FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3422, 493 aa 1>>>pF1KE3422 493 - 493 aa - 493 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6256+/-0.00148; mu= 1.7138+/- 0.084 mean_var=279.4223+/-65.156, 0's: 0 Z-trim(107.0): 668 B-trim: 258 in 1/50 Lambda= 0.076726 statistics sampled from 8495 (9296) to 8495 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.286), width: 16 Scan time: 3.220 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3570.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 493) 3318 381.7 9.9e-106 CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 570) 3176 366.1 5.9e-101 CCDS47265.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 455) 1322 160.7 3e-39 CCDS47264.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 592) 1322 160.8 3.6e-39 CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 358) 1260 153.7 3e-37 CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 ( 315) 1212 148.4 1.1e-35 CCDS73637.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 276) 1150 141.4 1.2e-33 CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX ( 960) 1009 126.4 1.3e-28 CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (1030) 1009 126.5 1.4e-28 CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 765 98.9 8.3e-21 CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 ( 305) 765 98.9 8.5e-21 CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 ( 297) 744 96.5 4.2e-20 CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 292) 731 95.1 1.1e-19 CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 664 87.7 2.1e-17 CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 667 88.3 2.2e-17 CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 660 87.5 3.8e-17 CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 346) 651 86.3 5.8e-17 CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 583) 645 85.9 1.3e-16 CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 623) 645 85.9 1.4e-16 CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 648) 645 86.0 1.4e-16 CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 496) 635 84.7 2.5e-16 CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 502) 635 84.7 2.5e-16 CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6 ( 632) 636 84.9 2.7e-16 CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 570) 635 84.8 2.7e-16 CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 423) 625 83.5 4.9e-16 CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 451) 625 83.6 5.1e-16 CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 469) 625 83.6 5.2e-16 CCDS44300.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 474) 616 82.6 1e-15 CCDS1454.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 504) 616 82.6 1.1e-15 CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 384) 610 81.8 1.4e-15 CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 400) 610 81.8 1.5e-15 CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 429) 610 81.9 1.6e-15 CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 ( 360) 596 80.2 4e-15 CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8 ( 544) 594 80.2 6.2e-15 CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 360) 584 78.9 1e-14 CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 770) 585 79.4 1.6e-14 CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 779) 585 79.4 1.6e-14 CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 780) 585 79.4 1.6e-14 CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 783) 585 79.4 1.6e-14 CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 357) 570 77.4 3e-14 CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 379) 570 77.4 3.1e-14 CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 568 77.1 3.5e-14 CCDS4818.1 MAPK13 gene_id:5603|Hs108|chr6 ( 365) 567 77.0 3.8e-14 CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 748) 572 77.9 4.1e-14 CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 782) 572 78.0 4.3e-14 CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 795) 572 78.0 4.3e-14 CCDS75628.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 340) 561 76.3 5.7e-14 CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 ( 367) 560 76.3 6.5e-14 CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 559 76.1 6.9e-14 CCDS54628.1 GSK3B gene_id:2932|Hs108|chr3 ( 420) 559 76.2 7.7e-14 >>CCDS3570.