FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3321, 904 aa 1>>>pF1KE3321 904 - 904 aa - 904 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4300+/-0.00153; mu= 15.2987+/- 0.092 mean_var=122.0922+/-25.762, 0's: 0 Z-trim(100.7): 199 B-trim: 0 in 0/49 Lambda= 0.116073 statistics sampled from 5982 (6202) to 5982 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.518), E-opt: 0.2 (0.191), width: 16 Scan time: 3.520 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3846.1 TLR3 gene_id:7098|Hs108|chr4 ( 904) 5981 1014.5 0 CCDS14152.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1041) 638 119.9 2.5e-26 CCDS14153.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1059) 638 119.9 2.6e-26 CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11 ( 951) 417 82.8 3.3e-15 CCDS3445.1 TLR10 gene_id:81793|Hs108|chr4 ( 811) 410 81.6 6.5e-15 CCDS3784.1 TLR2 gene_id:7097|Hs108|chr4 ( 784) 404 80.6 1.3e-14 CCDS33973.1 TLR1 gene_id:7096|Hs108|chr4 ( 786) 402 80.2 1.6e-14 CCDS55602.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1 ( 642) 351 71.6 5.2e-12 CCDS573.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1 ( 661) 351 71.6 5.3e-12 CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523) 347 71.3 1.6e-11 CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1530) 347 71.3 1.6e-11 CCDS10446.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 605) 338 69.4 2.2e-11 CCDS53982.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 643) 338 69.5 2.3e-11 CCDS45905.1 LINGO3 gene_id:645191|Hs108|chr19 ( 592) 335 68.9 3.1e-11 >>CCDS3846.1 TLR3 gene_id:7098|Hs108|chr4 (904 aa) initn: 5981 init1: 5981 opt: 5981 Z-score: 5422.4 bits: 1014.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5981; 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26.3% identity (57.6% similar) in 919 aa overlap (41-901:136-1026) 20 30 40 50 60 70 pF1KE3 WGGLLPFGMLCASSTTKCTVSHEVADCSHLKLTQVPDDLPTNITVLNLTHNQLRRLPAAN .: :.:. :: ..: :.: .:.. . . CCDS14 NPGIQSNGLNITDGAFLNLKNLRELLLEDNQLPQIPSGLPESLTELSLIQNNIYNITKEG 110 120 130 140 150 160 80 90 100 110 120 pF1KE3 FTRYSQLTSLDVG----FNTI---SKLEPELCQKLPMLKVLNLQHNELSQLSDKTFAFCT ..: .: .: .. :: . ...: . . : :..:.:. : ::.. : . . CCDS14 ISRLINLKNLYLAWNCYFNKVCEKTNIEDGVFETLTNLELLSLSFNSLSHVPPK---LPS 170 180 190 200 210 220 130 140 150 160 pF1KE3 NLTELHLMSNSIQKIKNNPFVKQKNLITLDLSHN---------------GLSSTKLGTQV .: .: : ...:. :... : :: :::: : : .: .. . CCDS14 SLRKLFLSNTQIKYISEEDFKGLINLTLLDLSGNCPRCFNAPFPCVPCDGGASINID-RF 230 240 250 260 270 280 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 QLENLQELLLSNNKIQALKSEELDIFAN-SSLKKLELSSNQ-IKEFSPGCFHAI-GRLFG ..:: .: : . .:.. . : : :: :.: : . :.. : : .. :: CCDS14 AFQNLTQLRYLNLSSTSLRKINAAWFKNMPHLKVLDLEFNYLVGEIASGAFLTMLPRLEI 290 300 310 320 330 340 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 LFLNNVQLGPSLTEKLCLELANT---SIRNLSLSNSQLSTTSNTTFLGL-KWTNLTMLDL : :. . : ... . . :.: : : . .. . : : . ::. ..: CCDS14 LDLSFNYIKGSYPQHINISRNFSKLLSLRALHLRGYVFQELREDDFQPLMQLPNLSTINL 350 360 370 380 390 400 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 SYNNLNVVGNDSFAWLPQLEYFFLEYNNIQHLFSHSLHGLFNVRYLNLKRSFTKQ-SISL . : .. . : . .:: ..: : :. : . . .. : ...: . :. : .. CCDS14 GINFIKQIDFKLFQNFSNLEIIYLSENRISPLVKDTRQSYANSS--SFQRHIRKRRSTDF 410 420 430 440 450 350 360 370 380 390 pF1KE3 ASLPKIDDFSFQ--WLK--CLEH---LNMEDNDIPGIKSNMFTGLINLKYLSLSNSFTSL :. . . : .: : . :.. :.: : :.: .: .. :.:: . .. CCDS14 EFDPHSNFYHFTRPLIKPQCAAYGKALDLSLNSIFFIGPNQFENLPDIACLNLSAN-SNA 460 470 480 490 500 510 400 410 420 430 440 pF1KE3 RTLTNETFVSLAHSPLHILNLTKNKISKIESDAFSWLGHLEVLDLGLNEIGQELTG---- ..:.. : .. : .. :.::.:... ...:.. :. ::::::. : ...: CCDS14 QVLSGTEFSAIPH--VKYLDLTNNRLDFDNASALTELSDLEVLDLSYNSHYFRIAGVTHH 520 530 540 550 560 570 450 460 470 480 490 500 pF1KE3 -QEWRGLENIFEIYLSYNKYLQLTRNSFALVPSLQRLML---RRVALKNVDSSP--SPFQ . ... :. . ::.:. :: . :: .:.. : : : :.. : :. CCDS14 LEFIQNFTNLKVLNLSHNNIYTLTDKYNLESKSLVELVFSGNRLDILWNDDDNRYISIFK 580 590 