Result of FASTA (ccds) for pFN21AE3422
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE3422, 493 aa
  1>>>pF1KE3422 493 - 493 aa - 493 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6256+/-0.00148; mu= 1.7138+/- 0.084
 mean_var=279.4223+/-65.156, 0's: 0 Z-trim(107.0): 668  B-trim: 258 in 1/50
 Lambda= 0.076726
 statistics sampled from 8495 (9296) to 8495 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.286), width:  16
 Scan time:  3.220

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3570.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4           ( 493) 3318 381.7 9.9e-106
CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4          ( 570) 3176 366.1 5.9e-101
CCDS47265.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5         ( 455) 1322 160.7   3e-39
CCDS47264.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5         ( 592) 1322 160.8 3.6e-39
CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14          ( 358) 1260 153.7   3e-37
CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2        ( 315) 1212 148.4 1.1e-35
CCDS73637.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14         ( 276) 1150 141.4 1.2e-33
CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX          ( 960) 1009 126.4 1.3e-28
CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX          (1030) 1009 126.5 1.4e-28
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12           ( 298)  765 98.9 8.3e-21
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17          ( 305)  765 98.9 8.5e-21
CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10           ( 297)  744 96.5 4.2e-20
CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7           ( 292)  731 95.1 1.1e-19
CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9         ( 346)  664 87.7 2.1e-17
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12          ( 523)  667 88.3 2.2e-17
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12         ( 523)  660 87.5 3.8e-17
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5            ( 346)  651 86.3 5.8e-17
CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6            ( 583)  645 85.9 1.3e-16
CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6             ( 623)  645 85.9 1.4e-16
CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6            ( 648)  645 86.0 1.4e-16
CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX          ( 496)  635 84.7 2.5e-16
CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX          ( 502)  635 84.7 2.5e-16
CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6            ( 632)  636 84.9 2.7e-16
CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX          ( 570)  635 84.8 2.7e-16
CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7          ( 423)  625 83.5 4.9e-16
CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7           ( 451)  625 83.6 5.1e-16
CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7          ( 469)  625 83.6 5.2e-16
CCDS44300.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1          ( 474)  616 82.6   1e-15
CCDS1454.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1           ( 504)  616 82.6 1.1e-15
CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2          ( 384)  610 81.8 1.4e-15
CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2         ( 400)  610 81.8 1.5e-15
CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2         ( 429)  610 81.9 1.6e-15
CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22         ( 360)  596 80.2   4e-15
CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8        ( 544)  594 80.2 6.2e-15
CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16         ( 360)  584 78.9   1e-14
CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1       ( 770)  585 79.4 1.6e-14
CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1       ( 779)  585 79.4 1.6e-14
CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1       ( 780)  585 79.4 1.6e-14
CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1       ( 783)  585 79.4 1.6e-14
CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16         ( 357)  570 77.4   3e-14
CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16         ( 379)  570 77.4 3.1e-14
CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6          ( 360)  568 77.1 3.5e-14
CCDS4818.1 MAPK13 gene_id:5603|Hs108|chr6          ( 365)  567 77.0 3.8e-14
CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1          ( 748)  572 77.9 4.1e-14
CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1          ( 782)  572 78.0 4.3e-14
CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1          ( 795)  572 78.0 4.3e-14
CCDS75628.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7          ( 340)  561 76.3 5.7e-14
CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22        ( 367)  560 76.3 6.5e-14
CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6          ( 360)  559 76.1 6.9e-14
CCDS54628.1 GSK3B gene_id:2932|Hs108|chr3          ( 420)  559 76.2 7.7e-14


