Result of FASTA (ccds) for pFN21AE6392
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE6392, 418 aa
  1>>>pF1KE6392 418 - 418 aa - 418 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3878+/-0.00107; mu= 16.6261+/- 0.064
 mean_var=69.7931+/-14.363, 0's: 0 Z-trim(103.3): 170  B-trim: 3 in 1/50
 Lambda= 0.153521
 statistics sampled from 7184 (7357) to 7184 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.591), E-opt: 0.2 (0.226), width:  16
 Scan time:  1.900

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS47065.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs108|chr4    ( 418) 2800 629.7 1.6e-180
CCDS3519.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs108|chr4     ( 421) 2784 626.1 1.9e-179
CCDS33993.1 TMPRSS11E gene_id:28983|Hs108|chr4     ( 423) 1283 293.7 2.3e-79
CCDS3518.1 TMPRSS11D gene_id:9407|Hs108|chr4       ( 418) 1195 274.2 1.7e-73
CCDS3521.1 TMPRSS11B gene_id:132724|Hs108|chr4     ( 416) 1113 256.0 4.8e-68
CCDS3520.1 TMPRSS11F gene_id:389208|Hs108|chr4     ( 438)  970 224.4 1.7e-58
CCDS58790.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs108|chr21      ( 453)  693 163.0 5.2e-40
CCDS13686.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs108|chr21      ( 454)  681 160.4 3.3e-39
CCDS74856.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22     ( 802)  660 155.9 1.3e-37
CCDS13941.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22     ( 811)  660 155.9 1.3e-37
CCDS33564.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs108|chr21       ( 492)  640 151.3 1.9e-36
CCDS54486.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs108|chr21       ( 529)  640 151.3   2e-36
CCDS13571.1 TMPRSS15 gene_id:5651|Hs108|chr21      (1019)  635 150.4 7.5e-36
CCDS55788.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11     ( 532)  627 148.4 1.5e-35
CCDS58185.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11     ( 563)  627 148.5 1.6e-35
CCDS41721.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11     ( 567)  627 148.5 1.6e-35
CCDS10430.1 TPSG1 gene_id:25823|Hs108|chr16        ( 321)  609 144.3 1.6e-34
CCDS3847.1 F11 gene_id:2160|Hs108|chr4             ( 625)  612 145.2 1.7e-34
CCDS12088.1 TMPRSS9 gene_id:360200|Hs108|chr19     (1059)  600 142.6 1.7e-33
CCDS76482.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11      ( 290)  591 140.3 2.3e-33
CCDS53717.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11      ( 397)  591 140.4   3e-33
CCDS44743.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11      ( 432)  591 140.4 3.2e-33
CCDS53716.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11      ( 435)  591 140.4 3.2e-33
CCDS31684.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11      ( 437)  591 140.4 3.2e-33
CCDS73391.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11      ( 413)  589 140.0 4.1e-33
CCDS73392.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11      ( 448)  589 140.0 4.4e-33
CCDS44735.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11      ( 457)  589 140.0 4.5e-33
CCDS75122.1 CORIN gene_id:10699|Hs108|chr4         ( 938)  589 140.2 8.2e-33
CCDS3477.1 CORIN gene_id:10699|Hs108|chr4          (1042)  589 140.2 8.9e-33
CCDS74669.1 PRSS56 gene_id:646960|Hs108|chr2       ( 603)  583 138.7 1.4e-32
CCDS8487.1 ST14 gene_id:6768|Hs108|chr11           ( 855)  579 137.9 3.5e-32
CCDS34120.1 KLKB1 gene_id:3818|Hs108|chr4          ( 638)  561 133.9 4.4e-31
CCDS43129.2 TMPRSS7 gene_id:344805|Hs108|chr3      ( 717)  541 129.5   1e-29
CCDS1563.1 PRSS38 gene_id:339501|Hs108|chr1        ( 326)  534 127.7 1.6e-29
CCDS157.1 CELA2A gene_id:63036|Hs108|chr1          ( 269)  528 126.3 3.4e-29
CCDS5279.1 PLG gene_id:5340|Hs108|chr6             ( 810)  521 125.1 2.5e-28
CCDS82945.1 CFI gene_id:3426|Hs108|chr4            ( 576)  504 121.2 2.5e-27
CCDS34049.1 CFI gene_id:3426|Hs108|chr4            ( 583)  504 121.2 2.6e-27
CCDS82946.1 CFI gene_id:3426|Hs108|chr4            ( 591)  504 121.2 2.6e-27
CCDS32993.1 HPN gene_id:3249|Hs108|chr19           ( 417)  499 120.0 4.2e-27
CCDS156.1 CTRC gene_id:11330|Hs108|chr1            ( 268)  495 119.0 5.4e-27
CCDS5976.1 PRSS55 gene_id:203074|Hs108|chr8        ( 352)  489 117.8 1.7e-26
CCDS30605.1 CELA2B gene_id:51032|Hs108|chr1        ( 269)  484 116.6 2.9e-26
CCDS44881.1 TMPRSS12 gene_id:283471|Hs108|chr12    ( 348)  479 115.6 7.8e-26
CCDS9530.1 F10 gene_id:2159|Hs108|chr13            ( 488)  473 114.3 2.6e-25
CCDS83495.1 F9 gene_id:2158|Hs108|chrX             ( 423)  471 113.8 3.1e-25
CCDS10852.1 CTRL gene_id:1506|Hs108|chr16          ( 264)  468 113.0 3.3e-25
CCDS14666.1 F9 gene_id:2158|Hs108|chrX             ( 461)  471 113.9 3.3e-25
CCDS73251.1 OVCH2 gene_id:341277|Hs108|chr11       ( 565)  446 108.4 1.8e-23
CCDS14101.1 ACR gene_id:49|Hs108|chr22             ( 421)  443 107.6 2.3e-23