600 610 620 630 510 520 530 540 550 560 pF1KE3 PLRNLTILDLSNNNIANINDDMLEGLE-KLEILDLQHNNLARL-WKHANPGGPIYFLKGL :.::: :::: : . .: .. . .: .: : .. : : . : .:. . CCDS14 GLKNLTRLDLSLNRLKHIPNEAFLNLPASLTELHINDNMLKFFNWT---------LLQQF 640 650 660 670 680 570 580 590 600 610 620 pF1KE3 SHLHILNLESNGFDEIPVEVFKDLFE-LKIIDLGLNNLNTLPASVFNNQVSLKSLNLQKN .:..:.:..: . . .. ..:. :. . :. : .. ::.. ... ::: :.:..: CCDS14 PRLELLDLRGNKLLFL-TDSLSDFTSSLRTLLLSHNRISHLPSGFLSEVSSLKHLDLSSN 690 700 710 720 730 740 630 640 650 660 670 pF1KE3 LITSVEKKVF-GPAFRNLTELDMRFNPFDCTCESIAWFVNWINETHTN--IPELSSHYLC :. ...:... . .:. :... :::.:::. :. : :..: : : ::.: . .: CCDS14 LLKTINKSALETKTTTKLSMLELHGNPFECTCD-IGDFRRWMDE-HLNVKIPRLVD-VIC 750 760 770 780 790 800 680 690 700 710 720 730 pF1KE3 NTPPHYHGFPVRLFDTSSCKDSAPFELFFMINTSILLIFIFIVLLIHFEGWRISFYWNVS .: .: . .. ..: ... ..:... : . .. .: :. : . : .:: CCDS14 ASPGDQRGKSIVSLELTTCVSDVTAVILFFFTFFITTMVMLAALAHHLFYWDVWFIYNVC 810 820 830 840 850 860 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 VHRVLGFKEIDRQTEQFEYAAYIIHAYKDK---DWVWEH--FSSMEKEDQSLKFCLEERD . .: :.. .. : : : ::: . :: ::: .. . :..:... .:::::: CCDS14 LAKVKGYRSLS--TSQTFYDAYISYDTKDASVTDWVINELRYHLEESRDKNVLLCLEERD 870 880 890 900 910 920 800 810 820 830 840 850 pF1KE3 FEAGVFELEAIVNSIKRSRKIIFVITHHLLKDPLCKRFKVHHAVQQAIEQNLDSIILVFL .. :. .. ...::..:.: .::.:.. :. : . :.:. ...:.: ::...: CCDS14 WDPGLAIIDNLMQSINQSKKTVFVLTKKYAKSWNFKT-AFYLALQRLMDENMDVIIFILL 930 940 950 960 970 980 860 870 880 890 900 pF1KE3 EEIPDYKLNHALCLRRGMFKSHCILNWPVQKERIGAFRHKLQVALGSKNSVH : : . .. : ::. . :: ::.:: . . : : . :. .. ..: CCDS14 E--PVLQHSQYLRLRQRICKSS-ILQWPDNPKAEGLFWQTLRNVVLTENDSRYNNMYVDS 990 1000 1010 1020 1030 CCDS14 IKQY 1040 >>CCDS14153.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1059 aa) initn: 340 init1: 106 opt: 638 Z-score: 586.0 bits: 119.9 E(32554): 2.6e-26 Smith-Waterman score: 764; 26.3% identity (57.6% similar) in 919 aa overlap (41-901:154-1044) 20 30 40 50 60 70 pF1KE3 WGGLLPFGMLCASSTTKCTVSHEVADCSHLKLTQVPDDLPTNITVLNLTHNQLRRLPAAN .: :.:. :: ..: :.: .:.. . . CCDS14 NPGIQSNGLNITDGAFLNLKNLRELLLEDNQLPQIPSGLPESLTELSLIQNNIYNITKEG 130 140 150 160 170 180 80 90 100 110 120 pF1KE3 FTRYSQLTSLDVG----FNTI---SKLEPELCQKLPMLKVLNLQHNELSQLSDKTFAFCT ..: .: .: .. :: . ...: . . : :..:.:. : ::.. : . . CCDS14 ISRLINLKNLYLAWNCYFNKVCEKTNIEDGVFETLTNLELLSLSFNSLSHVPPK---LPS 190 200 210 220 230 240 130 140 150 160 pF1KE3 NLTELHLMSNSIQKIKNNPFVKQKNLITLDLSHN---------------GLSSTKLGTQV .: .: : ...:. :... : :: :::: : : .: .. . CCDS14 SLRKLFLSNTQIKYISEEDFKGLINLTLLDLSGNCPRCFNAPFPCVPCDGGASINID-RF 250 260 270 280 290 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 QLENLQELLLSNNKIQALKSEELDIFAN-SSLKKLELSSNQ-IKEFSPGCFHAI-GRLFG ..:: .: : . .:.. . : : :: :.: : . :.. : : .. :: CCDS14 AFQNLTQLRYLNLSSTSLRKINAAWFKNMPHLKVLDLEFNYLVGEIASGAFLTMLPRLEI 300 310 320 330 340 350 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 LFLNNVQLGPSLTEKLCLELANT---SIRNLSLSNSQLSTTSNTTFLGL-KWTNLTMLDL : :. . : ... . . :.: : : . .. . : : . ::. ..: CCDS14 LDLSFNYIKGSYPQHINISRNFSKLLSLRALHLRGYVFQELREDDFQPLMQLPNLSTINL 360 370 380 390 400 410 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 SYNNLNVVGNDSFAWLPQLEYFFLEYNNIQHLFSHSLHGLFNVRYLNLKRSFTKQ-SISL . : .. . : . .:: ..: : :. : . . .. : ...: . :. : .. CCDS14 GINFIKQIDFKLFQNFSNLEIIYLSENRISPLVKDTRQSYANSS--SFQRHIRKRRSTDF 420 430 440 450 460 470 350 360 370 380 390 pF1KE3 ASLPKIDDFSFQ--WLK--CLEH---LNMEDNDIPGIKSNMFTGLINLKYLSLSNSFTSL :. . . : .: : . :.. :.: : :.: .: .. :.:: . .. CCDS14 EFDPHSNFYHFTRPLIKPQCAAYGKALDLSLNSIFFIGPNQFENLPDIACLNLSAN-SNA 480 490 500 510 520 530 400 410 420 430 440 pF1KE3 RTLTNETFVSLAHSPLHILNLTKNKISKIESDAFSWLGHLEVLDLGLNEIGQELTG---- ..:.. : .. : .. :.::.:... ...:.. :. ::::::. : ...: CCDS14 QVLSGTEFSAIPH--VKYLDLTNNRLDFDNASALTELSDLEVLDLSYNSHYFRIAGVTHH 540 550 560 570 580 590 450 460 470 480 490 500 pF1KE3 -QEWRGLENIFEIYLSYNKYLQLTRNSFALVPSLQRLML---RRVALKNVDSSP--SPFQ . ... :. . ::.:. :: . :: .:.. : : : :.. : :. CCDS14 