FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4216, 748 aa 1>>>pF1KE4216 748 - 748 aa - 748 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3638+/-0.0012; mu= 5.9182+/- 0.072 mean_var=172.4007+/-35.026, 0's: 0 Z-trim(107.7): 158 B-trim: 226 in 1/49 Lambda= 0.097680 statistics sampled from 9556 (9718) to 9556 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.299), width: 16 Scan time: 3.230 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS34025.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4 ( 748) 4997 717.2 2.3e-206 CCDS43246.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4 ( 653) 4306 619.8 4.2e-177 CCDS3611.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4 ( 655) 4067 586.1 5.7e-167 CCDS7227.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 ( 698) 1590 237.1 7.3e-62 CCDS58081.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 ( 704) 1590 237.1 7.3e-62 CCDS58079.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 ( 608) 1298 195.9 1.6e-49 CCDS54364.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 ( 639) 1241 187.9 4.3e-47 CCDS33214.2 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 ( 646) 1241 187.9 4.3e-47 CCDS46312.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 ( 638) 1239 187.6 5.2e-47 CCDS58080.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 ( 714) 1109 169.3 1.9e-41 CCDS54363.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 ( 606) 848 132.5 1.9e-30 CCDS82077.1 ARHGAP44 gene_id:9912|Hs108|chr17 ( 812) 403 69.9 1.9e-11 CCDS82076.1 ARHGAP44 gene_id:9912|Hs108|chr17 ( 774) 401 69.6 2.2e-11 CCDS45616.1 ARHGAP44 gene_id:9912|Hs108|chr17 ( 818) 401 69.6 2.3e-11 CCDS33689.1 SRGAP3 gene_id:9901|Hs108|chr3 (1075) 399 69.4 3.5e-11 CCDS2572.1 SRGAP3 gene_id:9901|Hs108|chr3 (1099) 399 69.4 3.5e-11 CCDS32408.1 ARHGAP17 gene_id:55114|Hs108|chr16 ( 803) 394 68.6 4.4e-11 CCDS32409.1 ARHGAP17 gene_id:55114|Hs108|chr16 ( 881) 394 68.6 4.8e-11 CCDS11498.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs108|chr17 ( 548) 386 67.4 7.1e-11 >>CCDS34025.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4 (748 aa) initn: 4997 init1: 4997 opt: 4997 Z-score: 3818.5 bits: 717.2 E(32554): 2.3e-206 Smith-Waterman score: 4997; 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47.7% identity (69.6% similar) in 726 aa overlap (21-734:39-689) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MEENNDSTENPQQGQGRQNAIKCGWLRKQGGFVKTWHTRWFVLKGDQLYY .: :::.:: ...:.:. :::::.::::.: CCDS72 ARRARSKSLVMGEQSRSPGRMPCPHRLGPVLKAGWLKKQRSIMKNWQQRWFVLRGDQLFY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE4 FKDEDETKPLGTIFLPGNKVSEHPCNEENPGKFLFEVVPGG--DRDRMTANHESYLLMAS .::.:: :: : : : :..:.: : . :.::: :::. ::: .:... :: :. ::::: CCDS72 YKDKDEIKPQGFISLQGTQVTELPPGPEDPGKHLFEISPGGAGEREKVPANPEALLLMAS 