYCRLYS
:::..:::::::::::..:.::..:::::.::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS12 REGTIGKKMYFIQHGVVSVLTKGNKEMKLSDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYS
580 590 600 610 620 630
570 580 590 600 610 620
pF1KE5 LSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVAIDRLDRIGKKNSILLQKFQKDLNTGVFNNQENEILK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: :.:::.:::::::: :..
CCDS12 LSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVAIDRLDRIGKKNSILLHKVQHDLNSGVFNNQENAIIQ
640 650 660 670 680 690
630 640 650 660 670 680
pF1KE5 QIVKHDREMVQAIAPINYPQMTTLNSTSSTTTPTSRMRTQSPPVYTATSLSHSNLHSPSP
.:::.::::: :.. :.. . : :: .::
CCDS12 EIVKYDREMV---------QQAELGQRVGLFPPP-------PPPPQVTS-----------
700 710 720
690 700 710 720 730 740
pF1KE5 STQTPQPSAILSPCSYTTAVCSPPVQSPLAARTFHYASPTASQLSLMQQQPQQQVQQSQP
. : : .: .: : : : ::.. . .:: . : :
CCDS12 AIATLQQAAAMSFC--------PQVARPLVG-PLALGSPRLVRRPPPGPAPAAASPGPPP
730 740 750 760 770
750 760 770 780 790
pF1KE5 PQTQPQQP-SPQ-PQT-PGSSTPKNEVHKSTQALHNTNLTREVRPLSASQPSLPHEVS--
: . : : ::. :.: : .. : . . :: :.: :::::::::::: .
CCDS12 PASPPGAPASPRAPRTSPYGGLPAAPL--AGPALPARRLSRASRPLSASQPSLPHGAPGP
780 790 800 810 820 830
800 810 820 830 840 850
pF1KE5 TLISRPHPTVGESLASIPQPVTAVPGTGLQAGGRSTVPQRVTLFRQMSSGAIPPNRGVPP
. .:: . :. : .:.:
CCDS12 AASTRPASSSTPRLGPTPAARAAAPSPDRRDSASPGAAGGLDPQDSARSRLSSNL
840 850 860 870 880
>>CCDS10248.1 HCN4 gene_id:10021|Hs108|chr15 (1203 aa)
initn: 3348 init1: 3287 opt: 3342 Z-score: 1684.4 bits: 323.3 E(32554): 1.7e-87
Smith-Waterman score: 3399; 62.0% identity (77.5% similar) in 885 aa overlap (2-879:134-979)
10 20 30
pF1KE5 MEGGGKPNSSSNSRDDGNSVFPAKASATGAG
:: ..:. . : .. : . .:. :
CCDS10 GSRGGGSGGTGSGSSHGHLHDSAEERRLIAEGDASPG--EDRTPPGLAAEPERPGAS-AQ
110 120 130 140 150 160
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 PAAAEKRLGTPPGGGGAGAKEHGNSVCFKVDGGGGGGGGGGGGEEPAGGFEDAEGPRRQY
:::. :: ..:. .. . .. .::.::...: . .:: :
CCDS10 PAASPPPPQQPPQPASASCEQPSVDTAIKVEGGAAAGDQI---------LPEAEVRLGQA
170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 GFMQRQFTSMLQPGVNKFSLRMFGSQKAVEKEQERVKTAGFWIIHPYSDFRFYWDLIMLI
::::::: .:::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::: ::.
CCDS10 GFMQRQFGAMLQPGVNKFSLRMFGSQKAVEREQERVKSAGFWIIHPYSDFRFYWDLTMLL
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 MMVGNLVIIPVGITFFTEQTTTPWIIFNVASDTVFLLDLIMNFRTGTVNEDSSEIILDPK
.:::::.::::::::: ...:::::.:::.::: ::.::..::::: : ::..::::::.
