FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4104, 473 aa 1>>>pF1KE4104 473 - 473 aa - 473 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1405+/-0.000285; mu= 10.9458+/- 0.018 mean_var=132.0584+/-26.412, 0's: 0 Z-trim(121.7): 50 B-trim: 146 in 1/54 Lambda= 0.111607 statistics sampled from 38607 (38659) to 38607 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.77), E-opt: 0.2 (0.453), width: 16 Scan time: 10.830 The best scores are: opt bits E(85289) NP_065819 (OMIM: 613423) BTB/POZ domain-containing ( 428) 1144 195.1 3.3e-49 XP_005268550 (OMIM: 613423) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 428) 1144 195.1 3.3e-49 XP_006714852 (OMIM: 613423) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 428) 1144 195.1 3.3e-49 XP_011535973 (OMIM: 613423) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 428) 1144 195.1 3.3e-49 XP_005268549 (OMIM: 613423) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 428) 1144 195.1 3.3e-49 XP_011535974 (OMIM: 613423) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 304) 640 113.8 6.7e-25 XP_011535975 (OMIM: 613423) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 286) 633 112.7 1.4e-24 NP_612453 (OMIM: 610521) BTB/POZ domain-containing ( 325) 630 112.2 2.2e-24 NP_076981 (OMIM: 615240) BTB/POZ domain-containing ( 234) 247 50.5 6.1e-06 XP_011525599 (OMIM: 615240) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 283) 247 50.5 7.1e-06 NP_001123466 (OMIM: 615240) BTB/POZ domain-contain ( 283) 247 50.5 7.1e-06 XP_011525600 (OMIM: 615240) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 283) 247 50.5 7.1e-06 XP_016882772 (OMIM: 615240) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 283) 247 50.5 7.1e-06 NP_001123467 (OMIM: 615240) BTB/POZ domain-contain ( 283) 247 50.5 7.1e-06 XP_016881197 (OMIM: 181270,613420) PREDICTED: BTB/ ( 257) 230 47.8 4.4e-05 NP_945342 (OMIM: 181270,613420) BTB/POZ domain-con ( 257) 230 47.8 4.4e-05 NP_001129677 (OMIM: 181270,613420) BTB/POZ domain- ( 257) 230 47.8 4.4e-05 NP_001245150 (OMIM: 181270,613420) BTB/POZ domain- ( 257) 230 47.8 4.4e-05 NP_001245151 (OMIM: 181270,613420) BTB/POZ domain- ( 265) 230 47.8 4.5e-05 NP_001136202 (OMIM: 181270,613420) BTB/POZ domain- ( 865) 230 48.1 0.00011 XP_011522877 (OMIM: 613422) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 226) 193 41.8 0.0024 NP_056168 (OMIM: 613422) BTB/POZ domain-containing ( 263) 193 41.8 0.0028 NP_955751 (OMIM: 607947) potassium channel regulat ( 229) 184 40.3 0.0067 NP_061865 (OMIM: 611285) BTB/POZ domain-containing ( 234) 184 40.3 0.0069 NP_775876 (OMIM: 607947) potassium channel regulat ( 272) 184 40.4 0.0077 >>NP_065819 (OMIM: 613423) BTB/POZ domain-containing pro (428 aa) initn: 1681 init1: 652 opt: 1144 Z-score: 1004.5 