Result of FASTA (ccds) for pFN21AE5654
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE5654, 543 aa
  1>>>pF1KE5654 543 - 543 aa - 543 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3031+/-0.000785; mu= 13.4012+/- 0.047
 mean_var=75.2787+/-15.186, 0's: 0 Z-trim(108.9): 14  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.147822
 statistics sampled from 10532 (10540) to 10532 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.686), E-opt: 0.2 (0.324), width:  16
 Scan time:  3.020

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3602.1 HPSE gene_id:10855|Hs108|chr4           ( 543) 3628 783.0       0
CCDS54774.1 HPSE gene_id:10855|Hs108|chr4          ( 469) 2189 476.1 3.9e-134
CCDS56337.1 HPSE gene_id:10855|Hs108|chr4          ( 485) 2133 464.2 1.6e-130
CCDS53568.1 HPSE2 gene_id:60495|Hs108|chr10        ( 548)  978 217.9 2.5e-56
CCDS7477.1 HPSE2 gene_id:60495|Hs108|chr10         ( 592)  978 217.9 2.7e-56
CCDS53566.1 HPSE2 gene_id:60495|Hs108|chr10        ( 480)  689 156.2 7.9e-38
CCDS53567.1 HPSE2 gene_id:60495|Hs108|chr10        ( 534)  687 155.8 1.2e-37


>>CCDS3602.1 HPSE gene_id:10855|Hs108|chr4                (543 aa)
 initn: 3628 init1: 3628 opt: 3628  Z-score: 4179.1  bits: 783.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3628; 99.8% identity (100.0% similar) in 543 aa overlap (1-543:1-543)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MLLRSKPALPPPLMLLLLGPLGPLSPGALPRPAQAQDVVDLDFFTQEPLHLVSPSFLSVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 MLLRSKPALPPPLMLLLLGPLGPLSPGALPRPAQAQDVVDLDFFTQEPLHLVSPSFLSVT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 IDANLATDPRFLILLGSPKLRTLARGLSPAYLRFGGTKTDFLIFDPKKESTFEERSYWQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 IDANLATDPRFLILLGSPKLRTLARGLSPAYLRFGGTKTDFLIFDPKKESTFEERSYWQS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 QVNQDICKYGSIPPDVEEKLRLEWPYQEQLLLREHYQKKFKNSTYSRSSVDVLYTFANCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 QVNQDICKYGSIPPDVEEKLRLEWPYQEQLLLREHYQKKFKNSTYSRSSVDVLYTFANCS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 GLDLIFGLNALLRTADLQWNSSNAQLLLDYCSSKGYNISWELGNEPNSFLKKADIFINGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 GLDLIFGLNALLRTADLQWNSSNAQLLLDYCSSKGYNISWELGNEPNSFLKKADIFINGS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 QLGEDFIQLHKLLRKSTFKNAKLYGPDVGQPRRKTAKMLKSFLKAGGEVIDSVTWHHYYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 QLGEDFIQLHKLLRKSTFKNAKLYGPDVGQPRRKTAKMLKSFLKAGGEVIDSVTWHHYYL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 NGRTATREDFLNPDVLDIFISSVQKVFQVVESTRPGKKVWLGETSSAYGGGAPLLSDTFA
       ::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 NGRTATKEDFLNPDVLDIFISSVQKVFQVVESTRPGKKVWLGETSSAYGGGAPLLSDTFA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 AGFMWLDKLGLSARMGIEVVMRQVFFGAGNYHLVDENFDPLPDYWLSLLFKKLVGTKVLM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 AGFMWLDKLGLSARMGIEVVMRQVFFGAGNYHLVDENFDPLPDYWLSLLFKKLVGTKVLM
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 ASVQGSKRRKLRVYLHCTNTDNPRYKEGDLTLYAINLHNVTKYLRLPYPFSNKQVDKYLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 ASVQGSKRRKLRVYLHCTNTDNPRYKEGDLTLYAINLHNVTKYLRLPYPFSNKQVDKYLL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE5 RPLGPHGLLSKSVQLNGLTLKMVDDQTLPPLMEKPLRPGSSLGLPAFSYSFFVIRNAKVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 RPLGPHGLLSKSVQLNGLTLKMVDDQTLPPLMEKPLRPGSSLGLPAFSYSFFVIRNAKVA
              490       500       510       520       530       540

