FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4102, 471 aa 1>>>pF1KE4102 471 - 471 aa - 471 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3420+/-0.00128; mu= 9.1179+/- 0.076 mean_var=180.7981+/-38.088, 0's: 0 Z-trim(107.1): 159 B-trim: 353 in 1/51 Lambda= 0.095384 statistics sampled from 9198 (9377) to 9198 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.288), width: 16 Scan time: 2.050 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 ( 471) 3222 456.3 3.2e-128 CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 488) 1325 195.3 1.2e-49 CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6 ( 503) 1000 150.6 3.7e-36 CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 ( 468) 976 147.2 3.5e-35 CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1 ( 486) 947 143.2 5.6e-34 CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 ( 475) 937 141.9 1.4e-33 CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11 ( 485) 866 132.1 1.3e-30 CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 477) 863 131.7 1.7e-30 CCDS34093.1 TRIM61 gene_id:391712|Hs108|chr4 ( 209) 828 126.5 2.7e-29 CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 ( 465) 733 113.8 4e-25 CCDS31390.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 488) 680 106.5 6.5e-23 CCDS31389.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 516) 680 106.5 6.8e-23 CCDS32220.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 500) 677 106.1 8.8e-23 CCDS31391.1 TRIM34 gene_id:53840|Hs108|chr11 ( 488) 664 104.3 3e-22 CCDS31388.1 TRIM34 gene_id:445372|Hs108|chr11 ( 842) 664 104.5 4.4e-22 CCDS4466.1 TRIM41 gene_id:90933|Hs108|chr5 ( 630) 652 102.8 1.1e-21 CCDS55762.1 TRIM49B gene_id:283116|Hs108|chr11 ( 452) 648 102.1 1.3e-21 CCDS376.1 TRIM62 gene_id:55223|Hs108|chr1 ( 475) 648 102.1 1.3e-21 CCDS60930.1 TRIM49D1 gene_id:399939|Hs108|chr11 ( 452) 644 101.5 1.9e-21 CCDS73363.1 TRIM64 gene_id:120146|Hs108|chr11 ( 449) 642 101.2 2.3e-21 CCDS53693.1 TRIM64B gene_id:642446|Hs108|chr11 ( 449) 634 100.1 4.9e-21 CCDS8287.1 TRIM49 gene_id:57093|Hs108|chr11 ( 452) 632 99.9 6e-21 CCDS53694.1 TRIM49C gene_id:642612|Hs108|chr11 ( 452) 630 99.6 7.3e-21 CCDS73287.1 TRIM64C gene_id:646754|Hs108|chr11 ( 450) 612 97.1 4e-20 CCDS4465.1 TRIM41 gene_id:90933|Hs108|chr5 ( 518) 613 97.3 4e-20 CCDS34654.1 TRIM50 gene_id:135892|Hs108|chr7 ( 487) 612 97.1 4.3e-20 CCDS5678.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7 ( 474) 610 96.9 5.1e-20 CCDS41612.1 TRIM22 gene_id:10346|Hs108|chr11 ( 498) 608 96.6 6.3e-20 CCDS32437.1 TRIM72 gene_id:493829|Hs108|chr16 ( 477) 606 96.3 7.4e-20 CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4 ( 468) 599 95.3 1.4e-19 CCDS34377.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 518) 599 95.4 1.5e-19 CCDS44327.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 343) 547 88.1 1.6e-17 CCDS6056.2 TRIM35 gene_id:23087|Hs108|chr8 ( 493) 541 87.4 3.8e-17 CCDS4676.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 395) 529 85.6 1e-16 CCDS34375.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 481) 529 85.7 1.2e-16 CCDS60929.1 TRIM77 gene_id:390231|Hs108|chr11 ( 450) 510 83.1 6.8e-16 CCDS4614.1 BTN1A1 gene_id:696|Hs108|chr6 ( 526) 509 83.0 8.3e-16 CCDS31393.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 493) 503 82.2 1.4e-15 CCDS10498.1 MEFV gene_id:4210|Hs108|chr16 ( 781) 506 82.8 1.5e-15 CCDS4678.1 TRIM26 gene_id:7726|Hs108|chr6 ( 539) 491 80.5 4.7e-15 CCDS31392.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 326) 486 79.6 5.3e-15 CCDS31394.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 347) 486 79.7 5.6e-15 CCDS2015.1 TRIM43 gene_id:129868|Hs108|chr2 ( 446) 481 79.1 1.1e-14 CCDS10114.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 341) 476 78.3 1.4e-14 CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6 ( 513) 471 77.8 3.1e-14 CCDS73719.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 296) 464 76.6 4.1e-14 CCDS56403.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 313) 464 76.6 4.2e-14 CCDS4607.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 407) 464 76.7 5.1e-14 CCDS4606.