FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9567, 488 aa 1>>>pF1KE9567 488 - 488 aa - 488 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5994+/-0.000788; mu= 16.9583+/- 0.048 mean_var=108.7158+/-35.124, 0's: 0 Z-trim(108.8): 190 B-trim: 1217 in 2/51 Lambda= 0.123006 statistics sampled from 10105 (10449) to 10105 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.684), E-opt: 0.2 (0.321), width: 16 Scan time: 3.430 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3930.1 PTGER4 gene_id:5734|Hs108|chr5 ( 488) 3172 574.1 1.2e-163 CCDS12686.1 PTGIR gene_id:5739|Hs108|chr19 ( 386) 499 99.6 6.3e-21 CCDS12309.1 PTGER1 gene_id:5731|Hs108|chr19 ( 402) 456 92.0 1.3e-18 CCDS61454.1 PTGDR gene_id:5729|Hs108|chr14 ( 296) 405 82.8 5.5e-16 CCDS9707.1 PTGDR gene_id:5729|Hs108|chr14 ( 359) 405 82.9 6.3e-16 CCDS9708.1 PTGER2 gene_id:5732|Hs108|chr14 ( 358) 403 82.6 8e-16 CCDS44160.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 365) 355 74.0 3e-13 CCDS652.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 374) 355 74.1 3e-13 CCDS658.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 388) 355 74.1 3.1e-13 CCDS657.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 390) 355 74.1 3.1e-13 CCDS656.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 390) 355 74.1 3.1e-13 CCDS655.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 418) 355 74.1 3.3e-13 CCDS42467.1 TBXA2R gene_id:6915|Hs108|chr19 ( 343) 313 66.6 5e-11 CCDS54198.1 TBXA2R gene_id:6915|Hs108|chr19 ( 407) 313 66.6 5.6e-11 >>CCDS3930.1 PTGER4 gene_id:5734|Hs108|chr5 (488 aa) initn: 3172 init1: 3172 opt: 3172 Z-score: 3051.5 bits: 574.1 E(32554): 1.2e-163 Smith-Waterman score: 3172; 100.0% identity (100.0% similar) in 488 aa overlap (1-488:1-488) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MSTPGVNSSASLSPDRLNSPVTIPAVMFIFGVVGNLVAIVVLCKSRKEQKETTFYTLVCG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS39 MSTPGVNSSASLSPDRLNSPVTIPAVMFIFGVVGNLVAIVVLCKSRKEQKETTFYTLVCG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 LAVTDLLGTLLVSPVTIATYMKGQWPGGQPLCEYSTFILLFFSLSGLSIICAMSVERYLA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS39 LAVTDLLGTLLVSPVTIATYMKGQWPGGQPLCEYSTFILLFFSLSGLSIICAMSVERYLA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 INHAYFYSHYVDKRLAGLTLFAVYASNVLFCALPNMGLGSSRLQYPDTWCFIDWTTNVTA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS39 INHAYFYSHYVDKRLAGLTLFAVYASNVLFCALPNMGLGSSRLQYPDTWCFIDWTTNVTA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 HAAYSYMYAGFSSFLILATVLCNVLVCGALLRMHRQFMRRTSLGTEQHHAAAAASVASRG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS39 HAAYSYMYAGFSSFLILATVLCNVLVCGALLRMHRQFMRRTSLGTEQHHAAAAASVASRG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 