          
pF1KE5 ACI
       :::
CCDS36 ACI
          

>>CCDS54774.1 HPSE gene_id:10855|Hs108|chr4               (469 aa)
 initn: 3111 init1: 2189 opt: 2189  Z-score: 2521.6  bits: 476.1 E(32554): 3.9e-134
Smith-Waterman score: 2967; 86.2% identity (86.4% similar) in 543 aa overlap (1-543:1-469)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MLLRSKPALPPPLMLLLLGPLGPLSPGALPRPAQAQDVVDLDFFTQEPLHLVSPSFLSVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MLLRSKPALPPPLMLLLLGPLGPLSPGALPRPAQAQDVVDLDFFTQEPLHLVSPSFLSVT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 IDANLATDPRFLILLGSPKLRTLARGLSPAYLRFGGTKTDFLIFDPKKESTFEERSYWQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IDANLATDPRFLILLGSPKLRTLARGLSPAYLRFGGTKTDFLIFDPKKESTFEERSYWQS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 QVNQDICKYGSIPPDVEEKLRLEWPYQEQLLLREHYQKKFKNSTYSRSSVDVLYTFANCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QVNQDICKYGSIPPDVEEKLRLEWPYQEQLLLREHYQKKFKNSTYSRSSVDVLYTFANCS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 GLDLIFGLNALLRTADLQWNSSNAQLLLDYCSSKGYNISWELGNEPNSFLKKADIFINGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GLDLIFGLNALLRTADLQWNSSNAQLLLDYCSSKGYNISWELGNEPNSFLKKADIFINGS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 QLGEDFIQLHKLLRKSTFKNAKLYGPDVGQPRRKTAKMLKSFLKAGGEVIDSVTWHHYYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QLGEDFIQLHKLLRKSTFKNAKLYGPDVGQPRRKTAKMLKSFLKAGGEVIDSVTWHHYYL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 NGRTATREDFLNPDVLDIFISSVQKVFQVVESTRPGKKVWLGETSSAYGGGAPLLSDTFA
       ::::::.:::::::::::::::::::::                                
CCDS54 NGRTATKEDFLNPDVLDIFISSVQKVFQ--------------------------------
              310       320                                        

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 AGFMWLDKLGLSARMGIEVVMRQVFFGAGNYHLVDENFDPLPDYWLSLLFKKLVGTKVLM
                                                 ::::::::::::::::::
CCDS54 ------------------------------------------DYWLSLLFKKLVGTKVLM
                                                330       340      

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 ASVQGSKRRKLRVYLHCTNTDNPRYKEGDLTLYAINLHNVTKYLRLPYPFSNKQVDKYLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ASVQGSKRRKLRVYLHCTNTDNPRYKEGDLTLYAINLHNVTKYLRLPYPFSNKQVDKYLL
        350       360       370       380       390       400      

              490       500       510       520       530       540
pF1KE5 RPLGPHGLLSKSVQLNGLTLKMVDDQTLPPLMEKPLRPGSSLGLPAFSYSFFVIRNAKVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RPLGPHGLLSKSVQLNGLTLKMVDDQTLPPLMEKPLRPGSSLGLPAFSYSFFVIRNAKVA
        410       420       430       440       450       460      

          
pF1KE5 ACI
       :::
CCDS54 ACI
          

>>CCDS56337.1 HPSE gene_id:10855|Hs108|chr4               (485 aa)
 initn: 2118 init1: 2118 opt: 2133  Z-score: 2456.8  bits: 464.2 E(32554): 1.6e-130
Smith-Waterman score: 3112; 89.0% identity (89.3% similar) in 543 aa overlap (1-543:1-485)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MLLRSKPALPPPLMLLLLGPLGPLSPGALPRPAQAQDVVDLDFFTQEPLHLVSPSFLSVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MLLRSKPALPPPLMLLLLGPLGPLSPGALPRPAQAQDVVDLDFFTQEPLHLVSPSFLSVT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 IDANLATDPRFLILLGSPKLRTLARGLSPAYLRFGGTKTDFLIFDPKKESTFEERSYWQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IDANLATDPRFLILLGSPKLRTLARGLSPAYLRFGGTKTDFLIFDPKKESTFEERSYWQS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 QVNQDICKYGSIPPDVEEKLRLEWPYQEQLLLREHYQKKFKNSTYSRSSVDVLYTFANCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.             
CCDS56 QVNQDICKYGSIPPDVEEKLRLEWPYQEQLLLREHYQKKFKNSTYSK-------------
              130       140       150       160                    

