Result of FASTA (ccds) for pFN21AE5744
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE5744, 626 aa
  1>>>pF1KE5744 626 - 626 aa - 626 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4260+/-0.00144; mu= -8.9193+/- 0.085
 mean_var=358.4638+/-75.232, 0's: 0 Z-trim(107.7): 103  B-trim: 25 in 2/51
 Lambda= 0.067741
 statistics sampled from 9658 (9717) to 9658 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.626), E-opt: 0.2 (0.298), width:  16
 Scan time:  3.440

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3385.1 JAKMIP1 gene_id:152789|Hs108|chr4       ( 626) 3947 400.6 3.3e-111
CCDS47005.1 JAKMIP1 gene_id:152789|Hs108|chr4      ( 831) 3787 385.0 2.1e-106
CCDS77897.1 JAKMIP1 gene_id:152789|Hs108|chr4      ( 461) 2665 275.2 1.4e-73
CCDS59495.1 JAKMIP2 gene_id:9832|Hs108|chr5        ( 799) 1830 193.8 7.6e-49
CCDS4285.1 JAKMIP2 gene_id:9832|Hs108|chr5         ( 810) 1819 192.7 1.6e-48
CCDS75352.1 JAKMIP2 gene_id:9832|Hs108|chr5        ( 820) 1819 192.7 1.6e-48
CCDS64284.1 JAKMIP2 gene_id:9832|Hs108|chr5        ( 778) 1631 174.3 5.4e-43
CCDS44494.1 JAKMIP3 gene_id:282973|Hs108|chr10     ( 844) 1617 173.0 1.5e-42


>>CCDS3385.1 JAKMIP1 gene_id:152789|Hs108|chr4            (626 aa)
 initn: 3947 init1: 3947 opt: 3947  Z-score: 2110.0  bits: 400.6 E(32554): 3.3e-111
Smith-Waterman score: 3947; 99.8% identity (100.0% similar) in 626 aa overlap (1-626:1-626)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MSKKGRSKGEKPEMETDAVQMANEELRAKLTSIQIEFQQEKSKVGKLRERLQEAKLEREQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MSKKGRSKGEKPEMETDAVQMANEELRAKLTSIQIEFQQEKSKVGKLRERLQEAKLEREQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 EQRRHTAYISELKAKLHEEKTKELQALREGLIRQHEQEAARTAKIKEGELQRLQATLNVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EQRRHTAYISELKAKLHEEKTKELQALREGLIRQHEQEAARTAKIKEGELQRLQATLNVL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 RDGAADKVKTALLTEAREEARRAFDGERLRLQQEILELKAARNQAEEALSNCMQADKTKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS33 RDGAADKVKTALLTEAREEARRAFDGERLRLQQEILELKAARKQAEEALSNCMQADKTKA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 ADLRAAYQAHQDEVHRIKRECERDIRRLMDEIKGKDRVILALEKELGVQAGQTQKLLLQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ADLRAAYQAHQDEVHRIKRECERDIRRLMDEIKGKDRVILALEKELGVQAGQTQKLLLQK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 EALDEQLVQVKEAERHHSSPKRELPPGIGDMVELMGVQDQHMDERDVRRFQLKIAELNSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EALDEQLVQVKEAERHHSSPKRELPPGIGDMVELMGVQDQHMDERDVRRFQLKIAELNSV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 IRKLEDRNTLLADERNELLKRSRETEVQLKPLVEKNKRMNKKNEDLLQSIQRMEEKIKNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IRKLEDRNTLLADERNELLKRSRETEVQLKPLVEKNKRMNKKNEDLLQSIQRMEEKIKNL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 TRENVEMKEKLSAQASLKRHTSLNDLSLTRDEQEIEFLRLQVLEQQHVIDDLSLERERLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TRENVEMKEKLSAQASLKRHTSLNDLSLTRDEQEIEFLRLQVLEQQHVIDDLSLERERLL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 RSKRHRGKSLKPPKKHVVETFFGFDEESVDSETLSETSYNTDRTDRTPATPEEDLDDATA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RSKRHRGKSLKPPKKHVVETFFGFDEESVDSETLSETSYNTDRTDRTPATPEEDLDDATA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE5 REEADLRFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRCQAKIEDLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 REEADLRFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRCQAKIEDLE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE5 KLLVEKGQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEKIYRLEMEENQLKNEMQDAKDQNELLEFRVLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KLLVEKGQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEKIYRLEMEENQLKNEMQDAKDQNELLEFRVLE
              550       560       570       580       590       600