CCDS10 LMVGNLIIIPVGITFFKDENTTPWIVFNVVSDTFFLIDLVLNFRTGIVVEDNTEIILDPQ
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 VIKMNYLKSWFVVDFISSIPVDYIFLIVEKGMDSEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRL
:::.::::::.::::::::::::::::: .::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RIKMKYLKSWFMVDFISSIPVDYIFLIVETRIDSEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRL
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 SRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPLLQDFPPDCWV
::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::.::::: ::::
CCDS10 SRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIVNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQDFPDDCWV
400 410 420 430 440 450
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 SLNEMVNDSWGKQYSYALFKAMSHMLCIGYGAQAPVSMSDLWITMLSMIVGATCYAMFVG
:.:.:::.::::::::::::::::::::::: ::::.:::.:.:::::::::::::::.:
CCDS10 SINNMVNNSWGKQYSYALFKAMSHMLCIGYGRQAPVGMSDVWLTMLSMIVGATCYAMFIG
460 470 480 490 500 510
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 HATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPADMRQKIHDYYEHRYQGKIFDEENILN
::::::::::::::::::::::::::::::::: : ::.::::::::::::.::::.::.
CCDS10 HATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPPDTRQRIHDYYEHRYQGKMFDEESILG
520 530 540 550 560 570
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 ELNDPLREEIVNFNCRKLVATMPLFANADPNFVTAMLSKLRFEVFQPGDYIIREGAVGKK
::..::::::.:::::::::.:::::::::::::.::.:::::::::::::::::..:::
CCDS10 ELSEPLREEIINFNCRKLVASMPLFANADPNFVTSMLTKLRFEVFQPGDYIIREGTIGKK
580 590 600 610 620 630
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 MYFIQHGVAGVITKSSKEMKLTDGSYFGEICLLTKGRRTASVRADTYCRLYSLSVDNFNE
::::::::..:.::..:: ::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MYFIQHGVVSVLTKGNKETKLADGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYSLSVDNFNE
640 650 660 670 680 690
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 VLEEYPMMRRAFETVAIDRLDRIGKKNSILLQKFQKDLNTGVFNNQENEILKQIVKHDRE
::::::::::::::::.::::::::::::::.: :.:::.:::: :::::..:::.::::
CCDS10 VLEEYPMMRRAFETVALDRLDRIGKKNSILLHKVQHDLNSGVFNYQENEIIQQIVQHDRE
700 710 720 730 740 750
640 650 660 670 680 690
pF1KE5 MVQAIAPINYPQMTTLNSTSSTTTPTSRMRTQSPPVYTATSLSHSNLHSPSPSTQTPQPS
:.. .. .: . : :: . :. . :..... . : : :.
CCDS10 MAHCAHRVQAAASATPTPTPVIWTPLIQAPLQAAAATTSVAIALT--HHPR------LPA
760 770 780 790 800
700 710 720 730 740 750
pF1KE5 AILSPCSYTTAVCSPPVQSPLAARTFHYASPTASQLSLMQQQPQQQVQQSQPPQTQPQQP
::. : . :.: . .. :.: : . .: .. .: . :... .
CCDS10 AIFRPPPGSGLGNLGAGQTPRHLKRLQSLIPSA----LGSASPASSPSQVDTPSSSSFHI
810 820 830 840 850
760 770 780 790 800
pF1KE5 SPQPQTPGSSTPKNEVHKSTQALHNTNLTREVRPLSASQPSLPHEVSTL--ISRPHPTVG
. : : :.: . .. . : :: :: ..:. ... : ..:
CCDS10 Q---QLAGFSAPAGLSPLLPSSSSSPPPGACGSP-SAPTPSAGVAATTIAGFGHFHKALG
860 870 880 890 900 910
810 820 830 840 850 860
pF1KE5 ESLASIPQPVTAVPGTGLQAGGRSTVPQRVTLFRQMSSGAIPPNRG---VPPA--PPPPA
::.: .:. : :: :.:: :: . . : : : :: .: ::::.
CCDS10 GSLSSSDSPLL----TPLQPGARS--PQAA-----QPSPAPPGARGGLGLPEHFLPPPPS
920 930 940 950 960
870 880 890
pF1KE5 AALPRESSSVLNTDPDAEKPRFASNL
. : : . :. :
CCDS10 SRSPSSSPGQLGQPPGELSLGLATGPLSTPETPPRQPEPPSLVAGASGGASPVGFTPRGG
970 980 990 1000 1010 1020
>>CCDS1108.1 HCN3 gene_id:57657|Hs108|chr1 (774 aa)
initn: 2281 init1: 2151 opt: 2947 Z-score: 1490.0 bits: 286.7 E(32554): 1.1e-76
Smith-Waterman score: 2986; 60.0% identity (77.2% similar) in 797 aa overlap (84-869:33-766)
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 GNSVCFKVDGGGGGGGGGGGGEEPAGGFEDAEGPRRQYGFM--QRQFTSMLQPGVNKFSL
: :: . : .:.. ..::: ::::::
CCDS11 AEQRPAAGASEGATPGLEAVPPVAPPPATAASGPIPKSGPEPKRRHLGTLLQPTVNKFSL
10 20 30 40 50 60
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 RMFGSQKAVEKEQERVKTAGFWIIHPYSDFRFYWDLIMLIMMVGNLVIIPVGITFFTEQT
:.:::.:::: ::::::.:: ::::::::::::::::::..:::::...::::::: :..