>>CCDS3570.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4                (493 aa)
 initn: 3318 init1: 3318 opt: 3318  Z-score: 2011.7  bits: 381.7 E(32554): 9.9e-106
Smith-Waterman score: 3318; 100.0% identity (100.0% similar) in 493 aa overlap (1-493:1-493)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMREIKLLKQLRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMREIKLLKQLRH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 ENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQIINGIGFCHSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQIINGIGFCHSH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 NIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEVYTDYVATRWYRAPELLVGDVKYG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEVYTDYVATRWYRAPELLVGDVKYG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 KAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAGVRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAGVRL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 PEIKEREPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMDGFAERFSQEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PEIKEREPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMDGFAERFSQEL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 QLKVQKDARNVSLSKKSQNRKKEKEKDDSLVEERKTLVVQDTNADPKIKDYKLFKIKGSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QLKVQKDARNVSLSKKSQNRKKEKEKDDSLVEERKTLVVQDTNADPKIKDYKLFKIKGSK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 IDGEKAEKGNRASNASCLHDSRTSHNKIVPSTSLKDCSNVSVDHTRNPSVAIPPLTHNLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 IDGEKAEKGNRASNASCLHDSRTSHNKIVPSTSLKDCSNVSVDHTRNPSVAIPPLTHNLS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 AVAPSINSGMGTETIPIQGYRVDEKTKKCSIPFVKPNRHSPSGIYNINVTTLVSGPPLSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AVAPSINSGMGTETIPIQGYRVDEKTKKCSIPFVKPNRHSPSGIYNINVTTLVSGPPLSD
              430       440       450       460       470       480

              490   
pF1KE3 DSGADLPQMEHQH
       :::::::::::::
CCDS35 DSGADLPQMEHQH
              490   

>>CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4               (570 aa)
 initn: 3176 init1: 3176 opt: 3176  Z-score: 1926.0  bits: 366.1 E(32554): 5.9e-101
Smith-Waterman score: 3176; 100.0% identity (100.0% similar) in 474 aa overlap (1-474:1-474)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMREIKLLKQLRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMREIKLLKQLRH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 ENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQIINGIGFCHSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQIINGIGFCHSH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 NIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEVYTDYVATRWYRAPELLVGDVKYG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 NIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEVYTDYVATRWYRAPELLVGDVKYG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 KAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAGVRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAGVRL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 PEIKEREPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMDGFAERFSQEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PEIKEREPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMDGFAERFSQEL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 QLKVQKDARNVSLSKKSQNRKKEKEKDDSLVEERKTLVVQDTNADPKIKDYKLFKIKGSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QLKVQKDARNVSLSKKSQNRKKEKEKDDSLVEERKTLVVQDTNADPKIKDYKLFKIKGSK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 IDGEKAEKGNRASNASCLHDSRTSHNKIVPSTSLKDCSNVSVDHTRNPSVAIPPLTHNLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IDGEKAEKGNRASNASCLHDSRTSHNKIVPSTSLKDCSNVSVDHTRNPSVAIPPLTHNLS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 AVAPSINSGMGTETIPIQGYRVDEKTKKCSIPFVKPNRHSPSGIYNINVTTLVSGPPLSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::      
CCDS82 AVAPSINSGMGTETIPIQGYRVDEKTKKCSIPFVKPNRHSPSGIYNINVTTLVSSEKNLF
              430       440       450       460       470       480

              490                                                  
pF1KE3 DSGADLPQMEHQH                                               
                                                                   
CCDS82 WASKKRREYSRTDVRLPELNYNHLPELRALGGIARNSRLTKKESKILSESRIPSLAAIDL
              490       500       510       520       530       540