              610       620      
pF1KE5 LEVRDSICCKLSNGADILFEPKLKFM
       ::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LEVRDSICCKLSNGADILFEPKLKFM
              610       620      

>>CCDS47005.1 JAKMIP1 gene_id:152789|Hs108|chr4           (831 aa)
 initn: 3875 init1: 3787 opt: 3787  Z-score: 2023.8  bits: 385.0 E(32554): 2.1e-106
Smith-Waterman score: 3787; 99.5% identity (99.8% similar) in 605 aa overlap (1-605:1-605)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MSKKGRSKGEKPEMETDAVQMANEELRAKLTSIQIEFQQEKSKVGKLRERLQEAKLEREQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MSKKGRSKGEKPEMETDAVQMANEELRAKLTSIQIEFQQEKSKVGKLRERLQEAKLEREQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 EQRRHTAYISELKAKLHEEKTKELQALREGLIRQHEQEAARTAKIKEGELQRLQATLNVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EQRRHTAYISELKAKLHEEKTKELQALREGLIRQHEQEAARTAKIKEGELQRLQATLNVL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 RDGAADKVKTALLTEAREEARRAFDGERLRLQQEILELKAARNQAEEALSNCMQADKTKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS47 RDGAADKVKTALLTEAREEARRAFDGERLRLQQEILELKAARKQAEEALSNCMQADKTKA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 ADLRAAYQAHQDEVHRIKRECERDIRRLMDEIKGKDRVILALEKELGVQAGQTQKLLLQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ADLRAAYQAHQDEVHRIKRECERDIRRLMDEIKGKDRVILALEKELGVQAGQTQKLLLQK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 EALDEQLVQVKEAERHHSSPKRELPPGIGDMVELMGVQDQHMDERDVRRFQLKIAELNSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EALDEQLVQVKEAERHHSSPKRELPPGIGDMVELMGVQDQHMDERDVRRFQLKIAELNSV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 IRKLEDRNTLLADERNELLKRSRETEVQLKPLVEKNKRMNKKNEDLLQSIQRMEEKIKNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IRKLEDRNTLLADERNELLKRSRETEVQLKPLVEKNKRMNKKNEDLLQSIQRMEEKIKNL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 TRENVEMKEKLSAQASLKRHTSLNDLSLTRDEQEIEFLRLQVLEQQHVIDDLSLERERLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TRENVEMKEKLSAQASLKRHTSLNDLSLTRDEQEIEFLRLQVLEQQHVIDDLSLERERLL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 RSKRHRGKSLKPPKKHVVETFFGFDEESVDSETLSETSYNTDRTDRTPATPEEDLDDATA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RSKRHRGKSLKPPKKHVVETFFGFDEESVDSETLSETSYNTDRTDRTPATPEEDLDDATA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE5 REEADLRFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRCQAKIEDLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 REEADLRFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRCQAKIEDLE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE5 KLLVEKGQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEKIYRLEMEENQLKNEMQDAKDQNELLEFRVLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KLLVEKGQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEKIYRLEMEENQLKNEMQDAKDQNELLEFRVLE
              550       560       570       580       590       600

              610       620                                        
pF1KE5 LEVRDSICCKLSNGADILFEPKLKFM                                  
       :: :.                                                       
CCDS47 LEERERRSPAFNLQITTFPENHSSALQLFCHQEGVKDVNVSELMKKLDILGDNGNLRNEE
              610       620       630       640       650       660

>>CCDS77897.1 JAKMIP1 gene_id:152789|Hs108|chr4           (461 aa)
 initn: 2658 init1: 2658 opt: 2665  Z-score: 1434.7  bits: 275.2 E(32554): 1.4e-73
Smith-Waterman score: 2667; 91.5% identity (94.5% similar) in 470 aa overlap (159-626:3-461)

      130       140       150       160       170       180        
pF1KE5 KTALLTEAREEARRAFDGERLRLQQEILELKAARNQAEEALSNCMQADKTKAAD--LRAA
                                     : .:...:.     :..: .. :.  ::: 
CCDS77                             MSKKGRSKGEKPE---METDAVQMANEELRAK
                                           10           20         

        190       200       210       220       230       240      
pF1KE5 YQAHQDEVHRIKRECERDIRRLMDEIKGKDRVILALEKELGVQAGQTQKLLLQKEALDEQ
         . : : .. : .        ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LTSIQIEFQQEKSK--------MDEIKGKDRVILALEKELGVQAGQTQKLLLQKEALDEQ
      30        40                50        60        70        80 