LEFIQNFTNLKVLNLSHNNIYTLTDKYNLESKSLVELVFSGNRLDILWNDDDNRYISIFK 600 610 620 630 640 650 510 520 530 540 550 560 pF1KE3 PLRNLTILDLSNNNIANINDDMLEGLE-KLEILDLQHNNLARL-WKHANPGGPIYFLKGL :.::: :::: : . .: .. . .: .: : .. : : . : .:. . CCDS14 GLKNLTRLDLSLNRLKHIPNEAFLNLPASLTELHINDNMLKFFNWT---------LLQQF 660 670 680 690 700 570 580 590 600 610 620 pF1KE3 SHLHILNLESNGFDEIPVEVFKDLFE-LKIIDLGLNNLNTLPASVFNNQVSLKSLNLQKN .:..:.:..: . . .. ..:. :. . :. : .. ::.. ... ::: :.:..: CCDS14 PRLELLDLRGNKLLFL-TDSLSDFTSSLRTLLLSHNRISHLPSGFLSEVSSLKHLDLSSN 710 720 730 740 750 760 630 640 650 660 670 pF1KE3 LITSVEKKVF-GPAFRNLTELDMRFNPFDCTCESIAWFVNWINETHTN--IPELSSHYLC :. ...:... . .:. :... :::.:::. :. : :..: : : ::.: . .: CCDS14 LLKTINKSALETKTTTKLSMLELHGNPFECTCD-IGDFRRWMDE-HLNVKIPRLVD-VIC 770 780 790 800 810 820 680 690 700 710 720 730 pF1KE3 NTPPHYHGFPVRLFDTSSCKDSAPFELFFMINTSILLIFIFIVLLIHFEGWRISFYWNVS .: .: . .. ..: ... ..:... : . .. .: :. : . : .:: CCDS14 ASPGDQRGKSIVSLELTTCVSDVTAVILFFFTFFITTMVMLAALAHHLFYWDVWFIYNVC 830 840 850 860 870 880 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 VHRVLGFKEIDRQTEQFEYAAYIIHAYKDK---DWVWEH--FSSMEKEDQSLKFCLEERD . .: :.. .. : : : ::: . :: ::: .. . :..:... .:::::: CCDS14 LAKVKGYRSLS--TSQTFYDAYISYDTKDASVTDWVINELRYHLEESRDKNVLLCLEERD 890 900 910 920 930 800 810 820 830 840 850 pF1KE3 FEAGVFELEAIVNSIKRSRKIIFVITHHLLKDPLCKRFKVHHAVQQAIEQNLDSIILVFL .. :. .. ...::..:.: .::.:.. :. : . :.:. ...:.: ::...: CCDS14 WDPGLAIIDNLMQSINQSKKTVFVLTKKYAKSWNFKT-AFYLALQRLMDENMDVIIFILL 940 950 960 970 980 990 860 870 880 890 900 pF1KE3 EEIPDYKLNHALCLRRGMFKSHCILNWPVQKERIGAFRHKLQVALGSKNSVH : : . .. : ::. . :: ::.:: . . : : . :. .. ..: CCDS14 E--PVLQHSQYLRLRQRICKSS-ILQWPDNPKAEGLFWQTLRNVVLTENDSRYNNMYVDS 1000 1010 1020 1030 1040 1050 CCDS14 IKQY >>CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11 (951 aa) initn: 406 init1: 214 opt: 417 Z-score: 386.6 bits: 82.8 E(32554): 3.3e-15 Smith-Waterman score: 430; 29.4% identity (58.8% similar) in 469 aa overlap (20-482:28-462) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MRQTLPCIYFWGGLLPFGMLCASSTTKCTVSHEVADCSHLKLTQVPDDLPTN :::. . : ...: ::: :: ::. : . CCDS31 MPGPLGLLCFLALGLLGSAGPSGAAPPLCAAPCS-CDGDRRV-DCSGKGLTAVPEGLSAF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 ITVLNLTHNQLRRLPAANFTRYSQLTSLDVGFNTISKLEPELCQKLPMLKVLNLQHNELS .:... :.. .:: : . : :... : .: ..:. . : ::::.::.:.:. CCDS31 TQALDISMNNITQLPEDAFKNFPFLEELQLAGNDLSFIHPKALSGLKELKVLTLQNNQLK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 QLSDKTFAFCTNLTELHLMSNSIQKIKNNPFVKQKNLITLDLSHNGLSSTKLGTQVQLEN . .... . : :.: .: : .. .. : .: : :. :.:. . . .: . CCDS31 TVPSEAIRGLSALQSLRLDANHITSVPEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVHPLSNLPT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 LQELLLSNNKIQALKSEELDIFAN-SSLKKLELSSNQIKEFSPGCFHAIGRLFGLFLNNV :: : :. :::... . :.: ::: :.: .:.:. .: :: .. : : :: CCDS31 LQALTLALNKISSIPDF---AFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLDLNYN 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 QLG--PSLTEKLCLELANTSIRNLSLSNSQLSTTSNTTFLGLKWTNLTMLDLSYNNLNVV .:: :. . : :...:.. ....:. . .: : : . : : :. : CCDS31 NLGEFPQAIKAL------PSLKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPL--LRTIHLYDNPLSFV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 GNDSFAWLPQLEYFFLEYNNIQHLFSHSLHGLFNVRYLNLKRSFTKQSISLASLPKIDDF ::..: : .:. . .. .. . : . : : ... :.: : .:: :.: ... CCDS31 GNSAFHNLSDLHSLVIRGASMVQQFPN-LTGTVHLESLTL----TGTKIS--SIP--NNL 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 SFQWLKCLEHLNMEDNDIPGIKSNMFTGLINLKYLSLS-NSFTSLRTLTNETFVSLAHSP : : :. :.. :.: . : :.: :. .::. :.. ... : . ..:: CCDS31 C-QEQKMLRTLDLSYNNIRDLPS--FNGCHALEEISLQRNQIYQIKEGTFQGLISL---- 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 LHILNLTKNKISKIESDAFSWLGHLEVLDLGLNEIGQELTGQEWRGLENIFEIYLSYNKY .::.:..: : .:.: ::. :: . ::...: :::. .::... .. : : CCDS31 -RILDLSRNLIHEIHSRAFATLGPITNLDVSFN----ELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFK 