Result of FASTA (ccds) for pFN21AE2315
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2315, 1101 aa
  1>>>pF1KE2315 1101 - 1101 aa - 1101 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9495+/-0.00122; mu= 18.4237+/- 0.074
 mean_var=72.9202+/-15.014, 0's: 0 Z-trim(101.8): 38  B-trim: 161 in 2/46
 Lambda= 0.150193
 statistics sampled from 6652 (6678) to 6652 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.55), E-opt: 0.2 (0.205), width:  16
 Scan time:  4.370

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3603.1 HELQ gene_id:113510|Hs108|chr4          (1101) 7131 1555.5       0
CCDS75158.1 HELQ gene_id:113510|Hs108|chr4         (1034) 4106 900.0       0
CCDS33833.1 POLQ gene_id:10721|Hs108|chr3          (2590)  700 162.1 1.5e-38
CCDS30769.2 HFM1 gene_id:164045|Hs108|chr1         (1435)  374 91.4 1.6e-17


>>CCDS3603.1 HELQ gene_id:113510|Hs108|chr4               (1101 aa)
 initn: 7131 init1: 7131 opt: 7131  Z-score: 8342.7  bits: 1555.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7131; 99.9% identity (99.9% similar) in 1101 aa overlap (1-1101:1-1101)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MDECGSRIRRRVSLPKRNRPSLGCIFGAPTAAELEPGDEGKEEEEMVAENRRRKTAGVLP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS36 MDECGSRIRRRVSLPKRNRPSLGCIFGAPTAAELVPGDEGKEEEEMVAENRRRKTAGVLP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 VEVQPLLLSDSPECLVLGGGDTNPDLLRHMPTDRGVGDQPNDSEVDMFGDYDSFTENSFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 VEVQPLLLSDSPECLVLGGGDTNPDLLRHMPTDRGVGDQPNDSEVDMFGDYDSFTENSFI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 AQVDDLEQKYMQLPEHKKHATDFATENLCSESIKNKLSITTIGNLTELQTDKHTENQSGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 AQVDDLEQKYMQLPEHKKHATDFATENLCSESIKNKLSITTIGNLTELQTDKHTENQSGY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 EGVTIEPGADLLYDVPSSQAIYFENLQNSSNDLGDHSMKERDWKSSSHNTVNEELPHNCI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 EGVTIEPGADLLYDVPSSQAIYFENLQNSSNDLGDHSMKERDWKSSSHNTVNEELPHNCI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 EQPQQNDESSSKVRTSSDMNRRKSIKDHLKNAMTGNAKAQTPIFSRSKQLKDTLLSEEIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 EQPQQNDESSSKVRTSSDMNRRKSIKDHLKNAMTGNAKAQTPIFSRSKQLKDTLLSEEIN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 VAKKTVESSSNDLGPFYSLPSKVRDLYAQFKGIEKLYEWQHTCLTLNSVQERKNLIYSLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 VAKKTVESSSNDLGPFYSLPSKVRDLYAQFKGIEKLYEWQHTCLTLNSVQERKNLIYSLP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 TSGGKTLVAEILMLQELLCCRKDVLMILPYVAIVQEKISGLSSFGIELGFFVEEYAGSKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 TSGGKTLVAEILMLQELLCCRKDVLMILPYVAIVQEKISGLSSFGIELGFFVEEYAGSKG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 RFPPTKRREKKSLYIATIEKGHSLVNSLIETGRIDSLGLVVVDELHMIGEGSRGATLEMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 RFPPTKRREKKSLYIATIEKGHSLVNSLIETGRIDSLGLVVVDELHMIGEGSRGATLEMT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 LAKILYTSKTTQIIGMSATLNNVEDLQKFLQAEYYTSQFRPVELKEYLKINDTIYEVDSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 LAKILYTSKTTQIIGMSATLNNVEDLQKFLQAEYYTSQFRPVELKEYLKINDTIYEVDSK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 AENGMTFSRLLNYKYSDTLKKMDPDHLVALVTEVIPNYSCLVFCPSKKNCENVAEMICKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 AENGMTFSRLLNYKYSDTLKKMDPDHLVALVTEVIPNYSCLVFCPSKKNCENVAEMICKF
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 LSKEYLKHKEKEKCEVIKNLKNIGNGNLCPVLKRTIPFGVAYHHSGLTSDERKLLEEAYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 LSKEYLKHKEKEKCEVIKNLKNIGNGNLCPVLKRTIPFGVAYHHSGLTSDERKLLEEAYS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 TGVLCLFTCTSTLAAGVNLPARRVILRAPYVAKEFLKRNQYKQMIGRAGRAGIDTIGESI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 TGVLCLFTCTSTLAAGVNLPARRVILRAPYVAKEFLKRNQYKQMIGRAGRAGIDTIGESI
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 LILQEKDKQQVLELITKPLENCYSHLVQEFTKGIQTLFLSLIGLKIATNLDDIYHFMNGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 LILQEKDKQQVLELITKPLENCYSHLVQEFTKGIQTLFLSLIGLKIATNLDDIYHFMNGT
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 FFGVQQKVLLKEKSLWEITVESLRYLTEKGLLQKDTIYKSEEEVQYNFHITKLGRASFKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 FFGVQQKVLLKEKSLWEITVESLRYLTEKGLLQKDTIYKSEEEVQYNFHITKLGRASFKG
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 TIDLAYCDILYRDLKKGLEGLVLESLLHLIYLTTPYDLVSQCNPDWMIYFRQFSQLSPAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 TIDLAYCDILYRDLKKGLEGLVLESLLHLIYLTTPYDLVSQCNPDWMIYFRQFSQLSPAE
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE2 QNVAAILGVSESFIGKKASGQAIGKKVDKNVVNRLYLSFVLYTLLKETNIWTVSEKFNMP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 QNVAAILGVSESFIGKKASGQAIGKKVDKNVVNRLYLSFVLYTLLKETNIWTVSEKFNMP
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE2 RGYIQNLLTGTASFSSCVLHFCEELEEFWVYRALLVELTKKLTYCVKAELIPLMEVTGVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 RGYIQNLLTGTASFSSCVLHFCEELEEFWVYRALLVELTKKLTYCVKAELIPLMEVTGVL
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE2 EGRAKQLYSAGYKSLMHLANANPEVLVRTIDHLSRRQAKQIVSSAKMLLHEKAEALQEEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 EGRAKQLYSAGYKSLMHLANANPEVLVRTIDHLSRRQAKQIVSSAKMLLHEKAEALQEEV
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100 
pF1KE2 EELLRLPSDFPGAVASSTDKA
       :::::::::::::::::::::
CCDS36 EELLRLPSDFPGAVASSTDKA
             1090      1100 