>>CCDS47065.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs108|chr4         (418 aa)
 initn: 2800 init1: 2800 opt: 2800  Z-score: 3354.4  bits: 629.7 E(32554): 1.6e-180
Smith-Waterman score: 2800; 99.8% identity (100.0% similar) in 418 aa overlap (1-418:1-418)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MMYRTVGFGTRSRNLKPWMIAVLIVLSLTVVAVTIGLLVHFLVFDQKKEYYHGSFKILDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MMYRTVGFGTRSRNLKPWMIAVLIVLSLTVVAVTIGLLVHFLVFDQKKEYYHGSFKILDP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 QINNNFGQSNTYQLKDLRETTENLVDEIFIDSAWKKNYIKNQVVRLTPEEDGVKVDVIMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QINNNFGQSNTYQLKDLRETTENLVDEIFIDSAWKKNYIKNQVVRLTPEEDGVKVDVIMV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 FQFPSTEQRAVREKKIQSILNQKIRNLRALPINASSVQVNAMSSSTGELTVQASCGKRVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FQFPSTEQRAVREKKIQSILNQKIRNLRALPINASSVQVNAMSSSTGELTVQASCGKRVV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 PLNVNRIASGVIAPKAAWPWQASLQYDNIHQCGATLISNTWLVTAAHCFQKYKNPHQWTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PLNVNRIASGVIAPKAAWPWQASLQYDNIHQCGATLISNTWLVTAAHCFQKYKNPHQWTV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 SFGTKINPPLMKRNVRRFIIHEKYRSAAREYDIAVVQVSSRVTFSDDIRRICLPEASASF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS47 SFGTKINPPLMKRNVRRFIIHEKYRSAAREYDIAVVQVSSRVTFSDDIRQICLPEASASF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE6 QPNLTVHITGFGALYYGGESQNDLREARVKIISDDVCKQPQVYGNDIKPGMFCAGYMEGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QPNLTVHITGFGALYYGGESQNDLREARVKIISDDVCKQPQVYGNDIKPGMFCAGYMEGI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410        
pF1KE6 YDACRGDSGGPLVTRDLKDTWYLIGIVSWGDNCGQKDKPGVYTQVTYYRNWIASKTGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YDACRGDSGGPLVTRDLKDTWYLIGIVSWGDNCGQKDKPGVYTQVTYYRNWIASKTGI
              370       380       390       400       410        

>>CCDS3519.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs108|chr4          (421 aa)
 initn: 2257 init1: 2257 opt: 2784  Z-score: 3335.2  bits: 626.1 E(32554): 1.9e-179
Smith-Waterman score: 2784; 99.0% identity (99.3% similar) in 421 aa overlap (1-418:1-421)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MMYRTVGFGTRSRNLKPWMIAVLIVLSLTVVAVTIGLLVHFLVFDQKKEYYHGSFKILDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MMYRTVGFGTRSRNLKPWMIAVLIVLSLTVVAVTIGLLVHFLVFDQKKEYYHGSFKILDP
               10        20        30        40        50        60