400 410 420 430 440 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 LQ--LTRNSFALVPSLQRLMLRRVALKNVDSSPSPFQPLRNLTILDLSNNNIANINDDML :. :. ..:. . :: CCDS31 LKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCCAFWGCDSYANLNTEDNSLQDHSVAQEKGTADAANV 450 460 470 480 490 500 >>CCDS3445.1 TLR10 gene_id:81793|Hs108|chr4 (811 aa) initn: 427 init1: 122 opt: 410 Z-score: 381.2 bits: 81.6 E(32554): 6.5e-15 Smith-Waterman score: 555; 24.6% identity (57.0% similar) in 800 aa overlap (127-897:27-775) 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 KLPMLKVLNLQHNELSQLSDKTFAFCTNLTELHLMSN-SIQKIKNNPFVKQKNLITLDLS : .::.: : ..... : ::::: CCDS34 MRLIRNIYIFCSIVMTAEGDAPELPEERELMTNCSNMSLRKVPADLTPATTTLDLS 10 20 30 40 50 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 HNGLSSTKLGTQVQLENLQELLLSNNKIQALKSEELDIFANSSLKKLELSSNQIKEFSPG .: : . . . .. .:. :.: .:.:: : . ... :. :. :.::.:..: . CCDS34 YNLLFQLQSSDFHSVSKLRVLILCHNRIQQLDLKTFEF--NKELRYLDLSNNRLKSVTWY 60 70 80 90 100 110 220 230 240 250 260 pF1KE3 CFHAIGRLFGLFLNNVQLGPSLTEKLCLELANTS-IRNLSLSNSQLSTTS---------N . .. : . : .:. . : .: : .: : .. :.::..... .. : CCDS34 LLAGL-RYLDLSFNDFDTMP-----ICEEAGNMSHLEILGLSGAKIQKSDFQKIAHLHLN 120 130 140 150 160 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 TTFLGLK----WTNLTMLDLSYNNLNVV-GNDSFAWLPQLEYFFLEYNNIQHLFSHSLHG :.:::.. . . .. :. ..:..: :. :. : .. ..: .. . . .. CCDS34 TVFLGFRTLPHYEEGSLPILNTTKLHIVLPMDTNFWV--LLRDGIKTSKILEMTNIDGKS 170 180 190 200 210 220 330 340 350 360 370 pF1KE3 LFNVRYLNLKRSFTKQSISLASLPKID---DFSFQWLKCLEHLNMEDNDIPGIKSNMFTG : .. . :. . . :. : :.: : : :. . : ..: . :.. : : CCDS34 QFVSYEMQRNLSLENAKTSVLLLNKVDLLWDDLFLILQFVWHTSVEHFQ---IRNVTFGG 230 240 250 260 270 280 380 390 400 410 420 430 pF1KE3 LINLKYLSLSNSFTSLRTLTNETFVSLAHSPLHILNLTKNKISKIESDAFSWLGHLEVLD : . :.. : : .:: ..: : .... . ..:: . : .... . CCDS34 KAYLDHNSFDYSNTVMRT------IKLEHVHFRVFYIQQDKI-------YLLLTKMDIEN 290 300 310 320 330 440 450 460 470 480 490 pF1KE3 LGLNEIGQELTGQEWRGLENIFEIYLSY-NKYL--QLTRNSFALVPSLQRLMLRRVALKN : ... .. . . . . :. ::.. :. : .: . .. : : :. :.: :.. CCDS34 LTISN--AQMPHMLFPNYPTKFQ-YLNFANNILTDELFKRTIQL-PHLKTLILNGNKLET 340 350 360 370 380 500 510 520 530 540 550 pF1KE3 VDSSPSPFQPLRNLTILDLSNNNIANINDDMLEGLEKLEILDLQHNNLARLWKHANPGGP . : : : : ::::.: . . ::. : . ..:..:.:. . : CCDS34 L-SLVSCFANNTPLEHLDLSQNLLQHKNDENCSWPETVVNMNLSYNKLSDSVFRCLP--- 390 400 410 420 430 440 560 570 580 590 600 610 pF1KE3 IYFLKGLSHLHILNLESNGFDEIPVEVFKDLFELKIIDLGLNNLNTLPASVFNNQVSLKS . ..::.:..: .. .: :... :. :. .....: :. ::. ...:. CCDS34 -------KSIQILDLNNNQIQTVPKETIH-LMALRELNIAFNFLTDLPGCSHFSRLSV-- 450 460 470 480 490 620 630 640 650 660 670 pF1KE3 LNLQKNLITSVEKKVFGPAFRNLTELDMRFNPFDCTCESIAWFVNWINETHTNIPELSSH ::.. :.: : . : . ... :. ::: :::: . :.. . ... . :. CCDS34 LNIEMNFILS-PSLDFVQSCQEVKTLNAGRNPFRCTCE-LKNFIQLETYSEVMMVGWSDS 500 510 520 530 540 550 680 690 700 710 720 730 pF1KE3 YLCNTPPHYHGFPVRLFDTSSCKDSAPFELFFMINTSILLIFIFIVLL--IHFE-GWRIS : :. : . .: .:: :. . : :... . :.:.. . : . .::. : . CCDS34 YTCEYPLNLRG--TRLKDVHLHELSCNTALLIVTIVVIMLVLGLAVAFCCLHFDLPWYLR 560 570 580 590 600 740 750 760 770 780 pF1KE3 FYWNVSV--HRVLGFKEIDRQTEQ-FEYAAYIIHAYKDKDWVW-EHFSSMEKEDQSLKFC . . . ::: : ..: .. .. :.: .. .:. :: : . ..:::: :. .: CCDS34 MLGQCTQTWHRV--RKTTQEQLKRNVRFHAFISYSEHDSLWVKNELIPNLEKEDGSILIC 610 620 630 640 650 660 790 800 810 820 830 840 pF1KE3 LEERDFEAGVFELEAIVNSIKRSRKIIFVITHHLLKDPLCKRFKVHHAVQQAIEQNLDSI : : :. : : ::. :..: : :::.. ..... :. .. . : .. ...: : : CCDS34 LYESYFDPGKSISENIVSFIEKSYKSIFVLSPNFVQNEWCH-YEFYFAHHNLFHENSDHI 670 680 690 700 710 720 850 860 870 880 890 900 pF1KE3 ILVFLEEIPDYKLNHALCLRRGMFKSHCILNWPVQKERIGAFRHKLQVALGSKNSVH ::..:: :: : . ....... :.:: .... : : .:..:. CCDS34 ILILLEPIPFYCIPTRYHKLKALLEKKAYLEWPKDRRKCGLFWANLRAAINVNVLATREM 730 740 750 760 770 780 CCDS34 YELQTFTELNEESRGSTISLMRTDCL 790 800 810 >>CCDS3784.1 TLR2 gene_id:7097|Hs108|chr4 (784 aa) initn: 346 init1: 137 opt: 404 Z-score: 375.9 bits: 80.6 E(32554): 1.3e-14 