        250       260       270       280       290       300      
pF1KE5 LVQVKEAERHHSSPKRELPPGIGDMVELMGVQDQHMDERDVRRFQLKIAELNSVIRKLED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LVQVKEAERHHSSPKRELPPGIGDMVELMGVQDQHMDERDVRRFQLKIAELNSVIRKLED
              90       100       110       120       130       140 

        310       320       330       340       350       360      
pF1KE5 RNTLLADERNELLKRSRETEVQLKPLVEKNKRMNKKNEDLLQSIQRMEEKIKNLTRENVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RNTLLADERNELLKRSRETEVQLKPLVEKNKRMNKKNEDLLQSIQRMEEKIKNLTRENVE
             150       160       170       180       190       200 

        370       380       390       400       410       420      
pF1KE5 MKEKLSAQASLKRHTSLNDLSLTRDEQEIEFLRLQVLEQQHVIDDLSLERERLLRSKRHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MKEKLSAQASLKRHTSLNDLSLTRDEQEIEFLRLQVLEQQHVIDDLSLERERLLRSKRHR
             210       220       230       240       250       260 

        430       440       450       460       470       480      
pF1KE5 GKSLKPPKKHVVETFFGFDEESVDSETLSETSYNTDRTDRTPATPEEDLDDATAREEADL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GKSLKPPKKHVVETFFGFDEESVDSETLSETSYNTDRTDRTPATPEEDLDDATAREEADL
             270       280       290       300       310       320 

        490       500       510       520       530       540      
pF1KE5 RFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRCQAKIEDLEKLLVEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRCQAKIEDLEKLLVEK
             330       340       350       360       370       380 

        550       560       570       580       590       600      
pF1KE5 GQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEKIYRLEMEENQLKNEMQDAKDQNELLEFRVLELEVRDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEKIYRLEMEENQLKNEMQDAKDQNELLEFRVLELEVRDS
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        610       620      
pF1KE5 ICCKLSNGADILFEPKLKFM
       ::::::::::::::::::::
CCDS77 ICCKLSNGADILFEPKLKFM
             450       460 

>>CCDS59495.1 JAKMIP2 gene_id:9832|Hs108|chr5             (799 aa)
 initn: 2210 init1: 960 opt: 1830  Z-score: 990.4  bits: 193.8 E(32554): 7.6e-49
Smith-Waterman score: 2251; 61.1% identity (81.8% similar) in 606 aa overlap (1-605:1-574)

               10        20        30        40         50         
pF1KE5 MSKKGRSKGEKPEMETDAVQMANEELRAKLTSIQIEFQQEKSKVGKL-RERLQEAKLERE
       ::::::.::::::    :.: :::.::.:::.::::..::::::.:: ::. ::::  ::
CCDS59 MSKKGRNKGEKPEALIVALQAANEDLRTKLTDIQIELHQEKSKVSKLEREKTQEAKRIRE
               10        20        30        40        50        60

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pF1KE5 QEQRRHTAYISELKAKLHEEKTKELQALREGLIRQHEQEAARTAKIKEGELQRLQATLNV
        :::.::. ..:::::::::: :::::.::.::.::::: .::.:...::.:::...: .
CCDS59 LEQRKHTVLVTELKAKLHEEKMKELQAVRENLIKQHEQEMSRTVKVRDGEIQRLKSALCA
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pF1KE5 LRDGAADKVKTALLTEAREEARRAFDGERLRLQQEILELKAARNQAEEALSNCMQADKTK
       ::::..:::.:::  :::::::. :: :::.: ::: .::.:..:..::::: .:::: :
CCDS59 LRDGSSDKVRTALTIEAREEARKLFDTERLKLLQEIADLKTAKKQVDEALSNMIQADKIK
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pF1KE5 AADLRAAYQAHQDEVHRIKRECERDIRRLMDEIKGKDRVILALEKELGVQAGQTQKLLLQ
       :.:::. .:.::. . .:: : ::::::::::::.:::.:..::::: .:.: .::: ::
CCDS59 AGDLRSEHQSHQEAISKIKWESERDIRRLMDEIKAKDRIIFSLEKELETQTGYVQKLQLQ
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pF1KE5 KEALDEQLVQVKEAERHHSSPKRELPPGIGDMVELMGVQDQHMDERDVRRFQLKIAELNS
       ::::::::  ::::: . ::::::.:   ::  :       : .  :.:: : .:::::.
CCDS59 KEALDEQLFLVKEAECNMSSPKREIPGRAGDGSE-------HCSSPDLRRNQKRIAELNA
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pF1KE5 VIRKLEDRNTLLADERNELLKRSRETEVQLKPLVEKNKRMNKKNEDLLQSIQRMEEKIKN
       .:::::::::::.::::::::: :::: : :::.:.:: . :.:..:. :.::::::.: 
CCDS59 TIRKLEDRNTLLGDERNELLKRVRETEKQCKPLLERNKCLAKRNDELMVSLQRMEEKLKA
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pF1KE5 LTRENVEMKEKLSAQASLKRHTSLNDLSLTRDEQEIEFLRLQVLEQQHVIDDLSLERERL
       .:.:: ::.::....  ::.  :::::. . .::: :::.:::.:::..::.:. .::.:
CCDS59 VTKENSEMREKITSHPPLKKLKSLNDLDQANEEQETEFLKLQVIEQQNIIDELTRDREKL
           360       370       380       390       400       410   

