Result of FASTA (omim) for pFN21AE4102
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE4102, 471 aa
  1>>>pF1KE4102 471 - 471 aa - 471 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9160+/-0.000534; mu= 11.9037+/- 0.033
 mean_var=202.0236+/-44.617, 0's: 0 Z-trim(114.2): 274  B-trim: 1085 in 2/52
 Lambda= 0.090235
 statistics sampled from 23627 (23982) to 23627 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.64), E-opt: 0.2 (0.281), width:  16
 Scan time:  8.450

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_742013 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein liga ( 488) 1325 185.8 2.2e-46
NP_660215 (OMIM: 607868) E3 ubiquitin-protein liga ( 468)  976 140.4   1e-32
NP_003132 (OMIM: 109092) E3 ubiquitin-protein liga ( 475)  937 135.3 3.5e-31
NP_060543 (OMIM: 613184) E3 ubiquitin-protein liga ( 485)  866 126.1 2.2e-28
XP_011542512 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477)  863 125.7 2.8e-28
NP_001020111 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein l ( 477)  863 125.7 2.8e-28
XP_006711842 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477)  863 125.7 2.8e-28
XP_011542511 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477)  863 125.7 2.8e-28
NP_057186 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein liga ( 477)  863 125.7 2.8e-28
XP_011542513 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 450)  763 112.6 2.2e-24
XP_016857901 (OMIM: 607868) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 467)  749 110.8 8.1e-24
NP_477514 (OMIM: 607564) tripartite motif-containi ( 488)  680 101.9 4.2e-21
NP_001003818 (OMIM: 607564) tripartite motif-conta ( 516)  680 101.9 4.4e-21
NP_892030 (OMIM: 616017) E3 ubiquitin-protein liga ( 500)  677 101.5 5.6e-21
NP_001003827 (OMIM: 605684) tripartite motif-conta ( 488)  664 99.8 1.8e-20
NP_067629 (OMIM: 605684) tripartite motif-containi ( 488)  664 99.8 1.8e-20
NP_291027 (OMIM: 610530) E3 ubiquitin-protein liga ( 630)  652 98.4 6.2e-20
NP_060677 (OMIM: 616755) E3 ubiquitin-protein liga ( 475)  648 97.7 7.4e-20
XP_016857118 (OMIM: 616755) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 555)  647 97.6   9e-20
XP_006714995 (OMIM: 610530) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 520)  637 96.3 2.1e-19
XP_006714992 (OMIM: 610530) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 543)  637 96.3 2.2e-19
NP_065091 (OMIM: 606124) tripartite motif-containi ( 452)  632 95.6 3.1e-19
NP_963921 (OMIM: 610530) E3 ubiquitin-protein liga ( 518)  613 93.2 1.8e-18
XP_006714993 (OMIM: 610530) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 541)  613 93.2 1.9e-18
XP_011514091 (OMIM: 612548) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 486)  612 93.0 1.9e-18
NP_001268379 (OMIM: 612548) E3 ubiquitin-protein l ( 486)  612 93.0 1.9e-18
NP_001268380 (OMIM: 612548) E3 ubiquitin-protein l ( 487)  612 93.0 1.9e-18
NP_835226 (OMIM: 612548) E3 ubiquitin-protein liga ( 487)  612 93.0 1.9e-18
NP_006065 (OMIM: 606559) E3 ubiquitin-protein liga ( 498)  608 92.5 2.8e-18
NP_001008275 (OMIM: 613288) tripartite motif-conta ( 477)  606 92.2 3.3e-18
XP_006714994 (OMIM: 610530) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 525)  602 91.8   5e-18
NP_067076 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein liga ( 518)  599 91.4 6.5e-18
NP_001186502 (OMIM: 606559) E3 ubiquitin-protein l ( 494)  597 91.1 7.6e-18
NP_001128327 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein l ( 343)  547 84.4 5.5e-16
NP_741983 (OMIM: 617007) tripartite motif-containi ( 493)  541 83.8 1.2e-15
XP_016856908 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 262)  528 81.7 2.6e-15
XP_016856907 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 262)  528 81.7 2.6e-15
NP_439893 (OMIM: 605701) tripartite motif-containi ( 395)  529 82.1 3.1e-15
NP_006769 (OMIM: 605701) tripartite motif-containi ( 481)  529 82.2 3.5e-15
XP_016866752 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite  ( 462)  527 81.9   4e-15
XP_011513161 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite  ( 462)  527 81.9   4e-15
NP_001723 (OMIM: 601610) butyrophilin subfamily 1  ( 526)  509 79.7 2.2e-14
XP_005249397 (OMIM: 601610) PREDICTED: butyrophili ( 626)  509 79.7 2.5e-14
NP_569074 (OMIM: 605684) tripartite motif-containi ( 270)  499 78.0 3.6e-14
NP_149023 (OMIM: 608487) tripartite motif-containi ( 493)  503 78.8 3.7e-14
XP_005253240 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite  ( 493)  503 78.8 3.7e-14
NP_000234 (OMIM: 134610,249100,608107) pyrin isofo ( 781)  506 79.5 3.7e-14
XP_016878725 (OMIM: 134610,249100,608107) PREDICTE ( 780)  501 78.8 5.8e-14
XP_005249435 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite  ( 539)  491 77.3 1.1e-13
NP_003440 (OMIM: 600830) tripartite motif-containi ( 539)  491 77.3 1.1e-13


