Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2320
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2320, 586 aa
1>>>pF1KE2320 586 - 586 aa - 586 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7730+/-0.000931; mu= 4.1032+/- 0.057
mean_var=185.9448+/-36.992, 0's: 0 Z-trim(112.4): 37 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.094055
statistics sampled from 13142 (13178) to 13142 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.73), E-opt: 0.2 (0.405), width: 16
Scan time: 2.870
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46978.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 ( 586) 3982 552.7 4.6e-157
CCDS3293.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 ( 680) 3894 540.8 2.1e-153
CCDS82887.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 ( 676) 3840 533.5 3.3e-151
CCDS46979.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 ( 461) 3107 433.9 2.1e-121
CCDS46976.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 ( 555) 3019 422.0 9.6e-118
CCDS46980.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 ( 393) 2399 337.8 1.5e-92
CCDS46977.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 ( 487) 2311 325.9 7.2e-89
CCDS44049.1 TP73 gene_id:7161|Hs108|chr1 ( 587) 2281 321.9 1.4e-87
CCDS49.1 TP73 gene_id:7161|Hs108|chr1 ( 636) 2273 320.8 3.2e-87
CCDS55569.1 TP73 gene_id:7161|Hs108|chr1 ( 565) 2264 319.6 6.7e-87
CCDS44050.1 TP73 gene_id:7161|Hs108|chr1 ( 450) 1849 263.2 5e-70
CCDS55566.1 TP73 gene_id:7161|Hs108|chr1 ( 499) 1841 262.2 1.2e-69
CCDS44051.1 TP73 gene_id:7161|Hs108|chr1 ( 426) 1638 234.6 2e-61
CCDS55567.1 TP73 gene_id:7161|Hs108|chr1 ( 555) 1637 234.5 2.7e-61
CCDS59965.1 TP73 gene_id:7161|Hs108|chr1 ( 403) 1618 231.8 1.2e-60
CCDS55568.1 TP73 gene_id:7161|Hs108|chr1 ( 540) 1616 231.6 1.9e-60
CCDS11118.1 TP53 gene_id:7157|Hs108|chr17 ( 393) 932 138.7 1.3e-32
CCDS73969.1 TP53 gene_id:7157|Hs108|chr17 ( 354) 927 138.0 1.9e-32
CCDS45606.1 TP53 gene_id:7157|Hs108|chr17 ( 341) 861 129.1 9.1e-30
CCDS45605.1 TP53 gene_id:7157|Hs108|chr17 ( 346) 861 129.1 9.2e-30
CCDS73971.1 TP53 gene_id:7157|Hs108|chr17 ( 302) 856 128.4 1.3e-29
CCDS73970.1 TP53 gene_id:7157|Hs108|chr17 ( 307) 856 128.4 1.3e-29
CCDS73966.1 TP53 gene_id:7157|Hs108|chr17 ( 261) 802 121.0 1.9e-27
CCDS73968.1 TP53 gene_id:7157|Hs108|chr17 ( 209) 731 111.3 1.2e-24
CCDS73967.1 TP53 gene_id:7157|Hs108|chr17 ( 214) 731 111.3 1.3e-24
CCDS73963.1 TP53 gene_id:7157|Hs108|chr17 ( 234) 682 104.7 1.4e-22
CCDS73965.1 TP53 gene_id:7157|Hs108|chr17 ( 182) 611 95.0 8.8e-20
CCDS73964.1 TP53 gene_id:7157|Hs108|chr17 ( 187) 611 95.0 9e-20
>>CCDS46978.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 (586 aa)
initn: 3982 init1: 3982 opt: 3982 Z-score: 2933.2 bits: 552.7 E(32554): 4.6e-157
Smith-Waterman score: 3982; 100.0% identity (100.0% similar) in 586 aa overlap (1-586:1-586)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLYLENNAQTQFSEPQYTNLGLLNSMDQQIQNGSSSTSPYNTDHAQNSVTAPSPYAQPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MLYLENNAQTQFSEPQYTNLGLLNSMDQQIQNGSSSTSPYNTDHAQNSVTAPSPYAQPSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVSFQQSSTAKSATWTYSTELKKLYCQIAKTCPIQIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVSFQQSSTAKSATWTYSTELKKLYCQIAKTCPIQIK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEVVKRCPNHELSREFNEGQIAPPSHLIRVEGNSHAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEVVKRCPNHELSREFNEGQIAPPSHLIRVEGNSHAQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 YVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFTTVLYNFMCNSSCVGGMNRRPILIIVTLETRDGQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFTTVLYNFMCNSSCVGGMNRRPILIIVTLETRDGQV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIRKQQVSDSTKNGDGTKRPFRQNTHGIQMTSIKKRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIRKQQVSDSTKNGDGTKRPFRQNTHGIQMTSIKKRR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKESLELMQYLPQHTIETYRQQQQQQHQHLLQKQTSIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKESLELMQYLPQHTIETYRQQQQQQHQHLLQKQTSIQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 