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 TQNDMEDWVKSIRRVIWGPFGGGIFGQKLEDTVRYEKRYGNRLAPMLVEQCVDFIRQRGL .: ::::::..::::::.:.:::::::.::.::..:..:: ::::.::::::::::.::: CCDS72 SQRDMEDWVQAIRRVIWAPLGGGIFGQRLEETVHHERKYGPRLAPLLVEQCVDFIRERGL 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 KEEGLFRLPGQANLVKELQDAFDCGEKPSFDSNTDVHTVASLLKLYLRELPEPVIPYAKY ::::::.:::::::..:::.::::::: :::.:::::::::::::::::::::.:.:.: CCDS72 TEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDVHTVASLLKLYLRELPEPVVPFARY 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 EDFLSCAKLLSKEEEAGVKELAKQVKSLPVVNYNLLKYICRFLDEVQSYSGVNKMSVQNL :::::::.::.:.: :. ::::::..:: .:::::.:::.::::::.::.::::::::: CCDS72 EDFLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQVSNLPQANYNLLRYICKFLDEVQAYSNVNKMSVQNL 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 ATVFGPNILRPKVEDPLTIMEGTVVVQQLMSVMISKHDCLFPKDA-ELQSKPQDGVSNNN :::::::::::.::::.:::::: .::.::.:.: ::. :: . : ..:. :. CCDS72 ATVFGPNILRPQVEDPVTIMEGTSLVQHLMTVLIRKHSQLFTAPVPEGPTSPRGGL---- 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 EIQKKATMGQLQNKENNNTKDSPSRQCS--WDKSESPQRSSMNNGSPTALSGSKTNSPKN ::. : . : . :. . :.: .: . .:.: . CCDS72 -------------------------QCAVGWGSEEVTRDSQGEPGGP-GLPAHRTSSLDG 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 SVHKLDVSRSPPLMVKKNPAFNKGSGIVTNGSFSSSNAEGLEKTQTTPNGSLQARRSSSL .. . .::. : : : : . : .:.:: :. . . :. :: CCDS72 AAVAV-LSRTAPT----------GPG--------SRCSPG-KKVQTLPSWKSSFRQPRSL 400 410 420 430 470 480 490 500 510 520 pF1KE4 KVSGTKMGTHSVQNGTVRMGILNSDTLGNPTNVRNMSWLPNGYVTLRDNKQKEQAGEL-- ::. : : .... :..: :: :: :: .:: ... .. .: CCDS72 --SGSPKGGGS----SLEVPIISSG--GN--------WLMNGLSSLRGHRRASSGDRLKD 440 450 460 470 480 530 540 550 560 570 580 pF1KE4 -GQHNRLSTYDNVHQQFSMMNLDDKQSIDSATWS-TSSCEISLPENSNSCRSSTTTCPEQ :. .:::::::: . .. :. : .:: .:: : :. . .:: :.: . CCDS72 SGSVQRLSTYDNVPAPGLVPGIP---SVASMAWSGASSSESSVGGSLSSC----TACRAS 490 500 510 520 530 590 600 610 620 630 pF1KE4 DFFGGN--FEDPVLDGPPQDDLSH-PRDYESKSDHRSVGGRSSRATSSSDNSETFVGNSS : . . : .:. : . :. :.. . . .:. .: . : .: : CCDS72 DSSARSSLHTDWALEPSPLPSSSEDPKSLDLDHSMDEAGAGASNSEPSEPDSPTREHARR 540 550 560 570 580 590 640 650 660 670 680 690 pF1KE4 SNHSALHSLVSSLKQEMTKQKIEYESRIKSLEQRNLTLETEMMSLHDELDQERKKFTMIE :. ::..::. :. :. .:. ::: .: .:. . :. .: :..:::::.::. :.: CCDS72 SE--ALQGLVTELRAELCRQRTEYERSVKRIEEGSADLRKRMSRLEEELDQEKKKYIMLE 600 610 620 630 640 650 700 710 720 730 740 pF1KE4 IKMRNAERAKEDAEKRNDMLQKEMEQFFSTFGELTVEPRRTERGNTIWIQ ::.::.:::.::::.::..::.:::.::::.: ::: CCDS72 IKLRNSERAREDAERRNQLLQREMEEFFSTLGSLTVGAKGARAPK 660 670 680 690 >>CCDS58081.