HPAASPALPRLSDFRRRRSFRRIAGAEIQMVILLIATSLVVLICSIPLVVRVFVNQLYQP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS39 HPAASPALPRLSDFRRRRSFRRIAGAEIQMVILLIATSLVVLICSIPLVVRVFVNQLYQP 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE9 SLEREVSKNPDLQAIRIASVNPILDPWIYILLRKTVLSKAIEKIKCLFCRIGGSRRERSG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS39 SLEREVSKNPDLQAIRIASVNPILDPWIYILLRKTVLSKAIEKIKCLFCRIGGSRRERSG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE9 QHCSDSQRTSSAMSGHSRSFISRELKEISSTSQTLLPDLSLPDLSENGLGGRNLLPGVPG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS39 QHCSDSQRTSSAMSGHSRSFISRELKEISSTSQTLLPDLSLPDLSENGLGGRNLLPGVPG 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE9 MGLAQEDTTSLRTLRISETSDSSQGQDSESVLLVDEAGGSGRAGPAPKGSSLQVTFPSET :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS39 MGLAQEDTTSLRTLRISETSDSSQGQDSESVLLVDEAGGSGRAGPAPKGSSLQVTFPSET 430 440 450 460 470 480 pF1KE9 LNLSEKCI :::::::: CCDS39 LNLSEKCI >>CCDS12686.1 PTGIR gene_id:5739|Hs108|chr19 (386 aa) initn: 659 init1: 358 opt: 499 Z-score: 489.2 bits: 99.6 E(32554): 6.3e-21 Smith-Waterman score: 631; 36.7% identity (62.1% similar) in 335 aa overlap (20-349:17-311) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MSTPGVNSSASLSPDRLNSPVTIPAVMFIFGVVGNLVAIVVLCKSRKEQKETTFYTLVCG :.: ..::. ::::: .:. .: ..:. . ..: .:: : CCDS12 MADSCRNLTYVRGSVGPAT-STLMFVAGVVGNGLALGIL-SARRPARPSAFAVLVTG 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE9 LAVTDLLGTLLVSPVTIATYMK-----GQWPGGQPLCEYSTFILLFFSLSGLSIICAMSV ::.:::::: ..::.....: . : :: ::. .: . ::.:... :. ::.: CCDS12 LAATDLLGTSFLSPAVFVAYARNSSLLGLARGGPALCDAFAFAMTFFGLASMLILFAMAV 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 ERYLAINHAYFYSHYVDKRLAGLTLFAVYASNVLFCALPNMGLGSSRLQYPDTWCFIDWT :: ::..: :.:.. : : :.: :.:: ::::::: .:::. . : .:::. CCDS12 ERCLALSHPYLYAQLDGPRCARLALPAIYAFCVLFCALPLLGLGQHQQYCPGSWCFLRMR 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 TNVTAHAAYSYMYAGFSSFLILATVLCNVLVCGALLRMHRQFMRRTSLGTEQHHAAAAAS . ::.: :::. ..:. : ::: : .: ::.:: ...: . : CCDS12 WAQPGGAAFSLAYAGLVALLVAAIFLCNGSVTLSLCRMYRQ---------QKRHQG---S 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 VASRGHPAASPALPRLSDFRRRRSFRRIAGAEIQMVILLIATSLVVLICSIPLVVRVFVN .. : :: .. :.. .::: ..:. .::.::..: :. CCDS12 LGPR---------PRTGE------------DEVDHLILLALMTVVMAVCSLPLTIRCFT- 230 240 250 260 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 QLYQPSLEREVSKNPDLQAIRIASVNPILDPWIYILLRKTVLSKAIEKIKCLFCRIGGSR : :. :.. :: :.:. . :::::::..::.::.:... . :: : CCDS12 QAVAPDSSSEMG---DLLAFRFYAFNPILDPWVFILFRKAVFQRLKLWVCCL-CLGPAHG 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 pF1KE9 RERSGQHCSDSQRTSSAMSGHSRSFISRELKEISSTSQTLLPDLSLPDLSENGLGGRNLL CCDS12 DSQTPLSQLASGRRDPRAPSAPVGKEGSCVPLSAWGEGQVEPLPPTQQSSGSAVGTSSKA 