CCDS11 RVFGSHKAVEIEQERVKSAGAWIIHPYSDFRFYWDLIMLLLMVGNLIVLPVGITFFKEEN
70 80 90 100 110 120
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 TTPWIIFNVASDTVFLLDLIMNFRTGTVNEDSSEIILDPKVIKMNYLKSWFVVDFISSIP
. :::.::: ::: :::::..::::: : :...::.: :..:. ::..::.::.:::::
CCDS11 SPPWIVFNVLSDTFFLLDLVLNFRTGIVVEEGAEILLAPRAIRTRYLRTWFLVDLISSIP
130 140 150 160 170 180
240 250 260 270 280
pF1KE5 VDYIFLIVE--KGMDSEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTY
::::::.:: .:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VDYIFLVVELEPRLDAEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTY
190 200 210 220 230 240
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 DLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPLLQDFPPDCWVSLNEMVNDSWGKQYSYAL
:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.:.::: :::.:::.::
CCDS11 DLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQDFPPDCWVSINHMVNHSWGRQYSHAL
250 260 270 280 290 300
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 FKAMSHMLCIGYGAQAPVSMSDLWITMLSMIVGATCYAMFVGHATALIQSLDSSRRQYQE
::::::::::::: ::::.: :.:.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS11 FKAMSHMLCIGYGQQAPVGMPDVWLTMLSMIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQE
310 320 330 340 350 360
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 KYKQVEQYMSFHKLPADMRQKIHDYYEHRYQGKIFDEENILNELNDPLREEIVNFNCRKL
::::::::::::::::: ::.::.:::::::::.::::.::.::..::::::.::.:: :
CCDS11 KYKQVEQYMSFHKLPADTRQRIHEYYEHRYQGKMFDEESILGELSEPLREEIINFTCRGL
370 380 390 400 410 420
470 480 490 500 510 520
pF1KE5 VATMPLFANADPNFVTAMLSKLRFEVFQPGDYIIREGAVGKKMYFIQHGVAGVITKSSKE
:: :::::.:::.::::.:.::::::::::: ..:::.::.::::::::. .:.......
CCDS11 VAHMPLFAHADPSFVTAVLTKLRFEVFQPGDLVVREGSVGRKMYFIQHGLLSVLARGARD
430 440 450 460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KE5 MKLTDGSYFGEICLLTKGRRTASVRADTYCRLYSLSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVAID
.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.:: ::::.:::::::::::.:
CCDS11 TRLTDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYSLSVDHFNAVLEEFPMMRRAFETVAMD
490 500 510 520 530 540
590 600 610 620 630 640
pF1KE5 RLDRIGKKNSILLQKFQKDLNTGVFNNQENEILKQ-IVKHDREMVQAI---APINYPQMT
:: ::::::::: :. ... . : . . :..: .:.:::.:.... :: . :
CCDS11 RLLRIGKKNSIL-QRKRSEPSPG----SSGGIMEQHLVQHDRDMARGVRGRAPSTGAQ--
550 560 570 580 590
650 660 670 680 690 700
pF1KE5 TLNSTSSTTTPTSRMRTQSPPVYTATSLSHSNLHSPSPSTQTPQPSAILSPCSYTTAVCS
:.. : . :. : . .... .. ..: : . .:...:. .. .: :
CCDS11 -LSGKPVLWEPLVHAPLQAAAVTSNVAIALTHQRGPLP-LSPDSPATLLARSAWRSA-GS
600 610 620 630 640 650
710 720 730 740 750 760
pF1KE5 PPVQSPLAARTFHYASPTASQLSLMQQQPQQQVQQS--QPPQTQPQQPSPQPQTPGSST-
: :::. :.: :: : . : . .. : . ..: . .: : :
CCDS11 P--ASPLVPVR---AGPWAST-SRLPAPPARTLHASLSRAGRSQVSLLGPPPGGGGRRLG
660 670 680 690 700
770 780 790 800 810 820
pF1KE5 PKNEVHKSTQALHNTNLTREVRPLSASQPSLPHEVSTLISRPHPTVGESLASIPQPVTAV
:.. :::::::::::.... :. .