Smith-Waterman score: 553; 24.1% identity (57.3% similar) in 804 aa overlap (145-899:21-784) 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 SDKTFAFCTNLTELHLMSNSIQKIKNNPFVKQKNLITLDLSHNGLSSTKLGTQVQL---- ...: .:. ..::. . . :. .. CCDS37 MPHTLWMVWVLGVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGL 10 20 30 40 50 180 190 200 210 220 pF1KE3 -ENLQELLLSNNKIQALKSEELDIFANSSLKKLELSSNQIKEFSPGCFHAIGRLFGLFLN : .. : ::::.: ... .:. .: :. : :.:: :. . : ..: : : :. CCDS37 TEAVKSLDLSNNRITYISNSDLQRCVN--LQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLS 60 70 80 90 100 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 NVQLGPSLTEKLCLELANTSIRNLSLSNSQLSTTSNTTFLGLKWTNLTMLDL-SYNNLNV :. .:. . :.. .. :: :.: . .. : : :.: .: . ...... CCDS37 YNYLS-NLSSSWFKPLSSLTFLNL-LGNPYKTLGETSLFSHL--TKLQILRVGNMDTFTK 110 120 130 140 150 160 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 VGNDSFAWLPQLEYFFLEYNNIQHLFSHSLHGLFNVRYLNLKRS--------FTKQSISL . .:: : :: . .. ...: .::... :: .: :. . :. . :. CCDS37 IQRKDFAGLTFLEELEIDASDLQSYEPKSLKSIQNVSHLILHMKQHILLLEIFVDVTSSV 170 180 190 200 210 220 350 360 370 380 pF1KE3 ASLP----KIDDFSFQWLKCLE-----------HLNMEDNDIPGIKS--NMFTGLINLKY : .: : :. :. : .... :... . . :...::..:.. CCDS37 ECLELRDTDLDTFHFSELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELEF 230 240 250 260 270 280 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 LSLS-NSFTSLRTLTNETFVSLAHSPLHILNLTKNKISKIESDAFSWLGHLEVLDLGLNE . . :. ..:. :. .. : .. .:: .. . : :. : : ... CCDS37 DDCTLNGVGNFRASDNDRVID----PGKVETLTIRRLHIPRFYLFYDLSTLYSLTERVKR 290 300 310 320 330 340 450 460 470 480 490 pF1KE3 IGQE---------LTGQEWRGLENI-FEIYLSYNKYLQLTRNSFALVPSLQRLMLRRVAL : : : .:. ..:: . . : ..::. . : :::: :.::. : CCDS37 ITVENSKVFLVPCLLSQHLKSLEYLDLSENLMVEEYLKNSACEDAW-PSLQTLILRQNHL 350 360 370 380 390 500 510 520 530 540 550 pF1KE3 KNVDSSPSPFQPLRNLTILDLSNNNIANINDDMLEGLEKLEILDLQHNNLARLWKHANPG ..... . :.::: .:.:.:.. .. . . ::.. :.:. . . :. : CCDS37 ASLEKTGETLLTLKNLTNIDISKNSFHSM-PETCQWPEKMKYLNLSSTRI-----HSVTG 400 410 420 430 440 450 560 570 580 590 600 610 pF1KE3 G-PIYFLKGLSHLHILNLESNGFDEIPVEVFKDLFELKIIDLGLNNLNTLP-ASVFNNQV : . :.::.. .:... . . .: .:: . .. :.: ::: ::.. . CCDS37 CIP-------KTLEILDVSNNNLNLFSL----NLPQLKELYISRNKLMTLPDASLLPMLL 460 470 480 490 500 620 630 640 650 660 670 pF1KE3 SLKSLNLQKNLITSVEKKVFGPAFRNLTELDMRFNPFDCTCESIAWFVNWINETHTNIPE :: ...: ::. :. . .:..: :. : : :.:: .. :.. . . . CCDS37 VLK---ISRNAITTFSKEQLD-SFHTLKTLEAGGNNFICSCEFLS-FTQEQQALAKVLID 510 520 530 540 550 680 690 700 710 720 pF1KE3 LSSHYLCNTPPHYHGFPVR--LFDTSSCKDSAPFELFFMINTSILLIFIFIVLLIHFEG- ..:::..: : .: :. ...: :. .: . : . .:::.. :: .:.: CCDS37 WPANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSECHRTA--LVSGMCCALFLLILLTGVLCHRFHGL 560 570 580 590 600 610 730 740 750 760 770 780 pF1KE3 WRISFYWN-VSVHRVLGFKEIDRQTEQFEYAAYIIHAYKDKDWVWE-HFSSMEKEDQSLK : ....: ....: : .... : :.. .. .: :: . . .:. . .: CCDS37 WYMKMMWAWLQAKR----KPRKAPSRNICYDAFVSYSERDAYWVENLMVQELENFNPPFK 620 630 640 650 660 670 790 800 810 820 830 840 pF1KE3 FCLEERDFEAGVFELEAIVNSIKRSRKIIFVITHHLLKDPLCKRFKVHHAVQQAIEQNLD .::..::: : . .. :..::..:.: .::......:. :: ... . . ...: : CCDS37 LCLHKRDFIPGKWIIDNIIDSIEKSHKTVFVLSENFVKSEWCK-YELDFSHFRLFDENND 680 690 700 710 720 730 850 860 870 880 890 900 pF1KE3 SIILVFLEEIPDYKLNHALCLRRGMFKSHCILNWPVQKERIGAFRHKLQVALGSKNSVH . ::..:: : . . .: : ..... :.::... . .: .:..:. : CCDS37 AAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRAAIKS 740 750 760 770 780 >>CCDS33973.1 TLR1 gene_id:7096|Hs108|chr4 (786 aa) initn: 247 init1: 87 opt: 402 Z-score: 374.1 bits: 80.2 E(32554): 1.6e-14 Smith-Waterman score: 500; 23.1% identity (57.9% similar) in 793 aa overlap (144-900:43-779) 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 LSDKTFAFCTNLTELHLMSNSIQKIKNNPFVKQKNLITLDLSHNGLSSTKLGTQVQLENL ..::. : :..:.: .: . ..: .: CCDS33 LILQIRIQLSEESEFLVDRSKNGLIHVPKDLSQKTTI-LNISQNYISELWTSDILSLSKL 20 30 40 50 60 70 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 