FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5744, 626 aa 1>>>pF1KE5744 626 - 626 aa - 626 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4260+/-0.00144; mu= -8.9193+/- 0.085 mean_var=358.4638+/-75.232, 0's: 0 Z-trim(107.7): 103 B-trim: 25 in 2/51 Lambda= 0.067741 statistics sampled from 9658 (9717) to 9658 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.626), E-opt: 0.2 (0.298), width: 16 Scan time: 3.440 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3385.1 JAKMIP1 gene_id:152789|Hs108|chr4 ( 626) 3947 400.6 3.3e-111 CCDS47005.1 JAKMIP1 gene_id:152789|Hs108|chr4 ( 831) 3787 385.0 2.1e-106 CCDS77897.1 JAKMIP1 gene_id:152789|Hs108|chr4 ( 461) 2665 275.2 1.4e-73 CCDS59495.1 JAKMIP2 gene_id:9832|Hs108|chr5 ( 799) 1830 193.8 7.6e-49 CCDS4285.1 JAKMIP2 gene_id:9832|Hs108|chr5 ( 810) 1819 192.7 1.6e-48 CCDS75352.1 JAKMIP2 gene_id:9832|Hs108|chr5 ( 820) 1819 192.7 1.6e-48 CCDS64284.1 JAKMIP2 gene_id:9832|Hs108|chr5 ( 778) 1631 174.3 5.4e-43 CCDS44494.1 JAKMIP3 gene_id:282973|Hs108|chr10 ( 844) 1617 173.0 1.5e-42 >>CCDS3385.1 JAKMIP1 gene_id:152789|Hs108|chr4 (626 aa) initn: 3947 init1: 3947 opt: 3947 Z-score: 2110.0 bits: 400.6 E(32554): 3.3e-111 Smith-Waterman score: 3947; 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CCDS47 LEERERRSPAFNLQITTFPENHSSALQLFCHQEGVKDVNVSELMKKLDILGDNGNLRNEE 610 620 630 640 650 660 >>CCDS77897.1 JAKMIP1 gene_id:152789|Hs108|chr4 (461 aa) initn: 2658 init1: 2658 opt: 2665 Z-score: 1434.7 bits: 275.2 E(32554): 1.4e-73 Smith-Waterman score: 2667; 91.5% identity (94.5% similar) in 470 aa overlap (159-626:3-461) 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 KTALLTEAREEARRAFDGERLRLQQEILELKAARNQAEEALSNCMQADKTKAAD--LRAA : .:...:. :..: .. :. ::: CCDS77 MSKKGRSKGEKPE---METDAVQMANEELRAK 10 20 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 YQAHQDEVHRIKRECERDIRRLMDEIKGKDRVILALEKELGVQAGQTQKLLLQKEALDEQ . : : .. : . :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS77 LTSIQIEFQQEKSK--------MDEIKGKDRVILALEKELGVQAGQTQKLLLQKEALDEQ 30 40 50 60 70 80 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 LVQVKEAERHHSSPKRELPPGIGDMVELMGVQDQHMDERDVRRFQLKIAELNSVIRKLED :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS77 LVQVKEAERHHSSPKRELPPGIGDMVELMGVQDQHMDERDVRRFQLKIAELNSVIRKLED 90 100 110 120 130 140 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 RNTLLADERNELLKRSRETEVQLKPLVEKNKRMNKKNEDLLQSIQRMEEKIKNLTRENVE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS77 RNTLLADERNELLKRSRETEVQLKPLVEKNKRMNKKNEDLLQSIQRMEEKIKNLTRENVE 150 160 170 180 190 200 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 