CCDS11 PRG------------------RPLSASQPSLPQRAT----------GD----------GS
710 720
830 840 850 860 870 880
pF1KE5 PGTGLQAGGRSTVPQRVTLFRQMSSGAIPPNRGVPPAPPPPAAALPRESSSVLNTDPDAE
:: ...: .: : : :: . :: :: : : ::
CCDS11 PGR--KGSGSERLPPSGLL-------AKPPRTAQPPRPPVPEPATPRGLQLSANM
730 740 750 760 770
890
pF1KE5 KPRFASNL
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110 120 130 140 150 160
pF1KE5 QPGVNKFSLRMFGSQKAVEKEQERVKTAGFWIIHPYSDFRFYWDLIMLIMMVGNLVIIPV
: : :: :. :: ..:.... . :. :
CCDS11 QNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKLQAPRIHRWTILHYSPFKAVWDWLILLLVIYTAVFTPY
220 230 240 250 260 270
170 180 190 200 210
pF1KE5 GITFF-TEQ----------TTTPWIIFNVASDTVFLLDLIMNFRTGTVNEDSSEIILDPK
. .:. ..: : .: . .. : .:..:...:::: :: .. :.. :.
CCDS11 SAAFLLSDQDESRRGACSYTCSPLTVVDLIVDIMFVVDIVINFRTTYVNTND-EVVSHPR
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 VIKMNYLKSWFVVDFISSIPVDYIFLIVEKGMDSEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRL
: ..:.:.::..:....:: : .:: . : : : ...::. ::
CCDS11 RIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFD--LLIFRTGSDET-------------TTLIGLLKTARL
340 350 360 370 380
280 290 300 310 320
pF1KE5 SRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLV-----PLLQD--
::.: .. .. :. .:.: .: :. . :. :: .:. . . : :.
CCDS11 LRLVRVARKLDR-----YSEYGAAV-LFLLMCTFALIAHWLACIWYAIGNVERPYLEHKI
390 400 410 420 430
330 340 350 360 370
pF1KE5 -FPPDCWVSLNEMVNDS-------WGKQYSYALFKAMSHMLCIGYGAQAPVSMSDLWITM
. . :.:.. : : .: ::. ..: . .:.: .: . :. ...
CCDS11 GWLDSLGVQLGKRYNGSDPASGPSVQDKYVTALYFTFSSLTSVGFGNVSPNTNSEKVFSI
440 450 460 470 480 490
380 390 400 410 420 430
pF1KE5 LSMIVGATCYAMFVGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPADMRQKIHDYYE
:..:. :: . :...:.:: : :. .:. .. .:.... ::..: .::....:..
CCDS11 CVMLIGSLMYASIFGNVSAIIQRLYSGTARYHTQMLRVKEFIRFHQIPNPLRQRLEEYFQ
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440 450 460 470 480 490
pF1KE5 H--RYQGKIFDEENILNELNDPLREEIVNFNCRKLVATMPLFANADPNFVTAMLSKLRFE
: : . : : . .:. . . :. .: : :. : :..: . . :. :..
CCDS11 HAWSYTNGI-DMNAVLKGFPECLQADICLHLHRALLQHCPAFSGAGKGCLRALAVKFKTT
560 570 580 590 600 610
500 510 520 530 540 550
pF1KE5 VFQPGDYIIREGAVGKKMYFIQHGVAGVITKSSKEMKLTDGSYFGE-ICLLTK-GRRTAS
::: ... : : . .:::..: .. . : .. ::: . : .. :. .:.
CCDS11 HAPPGDTLVHLGDVLSTLYFISRGSIEILRDDVVVAILGKNDIFGEPVSLHAQPGKSSAD
620 630 640 650 660 670
560 570 580 590 600
pF1KE5 VRADTYCRLYSLSVDNFNEVLEEYPMMRRAFET---VAIDRLDRIGKKNSILLQKFQKDL
::: ::: :.... .. :::. :: . ..: . :... : : .: : ..