>>CCDS47265.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5              (455 aa)
 initn: 1289 init1: 1124 opt: 1322  Z-score: 818.0  bits: 160.7 E(32554): 3e-39
Smith-Waterman score: 1332; 46.9% identity (75.8% similar) in 454 aa overlap (1-430:1-449)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMREIKLLKQLRH
       :: ::.:: ::::::: ::::..:.::.::::: : :  ... :.::::::::.:::..:
CCDS47 MEMYETLGKVGEGSYGTVMKCKHKNTGQIVAIKIFYERPEQS-VNKIAMREIKFLKQFHH
               10        20        30        40         50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 ENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQIINGIGFCHSH
       ::::::.:: ..::. .:::::.:::.::.:. . .::. . ..::::::. .: . ::.
CCDS47 ENLVNLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQILRAIDYLHSN
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 NIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEVYTDYVATRWYRAPELLVGDVKYG
       ::::::::::::::::::..:::::::::::::::..:::::::::::::::.. :..::
CCDS47 NIIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTLAAPGDIYTDYVATRWYRAPELVLKDTSYG
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 KAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAGVRL
       : ::.::.::.. ::  :.: .:..::.: :..:.. .::: :. :..:.:.:.:::: :
CCDS47 KPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFSKSPIFAGVVL
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 PEIKEREPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMDGFAERFSQEL
       :.... .  ...::::. .. :... ::.:::  :   ..::::..:  ::: :.:  ::
CCDS47 PQVQHPKNARKKYPKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTRDGFIEKFMPEL
     240       250       260       270       280       290         

              310        320       330            340       350    
pF1KE3 QLKVQKDARNVSLSK-KSQNRKKEKEKDDSLVEERKTLVV-----QDTNADPKIKDYKL-
       . :. ..:.  :: : : .....: .::.  .   .::.      .. . . : :. :. 
CCDS47 KAKLLQEAKVNSLIKPKESSKENELRKDERKTVYTNTLLSSSVLGKEIEKEKKPKEIKVR
     300       310       320       330       340       350         

            360              370           380           390       
pF1KE3 -FKIKGSKIDGEKAEK-------GNRASNASCLH----DSRT----SHNKIVPSTSLKDC
        .:.::.. :  . .:       :.. .: . .:    :..       : : :::   .:
CCDS47 VIKVKGGRGDISEPKKKEYEGGLGQQDANEN-VHPMSPDTKLVTIEPPNPINPST---NC
     360       370       380       390        400       410        

       400       410        420       430       440       450      
pF1KE3 SNVSVDHTRNPSVAIPPLT-HNLSAVAPSINSGMGTETIPIQGYRVDEKTKKCSIPFVKP
       .... .   . ::..::..  : . .: ...:..                          
CCDS47 NGLKENPHCGGSVTMPPINLTNSNLMAANLSSNLFHPSVR                    
         420       430       440       450                         

        460       470       480       490   
pF1KE3 NRHSPSGIYNINVTTLVSGPPLSDDSGADLPQMEHQH

>>CCDS47264.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5              (592 aa)
 initn: 1289 init1: 1124 opt: 1322  Z-score: 816.7  bits: 160.8 E(32554): 3.6e-39
Smith-Waterman score: 1349; 45.3% identity (73.8% similar) in 488 aa overlap (1-463:1-483)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMREIKLLKQLRH
       :: ::.:: ::::::: ::::..:.::.::::: : :  ... :.::::::::.:::..:
CCDS47 MEMYETLGKVGEGSYGTVMKCKHKNTGQIVAIKIFYERPEQS-VNKIAMREIKFLKQFHH
               10        20        30        40         50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 ENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQIINGIGFCHSH
       ::::::.:: ..::. .:::::.:::.::.:. . .::. . ..::::::. .: . ::.
CCDS47 ENLVNLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQILRAIDYLHSN
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 NIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEVYTDYVATRWYRAPELLVGDVKYG
       ::::::::::::::::::..:::::::::::::::..:::::::::::::::.. :..::
CCDS47 NIIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTLAAPGDIYTDYVATRWYRAPELVLKDTSYG
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 KAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAGVRL
       : ::.::.::.. ::  :.: .:..::.: :..:.. .::: :. :..:.:.:.:::: :
CCDS47 KPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFSKSPIFAGVVL
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 PEIKEREPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMDGFAERFSQEL
       :.... .  ...::::. .. :... ::.:::  :   ..::::..:  ::: :.:  ::
CCDS47 PQVQHPKNARKKYPKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTRDGFIEKFMPEL
     240       250       260       270       280       290         