               70        80           90       100       110       
pF1KE6 QINNNFGQSNTYQLKDLRETTENLV---DEIFIDSAWKKNYIKNQVVRLTPEEDGVKVDV
       :::::::::::::::::::::::::   ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QINNNFGQSNTYQLKDLRETTENLVSQVDEIFIDSAWKKNYIKNQVVRLTPEEDGVKVDV
               70        80        90       100       110       120

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE6 IMVFQFPSTEQRAVREKKIQSILNQKIRNLRALPINASSVQVNAMSSSTGELTVQASCGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 IMVFQFPSTEQRAVREKKIQSILNQKIRNLRALPINASSVQVNAMSSSTGELTVQASCGK
              130       140       150       160       170       180

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE6 RVVPLNVNRIASGVIAPKAAWPWQASLQYDNIHQCGATLISNTWLVTAAHCFQKYKNPHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 RVVPLNVNRIASGVIAPKAAWPWQASLQYDNIHQCGATLISNTWLVTAAHCFQKYKNPHQ
              190       200       210       220       230       240

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE6 WTVSFGTKINPPLMKRNVRRFIIHEKYRSAAREYDIAVVQVSSRVTFSDDIRRICLPEAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS35 WTVSFGTKINPPLMKRNVRRFIIHEKYRSAAREYDIAVVQVSSRVTFSDDIRQICLPEAS
              250       260       270       280       290       300

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE6 ASFQPNLTVHITGFGALYYGGESQNDLREARVKIISDDVCKQPQVYGNDIKPGMFCAGYM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ASFQPNLTVHITGFGALYYGGESQNDLREARVKIISDDVCKQPQVYGNDIKPGMFCAGYM
              310       320       330       340       350       360

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE6 EGIYDACRGDSGGPLVTRDLKDTWYLIGIVSWGDNCGQKDKPGVYTQVTYYRNWIASKTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EGIYDACRGDSGGPLVTRDLKDTWYLIGIVSWGDNCGQKDKPGVYTQVTYYRNWIASKTG
              370       380       390       400       410       420

        
pF1KE6 I
       :
CCDS35 I
        

>>CCDS33993.1 TMPRSS11E gene_id:28983|Hs108|chr4          (423 aa)
 initn: 1099 init1: 980 opt: 1283  Z-score: 1538.4  bits: 293.7 E(32554): 2.3e-79
Smith-Waterman score: 1283; 43.0% identity (75.4% similar) in 423 aa overlap (1-418:1-423)

               10         20        30        40        50         
pF1KE6 MMYRTVGFGTRSR-NLKPWMIAVLIVLSLTVVAVTIGLLVHFLVFDQKKEY-YHGSFKIL
       ::::     .:.:   .::.:...: .:: :.:: ::: ::.. ..::: : :...... 
CCDS33 MMYRPDVVRARKRVCWEPWVIGLVIFISLIVLAVCIGLTVHYVRYNQKKTYNYYSTLSFT
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE6 DPQINNNFGQSNTYQLKDLRETTENLVDEIFIDSAWKKNYIKNQVVRLTPEEDGVKVDVI
         ..  .::.  . .. .. .  :..: . :  :  .....:.::.... .. :: . ..
CCDS33 TDKLYAEFGREASNNFTEMSQRLESMVKNAFYKSPLREEFVKSQVIKFSQQKHGVLAHML
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150        160       170       
pF1KE6 MVFQFPSTEQRAVREKKIQSILNQKIRNLRALP-INASSVQVNAMSSSTGELTVQASCG-
       .. .: :::.  . .: .: .:..:...  . : ..  ::... ....  .  ..  :: 
CCDS33 LICRFHSTEDPETVDKIVQLVLHEKLQDAVGPPKVDPHSVKIKKINKTETDSYLNHCCGT
              130       140       150       160       170       180

        180        190       200       210       220       230     
pF1KE6 KRVVPLNVN-RIASGVIAPKAAWPWQASLQYDNIHQCGATLISNTWLVTAAHCFQKYKNP
       .:   :. . ::..:. . .. ::::::::.:. :.::::::. ::::.:::::  ::::
CCDS33 RRSKTLGQSLRIVGGTEVEEGEWPWQASLQWDGSHRCGATLINATWLVSAAHCFTTYKNP
              190       200       210       220       230       240

         240       250       260       270       280       290     
pF1KE6 HQWTVSFGTKINPPLMKRNVRRFIIHEKYRSAAREYDIAVVQVSSRVTFSDDIRRICLPE
        .::.:::. :.:  :::..::.:.::::.  ...:::.....:: : ... ..:.:::.
CCDS33 ARWTASFGVTIKPSKMKRGLRRIIVHEKYKHPSHDYDISLAELSSPVPYTNAVHRVCLPD
              250       260       270       280       290       300