>>NP_742013 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein ligase T  (488 aa)
 initn: 1195 init1: 651 opt: 1325  Z-score: 953.6  bits: 185.8 E(85289): 2.2e-46
Smith-Waterman score: 1325; 43.1% identity (70.6% similar) in 473 aa overlap (6-470:19-488)

                            10        20        30        40       
pF1KE4              MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSWKDL
                         :: ::: :.:: .::::::.:: :.::::::..:..  :.::
NP_742 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
               10        20        30        40        50        60

        50        60        70        80        90       100       
pF1KE4 DDTFPCPVCRFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLF
       .  :::::::    :.:.: : :: ...:::::::   . ... .....: .:.. :.::
NP_742 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQ---AVKRKIRDESLCPQHHEALSLF
               70        80        90          100       110       

       110       120       130       140       150       160       
pF1KE4 CVKDLEILCTQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGS
       : .: : .:  :..:  :. : . :.  :.. ..: :.  ::::....... .    . .
NP_742 CYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEK
       120       130       140       150       160       170       

       170       180       190       200       210       220       
pF1KE4 KSVELKKKVEYKREEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYV
       :  :::. :: .:..:  :::...  :..::...: ....::..:: .: :: ..:.:  
NP_742 KPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKR
       180       190       200       210       220       230       

       230       240       250       260         270       280     
pF1KE4 STLKHLLREVEGKSVQSNLELLTQAKSMHHKYQNLKCPEL--FSFRLTKYGFSLPPQYSG
         : ::  ::::: .::..:.: ..::  .: ...:  :.   :..: :   ..: :: .
NP_742 RDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFA
       240       250       260       270       280       290       

         290       300       310        320       330       340    
pF1KE4 LDRIIKPFQVDVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRY-ERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQR
       : .:.: . .:: :: .::::.:..:::::.:.. : . :..   ::::   : ::... 
NP_742 LRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEG
       300       310       320       330       340       350       

          350       360       370       380       390       400    
pF1KE4 FSSGRHYWEVEVGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTT
       :.:::::::::::.: .: .:::.: . :. .  :    :.: .  .  . :.:.    :
NP_742 FTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFT
       360       370       380       390       400       410       

          410       420       430       440       450              
pF1KE4 QLLPVVKPSKIGIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDCFTEAVWPYFYTGT-----DSE
        :   :::...::::::: : :::::..::: .:::.: ::: .:: :: :      .. 
NP_742 PLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDTFTEKLWPLFYPGIRAGRKNAA
       420       430       440       450       460       470       

     460       470 
pF1KE4 PLKICSVSDSER
       :: :   .: : 
NP_742 PLTIRPPTDWE 
       480         

>>NP_660215 (OMIM: 607868) E3 ubiquitin-protein ligase T  (468 aa)
 initn: 918 init1: 322 opt: 976  Z-score: 708.3  bits: 140.4 E(85289): 1e-32
Smith-Waterman score: 976; 35.6% identity (63.5% similar) in 463 aa overlap (9-464:9-455)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSWKDLDDTFPCPVCRFCF
               :::::..: :::.:. :::  .::::::: :.   : . .  . :: ::   
NP_660 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPYACPECRELS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 PYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKDLEILCTQCS
       : ...: :  : ...:.:     :: .      ...:  : . :. ::  .:..::. : 
NP_660 PQRNLRPNRPLAKMAEMA-----RRLHPPSPVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAACE
               70             80        90       100       110     