              310        320       330            340       350    
pF1KE3 QLKVQKDARNVSLSK-KSQNRKKEKEKDDSLVEERKTLVV-----QDTNADPKIKDYKL-
       . :. ..:.  :: : : .....: .::.  .   .::.      .. . . : :. :. 
CCDS47 KAKLLQEAKVNSLIKPKESSKENELRKDERKTVYTNTLLSSSVLGKEIEKEKKPKEIKVR
     300       310       320       330       340       350         

            360              370           380           390       
pF1KE3 -FKIKGSKIDGEKAEK-------GNRASNASCLH----DSRT----SHNKIVPSTSLKDC
        .:.::.. :  . .:       :.. .: . .:    :..       : : :::   .:
CCDS47 VIKVKGGRGDISEPKKKEYEGGLGQQDANEN-VHPMSPDTKLVTIEPPNPINPST---NC
     360       370       380       390        400       410        

       400       410        420       430       440       450      
pF1KE3 SNVSVDHTRNPSVAIPPLT-HNLSAVAPSINSGMGTETIPIQGYRVDEKTKKCSIPFVKP
       .... .   . ::..::..  : . .: ...:..   .. .      ..:.. ::  : :
CCDS47 NGLKENPHCGGSVTMPPINLTNSNLMAANLSSNLFHPSVRLTERAKKRRTSSQSIGQVMP
         420       430       440       450       460       470     

         460       470       480       490                         
pF1KE3 N-RHSPSGIYNINVTTLVSGPPLSDDSGADLPQMEHQH                      
       : :.   :                                                    
CCDS47 NSRQEDPGPIQSQMEKGIFNERTGHSDQMANENKRKLNFSRSDRKEFHFPELPVTIQSKD
         480       490       500       510       520       530     

>>CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14               (358 aa)
 initn: 1255 init1: 1255 opt: 1260  Z-score: 782.2  bits: 153.7 E(32554): 3e-37
Smith-Waterman score: 1260; 55.7% identity (81.9% similar) in 309 aa overlap (1-309:2-310)

                10        20        30        40        50         
pF1KE3  MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMREIKLLKQLR
        :::::..: .::::::.:.::::.:::.::::::::::.:: ..::::.:::..::::.
CCDS96 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE3 HENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQIINGIGFCHS
       : :::::::: ..:.: .::::. :::.: .:. .  :.  ..:..  .: .....:::.
CCDS96 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE3 HNIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEVYTDYVATRWYRAPELLVGDVKY
       :: ::::.::::::... .:.::::::::: :..:.. :::::::::::.:::::::..:
CCDS96 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE3 GKAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAGVR
       :  ::::::::. .:.. : ::.:: ::.:::: :   ::.::::::..:. :  :.::.
CCDS96 GPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVK
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE3 LPEIKEREPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMDGFAERFSQE
       .:. .. :::: ..:..:  .. : : :::.:: .:  : .:::: .:.     : ...:
CCDS96 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLKGCLHMDPTQRLTCEQLLHHPYFENIREIEDLAKE
              250       260       270       280       290       300

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE3 LQLKVQKDARNVSLSKKSQNRKKEKEKDDSLVEERKTLVVQDTNADPKIKDYKLFKIKGS
        .  ..:  :                                                  
CCDS96 HNKPTRKTLRKSRKHHCFTETSKLQYLPQLTGSSILPALDNKKYYCDTKKLNYRFPNI  
              310       320       330       340       350          