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 523) 464 76.8 6e-14 CCDS56405.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 ( 466) 460 76.2 8.2e-14 >>CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 (471 aa) initn: 3222 init1: 3222 opt: 3222 Z-score: 2415.5 bits: 456.3 E(32554): 3.2e-128 Smith-Waterman score: 3222; 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CCDS34 PLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDTFTEKLWPLFYPGIRAGRKNAA 420 430 440 450 460 470 460 470 pF1KE4 PLKICSVSDSER :: : .: : CCDS34 PLTIRPPTDWE 480 >>CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6 (503 aa) initn: 860 init1: 371 opt: 1000 Z-score: 762.7 bits: 150.6 E(32554): 3.7e-36 Smith-Waterman score: 1000; 42.7% identity (73.3% similar) in 356 aa overlap (6-358:19-371) 10 20 30 40 pF1KE4 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSWKDL :: ::: :.:: .::::::.:: :.::::::..:.. :.:: CCDS78 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 DDTFPCPVCRFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLF . ::::::: :.:.: : :: ...::::::: . ... .....: .:.. :.:: CCDS78 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQ---AVKRKIRDESLCPQHHEALSLF 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 CVKDLEILCTQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGS : .: : .: :..: :. : . :. :.. ..: :. ::::....... . . . CCDS78 CYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEK 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 KSVELKKKVEYKREEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYV : :::. :: .:..: :::... :..::...: ....::..:: .: :: ..:.: CCDS78 KPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKR 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 STLKHLLREVEGKSVQSNLELLTQAKSMHHKYQNLKCPEL--FSFRLTKYGFSLPPQYSG : :: ::::: .::..:.: ..:: .: ...: :. :..: : ..: :: . CCDS78 RDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFA 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 LDRIIKPFQVDVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRY-ERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQR : .:.: . .:: :: .::::.:..:::::.:.. : . :.. :::: : ::... CCDS78 LRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEG 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 FSSGRHYWEVEVGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTT :.:::::::::... CCDS78 FTSGRHYWEVEAAHCVLAQDPENQALARFYCYTERTIAKRLVLRRDPSVKRTLCRGCSSL 360 370 380 390 400 410 >>CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 (468 aa) initn: 918 init1: 322 opt: 976 Z-score: 745.2 bits: 147.2 E(32554): 3.5e-35 Smith-Waterman score: 976; 35.6% identity (63.5% similar) in 463 aa overlap (9-464:9-455) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSWKDLDDTFPCPVCRFCF :::::..: :::.:. ::: .::::::: :. : . . . :: :: CCDS31 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPYACPECRELS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 PYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKDLEILCTQCS : ...: : : ...:.: :: . ...: : . :. :: .:..::. : CCDS31 PQRNLRPNRPLAKMAEMA-----RRLHPPSPVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAACE 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 FSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVELKKKVEYKR : .: : . :.. :: . :: ::: ::.... . : .: :: .: CCDS31 RSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQR 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 EEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLKHLLREVEGK ... .:::..: .: .:....:.....::...: .: :. ..:.. . : .:. :.::. CCDS31 QNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEGR 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 pF1KE4 SVQSNLELLTQAKSMHHKYQNLKC--PELFSFRLTKYGFSLPPQYSGLDRIIKPFQVDVI : :: . :. .. :..: ::. ..: . .: :: . .. :. :: CCDS31 CQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMEL-RTVCRVP----GLVETLRRFRGDVT 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 LDLNTAHPQLLVSEDRKAVRYERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQRFSSGRHYWEVEVGN :: .::.:.:..::::..:. .. . .:.:: : :::..::.:::::::::::. CCDS31 LDPDTANPELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGD 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 KPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAI---GRYMKSGYVASGPKTTQLLPVVKPSKI . .: ::::.. . :. . . :. .::: . : :..:. : .: : : .. CCDS31 RTSWALGVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVFLGSYYNSSERALAPLRD---P---PRRV 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 GIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDC-FTEAVWPYFYTGTDSE-PLKICSVSDSER ::::::: : ::::. .: :.:. : . :. .. : : ..: :. :: CCDS31 GIFLDYEAGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPTPMTICRPKGGSGDT 410 420 430 440 450 460 CCDS31 LAPQ >>CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1 (486 aa) initn: 957 init1: 491 opt: 947 Z-score: 723.4 bits: 143.2 E(32554): 5.6e-34 Smith-Waterman score: 947; 35.7% identity (63.5% similar) in 457 aa overlap (10-461:10-456) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSWKDLDDT----FPCPVC :.:.. ::.::..:..::...:::.:: :.: . : . . :: : CCDS16 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQGGVYACPQC 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 RFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKDLEILC : : ..:: : :: .:.: ...: . . :. : .:.. :. :: .: :: CCDS16 RGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARR-----CARHGEDLSRFCEEDEAALC 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 TQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVELKKKV :. . .:. : :...::. .. :. .:: .:...: . :.:.: :.:: CCDS16 WVCDAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWKEKV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 EYKREEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLKHLLRE :..:... :::. : :: .:.. ::... :: : .: :. .: . ..::.: : CCDS16 EMQRQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKELADE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 VEGKSVQSNLELLTQAKSMHHKYQNLKCPELFSFRLT-KYGFSLPPQYSGLDRIIKPFQV .. . . : :: .... . . . : .. . : . .: : .... ::: CCDS16 LQERCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTACCIP----GRRELLRKFQV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 DVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRYERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQRFSSGRHYWEVE :: :: ::::.::.. : ..:. . :.. .:.:: . : .:: : :::::::::: CCDS16 DVKLDPATAHPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEVL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 VGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTTQLLPVVKPSKI ::. .: :::::: : :. . :: .: ::. . :.. . .. :: . .: : CCDS16 VGEGAEWGLGVCQDTLPRKGETTPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLESPRCI 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 GIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDCFTEAVWPYFYTGTDSEPLKICSVSDSER ::::::: :..::::..: : .::::. :. . :::. :. :: CCDS16 GIFLDYEAGEISFYNVTDGSYIYTFNQLFSGLLRPYFFI-CDATPLILPPTTIAGSGNWA 420 430 440 450 460 470 CCDS16 SRDHLDPASDVRDDHL 480 >>CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 (475 aa) initn: 870 init1: 406 opt: 937 Z-score: 716.1 bits: 141.9 E(32554): 1.4e-33 Smith-Waterman score: 937; 35.7% identity (64.5% similar) in 476 aa overlap (1-467:1-466) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSWKDLDDTFPCPVCRFCF : .. :. . :: .:::::. . .::.:.:::.::. :.: : .. ::::: : CCDS44 MASAARLTMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQECISQVGKGGGSV--CPVCRQRF 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 PYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKDLEILCTQCS :..: : :: :... :... ..... : : : :.. : ::: :: . :: :. CCDS44 LLKNLRPNRQLANMVNNLKEIS-QEAREGTQGER--CAVHGERLHLFCEKDGKALCWVCA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 FSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVELKKKVEYKR : ::. : . :...::. ..: :. .: :: . : .::. . . : .. :: :: .. CCDS44 QSRKHRDHAMVPLEEAAQEYQEKLQVALGELRRKQELAEKLEVEIAIKRADWKKTVETQK 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 EEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLKHLLREVEGK .:..:: : . :: .:.. :.... .: . : :.:. ..:.. ..:..:. :.. . CCDS44 SRIHAEFVQQKNFLVEEEQRQLQELEKDEREQLRILGEKEAKLAQQSQALQELISELDRR 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 pF1KE4 SVQSNLELLTQAKSMHHKYQ--NLKCPELFSFRLTKYGFSLPPQYSGLDRIIKPFQVDVI .: :::: .. . .. . ::: .. : .: . .: :: .... : . CCDS44 CHSSALELLQEVIIVLERSESWNLKDLDITSPELRSV-CHVP----GLKKMLRTCAVHIT 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 LDLNTAHPQLLVSEDRKAVRYERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQRFSSGRHYWEVEVGN :: .::.: :..::::. :: ...: . .:: : :::.:.: ::.:::::.: . CCDS44 LDPDTANPWLILSEDRRQVRLGDTQQSIPGNEERFDSYPMVLGAQHFHSGKHYWEVDVTG 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 KPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTTQLLPVVKPSKIGIF : : ::::.: . :. . : .:::.: . :. : :. : : : : ..::: CCDS44 KEAWDLGVCRDSVRRKGHFLLSSKSGFWTIWLWNKQKYEAGTYPQTPLHLQVPPCQVGIF 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 LDYELGDLSFYNMNDR-SILYTFNDC-FTEAVWPYFYTG-----TDSEPLKICSVSDSER :::: : .::::..:. :..:.:..: :: . :.: : .. :: .: .. CCDS44 LDYEAGMVSFYNITDHGSLIYSFSECAFTGPLRPFFSPGFNDGGKNTAPLTLCPLNIGSQ 420 430 440 450 460 470 CCDS44 GSTDY >>CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11 (485 aa) initn: 845 init1: 402 opt: 866 Z-score: 663.2 bits: 132.1 E(32554): 1.3e-30 Smith-Waterman score: 872; 34.6% identity (62.7% similar) in 491 aa overlap (5-470:4-484) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MEFVTALVN-LQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSWKDLDDT----FPCPV ::::. . :: .::::. .:..:..:.:::.::.:::: :. .. . ::. CCDS31 MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIPGESQNWGYTCPL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 CRFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKDLEIL :: ...: : :: :..: .. :... . . . .::.:.. : .:: .:. :. CCDS31 CRAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLK---GDLCERHGEKLKMFCKEDVLIM 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 CTQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVELKKK : :: : .:. : . :.. .: .. :. .:: :... :.. :. . . .... : . CCDS31 CEACSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGERKRTATWKIQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 VEYKREEINSEFEQIRLFLQNEQE----------MILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSD :: ... : :::. . .:...: : ..: : . . ::. : :: . CCDS31 VETRKQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKLELNHSELIQ 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 YVSTLKHLLREVEGKSVQSNLELLTQAKSM--HHKYQNLKCPELFSFRLTKYGFSLPPQY ..: ... :.. .: . .: . . . . : .:. :: .:..: : CCDS31 QSQVLWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKTDCRVL---- 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 SGLDRIIKPFQVDVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRYERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQ :: .:.: . .:: :: .::. .:.:::::: :.: .... .:.::: ::::: CCDS31 -GLREILKTYAADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQKLPDNPERFYRYNIVLGSQ 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 RFSSGRHYWEVEVGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKT .::::::::::::.. .: ::::.. . :. : :::.: : :.. .: CCDS31 CISSGRHYWEVEVGDRSEWGLGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVI-RLRKGNEYRAGTDE 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 pF1KE4 TQLLPV-VKPSKIGIFLDYELGDLSFYNMND-RSILYTFNDC-FTEAVWPYF---YT-GT .: . : : ..:::.::: :.::::..: : ..:: : . ::: :. :: CCDS31 YPILSLPVPPRRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPYFSPCYSIGT 420 430 440 450 460 470 460 470 pF1KE4 D-SEPLKICSVSDSER . . :: :::. :.: CCDS31 NNTAPLAICSL-DGED 480 >>CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 (477 aa) initn: 734 init1: 294 opt: 863 Z-score: 661.1 bits: 131.7 E(32554): 1.7e-30 Smith-Waterman score: 863; 32.2% identity (61.4% similar) in 485 aa overlap (1-467:1-472) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSW---------KDLDDTF :: : .::::..: :::.:. ::: .:::::::.:...:: . .: CCDS15 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 PCPVCRFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKD ::: :: : ... : : ...:.:.: . ::.. .:..:.. : ::: :: CCDS15 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ------HPGLQKQD-LCQEHHEPLKLFCQKD 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 LEILCTQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVE .:. : : .:. : . : ..:.. .. :: ..: ::..: :. .. . .. .: CCDS15 QSPICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAE 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 LKKKVEYKREEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLK . ::. .::.: :::.. :.: .:.. .:. .. :: . ..: :... :. .:. CCDS15 WQGKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 HLLREVEGKSVQSNLELLTQAKSMHHKYQNL--KCPELFSFRLTKYGFSLPPQYSGLDRI :: ..: .:.:. :..: . : . .:. .:::. . .: : .. CCDS15 LLLLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQI----EV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 IKPFQVDVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRY---ERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQRFS .. : ::. : ..:.: ::. :.:. :: . ..: . :: . : ..:. :: CCDS15 LRGFLEDVVPDATSAYPYLLLYESRQR-RYLGSSPEGSGFC-SKDRFVAYPCAVGQTAFS 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 SGRHYWEV--EVGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTT :::::::: .. . : ::::.: . :. . .:::.. . :... : CCDS15 SGRHYWEVGMNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLSTFSALT 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 QLLPVVKPSKIGIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDC-FTEAVWPYFYTGTD-SEPLK .. . ::..:::::.: :..:::...: : :.:... : . :.: :. : . CCDS15 PVMLMEPPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCLGAPKSGQMV 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 ICSVSDSER : .:. CCDS15 ISTVTMWVKG 470 >>CCDS34093.1 TRIM61 gene_id:391712|Hs108|chr4 (209 aa) initn: 858 init1: 828 opt: 828 Z-score: 639.5 bits: 126.5 E(32554): 2.7e-29 Smith-Waterman score: 828; 65.5% identity (83.6% similar) in 177 aa overlap (1-177:1-177) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSWKDLDDTFPCPVCRFCF :::::::..:. :.::::::.::::::::.:::::: ::. .::::: :.:::: :.:: CCDS34 MEFVTALADLRAEASCPICLDYLKDPVTISCGHNFCLSCIIMSWKDLHDSFPCPFCHFCC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 PYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKDLEILCTQCS : ..: :::: .::::::::::: .:::::.:. .:.:::: ::.:: ::::.:: .:: CCDS34 PERKFISNPQLGSLTEIAKQLQIRSKKRKRQEEKHVCKKHNQVLTFFCQKDLELLCPRCS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 FSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVELKKKVEYKR .:: ::.: . ::::::::::. :: : .. .: .:::: .: ::.:::::.: CCDS34 LSTDHQHHCVWPIKKAASYHRKKLEEYNAPWKERVELIEKVITMQTRKSLELKKKMESPS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 EEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLKHLLREVEGK CCDS34 VTRLECSCTISAHFNLRLPGSSDSSASGS 190 200 >>CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 (465 aa) initn: 723 init1: 374 opt: 733 Z-score: 564.5 bits: 113.8 E(32554): 4e-25 Smith-Waterman score: 785; 31.8% identity (61.3% similar) in 462 aa overlap (1-452:1-450) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLS-----VSWKDL-DDTFPCP : .:. ...::..: ::: . .::.:::::..:. :.. : :.: ..:: :: CCDS45 MASTTSTKKMMEEATCSICLSLMTNPVSINCGHSYCHLCITDFFKNPSQKQLRQETFCCP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 VCRFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKDLEI :: : . :.: : :: .: : :. . . : ::.:.. . ::: . .. CCDS45 QCRAPFHMDSLRPNKQLGSLIEALKETDQEMS----------CEEHGEQFHLFCEDEGQL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 LCTQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVELKK .: .: . .:. : .. . . ..: :. .. :.. .: . . . . .. :. CCDS45 ICWRCERAPQHKGHTTALVEDVCQGYKEKLQKAVTKLKQLEDRCTEQKLSTAMRITKWKE 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 KVEYKREEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLKHLL ::. .:..: :.:.... ::..:.. : ... ::.. :..: . . :. . :: . CCDS45 KVQIQRQKIRSDFKNLQCFLHEEEKSYLWRLEKEEQQTLSRLRDYEAGLGLKSNELKSHI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 REVEGKSVQSNLELLTQAKSMHHKYQNLK--CPELFSFRLTKYGFSLPPQYSGLDRIIKP :.: : : .:: .... . .: : :..: . .. : . .... CCDS45 LELEEKCQGSAQKLLQNVNDTLSRSWAVKLETSEAVSLELHTM-CNVSKLYFDVKKMLRS 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 FQVDVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRYERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQRFSSGRHYW ::.: :: .::: .:..::::. : ..: . ::: . : ::: . :.:::.:. 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