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pF1KE5 LRSKRHRGKSLKPPKKHVVETFFGFDEESVDSETLSETSYNTDRTDRTPATPEEDLDDAT
       .: ..:: .: :: :. :.. :.:.::.:.:::: : .:.   :::::::::..:::.. 
CCDS59 IRRRKHR-RSSKPIKRPVLDPFIGYDEDSMDSETSSMASF---RTDRTPATPDDDLDESL
           420        430       440       450          460         

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pF1KE5 AREEADLRFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRCQAKIEDL
       : ::..::: :::.:::::::::::::::.:: .::::::...:::::..:: .::::::
CCDS59 AAEESELRFRQLTKEYQALQRAYALLQEQTGGIIDAEREAKAQEQLQAEVLRYKAKIEDL
     470       480       490       500       510       520         

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pF1KE5 EKLLVEKGQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEKIYRLEMEENQLKNEMQDAKDQNELLEFRVL
       :  :..:::      :::                : :...:..:.:::.::::::::: :
CCDS59 EATLAQKGQI-----EKQ----------------EAENHRLQQELQDARDQNELLEFRNL
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pF1KE5 ELEVRDSICCKLSNGADILFEPKLKFM                                 
       ::: :.                                                      
CCDS59 ELEERERRSPPFNLQIHPFSDGVSALQIYCMKEGVKDVNIPDLIKQLDILGDNGNLRNEE
      570       580       590       600       610       620        

>>CCDS4285.1 JAKMIP2 gene_id:9832|Hs108|chr5              (810 aa)
 initn: 2343 init1: 960 opt: 1819  Z-score: 984.5  bits: 192.7 E(32554): 1.6e-48
Smith-Waterman score: 2407; 63.2% identity (85.0% similar) in 606 aa overlap (1-605:1-595)

               10        20        30        40         50         
pF1KE5 MSKKGRSKGEKPEMETDAVQMANEELRAKLTSIQIEFQQEKSKVGKL-RERLQEAKLERE
       ::::::.::::::    :.: :::.::.:::.::::..::::::.:: ::. ::::  ::
CCDS42 MSKKGRNKGEKPEALIVALQAANEDLRTKLTDIQIELHQEKSKVSKLEREKTQEAKRIRE
               10        20        30        40        50        60

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pF1KE5 QEQRRHTAYISELKAKLHEEKTKELQALREGLIRQHEQEAARTAKIKEGELQRLQATLNV
        :::.::. ..:::::::::: :::::.::.::.::::: .::.:...::.:::...: .
CCDS42 LEQRKHTVLVTELKAKLHEEKMKELQAVRENLIKQHEQEMSRTVKVRDGEIQRLKSALCA
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE5 LRDGAADKVKTALLTEAREEARRAFDGERLRLQQEILELKAARNQAEEALSNCMQADKTK
       ::::..:::.:::  :::::::. :: :::.: ::: .::.:..:..::::: .:::: :
CCDS42 LRDGSSDKVRTALTIEAREEARKLFDTERLKLLQEIADLKTAKKQVDEALSNMIQADKIK
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE5 AADLRAAYQAHQDEVHRIKRECERDIRRLMDEIKGKDRVILALEKELGVQAGQTQKLLLQ
       :.:::. .:.::. . .:: : ::::::::::::.:::.:..::::: .:.: .::: ::
CCDS42 AGDLRSEHQSHQEAISKIKWESERDIRRLMDEIKAKDRIIFSLEKELETQTGYVQKLQLQ
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE5 KEALDEQLVQVKEAERHHSSPKRELPPGIGDMVELMGVQDQHMDERDVRRFQLKIAELNS
       ::::::::  ::::: . ::::::.:   ::  :       : .  :.:: : .:::::.
CCDS42 KEALDEQLFLVKEAECNMSSPKREIPGRAGDGSE-------HCSSPDLRRNQKRIAELNA
              250       260       270              280       290   