MKEKLSAQASLKRHTSLNDLSLTRDEQEIEFLRLQVLEQQHVIDDLSLERERLLRSKRHR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS77 MKEKLSAQASLKRHTSLNDLSLTRDEQEIEFLRLQVLEQQHVIDDLSLERERLLRSKRHR 210 220 230 240 250 260 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 GKSLKPPKKHVVETFFGFDEESVDSETLSETSYNTDRTDRTPATPEEDLDDATAREEADL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS77 GKSLKPPKKHVVETFFGFDEESVDSETLSETSYNTDRTDRTPATPEEDLDDATAREEADL 270 280 290 300 310 320 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 RFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRCQAKIEDLEKLLVEK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS77 RFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRCQAKIEDLEKLLVEK 330 340 350 360 370 380 550 560 570 580 590 600 pF1KE5 GQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEKIYRLEMEENQLKNEMQDAKDQNELLEFRVLELEVRDS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS77 GQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEKIYRLEMEENQLKNEMQDAKDQNELLEFRVLELEVRDS 390 400 410 420 430 440 610 620 pF1KE5 ICCKLSNGADILFEPKLKFM :::::::::::::::::::: CCDS77 ICCKLSNGADILFEPKLKFM 450 460 >>CCDS59495.1 JAKMIP2 gene_id:9832|Hs108|chr5 (799 aa) initn: 2210 init1: 960 opt: 1830 Z-score: 990.4 bits: 193.8 E(32554): 7.6e-49 Smith-Waterman score: 2251; 61.1% identity (81.8% similar) in 606 aa overlap (1-605:1-574) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MSKKGRSKGEKPEMETDAVQMANEELRAKLTSIQIEFQQEKSKVGKL-RERLQEAKLERE ::::::.:::::: :.: :::.::.:::.::::..::::::.:: ::. :::: :: CCDS59 MSKKGRNKGEKPEALIVALQAANEDLRTKLTDIQIELHQEKSKVSKLEREKTQEAKRIRE 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 QEQRRHTAYISELKAKLHEEKTKELQALREGLIRQHEQEAARTAKIKEGELQRLQATLNV :::.::. ..:::::::::: :::::.::.::.::::: .::.:...::.:::...: . CCDS59 LEQRKHTVLVTELKAKLHEEKMKELQAVRENLIKQHEQEMSRTVKVRDGEIQRLKSALCA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 LRDGAADKVKTALLTEAREEARRAFDGERLRLQQEILELKAARNQAEEALSNCMQADKTK ::::..:::.::: :::::::. :: :::.: ::: .::.:..:..::::: .:::: : CCDS59 LRDGSSDKVRTALTIEAREEARKLFDTERLKLLQEIADLKTAKKQVDEALSNMIQADKIK 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 AADLRAAYQAHQDEVHRIKRECERDIRRLMDEIKGKDRVILALEKELGVQAGQTQKLLLQ :.:::. .:.::. . .:: : ::::::::::::.:::.:..::::: .:.: .::: :: CCDS59 AGDLRSEHQSHQEAISKIKWESERDIRRLMDEIKAKDRIIFSLEKELETQTGYVQKLQLQ 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 KEALDEQLVQVKEAERHHSSPKRELPPGIGDMVELMGVQDQHMDERDVRRFQLKIAELNS :::::::: ::::: . ::::::.: :: : : . :.:: : .:::::. CCDS59 KEALDEQLFLVKEAECNMSSPKREIPGRAGDGSE-------HCSSPDLRRNQKRIAELNA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 