SPSSYGNSSPPLNKMNSMNKLPSVSQLINPQQRNALTPTTIPDGMGANIPMMGTHMPMAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SPSSYGNSSPPLNKMNSMNKLPSVSQLINPQQRNALTPTTIPDGMGANIPMMGTHMPMAG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 DMNGLSPTQALPPPLSMPSTSHCTPPPPYPTDCSIVSFLARLGCSSCLDYFTTQGLTTIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DMNGLSPTQALPPPLSMPSTSHCTPPPPYPTDCSIVSFLARLGCSSCLDYFTTQGLTTIY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 QIEHYSMDDLASLKIPEQFRHAIWKGILDHRQLHEFSSPSHLLRTPSSASTVSVGSSETR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QIEHYSMDDLASLKIPEQFRHAIWKGILDHRQLHEFSSPSHLLRTPSSASTVSVGSSETR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KE2 GERVIDAVRFTLRQTISFPPRDEWNDFNFDMDARRNKQQRIKEEGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GERVIDAVRFTLRQTISFPPRDEWNDFNFDMDARRNKQQRIKEEGE
550 560 570 580
>>CCDS3293.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 (680 aa)
initn: 3894 init1: 3894 opt: 3894 Z-score: 2867.7 bits: 540.8 E(32554): 2.1e-153
Smith-Waterman score: 3894; 100.0% identity (100.0% similar) in 572 aa overlap (15-586:109-680)
10 20 30 40
pF1KE2 MLYLENNAQTQFSEPQYTNLGLLNSMDQQIQNGSSSTSPYNTDH
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EPSEDGATNKIEISMDCIRMQDSDLSDPMWPQYTNLGLLNSMDQQIQNGSSSTSPYNTDH
80 90 100 110 120 130
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 AQNSVTAPSPYAQPSSTFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVSFQQSSTAKSATWTYSTEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AQNSVTAPSPYAQPSSTFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVSFQQSSTAKSATWTYSTEL
140 150 160 170 180 190
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 KKLYCQIAKTCPIQIKVMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEVVKRCPNHELSREFNEGQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KKLYCQIAKTCPIQIKVMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEVVKRCPNHELSREFNEGQI
200 210 220 230 240 250
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 APPSHLIRVEGNSHAQYVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFTTVLYNFMCNSSCVGGMNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 APPSHLIRVEGNSHAQYVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFTTVLYNFMCNSSCVGGMNR
260 270 280 290 300 310
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 RPILIIVTLETRDGQVLGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIRKQQVSDSTKNGDGTKRPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RPILIIVTLETRDGQVLGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIRKQQVSDSTKNGDGTKRPF
320 330 340 350 360 370
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 RQNTHGIQMTSIKKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKESLELMQYLPQHTIETYRQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RQNTHGIQMTSIKKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKESLELMQYLPQHTIETYRQQ
380 390 400 410 420 430
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 QQQQHQHLLQKQTSIQSPSSYGNSSPPLNKMNSMNKLPSVSQLINPQQRNALTPTTIPDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QQQQHQHLLQKQTSIQSPSSYGNSSPPLNKMNSMNKLPSVSQLINPQQRNALTPTTIPDG
440 450 460 470 480 490
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 MGANIPMMGTHMPMAGDMNGLSPTQALPPPLSMPSTSHCTPPPPYPTDCSIVSFLARLGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MGANIPMMGTHMPMAGDMNGLSPTQALPPPLSMPSTSHCTPPPPYPTDCSIVSFLARLGC
500 510 520 530 540 550
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 SSCLDYFTTQGLTTIYQIEHYSMDDLASLKIPEQFRHAIWKGILDHRQLHEFSSPSHLLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SSCLDYFTTQGLTTIYQIEHYSMDDLASLKIPEQFRHAIWKGILDHRQLHEFSSPSHLLR
560 570 580 590 600 610