bits: 195.1 E(85289): 3.3e-49 Smith-Waterman score: 1669; 61.7% identity (78.2% similar) in 441 aa overlap (35-473:16-428) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 DTGSGGSTILPISEMVSSSSSPGASAAAAPGPCAPSPFPEVVELNVGGQVYVTKHSTLLS : .:. :::::::::::::: :.::::.: NP_065 MALSGNCSRYYPREQGSAVPNSFPEVVELNVGGQVYFTRHSTLIS 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 VPDSTLASMFSPSSPRGGARRRGELPRDSRARFFIDRDGFLFRYVLDYLRDKQLALPEHF .: : : .::::. : : ..: .::..:::::::::::::.::::::.:..::.:: NP_065 IPHSLLWKMFSPK--RDTA---NDLAKDSKGRFFIDRDGFLFRYILDYLRDRQVVLPDHF 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 PEKERLLREAEYFQLTDLVKLLSPKVTKQNSLNDEGCQSDLEDNVSQGSSDALLLRGAAA ::: :: :::::::: ::::::.: ::. :: :.::.:: .::::. . .. 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XP_005 PEKGRLKREAEYFQLPDLVKLLTPDEIKQSP--DEFCHSDFED-ASQGSDTRIC--PPSS 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 AVPSGPGAHGGGGGGGAQDKRSGFLTLGYRGSYTTVRDNQADAKFRRVARIMVCGRIALA .:. :.. ::.:.::::: : :..::::::::: ::.:::::.:: XP_005 LLPA--------------DRKWGFITVGYRGSCTLGREGQADAKFRRVPRILVCGRISLA 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 KEVFGDTLNESRDPDRQPEKYTSRFYLKFTYLEQAFDRLSEAGFHMVACNSSGTAAFVNQ :::::.:::::::::: ::.::::::::: .::.::: ::: :::::::::: ::.:.:: XP_005 KEVFGETLNESRDPDRAPERYTSRFYLKFKHLERAFDMLSECGFHMVACNSSVTASFINQ 210 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 YRDDKIWSSYTEYIFFRPPQKIVSPKQEHEDRKHDKVTDKGSESGTSCNELSTSSCDSHS : :::::::::::.:.: :.. ::.. :. : :: .:::::::.::::::::.: XP_005 YTDDKIWSSYTEYVFYREPSRW-SPSHCDCCCKNGK-GDKEGESGTSCNDLSTSSCDSQS 270 280 290 300 310 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 EASTPQDNPSSAQQATAHQPNTLTLDRPSKKAPVQWIPPPDKRRNSELFQTLISKSRETN :::.::. . ...: : ::::: ::.::: : . ::.:.:..:: : :::.: XP_005 EASSPQE--TVICGPVTRQTNIQTLDRPIKKGPVQLIQQSEMRRKSDLLRTLTSGSRESN 320 330 340 350 360 370 430 440 450 460 470 pF1KE4 LSKKK--VCEKLSVEEEMKKCIQDFKKIHIPDYFPERKRQWQSELLQKYGL .:.:: : ::::.:::..:::::: ::.::: :::::. ::::::.:: : XP_005 MSSKKKAVKEKLSIEEELEKCIQDFLKIKIPDRFPERKHPWQSELLRKYHL 380 390 400 410 420 >>XP_011535974 (OMIM: 613423) PREDICTED: BTB/POZ domain- (304 aa) initn: 1173 init1: 630 opt: 640 Z-score: 568.0 bits: 113.8 E(85289): 6.7e-25 Smith-Waterman score: 1165; 64.1% identity (79.4% similar) in 287 aa overlap (35-321:16-278) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 DTGSGGSTILPISEMVSSSSSPGASAAAAPGPCAPSPFPEVVELNVGGQVYVTKHSTLLS : .:. :::::::::::::: :.::::.: XP_011 MALSGNCSRYYPREQGSAVPNSFPEVVELNVGGQVYFTRHSTLIS 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 VPDSTLASMFSPSSPRGGARRRGELPRDSRARFFIDRDGFLFRYVLDYLRDKQLALPEHF .: : : .::::. : : ..: .::..:::::::::::::.::::::.:..::.:: XP_011 IPHSLLWKMFSPK--RDTA---NDLAKDSKGRFFIDRDGFLFRYILDYLRDRQVVLPDHF 