VIRKLEDRNTLLADERNELLKRSRETEVQLKPLVEKNKRMNKKNEDLLQSIQRMEEKIKN .:::::::::::.::::::::: :::: : :::.:.:: . :.:..:. :.::::::.: CCDS59 TIRKLEDRNTLLGDERNELLKRVRETEKQCKPLLERNKCLAKRNDELMVSLQRMEEKLKA 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 LTRENVEMKEKLSAQASLKRHTSLNDLSLTRDEQEIEFLRLQVLEQQHVIDDLSLERERL .:.:: ::.::.... ::. :::::. . .::: :::.:::.:::..::.:. .::.: CCDS59 VTKENSEMREKITSHPPLKKLKSLNDLDQANEEQETEFLKLQVIEQQNIIDELTRDREKL 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 LRSKRHRGKSLKPPKKHVVETFFGFDEESVDSETLSETSYNTDRTDRTPATPEEDLDDAT .: ..:: .: :: :. :.. :.:.::.:.:::: : .:. :::::::::..:::.. CCDS59 IRRRKHR-RSSKPIKRPVLDPFIGYDEDSMDSETSSMASF---RTDRTPATPDDDLDESL 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 AREEADLRFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRCQAKIEDL : ::..::: :::.:::::::::::::::.:: .::::::...:::::..:: .:::::: CCDS59 AAEESELRFRQLTKEYQALQRAYALLQEQTGGIIDAEREAKAQEQLQAEVLRYKAKIEDL 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 EKLLVEKGQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEKIYRLEMEENQLKNEMQDAKDQNELLEFRVL : :..::: ::: : :...:..:.:::.::::::::: : CCDS59 EATLAQKGQI-----EKQ----------------EAENHRLQQELQDARDQNELLEFRNL 530 540 550 560 600 610 620 pF1KE5 ELEVRDSICCKLSNGADILFEPKLKFM ::: :. CCDS59 ELEERERRSPPFNLQIHPFSDGVSALQIYCMKEGVKDVNIPDLIKQLDILGDNGNLRNEE 570 580 590 600 610 620 >>CCDS4285.1 JAKMIP2 gene_id:9832|Hs108|chr5 (810 aa) initn: 2343 init1: 960 opt: 1819 Z-score: 984.5 bits: 192.7 E(32554): 1.6e-48 Smith-Waterman score: 2407; 63.2% identity (85.0% similar) in 606 aa overlap (1-605:1-595) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MSKKGRSKGEKPEMETDAVQMANEELRAKLTSIQIEFQQEKSKVGKL-RERLQEAKLERE ::::::.:::::: :.: :::.::.:::.::::..::::::.:: ::. :::: :: CCDS42 MSKKGRNKGEKPEALIVALQAANEDLRTKLTDIQIELHQEKSKVSKLEREKTQEAKRIRE 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 QEQRRHTAYISELKAKLHEEKTKELQALREGLIRQHEQEAARTAKIKEGELQRLQATLNV :::.::. ..:::::::::: :::::.::.::.::::: .::.:...::.:::...: . CCDS42 LEQRKHTVLVTELKAKLHEEKMKELQAVRENLIKQHEQEMSRTVKVRDGEIQRLKSALCA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 LRDGAADKVKTALLTEAREEARRAFDGERLRLQQEILELKAARNQAEEALSNCMQADKTK ::::..:::.::: :::::::. :: :::.: ::: .::.:..:..::::: .:::: : CCDS42 LRDGSSDKVRTALTIEAREEARKLFDTERLKLLQEIADLKTAKKQVDEALSNMIQADKIK 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 AADLRAAYQAHQDEVHRIKRECERDIRRLMDEIKGKDRVILALEKELGVQAGQTQKLLLQ :.:::. .:.::. . .:: : ::::::::::::.:::.:..::::: .:.: .::: :: CCDS42 AGDLRSEHQSHQEAISKIKWESERDIRRLMDEIKAKDRIIFSLEKELETQTGYVQKLQLQ 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 