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 TPSSASTVSVGSSETRGERVIDAVRFTLRQTISFPPRDEWNDFNFDMDARRNKQQRIKEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TPSSASTVSVGSSETRGERVIDAVRFTLRQTISFPPRDEWNDFNFDMDARRNKQQRIKEE
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 GE
::
CCDS32 GE
680
>>CCDS82887.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 (676 aa)
initn: 2061 init1: 2061 opt: 3840 Z-score: 2828.2 bits: 533.5 E(32554): 3.3e-151
Smith-Waterman score: 3840; 99.1% identity (99.3% similar) in 572 aa overlap (15-586:109-676)
10 20 30 40
pF1KE2 MLYLENNAQTQFSEPQYTNLGLLNSMDQQIQNGSSSTSPYNTDH
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EPSEDGATNKIEISMDCIRMQDSDLSDPMWPQYTNLGLLNSMDQQIQNGSSSTSPYNTDH
80 90 100 110 120 130
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 AQNSVTAPSPYAQPSSTFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVSFQQSSTAKSATWTYSTEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AQNSVTAPSPYAQPSSTFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVSFQQSSTAKSATWTYSTEL
140 150 160 170 180 190
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 KKLYCQIAKTCPIQIKVMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEVVKRCPNHELSREFNEGQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KKLYCQIAKTCPIQIKVMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEVVKRCPNHELSREFNEGQI
200 210 220 230 240 250
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 APPSHLIRVEGNSHAQYVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFTTVLYNFMCNSSCVGGMNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 APPSHLIRVEGNSHAQYVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFTTVLYNFMCNSSCVGGMNR
260 270 280 290 300 310
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 RPILIIVTLETRDGQVLGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIRKQQVSDSTKNGDGTKRPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :
CCDS82 RPILIIVTLETRDGQVLGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIRKQQVSDSTKNGDA----F
320 330 340 350 360 370
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 RQNTHGIQMTSIKKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKESLELMQYLPQHTIETYRQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RQNTHGIQMTSIKKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKESLELMQYLPQHTIETYRQQ
380 390 400 410 420 430
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 QQQQHQHLLQKQTSIQSPSSYGNSSPPLNKMNSMNKLPSVSQLINPQQRNALTPTTIPDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QQQQHQHLLQKQTSIQSPSSYGNSSPPLNKMNSMNKLPSVSQLINPQQRNALTPTTIPDG
440 450 460 470 480 490
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 MGANIPMMGTHMPMAGDMNGLSPTQALPPPLSMPSTSHCTPPPPYPTDCSIVSFLARLGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MGANIPMMGTHMPMAGDMNGLSPTQALPPPLSMPSTSHCTPPPPYPTDCSIVSFLARLGC
500 510 520 530 540 550
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 SSCLDYFTTQGLTTIYQIEHYSMDDLASLKIPEQFRHAIWKGILDHRQLHEFSSPSHLLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SSCLDYFTTQGLTTIYQIEHYSMDDLASLKIPEQFRHAIWKGILDHRQLHEFSSPSHLLR
560 570 580 590 600 610
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 TPSSASTVSVGSSETRGERVIDAVRFTLRQTISFPPRDEWNDFNFDMDARRNKQQRIKEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TPSSASTVSVGSSETRGERVIDAVRFTLRQTISFPPRDEWNDFNFDMDARRNKQQRIKEE
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 GE
::
CCDS82 GE
>>CCDS46979.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 (461 aa)
initn: 3107 init1: 3107 opt: 3107 Z-score: 2293.1 bits: 433.9 E(32554): 2.1e-121