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 GLDLIFGLNALLRTADLQWNSSNAQLLLDYCSSKGYNISWELGNEPNSFLKKADIFINGS
                                                    :::::::::::::::
CCDS56 ---------------------------------------------PNSFLKKADIFINGS
                                                    170       180  

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 QLGEDFIQLHKLLRKSTFKNAKLYGPDVGQPRRKTAKMLKSFLKAGGEVIDSVTWHHYYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QLGEDFIQLHKLLRKSTFKNAKLYGPDVGQPRRKTAKMLKSFLKAGGEVIDSVTWHHYYL
            190       200       210       220       230       240  

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 NGRTATREDFLNPDVLDIFISSVQKVFQVVESTRPGKKVWLGETSSAYGGGAPLLSDTFA
       ::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 NGRTATKEDFLNPDVLDIFISSVQKVFQVVESTRPGKKVWLGETSSAYGGGAPLLSDTFA
            250       260       270       280       290       300  

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 AGFMWLDKLGLSARMGIEVVMRQVFFGAGNYHLVDENFDPLPDYWLSLLFKKLVGTKVLM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 AGFMWLDKLGLSARMGIEVVMRQVFFGAGNYHLVDENFDPLPDYWLSLLFKKLVGTKVLM
            310       320       330       340       350       360  

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 ASVQGSKRRKLRVYLHCTNTDNPRYKEGDLTLYAINLHNVTKYLRLPYPFSNKQVDKYLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ASVQGSKRRKLRVYLHCTNTDNPRYKEGDLTLYAINLHNVTKYLRLPYPFSNKQVDKYLL
            370       380       390       400       410       420  

              490       500       510       520       530       540
pF1KE5 RPLGPHGLLSKSVQLNGLTLKMVDDQTLPPLMEKPLRPGSSLGLPAFSYSFFVIRNAKVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RPLGPHGLLSKSVQLNGLTLKMVDDQTLPPLMEKPLRPGSSLGLPAFSYSFFVIRNAKVA
            430       440       450       460       470       480  

          
pF1KE5 ACI
       :::
CCDS56 ACI
          

>>CCDS53568.1 HPSE2 gene_id:60495|Hs108|chr10             (548 aa)
 initn: 1279 init1: 605 opt: 978  Z-score: 1124.7  bits: 217.9 E(32554): 2.5e-56
Smith-Waterman score: 1325; 43.4% identity (68.8% similar) in 509 aa overlap (13-492:33-539)

                                 10        20        30          40
pF1KE5                   MLLRSKPALPPPLMLLLLGPLGPLSPGALPRPA--QAQDVVD
                                     : : : .  :   :  . : :  . . .. 
CCDS53 VLCAFPEAMPSSNSRPPACLAPGALYLALLLHLSLSSQAGDRRPLPVDRAAGLKEKTLIL
             10        20        30        40        50        60  

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pF1KE5 LDFFTQEPLHLVSPSFLSVTIDANLATDPRFLILLGSPKLRTLARGLSPAYLRFGGTKTD
       ::  :..:.. :. .:::. .: ..  :  .: .:.: .: :::::::::.::::: .::
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       :: :    .: :        .  ..: .. : .:.       :: ..  :::  .:. : 
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         : .: ::.:.... ..:   .  :.: ::.::.:::: :::.:::: :. . .::::.
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pF1KE5 AQLLLDYCSSKGYNISWELGNEPNSFLKKADIFINGSQLGEDFIQLHKLLRK-STFKNAK
       :  :: : .:: ::::::::::::..       .::::::.:.:::..::.    .. :.
CCDS53 ALSLLKYSASKKYNISWELGNEPNNYRTMHGRAVNGSQLGKDYIQLKSLLQPIRIYSRAS
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       ::::..:.::...  .: .:.:..: ..:.:::.: :..::..   :::.  .:: . ..
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       ..:. .::..  ::::.::  . .. .::.  :::..::::.::. ::. : .::.::.:
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pF1KE5 QVFFGAGNYHLVDENFDPLPDYWLSLLFKKLVGTKVLMASVQGSKRR---------KLRV
       . ::  :  ::::.::.::::::::::.:.:.: ::: . : : .:.         :::.
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CCDS53 RCQYCGII                                          
                                                         