         300       310       320       330       340       350     
pF1KE6 ASASFQPNLTVHITGFGALYYGGESQNDLREARVKIISDDVCKQPQVYGNDIKPGMFCAG
       ::  :::. .. .::::::   : ::: ::.:.: .:.  .:..::.:.. : : :.:::
CCDS33 ASYEFQPGDVMFVTGFGALKNDGYSQNHLRQAQVTLIDATTCNEPQAYNDAITPRMLCAG
              310       320       330       340       350       360

         360       370       380       390       400       410     
pF1KE6 YMEGIYDACRGDSGGPLVTRDLKDTWYLIGIVSWGDNCGQKDKPGVYTQVTYYRNWIASK
        .::  :::.::::::::. : .: ::: :::::::.:.. .::::::.::  :.::.::
CCDS33 SLEGKTDACQGDSGGPLVSSDARDIWYLAGIVSWGDECAKPNKPGVYTRVTALRDWITSK
              370       380       390       400       410       420

          
pF1KE6 TGI
       :::
CCDS33 TGI
          

>>CCDS3518.1 TMPRSS11D gene_id:9407|Hs108|chr4            (418 aa)
 initn: 1195 init1: 869 opt: 1195  Z-score: 1433.2  bits: 274.2 E(32554): 1.7e-73
Smith-Waterman score: 1195; 40.3% identity (75.2% similar) in 419 aa overlap (2-418:1-418)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MMYRTVGFGTRSRNLKPWMIAVLIVLSLTVVAVTIGLLVHFLVFDQKKEYYHGSFKILDP
        ::: .   . :: :.:...  ..: .....::::.:::.::.::::. .:..::..:. 
CCDS35  MYRPARVTSTSRFLNPYVVCFIVVAGVVILAVTIALLVYFLAFDQKSYFYRSSFQLLNV
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 QINNNFGQSNTYQLKDLRETTENLVDEIFIDSAWKKNYIKNQVVRLTPEEDGVKVDVIMV
       . :.....  : . . :    :.:. . : .:  ....:. .:..:  . .::..::.: 
CCDS35 EYNSQLNSPATQEYRTLSGRIESLITKTFKESNLRNQFIRAHVAKLRQDGSGVRADVVMK
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170          
pF1KE6 FQFPSTEQRAVREKKIQSILNQKIRNLRALPINASSVQVNAMSSSTGELTVQASCGK--R
       :::  ... :  ...:.:.: : . :   : :: :. ..........   .   ::    
CCDS35 FQFTRNNNGASMKSRIESVLRQMLNNSGNLEINPST-EITSLTDQAAANWLINECGAGPD
     120       130       140       150        160       170        

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE6 VVPLNVNRIASGVIAPKAAWPWQASLQYDNIHQCGATLISNTWLVTAAHCFQKYKNPHQW
       .. :. .:: .:. : ...::::.::. .: :.::..::.: :..::::::.. .::..:
CCDS35 LITLSEQRILGGTEAEEGSWPWQVSLRLNNAHHCGGSLINNMWILTAAHCFRSNSNPRDW
      180       190       200       210       220       230        

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE6 TVSFGTKINPPLMKRNVRRFIIHEKYRSAAREYDIAVVQVSSRVTFSDDIRRICLPEASA
        .. : . . : ..  :: ..::..:.::..: :::.:.. . :::. ::. .::: :. 
CCDS35 IATSGISTTFPKLRMRVRNILIHNNYKSATHENDIALVRLENSVTFTKDIHSVCLPAATQ
      240       250       260       270       280       290        

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE6 SFQPNLTVHITGFGALYYGGESQNDLREARVKIISDDVCKQPQVYGNDIKPGMFCAGYME
       .. :. :...::.::  :.:..  .::...:.:::.:::. :. :.. :  ::.:::  .
CCDS35 NIPPGSTAYVTGWGAQEYAGHTVPELRQGQVRIISNDVCNAPHSYNGAILSGMLCAGVPQ
      300       310       320       330       340       350        

      360       370       380       390       400       410        
pF1KE6 GIYDACRGDSGGPLVTRDLKDTWYLIGIVSWGDNCGQKDKPGVYTQVTYYRNWIASKTGI
       :  :::.:::::::: .: .  :...:::::::.::  :::::::.:: : .:: ..:::
CCDS35 GGVDACQGDSGGPLVQEDSRRLWFIVGIVSWGDQCGLPDKPGVYTRVTAYLDWIRQQTGI
      360       370       380       390       400       410        