320 330 340 350 360 370 >>CCDS12309.1 PTGER1 gene_id:5731|Hs108|chr19 (402 aa) initn: 343 init1: 161 opt: 456 Z-score: 447.7 bits: 92.0 E(32554): 1.3e-18 Smith-Waterman score: 467; 30.9% identity (60.9% similar) in 353 aa overlap (2-339:19-361) 10 20 30 40 pF1KE9 MSTPGVNSSASLSPDRLNSPVTIPAVMFIFGVVGNLVAIVVLC ..: : ..... :. ::. .: . .:.:.::.:...: CCDS12 MSPCGPLNLSLAGEATTCAAPWVPNTSAVPPSG-ASPA-LPIFSMTLGAVSNLLALALLA 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 pF1KE9 KS----RKEQKETTFYTLVCGLAVTDLLGTLLVSPVTIATYMKGQWPGGQPLCEYSTFIL .. :.... .:: .: .: .::: : .. . ... : :. :.: :.. . CCDS12 QAAGRLRRRRSAATFLLFVASLLATDLAGHVIPGALVLRLYTAGRAPAGGA-CHFLGGCM 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE9 LFFSLSGLSIICAMSVERYLAINHAYFYSHYVDKRLAGLTLFAVYASNVLFCALPNMGLG .::.: : . :.:.::: ..... ... :. : :.: :: : . :: .: CCDS12 VFFGLCPLLLGCGMAVERCVGVTRPLLHAARVSVARARLALAAVAAVALAVALLPLARVG 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 SSRLQYPDTWCFIDW-TTNVTAHAAYSYMYAGFSSFLILATVLCNVLVCGALLRMH-RQF .:::: ::::: . .: . ..:... .::...::.: :::: . :. CCDS12 RYELQYPGTWCFIGLGPPGGWRQALLAGLFASLGLVALLAALVCNTLSGLALLRARWRRR 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 MRRT--SLGTEQH-----HAAAAASVASRGHPAASPALPRLSDFRRRRSFRRIAGAEIQM :: . : ... :. .::..: . :.. .. .. : : :: . ...: CCDS12 SRRPPPASGPDSRRRWGAHGPRSASASSASSIASASTF--FGGSRSSGSARRARAHDVEM 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 pF1KE9 VILLIATSLVVLICSIPLVVRVF--VNQLYQPSLEREVSKNPDLQAIRIASVNPILDPWI : :.. .: :: :..: : :. . ::.: : . :.:.:: : :::::. CCDS12 VGQLVGIMVVSCICWSPMLVLVALAVGGWSSTSLQR-----PLFLAVRLASWNQILDPWV 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KE9 YILLRKTVLSKAIEKIKCLFCRIGGSRRERSGQHCSDSQRTSSAMSGHSRSFISRELKEI :::::..:: . CCDS12 YILLRQAVLRQLLRLLPPRAGAKGGPAGLGLTPSAWEASSLRSSRHSGLSHF 360 370 380 390 400 >>CCDS61454.1 PTGDR gene_id:5729|Hs108|chr14 (296 aa) initn: 445 init1: 218 opt: 405 Z-score: 400.5 bits: 82.8 E(32554): 5.5e-16 Smith-Waterman score: 454; 32.0% identity (61.5% similar) in 309 aa overlap (1-292:1-285) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MSTPGVNSSASLSPDRLNSPVTIPAVMFIFGVVGNLVAIVVLCKS------RKEQKE--T :..: . . : .. :: : . .:.: :..:::.:. .: .: :. . . CCDS61 MKSPFYRCQNTTSVEKGNSAV-MGGVLFSTGLLGNLLALGLLARSGLGWCSRRPLRPLPS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 TFYTLVCGLAVTDLLGTLLVSPVTIATYMKGQ-----WPG-GQPLCEYSTFILLFFSLSG .:: :::::.:::::: :.:::..:.: ... :. . ::. .:.. ::.::. CCDS61 VFYMLVCGLTVTDLLGKCLLSPVVLAAYAQNRSLRVLAPALDNSLCQAFAFFMSFFGLSS 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 LSIICAMSVERYLAINHAYFYSHYVDKRLAGLTLFAVYASNVLFCALPNMGLGSSRLQY- . ::..: .:...: .:: ... ::..:. .: : .. ::::: ::.:. .:: CCDS61 TLQLLAMALECWLSLGHPFFYRRHITLRLGALVAPVVSAFSLAFCALPFMGFGKF-VQYC 