>>CCDS7477.1 HPSE2 gene_id:60495|Hs108|chr10              (592 aa)
 initn: 1099 init1: 605 opt: 978  Z-score: 1124.2  bits: 217.9 E(32554): 2.7e-56
Smith-Waterman score: 1499; 44.2% identity (69.2% similar) in 559 aa overlap (13-542:33-589)

                                 10        20        30          40
pF1KE5                   MLLRSKPALPPPLMLLLLGPLGPLSPGALPRPA--QAQDVVD
                                     : : : .  :   :  . : :  . . .. 
CCDS74 VLCAFPEAMPSSNSRPPACLAPGALYLALLLHLSLSSQAGDRRPLPVDRAAGLKEKTLIL
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pF1KE5 LDFFTQEPLHLVSPSFLSVTIDANLATDPRFLILLGSPKLRTLARGLSPAYLRFGGTKTD
       ::  :..:.. :. .:::. .: ..  :  .: .:.: .: :::::::::.::::: .::
CCDS74 LDVSTKNPVRTVNENFLSLQLDPSIIHDG-WLDFLSSKRLVTLARGLSPAFLRFGGKRTD
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pF1KE5 FLIF----DPKKES-----TFEERSYWQSQVNQDI-------CKYGSIPPDVEEKLRLEW
       :: :    .: :        .  ..: .. : .:.       :: ..  :::  .:. : 
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pF1KE5 PYQEQL-LLREHYQKKFKNSTYSRSSVDVLYTFANCSGLDLIFGLNALLRTADLQWNSSN
         : .: ::.:.... ..:   .  :.: ::.::.:::: :::.:::: :. . .::::.
CCDS74 AAQMHLVLLKEQFSNTYSNLILTARSLDKLYNFADCSGLHLIFALNALRRNPNNSWNSSS
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pF1KE5 AQLLLDYCSSKGYNISWELGNEPNSFLKKADIFINGSQLGEDFIQLHKLLRK-STFKNAK
       :  :: : .:: ::::::::::::..       .::::::.:.:::..::.    .. :.
CCDS74 ALSLLKYSASKKYNISWELGNEPNNYRTMHGRAVNGSQLGKDYIQLKSLLQPIRIYSRAS
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       ::::..:.::...  .: .:.:..: ..:.:::.: :..::..   :::.  .:: . ..
CCDS74 LYGPNIGRPRKNVIALLDGFMKVAGSTVDAVTWQHCYIDGRVVKVMDFLKTRLLDTLSDQ
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pF1KE5 VQKVFQVVESTRPGKKVWLGETSSAYGGGAPLLSDTFAAGFMWLDKLGLSARMGIEVVMR
       ..:. .::..  ::::.::  . .. .::.  :::..::::.::. ::. : .::.::.:
CCDS74 IRKIQKVVNTYTPGKKIWLEGVVTTSAGGTNNLSDSYAAGFLWLNTLGMLANQGIDVVIR
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pF1KE5 QVFFGAGNYHLVDENFDPLPDYWLSLLFKKLVGTKVLMASVQGSKRR---------KLRV
       . ::  :  ::::.::.::::::::::.:.:.: ::: . : : .:.         :::.
CCDS74 HSFFDHGYNHLVDQNFNPLPDYWLSLLYKRLIGPKVLAVHVAGLQRKPRPGRVIRDKLRI
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pF1KE5 YLHCTNTDNPRYKEGDLTLYAINLHNVTKYLRLPYPFSNKQVDKYLLRPLGPHGLLSKSV
       : ::::  :  : .:..::. ::::   : ..:   . .: : .:::.: : .:: ::::
CCDS74 YAHCTNHHNHNYVRGSITLFIINLHRSRKKIKLAGTLRDKLVHQYLLQPYGQEGLKSKSV
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pF1KE5 QLNGLTLKMVDDQTLPPLMEKPLRPGSSLGLPAFSYSFFVIRNAKVAACI  
       ::::  : :::: ::: :  .::: : .: .:  ...:.:..:... ::   
CCDS74 QLNGQPLVMVDDGTLPELKPRPLRAGRTLVIPPVTMGFYVVKNVNALACRYR
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>>CCDS53566.1 HPSE2 gene_id:60495|Hs108|chr10             (480 aa)
 initn: 804 init1: 605 opt: 689  Z-score: 792.6  bits: 156.2 E(32554): 7.9e-38
Smith-Waterman score: 1055; 36.7% identity (59.0% similar) in 542 aa overlap (13-542:33-477)