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pF1KE5 VIRKLEDRNTLLADERNELLKRSRETEVQLKPLVEKNKRMNKKNEDLLQSIQRMEEKIKN
       .:::::::::::.::::::::: :::: : :::.:.:: . :.:..:. :.::::::.: 
CCDS42 TIRKLEDRNTLLGDERNELLKRVRETEKQCKPLLERNKCLAKRNDELMVSLQRMEEKLKA
           300       310       320       330       340       350   

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pF1KE5 LTRENVEMKEKLSAQASLKRHTSLNDLSLTRDEQEIEFLRLQVLEQQHVIDDLSLERERL
       .:.:: ::.::....  ::.  :::::. . .::: :::.:::.:::..::.:. .::.:
CCDS42 VTKENSEMREKITSHPPLKKLKSLNDLDQANEEQETEFLKLQVIEQQNIIDELTRDREKL
           360       370       380       390       400       410   

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pF1KE5 LRSKRHRGKSLKPPKKHVVETFFGFDEESVDSETLSETSYNTDRTDRTPATPEEDLDDAT
       .: ..:: .: :: :. :.. :.:.::.:.:::: : .:.   :::::::::..:::.. 
CCDS42 IRRRKHR-RSSKPIKRPVLDPFIGYDEDSMDSETSSMASF---RTDRTPATPDDDLDESL
           420        430       440       450          460         

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pF1KE5 AREEADLRFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRCQAKIEDL
       : ::..::: :::.:::::::::::::::.:: .::::::...:::::..:: .::::::
CCDS42 AAEESELRFRQLTKEYQALQRAYALLQEQTGGIIDAEREAKAQEQLQAEVLRYKAKIEDL
     470       480       490       500       510       520         

     540       550       560       570       580       590         
pF1KE5 EKLLVEKGQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEKIYRLEMEENQLKNEMQDAKDQNELLEFRVL
       :  :..:::::.:::.:::.:. ::.::::: . : :...:..:.:::.::::::::: :
CCDS42 EATLAQKGQDSHWVEDKQLFIKRNQELLEKIEKQEAENHRLQQELQDARDQNELLEFRNL
     530       540       550       560       570       580         

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pF1KE5 ELEVRDSICCKLSNGADILFEPKLKFM                                 
       ::: :.                                                      
CCDS42 ELEERERRSPPFNLQIHPFSDGVSALQIYCMKEGVKDVNIPDLIKQLDILGDNGNLRNEE
     590       600       610       620       630       640         

>>CCDS75352.1 JAKMIP2 gene_id:9832|Hs108|chr5             (820 aa)
 initn: 2343 init1: 960 opt: 1819  Z-score: 984.4  bits: 192.7 E(32554): 1.6e-48
Smith-Waterman score: 2407; 63.2% identity (85.0% similar) in 606 aa overlap (1-605:1-595)

               10        20        30        40         50         
pF1KE5 MSKKGRSKGEKPEMETDAVQMANEELRAKLTSIQIEFQQEKSKVGKL-RERLQEAKLERE
       ::::::.::::::    :.: :::.::.:::.::::..::::::.:: ::. ::::  ::
CCDS75 MSKKGRNKGEKPEALIVALQAANEDLRTKLTDIQIELHQEKSKVSKLEREKTQEAKRIRE
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE5 QEQRRHTAYISELKAKLHEEKTKELQALREGLIRQHEQEAARTAKIKEGELQRLQATLNV
        :::.::. ..:::::::::: :::::.::.::.::::: .::.:...::.:::...: .
CCDS75 LEQRKHTVLVTELKAKLHEEKMKELQAVRENLIKQHEQEMSRTVKVRDGEIQRLKSALCA
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE5 LRDGAADKVKTALLTEAREEARRAFDGERLRLQQEILELKAARNQAEEALSNCMQADKTK
       ::::..:::.:::  :::::::. :: :::.: ::: .::.:..:..::::: .:::: :
CCDS75 LRDGSSDKVRTALTIEAREEARKLFDTERLKLLQEIADLKTAKKQVDEALSNMIQADKIK
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE5 AADLRAAYQAHQDEVHRIKRECERDIRRLMDEIKGKDRVILALEKELGVQAGQTQKLLLQ
       :.:::. .:.::. . .:: : ::::::::::::.:::.:..::::: .:.: .::: ::
CCDS75 AGDLRSEHQSHQEAISKIKWESERDIRRLMDEIKAKDRIIFSLEKELETQTGYVQKLQLQ
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE5 KEALDEQLVQVKEAERHHSSPKRELPPGIGDMVELMGVQDQHMDERDVRRFQLKIAELNS
       ::::::::  ::::: . ::::::.:   ::  :       : .  :.:: : .:::::.
CCDS75 KEALDEQLFLVKEAECNMSSPKREIPGRAGDGSE-------HCSSPDLRRNQKRIAELNA
              250       260       270              280       290   