>>CCDS3521.1 TMPRSS11B gene_id:132724|Hs108|chr4          (416 aa)
 initn: 916 init1: 833 opt: 1113  Z-score: 1335.1  bits: 256.0 E(32554): 4.8e-68
Smith-Waterman score: 1113; 40.4% identity (72.6% similar) in 423 aa overlap (2-418:1-416)

               10        20         30        40        50         
pF1KE6 MMYRTVGFGTRSRNLKPWMIAVLIVLSLT-VVAVTIGLLVHFLVFDQKKEYYHGSFKILD
        :::    :  :.   :   ...: :... ...::::::::::. . :  ::.:.:.:  
CCDS35  MYR---HGISSQRSWPLWTTIFIFLGVAAILGVTIGLLVHFLAVE-KTYYYQGDFHISG
                   10        20        30        40         50     

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE6 PQINNNFGQSNTYQLKDLRETTENLVDEIFIDSAWKKNYIKNQVVRLTPEEDGVKVDVIM
          :.:  .. .    .: .  :. . . : .:.  :.:.:..:..: :. .: .:.. .
CCDS35 VTYNDNCENAASQASTNLSKDIETKMLNAFQNSSIYKEYVKSEVIKLLPNANGSNVQLQL
          60        70        80        90       100       110     

     120       130          140       150       160       170      
pF1KE6 VFQFPSTEQRAVREK---KIQSILNQKIRNLRALPINASSVQVNAMSSSTGELTVQASCG
        :.:: .:  ..: :   :....:.... .  :.:   .:...  .:....:. ..  ::
CCDS35 KFKFPPAEGVSMRTKIKAKLHQMLKNNMASWNAVP---ASIKLMEISKAASEMLTNNCCG
         120       130       140       150          160       170  

        180         190       200       210       220       230    
pF1KE6 KRVVPLNV--NRIASGVIAPKAAWPWQASLQYDNIHQCGATLISNTWLVTAAHCFQKYKN
       ..:.   .  :.:..:  . ..:::::::.:. . : :::.:::. ::..::::: : .:
CCDS35 RQVANSIITGNKIVNGKSSLEGAWPWQASMQWKGRHYCGASLISSRWLLSAAHCFAKKNN
            180       190       200       210       220       230  

          240       250       260       270       280       290    
pF1KE6 PHQWTVSFGTKINPPLMKRNVRRFIIHEKYRSAAREYDIAVVQVSSRVTFSDDIRRICLP
        ..:::.::  .: : : :.:. .:.::.: : . . :::.::.. .:.:.. ::.::::
CCDS35 SKDWTVNFGIVVNKPYMTRKVQNIIFHENYSSPGLHDDIALVQLAEEVSFTEYIRKICLP
            240       250       260       270       280       290  

          300       310       320       330       340       350    
pF1KE6 EASASFQPNLTVHITGFGALYYGGESQNDLREARVKIISDDVCKQPQVYGNDIKPGMFCA
       ::. ... : .: .::.:.::..:     :.:  .:::.. .:.   .:.. .   :.::
CCDS35 EAKMKLSENDNVVVTGWGTLYMNGSFPVILQEDFLKIIDNKICNASYAYSGFVTDTMLCA
            300       310       320       330       340       350  

          360       370       380       390       400       410    
pF1KE6 GYMEGIYDACRGDSGGPLVTRDLKDTWYLIGIVSWGDNCGQKDKPGVYTQVTYYRNWIAS
       :.: :  :::..::::::.  : .. :.:.:::::::.::.:.::::::.:: :::::.:
CCDS35 GFMSGEADACQNDSGGPLAYPDSRNIWHLVGIVSWGDGCGKKNKPGVYTRVTSYRNWITS
            360       370       380       390       400       410  

           
pF1KE6 KTGI
       :::.
CCDS35 KTGL
           

>>CCDS3520.1 TMPRSS11F gene_id:389208|Hs108|chr4          (438 aa)
 initn: 1223 init1: 689 opt: 970  Z-score: 1163.6  bits: 224.4 E(32554): 1.7e-58
Smith-Waterman score: 1240; 43.5% identity (73.3% similar) in 439 aa overlap (1-418:1-438)

                   10           20        30           40        50
pF1KE6 MMYRTVGFG----TRS---RNLKPWMIAVLIVLSLTVVAV---TIGLLVHFLVFDQKKEY
       :::  : :.    .:.   :. . :  . : ...:..::.   .::...::.: :.:. :
CCDS35 MMYAPVEFSEAEFSRAEYQRKQQFWDSVRLALFTLAIVAIIGIAIGIVTHFVVEDDKSFY
               10        20        30        40        50        60