>>CCDS75158.1 HELQ gene_id:113510|Hs108|chr4              (1034 aa)
 initn: 4106 init1: 4106 opt: 4106  Z-score: 4800.8  bits: 900.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6567; 93.8% identity (93.8% similar) in 1101 aa overlap (1-1101:1-1034)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MDECGSRIRRRVSLPKRNRPSLGCIFGAPTAAELEPGDEGKEEEEMVAENRRRKTAGVLP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MDECGSRIRRRVSLPKRNRPSLGCIFGAPTAAELVPGDEGKEEEEMVAENRRRKTAGVLP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 VEVQPLLLSDSPECLVLGGGDTNPDLLRHMPTDRGVGDQPNDSEVDMFGDYDSFTENSFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VEVQPLLLSDSPECLVLGGGDTNPDLLRHMPTDRGVGDQPNDSEVDMFGDYDSFTENSFI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 AQVDDLEQKYMQLPEHKKHATDFATENLCSESIKNKLSITTIGNLTELQTDKHTENQSGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AQVDDLEQKYMQLPEHKKHATDFATENLCSESIKNKLSITTIGNLTELQTDKHTENQSGY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 EGVTIEPGADLLYDVPSSQAIYFENLQNSSNDLGDHSMKERDWKSSSHNTVNEELPHNCI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EGVTIEPGADLLYDVPSSQAIYFENLQNSSNDLGDHSMKERDWKSSSHNTVNEELPHNCI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 EQPQQNDESSSKVRTSSDMNRRKSIKDHLKNAMTGNAKAQTPIFSRSKQLKDTLLSEEIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EQPQQNDESSSKVRTSSDMNRRKSIKDHLKNAMTGNAKAQTPIFSRSKQLKDTLLSEEIN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 VAKKTVESSSNDLGPFYSLPSKVRDLYAQFKGIEKLYEWQHTCLTLNSVQERKNLIYSLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VAKKTVESSSNDLGPFYSLPSKVRDLYAQFKGIEKLYEWQHTCLTLNSVQERKNLIYSLP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 TSGGKTLVAEILMLQELLCCRKDVLMILPYVAIVQEKISGLSSFGIELGFFVEEYAGSKG
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::                       
CCDS75 TSGGKTLVAEILMLQELLCCRKDVLMILPYVAIVQEK-----------------------
              370       380       390                              