Smith-Waterman score: 3107; 100.0% identity (100.0% similar) in 456 aa overlap (1-456:1-456)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLYLENNAQTQFSEPQYTNLGLLNSMDQQIQNGSSSTSPYNTDHAQNSVTAPSPYAQPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MLYLENNAQTQFSEPQYTNLGLLNSMDQQIQNGSSSTSPYNTDHAQNSVTAPSPYAQPSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVSFQQSSTAKSATWTYSTELKKLYCQIAKTCPIQIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVSFQQSSTAKSATWTYSTELKKLYCQIAKTCPIQIK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEVVKRCPNHELSREFNEGQIAPPSHLIRVEGNSHAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEVVKRCPNHELSREFNEGQIAPPSHLIRVEGNSHAQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 YVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFTTVLYNFMCNSSCVGGMNRRPILIIVTLETRDGQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFTTVLYNFMCNSSCVGGMNRRPILIIVTLETRDGQV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIRKQQVSDSTKNGDGTKRPFRQNTHGIQMTSIKKRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIRKQQVSDSTKNGDGTKRPFRQNTHGIQMTSIKKRR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKESLELMQYLPQHTIETYRQQQQQQHQHLLQKQTSIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKESLELMQYLPQHTIETYRQQQQQQHQHLLQKQTSIQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 SPSSYGNSSPPLNKMNSMNKLPSVSQLINPQQRNALTPTTIPDGMGANIPMMGTHMPMAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SPSSYGNSSPPLNKMNSMNKLPSVSQLINPQQRNALTPTTIPDGMGANIPMMGTHMPMAG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 DMNGLSPTQALPPPLSMPSTSHCTPPPPYPTDCSIVSFLARLGCSSCLDYFTTQGLTTIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DMNGLSPTQALPPPLSMPSTSHCTPPPPYPTDCSIVRIWQV
430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 QIEHYSMDDLASLKIPEQFRHAIWKGILDHRQLHEFSSPSHLLRTPSSASTVSVGSSETR
>>CCDS46976.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 (555 aa)
initn: 3019 init1: 3019 opt: 3019 Z-score: 2227.4 bits: 422.0 E(32554): 9.6e-118
Smith-Waterman score: 3019; 100.0% identity (100.0% similar) in 442 aa overlap (15-456:109-550)
10 20 30 40
pF1KE2 MLYLENNAQTQFSEPQYTNLGLLNSMDQQIQNGSSSTSPYNTDH
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EPSEDGATNKIEISMDCIRMQDSDLSDPMWPQYTNLGLLNSMDQQIQNGSSSTSPYNTDH
80 90 100 110 120 130
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 AQNSVTAPSPYAQPSSTFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVSFQQSSTAKSATWTYSTEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AQNSVTAPSPYAQPSSTFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVSFQQSSTAKSATWTYSTEL
140 150 160 170 180 190
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 KKLYCQIAKTCPIQIKVMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEVVKRCPNHELSREFNEGQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KKLYCQIAKTCPIQIKVMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEVVKRCPNHELSREFNEGQI
200 210 220 230 240 250
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 APPSHLIRVEGNSHAQYVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFTTVLYNFMCNSSCVGGMNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 APPSHLIRVEGNSHAQYVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFTTVLYNFMCNSSCVGGMNR
260 270 280 290 300 310
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 RPILIIVTLETRDGQVLGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIRKQQVSDSTKNGDGTKRPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RPILIIVTLETRDGQVLGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIRKQQVSDSTKNGDGTKRPF
320 330 340 350 360 370
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 RQNTHGIQMTSIKKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKESLELMQYLPQHTIETYRQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RQNTHGIQMTSIKKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKESLELMQYLPQHTIETYRQQ
380 390 400 410 420 430
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 QQQQHQHLLQKQTSIQSPSSYGNSSPPLNKMNSMNKLPSVSQLINPQQRNALTPTTIPDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QQQQHQHLLQKQTSIQSPSSYGNSSPPLNKMNSMNKLPSVSQLINPQQRNALTPTTIPDG
440 450 460 470 480 490
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 MGANIPMMGTHMPMAGDMNGLSPTQALPPPLSMPSTSHCTPPPPYPTDCSIVSFLARLGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MGANIPMMGTHMPMAGDMNGLSPTQALPPPLSMPSTSHCTPPPPYPTDCSIVRIWQV