QELLLSNNKIQALKSEELDIFA-NSSLKKLELSSNQIKEFSPGCFHAIG-RLFGLFLNNV . :..:.:.:: : ....: :. :. :.:: :.. ..: : ... . . : .: CCDS33 RILIISHNRIQYL---DISVFKFNQELEYLDLSHNKLVKIS--CHPTVNLKHLDLSFNAF 80 90 100 110 120 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 QLGPSLTEKLCLELANTS-IRNLSLSNSQLSTTSNTTFLGLKWTNLTMLDLSYNNLNVVG . : .: :..: : .. :.::...: .: : . :. ... .: CCDS33 DALP-----ICKEFGNMSQLKFLGLSTTHLEKSSV----------LPIAHLNISKVLLVL 130 140 150 160 170 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 NDSFAWLPQLEYFFLEYNNIQHLFSHSLHGLFNVRYLNLKRSFTKQSISLASLPKIDDFS ..... . : ..: . ..::: .: . : . : : .:. . .. CCDS33 GETYGEKEDPE-------GLQDFNTESLHIVFPT---NKEFHF----ILDVSVKTVANLE 180 190 200 210 360 370 380 390 400 pF1KE3 FQWLKCLEHLNMEDNDIPGIKSNMFTGLIN--LKYLSLSNSFTSLRTLTNETFVSLAHSP .. .::. .::: . : . : :. :.:.: :. .. . . . :. CCDS33 LSNIKCV----LEDNKCSYFLSILAKLQTNPKLSNLTLNNIETTWNSFI-RILQLVWHTT 220 230 240 250 260 270 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 LHILNLTKNKIS-KIESDAFSWLGHLEVLDLGLNEIGQELTGQEWRGLENIFEIYLSYNK . ..... :.. ... :.. : . :..... ... : . .:: . : CCDS33 VWYFSISNVKLQGQLDFRDFDYSG-TSLKALSIHQVVSDVFGFPQSYIYEIFSNMNIKNF 280 290 300 310 320 330 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 YLQLTRNSFALVPSLQRLMLRRVALKNVDSSPSPFQPLRNLTILD---LSNNNIANIND- .. :: : :: .:. . ..: . . :. .:: :. :. :.. ... CCDS33 TVSGTRMVHMLCPSKISPFLH-LDFSNNLLTDTVFENCGHLTELETLILQMNQLKELSKI 340 350 360 370 380 390 530 540 550 560 pF1KE3 -DMLEGLEKLEILDLQHNNLAR-------LWKHA----NPGGPIY---FLKGLS-HLHIL .: ...:. ::...:... : .. : .. : ... : ....: CCDS33 AEMTTQMKSLQQLDISQNSVSYDEKKGDCSWTKSLLSLNMSSNILTDTIFRCLPPRIKVL 400 410 420 430 440 450 570 580 590 600 610 620 pF1KE3 NLESNGFDEIPVEVFKDLFELKIIDLGLNNLNTLPASVFNNQVSLKSLNLQKNLITSVEK .:.:: . :: .: : : :. .....:.:. ::. .. ::. : ...: .. CCDS33 DLHSNKIKSIPKQVVK-LEALQELNVAFNSLTDLPGC--GSFSSLSVLIIDHNSVSHPSA 460 470 480 490 500 630 640 650 660 670 680 pF1KE3 KVFGPAFRNLTELDMRFNPFDCTCESIAWFVNWINETHTNIPE-LSSHYLCNTPPHYHGF : . ... . :::.:::: .. ::. :... ... : . : :. : :.: CCDS33 DFF-QSCQKMRSIKAGDNPFQCTCE-LGEFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGT 510 520 530 540 550 560 690 700 710 720 730 740 pF1KE3 PVRLFDTS--SCKDSAPFELFFMINTSILLIFIFIVLLIHFEG--W--RISFYWNVSVHR .. : : ::. . :. : ...:.. . .. : . : :. :. . .: CCDS33 LLKDFHMSELSCNITL---LIVTIVATMLVLAVTVTSLCSYLDLPWYLRMVCQWTQTRRR 570 580 590 600 610 620 750 760 770 780 790 pF1KE3 V--LGFKEIDRQTEQFEYAAYIIHAYKDKDWVW-EHFSSMEKEDQSLKFCLEERDFEAGV . . ..:..:. ... :.: .. .:. :: : . ..::: ....::.::.: : CCDS33 ARNIPLEELQRN---LQFHAFISYSGHDSFWVKNELLPNLEKE--GMQICLHERNFVPGK 630 640 650 660 670 800 810 820 830 840 850 pF1KE3 FELEAIVNSIKRSRKIIFVITHHLLKDPLCKRFKVHHAVQQAIEQNLDSIILVFLEEIPD .: :.. :..: : :::.. ..... :. .... : .. .... .:.::..:: ::. CCDS33 SIVENIITCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCH-YELYFAHHNLFHEGSNSLILILLEPIPQ 680 690 700 710 720 730 860 870 880 890 900 pF1KE3 YKLNHALCLRRGMFKSHCILNWPVQKERIGAFRHKLQVALGSKNSVH :.. . .... . :.:: .: . : : .:..:.. : CCDS33 YSIPSSYHKLKSLMARRTYLEWPKEKSKRGLFWANLRAAINIKLTEQAKK 740 750 760 770 780 >>CCDS55602.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1 (642 aa) initn: 189 init1: 87 opt: 351 Z-score: 329.1 bits: 71.6 E(32554): 5.2e-12 Smith-Waterman score: 446; 28.5% identity (55.6% similar) in 586 aa overlap (18-593:91-608) 10 20 30 40 pF1KE3 MRQTLPCIYFWGGLLPFGMLCASSTTKCTVSHE-VADCSHLKLTQVP : .: :. :.: :.::. . : . : CCDS55 RSGGHSLSPEENEFAEEEPVLVLSPEEPGPGPAAVSCPRDCACSQEGVVDCGGIDLREFP 70 80 90 100 110 120 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 DDLPTNITVLNLTHNQLRRLPAANFTRYSQLTSLDVGFNTISKLEPELCQKLPMLKVLNL ::: . . :.: .:::. :. :: ..: :..::: CCDS55 GDLPEHTNHLSLQNNQLE------------------------KIYPEELSRLHRLETLNL 130 140 150 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 QHNELSQ--LSDKTFAFCTNLTELHLMSNSIQKIKNNPFVKQKNLITLDLSHNGLSSTKL :.:.:.. : .:.: :::. :.: .: :. : . ::..:.. : :.. CCDS55 QNNRLTSRGLPEKAFEHLTNLNYLYLANN---KLTLAPRFLPNALISVDFAANYLTKIYG 