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 RFPPTKRREKKSLYIATIEKGHSLVNSLIETGRIDSLGLVVVDELHMIGEGSRGATLEMT
                                                   ::::::::::::::::
CCDS75 --------------------------------------------LHMIGEGSRGATLEMT
                                                   400       410   

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 LAKILYTSKTTQIIGMSATLNNVEDLQKFLQAEYYTSQFRPVELKEYLKINDTIYEVDSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LAKILYTSKTTQIIGMSATLNNVEDLQKFLQAEYYTSQFRPVELKEYLKINDTIYEVDSK
           420       430       440       450       460       470   

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 AENGMTFSRLLNYKYSDTLKKMDPDHLVALVTEVIPNYSCLVFCPSKKNCENVAEMICKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AENGMTFSRLLNYKYSDTLKKMDPDHLVALVTEVIPNYSCLVFCPSKKNCENVAEMICKF
           480       490       500       510       520       530   

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 LSKEYLKHKEKEKCEVIKNLKNIGNGNLCPVLKRTIPFGVAYHHSGLTSDERKLLEEAYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LSKEYLKHKEKEKCEVIKNLKNIGNGNLCPVLKRTIPFGVAYHHSGLTSDERKLLEEAYS
           540       550       560       570       580       590   

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 TGVLCLFTCTSTLAAGVNLPARRVILRAPYVAKEFLKRNQYKQMIGRAGRAGIDTIGESI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TGVLCLFTCTSTLAAGVNLPARRVILRAPYVAKEFLKRNQYKQMIGRAGRAGIDTIGESI
           600       610       620       630       640       650   

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 LILQEKDKQQVLELITKPLENCYSHLVQEFTKGIQTLFLSLIGLKIATNLDDIYHFMNGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LILQEKDKQQVLELITKPLENCYSHLVQEFTKGIQTLFLSLIGLKIATNLDDIYHFMNGT
           660       670       680       690       700       710   

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 FFGVQQKVLLKEKSLWEITVESLRYLTEKGLLQKDTIYKSEEEVQYNFHITKLGRASFKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FFGVQQKVLLKEKSLWEITVESLRYLTEKGLLQKDTIYKSEEEVQYNFHITKLGRASFKG
           720       730       740       750       760       770   

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 TIDLAYCDILYRDLKKGLEGLVLESLLHLIYLTTPYDLVSQCNPDWMIYFRQFSQLSPAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TIDLAYCDILYRDLKKGLEGLVLESLLHLIYLTTPYDLVSQCNPDWMIYFRQFSQLSPAE
           780       790       800       810       820       830   

              910       920       930       940       950       960
pF1KE2 QNVAAILGVSESFIGKKASGQAIGKKVDKNVVNRLYLSFVLYTLLKETNIWTVSEKFNMP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QNVAAILGVSESFIGKKASGQAIGKKVDKNVVNRLYLSFVLYTLLKETNIWTVSEKFNMP
           840       850       860       870       880       890   

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE2 RGYIQNLLTGTASFSSCVLHFCEELEEFWVYRALLVELTKKLTYCVKAELIPLMEVTGVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RGYIQNLLTGTASFSSCVLHFCEELEEFWVYRALLVELTKKLTYCVKAELIPLMEVTGVL
           900       910       920       930       940       950   

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE2 EGRAKQLYSAGYKSLMHLANANPEVLVRTIDHLSRRQAKQIVSSAKMLLHEKAEALQEEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EGRAKQLYSAGYKSLMHLANANPEVLVRTIDHLSRRQAKQIVSSAKMLLHEKAEALQEEV
           960       970       980       990      1000      1010   