KEALDEQLVQVKEAERHHSSPKRELPPGIGDMVELMGVQDQHMDERDVRRFQLKIAELNS :::::::: ::::: . ::::::.: :: : : . :.:: : .:::::. CCDS42 KEALDEQLFLVKEAECNMSSPKREIPGRAGDGSE-------HCSSPDLRRNQKRIAELNA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 VIRKLEDRNTLLADERNELLKRSRETEVQLKPLVEKNKRMNKKNEDLLQSIQRMEEKIKN .:::::::::::.::::::::: :::: : :::.:.:: . :.:..:. :.::::::.: CCDS42 TIRKLEDRNTLLGDERNELLKRVRETEKQCKPLLERNKCLAKRNDELMVSLQRMEEKLKA 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 LTRENVEMKEKLSAQASLKRHTSLNDLSLTRDEQEIEFLRLQVLEQQHVIDDLSLERERL .:.:: ::.::.... ::. :::::. . .::: :::.:::.:::..::.:. .::.: CCDS42 VTKENSEMREKITSHPPLKKLKSLNDLDQANEEQETEFLKLQVIEQQNIIDELTRDREKL 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 LRSKRHRGKSLKPPKKHVVETFFGFDEESVDSETLSETSYNTDRTDRTPATPEEDLDDAT .: ..:: .: :: :. :.. :.:.::.:.:::: : .:. :::::::::..:::.. CCDS42 IRRRKHR-RSSKPIKRPVLDPFIGYDEDSMDSETSSMASF---RTDRTPATPDDDLDESL 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 AREEADLRFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRCQAKIEDL : ::..::: :::.:::::::::::::::.:: .::::::...:::::..:: .:::::: CCDS42 AAEESELRFRQLTKEYQALQRAYALLQEQTGGIIDAEREAKAQEQLQAEVLRYKAKIEDL 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 EKLLVEKGQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEKIYRLEMEENQLKNEMQDAKDQNELLEFRVL : :..:::::.:::.:::.:. ::.::::: . : :...:..:.:::.::::::::: : CCDS42 EATLAQKGQDSHWVEDKQLFIKRNQELLEKIEKQEAENHRLQQELQDARDQNELLEFRNL 530 540 550 560 570 580 600 610 620 pF1KE5 ELEVRDSICCKLSNGADILFEPKLKFM ::: :. CCDS42 ELEERERRSPPFNLQIHPFSDGVSALQIYCMKEGVKDVNIPDLIKQLDILGDNGNLRNEE 590 600 610 620 630 640 >>CCDS75352.1 JAKMIP2 gene_id:9832|Hs108|chr5 (820 aa) initn: 2343 init1: 960 opt: 1819 Z-score: 984.4 bits: 192.7 E(32554): 1.6e-48 Smith-Waterman score: 2407; 63.2% identity (85.0% similar) in 606 aa overlap (1-605:1-595) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MSKKGRSKGEKPEMETDAVQMANEELRAKLTSIQIEFQQEKSKVGKL-RERLQEAKLERE ::::::.:::::: :.: :::.::.:::.::::..::::::.:: ::. :::: :: CCDS75 MSKKGRNKGEKPEALIVALQAANEDLRTKLTDIQIELHQEKSKVSKLEREKTQEAKRIRE 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 QEQRRHTAYISELKAKLHEEKTKELQALREGLIRQHEQEAARTAKIKEGELQRLQATLNV :::.::. ..:::::::::: :::::.::.::.::::: .::.:...::.:::...: . CCDS75 LEQRKHTVLVTELKAKLHEEKMKELQAVRENLIKQHEQEMSRTVKVRDGEIQRLKSALCA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 LRDGAADKVKTALLTEAREEARRAFDGERLRLQQEILELKAARNQAEEALSNCMQADKTK ::::..:::.::: :::::::. :: :::.: ::: .::.:..:..::::: .:::: : CCDS75 LRDGSSDKVRTALTIEAREEARKLFDTERLKLLQEIADLKTAKKQVDEALSNMIQADKIK 