>>CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2             (315 aa)
 initn: 1195 init1: 663 opt: 1212  Z-score: 754.1  bits: 148.4 E(32554): 1.1e-35
Smith-Waterman score: 1218; 53.8% identity (82.1% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-308)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMREIKLLKQLRH
       :::::.:. .::::::.:.::::: .:..::.:::.::.:: .:::::.:::..::::.:
CCDS33 MEKYEKLAKTGEGSYGVVFKCRNKTSGQVVAVKKFVESEDDPVVKKIALREIRMLKQLKH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 ENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQIINGIGFCHSH
        :::::.:: ..:.. .::::. :::.:..::  :::.   :... :.: .....::: :
CCDS33 PNLVNLIEVFRRKRKMHLVFEYCDHTLLNELERNPNGVADGVIKSVLWQTLQALNFCHIH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 NIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEVYTDYVATRWYRAPELLVGDVKYG
       : :::::::::::....:..:.::::::. :  ::..:::::::::::::::::::..::
CCDS33 NCIHRDIKPENILITKQGIIKICDFGFAQILI-PGDAYTDYVATRWYRAPELLVGDTQYG
              130       140       150        160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 KAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAGVRL
       ..::.:::::. .:.. :.::.:: ::.:::: :.  ::.:::::: .:..:  : :. .
CCDS33 SSVDIWAIGCVFAELLTGQPLWPGKSDVDQLYLIIRTLGKLIPRHQSIFKSNGFFHGISI
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 PEIKEREPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMDGFAERFSQEL
       :: .. : ::...  .  :.... : ::...:: :  :..::. ..:  :.:     :: 
CCDS33 PEPEDMETLEEKFSDVHPVALNFMKGCLKMNPDDRLTCSQLLESSYF--DSF-----QEA
     240       250       260       270       280              290  

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 QLKVQKDARNVSLSKKSQNRKKEKEKDDSLVEERKTLVVQDTNADPKIKDYKLFKIKGSK
       :.:  . ::: . ... :                                          
CCDS33 QIK--RKARNEGRNRRRQQVLPLKS                                   
              300       310                                        

>>CCDS73637.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14              (276 aa)
 initn: 1145 init1: 1145 opt: 1150  Z-score: 717.7  bits: 141.4 E(32554): 1.2e-33
Smith-Waterman score: 1150; 58.9% identity (85.3% similar) in 265 aa overlap (1-265:2-266)

                10        20        30        40        50         
pF1KE3  MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMREIKLLKQLR
        :::::..: .::::::.:.::::.:::.::::::::::.:: ..::::.:::..::::.
CCDS73 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE3 HENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQIINGIGFCHS
       : :::::::: ..:.: .::::. :::.: .:. .  :.  ..:..  .: .....:::.
CCDS73 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE3 HNIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEVYTDYVATRWYRAPELLVGDVKY
       :: ::::.::::::... .:.::::::::: :..:.. :::::::::::.:::::::..:
CCDS73 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE3 GKAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAGVR
       :  ::::::::. .:.. : ::.:: ::.:::: :   ::.::::::..:. :  :.::.
CCDS73 GPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVK
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE3 LPEIKEREPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMDGFAERFSQE
       .:. .. :::: ..:..:  .. : :                                  
CCDS73 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLKGRVPIASRTE                        
              250       260       270                              

>>CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX               (960 aa)
 initn: 853 init1: 824 opt: 1009  Z-score: 626.9  bits: 126.4 E(32554): 1.3e-28
Smith-Waterman score: 1044; 39.1% identity (71.9% similar) in 437 aa overlap (1-433:10-432)

                        10        20        30        40        50 
pF1KE3          MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMRE
                :.:.: ::.::::.::.:.:::.:.: .::::::: .:.... ::. ..::
CCDS83 MKIPNIGNVMNKFEILGVVGEGAYGVVLKCRHKETHEIVAIKKFKDSEENEEVKETTLRE
               10        20        30        40        50        60