CCDS11 VRALTYCDLHKIQRADLLEVLDMYPAFAESFWSKLEVTFNLRDAAGGLHSSPRQAPGSQD
680 690 700 710 720 730
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 NTGVF--NNQENEILKQIVKHDREMVQAIAPINYPQMTTLNSTSSTTTPTSRMRTQS-PP
. : : .:: . : :. . .: . ...: . : . . .. ::
CCDS11 HQGFFLSDNQSGS------PH--ELGPQFPSKGYSLLGPGSQNSMGAGPCAPGHPDAAPP
740 750 760 770 780
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 --VYTATSLSHSNLHS--PSPSTQTPQPSAILSPCSYTTAVCSPPVQSPLAARTFHYASP
. :..: :. : : :.:: . : . . . .:. . : .:
CCDS11 LSISDASGLWPELLQEMPPRHSPQSPQEDPDCWPLKLGSRL--EQLQAQMN-RLESRVSS
790 800 810 820 830 840
730 740 750 760 770
pF1KE5 TASQLSLMQQQPQQQVQQS---QPPQTQPQQPSP---QPQTPGSSTPKNEVHKSTQALHN
:.. . :.:. : . : . : .. : . .:: :.. . .:.
CCDS11 DLSRILQLLQKPMPQGHASYILEAPASNDLALVPIASETTSPGPRLPQGFL-PPAQTPSY
850 860 870 880 890 900
780 790 800 810 820 830
pF1KE5 TNLTREVRPLSASQPSLPHEVSTLISRPHPTVGESLASIPQPVTAVPGTGLQAGGRSTVP
.: :.: .:: . . . :. . : : : :.. : :
CCDS11 GDLDDCSPKHRNSSPRMPHLAVATDKTLAPSSEQEQPEGLWPPLASPLHPLEVQGLICGP
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pF1KE5 QRVTLFRQMSSGAIPPNRGVPPAPPPPAAALPRESSSVLNTDPDAEKPRFASNL
.: ... :..:
CCDS11 CFSSLPEHL--GSVPKQLDFQRHGSDPGFAGSWGH
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pF1KE5 QPGVNKFSLRMFGSQKAVEKEQERVKTAGFWIIHPYSDFRFYWDLIMLIMMVGNLVIIPV
: : :: :. :: ..:.... . :. :
CCDS62 QNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKLQAPRIHRWTILHYSPFKAVWDWLILLLVIYTAVFTPY
220 230 240 250 260 270
170 180 190 200 210
pF1KE5 GITFF-TEQ----------TTTPWIIFNVASDTVFLLDLIMNFRTGTVNEDSSEIILDPK
. .:. ..: : .: . .. : .:..:...:::: :: .. :.. :.
CCDS62 SAAFLLSDQDESRRGACSYTCSPLTVVDLIVDIMFVVDIVINFRTTYVNTND-EVVSHPR
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 VIKMNYLKSWFVVDFISSIPVDYIFLIVEKGMDSEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRL
: ..:.:.::..:....:: : .:: . : : : ...::. ::
CCDS62 RIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFD--LLIFRTGSDET-------------TTLIGLLKTARL
340 350 360 370 380
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pF1KE5 SRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLV-----PLLQD--
::.: .. .. :. .:.: .: :. . :. :: .:. . . : :.
CCDS62 LRLVRVARKLDR-----YSEYGAAV-LFLLMCTFALIAHWLACIWYAIGNVERPYLEHKI
390 400 410 420 430
330 340 350 360 370
pF1KE5 -FPPDCWVSLNEMVNDS-------WGKQYSYALFKAMSHMLCIGYGAQAPVSMSDLWITM
. . :.:.. : : .: ::. ..: . .:.: .: . :. ...
CCDS62 GWLDSLGVQLGKRYNGSDPASGPSVQDKYVTALYFTFSSLTSVGFGNVSPNTNSEKVFSI
440 450 460 470 480 490
380 390 400 410 420 430
pF1KE5 LSMIVGATCYAMFVGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPADMRQKIHDYYE
:..:. :: . :...:.:: : :. .:. .. .:.... ::..: .::....:..
CCDS62 CVMLIGSLMYASIFGNVSAIIQRLYSGTARYHTQMLRVKEFIRFHQIPNPLRQRLEEYFQ
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440 450 460 470 480 490
pF1KE5 H--RYQGKIFDEENILNELNDPLREEIVNFNCRKLVATMPLFANADPNFVTAMLSKLRFE
: : . : : . .:. . . :. .: : :. : :..: . . :. :..