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 FSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVELKKKVEYKR
        : .:  : . :.. ::   .  :: ::: ::.... .           :  .: :: .:
NP_660 RSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQR
         120       130       140       150       160       170     

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 EEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLKHLLREVEGK
       ... .:::..: .: .:....:.....::...: .: :. ..:..  . : .:. :.::.
NP_660 QNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEGR
         180       190       200       210       220       230     

              250       260         270       280       290        
pF1KE4 SVQSNLELLTQAKSMHHKYQNLKC--PELFSFRLTKYGFSLPPQYSGLDRIIKPFQVDVI
            : :: . :.  .. :..:   ::.  ..: .    .:    :: . .. :. :: 
NP_660 CQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMEL-RTVCRVP----GLVETLRRFRGDVT
         240       250       260        270           280       290

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE4 LDLNTAHPQLLVSEDRKAVRYERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQRFSSGRHYWEVEVGN
       :: .::.:.:..::::..:.    .. .  .:.::   : :::..::.:::::::::::.
NP_660 LDPDTANPELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGD
              300       310       320       330       340       350

      360       370       380          390       400       410     
pF1KE4 KPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAI---GRYMKSGYVASGPKTTQLLPVVKPSKI
       . .: ::::.. . :. . . :. .::: .   : :..:.  : .:      :   : ..
NP_660 RTSWALGVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVFLGSYYNSSERALAPLRD---P---PRRV
              360       370       380       390          400       

         420       430       440        450        460       470   
pF1KE4 GIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDC-FTEAVWPYFYTGTDSE-PLKICSVSDSER  
       ::::::: : ::::. .: :.:. : .  :. .. : :   ..:  :. ::         
NP_660 GIFLDYEAGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPTPMTICRPKGGSGDT
          410       420       430       440       450       460    

NP_660 LAPQ
           

>>NP_003132 (OMIM: 109092) E3 ubiquitin-protein ligase T  (475 aa)
 initn: 870 init1: 406 opt: 937  Z-score: 680.8  bits: 135.3 E(85289): 3.5e-31
Smith-Waterman score: 937; 35.7% identity (64.5% similar) in 476 aa overlap (1-467:1-466)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSWKDLDDTFPCPVCRFCF
       :  .. :. . :: .:::::. . .::.:.:::.::. :.:   :   ..  :::::  :
NP_003 MASAARLTMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQECISQVGKGGGSV--CPVCRQRF
               10        20        30        40        50          

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 PYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKDLEILCTQCS
         :..: : :: :...  :... .....  : :   :  :.. : ::: :: . ::  :.
NP_003 LLKNLRPNRQLANMVNNLKEIS-QEAREGTQGER--CAVHGERLHLFCEKDGKALCWVCA
       60        70        80         90         100       110     

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 FSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVELKKKVEYKR
        : ::. : . :...::. ..: :. .:  :: . : .::. .  . : .. :: :: ..
NP_003 QSRKHRDHAMVPLEEAAQEYQEKLQVALGELRRKQELAEKLEVEIAIKRADWKKTVETQK
         120       130       140       150       160       170     

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 EEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLKHLLREVEGK
        .:..:: : . :: .:..  :.... .: . :  :.:. ..:..  ..:..:. :.. .
NP_003 SRIHAEFVQQKNFLVEEEQRQLQELEKDEREQLRILGEKEAKLAQQSQALQELISELDRR
         180       190       200       210       220       230     

              250       260         270       280       290        
pF1KE4 SVQSNLELLTQAKSMHHKYQ--NLKCPELFSFRLTKYGFSLPPQYSGLDRIIKPFQVDVI
         .: :::: ..  . .. .  :::  .. : .: .    .:    :: ....   : . 
NP_003 CHSSALELLQEVIIVLERSESWNLKDLDITSPELRSV-CHVP----GLKKMLRTCAVHIT
         240       250       260       270            280       290

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE4 LDLNTAHPQLLVSEDRKAVRYERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQRFSSGRHYWEVEVGN
       :: .::.: :..::::. ::    ...:  . .::   : :::.:.: ::.:::::.: .
NP_003 LDPDTANPWLILSEDRRQVRLGDTQQSIPGNEERFDSYPMVLGAQHFHSGKHYWEVDVTG
              300       310       320       330       340       350