              60        70        80        90       100       110 
pF1KE3 IKLLKQLRHENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQII
       .:.:. :..::.:.: :. ... . :::::.:....:. :: .:::.  . :..:..:.:
CCDS83 LKMLRTLKQENIVELKEAFRRRGKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNGVPPEKVKSYIYQLI
               70        80        90       100       110       120

             120       130       140       150        160       170
pF1KE3 NGIGFCHSHNIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEV-YTDYVATRWYRAP
       ..: .::...:.::::::::.:.:.. :.:::::::::.:.  ... ::.::::::::.:
CCDS83 KAIHWCHKNDIVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNANYTEYVATRWYRSP
              130       140       150       160       170       180

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pF1KE3 ELLVGDVKYGKAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFN
       :::.: . :::.::.:..::.. :.  :.:::::.:.::::. :.  :: :  ....:: 
CCDS83 ELLLG-APYGKSVDMWSVGCILGELSDGQPLFPGESEIDQLFTIQKVLGPLPSEQMKLFY
               190       200       210       220       230         

              240       250        260       270       280         
pF1KE3 KNPVFAGVRLPEIKEREPLERRY-PKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQM
       .:: : :.:.: ... . :::::   :. :..:: :. :..::  : .  . :.:  :: 
CCDS83 SNPRFHGLRFPAVNHPQSLERRYLGILNSVLLDLMKNLLKLDPADRYLTEQCLNHPTFQT
     240       250       260       270       280       290         

     290       300       310       320         330       340       
pF1KE3 DGFAERFSQELQLKVQKDARNVSLSKKSQNRKKE--KEKDDSLVEERKTLVVQDTNADPK
       . . .:  ..   .    ... .::...:  :.   . .  :  .. ..: :    ::  
CCDS83 QRLLDRSPSRSAKRKPYHVESSTLSNRNQAGKSTALQSHHRSNSKDIQNLSVGLPRADEG
     300       310       320       330       340       350         

       350       360       370       380       390       400       
pF1KE3 IKDYKLFKIKGSKIDGEKAEKGNRASNASCLHDSRTSHNKIVPSTSLKDCSNVSVDHTRN
       .   . :      ..:. :     ... : :: ..: . .  :... :: .: .. :  .
CCDS83 LPANESF------LNGNLA-----GASLSPLH-TKTYQASSQPGSTSKDLTNNNIPHLLS
     360             370            380        390       400       

       410       420       430       440       450       460       
pF1KE3 PSVAIPPLTHNLSAVAPSINSGMGTETIPIQGYRVDEKTKKCSIPFVKPNRHSPSGIYNI
       :. :      ... . :. . : ::.                                  
CCDS83 PKEAKSKTEFDFN-IDPKPSEGPGTKYLKSNSRSQQNRHSFMESSQSKAGTLQPNEKQSR
       410       420        430       440       450       460      

>>CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX               (1030 aa)
 initn: 824 init1: 824 opt: 1009  Z-score: 626.6  bits: 126.5 E(32554): 1.4e-28
Smith-Waterman score: 1044; 39.1% identity (71.9% similar) in 437 aa overlap (1-433:10-432)

                        10        20        30        40        50 
pF1KE3          MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMRE
                :.:.: ::.::::.::.:.:::.:.: .::::::: .:.... ::. ..::
CCDS14 MKIPNIGNVMNKFEILGVVGEGAYGVVLKCRHKETHEIVAIKKFKDSEENEEVKETTLRE
               10        20        30        40        50        60

              60        70        80        90       100       110 
pF1KE3 IKLLKQLRHENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQII
       .:.:. :..::.:.: :. ... . :::::.:....:. :: .:::.  . :..:..:.:
CCDS14 LKMLRTLKQENIVELKEAFRRRGKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNGVPPEKVKSYIYQLI
               70        80        90       100       110       120

             120       130       140       150        160       170
pF1KE3 NGIGFCHSHNIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEV-YTDYVATRWYRAP
       ..: .::...:.::::::::.:.:.. :.:::::::::.:.  ... ::.::::::::.:
CCDS14 KAIHWCHKNDIVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNANYTEYVATRWYRSP
              130       140       150       160       170       180