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 (493 aa) initn: 3318 init1: 3318 opt: 3318 Z-score: 2011.7 bits: 381.7 E(32554): 9.9e-106 Smith-Waterman score: 3318; 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CCDS47 ENLVNLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQILRAIDYLHSN 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 NIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEVYTDYVATRWYRAPELLVGDVKYG ::::::::::::::::::..:::::::::::::::..:::::::::::::::.. :..:: CCDS47 NIIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTLAAPGDIYTDYVATRWYRAPELVLKDTSYG 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 KAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAGVRL : ::.::.::.. :: :.: .:..::.: :..:.. .::: :. :..:.:.:.:::: : CCDS47 KPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFSKSPIFAGVVL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 PEIKEREPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMDGFAERFSQEL :.... . ...::::. .. :... ::.::: : ..::::..: ::: :.: :: CCDS47 PQVQHPKNARKKYPKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTRDGFIEKFMPEL 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 pF1KE3 QLKVQKDARNVSLSK-KSQNRKKEKEKDDSLVEERKTLVV-----QDTNADPKIKDYKL- . :. ..:. :: : : .....: .::. . .::. .. . . : :. :. 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CCDS47 NGLKENPHCGGSVTMPPINLTNSNLMAANLSSNLFHPSVR 420 430 440 450 460 470 480 490 pF1KE3 NRHSPSGIYNINVTTLVSGPPLSDDSGADLPQMEHQH >>CCDS47264.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 (592 aa) initn: 1289 init1: 1124 opt: 1322 Z-score: 816.7 bits: 160.8 E(32554): 3.6e-39 Smith-Waterman score: 1349; 45.3% identity (73.8% similar) in 488 aa overlap (1-463:1-483) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMREIKLLKQLRH :: ::.:: ::::::: ::::..:.::.::::: : : ... :.::::::::.:::..: CCDS47 MEMYETLGKVGEGSYGTVMKCKHKNTGQIVAIKIFYERPEQS-VNKIAMREIKFLKQFHH 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 ENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQIINGIGFCHSH ::::::.:: ..::. .:::::.:::.::.:. . .::. . ..::::::. .: . ::. CCDS47 ENLVNLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQILRAIDYLHSN 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 NIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEVYTDYVATRWYRAPELLVGDVKYG ::::::::::::::::::..:::::::::::::::..:::::::::::::::.. :..:: CCDS47 NIIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTLAAPGDIYTDYVATRWYRAPELVLKDTSYG 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 KAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAGVRL : ::.::.::.. :: :.: .:..::.: :..:.. .::: :. :..:.:.:.:::: : CCDS47 KPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFSKSPIFAGVVL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 PEIKEREPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMDGFAERFSQEL :.... . ...::::. .. :... ::.::: : ..::::..: ::: :.: :: CCDS47 PQVQHPKNARKKYPKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTRDGFIEKFMPEL 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 pF1KE3 QLKVQKDARNVSLSK-KSQNRKKEKEKDDSLVEERKTLVV-----QDTNADPKIKDYKL- . :. ..:. :: : : .....: .::. . .::. .. . . : :. :. CCDS47 KAKLLQEAKVNSLIKPKESSKENELRKDERKTVYTNTLLSSSVLGKEIEKEKKPKEIKVR 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 -FKIKGSKIDGEKAEK-------GNRASNASCLH----DSRT----SHNKIVPSTSLKDC .:.::.. : . .: :.. .: . .: :.. : : ::: .: CCDS47 VIKVKGGRGDISEPKKKEYEGGLGQQDANEN-VHPMSPDTKLVTIEPPNPINPST---NC 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 SNVSVDHTRNPSVAIPPLT-HNLSAVAPSINSGMGTETIPIQGYRVDEKTKKCSIPFVKP .... . . ::..::.. : . .: ...:.. .. . ..:.. :: : : CCDS47 NGLKENPHCGGSVTMPPINLTNSNLMAANLSSNLFHPSVRLTERAKKRRTSSQSIGQVMP 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 pF1KE3 N-RHSPSGIYNINVTTLVSGPPLSDDSGADLPQMEHQH : :. : CCDS47 NSRQEDPGPIQSQMEKGIFNERTGHSDQMANENKRKLNFSRSDRKEFHFPELPVTIQSKD 480 490 500 510 520 530 >>CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 (358 aa) initn: 1255 init1: 1255 opt: 1260 Z-score: 782.2 bits: 153.7 E(32554): 3e-37 Smith-Waterman score: 1260; 55.7% identity (81.9% similar) in 309 aa overlap (1-309:2-310) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMREIKLLKQLR :::::..: .::::::.:.::::.:::.::::::::::.:: ..::::.:::..::::. CCDS96 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 HENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQIINGIGFCHS : :::::::: ..:.: .::::. :::.: .:. . :. ..:.. .: .....:::. CCDS96 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 HNIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEVYTDYVATRWYRAPELLVGDVKY :: ::::.::::::... .:.::::::::: :..:.. :::::::::::.:::::::..: CCDS96 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 GKAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAGVR : ::::::::. .:.. : ::.:: ::.:::: : ::.::::::..:. : :.::. CCDS96 GPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVK 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 LPEIKEREPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMDGFAERFSQE .:. .. :::: ..:..: .. : : :::.:: .: : .:::: .:. : ...: CCDS96 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLKGCLHMDPTQRLTCEQLLHHPYFENIREIEDLAKE 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 LQLKVQKDARNVSLSKKSQNRKKEKEKDDSLVEERKTLVVQDTNADPKIKDYKLFKIKGS . ..: : CCDS96 HNKPTRKTLRKSRKHHCFTETSKLQYLPQLTGSSILPALDNKKYYCDTKKLNYRFPNI 310 320 330 340 350 >>CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 (315 aa) initn: 1195 init1: 663 opt: 1212 Z-score: 754.1 bits: 148.4 E(32554): 1.1e-35 Smith-Waterman score: 1218; 53.8% identity (82.1% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-308) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMREIKLLKQLRH :::::.:. .::::::.:.::::: .:..::.:::.::.:: .:::::.:::..::::.: CCDS33 MEKYEKLAKTGEGSYGVVFKCRNKTSGQVVAVKKFVESEDDPVVKKIALREIRMLKQLKH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 ENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQIINGIGFCHSH :::::.:: ..:.. .::::. :::.:..:: :::. :... :.: .....::: : CCDS33 PNLVNLIEVFRRKRKMHLVFEYCDHTLLNELERNPNGVADGVIKSVLWQTLQALNFCHIH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 NIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEVYTDYVATRWYRAPELLVGDVKYG : :::::::::::....:..:.::::::. : ::..:::::::::::::::::::..:: CCDS33 NCIHRDIKPENILITKQGIIKICDFGFAQILI-PGDAYTDYVATRWYRAPELLVGDTQYG 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 KAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAGVRL ..::.:::::. .:.. :.::.:: ::.:::: :. ::.:::::: .:..: : :. . CCDS33 SSVDIWAIGCVFAELLTGQPLWPGKSDVDQLYLIIRTLGKLIPRHQSIFKSNGFFHGISI 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 PEIKEREPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMDGFAERFSQEL :: .. : ::... . :.... : ::...:: : :..::. ..: :.: :: CCDS33 PEPEDMETLEEKFSDVHPVALNFMKGCLKMNPDDRLTCSQLLESSYF--DSF-----QEA 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 QLKVQKDARNVSLSKKSQNRKKEKEKDDSLVEERKTLVVQDTNADPKIKDYKLFKIKGSK :.: . ::: . ... : CCDS33 QIK--RKARNEGRNRRRQQVLPLKS 300 310 >>CCDS73637.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 (276 aa) initn: 1145 init1: 1145 opt: 1150 Z-score: 717.7 bits: 141.4 E(32554): 1.2e-33 Smith-Waterman score: 1150; 58.9% identity (85.3% similar) in 265 aa overlap (1-265:2-266) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMREIKLLKQLR :::::..: .::::::.:.::::.:::.::::::::::.:: ..::::.:::..::::. CCDS73 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 HENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQIINGIGFCHS : :::::::: ..:.: .::::. :::.: .:. . :. ..:.. .: .....:::. CCDS73 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 HNIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEVYTDYVATRWYRAPELLVGDVKY :: ::::.::::::... .:.::::::::: :..:.. :::::::::::.:::::::..: CCDS73 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 GKAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAGVR : ::::::::. .:.. : ::.:: ::.:::: : ::.::::::..:. : :.::. CCDS73 GPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVK 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 LPEIKEREPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMDGFAERFSQE .:. .. :::: ..:..: .. : : CCDS73 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLKGRVPIASRTE 250 260 270 >>CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (960 aa) initn: 853 init1: 824 opt: 1009 Z-score: 626.9 bits: 126.4 E(32554): 1.3e-28 Smith-Waterman score: 1044; 39.1% identity (71.9% similar) in 437 aa overlap (1-433:10-432) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMRE :.:.: ::.::::.::.:.:::.:.: .::::::: .:.... ::. ..:: CCDS83 MKIPNIGNVMNKFEILGVVGEGAYGVVLKCRHKETHEIVAIKKFKDSEENEEVKETTLRE 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 IKLLKQLRHENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQII .:.:. :..::.:.: :. ... . :::::.:....:. :: .:::. . :..:..:.: CCDS83 LKMLRTLKQENIVELKEAFRRRGKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNGVPPEKVKSYIYQLI 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 NGIGFCHSHNIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEV-YTDYVATRWYRAP ..: .::...:.::::::::.:.:.. :.:::::::::.:. ... ::.::::::::.: CCDS83 KAIHWCHKNDIVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNANYTEYVATRWYRSP 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 ELLVGDVKYGKAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFN :::.: . :::.::.:..::.. :. :.:::::.:.::::. :. :: : ....:: CCDS83 ELLLG-APYGKSVDMWSVGCILGELSDGQPLFPGESEIDQLFTIQKVLGPLPSEQMKLFY 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 KNPVFAGVRLPEIKEREPLERRY-PKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQM .:: : :.:.: ... . ::::: :. :..:: :. :..:: : . . :.: :: CCDS83 SNPRFHGLRFPAVNHPQSLERRYLGILNSVLLDLMKNLLKLDPADRYLTEQCLNHPTFQT 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 DGFAERFSQELQLKVQKDARNVSLSKKSQNRKKE--KEKDDSLVEERKTLVVQDTNADPK . . .: .. . ... .::...: :. . . : .. ..: : :: CCDS83 QRLLDRSPSRSAKRKPYHVESSTLSNRNQAGKSTALQSHHRSNSKDIQNLSVGLPRADEG 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 IKDYKLFKIKGSKIDGEKAEKGNRASNASCLHDSRTSHNKIVPSTSLKDCSNVSVDHTRN . . : ..:. : ... : :: ..: . . :... :: .: .. : . CCDS83 LPANESF------LNGNLA-----GASLSPLH-TKTYQASSQPGSTSKDLTNNNIPHLLS 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 PSVAIPPLTHNLSAVAPSINSGMGTETIPIQGYRVDEKTKKCSIPFVKPNRHSPSGIYNI :. : ... . :. . : ::. CCDS83 PKEAKSKTEFDFN-IDPKPSEGPGTKYLKSNSRSQQNRHSFMESSQSKAGTLQPNEKQSR 410 420 430 440 450 460 >>CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (1030 aa) initn: 824 init1: 824 opt: 1009 Z-score: 626.6 bits: 126.5 E(32554): 1.4e-28 Smith-Waterman score: 1044; 39.1% identity (71.9% similar) in 437 aa overlap (1-433:10-432) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMRE :.:.: ::.::::.::.:.:::.:.: .::::::: .:.... ::. ..:: CCDS14 MKIPNIGNVMNKFEILGVVGEGAYGVVLKCRHKETHEIVAIKKFKDSEENEEVKETTLRE 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 IKLLKQLRHENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQII .:.:. :..::.:.: :. ... . :::::.:....:. :: .:::. . :..:..:.: CCDS14 LKMLRTLKQENIVELKEAFRRRGKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNGVPPEKVKSYIYQLI 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 NGIGFCHSHNIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEV-YTDYVATRWYRAP ..: .::...:.::::::::.:.:.. :.:::::::::.:. ... ::.::::::::.: CCDS14 KAIHWCHKNDIVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNANYTEYVATRWYRSP 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 ELLVGDVKYGKAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFN :::.: . :::.::.:..::.. :. :.:::::.:.::::. :. :: : ....:: CCDS14 ELLLG-APYGKSVDMWSVGCILGELSDGQPLFPGESEIDQLFTIQKVLGPLPSEQMKLFY 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 KNPVFAGVRLPEIKEREPLERRY-PKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQM .:: : :.:.: ... . ::::: :. :..:: :. :..:: : . . :.: :: CCDS14 SNPRFHGLRFPAVNHPQSLERRYLGILNSVLLDLMKNLLKLDPADRYLTEQCLNHPTFQT 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 DGFAERFSQELQLKVQKDARNVSLSKKSQNRKKE--KEKDDSLVEERKTLVVQDTNADPK . . .: .. . ... .::...: :. . . : .. ..: : :: CCDS14 QRLLDRSPSRSAKRKPYHVESSTLSNRNQAGKSTALQSHHRSNSKDIQNLSVGLPRADEG 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 IKDYKLFKIKGSKIDGEKAEKGNRASNASCLHDSRTSHNKIVPSTSLKDCSNVSVDHTRN . . : ..:. : ... : :: ..: . . :... :: .: .. : . CCDS14 LPANESF------LNGNLA-----GASLSPLH-TKTYQASSQPGSTSKDLTNNNIPHLLS 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 PSVAIPPLTHNLSAVAPSINSGMGTETIPIQGYRVDEKTKKCSIPFVKPNRHSPSGIYNI :. : ... . :. . : ::. CCDS14 PKEAKSKTEFDFN-IDPKPSEGPGTKYLKSNSRSQQNRHSFMESSQSKAGTLQPNEKQSR 410 420 430 440 450 460 >>CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 (298 aa) initn: 774 init1: 476 opt: 765 Z-score: 487.0 bits: 98.9 E(32554): 8.3e-21 Smith-Waterman score: 765; 41.9% identity (70.8% similar) in 298 aa overlap (1-288:1-287) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMREIKLLKQLRH ::..... .:::.::.:.: ::: ::..::.::. . . . : . :.:::.:::.: : CCDS88 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 ENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTI---LDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQIINGIGFC :.:.::.: . ... ::::::. . . .: : .:. ....::::...:..:: CCDS88 PNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASAL--TGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFC 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 HSHNIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEVYTDYVATRWYRAPELLVGDV ::: ..:::.::.:.:.. :..:: :::.::....: ..:: :.: ::::::.:.: CCDS88 HSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 KYGKAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAG :. :::.:..::. .:: . ::::::.::::..:. ::. : .:. :. : CCDS88 YYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGT--P--DEV-----VWPG 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 VR-LPEIKE------REPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMD : .:. : :. . . : :.: .: .. :: ::.:: : : ::: CCDS88 VTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDV 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 GFAERFSQELQLKVQKDARNVSLSKKSQNRKKEKEKDDSLVEERKTLVVQDTNADPKIKD CCDS88 TKPVPHLRL 290 493 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 04:43:25 2016 done: Sun Nov 6 04:43:26 2016 Total Scan time: 3.220 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]