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 PEKERLLREAEYFQLTDLVKLLSPKVTKQNSLNDEGCQSDLEDNVSQGSSDALLLRGAAA ::: :: :::::::: ::::::.: ::. :: :.::.:: .::::. . .. XP_011 PEKGRLKREAEYFQLPDLVKLLTPDEIKQSP--DEFCHSDFED-ASQGSDTRIC--PPSS 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 AVPSGPGAHGGGGGGGAQDKRSGFLTLGYRGSYTTVRDNQADAKFRRVARIMVCGRIALA .:. :.. ::.:.::::: : :..::::::::: ::.:::::.:: XP_011 LLPA--------------DRKWGFITVGYRGSCTLGREGQADAKFRRVPRILVCGRISLA 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 KEVFGDTLNESRDPDRQPEKYTSRFYLKFTYLEQAFDRLSEAGFHMVACNSSGTAAFVNQ :::::.:::::::::: ::.::::::::: .::.::: ::: :::::::::: ::.:.:: XP_011 KEVFGETLNESRDPDRAPERYTSRFYLKFKHLERAFDMLSECGFHMVACNSSVTASFINQ 210 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 YRDDKIWSSYTEYIFFRPPQKIVSPKQEHEDRKHDKVTDKGSESGTSCNELSTSSCDSHS : :::::::::::.:.: XP_011 YTDDKIWSSYTEYVFYRCVLYNINLLYKIRASRGGEGRNSMIS 270 280 290 300 >>XP_011535975 (OMIM: 613423) PREDICTED: BTB/POZ domain- (286 aa) initn: 1166 init1: 623 opt: 633 Z-score: 562.3 bits: 112.7 E(85289): 1.4e-24 Smith-Waterman score: 1158; 64.0% identity (79.4% similar) in 286 aa overlap (35-320:16-277) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 DTGSGGSTILPISEMVSSSSSPGASAAAAPGPCAPSPFPEVVELNVGGQVYVTKHSTLLS : .:. :::::::::::::: :.::::.: XP_011 MALSGNCSRYYPREQGSAVPNSFPEVVELNVGGQVYFTRHSTLIS 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 VPDSTLASMFSPSSPRGGARRRGELPRDSRARFFIDRDGFLFRYVLDYLRDKQLALPEHF .: : : .::::. : : ..: .::..:::::::::::::.::::::.:..::.:: XP_011 IPHSLLWKMFSPK--RDTA---NDLAKDSKGRFFIDRDGFLFRYILDYLRDRQVVLPDHF 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 PEKERLLREAEYFQLTDLVKLLSPKVTKQNSLNDEGCQSDLEDNVSQGSSDALLLRGAAA ::: :: :::::::: ::::::.: ::. :: :.::.:: .::::. . .. XP_011 PEKGRLKREAEYFQLPDLVKLLTPDEIKQSP--DEFCHSDFED-ASQGSDTRIC--PPSS 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 AVPSGPGAHGGGGGGGAQDKRSGFLTLGYRGSYTTVRDNQADAKFRRVARIMVCGRIALA .:. :.. ::.:.::::: : :..::::::::: ::.:::::.:: XP_011 LLPA--------------DRKWGFITVGYRGSCTLGREGQADAKFRRVPRILVCGRISLA 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 KEVFGDTLNESRDPDRQPEKYTSRFYLKFTYLEQAFDRLSEAGFHMVACNSSGTAAFVNQ :::::.:::::::::: ::.::::::::: .::.::: ::: :::::::::: ::.:.:: XP_011 KEVFGETLNESRDPDRAPERYTSRFYLKFKHLERAFDMLSECGFHMVACNSSVTASFINQ 210 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 YRDDKIWSSYTEYIFFRPPQKIVSPKQEHEDRKHDKVTDKGSESGTSCNELSTSSCDSHS : :::::::::::.:. XP_011 YTDDKIWSSYTEYVFYPLSTVLIAT 270 280 >>NP_612453 (OMIM: 610521) BTB/POZ domain-containing pro (325 aa) initn: 894 init1: 540 opt: 630 Z-score: 558.9 bits: 112.2 E(85289): 2.2e-24 Smith-Waterman score: 1056; 51.9% identity (73.8% similar) in 343 aa overlap (1-321:1-324) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MALKDTGSGGSTILPISEMVSSSSSPGASAAAAPGPCAPSPFPEVVELNVGGQVYVTKHS ::: :. : :: .... :...... . : ::..::::::::::::.. NP_612 MALADSTRG----LP------NGGGGGGGSGSSSSSAEPPLFPDIVELNVGGQVYVTRRC 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 TLLSVPDSTLASMFSPSSPRGGARRRGELPRDSRARFFIDRDGFLFRYVLDYLRDKQLAL :..::::: : ::. ..:. :: :::..:::.:::::::::.:::::: ::.: NP_612 TVVSVPDSLLWRMFTQQQPQ-------ELARDSKGRFFLDRDGFLFRYILDYLRDLQLVL 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 pF1KE4 PEHFPEKERLLREAEYFQLTDLVKLL-SPKVT------KQNSLNDEGCQSDLEDNVSQGS :..:::. :: ::::::.: .::. : .:. .. ... :: .: . . : NP_612 PDYFPERSRLQREAEYFELPELVRRLGAPQQPGPGPPPSRRGVHKEGSLGD--ELLPLGY 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 pF1KE4 SDALLLRGAAAAVPS-----GPGAHGGGGGGG----AQD----KRSGFLTLGYRGSYTTV :. .::.:..:: . . .::..: .:. .:::..:.::::::: NP_612 SEPEQQEGASAGAPSPTLELASRSPSGGAAGPLLTPSQSLDGSRRSGYITIGYRGSYTIG 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 RDNQADAKFRRVARIMVCGRIALAKEVFGDTLNESRDPDRQPEKYTSRFYLKFTYLEQAF :: :::::::::::: :::. .:::::::::::::::::: ::.::::.::::..::::: NP_612 RDAQADAKFRRVARITVCGKTSLAKEVFGDTLNESRDPDRPPERYTSRYYLKFNFLEQAF 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 DRLSEAGFHMVACNSSGTAAFVNQ--YRDDKIWSSYTEYIFFRPPQKIVSPKQEHEDRKH :.:::.:::::::.:.:: ::... .::::.:::::.: : NP_612 DKLSESGFHMVACSSTGTCAFASSTDQSEDKIWTSYTEYVFCRE 290 300 310 320 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 DKVTDKGSESGTSCNELSTSSCDSHSEASTPQDNPSSAQQATAHQPNTLTLDRPSKKAPV >>NP_076981 (OMIM: 615240) BTB/POZ domain-containing pro (234 aa) initn: 278 init1: 163 opt: 247 Z-score: 227.7 bits: 50.5 E(85289): 6.1e-06 Smith-Waterman score: 247; 34.2% identity (61.7% similar) in 149 aa overlap (2-146:12-150) 10 20 30 40 pF1KE4 MALKDTGSGGSTILPISEMVSSSSSPGASAAAAPGPCAPSPFPEV---VE .:. :: :.. .: . :: .: :: : :. . . :. 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XP_011 MPHRKERPSGSSLHTHGSTGTAEGGNMSRLSLTRSP-VSPLAAQGIPLPAQLTKSNAPVH 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 LNVGGQVYVTKHSTLLSVPDSTLASMFSPSSPRGGARRRGELPRDS-RARFFIDRDGFLF ..:::..:... .:: . ::: .. .:. . : . :: . ..:::::: .: XP_011 IDVGGHMYTSSLATLTKYPDSRISRLFNGTEP---------IVLDSLKQHYFIDRDGEIF 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 RYVLDYLRDKQLALPEHFPEKERLLREAEYFQLTDLVKLLSPKVTKQNSLNDEGCQSDLE ::::..:: ..: ::. : . : .::.:.:: .:. : XP_011 RYVLSFLRTSKLLLPDDFKDFSLLYEEARYYQLQPMVRELERWQQEQEQRRRSRACDCLV 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 DNVSQGSSDALLLRGAAAAVPSGPGAHGGGGGGGAQDKRSGFLTLGYRGSYTTVRDNQAD XP_011 VRVTPDLGERIALSGEKALIEEVFPETGDVMCNSVNAGWNQDPTHVIRFPLNGYCRLNSV 180 190 200 210 220 230 473 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 01:44:08 2016 done: Sun Nov 6 01:44:09 2016 Total Scan time: 10.830 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]