             1090      1100 
pF1KE2 EELLRLPSDFPGAVASSTDKA
       :::::::::::::::::::::
CCDS75 EELLRLPSDFPGAVASSTDKA
          1020      1030    

>>CCDS33833.1 POLQ gene_id:10721|Hs108|chr3               (2590 aa)
 initn: 1220 init1: 369 opt: 700  Z-score: 805.8  bits: 162.1 E(32554): 1.5e-38
Smith-Waterman score: 1436; 33.7% identity (65.1% similar) in 875 aa overlap (253-1072:4-856)

            230       240       250       260       270       280  
pF1KE2 WKSSSHNTVNEELPHNCIEQPQQNDESSSKVRTSSDMNRRKSIKDHLKNAMTGNAKAQTP
                                     .: :.   : .: .: ...  .:. .. .:
CCDS33                            MNLLRRSGKRRRSESGSDSFSG--SGGDSSASP
                                          10        20          30 

                  290       300       310         320       330    
pF1KE2 IF------SRSKQLKDTLLSEEINVAKKTVESSSND--LGPFYSLPSKVRDLYAQFKGIE
        :      :    :   : .   .  : :: .   :  :   ..::. : . : .: :..
CCDS33 QFLSGSVLSPPPGLGRCLKAAAAGECKPTVPDYERDKLLLANWGLPKAVLEKYHSF-GVK
              40        50        60        70        80         90

          340       350       360       370       380       390    
pF1KE2 KLYEWQHTCLTLNSVQERKNLIYSLPTSGGKTLVAEILMLQELLCCRKDVLMILPYVAIV
       :..:::  :: :..: : :::.:: :::.:::::::.:.:...:  :: .:.:::.:...
CCDS33 KMFEWQAECLLLGQVLEGKNLVYSAPTSAGKTLVAELLILKRVLEMRKKALFILPFVSVA
              100       110       120       130       140       150

          400       410       420       430       440       450    
pF1KE2 QEKISGLSSFGIELGFFVEEYAGSKGRFPPTKRREKKSLYIATIEKGHSLVNSLIETGRI
       .::   :.:.  :.:. :. : :: .   :...  . .. . :::....:.: ::: ...
CCDS33 KEKKYYLQSLFQEVGIKVDGYMGSTS---PSRHFSSLDIAVCTIERANGLINRLIEENKM
              160       170          180       190       200       

          460       470       480       490                        
pF1KE2 DSLGLVVVDELHMIGEGSRGATLEMTLAKILYTSKTT---------------QIIGMSAT
       : ::.::::::::.:.. ::  ::. :.:: : .. .               ::.:::::
CCDS33 DLLGMVVVDELHMLGDSHRGYLLELLLTKICYITRKSASCQADLASSLSNAVQIVGMSAT
       210       220       230       240       250       260       

     500       510       520       530       540       550         
pF1KE2 LNNVEDLQKFLQAEYYTSQFRPVELKEYLKINDTIYEVDSKAENGMTFSRLLNYKYSDTL
       : :.: . ..:.:: : ..:::: : : .:....::  ::. .    :  .:. :     
CCDS33 LPNLELVASWLNAELYHTDFRPVPLLESVKVGNSIY--DSSMKLVREFEPMLQVKG----
       270       280       290       300         310       320     

     560       570        580       590        600            610  
pF1KE2 KKMDPDHLVALVTEVI-PNYSCLVFCPSKKNCENVAEMICK-FLSKEY-----LKHKE--
          : ::.:.:  :.:  :.: :.:::::: ::..:..: . : . ..     .: .:  
CCDS33 ---DEDHVVSLCYETICDNHSVLLFCPSKKWCEKLADIIAREFYNLHHQAEGLVKPSECP
                330       340       350       360       370        

                    620       630       640       650       660    
pF1KE2 ------KEKCEVIKNLKNIGNGNLCPVLKRTIPFGVAYHHSGLTSDERKLLEEAYSTGVL
             ::  ::. .:. . .: :  ::..:.:.:::.::.::: .:: ..: :.  :..
CCDS33 PVILEQKELLEVMDQLRRLPSG-LDSVLQKTVPWGVAFHHAGLTFEERDIIEGAFRQGLI
      380       390       400        410       420       430       