160 170 180 190 200 210 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 GTQVQLENLQELLLSNNKIQALKSEELDIFANSS-LKKLELSSNQIKEFSPGCFHAIGRL : : ::. . : :::. : . ..: .:: .. : :::: ... : : : CCDS55 LTFGQKPNLRSVYLHNNKL-ADAGLPDNMFNGSSNVEVLILSSNFLRHV-PK--HLPPAL 220 230 240 250 260 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 FGLFLNNVQLGPSLTEKLCLELANTSIRNLSLSNSQLSTTS--NTTFLGLKWTNLTMLDL . : :.: .: .. :: .:.:.: :.:. :. . : :: : ..: .::: CCDS55 YKLHLKNNKL-EKIPPGAFSEL--SSLRELYLQNNYLTDEGLDNETFW--KLSSLEYLDL 270 280 290 300 310 320 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 SYNNLNVVGNDSFAWLPQ-LEYFFLEYNNIQHLFSHSLHGLFNVRYLNLKRSFTKQSISL : :::. : : ::. : . :: : :. . .. : . ...:: :. . ... CCDS55 SSNNLSRVP----AGLPRSLVLLHLEKNAIRSVDANVLTPIRSLEYLLLHSNQLREQ--- 330 340 350 360 370 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 ASLPKIDDFSFQWLKCLEHLNMEDNDIPGIKSNMFTGLINLKYLSLSNSFTSLRTLTNET : ..:: :: :. ... .: . . :.. . .: . : :..:. . : CCDS55 ----GIHPLAFQGLKRLHTVHLYNNALERVPSGLPRRVRTL--MILHNQITG---IGRED 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 pF1KE3 FVSLAHSPLHILNLTKNKIS--KIESDAFSWLGHLEVLDLGLNEIGQELTGQEWRGLENI :.. :. :::. :.:. ... ::: : :. :::. :.. : .:. CCDS55 FATTYF--LEELNLSYNRITSPQVHRDAFRKLRLLRSLDLSGNRLHTLPPGLP----RNV 430 440 450 460 470 480 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 FEIYLSYNKYLQLTRNSFALVPSLQRLMLRRVALKNVDSSPSPFQPLRNLTILDLSNNNI . .. :. :.:.... . .:..:.: :.. .: . : .: .::...:.. CCDS55 HVLKVKRNELAALARGALVGMAQLRELYLTSNRLRSRALGPRAWVDLAHLQLLDIAGNQL 490 500 510 520 530 540 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 ANINDDMLEGL-EKLEILDLQHNNLARLWKHANPGGPIYFLKGLSHLHILNLESNGFDEI ..: ::: :.:: : ::.:... . .: . : :::. .: ... . . CCDS55 TEIP----EGLPESLEYLYLQNNKISAVPANAFDSTPN--LKGI----FLRFNKLAVGSV 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 PVEVFKDLFELKIIDLGLNNLNTLPASVFNNQVSLKSLNLQKNLITSVEKKVFGPAFRNL .:. : .:...:. CCDS55 VDSAFRRLKHLQVLDIEGNLEFGDISKDRGRLGKEKEEEEEEEEEEEETR 600 610 620 630 640 >>CCDS573.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1 (661 aa) initn: 189 init1: 87 opt: 351 Z-score: 329.0 bits: 71.6 E(32554): 5.3e-12 Smith-Waterman score: 446; 28.5% identity (55.6% similar) in 586 aa overlap (18-593:110-627) 10 20 30 40 pF1KE3 MRQTLPCIYFWGGLLPFGMLCASSTTKCTVSHE-VADCSHLKLTQVP : .: :. :.: :.::. . : . : CCDS57 RSGGHSLSPEENEFAEEEPVLVLSPEEPGPGPAAVSCPRDCACSQEGVVDCGGIDLREFP 80 90 100 110 120 130 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 DDLPTNITVLNLTHNQLRRLPAANFTRYSQLTSLDVGFNTISKLEPELCQKLPMLKVLNL ::: . . :.: .:::. :. :: ..: :..::: CCDS57 GDLPEHTNHLSLQNNQLE------------------------KIYPEELSRLHRLETLNL 140 150 160 170 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 QHNELSQ--LSDKTFAFCTNLTELHLMSNSIQKIKNNPFVKQKNLITLDLSHNGLSSTKL :.:.:.. : .:.: :::. :.: .: :. : . ::..:.. : :.. CCDS57 QNNRLTSRGLPEKAFEHLTNLNYLYLANN---KLTLAPRFLPNALISVDFAANYLTKIYG 180 190 200 210 220 230 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 GTQVQLENLQELLLSNNKIQALKSEELDIFANSS-LKKLELSSNQIKEFSPGCFHAIGRL : : ::. . : :::. : . ..: .:: .. : :::: ... : : : CCDS57 LTFGQKPNLRSVYLHNNKL-ADAGLPDNMFNGSSNVEVLILSSNFLRHV-PK--HLPPAL 240 250 260 270 280 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 FGLFLNNVQLGPSLTEKLCLELANTSIRNLSLSNSQLSTTS--NTTFLGLKWTNLTMLDL . : :.: .: .. :: .:.:.: :.:. :. . : :: : ..: .::: CCDS57 YKLHLKNNKL-EKIPPGAFSEL--SSLRELYLQNNYLTDEGLDNETFW--KLSSLEYLDL 290 300 310 320 330 340 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 SYNNLNVVGNDSFAWLPQ-LEYFFLEYNNIQHLFSHSLHGLFNVRYLNLKRSFTKQSISL : :::. : : ::. : . :: : :. . .. : . ...:: :. . ... CCDS57 SSNNLSRVP----AGLPRSLVLLHLEKNAIRSVDANVLTPIRSLEYLLLHSNQLREQ--- 350 360 370 380 390 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 ASLPKIDDFSFQWLKCLEHLNMEDNDIPGIKSNMFTGLINLKYLSLSNSFTSLRTLTNET : ..:: :: :. ... .: . . :.. . .: . : :..:. . : CCDS57 ----GIHPLAFQGLKRLHTVHLYNNALERVPSGLPRRVRTL--MILHNQITG---IGRED 400 410 420 430 440 410 420 430 440 450 pF1KE3 