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 PDTWCFIDWTTNVTAHAA--YSYMYAGFSSFLILATVLCNVLVCGALLRMHRQFMRRTSL : :::::. . . . .. :: .:... ..:.:::::::. . : :::...:. CCDS61 PGTWCFIQMVHEEGSLSVLGYSVLYSSLMALLVLATVLCNLGAMRNLYAMHRRLQRHPRS 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 GTEQHHAAAAASVASRGHPAASPALPRLSDFRRRRSFRRIAGAEIQMVILLIATSLVVLI :.. : . :. :. : :.. ..:: ... . CCDS61 CTRD-----CAEPRADGREASPQPLE-----------------ELDHLLLLALMTVLFTM 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 CSIPLVVRVFVNQLYQPSLEREVSKNPDLQAIRIASVNPILDPWIYILLRKTVLSKAIEK ::.:... : CCDS61 CSLPVIAFVPGVPAKTPGSR 280 290 >>CCDS9707.1 PTGDR gene_id:5729|Hs108|chr14 (359 aa) initn: 514 init1: 218 opt: 405 Z-score: 399.4 bits: 82.9 E(32554): 6.3e-16 Smith-Waterman score: 560; 32.0% identity (61.6% similar) in 391 aa overlap (1-373:1-359) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MSTPGVNSSASLSPDRLNSPVTIPAVMFIFGVVGNLVAIVVLCKS------RKEQKE--T :..: . . : .. :: : . .:.: :..:::.:. .: .: :. . . CCDS97 MKSPFYRCQNTTSVEKGNSAV-MGGVLFSTGLLGNLLALGLLARSGLGWCSRRPLRPLPS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 TFYTLVCGLAVTDLLGTLLVSPVTIATYMKGQ-----WPG-GQPLCEYSTFILLFFSLSG .:: :::::.:::::: :.:::..:.: ... :. . ::. .:.. ::.::. CCDS97 VFYMLVCGLTVTDLLGKCLLSPVVLAAYAQNRSLRVLAPALDNSLCQAFAFFMSFFGLSS 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 LSIICAMSVERYLAINHAYFYSHYVDKRLAGLTLFAVYASNVLFCALPNMGLGSSRLQY- . ::..: .:...: .:: ... ::..:. .: : .. ::::: ::.:. .:: CCDS97 TLQLLAMALECWLSLGHPFFYRRHITLRLGALVAPVVSAFSLAFCALPFMGFGKF-VQYC 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 PDTWCFIDWTTNVTAHAA--YSYMYAGFSSFLILATVLCNVLVCGALLRMHRQFMRRTSL : :::::. . . . .. :: .:... ..:.:::::::. . : :::...:. CCDS97 PGTWCFIQMVHEEGSLSVLGYSVLYSSLMALLVLATVLCNLGAMRNLYAMHRRLQRHPRS 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 GTEQHHAAAAASVASRGHPAASPALPRLSDFRRRRSFRRIAGAEIQMVILLIATSLVVLI :.. : . :. :. : :.. ..:: ... . CCDS97 CTRD-----CAEPRADGREASPQPLE-----------------ELDHLLLLALMTVLFTM 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 CSIPLVVRVFVNQLYQPSLEREVSKNP-DLQAIRIASVNPILDPWIYILLRKTVLSKAIE ::.:.. :.. . . . . . ..:.. ::.:.:. :: :.::::.:..:. :. .. CCDS97 CSLPVIYRAYYGAFKDVKEKNRTSEEAEDLRALRFLSVISIVDPWIFIIFRSPVFRIFFH 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KE9 KIKCLFCRIGGSRRERSGQHCSDSQRTSSAMSGHSRSFISRELKEISSTSQTLLPDLSLP :: : : : :: .::.: :.. CCDS97 KI---FIR---PLRYRS--RCSNSTNMESSL 340 350 410 420 430 440 450 460 pF1KE9 DLSENGLGGRNLLPGVPGMGLAQEDTTSLRTLRISETSDSSQGQDSESVLLVDEAGGSGR >>CCDS9708.1 PTGER2 gene_id:5732|Hs108|chr14 (358 aa) initn: 666 init1: 237 opt: 403 Z-score: 397.5 bits: 82.6 E(32554): 8e-16 Smith-Waterman score: 615; 35.2% identity (62.9% similar) in 369 aa overlap (19-370:24-353) 10 20 30 40 