          670       680       690       700       710       720    
pF1KE2 CLFTCTSTLAAGVNLPARRVILRAPYVAKEFLKRNQYKQMIGRAGRAGIDTIGESILILQ
        ... ::::..::::::::::.:.:  . . :    ::::.::::: :.::.:::::: .
CCDS33 RVLAATSTLSSGVNLPARRVIIRTPIFGGRPLDILTYKQMVGRAGRKGVDTVGESILICK
       440       450       460       470       480       490       

          730          740       750         760       770         
pF1KE2 EKDKQQVLELIT---KPLENCYSHLVQEFTKG--IQTLFLSLIGLKIATNLDDIYHFMNG
       ...:.. . :.    ::...: ..   : . :  :....  ..:  .:.. .:.. .   
CCDS33 NSEKSKGIALLQGSLKPVRSCLQRREGEEVTGSMIRAILEIIVG-GVASTSQDMHTYAAC
       500       510       520       530       540        550      

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pF1KE2 TFFGV-----QQKVLLKEKSLWEITVES-LRYLTEKGLLQKDTIYKSEEEVQYNFHITKL
       ::...     .: .  ...:.   ..:. . .: :. ..:.     . :   :  : :.:
CCDS33 TFLAASMKEGKQGIQRNQESVQLGAIEACVMWLLENEFIQSTEASDGTEGKVY--HPTHL
        560       570       580       590       600         610    

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pF1KE2 GRASFKGTIDLAYCDILYRDLKKGLEGLVLESLLHLIYLTTPYDLVSQCNPDWMIYFRQF
       : :....... :    .. ::.....:.:::. ::..::.::. . .  . ::. .:  .
CCDS33 GSATLSSSLSPADTLDIFADLQRAMKGFVLENDLHILYLVTPM-FEDWTTIDWYRFFCLW
          620       630       640       650        660       670   

           900       910       920       930           940         
pF1KE2 SQLSPAEQNVAAILGVSESFIGKKASGQAIGKKVDKN----VVNRLYLSFVLYTLLKETN
        .:  . . :: ..:: :.:... ..:.....   ..    . .:.. :.::  :..:. 
CCDS33 EKLPTSMKRVAELVGVEEGFLARCVKGKVVARTERQHRQMAIHKRFFTSLVLLDLISEVP
           680       690       700       710       720       730   

     950       960       970       980        990      1000        
pF1KE2 IWTVSEKFNMPRGYIQNLLTGTASFSSCVLHFCEELEEFW-VYRALLVELTKKLTYCVKA
       .  ...:..  :: ::.:  ..: ... .  : ..:   :  .. :: .. :.::. .. 
CCDS33 LREINQKYGCNRGQIQSLQQSAAVYAGMITVFSNRLG--WHNMELLLSQFQKRLTFGIQR
           740       750       760       770         780       790 

     1010      1020      1030      1040       1050      1060       
pF1KE2 ELIPLMEVTGVLEGRAKQLYSAGYKSLMHLANANP-EVLVRTIDHLSRRQAKQIVSSAKM
       ::  :..:. .   ::. ::..:....  :: ::  :: :   . .  ..:.. :.  . 
CCDS33 ELCDLVRVSLLNAQRARVLYASGFHTVADLARANIVEVEVILKNAVPFKSARKAVDEEEE
             800       810       820       830       840       850 

      1070      1080      1090      1100                           
pF1KE2 LLHEKAEALQEEVEELLRLPSDFPGAVASSTDKA                          
        ..:.                                                       
CCDS33 AVEERRNMRTIWVTGRKGLTEREAAALIVEEARMILQQDLVEMGVQWNPCALLHSSTCSL
             860       870       880       890       900       910 

>>CCDS30769.2 HFM1 gene_id:164045|Hs108|chr1              (1435 aa)
 initn: 323 init1: 152 opt: 374  Z-score: 428.1  bits: 91.4 E(32554): 1.6e-17
Smith-Waterman score: 431; 22.4% identity (56.3% similar) in 758 aa overlap (122-835:75-782)