      360       370       380       390       400       410        
pF1KE4 KPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTTQLLPVVKPSKIGIF
       :  : ::::.: . :. .   :  .:::.:  . :. : :.    : :   : : ..:::
NP_003 KEAWDLGVCRDSVRRKGHFLLSSKSGFWTIWLWNKQKYEAGTYPQTPLHLQVPPCQVGIF
              360       370       380       390       400       410

      420       430        440        450            460       470 
pF1KE4 LDYELGDLSFYNMNDR-SILYTFNDC-FTEAVWPYFYTG-----TDSEPLKICSVSDSER
       :::: : .::::..:. :..:.:..: ::  . :.:  :      .. :: .: ..    
NP_003 LDYEAGMVSFYNITDHGSLIYSFSECAFTGPLRPFFSPGFNDGGKNTAPLTLCPLNIGSQ
              420       430       440       450       460       470

NP_003 GSTDY
            

>>NP_060543 (OMIM: 613184) E3 ubiquitin-protein ligase T  (485 aa)
 initn: 845 init1: 402 opt: 866  Z-score: 630.7  bits: 126.1 E(85289): 2.2e-28
Smith-Waterman score: 872; 34.6% identity (62.7% similar) in 491 aa overlap (5-470:4-484)

                10        20        30        40        50         
pF1KE4 MEFVTALVN-LQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSWKDLDDT----FPCPV
           ::::. . :: .::::. .:..:..:.:::.::.::::  :.   ..    . ::.
NP_060  MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIPGESQNWGYTCPL
                10        20        30        40        50         

          60        70        80        90       100       110     
pF1KE4 CRFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKDLEIL
       ::     ...: : :: :..: .. :... .   .   . .::.:.. : .:: .:. :.
NP_060 CRAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLK---GDLCERHGEKLKMFCKEDVLIM
      60        70        80        90          100       110      

         120       130       140       150       160       170     
pF1KE4 CTQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVELKKK
       :  :: : .:. : . :.. .:  ..  :. .:: :... :.. :. . . ....  : .
NP_060 CEACSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGERKRTATWKIQ
        120       130       140       150       160       170      

         180       190                 200       210       220     
pF1KE4 VEYKREEINSEFEQIRLFLQNEQE----------MILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSD
       :: ... :  :::. . .:...:             : ..: :  . . ::. :  :: .
NP_060 VETRKQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKLELNHSELIQ
        180       190       200       210       220       230      

         230       240       250         260       270       280   
pF1KE4 YVSTLKHLLREVEGKSVQSNLELLTQAKSM--HHKYQNLKCPELFSFRLTKYGFSLPPQY
         ..: ... :.. .: .    .: . . .  . :  .:. :: .:..:      :    
NP_060 QSQVLWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKTDCRVL----
        240       250       260       270       280       290      

           290       300       310       320       330       340   
pF1KE4 SGLDRIIKPFQVDVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRYERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQ
        :: .:.: . .:: :: .::. .:.:::::: :.:   ....  .:.:::    :::::
NP_060 -GLREILKTYAADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQKLPDNPERFYRYNIVLGSQ
             300       310       320       330       340       350 

           350       360       370       380       390       400   
pF1KE4 RFSSGRHYWEVEVGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKT
        .::::::::::::.. .: ::::.. . :.     :   :::.: :  :..   .:   
NP_060 CISSGRHYWEVEVGDRSEWGLGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVI-RLRKGNEYRAGTDE
             360       370       380       390        400       410

            410       420       430        440        450          
pF1KE4 TQLLPV-VKPSKIGIFLDYELGDLSFYNMND-RSILYTFNDC-FTEAVWPYF---YT-GT
         .: . : : ..:::.:::  :.::::..:  : ..::    :   . :::   :. ::
NP_060 YPILSLPVPPRRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPYFSPCYSIGT
              420       430       440       450       460       470

         460       470 
pF1KE4 D-SEPLKICSVSDSER
       . . :: :::. :.: 
NP_060 NNTAPLAICSL-DGED
              480      

>>XP_011542512 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr  (477 aa)
 initn: 734 init1: 294 opt: 863  Z-score: 628.7  bits: 125.7 E(85289): 2.8e-28
Smith-Waterman score: 863; 32.2% identity (61.4% similar) in 485 aa overlap (1-467:1-472)