pF1KE9 MSTPGVNSSASLSPDRLNSPVTIPAVMFIFGVVGNLVAIVVL---------CKSR ::. : .::: ::.:::.:...: :.. CCDS97 MGNASNDSQSEDCETRQWLPPGESPA-ISSVMFSAGVLGNLIALALLARRWRGDVGCSAG 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 KEQKETTFYTLVCGLAVTDLLGTLLVSPVTIATYMKGQW-----PGGQPLCEYSTFILLF .... . :..:: :. :::::: :.:::..:.: ..: : .. : : .: . : CCDS97 RRSSLSLFHVLVTELVFTDLLGTCLISPVVLASYARNQTLVALAPESRA-CTYFAFAMTF 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 FSLSGLSIICAMSVERYLAINHAYFYSHYVDKRLAGLTLFAV-YASNVLFCALPNMGLGS :::. . .. ::..::::.:.: :::.. :. : .::... : :: ..:::.:: . :. CCDS97 FSLATMLMLFAMALERYLSIGHPYFYQRRVS-RSGGLAVLPVIYAVSLLFCSLPLLDYGQ 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 pF1KE9 SRLQY-PDTWCFIDWTTNVTAHAAYSYMYAGFSSFLILATVLCNVLVCGALLRMHRQFMR .:: : ::::: ...:: .:: . .::.... :: : :.::::. : CCDS97 -YVQYCPGTWCFIR-----HGRTAYLQLYATLLLLLIVSVLACNFSVILNLIRMHRR-SR 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 RTSLGTEQHHAAAAASVAS-RGHPAASPALPRLSDFRRRRSFRRIAGAEIQMVILLIATS :. : :..: :: :.: :::. : . : . .::: . CCDS97 RSRCGP---------SLGSGRGGPGA-----------RRRGERVSMAEETDHLILLAIMT 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE9 LVVLICSIPLVVRVFVNQLYQPSLEREVSKNPDLQAIRIASVNPILDPWIYILLRKTVLS .. .::.:... ...: . : ..: . ::::.:. :.: :.:::.. .:: :: CCDS97 ITFAVCSLPFTIFAYMN---ETSSRKE---KWDLQALRFLSINSIIDPWVFAILRPPVL- 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 390 pF1KE9 KAIEKIKCLFCRIGGSRRERSGQHCSDSQRTSSAMSGHSRSFISRELKEISSTSQTLLPD . .... : :::. .. . :: .. .: CCDS97 RLMRSVLC--CRISLRTQDATQTSCSTQSDASKQADL 330 340 350 400 410 420 430 440 450 pF1KE9 LSLPDLSENGLGGRNLLPGVPGMGLAQEDTTSLRTLRISETSDSSQGQDSESVLLVDEAG >>CCDS44160.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 (365 aa) initn: 363 init1: 199 opt: 355 Z-score: 351.4 bits: 74.0 E(32554): 3e-13 Smith-Waterman score: 434; 31.9% identity (58.2% similar) in 342 aa overlap (21-339:52-356) 10 20 30 40 pF1KE9 MSTPGVNSSASLSPDRLNSPVTIPAVMFIFGVVGNLVAIVVLCKS--RKE :..: .:.. : ::: .:.... .: :.: CCDS44 TGMWAPERSAEARGNLTRPPGSGEDCGSVSVAFPITMLLTGFVGNALAMLLVSRSYRRRE 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 QKETTFYTLVCG-LAVTDLLGTLLVSPVTIATYMKGQ-W----PGGQPLCEYSTFILLFF .:. . : : ::.:::.: ::..::.:..:.. : : :.:. :: . . . : CCDS44 SKRKKSFLLCIGWLALTDLVGQLLTTPVVIVVYLSKQRWEHIDPSGR-LCTFFGLTMTVF 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 SLSGLSIICAMSVERYLAINHAYFYSHYVDKRLAGLTLFAVYASNVLFCALPNMGLGSSR .::.: : ::.::: ::: ..:. .. : . .:..:. . . : :: .:.:. CCDS44 GLSSLFIASAMAVERALAIRAPHWYASHMKTRATRAVLLGVWLAVLAFALLPVLGVGQYT 150 160 170 180 190 200 170 180 190 200 210 pF1KE9 LQYPDTWCFIDW----TTNVTAHAAYSYMYAGFSSFL-ILA---TVLCNVLVCGALLRMH .:.: :::::. . . ..: . ..:. .:: .:: : ::. . ::. 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