             100       110       120       130       140           
pF1KE2 TDRGVGDQPNDSEVDMFGDYDSFTENSFIAQVDDLEQKYMQLPEHKKHA--TD-FATENL
                                     .. . . .:..: .. . :  .: .  ..:
CCDS30 IPDTQELEEELESHKLLGQEKRPKMLTSNLKITNEDTNYISLTQKFQFAFPSDKYEQDDL
           50        60        70        80        90       100    

      150       160       170       180       190       200        
pF1KE2 CSESIKNKLSITTIGNLTELQTDKHTENQSGYEGVTIEPGADLLYDVPSSQAIYF-ENLQ
         :.. :.      :.::   .... .:. : :   : :  ..  :   .. . : :.  
CCDS30 NLEGVGNNDLSHIAGKLT--YASQKYKNHIGTE---IAPEKSVPDD---TKLVNFAEDKG
          110       120         130          140          150      

       210       220        230       240       250       260      
pF1KE2 NSSNDLGDHSMKERD-WKSSSHNTVNEELPHNCIEQPQQNDESSSKVRTSSDMNRRKSIK
       .:.. .  . .:  :  ..:.... ::   :    .  :.. ...: :. :  : .....
CCDS30 ESTSVFRKRLFKISDNIHGSAYSNDNELDSHIGSVKIVQTEMNKGKSRNYS--NSKQKFQ
        160       170       180       190       200         210    

        270       280       290       300          310          320
pF1KE2 DHLKNAMTGNAKAQTPIFSRSKQLKDTLLSEEINVA---KKTVESSSNDLGPFYS---LP
        .  :..:.:       :: :.  .  . .  ..::   .   : . : :: . .   .:
CCDS30 -YSANVFTANNA-----FSASEIGEGMFKAPSFSVAFQPHDIQEVTENGLGSLKAVTEIP
           220            230       240       250       260        

              330       340       350       360       370       380
pF1KE2 SKVRDLYAQFKGIEKLYEWQHTCLTLNSVQERKNLIYSLPTSGGKTLVAEILMLQELLCC
       .: :... .:      ... ..    . .   .:..   ::..:::.: :. . . :.  
CCDS30 AKFRSIFKEFP----YFNYIQSKAFDDLLYTDRNFVICAPTGSGKTVVFELAITRLLMEV
      270           280       290       300       310       320    

                   390       400        410       420       430    
pF1KE2 -----RKDVLMILPYVAIVQEKISGLS-SFGIELGFFVEEYAGSKGRFPPTKRREKKSLY
               .... :  :. .....  . .::  .:.  .: .:.   .    . ..  . 
CCDS30 PLPWLNIKIVYMAPIKALCSQRFDDWKEKFG-PIGLNCKELTGDT-VMDDLFEIQHAHII
          330       340       350        360        370       380  

          440       450       460       470       480       490    
pF1KE2 IATIEKGHSLVNSLIETGRIDSLGLVVVDELHMIGEGSRGATLEMTLAKILYTSKTTQ--
       ..: ::  :.. .  ... .. . : ..::.:.. . .:: :::......  .....:  
CCDS30 MTTPEKWDSMTRKWRDNSLVQLVRLFLIDEVHIVKDENRGPTLEVVVSRMKTVQSVSQTL
            390       400       410       420       430       440  

                      500       510        520       530        540
pF1KE2 ----------IIGMSATLNNVEDLQKFLQ-AEYYTSQFRPVELKEYLKINDTIYEVD-SK
                 ....:::. :.::. ..:. .:  .  ..  : .. .:.. ..     :.
CCDS30 KNTSTAIPMRFVAVSATIPNAEDIAEWLSDGERPAVCLKMDESHRPVKLQKVVLGFPCSS
            450       460       470       480       490       500  

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 AENGMTFSRLLNYKYSDTLKKMDPDHLVALVTEVIPNYSCLVFCPSKKNCENVAEMICKF
        .. . :.  :::: ..         .. . ..  :.   :::: ..:. ...: .. : 
CCDS30 NQTEFKFDLTLNYKIAS---------VIQMYSDQKPT---LVFCATRKGVQQAASVLVK-
            510                520       530          540          

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 LSKEYLKHKEKEKCEVIKNLKNIGNGNLCPVLKRTIPFGVAYHHSGLTSDERKLLEEAYS
        .:  .  ..:.. .  :   .. ...:  .::     :.::::.:.  ..::..: :..
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