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE5 VIRKLEDRNTLLADERNELLKRSRETEVQLKPLVEKNKRMNKKNEDLLQSIQRMEEKIKN
       .:::::::::::.::::::::: :::: : :::.:.:: . :.:..:. :.::::::.: 
CCDS75 TIRKLEDRNTLLGDERNELLKRVRETEKQCKPLLERNKCLAKRNDELMVSLQRMEEKLKA
           300       310       320       330       340       350   

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pF1KE5 LTRENVEMKEKLSAQASLKRHTSLNDLSLTRDEQEIEFLRLQVLEQQHVIDDLSLERERL
       .:.:: ::.::....  ::.  :::::. . .::: :::.:::.:::..::.:. .::.:
CCDS75 VTKENSEMREKITSHPPLKKLKSLNDLDQANEEQETEFLKLQVIEQQNIIDELTRDREKL
           360       370       380       390       400       410   

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE5 LRSKRHRGKSLKPPKKHVVETFFGFDEESVDSETLSETSYNTDRTDRTPATPEEDLDDAT
       .: ..:: .: :: :. :.. :.:.::.:.:::: : .:.   :::::::::..:::.. 
CCDS75 IRRRKHR-RSSKPIKRPVLDPFIGYDEDSMDSETSSMASF---RTDRTPATPDDDLDESL
           420        430       440       450          460         

     480       490       500       510       520       530         
pF1KE5 AREEADLRFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRCQAKIEDL
       : ::..::: :::.:::::::::::::::.:: .::::::...:::::..:: .::::::
CCDS75 AAEESELRFRQLTKEYQALQRAYALLQEQTGGIIDAEREAKAQEQLQAEVLRYKAKIEDL
     470       480       490       500       510       520         

     540       550       560       570       580       590         
pF1KE5 EKLLVEKGQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEKIYRLEMEENQLKNEMQDAKDQNELLEFRVL
       :  :..:::::.:::.:::.:. ::.::::: . : :...:..:.:::.::::::::: :
CCDS75 EATLAQKGQDSHWVEDKQLFIKRNQELLEKIEKQEAENHRLQQELQDARDQNELLEFRNL
     530       540       550       560       570       580         

     600       610       620                                       
pF1KE5 ELEVRDSICCKLSNGADILFEPKLKFM                                 
       ::: :.                                                      
CCDS75 ELEERERRSPPFNLQIHPFSDGVSALQIYCMKEGVKDVNIPDLIKQLDILGDNGNLRNEE
     590       600       610       620       630       640         

>>CCDS64284.1 JAKMIP2 gene_id:9832|Hs108|chr5             (778 aa)
 initn: 2153 init1: 960 opt: 1631  Z-score: 885.4  bits: 174.3 E(32554): 5.4e-43
Smith-Waterman score: 2219; 62.5% identity (84.7% similar) in 563 aa overlap (44-605:2-553)

            20        30        40         50        60        70  
pF1KE5 METDAVQMANEELRAKLTSIQIEFQQEKSKVGKL-RERLQEAKLEREQEQRRHTAYISEL
                                     :.:: ::. ::::  :: :::.::. ..::
CCDS64                              MVSKLEREKTQEAKRIRELEQRKHTVLVTEL
                                            10        20        30 

             80        90       100       110       120       130  
pF1KE5 KAKLHEEKTKELQALREGLIRQHEQEAARTAKIKEGELQRLQATLNVLRDGAADKVKTAL
       :::::::: :::::.::.::.::::: .::.:...::.:::...: .::::..:::.:::
CCDS64 KAKLHEEKMKELQAVRENLIKQHEQEMSRTVKVRDGEIQRLKSALCALRDGSSDKVRTAL
              40        50        60        70        80        90 

            140       150       160       170       180       190  
pF1KE5 LTEAREEARRAFDGERLRLQQEILELKAARNQAEEALSNCMQADKTKAADLRAAYQAHQD
         :::::::. :: :::.: ::: .::.:..:..::::: .:::: ::.:::. .:.::.
CCDS64 TIEAREEARKLFDTERLKLLQEIADLKTAKKQVDEALSNMIQADKIKAGDLRSEHQSHQE
             100       110       120       130       140       150 