FVSLAHSPLHILNLTKNKIS--KIESDAFSWLGHLEVLDLGLNEIGQELTGQEWRGLENI :.. :. :::. :.:. ... ::: : :. :::. :.. : .:. CCDS57 FATTYF--LEELNLSYNRITSPQVHRDAFRKLRLLRSLDLSGNRLHTLPPGLP----RNV 450 460 470 480 490 500 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 FEIYLSYNKYLQLTRNSFALVPSLQRLMLRRVALKNVDSSPSPFQPLRNLTILDLSNNNI . .. :. :.:.... . .:..:.: :.. .: . : .: .::...:.. CCDS57 HVLKVKRNELAALARGALVGMAQLRELYLTSNRLRSRALGPRAWVDLAHLQLLDIAGNQL 510 520 530 540 550 560 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 ANINDDMLEGL-EKLEILDLQHNNLARLWKHANPGGPIYFLKGLSHLHILNLESNGFDEI ..: ::: :.:: : ::.:... . .: . : :::. .: ... . . CCDS57 TEIP----EGLPESLEYLYLQNNKISAVPANAFDSTPN--LKGI----FLRFNKLAVGSV 570 580 590 600 610 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 PVEVFKDLFELKIIDLGLNNLNTLPASVFNNQVSLKSLNLQKNLITSVEKKVFGPAFRNL .:. : .:...:. CCDS57 VDSAFRRLKHLQVLDIEGNLEFGDISKDRGRLGKEKEEEEEEEEEEEETR 620 630 640 650 660 >>CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523 aa) initn: 558 init1: 252 opt: 347 Z-score: 320.5 bits: 71.3 E(32554): 1.6e-11 Smith-Waterman score: 475; 24.1% identity (54.3% similar) in 698 aa overlap (23-696:279-917) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MRQTLPCIYFWGGLLPFGMLCASSTTKCTVSHEVADCSHLKLTQVPDDLPTN : . :: :....:: : ..: .:: . CCDS43 RGFNVADVQKKEYVCPAPHSEPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGKGLMEIPANLPEG 250 260 270 280 290 300 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 ITVLNLTHNQLRRLPAANFTRYSQLTSLDVGFNTISKLEPELCQKLPMLKVLNLQHNELS :. . : .:... .::. ::.:..: .:.. : :: . :. : : : : : :... CCDS43 IVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKSLTSLVLYGNKIT 310 320 330 340 350 360 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 QLSDKTFAFCTNLTELHLMSNSIQKIKNNPFVKQKNLITLDLSHNGLSSTKLGTQVQLEN .. : ..: : : .:.:. .. : : .:: :.: : :.. . : . :.. CCDS43 EIVKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQTISKGLFAPLQS 370 380 390 400 410 420 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 LQELLLSNNKIQALKSEELDIFANSSLKKLELSSNQIKEFSPGCFHAIGRLFGLFLNNVQ .: : :..: . . . .: .:. :..: :. . : . :: . ..... CCDS43 IQTLHLAQNPF--VCDCHLKWLADY------LQDNPIETSGARC-SSPRRLANKRISQIK 430 440 450 460 470 240 250 260 270 280 pF1KE3 LGPSLTEKL-CLELANTSIRNLSLSNSQLSTTSNTTFLGLK-----WTNLTMLDLSYNNL ..:. : : :.. : :. :. : . :..: : ..: CCDS43 -----SKKFRC-----------SGSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKL 480 490 500 510 520 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 NVVGNDSFAWLPQLEYFFLEYNNIQHLFSHSLHGLFNVRYLNLKRSFTKQSISLASLPKI . . .. .:. :. :... : . :.:. . ::. : ..: .. .. CCDS43 VRIPSHLPEYVTDLR---LNDNEVSVLEAT---GIFK-KLPNLR----KINLSNNKIKEV 530 540 550 560 570 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 DDFSFQWLKCLEHLNMEDNDIPGIKSNMFTGLINLKYLSLSNSFTSLRTLTNETFVSLAH . .:. ...: . :.. ... .: :: .:: : : ... . ..:.::..: CCDS43 REGAFDGAASVQELMLTGNQLETVHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIG--CVSNDTFAGL-- 580 590 600 610 620 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 SPLHILNLTKNKISKIESDAFSWLGHLEVLDLGLNEIGQELTGQEWRGLENIFEIYLSYN : ...:.: :.:. : ::. : : ...: : .. . : : . .: : CCDS43 SSVRLLSLYDNRITTITPGAFTTLVSLSTINLLSNPFNCN-CHLAWLGKWLRKRRIVSGN 630 640 650 660 670 680 470 480 490 500 510 pF1KE3 KYLQLTRNSFAL--VPSLQRLMLRRVALKNVDSSP---SPFQPLRNL---TILDLSNNNI : . : : .: .: . .. . . . : :: : . :.. ::... CCDS43 PRCQ---KPFFLKEIP-IQDVAIQDFTCDGNEESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGL 690 700 710 720 730 740 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 ANINDDMLEGLEKLEILDLQHNNLARLWKHANPGGPIYFLKGLSHLHILNLESNGFDEIP . : . . .: :. :.:. . .. :..: :: ...: .:... . CCDS43 RALPRGMPKDVTELY---LEGNHLTAVPRE---------LSALRHLTLIDLSNNSISMLT 750 760 770 780 790 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 VEVFKDLFELKIIDLGLNNLNTLPASVFNNQVSLKSLNLQKNLITSVEKKVFGPAFRNLT .:... .:. . :. : : .:. .::. ::. :.:. : :.:: . :. . .:. 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