CCDS62 HAWSYTNGI-DMNAVLKGFPECLQADICLHLHRALLQHCPAFSGAGKGCLRALAVKFKTT
560 570 580 590 600 610
500 510 520 530 540 550
pF1KE5 VFQPGDYIIREGAVGKKMYFIQHGVAGVITKSSKEMKLTDGSYFGE-ICLLTK-GRRTAS
::: ... : : . .:::..: .. . : .. ::: . : .. :. .:.
CCDS62 HAPPGDTLVHLGDVLSTLYFISRGSIEILRDDVVVAILGKNDIFGEPVSLHAQPGKSSAD
620 630 640 650 660 670
560 570 580 590 600
pF1KE5 VRADTYCRLYSLSVDNFNEVLEEYPMMRRAFET---VAIDRLDRIGKKNSILLQKFQKDL
::: ::: :.... .. :::. :: . ..: . :... : : .: : ..
CCDS62 VRALTYCDLHKIQRADLLEVLDMYPAFAESFWSKLEVTFNLRDAAGGLHSSPRQAPGSQD
680 690 700 710 720 730
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 NTGVF-NNQENEILKQIVKHDR-----EMVQAIAPINYPQMTTLNSTSSTTTPTSRMRTQ
. : : ...... . : :..: . : . :: . ::..
CCDS62 HQGFFLSDNQSDAAPPLSISDASGLWPELLQEMPPRHSPQSPQEDPDCWPLKLGSRLEQL
740 750 760 770 780 790
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pF1KE5 SPPVYTATSLSHSNLHSPSPSTQTPQPSAILSPCSYTTAVCSPPVQSPLAARTFHYASPT
. . : :.: : :.:.. ... . :... :: :: :
CCDS62 QAQMNRLESRVSSDLSRILQLLQKPMPQG------HASYILEAPASNDLA--LVPIASET
800 810 820 830 840
730 740 750 760 770
pF1KE5 ASQLSLMQQ---QPQQQVQQSQPPQTQPQQPSPQPQTP--GSSTPKNEVHKSTQALHNTN
.: . : : : . .. . .:.. . .:. : . .: :. . .: : .
CCDS62 TSPGPRLPQGFLPPAQTPSYGDLDDCSPKHRNSSPRMPHLAVATDKTLAPSSEQ-----E
850 860 870 880 890 900
780 790 800 810 820 830
pF1KE5 LTREVRPLSASQPSLPHEVSTLISRP-HPTVGESLASIPQPVTAVPGTGLQAGGRSTVPQ
. . : :: : : ::. :: : .. : :.:.:.
CCDS62 QPEGLWPPLAS-PLHPLEVQGLICGPCFSSLPEHLGSVPKQLDFQRHGSDPGFAGSWGH
910 920 930 940 950
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pF1KE5 RVTLFRQMSSGAIPPNRGVPPAPPPPAAALPRESSSVLNTDPDAEKPRFASNL
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: .: :.. .: : :.: : . ..:
CCDS31 ITAFKQPIEDDSCKGWGKFARLTRALTSSRGVLQ-QLAPSVQKGENVHKHSRLAEVLQLG
140 150 160 170 180 190
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 SQKAVEKEQERVKTAGFWIIHPYSDFRFYWDLIMLIMMVGNLVIIPVGITFFTEQTTTPW
:. . .:: :: :.: : :. :: :.::. . ...: ...: :.:... :
CCDS31 SDILPQYKQEAPKTPPHIILH-YCVFKTTWDWIILILTFYTAILVPYNVSFKTRQNNVAW
200 210 220 230 240 250
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pF1KE5 IIFNVASDTVFLLDLIMNFRTGTVNEDSSEIILDPKVIKMNYLKSWFVVDFISSIPVDYI
.. . :..::.:...::.: :. ..:.: :::.:.:::::.:::.:..: .: : :
CCDS31 LVVDSIVDVIFLVDIVLNFHTTFVGP-AGEVISDPKLIRMNYLKTWFVIDLLSCLPYDVI
260 270 280 290 300
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 --FLIVEKGMDSEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLAS
: :..:..: :.. :...:::::.:. : . .. : : :
CCDS31 NAFENVDEGISSL------------FSS-LKVVRLLRLGRVARKLDHYIE-----YGAAV
310 320 330 340 350
300 310 320 330
pF1KE5 AVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPLLQDFPPDC-------WV-----------SLNE
:. :. .. : :: .:. . . . : : :. ..:
CCDS31 LVL----LVCVFGLAAHWMACIWYSIGDYEIFDEDTKTIRNNSWLYQLAMDIGTPYQFNG
360 370 380 390 400
340 350 360 370 380
pF1KE5 MVNDSW--GKQ----YSYALFKAMSHMLCIGYGAQAPVSMSDLWITMLSMIVGATCYAMF
. .: : . : .:. .:. . .:.: :: . . ... :..:. :: .