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 (704 aa) initn: 1677 init1: 1268 opt: 1590 Z-score: 1224.1 bits: 237.1 E(32554): 7.3e-62 Smith-Waterman score: 1960; 47.7% identity (69.6% similar) in 726 aa overlap (21-734:45-695) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MEENNDSTENPQQGQGRQNAIKCGWLRKQGGFVKTWHTRWFVLKGDQLYY .: :::.:: ...:.:. :::::.::::.: CCDS58 RYFTRSKSLVMGEQSRSPGRMPCPHRLGPVLKAGWLKKQRSIMKNWQQRWFVLRGDQLFY 20 30 40 50 60 70 60 70 80 90 100 pF1KE4 FKDEDETKPLGTIFLPGNKVSEHPCNEENPGKFLFEVVPGG--DRDRMTANHESYLLMAS .::.:: :: : : : :..:.: : . :.::: :::. ::: .:... :: :. ::::: CCDS58 YKDKDEIKPQGFISLQGTQVTELPPGPEDPGKHLFEISPGGAGEREKVPANPEALLLMAS 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 TQNDMEDWVKSIRRVIWGPFGGGIFGQKLEDTVRYEKRYGNRLAPMLVEQCVDFIRQRGL .: ::::::..::::::.:.:::::::.::.::..:..:: ::::.::::::::::.::: CCDS58 SQRDMEDWVQAIRRVIWAPLGGGIFGQRLEETVHHERKYGPRLAPLLVEQCVDFIRERGL 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 KEEGLFRLPGQANLVKELQDAFDCGEKPSFDSNTDVHTVASLLKLYLRELPEPVIPYAKY ::::::.:::::::..:::.::::::: :::.:::::::::::::::::::::.:.:.: CCDS58 TEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDVHTVASLLKLYLRELPEPVVPFARY 200 210 220 230 240 250 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 EDFLSCAKLLSKEEEAGVKELAKQVKSLPVVNYNLLKYICRFLDEVQSYSGVNKMSVQNL :::::::.::.:.: :. ::::::..:: .:::::.:::.::::::.::.::::::::: CCDS58 EDFLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQVSNLPQANYNLLRYICKFLDEVQAYSNVNKMSVQNL 260 270 280 290 300 310 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 ATVFGPNILRPKVEDPLTIMEGTVVVQQLMSVMISKHDCLFPKDA-ELQSKPQDGVSNNN :::::::::::.::::.:::::: .::.::.:.: ::. :: . : ..:. :. CCDS58 ATVFGPNILRPQVEDPVTIMEGTSLVQHLMTVLIRKHSQLFTAPVPEGPTSPRGGL---- 320 330 340 350 360 370 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 EIQKKATMGQLQNKENNNTKDSPSRQCS--WDKSESPQRSSMNNGSPTALSGSKTNSPKN ::. : . : . :. . :.: .: . .:.: . CCDS58 -------------------------QCAVGWGSEEVTRDSQGEPGGP-GLPAHRTSSLDG 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 SVHKLDVSRSPPLMVKKNPAFNKGSGIVTNGSFSSSNAEGLEKTQTTPNGSLQARRSSSL .. . .::. : : : : . : .:.:: :. . . :. :: CCDS58 AAVAV-LSRTAPT----------GPG--------SRCSPG-KKVQTLPSWKSSFRQPRSL 410 420 430 440 470 480 490 500 510 520 pF1KE4 KVSGTKMGTHSVQNGTVRMGILNSDTLGNPTNVRNMSWLPNGYVTLRDNKQKEQAGEL-- ::. : : .... :..: :: :: :: .:: ... .. .: CCDS58 --SGSPKGGGS----SLEVPIISSG--GN--------WLMNGLSSLRGHRRASSGDRLKD 450 460 470 480 530 540 550 560 570 580 pF1KE4 -GQHNRLSTYDNVHQQFSMMNLDDKQSIDSATWS-TSSCEISLPENSNSCRSSTTTCPEQ :. .:::::::: . .. :. : .:: .:: : :. . .:: :.: . CCDS58 SGSVQRLSTYDNVPAPGLVPGIP---SVASMAWSGASSSESSVGGSLSSC----TACRAS 490 500 510 520 530 540 590 600 610 620 630 pF1KE4 DFFGGN--FEDPVLDGPPQDDLSH-PRDYESKSDHRSVGGRSSRATSSSDNSETFVGNSS : . . : .:. : . :. :.. . . .:. .: . : .: : CCDS58 DSSARSSLHTDWALEPSPLPSSSEDPKSLDLDHSMDEAGAGASNSEPSEPDSPTREHARR 550 560 570 580 590 600 640 650 660 670 680 690 pF1KE4 SNHSALHSLVSSLKQEMTKQKIEYESRIKSLEQRNLTLETEMMSLHDELDQERKKFTMIE :. ::..::. :. :. .:. ::: .: .:. . :. .: :..:::::.::. :.: CCDS58 SE--ALQGLVTELRAELCRQRTEYERSVKRIEEGSADLRKRMSRLEEELDQEKKKYIMLE 610 620 630 640 650 700 710 720 730 740 pF1KE4 IKMRNAERAKEDAEKRNDMLQKEMEQFFSTFGELTVEPRRTERGNTIWIQ ::.::.:::.::::.::..::.:::.::::.: ::: CCDS58 IKLRNSERAREDAERRNQLLQREMEEFFSTLGSLTVGAKGARAPK 660 670 680 690 700 >>CCDS58079.