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pF1KE3 ELLVGDVKYGKAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFN
       :::.: . :::.::.:..::.. :.  :.:::::.:.::::. :.  :: :  ....:: 
CCDS14 ELLLG-APYGKSVDMWSVGCILGELSDGQPLFPGESEIDQLFTIQKVLGPLPSEQMKLFY
               190       200       210       220       230         

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pF1KE3 KNPVFAGVRLPEIKEREPLERRY-PKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQM
       .:: : :.:.: ... . :::::   :. :..:: :. :..::  : .  . :.:  :: 
CCDS14 SNPRFHGLRFPAVNHPQSLERRYLGILNSVLLDLMKNLLKLDPADRYLTEQCLNHPTFQT
     240       250       260       270       280       290         

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pF1KE3 DGFAERFSQELQLKVQKDARNVSLSKKSQNRKKE--KEKDDSLVEERKTLVVQDTNADPK
       . . .:  ..   .    ... .::...:  :.   . .  :  .. ..: :    ::  
CCDS14 QRLLDRSPSRSAKRKPYHVESSTLSNRNQAGKSTALQSHHRSNSKDIQNLSVGLPRADEG
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pF1KE3 IKDYKLFKIKGSKIDGEKAEKGNRASNASCLHDSRTSHNKIVPSTSLKDCSNVSVDHTRN
       .   . :      ..:. :     ... : :: ..: . .  :... :: .: .. :  .
CCDS14 LPANESF------LNGNLA-----GASLSPLH-TKTYQASSQPGSTSKDLTNNNIPHLLS
     360             370            380        390       400       

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pF1KE3 PSVAIPPLTHNLSAVAPSINSGMGTETIPIQGYRVDEKTKKCSIPFVKPNRHSPSGIYNI
       :. :      ... . :. . : ::.                                  
CCDS14 PKEAKSKTEFDFN-IDPKPSEGPGTKYLKSNSRSQQNRHSFMESSQSKAGTLQPNEKQSR
       410       420        430       440       450       460      

>>CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12                (298 aa)
 initn: 774 init1: 476 opt: 765  Z-score: 487.0  bits: 98.9 E(32554): 8.3e-21
Smith-Waterman score: 765; 41.9% identity (70.8% similar) in 298 aa overlap (1-288:1-287)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMREIKLLKQLRH
       ::.....  .:::.::.:.: ::: ::..::.::.  . . . : . :.:::.:::.: :
CCDS88 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNH
               10        20        30        40        50        60

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pF1KE3 ENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTI---LDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQIINGIGFC
        :.:.::.: . ... ::::::. . .   .:   :  .:.   ....::::...:..::
CCDS88 PNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASAL--TGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFC
               70        80        90         100       110        

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE3 HSHNIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEVYTDYVATRWYRAPELLVGDV
       ::: ..:::.::.:.:..  :..:: :::.::....: ..::  :.: ::::::.:.:  
CCDS88 HSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCK
      120       130       140       150       160       170        

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE3 KYGKAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAG
        :. :::.:..::. .::   . ::::::.::::..:.  ::.  :  .:.     :. :
CCDS88 YYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGT--P--DEV-----VWPG
      180       190       200       210       220                  

        240             250       260       270       280       290
pF1KE3 VR-LPEIKE------REPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMD
       :  .:. :       :. . .  : :.:   .: .. :: ::.::      : : :::  
CCDS88 VTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDV
     230       240       250       260       270       280         

              300       310       320       330       340       350
pF1KE3 GFAERFSQELQLKVQKDARNVSLSKKSQNRKKEKEKDDSLVEERKTLVVQDTNADPKIKD
                                                                   
CCDS88 TKPVPHLRL                                                   
     290                                                           




493 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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