500 510 520 530 540 550
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 SSCLDYFTTQGLTTIYQIEHYSMDDLASLKIPEQFRHAIWKGILDHRQLHEFSSPSHLLR
>>CCDS46980.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 (393 aa)
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Smith-Waterman score: 2399; 99.7% identity (100.0% similar) in 356 aa overlap (1-356:1-356)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLYLENNAQTQFSEPQYTNLGLLNSMDQQIQNGSSSTSPYNTDHAQNSVTAPSPYAQPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MLYLENNAQTQFSEPQYTNLGLLNSMDQQIQNGSSSTSPYNTDHAQNSVTAPSPYAQPSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVSFQQSSTAKSATWTYSTELKKLYCQIAKTCPIQIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVSFQQSSTAKSATWTYSTELKKLYCQIAKTCPIQIK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEVVKRCPNHELSREFNEGQIAPPSHLIRVEGNSHAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEVVKRCPNHELSREFNEGQIAPPSHLIRVEGNSHAQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 YVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFTTVLYNFMCNSSCVGGMNRRPILIIVTLETRDGQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFTTVLYNFMCNSSCVGGMNRRPILIIVTLETRDGQV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIRKQQVSDSTKNGDGTKRPFRQNTHGIQMTSIKKRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIRKQQVSDSTKNGDGTKRPFRQNTHGIQMTSIKKRR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKESLELMQYLPQHTIETYRQQQQQQHQHLLQKQTSIQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS46 SPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKESLELMQYLPQHTIETYRQQQQQQHQHLLQKHLLSA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 SPSSYGNSSPPLNKMNSMNKLPSVSQLINPQQRNALTPTTIPDGMGANIPMMGTHMPMAG
CCDS46 CFRNELVEPRRETPKQSDVFFRHSKPPNRSVYP
370 380 390
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Smith-Waterman score: 2311; 99.7% identity (100.0% similar) in 342 aa overlap (15-356:109-450)
10 20 30 40
pF1KE2 MLYLENNAQTQFSEPQYTNLGLLNSMDQQIQNGSSSTSPYNTDH
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EPSEDGATNKIEISMDCIRMQDSDLSDPMWPQYTNLGLLNSMDQQIQNGSSSTSPYNTDH
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50 60 70 80 90 100
pF1KE2 AQNSVTAPSPYAQPSSTFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVSFQQSSTAKSATWTYSTEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AQNSVTAPSPYAQPSSTFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVSFQQSSTAKSATWTYSTEL
140 150 160 170 180 190
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 KKLYCQIAKTCPIQIKVMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEVVKRCPNHELSREFNEGQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KKLYCQIAKTCPIQIKVMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEVVKRCPNHELSREFNEGQI
200 210 220 230 240 250
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 APPSHLIRVEGNSHAQYVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFTTVLYNFMCNSSCVGGMNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 APPSHLIRVEGNSHAQYVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFTTVLYNFMCNSSCVGGMNR
260 270 280 290 300 310
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 RPILIIVTLETRDGQVLGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIRKQQVSDSTKNGDGTKRPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RPILIIVTLETRDGQVLGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIRKQQVSDSTKNGDGTKRPF
320 330 340 350 360 370
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 RQNTHGIQMTSIKKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKESLELMQYLPQHTIETYRQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RQNTHGIQMTSIKKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKESLELMQYLPQHTIETYRQQ
380 390 400 410 420 430
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 QQQQHQHLLQKQTSIQSPSSYGNSSPPLNKMNSMNKLPSVSQLINPQQRNALTPTTIPDG
:::::::::::.