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 (608 aa) initn: 1677 init1: 1268 opt: 1298 Z-score: 1002.7 bits: 195.9 E(32554): 1.6e-49 Smith-Waterman score: 1668; 46.8% identity (68.5% similar) in 654 aa overlap (91-734:21-599) 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 GTIFLPGNKVSEHPCNEENPGKFLFEVVPGGDRDRMTANHESYLLMASTQNDMEDWVKSI :.:... :: :. :::::.: ::::::..: CCDS58 MPFWPIRCLKRSRRMPRGGAGEREKVPANPEALLLMASSQRDMEDWVQAI 10 20 30 40 50 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 RRVIWGPFGGGIFGQKLEDTVRYEKRYGNRLAPMLVEQCVDFIRQRGLKEEGLFRLPGQA :::::.:.:::::::.::.::..:..:: ::::.::::::::::.::: ::::::.:::: CCDS58 RRVIWAPLGGGIFGQRLEETVHHERKYGPRLAPLLVEQCVDFIRERGLTEEGLFRMPGQA 60 70 80 90 100 110 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 NLVKELQDAFDCGEKPSFDSNTDVHTVASLLKLYLRELPEPVIPYAKYEDFLSCAKLLSK :::..:::.::::::: :::.:::::::::::::::::::::.:.:.::::::::.::.: CCDS58 NLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDVHTVASLLKLYLRELPEPVVPFARYEDFLSCAQLLTK 120 130 140 150 160 170 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 EEEAGVKELAKQVKSLPVVNYNLLKYICRFLDEVQSYSGVNKMSVQNLATVFGPNILRPK .: :. ::::::..:: .:::::.:::.::::::.::.::::::::::::::::::::. CCDS58 DEGEGTLELAKQVSNLPQANYNLLRYICKFLDEVQAYSNVNKMSVQNLATVFGPNILRPQ 180 190 200 210 220 230 310 320 330 340 350 pF1KE4 VEDPLTIMEGTVVVQQLMSVMISKHDCLFPKDA-ELQSKPQDGVSNNNEIQKKATMGQLQ ::::.:::::: .::.::.:.: ::. :: . : ..:. :. CCDS58 VEDPVTIMEGTSLVQHLMTVLIRKHSQLFTAPVPEGPTSPRGGL---------------- 240 250 260 270 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 NKENNNTKDSPSRQCS--WDKSESPQRSSMNNGSPTALSGSKTNSPKNSVHKLDVSRSPP ::. : . : . :. . :.: .: . .:.: ... . .::. : CCDS58 -------------QCAVGWGSEEVTRDSQGEPGGP-GLPAHRTSSLDGAAVAV-LSRTAP 280 290 300 310 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 LMVKKNPAFNKGSGIVTNGSFSSSNAEGLEKTQTTPNGSLQARRSSSLKVSGTKMGTHSV : : : . : .:.:: :. . . :. :: ::. : : CCDS58 T----------GPG--------SRCSPG-KKVQTLPSWKSSFRQPRSL--SGSPKGGGS- 320 330 340 350 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 QNGTVRMGILNSDTLGNPTNVRNMSWLPNGYVTLRDNKQKEQAGEL---GQHNRLSTYDN .... :..: :: :: :: .:: ... .. .: :. .::::::: CCDS58 ---SLEVPIISSG--GN--------WLMNGLSSLRGHRRASSGDRLKDSGSVQRLSTYDN 360 370 380 390 400 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 VHQQFSMMNLDDKQSIDSATWS-TSSCEISLPENSNSCRSSTTTCPEQDFFGGN--FEDP : . .. :. : .:: .:: : :. . .:: :.: .: . . : CCDS58 VPAPGLVPGI---PSVASMAWSGASSSESSVGGSLSSC----TACRASDSSARSSLHTDW 