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 AADLRAAYQAHQDEVHRIKRECERDIRRLMDEIKGKDRVILALEKELGVQAGQTQKLLLQ :.:::. .:.::. . .:: : ::::::::::::.:::.:..::::: .:.: .::: :: CCDS75 AGDLRSEHQSHQEAISKIKWESERDIRRLMDEIKAKDRIIFSLEKELETQTGYVQKLQLQ 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 KEALDEQLVQVKEAERHHSSPKRELPPGIGDMVELMGVQDQHMDERDVRRFQLKIAELNS :::::::: ::::: . ::::::.: :: : : . :.:: : .:::::. CCDS75 KEALDEQLFLVKEAECNMSSPKREIPGRAGDGSE-------HCSSPDLRRNQKRIAELNA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 VIRKLEDRNTLLADERNELLKRSRETEVQLKPLVEKNKRMNKKNEDLLQSIQRMEEKIKN .:::::::::::.::::::::: :::: : :::.:.:: . :.:..:. :.::::::.: CCDS75 TIRKLEDRNTLLGDERNELLKRVRETEKQCKPLLERNKCLAKRNDELMVSLQRMEEKLKA 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 LTRENVEMKEKLSAQASLKRHTSLNDLSLTRDEQEIEFLRLQVLEQQHVIDDLSLERERL .:.:: ::.::.... ::. :::::. . .::: :::.:::.:::..::.:. .::.: CCDS75 VTKENSEMREKITSHPPLKKLKSLNDLDQANEEQETEFLKLQVIEQQNIIDELTRDREKL 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 LRSKRHRGKSLKPPKKHVVETFFGFDEESVDSETLSETSYNTDRTDRTPATPEEDLDDAT .: ..:: .: :: :. :.. :.:.::.:.:::: : .:. :::::::::..:::.. CCDS75 IRRRKHR-RSSKPIKRPVLDPFIGYDEDSMDSETSSMASF---RTDRTPATPDDDLDESL 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 AREEADLRFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRCQAKIEDL : ::..::: :::.:::::::::::::::.:: .::::::...:::::..:: .:::::: CCDS75 AAEESELRFRQLTKEYQALQRAYALLQEQTGGIIDAEREAKAQEQLQAEVLRYKAKIEDL 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 EKLLVEKGQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEKIYRLEMEENQLKNEMQDAKDQNELLEFRVL : :..:::::.:::.:::.:. ::.::::: . : :...:..:.:::.::::::::: : CCDS75 EATLAQKGQDSHWVEDKQLFIKRNQELLEKIEKQEAENHRLQQELQDARDQNELLEFRNL 530 540 550 560 570 580 600 610 620 pF1KE5 ELEVRDSICCKLSNGADILFEPKLKFM ::: :. CCDS75 ELEERERRSPPFNLQIHPFSDGVSALQIYCMKEGVKDVNIPDLIKQLDILGDNGNLRNEE 590 600 610 620 630 640 >>CCDS64284.1 JAKMIP2 gene_id:9832|Hs108|chr5 (778 aa) initn: 2153 init1: 960 opt: 1631 Z-score: 885.4 bits: 174.3 E(32554): 5.4e-43 Smith-Waterman score: 2219; 62.5% identity (84.7% similar) in 563 aa overlap (44-605:2-553) 20 30 40 50 60 70 pF1KE5 METDAVQMANEELRAKLTSIQIEFQQEKSKVGKL-RERLQEAKLEREQEQRRHTAYISEL :.:: ::. :::: :: :::.::. ..:: CCDS64 MVSKLEREKTQEAKRIRELEQRKHTVLVTEL 10 20 30 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 KAKLHEEKTKELQALREGLIRQHEQEAARTAKIKEGELQRLQATLNVLRDGAADKVKTAL :::::::: :::::.::.::.::::: .::.:...::.:::...: .::::..:::.::: CCDS64 KAKLHEEKMKELQAVRENLIKQHEQEMSRTVKVRDGEIQRLKSALCALRDGSSDKVRTAL 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 