CCDS46 QQQQHQHLLQKHLLSACFRNELVEPRRETPKQSDVFFRHSKPPNRSVYP
440 450 460 470 480
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10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLYLENNAQTQFSEPQYTNLGLLNSMDQQIQNGSSSTSPYNTDHAQNSVTAPSPYAQPSS
:::. . :. ... :. :: : ..::: ... ..:.:::. .:: :: . ::::::::
CCDS44 MLYVGDPAR-HLATAQF-NL-LSSTMDQ-MSSRAASASPYTPEHAA-SVPTHSPYAQPSS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVSFQQSSTAKSATWTYSTELKKLYCQIAKTCPIQIK
:::..::.:.::::::::::: :.:.::::::::::::::: :::::::::::::::::
CCDS44 TFDTMSPAPVIPSNTDYPGPHHFEVTFQQSSTAKSATWTYSPLLKKLYCQIAKTCPIQIK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEVVKRCPNHELSREFNEGQIAPPSHLIRVEGNSHAQ
: :::: :..::::::::::::::.::::::::::.:.::::: :: :::::::::. .:
CCDS44 VSTPPPPGTAIRAMPVYKKAEHVTDVVKRCPNHELGRDFNEGQSAPASHLIRVEGNNLSQ
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 YVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFTTVLYNFMCNSSCVGGMNRRPILIIVTLETRDGQV
::.::.::::::.::::::::::::::.::::::::::::::::::::::.::: :::::
CCDS44 YVDDPVTGRQSVVVPYEPPQVGTEFTTILYNFMCNSSCVGGMNRRPILIIITLEMRDGQV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE2 LGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIRKQQVSD--STKNGDGTKRPFRQNTHGIQM--TSI
:::: ::.::::::::::::::: :.::. . :.::: ..:: :.:. .. ...
CCDS44 LGRRSFEGRICACPGRDRKADEDHYREQQALNESSAKNGAASKRAFKQSPPAVPALGAGV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 KKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKESLELMQYLPQHTIETYRQQQQQQHQHLLQKQ
:::: :.. :: :::::..:.:.:.:::::::. .:: ...:::::: :::.
CCDS44 KKRRHGDEDTYYLQVRGRENFEILMKLKESLELMELVPQPLVDSYRQQQQ-----LLQRP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 TSIQSPSSYGNSSPPLNKMNS-MNKLPSVSQLIN--PQQRNALTPTTIPDGMGANIPMMG
. .: :: :: :.::... :::::::.::.. : . .: ::. : : : . :
CCDS44 SHLQPPS-YGPVLSPMNKVHGGMNKLPSVNQLVGQPPPHSSAATPNLGPVGPGM-LNNHG
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 THMPMAGDMNGLSPTQALPPPLSMPSTSHCTPPPPYPTDCSIVSFLARLGCSSCLDYFTT
.: :.:.. .: :: : ::::::::: .: :.::::. ::: .:..:::.
CCDS44 HAVPANGEMSSSHSAQ------SMVSGSHCTPPPPYHADPSLVSFLTGLGCPNCIEYFTS
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 QGLTTIYQIEHYSMDDLASLKIPEQFRHAIWKGILDHRQLHEFSSPSHLLRTPSSASTVS
::: .::.... ...::..::::::.: .::.:. : .: :..:. ..:::. :.:.:.:
CCDS44 QGLQSIYHLQNLTIEDLGALKIPEQYRMTIWRGLQDLKQGHDYSTAQQLLRS-SNAATIS
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580
pF1KE2 VGSS-ETRGERVIDAVRFTLRQTISFPPR-------DEWNDFNFDMDARRNKQQRIKEEG
.:.: : . .::..::.: .:.::..: : ::: ::.::. . ..: ::::
CCDS44 IGGSGELQRQRVMEAVHFRVRHTITIPNRGGPGGGPDEWADFGFDLPDCKARKQPIKEEF
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 E
CCDS44 TEAEIH
>>CCDS49.1 TP73 gene_id:7161|Hs108|chr1 (636 aa)