410 420 430 440 450 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 VLDGPPQDDLSH-PRDYESKSDHRSVGGRSSRATSSSDNSETFVGNSSSNHSALHSLVSS .:. : . :. :.. . . .:. .: . : .: : :. ::..::. CCDS58 ALEPSPLPSSSEDPKSLDLDHSMDEAGAGASNSEPSEPDSPTREHARRSE--ALQGLVTE 460 470 480 490 500 510 660 670 680 690 700 710 pF1KE4 LKQEMTKQKIEYESRIKSLEQRNLTLETEMMSLHDELDQERKKFTMIEIKMRNAERAKED :. :. .:. ::: .: .:. . :. .: :..:::::.::. :.:::.::.:::.:: CCDS58 LRAELCRQRTEYERSVKRIEEGSADLRKRMSRLEEELDQEKKKYIMLEIKLRNSERARED 520 530 540 550 560 570 720 730 740 pF1KE4 AEKRNDMLQKEMEQFFSTFGELTVEPRRTERGNTIWIQ ::.::..::.:::.::::.: ::: CCDS58 AERRNQLLQREMEEFFSTLGSLTVGAKGARAPK 580 590 600 >>CCDS54364.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 (639 aa) initn: 1471 init1: 846 opt: 1241 Z-score: 958.9 bits: 187.9 E(32554): 4.3e-47 Smith-Waterman score: 1398; 38.3% identity (63.0% similar) in 738 aa overlap (7-735:32-638) 10 20 30 pF1KE4 MEENNDSTENPQQGQGRQNAIKCGWLRKQGGFVKTW :: :: . :: :::.:: ..::.: CCDS54 SLGQSACLFLSIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPL-----ERPIKMGWLKKQRSIVKNW 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 90 pF1KE4 HTRWFVLKGDQLYYFKDEDETKPLGTIFLPGNKVSEHPCNEENPGKFLFEVVPGG-DRDR . :.:::...::::.:::..::: : ..::: ..: : :. :::.::..:.. :..: CCDS54 QQRYFVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWDQNR 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE4 MTANHESYLLMASTQNDMEDWVKSIRRVIWGPFGGGIFGQKLEDTVRYEKRYGNRLAPML : ...::.::::.: .::.::: .::: : :. .:::.:..:: ::...: .:.:.: CCDS54 M--GQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCGA-VFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPIL 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE4 VEQCVDFIRQRGLKEEGLFRLPGQANLVKELQDAFDCGEKPSFDSNTDVHTVASLLKLYL ::.:..:: ..: .:::.:::::: ::::.:.:::: ::.:::: .:::::::::::::: CCDS54 VEKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYL 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 RELPEPVIPYAKYEDFLSCAKLLSKEEEAGVKELAKQVKSLPVVNYNLLKYICRFLDEVQ :.:::::.:...:: :: :..: . .: . .:: ::.. :: ::.::.:::::: :.: CCDS54 RDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQ 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 SYSGVNKMSVQNLATVFGPNILRPKVEDPLTIMEGTVVVQQLMSVMISKHDCLFPKDAEL .::::::.:::::.: :..: ::::: .::.:: .:..:..:: :. ::::. .. CCDS54 LNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDI 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 QSKPQDGVSNNNEIQKKATMGQLQNKENNNTKDSPSRQCS--WDKSESPQRSSMNNGSPT .: :: :. : .: . : :: .:. : : ... . CCDS54 PLSP--------PAQK------------NDPKKAPVARSSVGWDATED-LRISRTDSFSS 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 ALSGSKTNSPKNSVHKLDVSRSPPLMVKKNPAFNKGSGIVTNGSFSSSNAEGLEKTQTTP : : :.:: ....: . :: . :. : . .. . .. ..::: : CCDS54 MTSDSDTTSP--------TGQQP------SDAFPEDSSKVPREKPGDWKMQSRKRTQTLP 