FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2696, 307 aa 1>>>pF1KE2696 307 - 307 aa - 307 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 62035967 residues in 87258 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2516+/-0.000352; mu= 15.9350+/- 0.022 mean_var=70.8941+/-15.010, 0's: 0 Z-trim(114.5): 68 B-trim: 1490 in 2/47 Lambda= 0.152324 statistics sampled from 24533 (24614) to 24533 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.668), E-opt: 0.2 (0.282), width: 16 Scan time: 7.050 The best scores are: opt bits E(87258) NP_005105 (OMIM: 603244) heparan sulfate glucosami ( 307) 2109 472.5 4.6e-133 XP_011512215 (OMIM: 603244) PREDICTED: heparan sul ( 307) 2109 472.5 4.6e-133 XP_006715442 (OMIM: 609407) PREDICTED: heparan sul ( 346) 1014 231.9 1.4e-60 XP_016865962 (OMIM: 609407) PREDICTED: heparan sul ( 346) 1014 231.9 1.4e-60 XP_016865963 (OMIM: 609407) PREDICTED: heparan sul ( 346) 1014 231.9 1.4e-60 XP_016865961 (OMIM: 609407) PREDICTED: heparan sul ( 346) 1014 231.9 1.4e-60 XP_011533890 (OMIM: 609407) PREDICTED: heparan sul ( 346) 1014 231.9 1.4e-60 XP_016865960 (OMIM: 609407) PREDICTED: heparan sul ( 346) 1014 231.9 1.4e-60 XP_016865959 (OMIM: 609407) PREDICTED: heparan sul ( 346) 1014 231.9 1.4e-60 NP_705840 (OMIM: 609407) heparan sulfate glucosami ( 346) 1014 231.9 1.4e-60 NP_006031 (OMIM: 604059) heparan sulfate glucosami ( 456) 789 182.6 1.3e-45 NP_006034 (OMIM: 604056) heparan sulfate glucosami ( 367) 784 181.4 2.4e-45 NP_006032 (OMIM: 604058) heparan sulfate glucosami ( 390) 773 179.0 1.4e-44 NP_006033 (OMIM: 604057) heparan sulfate glucosami ( 406) 766 177.5 4.1e-44 XP_011522416 (OMIM: 604057) PREDICTED: heparan sul ( 207) 551 130.0 4e-30 XP_016880968 (OMIM: 604058) PREDICTED: heparan sul ( 203) 550 129.8 4.5e-30 XP_016864035 (OMIM: 615039) PREDICTED: bifunctiona ( 493) 398 96.7 1e-19 XP_016864034 (OMIM: 615039) PREDICTED: bifunctiona ( 493) 398 96.7 1e-19 NP_072091 (OMIM: 615039) bifunctional heparan sulf ( 872) 398 96.8 1.7e-19 XP_016864331 (OMIM: 603950) PREDICTED: bifunctiona ( 493) 385 93.8 7.6e-19 NP_004775 (OMIM: 603950) bifunctional heparan sulf ( 873) 385 94.0 1.2e-18 XP_006714479 (OMIM: 603950) PREDICTED: bifunctiona ( 873) 385 94.0 1.2e-18 XP_016864332 (OMIM: 603950) PREDICTED: bifunctiona ( 484) 371 90.7 6.3e-18 XP_016864333 (OMIM: 603950) PREDICTED: bifunctiona ( 519) 371 90.8 6.7e-18 XP_016864330 (OMIM: 603950) PREDICTED: bifunctiona ( 519) 371 90.8 6.7e-18 XP_016864328 (OMIM: 603950) PREDICTED: bifunctiona ( 899) 371 90.9 1e-17 XP_016864329 (OMIM: 603950) PREDICTED: bifunctiona ( 899) 371 90.9 1e-17 XP_016872346 (OMIM: 603268) PREDICTED: bifunctiona ( 406) 357 87.6 4.6e-17 XP_005270313 (OMIM: 603268) PREDICTED: bifunctiona ( 509) 357 87.7 5.5e-17 XP_011538612 (OMIM: 603268) PREDICTED: bifunctiona ( 883) 357 87.8 8.6e-17 NP_003626 (OMIM: 603268) bifunctional heparan sulf ( 883) 357 87.8 8.6e-17 NP_001317036 (OMIM: 603268) bifunctional heparan s ( 815) 229 59.7 2.4e-08 XP_016880969 (OMIM: 604057) PREDICTED: heparan sul ( 231) 221 57.6 2.9e-08 XP_011544304 (OMIM: 604056) PREDICTED: heparan sul ( 194) 214 56.0 7.4e-08 XP_005268499 (OMIM: 600853,616116) PREDICTED: bifu ( 471) 215 56.4 1.3e-07 XP_011544303 (OMIM: 604056) PREDICTED: heparan sul ( 204) 210 55.1 1.4e-07 XP_016864922 (OMIM: 600853,616116) PREDICTED: bifu ( 553) 215 56.5 1.5e-07 XP_016864921 (OMIM: 600853,616116) PREDICTED: bifu ( 566) 215 56.5 1.5e-07 XP_011535940 (OMIM: 600853,616116) PREDICTED: bifu ( 566) 215 56.5 1.5e-07 XP_016864917 (OMIM: 600853,616116) PREDICTED: bifu ( 882) 215 56.6 2.1e-07 NP_001534 (OMIM: 600853,616116) bifunctional hepar ( 882) 215 56.6 2.1e-07 XP_016864918 (OMIM: 600853,616116) PREDICTED: bifu ( 882) 215 56.6 2.1e-07 XP_016864920 (OMIM: 600853,616116) PREDICTED: bifu ( 882) 215 56.6 2.1e-07 XP_006714846 (OMIM: 600853,616116) PREDICTED: bifu ( 882) 215 56.6 2.1e-07 XP_016864919 (OMIM: 600853,616116) PREDICTED: bifu ( 882) 215 56.6 2.1e-07 XP_005268494 (OMIM: 600853,616116) PREDICTED: bifu ( 895) 215 56.6 2.2e-07 XP_016864916 (OMIM: 600853,616116) PREDICTED: bifu ( 895) 215 56.6 2.2e-07 XP_006714845 (OMIM: 600853,616116) PREDICTED: bifu ( 895) 215 56.6 2.2e-07 XP_005268492 (OMIM: 600853,616116) PREDICTED: bifu ( 895) 215 56.6 2.2e-07 XP_005268493 (OMIM: 600853,616116) PREDICTED: bifu ( 895) 215 56.6 2.2e-07 >>NP_005105 (OMIM: 603244) heparan sulfate glucosamine 3 (307 aa) initn: 2109 init1: 2109 opt: 2109 Z-score: 2510.0 bits: 472.5 E(87258): 4.6e-133 Smith-Waterman score: 2109; 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