               60        70        80        90       100       110
pF1KE6 YHGSFKILDPQINNNFGQSNTYQLKDLRETTENLVDEIFIDSAWKKNYIKNQVVRLTPEE
       : .:::. . . ..:.:  .. .. .  .  : ....::  :.    .::..:..:.:.:
CCDS35 YLASFKVTNIKYKENYGIRSSREFIERSHQIERMMSRIFRHSSVGGRFIKSHVIKLSPDE
               70        80        90       100       110       120

              120       130       140        150       160         
pF1KE6 DGVKVDVIMVFQFPSTEQRAVREKKIQSILNQKIRNLR-ALPINASSVQVNAMSSSTGEL
       .:: . ....:..:::..    .:::.. : :.... . .: ::  : ... ..:.  . 
CCDS35 QGVDILIVLIFRYPSTDSAEQIKKKIEKALYQSLKTKQLSLTINKPSFRLTPIDSKKMRN
              130       140       150       160       170       180

     170           180           190        200        210         
pF1KE6 TVQASCGKRV----VPL----NVNRIASGV-IAPKAAWPWQASLQY-DNIHQCGATLISN
        ... :: :.    .::    ...::..:   : .. ::::::::   . :::::.::::
CCDS35 LLNSRCGIRMTSSNMPLPASSSTQRIVQGRETAMEGEWPWQASLQLIGSGHQCGASLISN
              190       200       210       220       230       240

     220       230       240       250       260       270         
pF1KE6 TWLVTAAHCFQKYKNPHQWTVSFGTKINPPLMKRNVRRFIIHEKYRSAAREYDIAVVQVS
       :::.:::::: : :.: :: ..::. :.:: .:::::..:.::.:.  . : :::.::.:
CCDS35 TWLLTAAHCFWKNKDPTQWIATFGATITPPAVKRNVRKIILHENYHRETNENDIALVQLS
              250       260       270       280       290       300

     280       290       300       310       320       330         
pF1KE6 SRVTFSDDIRRICLPEASASFQPNLTVHITGFGALYYGGESQNDLREARVKIISDDVCKQ
       . : ::. ..:.:::..: .. :. .: .::::..   :  :: ::.:::. :: :::..
CCDS35 TGVEFSNIVQRVCLPDSSIKLPPKTSVFVTGFGSIVDDGPIQNTLRQARVETISTDVCNR
              310       320       330       340       350       360

     340       350       360       370       380       390         
pF1KE6 PQVYGNDIKPGMFCAGYMEGIYDACRGDSGGPLVTRDLKDTWYLIGIVSWGDNCGQKDKP
        .:: . : :::.:::.:::  :::.::::::::  : .: ::..::::::..:.   ::
CCDS35 KDVYDGLITPGMLCAGFMEGKIDACKGDSGGPLV-YDNHDIWYIVGIVSWGQSCALPKKP
              370       380       390        400       410         

     400       410        
pF1KE6 GVYTQVTYYRNWIASKTGI
       ::::.:: ::.:::::::.
CCDS35 GVYTRVTKYRDWIASKTGM
     420       430        

>>CCDS58790.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs108|chr21           (453 aa)
 initn: 670 init1: 303 opt: 693  Z-score: 831.8  bits: 163.0 E(32554): 5.2e-40
Smith-Waterman score: 693; 32.5% identity (62.0% similar) in 416 aa overlap (15-412:46-443)

                               10        20        30        40    
pF1KE6                 MMYRTVGFGTRSRNLKPWMIAVLIVLSLTVVAVTIGLLVHFLVF
                                     :: . : :. ...: ..:..::: .::   
CCDS58 RSLFGLDDLKISPVAPDADAVAAQILSLLPLKFFPIIVIGIIAL-ILALAIGLGIHF---
          20        30        40        50         60        70    

           50         60        70            80        90         
pF1KE6 DQKKEYY-HGSFKILDPQINNNFGQSNTYQLKD----LRETTENLVDEIFIDSAWK----
       : . .:  ..::: ..  :    : :.  . .:    .:   .: : ..:  ..::    
CCDS58 DCSGKYRCRSSFKCIE-LIARCDGVSDCKDGEDEYRCVRVGGQNAVLQVFTAASWKTMCS
              80         90       100       110       120       130