LTEAREEARRAFDGERLRLQQEILELKAARNQAEEALSNCMQADKTKAADLRAAYQAHQD :::::::. :: :::.: ::: .::.:..:..::::: .:::: ::.:::. .:.::. CCDS64 TIEAREEARKLFDTERLKLLQEIADLKTAKKQVDEALSNMIQADKIKAGDLRSEHQSHQE 100 110 120 130 140 150 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 EVHRIKRECERDIRRLMDEIKGKDRVILALEKELGVQAGQTQKLLLQKEALDEQLVQVKE . .:: : ::::::::::::.:::.:..::::: .:.: .::: :::::::::: ::: CCDS64 AISKIKWESERDIRRLMDEIKAKDRIIFSLEKELETQTGYVQKLQLQKEALDEQLFLVKE 160 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 AERHHSSPKRELPPGIGDMVELMGVQDQHMDERDVRRFQLKIAELNSVIRKLEDRNTLLA :: . ::::::.: :: : : . :.:: : .:::::..:::::::::::. CCDS64 AECNMSSPKREIPGRAGDGSE-------HCSSPDLRRNQKRIAELNATIRKLEDRNTLLG 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 DERNELLKRSRETEVQLKPLVEKNKRMNKKNEDLLQSIQRMEEKIKNLTRENVEMKEKLS ::::::::: :::: : :::.:.:: . :.:..:. :.::::::.: .:.:: ::.::.. CCDS64 DERNELLKRVRETEKQCKPLLERNKCLAKRNDELMVSLQRMEEKLKAVTKENSEMREKIT 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 AQASLKRHTSLNDLSLTRDEQEIEFLRLQVLEQQHVIDDLSLERERLLRSKRHRGKSLKP .. ::. :::::. . .::: :::.:::.:::..::.:. .::.:.: ..:: .: :: CCDS64 SHPPLKKLKSLNDLDQANEEQETEFLKLQVIEQQNIIDELTRDREKLIRRRKHR-RSSKP 330 340 350 360 370 380 440 450 460 470 480 490 pF1KE5 PKKHVVETFFGFDEESVDSETLSETSYNTDRTDRTPATPEEDLDDATAREEADLRFCQLT :. :.. :.:.::.:.:::: : .:. :::::::::..:::.. : ::..::: ::: CCDS64 IKRPVLDPFIGYDEDSMDSETSSMASF---RTDRTPATPDDDLDESLAAEESELRFRQLT 390 400 410 420 430 440 500 510 520 530 540 550 pF1KE5 REYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRCQAKIEDLEKLLVEKGQDSKW .:::::::::::::::.:: .::::::...:::::..:: .::::::: :..:::::.: CCDS64 KEYQALQRAYALLQEQTGGIIDAEREAKAQEQLQAEVLRYKAKIEDLEATLAQKGQDSHW 450 460 470 480 490 500 560 570 580 590 600 610 pF1KE5 VEEKQLLIRTNQDLLEKIYRLEMEENQLKNEMQDAKDQNELLEFRVLELEVRDSICCKLS ::.:::.:. ::.::::: . : :...:..:.:::.::::::::: :::: :. CCDS64 VEDKQLFIKRNQELLEKIEKQEAENHRLQQELQDARDQNELLEFRNLELEERERRSPPFN 510 520 530 540 550 560 620 pF1KE5 NGADILFEPKLKFM CCDS64 LQIHPFSDGVSALQIYCMKEGVKDVNIPDLIKQLDILGDNGNLRNEEQVAIIQASTVLSL 570 580 590 600 610 620 >>CCDS44494.1 JAKMIP3 gene_id:282973|Hs108|chr10 (844 aa) initn: 2254 init1: 883 opt: 1617 Z-score: 877.5 bits: 173.0 E(32554): 1.5e-42 Smith-Waterman score: 2357; 60.3% identity (84.5% similar) in 624 aa overlap (1-605:1-619) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MSKKG---RSKGEKPEMETDAVQMANEELRAKLTSIQIEFQQEKSKVGKL-RERLQEAKL :::.: :.::.: : :.: :::.::::::.::::.:::::::.:. ::. :: . CCDS44 MSKRGMSSRAKGDKAEA-LAALQAANEDLRAKLTDIQIELQQEKSKVSKVEREKNQELRQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 EREQEQRRHTAYISELKAKLHEEKTKELQALREGLIRQHEQEAARTAKIKEGELQRLQAT ::.::.. .. ..:::.:::::: :::::.:: :.:::: : :. :::..: ::::: CCDS44 VREHEQHKTAVLLTELKTKLHEEKMKELQAVRETLLRQHEAELLRVIKIKDNENQRLQAL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 LNVLRDGAADKVKTALLTEAREEARRAFDGERLRLQQEILELKAARNQAEEALSNCMQAD :..::::. .::::.::.::.:::...:. :....:::: :::.:. :.::::. .::: CCDS44 LSALRDGGPEKVKTVLLSEAKEEAKKGFEVEKVKMQQEISELKGAKRQVEEALTLVIQAD 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 KTKAADLRAAYQAHQDEVHRIKRECERDIRRLMDEIKGKDRVILALEKELGVQAGQTQKL : :::..:..:. ::.:. :::.::::.:::::.::: :::....::.:::::::..:.: CCDS44 KIKAAEIRSVYHLHQEEITRIKKECEREIRRLMEEIKFKDRAVFVLERELGVQAGHAQRL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LLQKEALDEQLVQVKEAERHHSSPKRELP--PGIGDMVELMGVQDQHMDERDVRRFQLKI :::::::::: ::.::.:: .::.:::: : :: . : .:..::.:.::::::: CCDS44 QLQKEALDEQLSQVREADRHPGSPRRELPHAAGAGDASDHSGSPEQQLDEKDARRFQLKI 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 AELNSVIRKLEDRNTLLADERNELLKRSRETEVQLKPLVEKNKRMNKKNEDLLQSIQRME :::...::::::::.::..:::::::: ::.: : :::..::::...::::: ....::: CCDS44 AELSAIIRKLEDRNALLSEERNELLKRVREAESQYKPLLDKNKRLSRKNEDLSHALRRME 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 EKIKNLTRENVEMKEKLSAQASLKRHTSLNDLSLTRDEQEIEFLRLQVLEQQHVIDDLS- .:.: .:.::.::... . ..: .:::::. ..::.:..::.::..:::..::.:: CCDS44 NKLKFVTQENIEMRQRAGI---IRRPSSLNDLDQSQDEREVDFLKLQIVEQQNLIDELSK 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 -----------LERERLLRSKRHRGKSLKPPKKHVVETFFGFDEE-SVDSETLSETSYNT :::..::: ...: : : :: :::::::.::: :..:. : .::.: CCDS44 TLETAGYVKSVLERDKLLRFRKQRKKMAKLPKPVVVETFFGYDEEASLESDG-SSVSYQT 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE5 DRTDRTPATPEEDLDDATAREEADLRFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREART ::::.:: ::..::... :.::..::: ::: :::::::::::::::::::::::::..: CCDS44 DRTDQTPCTPDDDLEEGMAKEETELRFRQLTMEYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREVKT 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KE5 REQLQADLLRCQAKIEDLEKLLVEKGQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEKIYRLEMEENQLK ::::::.. : ::.:::::: :.:.::: ::.:::: : : ::.:.::: ..: :: .:. CCDS44 REQLQAEVQRAQARIEDLEKALAEQGQDMKWIEEKQALYRRNQELVEKIKQMETEEARLR 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 pF1KE5 NEMQDAKDQNELLEFRVLELEVRDSICCKLSNGADILFEPKLKFM .:.:::.:::::::::.:::: :. CCDS44 HEVQDARDQNELLEFRILELEERERKSPAISFHHTPFVDGKSPLQVYCEAEGVTDIVVAE 600 610 620 630 640 650 626 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 06:18:20 2016 done: Tue Nov 8 06:18:20 2016 Total Scan time: 3.440 Total Display time: 0.120 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]