               10        20        30        40                 50 
pF1KE4 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSW---------KDLDDTF
       :: :    .::::..: :::.:. :::  .:::::::.:...::         .    .:
XP_011 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF
               10        20        30        40        50        60

              60        70        80        90       100       110 
pF1KE4 PCPVCRFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKD
       ::: ::   : ...  :  : ...:.:.:      .   ::.. .:..:.. : ::: ::
XP_011 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ------HPGLQKQD-LCQEHHEPLKLFCQKD
               70        80              90        100       110   

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE4 LEILCTQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVE
          .:. :  : .:. : . : ..:.. ..  :: ..: ::..: :. ..   . .. .:
XP_011 QSPICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAE
           120       130       140       150       160       170   

             180       190       200       210       220       230 
pF1KE4 LKKKVEYKREEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLK
        . ::. .::.:  :::.. :.: .:.. .:. .. :: .  ..: :... :.    .:.
XP_011 WQGKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLE
           180       190       200       210       220       230   

             240       250       260         270       280         
pF1KE4 HLLREVEGKSVQSNLELLTQAKSMHHKYQNL--KCPELFSFRLTKYGFSLPPQYSGLDRI
        :: ..: .:.:. :..: . :    . .:.  .:::.      .    .: :     ..
XP_011 LLLLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQI----EV
           240       250       260       270       280             

     290       300       310          320       330       340      
pF1KE4 IKPFQVDVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRY---ERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQRFS
       .. :  ::. : ..:.: ::. :.:.  ::     .  ..: .  :: . : ..:.  ::
XP_011 LRGFLEDVVPDATSAYPYLLLYESRQR-RYLGSSPEGSGFC-SKDRFVAYPCAVGQTAFS
     290       300       310        320        330       340       

        350         360       370       380       390       400    
pF1KE4 SGRHYWEV--EVGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTT
       ::::::::  .. .   : ::::.: . :. .      .:::..     . :...    :
XP_011 SGRHYWEVGMNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLSTFSALT
       350       360       370       380       390       400       

          410       420       430       440        450        460  
pF1KE4 QLLPVVKPSKIGIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDC-FTEAVWPYFYTGTD-SEPLK
        .. .  ::..:::::.: :..:::...: : :.:...  :   . :.:  :.  :  . 
XP_011 PVMLMEPPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCLGAPKSGQMV
       410       420       430       440       450       460       

            470  
pF1KE4 ICSVSDSER 
       : .:.     
XP_011 ISTVTMWVKG
       470       

>>NP_001020111 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein ligas  (477 aa)
 initn: 734 init1: 294 opt: 863  Z-score: 628.7  bits: 125.7 E(85289): 2.8e-28
Smith-Waterman score: 863; 32.2% identity (61.4% similar) in 485 aa overlap (1-467:1-472)

               10        20        30        40                 50 
pF1KE4 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSW---------KDLDDTF
       :: :    .::::..: :::.:. :::  .:::::::.:...::         .    .:
NP_001 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF
               10        20        30        40        50        60

              60        70        80        90       100       110 
pF1KE4 PCPVCRFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKD
       ::: ::   : ...  :  : ...:.:.:      .   ::.. .:..:.. : ::: ::
NP_001 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ------HPGLQKQD-LCQEHHEPLKLFCQKD
               70        80              90        100       110   

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE4 LEILCTQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVE
          .:. :  : .:. : . : ..:.. ..  :: ..: ::..: :. ..   . .. .:
NP_001 QSPICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAE
           120       130       140       150       160       170   

             180       190       200       210       220       230 
pF1KE4 LKKKVEYKREEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLK
        . ::. .::.:  :::.. :.: .:.. .:. .. :: .  ..: :... :.    .:.
NP_001 WQGKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLE
           180       190       200       210       220       230   

             240       250       260         270       280         
pF1KE4 HLLREVEGKSVQSNLELLTQAKSMHHKYQNL--KCPELFSFRLTKYGFSLPPQYSGLDRI
        :: ..: .:.:. :..: . :    . .:.  .:::.      .    .: :     ..
NP_001 LLLLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQI----EV
           240       250       260       270       280             