400 410 420 430 460 470 480 490 500 510 pF1KE4 NGSLQARRSSSLKVSGTKMGTHSVQNGTVRMGILNSDTLGNPTNVRNMSWLPNGYVTLRD : :. : ... .:..: .: :. .: : :.. CCDS54 N------RKCFL--TSAFQGANSS-----KMEIF-----------KNEFWSPSS------ 440 450 460 520 530 540 550 560 570 pF1KE4 NKQKEQAGELGQHNRLSTYDNVHQQFSMMNLDDKQSIDSATWSTSSCEISLPENSNSCRS . .::: : : : . : . .:.:.: :. CCDS54 ---EAKAGE-G-HRRTMSQD-------LRQLSDSQ-----------------------RT 470 480 490 580 590 600 610 620 630 pF1KE4 STTTCPEQDFFGGNFED-PVLDGPPQDDLS--HPRDYESKSDHRSVGGRSSRATSSSDNS :: ... : : : : .. : . .::.: : .: :: CCDS54 ST------------YDNVPSLPGSPGEEASALSSQACDSKGD-----------TLASPNS 500 510 520 530 640 650 660 670 680 pF1KE4 ETFVGNSSSNHSALHSL---VSSLKQEMTKQKIEYESRIKSLEQRNLTLETEMMSLHDEL :: :...:.. . :: :. :..:. :: :: .::.::..: . .... :..:: CCDS54 ETGPGKKNSGEEEIDSLQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEEL 540 550 560 570 580 590 690 700 710 720 730 740 pF1KE4 DQERKKFTMIEIKMRNAERAKEDAEKRNDMLQKEMEQFFSTFGELTVEPRRTERGNTIWI ..:.:: . .::..:: ::..::.:::: :..:...: ... : .: CCDS54 EKEKKKSAALEISLRNMERSREDVEKRNKALEEEVKEFVKSMKEPKTEA 600 610 620 630 pF1KE4 Q >>CCDS33214.2 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 (646 aa) initn: 1471 init1: 846 opt: 1241 Z-score: 958.9 bits: 187.9 E(32554): 4.3e-47 Smith-Waterman score: 1398; 38.3% identity (63.0% similar) in 738 aa overlap (7-735:39-645) 10 20 30 pF1KE4 MEENNDSTENPQQGQGRQNAIKCGWLRKQGGFVKTW :: :: . :: :::.:: ..::.: CCDS33 WDFNLKVEAAKIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPL-----ERPIKMGWLKKQRSIVKNW 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KE4 HTRWFVLKGDQLYYFKDEDETKPLGTIFLPGNKVSEHPCNEENPGKFLFEVVPGG-DRDR . :.:::...::::.:::..::: : ..::: ..: : :. :::.::..:.. :..: CCDS33 QQRYFVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWDQNR 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE4 MTANHESYLLMASTQNDMEDWVKSIRRVIWGPFGGGIFGQKLEDTVRYEKRYGNRLAPML : ...::.::::.: .::.::: .::: : :. .:::.:..:: ::...: .:.:.: CCDS33 M--GQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCGA-VFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPIL 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE4 VEQCVDFIRQRGLKEEGLFRLPGQANLVKELQDAFDCGEKPSFDSNTDVHTVASLLKLYL ::.:..:: ..: .:::.:::::: ::::.:.:::: ::.:::: .:::::::::::::: CCDS33 VEKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYL 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 RELPEPVIPYAKYEDFLSCAKLLSKEEEAGVKELAKQVKSLPVVNYNLLKYICRFLDEVQ :.:::::.:...:: :: :..: . .: . .:: ::.. :: ::.::.:::::: :.: CCDS33 RDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQ 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 SYSGVNKMSVQNLATVFGPNILRPKVEDPLTIMEGTVVVQQLMSVMISKHDCLFPKDAEL .::::::.:::::.: :..: ::::: .::.:: .:..:..:: :. ::::. .. 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