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Smith-Waterman score: 2273; 59.5% identity (80.7% similar) in 580 aa overlap (20-584:65-629)
10 20 30 40
pF1KE2 MLYLENNAQTQFSEPQYTNLGLLNSMDQQIQNGSSSTSPYNTDHAQNSV
..::.: .:... ..:.:::. .:: ::
CCDS49 SRGNNEVVGGTDSSMDVFHLEGMTTSVMAQFNLLSSTMDQMSSRAASASPYTPEHAA-SV
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50 60 70 80 90 100
pF1KE2 TAPSPYAQPSSTFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVSFQQSSTAKSATWTYSTELKKLYC
. :::::::::::..::.:.::::::::::: :.:.::::::::::::::: ::::::
CCDS49 PTHSPYAQPSSTFDTMSPAPVIPSNTDYPGPHHFEVTFQQSSTAKSATWTYSPLLKKLYC
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 QIAKTCPIQIKVMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEVVKRCPNHELSREFNEGQIAPPSH
:::::::::::: :::: :..::::::::::::::.::::::::::.:.::::: :: ::
CCDS49 QIAKTCPIQIKVSTPPPPGTAIRAMPVYKKAEHVTDVVKRCPNHELGRDFNEGQSAPASH
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 LIRVEGNSHAQYVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFTTVLYNFMCNSSCVGGMNRRPILI
:::::::. .:::.::.::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS49 LIRVEGNNLSQYVDDPVTGRQSVVVPYEPPQVGTEFTTILYNFMCNSSCVGGMNRRPILI
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 IVTLETRDGQVLGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIRKQQVSD--STKNGDGTKRPFRQN
:.::: ::::::::: ::.::::::::::::::: :.::. . :.::: ..:: :.:.
CCDS49 IITLEMRDGQVLGRRSFEGRICACPGRDRKADEDHYREQQALNESSAKNGAASKRAFKQS
280 290 300 310 320 330
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 THGIQM--TSIKKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKESLELMQYLPQHTIETYRQQQ
.. ...:::: :.. :: :::::..:.:.:.:::::::. .:: ...:::::
CCDS49 PPAVPALGAGVKKRRHGDEDTYYLQVRGRENFEILMKLKESLELMELVPQPLVDSYRQQQ
340 350 360 370 380 390
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 QQQHQHLLQKQTSIQSPSSYGNSSPPLNKMNS-MNKLPSVSQLIN--PQQRNALTPTTIP
: :::. . .: :: :: :.::... :::::::.::.. : . .: ::. :
CCDS49 Q-----LLQRPSHLQPPS-YGPVLSPMNKVHGGMNKLPSVNQLVGQPPPHSSAATPNLGP
400 410 420 430 440
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 DGMGANIPMMGTHMPMAGDMNGLSPTQALPPPLSMPSTSHCTPPPPYPTDCSIVSFLARL
: : . : .: :.:.. .: :: : ::::::::: .: :.::::. :
CCDS49 VGPGM-LNNHGHAVPANGEMSSSHSAQ------SMVSGSHCTPPPPYHADPSLVSFLTGL
450 460 470 480 490 500
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 GCSSCLDYFTTQGLTTIYQIEHYSMDDLASLKIPEQFRHAIWKGILDHRQLHEFSSPSHL
:: .:..:::.::: .::.... ...::..::::::.: .::.:. : .: :..:. ..:
CCDS49 GCPNCIEYFTSQGLQSIYHLQNLTIEDLGALKIPEQYRMTIWRGLQDLKQGHDYSTAQQL
510 520 530 540 550 560
530 540 550 560 570
pF1KE2 LRTPSSASTVSVGSS-ETRGERVIDAVRFTLRQTISFPPR-------DEWNDFNFDMDAR
::. :.:.:.:.:.: : . .::..::.: .:.::..: : ::: ::.::.