     290       300       310          320       330       340      
pF1KE4 IKPFQVDVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRY---ERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQRFS
       .. :  ::. : ..:.: ::. :.:.  ::     .  ..: .  :: . : ..:.  ::
NP_001 LRGFLEDVVPDATSAYPYLLLYESRQR-RYLGSSPEGSGFC-SKDRFVAYPCAVGQTAFS
     290       300       310        320        330       340       

        350         360       370       380       390       400    
pF1KE4 SGRHYWEV--EVGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTT
       ::::::::  .. .   : ::::.: . :. .      .:::..     . :...    :
NP_001 SGRHYWEVGMNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLSTFSALT
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pF1KE4 QLLPVVKPSKIGIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDC-FTEAVWPYFYTGTD-SEPLK
        .. .  ::..:::::.: :..:::...: : :.:...  :   . :.:  :.  :  . 
NP_001 PVMLMEPPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCLGAPKSGQMV
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            470  
pF1KE4 ICSVSDSER 
       : .:.     
NP_001 ISTVTMWVKG
       470       

>>XP_006711842 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr  (477 aa)
 initn: 734 init1: 294 opt: 863  Z-score: 628.7  bits: 125.7 E(85289): 2.8e-28
Smith-Waterman score: 863; 32.2% identity (61.4% similar) in 485 aa overlap (1-467:1-472)

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pF1KE4 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSW---------KDLDDTF
       :: :    .::::..: :::.:. :::  .:::::::.:...::         .    .:
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               10        20        30        40        50        60

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pF1KE4 PCPVCRFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKD
       ::: ::   : ...  :  : ...:.:.:      .   ::.. .:..:.. : ::: ::
XP_006 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ------HPGLQKQD-LCQEHHEPLKLFCQKD
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pF1KE4 LEILCTQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVE
          .:. :  : .:. : . : ..:.. ..  :: ..: ::..: :. ..   . .. .:
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pF1KE4 LKKKVEYKREEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLK
        . ::. .::.:  :::.. :.: .:.. .:. .. :: .  ..: :... :.    .:.
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pF1KE4 HLLREVEGKSVQSNLELLTQAKSMHHKYQNL--KCPELFSFRLTKYGFSLPPQYSGLDRI
        :: ..: .:.:. :..: . :    . .:.  .:::.      .    .: :     ..
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       .. :  ::. : ..:.: ::. :.:.  ::     .  ..: .  :: . : ..:.  ::
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pF1KE4 SGRHYWEV--EVGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTT
       ::::::::  .. .   : ::::.: . :. .      .:::..     . :...    :
XP_006 SGRHYWEVGMNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLSTFSALT
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pF1KE4 QLLPVVKPSKIGIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDC-FTEAVWPYFYTGTD-SEPLK
        .. .  ::..:::::.: :..:::...: : :.:...  :   . :.:  :.  :  . 
XP_006 PVMLMEPPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCLGAPKSGQMV
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            470  
pF1KE4 ICSVSDSER 
       : .:.     
XP_006 ISTVTMWVKG
       470       

>>XP_011542511 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr  (477 aa)
 initn: 734 init1: 294 opt: 863  Z-score: 628.7  bits: 125.7 E(85289): 2.8e-28
Smith-Waterman score: 863; 32.2% identity (61.4% similar) in 485 aa overlap (1-467:1-472)

               10        20        30        40                 50 
pF1KE4 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSW---------KDLDDTF
       :: :    .::::..: :::.:. :::  .:::::::.:...::         .    .:
XP_011 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF
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pF1KE4 PCPVCRFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKD
       ::: ::   : ...  :  : ...:.:.:      .   ::.. .:..:.. : ::: ::
XP_011 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ------HPGLQKQD-LCQEHHEPLKLFCQKD
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pF1KE4 LEILCTQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVE
          .:. :  : .:. : . : ..:.. ..  :: ..: ::..: :. ..   . .. .:
XP_011 QSPICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAE
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pF1KE4 LKKKVEYKREEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLK
        . ::. .::.:  :::.. :.: .:.. .:. .. :: .  ..: :... :.    .:.
XP_011 WQGKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLE
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pF1KE4 HLLREVEGKSVQSNLELLTQAKSMHHKYQNL--KCPELFSFRLTKYGFSLPPQYSGLDRI
        :: ..: .:.:. :..: . :    . .:.  .:::.      .    .: :     ..
XP_011 LLLLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQI----EV
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pF1KE4 IKPFQVDVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRY---ERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQRFS
       .. :  ::. : ..:.: ::. :.:.  ::     .  ..: .  :: . : ..:.  ::
XP_011 LRGFLEDVVPDATSAYPYLLLYESRQR-RYLGSSPEGSGFC-SKDRFVAYPCAVGQTAFS
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pF1KE4 SGRHYWEV--EVGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTT
       ::::::::  .. .   : ::::.: . :. .      .:::..     . :...    :
XP_011 SGRHYWEVGMNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLSTFSALT
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pF1KE4 QLLPVVKPSKIGIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDC-FTEAVWPYFYTGTD-SEPLK
        .. .  ::..:::::.: :..:::...: : :.:...  :   . :.:  :.  :  . 
XP_011 PVMLMEPPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCLGAPKSGQMV
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            470  
pF1KE4 ICSVSDSER 
       : .:.     
XP_011 ISTVTMWVKG
       470       