CCDS31 SGSGKWEGGPSKNSVYISSLYFTMTSLTSVGFGNIAPSTDIEKIFAVAIMMIGSLLYATI
410 420 430 440 450 460
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pF1KE5 VGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPADMRQKIHDYYEHRYQ-GKIFDEEN
:..:...:.. .. .:.: ..:.........: . ... :: .. .. .: :.
CCDS31 FGNVTTIFQQMYANTNRYHEMLNSVRDFLKLYQVPKGLSERVMDYIVSTWSMSRGIDTEK
470 480 490 500 510 520
450 460 470 480 490 500
pF1KE5 ILNELNDPLREEI-VNFNCRKLVATMPLFANADPNFVTAMLSKLRFEVFQPGDYIIREGA
.:. .: .: :..: ::. : : :. . . :. ... ::: : . :
CCDS31 VLQICPKDMRADICVHLN-RKVFKEHPAFRLASDGCLRALAMEFQTVHCAPGDLIYHAGE
530 540 550 560 570 580
510 520 530 540 550 560
pF1KE5 VGKKMYFIQHGVAGVITKSSKEMKLTDGSYFGEICL--LTKGRRTASVRADTYCRLYSLS
.. :. : :: . : :. ::.. : .. :.::: ::: :. ..
CCDS31 SVDSLCFVVSGSLEVIQDDEVVAILGKGDVFGDVFWKEATLAQSCANVRALTYCDLHVIK
590 600 610 620 630 640
570 580 590 600 610 620
pF1KE5 VDNFNEVLEEYPMMRRAFETVAIDRLDRIGKKNSILLQKFQKDLNTGVFNNQENEILKQI
: ...::: : . ..:
CCDS31 RDALQKVLEFYTAFSHSFSRNLILTYNLRKRIVFRKISDVKREEEERMKRKNEAPLILPP
650 660 670 680 690 700
>>CCDS9756.1 KCNH5 gene_id:27133|Hs108|chr14 (988 aa)
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pF1KE5 AEGPRRQYGFMQRQFTSMLQPGVNKFSLRMFGSQKAVEKEQERVKTAGFWIIHPYSDFRF
.::. . .:: :: :.: : :.
CCDS97 TNSRSVLQQLTPMNKTEVVHKHSRLAEVLQLGSDILPQYKQEAPKTPPHIILH-YCAFKT
160 170 180 190 200 210
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 YWDLIMLIMMVGNLVIIPVGITFFTEQTTTPWIIFNVASDTVFLLDLIMNFRTGTVNEDS
:: ..::. . ...: ...: :.:.. :.... . :..::.:...::.: :. .
CCDS97 TWDWVILILTFYTAIMVPYNVSFKTKQNNIAWLVLDSVVDVIFLVDIVLNFHTTFVGP-G
220 230 240 250 260 270
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 SEIILDPKVIKMNYLKSWFVVDFISSIPVDYI--FLIVEKGMDSEVYKTARALRIVRFTK
.:.: :::.:.:::::.:::.:..: .: : : : :..:..: .... :..::
CCDS97 GEVISDPKLIRMNYLKTWFVIDLLSCLPYDIINAFENVDEGISS-LFSS---LKVVR---
280 290 300 310 320
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pF1KE5 ILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLV--
::::.:. : . .. : : : :. :. .. :. :: .:. . .
CCDS97 ------LLRLGRVARKLDHYLE-----YGAAVLVL----LVCVFGLVAHWLACIWYSIGD
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. . . : : .. : : : . : .:. .:. .
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.....: . ... :: .. .: .: :..:. .: .: :..: ::. : :
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. . : :.::. .. . . . .. .. ... .. . : .:.
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..: . : : .: . : :. : . ... .: ..: :. .: ::
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CCDS97 QIPCQDIFSVSRPESPESDKDEIHF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]