            100       110       120       130         140          
pF1KE6 ---KNYIKNQVVRLTPEEDGVKVDVIMVFQFPSTEQRAVREK--KIQSIL-NQKIRNLRA
          :..  : .       . :. : . :    :. .   ::.  .:. .: ..:.  :. 
CCDS58 DDWKGHYANVACAQLGFPSYVSSDNLRV----SSLEGQFREEFVSIDHLLPDDKVTALH-
              140       150           160       170       180      

     150       160       170        180       190       200        
pF1KE6 LPINASSVQVNAMSSSTGELTVQAS-CGKRVVPLNVNRIASGVIAPKAAWPWQASLQYDN
             :: :    .:   .:.: . ::.:      .::..: ..  . ::::::::...
CCDS58 -----HSVYVREGCASGHVVTLQCTACGHRR--GYSSRIVGGNMSLLSQWPWQASLQFQG
              190       200       210         220       230        

      210       220       230       240         250       260      
pF1KE6 IHQCGATLISNTWLVTAAHCFQKYKNPHQWTVSFG--TKINPPLMKRNVRRFIIHEKYRS
        : ::...:.  :..:::::      :..::.. :  . .. :  .. :.... : ::. 
CCDS58 YHLCGGSVITPLWIITAAHCVYDLYLPKSWTIQVGLVSLLDNPAPSHLVEKIVYHSKYKP
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pF1KE6 AAREYDIAVVQVSSRVTFSDDIRRICLPEASASFQPNLTVHITGFGALYYGGESQNDLRE
            :::...... .::.. :. .:::..  .:  . .   .:.::   ::...  : .
CCDS58 KRLGNDIALMKLAGPLTFNEMIQPVCLPNSEENFPDGKVCWTSGWGATEDGGDASPVLNH
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pF1KE6 ARVKIISDDVCKQPQVYGNDIKPGMFCAGYMEGIYDACRGDSGGPLVTRDLKDTWYLIGI
       : : .::. .:.. .:::. :.:.:.::::. :  :.:.:::::::: .. .  : :.: 
CCDS58 AAVPLISNKICNHRDVYGGIISPSMLCAGYLTGGVDSCQGDSGGPLVCQE-RRLWKLVGA
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pF1KE6 VSWGDNCGQKDKPGVYTQVTYYRNWIASKTGI    
       .:.: .:.. .::::::.:: . .::          
CCDS58 TSFGIGCAEVNKPGVYTRVTSFLDWIHEQMERDLKT
       420       430       440       450   

>>CCDS13686.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs108|chr21           (454 aa)
 initn: 441 init1: 211 opt: 681  Z-score: 817.4  bits: 160.4 E(32554): 3.3e-39
Smith-Waterman score: 681; 32.4% identity (61.9% similar) in 417 aa overlap (15-412:46-444)

                               10        20        30        40    
pF1KE6                 MMYRTVGFGTRSRNLKPWMIAVLIVLSLTVVAVTIGLLVHFLVF
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CCDS13 RSLFGLDDLKISPVAPDADAVAAQILSLLPLKFFPIIVIGIIAL-ILALAIGLGIHF---
          20        30        40        50         60        70    