>>NP_057186 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein ligase T  (477 aa)
 initn: 734 init1: 294 opt: 863  Z-score: 628.7  bits: 125.7 E(85289): 2.8e-28
Smith-Waterman score: 863; 32.2% identity (61.4% similar) in 485 aa overlap (1-467:1-472)

               10        20        30        40                 50 
pF1KE4 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSW---------KDLDDTF
       :: :    .::::..: :::.:. :::  .:::::::.:...::         .    .:
NP_057 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF
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pF1KE4 PCPVCRFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKD
       ::: ::   : ...  :  : ...:.:.:      .   ::.. .:..:.. : ::: ::
NP_057 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ------HPGLQKQD-LCQEHHEPLKLFCQKD
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pF1KE4 LEILCTQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVE
          .:. :  : .:. : . : ..:.. ..  :: ..: ::..: :. ..   . .. .:
NP_057 QSPICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAE
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pF1KE4 LKKKVEYKREEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLK
        . ::. .::.:  :::.. :.: .:.. .:. .. :: .  ..: :... :.    .:.
NP_057 WQGKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLE
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pF1KE4 HLLREVEGKSVQSNLELLTQAKSMHHKYQNL--KCPELFSFRLTKYGFSLPPQYSGLDRI
        :: ..: .:.:. :..: . :    . .:.  .:::.      .    .: :     ..
NP_057 LLLLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQI----EV
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pF1KE4 IKPFQVDVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRY---ERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQRFS
       .. :  ::. : ..:.: ::. :.:.  ::     .  ..: .  :: . : ..:.  ::
NP_057 LRGFLEDVVPDATSAYPYLLLYESRQR-RYLGSSPEGSGFC-SKDRFVAYPCAVGQTAFS
     290       300       310        320        330       340       

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pF1KE4 SGRHYWEV--EVGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTT
       ::::::::  .. .   : ::::.: . :. .      .:::..     . :...    :
NP_057 SGRHYWEVGMNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLSTFSALT
       350       360       370       380       390       400       

          410       420       430       440        450        460  
pF1KE4 QLLPVVKPSKIGIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDC-FTEAVWPYFYTGTD-SEPLK
        .. .  ::..:::::.: :..:::...: : :.:...  :   . :.:  :.  :  . 
NP_057 PVMLMEPPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCLGAPKSGQMV
       410       420       430       440       450       460       

            470  
pF1KE4 ICSVSDSER 
       : .:.     
NP_057 ISTVTMWVKG
       470       

>>XP_011542513 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr  (450 aa)
 initn: 634 init1: 294 opt: 763  Z-score: 558.6  bits: 112.6 E(85289): 2.2e-24
Smith-Waterman score: 763; 31.0% identity (60.9% similar) in 455 aa overlap (31-467:4-445)

               10        20        30        40                 50 
pF1KE4 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSW---------KDLDDTF
                                     :::::::.:...::         .    .:
XP_011                            MTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF
                                          10        20        30   

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pF1KE4 PCPVCRFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKD
       ::: ::   : ...  :  : ...:.:.:      .   ::.. .:..:.. : ::: ::
XP_011 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ------HPGLQKQD-LCQEHHEPLKLFCQKD
            40        50        60              70         80      

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE4 LEILCTQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVE
          .:. :  : .:. : . : ..:.. ..  :: ..: ::..: :. ..   . .. .:
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