            200       210       220       230       240       250  
pF1KE5 EVHRIKRECERDIRRLMDEIKGKDRVILALEKELGVQAGQTQKLLLQKEALDEQLVQVKE
        . .:: : ::::::::::::.:::.:..::::: .:.: .::: ::::::::::  :::
CCDS64 AISKIKWESERDIRRLMDEIKAKDRIIFSLEKELETQTGYVQKLQLQKEALDEQLFLVKE
             160       170       180       190       200       210 

            260       270       280       290       300       310  
pF1KE5 AERHHSSPKRELPPGIGDMVELMGVQDQHMDERDVRRFQLKIAELNSVIRKLEDRNTLLA
       :: . ::::::.:   ::  :       : .  :.:: : .:::::..:::::::::::.
CCDS64 AECNMSSPKREIPGRAGDGSE-------HCSSPDLRRNQKRIAELNATIRKLEDRNTLLG
             220       230              240       250       260    

            320       330       340       350       360       370  
pF1KE5 DERNELLKRSRETEVQLKPLVEKNKRMNKKNEDLLQSIQRMEEKIKNLTRENVEMKEKLS
       ::::::::: :::: : :::.:.:: . :.:..:. :.::::::.: .:.:: ::.::..
CCDS64 DERNELLKRVRETEKQCKPLLERNKCLAKRNDELMVSLQRMEEKLKAVTKENSEMREKIT
          270       280       290       300       310       320    

            380       390       400       410       420       430  
pF1KE5 AQASLKRHTSLNDLSLTRDEQEIEFLRLQVLEQQHVIDDLSLERERLLRSKRHRGKSLKP
       ..  ::.  :::::. . .::: :::.:::.:::..::.:. .::.:.: ..:: .: ::
CCDS64 SHPPLKKLKSLNDLDQANEEQETEFLKLQVIEQQNIIDELTRDREKLIRRRKHR-RSSKP
          330       340       350       360       370        380   

            440       450       460       470       480       490  
pF1KE5 PKKHVVETFFGFDEESVDSETLSETSYNTDRTDRTPATPEEDLDDATAREEADLRFCQLT
        :. :.. :.:.::.:.:::: : .:.   :::::::::..:::.. : ::..::: :::
CCDS64 IKRPVLDPFIGYDEDSMDSETSSMASF---RTDRTPATPDDDLDESLAAEESELRFRQLT
           390       400       410          420       430       440

            500       510       520       530       540       550  
pF1KE5 REYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRCQAKIEDLEKLLVEKGQDSKW
       .:::::::::::::::.:: .::::::...:::::..:: .:::::::  :..:::::.:
CCDS64 KEYQALQRAYALLQEQTGGIIDAEREAKAQEQLQAEVLRYKAKIEDLEATLAQKGQDSHW
              450       460       470       480       490       500

            560       570       580       590       600       610  
pF1KE5 VEEKQLLIRTNQDLLEKIYRLEMEENQLKNEMQDAKDQNELLEFRVLELEVRDSICCKLS
       ::.:::.:. ::.::::: . : :...:..:.:::.::::::::: :::: :.       
CCDS64 VEDKQLFIKRNQELLEKIEKQEAENHRLQQELQDARDQNELLEFRNLELEERERRSPPFN
              510       520       530       540       550       560

            620                                                    
pF1KE5 NGADILFEPKLKFM                                              
                                                                   
CCDS64 LQIHPFSDGVSALQIYCMKEGVKDVNIPDLIKQLDILGDNGNLRNEEQVAIIQASTVLSL
              570       580       590       600       610       620

>>CCDS44494.1 JAKMIP3 gene_id:282973|Hs108|chr10          (844 aa)
 initn: 2254 init1: 883 opt: 1617  Z-score: 877.5  bits: 173.0 E(32554): 1.5e-42
Smith-Waterman score: 2357; 60.3% identity (84.5% similar) in 624 aa overlap (1-605:1-619)

                  10        20        30        40         50      
pF1KE5 MSKKG---RSKGEKPEMETDAVQMANEELRAKLTSIQIEFQQEKSKVGKL-RERLQEAKL
       :::.:   :.::.: :    :.: :::.::::::.::::.:::::::.:. ::. :: . 
CCDS44 MSKRGMSSRAKGDKAEA-LAALQAANEDLRAKLTDIQIELQQEKSKVSKVEREKNQELRQ
               10         20        30        40        50         