                                 10        20        30          40
pF1KE5                   MLLRSKPALPPPLMLLLLGPLGPLSPGALPRPA--QAQDVVD
                                     : : : .  :   :  . : :  . . .. 
CCDS53 VLCAFPEAMPSSNSRPPACLAPGALYLALLLHLSLSSQAGDRRPLPVDRAAGLKEKTLIL
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pF1KE5 LDFFTQEPLHLVSPSFLSVTIDANLATDPRFLILLGSPKLRTLARGLSPAYLRFGGTKTD
       ::  :..:.. :. .:::. .: ..  :  .: .:.: .: :::::::::.::::: .::
CCDS53 LDVSTKNPVRTVNENFLSLQLDPSIIHDG-WLDFLSSKRLVTLARGLSPAFLRFGGKRTD
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pF1KE5 FLIFDPKKESTFEERSYWQSQVNQDICKYGSIPPDVEEKLRLEWPYQEQLLLREHYQKKF
       :: :.       . :.  .:.        :.  ::                   .: :..
CCDS53 FLQFQ-------NLRNPAKSR--------GGPGPD-------------------YYLKNY
                    130               140                          

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pF1KE5 KNSTYSRSSVDVLYTFANCSGLDLIFGLNALLRTADLQWNSSNAQLLLDYCSSKGYNISW
       ..                                                          
CCDS53 ED----------------------------------------------------------
                                                                   

              230       240       250        260       270         
pF1KE5 ELGNEPNSFLKKADIFINGSQLGEDFIQLHKLLRK-STFKNAKLYGPDVGQPRRKTAKML
           :::..       .::::::.:.:::..::.    .. :.::::..:.::...  .:
CCDS53 ----EPNNYRTMHGRAVNGSQLGKDYIQLKSLLQPIRIYSRASLYGPNIGRPRKNVIALL
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pF1KE5 KSFLKAGGEVIDSVTWHHYYLNGRTATREDFLNPDVLDIFISSVQKVFQVVESTRPGKKV
        .:.:..: ..:.:::.: :..::..   :::.  .:: . ....:. .::..  ::::.
CCDS53 DGFMKVAGSTVDAVTWQHCYIDGRVVKVMDFLKTRLLDTLSDQIRKIQKVVNTYTPGKKI
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pF1KE5 WLGETSSAYGGGAPLLSDTFAAGFMWLDKLGLSARMGIEVVMRQVFFGAGNYHLVDENFD
       ::  . .. .::.  :::..::::.::. ::. : .::.::.:. ::  :  ::::.::.
CCDS53 WLEGVVTTSAGGTNNLSDSYAAGFLWLNTLGMLANQGIDVVIRHSFFDHGYNHLVDQNFN
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pF1KE5 PLPDYWLSLLFKKLVGTKVLMASVQGSKRR---------KLRVYLHCTNTDNPRYKEGDL
       ::::::::::.:.:.: ::: . : : .:.         :::.: ::::  :  : .:..
CCDS53 PLPDYWLSLLYKRLIGPKVLAVHVAGLQRKPRPGRVIRDKLRIYAHCTNHHNHNYVRGSI
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pF1KE5 TLYAINLHNVTKYLRLPYPFSNKQVDKYLLRPLGPHGLLSKSVQLNGLTLKMVDDQTLPP
       ::. ::::   : ..:   . .: : .:::.: : .:: ::::::::  : :::: ::: 
CCDS53 TLFIINLHRSRKKIKLAGTLRDKLVHQYLLQPYGQEGLKSKSVQLNGQPLVMVDDGTLPE
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              520       530       540     
pF1KE5 LMEKPLRPGSSLGLPAFSYSFFVIRNAKVAACI  
       :  .::: : .: .:  ...:.:..:... ::   
CCDS53 LKPRPLRAGRTLVIPPVTMGFYVVKNVNALACRYR
         450       460       470       480