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pF1KE6 DQKKEYY-HGSFKILDPQINNNFGQSNTYQLKD----LRETTENLVDEIFIDSAWK----
       : . .:  ..::: ..  :    : :.  . .:    .:   .: : ..:  ..::    
CCDS13 DCSGKYRCRSSFKCIE-LIARCDGVSDCKDGEDEYRCVRVGGQNAVLQVFTAASWKTMCS
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pF1KE6 ---KNYIKNQVVRLTPEEDGVKVDVIMVFQFPSTEQRAVREK--KIQSIL-NQKIRNLRA
          :..  : .       . :. : . :    :. .   ::.  .:. .: ..:.  :. 
CCDS13 DDWKGHYANVACAQLGFPSYVSSDNLRV----SSLEGQFREEFVSIDHLLPDDKVTALH-
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pF1KE6 LPINASSVQVNAMSSSTGELTVQAS-CGKRVVPLNVNRIASGVIAPKAAWPWQASLQYDN
             :: :    .:   .:.: . ::.:      .::..: ..  . ::::::::...
CCDS13 -----HSVYVREGCASGHVVTLQCTACGHRR--GYSSRIVGGNMSLLSQWPWQASLQFQG
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pF1KE6 IHQCGATLISNTWLVTAAHCFQKYKNPHQWTVSFG--TKINPPLMKRNVRRFIIHEKYRS
        : ::...:.  :..:::::      :..::.. :  . .. :  .. :.... : ::. 
CCDS13 YHLCGGSVITPLWIITAAHCVYDLYLPKSWTIQVGLVSLLDNPAPSHLVEKIVYHSKYKP
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pF1KE6 AAREYDIAVVQVSSRVTFSDDIRRICLPEASASFQPNLTVHITGFGALYYG-GESQNDLR
            :::...... .::.. :. .:::..  .:  . .   .:.::   : :...  : 
CCDS13 KRLGNDIALMKLAGPLTFNEMIQPVCLPNSEENFPDGKVCWTSGWGATEDGAGDASPVLN
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pF1KE6 EARVKIISDDVCKQPQVYGNDIKPGMFCAGYMEGIYDACRGDSGGPLVTRDLKDTWYLIG
       .: : .::. .:.. .:::. :.:.:.::::. :  :.:.:::::::: .. .  : :.:
CCDS13 HAAVPLISNKICNHRDVYGGIISPSMLCAGYLTGGVDSCQGDSGGPLVCQE-RRLWKLVG
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pF1KE6 IVSWGDNCGQKDKPGVYTQVTYYRNWIASKTGI    
        .:.: .:.. .::::::.:: . .::          
CCDS13 ATSFGIGCAEVNKPGVYTRVTSFLDWIHEQMERDLKT
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                                     .::..:... .. ::::::::  . : ::.
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       .::.. :..:::::::.  . .   ::: .: :.  :   :  .. .: :...:  ..  
CCDS74 ALIADRWVITAAHCFQEDSMASTVLWTVFLG-KVWQNSRWPGEVSFKVSRLLLHPYHEED
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pF1KE6 AREYDIAVVQVSSRVTFSDDIRRICLPEASASFQPNLTVHITGFGALYYGGESQNDLREA
       ...::.:..:..  :. :  .: .:::  :  :.:.:   :::.:::  ::  .: :...
CCDS74 SHDYDVALLQLDHPVVRSAAVRPVCLPARSHFFEPGLHCWITGWGALREGGPISNALQKV
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pF1KE6 RVKIISDDVCKQPQVYGNDIKPGMFCAGYMEGIYDACRGDSGGPLVTRDLKDTWYLIGIV
        :..: .:.:.  .::  .. : :.:::: .:  :::.:::::::: . :.  :.: :.:
CCDS74 DVQLIPQDLCS--EVYRYQVTPRMLCAGYRKGKKDACQGDSGGPLVCKALSGRWFLAGLV
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       ::: .::. .  ::::..:   .::      
CCDS74 SWGLGCGRPNYFGVYTRITGVISWIQQVVT 
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>>CCDS13941.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22          (811 aa)
 initn: 634 init1: 279 opt: 660  Z-score: 788.5  bits: 155.9 E(32554): 1.3e-37
Smith-Waterman score: 660; 42.1% identity (70.6% similar) in 235 aa overlap (185-412:575-806)

          160       170       180       190       200       210    
pF1KE6 SSVQVNAMSSSTGELTVQASCGKRVVPLNVNRIASGVIAPKAAWPWQASLQYDNIHQCGA
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CCDS13 KKPNPQCDGRPDCRDGSDEEHCDCGLQGPSSRIVGGAVSSEGEWPWQASLQVRGRHICGG
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pF1KE6 TLISNTWLVTAAHCFQK--YKNPHQWTVSFGTKI--N---PPLMKRNVRRFIIHEKYRSA
       .::.. :..:::::::.  . .   ::: .: :.  :   :  .. .: :...:  ..  
CCDS13 ALIADRWVITAAHCFQEDSMASTVLWTVFLG-KVWQNSRWPGEVSFKVSRLLLHPYHEED
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pF1KE6 AREYDIAVVQVSSRVTFSDDIRRICLPEASASFQPNLTVHITGFGALYYGGESQNDLREA
       ...::.:..:..  :. :  .: .:::  :  :.:.:   :::.:::  ::  .: :...
CCDS13 SHDYDVALLQLDHPVVRSAAVRPVCLPARSHFFEPGLHCWITGWGALREGGPISNALQKV
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pF1KE6 RVKIISDDVCKQPQVYGNDIKPGMFCAGYMEGIYDACRGDSGGPLVTRDLKDTWYLIGIV
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CCDS13 DVQLIPQDLCS--EVYRYQVTPRMLCAGYRKGKKDACQGDSGGPLVCKALSGRWFLAGLV
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CCDS13 SWGLGCGRPNYFGVYTRITGVISWIQQVVT 
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418 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 start: Tue Nov  8 12:51:52 2016 done: Tue Nov  8 12:51:52 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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