         60        70        80        90       100       110      
pF1KE5 EREQEQRRHTAYISELKAKLHEEKTKELQALREGLIRQHEQEAARTAKIKEGELQRLQAT
        ::.::.. .. ..:::.:::::: :::::.:: :.:::: :  :. :::..: ::::: 
CCDS44 VREHEQHKTAVLLTELKTKLHEEKMKELQAVRETLLRQHEAELLRVIKIKDNENQRLQAL
      60        70        80        90       100       110         

        120       130       140       150       160       170      
pF1KE5 LNVLRDGAADKVKTALLTEAREEARRAFDGERLRLQQEILELKAARNQAEEALSNCMQAD
       :..::::. .::::.::.::.:::...:. :....:::: :::.:. :.::::.  .:::
CCDS44 LSALRDGGPEKVKTVLLSEAKEEAKKGFEVEKVKMQQEISELKGAKRQVEEALTLVIQAD
     120       130       140       150       160       170         

        180       190       200       210       220       230      
pF1KE5 KTKAADLRAAYQAHQDEVHRIKRECERDIRRLMDEIKGKDRVILALEKELGVQAGQTQKL
       : :::..:..:. ::.:. :::.::::.:::::.::: :::....::.:::::::..:.:
CCDS44 KIKAAEIRSVYHLHQEEITRIKKECEREIRRLMEEIKFKDRAVFVLERELGVQAGHAQRL
     180       190       200       210       220       230         

        240       250       260         270       280       290    
pF1KE5 LLQKEALDEQLVQVKEAERHHSSPKRELP--PGIGDMVELMGVQDQHMDERDVRRFQLKI
        :::::::::: ::.::.:: .::.::::   : ::  .  :  .:..::.:.:::::::
CCDS44 QLQKEALDEQLSQVREADRHPGSPRRELPHAAGAGDASDHSGSPEQQLDEKDARRFQLKI
     240       250       260       270       280       290         

          300       310       320       330       340       350    
pF1KE5 AELNSVIRKLEDRNTLLADERNELLKRSRETEVQLKPLVEKNKRMNKKNEDLLQSIQRME
       :::...::::::::.::..:::::::: ::.: : :::..::::...::::: ....:::
CCDS44 AELSAIIRKLEDRNALLSEERNELLKRVREAESQYKPLLDKNKRLSRKNEDLSHALRRME
     300       310       320       330       340       350         

          360       370       380       390       400       410    
pF1KE5 EKIKNLTRENVEMKEKLSAQASLKRHTSLNDLSLTRDEQEIEFLRLQVLEQQHVIDDLS-
       .:.: .:.::.::... .    ..: .:::::. ..::.:..::.::..:::..::.:: 
CCDS44 NKLKFVTQENIEMRQRAGI---IRRPSSLNDLDQSQDEREVDFLKLQIVEQQNLIDELSK
     360       370          380       390       400       410      

                      420       430       440        450       460 
pF1KE5 -----------LERERLLRSKRHRGKSLKPPKKHVVETFFGFDEE-SVDSETLSETSYNT
                  :::..::: ...: :  : ::  :::::::.::: :..:.  : .::.:
CCDS44 TLETAGYVKSVLERDKLLRFRKQRKKMAKLPKPVVVETFFGYDEEASLESDG-SSVSYQT
        420       430       440       450       460        470     

             470       480       490       500       510       520 
pF1KE5 DRTDRTPATPEEDLDDATAREEADLRFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREART
       ::::.:: ::..::... :.::..::: ::: :::::::::::::::::::::::::..:
CCDS44 DRTDQTPCTPDDDLEEGMAKEETELRFRQLTMEYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREVKT
         480       490       500       510       520       530     

             530       540       550       560       570       580 
pF1KE5 REQLQADLLRCQAKIEDLEKLLVEKGQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEKIYRLEMEENQLK
       ::::::.. : ::.:::::: :.:.::: ::.:::: : : ::.:.::: ..: :: .:.
CCDS44 REQLQAEVQRAQARIEDLEKALAEQGQDMKWIEEKQALYRRNQELVEKIKQMETEEARLR
         540       550       560       570       580       590     

             590       600       610       620                     
pF1KE5 NEMQDAKDQNELLEFRVLELEVRDSICCKLSNGADILFEPKLKFM               
       .:.:::.:::::::::.:::: :.                                    
CCDS44 HEVQDARDQNELLEFRILELEERERKSPAISFHHTPFVDGKSPLQVYCEAEGVTDIVVAE
         600       610       620       630       640       650     




626 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Tue Nov  8 06:18:20 2016 done: Tue Nov  8 06:18:20 2016
 Total Scan time:  3.440 Total Display time:  0.120

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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