>>CCDS53567.1 HPSE2 gene_id:60495|Hs108|chr10             (534 aa)
 initn: 802 init1: 605 opt: 687  Z-score: 789.5  bits: 155.8 E(32554): 1.2e-37
Smith-Waterman score: 1162; 38.4% identity (64.6% similar) in 542 aa overlap (13-542:33-531)

                                 10        20        30          40
pF1KE5                   MLLRSKPALPPPLMLLLLGPLGPLSPGALPRPA--QAQDVVD
                                     : : : .  :   :  . : :  . . .. 
CCDS53 VLCAFPEAMPSSNSRPPACLAPGALYLALLLHLSLSSQAGDRRPLPVDRAAGLKEKTLIL
             10        20        30        40        50        60  

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pF1KE5 LDFFTQEPLHLVSPSFLSVTIDANLATDPRFLILLGSPKLRTLARGLSPAYLRFGGTKTD
       ::  :..:.. :. .:::. .: ..  :  .: .:.: .: :::::::::.::::: .::
CCDS53 LDVSTKNPVRTVNENFLSLQLDPSIIHDG-WLDFLSSKRLVTLARGLSPAFLRFGGKRTD
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pF1KE5 FLIFDPKKESTFEERSYWQSQVNQDICKYGSIPPDVEEKLRLEWPYQEQLLLREHYQKKF
       :: :.       . :.  .:.        :.  ::   :      :.....  .    : 
CCDS53 FLQFQ-------NLRNPAKSR--------GGPGPDYYLK-----NYEDDIVRSDVALDKQ
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pF1KE5 KNSTYSRSSVDVLYTFANCSGLDLIFGLNALLRTADLQWNSSNAQLLLDYCSSKGYNISW
       :.   ..   ::.  .   .. .. .   .::.    :.... ..:.:            
CCDS53 KGCKIAQHP-DVMLELQREKAAQMHL---VLLKE---QFSNTYSNLIL------------
             170        180          190          200              

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pF1KE5 ELGNEPNSFLKKADIFINGSQLGEDFIQLHKLLRK-STFKNAKLYGPDVGQPRRKTAKML
          .:::..       .::::::.:.:::..::.    .. :.::::..:.::...  .:
CCDS53 ---TEPNNYRTMHGRAVNGSQLGKDYIQLKSLLQPIRIYSRASLYGPNIGRPRKNVIALL
               210       220       230       240       250         

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pF1KE5 KSFLKAGGEVIDSVTWHHYYLNGRTATREDFLNPDVLDIFISSVQKVFQVVESTRPGKKV
        .:.:..: ..:.:::.: :..::..   :::.  .:: . ....:. .::..  ::::.
CCDS53 DGFMKVAGSTVDAVTWQHCYIDGRVVKVMDFLKTRLLDTLSDQIRKIQKVVNTYTPGKKI
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pF1KE5 WLGETSSAYGGGAPLLSDTFAAGFMWLDKLGLSARMGIEVVMRQVFFGAGNYHLVDENFD
       ::  . .. .::.  :::..::::.::. ::. : .::.::.:. ::  :  ::::.::.
CCDS53 WLEGVVTTSAGGTNNLSDSYAAGFLWLNTLGMLANQGIDVVIRHSFFDHGYNHLVDQNFN
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pF1KE5 PLPDYWLSLLFKKLVGTKVLMASVQGSKRR---------KLRVYLHCTNTDNPRYKEGDL
       ::::::::::.:.:.: ::: . : : .:.         :::.: ::::  :  : .:..
CCDS53 PLPDYWLSLLYKRLIGPKVLAVHVAGLQRKPRPGRVIRDKLRIYAHCTNHHNHNYVRGSI
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       ::. ::::   : ..:   . .: : .:::.: : .:: ::::::::  : :::: ::: 
CCDS53 TLFIINLHRSRKKIKLAGTLRDKLVHQYLLQPYGQEGLKSKSVQLNGQPLVMVDDGTLPE
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       :  .::: : .: .:  ...:.:..:... ::   
CCDS53 LKPRPLRAGRTLVIPPVTMGFYVVKNVNALACRYR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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