CCDS49 LRS-SNAATISIGGSGELQRQRVMEAVHFRVRHTITIPNRGGPGGGPDEWADFGFDLPDC
570 580 590 600 610
580
pF1KE2 RNKQQRIKEEGE
. ..: ::::
CCDS49 KARKQPIKEEFTEAEIH
620 630
>>CCDS55569.1 TP73 gene_id:7161|Hs108|chr1 (565 aa)
initn: 2094 init1: 1325 opt: 2264 Z-score: 1673.6 bits: 319.6 E(32554): 6.7e-87
Smith-Waterman score: 2264; 59.9% identity (80.7% similar) in 574 aa overlap (26-584:1-558)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLYLENNAQTQFSEPQYTNLGLLNSMDQQIQNGSSSTSPYNTDHAQNSVTAPSPYAQPSS
::: ... ..:.:::. .:: :: . ::::::::
CCDS55 MDQ-MSSRAASASPYTPEHAA-SVPTHSPYAQPSS
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVSFQQSSTAKSATWTYSTELKKLYCQIAKTCPIQIK
:::..::.:.::::::::::: :.:.::::::::::::::: :::::::::::::::::
CCDS55 TFDTMSPAPVIPSNTDYPGPHHFEVTFQQSSTAKSATWTYSPLLKKLYCQIAKTCPIQIK
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEVVKRCPNHELSREFNEGQIAPPSHLIRVEGNSHAQ
: :::: :..::::::::::::::.::::::::::.:.::::: :: :::::::::. .:
CCDS55 VSTPPPPGTAIRAMPVYKKAEHVTDVVKRCPNHELGRDFNEGQSAPASHLIRVEGNNLSQ
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 YVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFTTVLYNFMCNSSCVGGMNRRPILIIVTLETRDGQV
::.::.::::::.::::::::::::::.::::::::::::::::::::::.::: :::::
CCDS55 YVDDPVTGRQSVVVPYEPPQVGTEFTTILYNFMCNSSCVGGMNRRPILIIITLEMRDGQV
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290
pF1KE2 LGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIRKQQVSD--STKNGDGTKRPFRQNTHGIQM--TSI
:::: ::.::::::::::::::: :.::. . :.::: ..:: :.:. .. ...
CCDS55 LGRRSFEGRICACPGRDRKADEDHYREQQALNESSAKNGAASKRAFKQSPPAVPALGAGV
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 KKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKESLELMQYLPQHTIETYRQQQQQQHQHLLQKQ
:::: :.. :: :::::..:.:.:.:::::::. .:: ...:::::: :::.
CCDS55 KKRRHGDEDTYYLQVRGRENFEILMKLKESLELMELVPQPLVDSYRQQQQ-----LLQRP
280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 TSIQSPSSYGNSSPPLNKMNS-MNKLPSVSQLIN--PQQRNALTPTTIPDGMGANIPMMG
. .: :: :: :.::... :::::::.::.. : . .: ::. : : : . :
CCDS55 SHLQPPS-YGPVLSPMNKVHGGMNKLPSVNQLVGQPPPHSSAATPNLGPVGPGM-LNNHG
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 THMPMAGDMNGLSPTQALPPPLSMPSTSHCTPPPPYPTDCSIVSFLARLGCSSCLDYFTT
.: :.:.. .: :: : ::::::::: .: :.::::. ::: .:..:::.
CCDS55 HAVPANGEMSSSHSAQ------SMVSGSHCTPPPPYHADPSLVSFLTGLGCPNCIEYFTS
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 QGLTTIYQIEHYSMDDLASLKIPEQFRHAIWKGILDHRQLHEFSSPSHLLRTPSSASTVS
::: .::.... ...::..::::::.: .::.:. : .: :..:. ..:::. :.:.:.:
CCDS55 QGLQSIYHLQNLTIEDLGALKIPEQYRMTIWRGLQDLKQGHDYSTAQQLLRS-SNAATIS
450 460 470 480 490
540 550 560 570 580
pF1KE2 VGSS-ETRGERVIDAVRFTLRQTISFPPR-------DEWNDFNFDMDARRNKQQRIKEEG
.:.: : . .::..::.: .:.::..: : ::: ::.::. . ..: ::::
CCDS55 IGGSGELQRQRVMEAVHFRVRHTITIPNRGGPGGGPDEWADFGFDLPDCKARKQPIKEEF
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 E
CCDS55 TEAEIH
560
586 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 17:36:06 2016 done: Sun Nov 6 17:36:07 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]