FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5577, 447 aa 1>>>pF1KE5577 447 - 447 aa - 447 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4294+/-0.000364; mu= 17.8152+/- 0.023 mean_var=84.5236+/-17.491, 0's: 0 Z-trim(115.1): 161 B-trim: 1232 in 1/52 Lambda= 0.139504 statistics sampled from 25112 (25273) to 25112 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.665), E-opt: 0.2 (0.296), width: 16 Scan time: 9.030 The best scores are: opt bits E(85289) NP_570126 (OMIM: 610121) 5-hydroxytryptamine recep ( 447) 3020 617.8 1.9e-176 NP_001243542 (OMIM: 610123) 5-hydroxytryptamine re ( 456) 2147 442.1 1.5e-123 NP_872395 (OMIM: 610123) 5-hydroxytryptamine recep ( 471) 2115 435.6 1.3e-121 NP_938055 (OMIM: 610123) 5-hydroxytryptamine recep ( 441) 1782 368.6 1.9e-101 NP_938056 (OMIM: 610123) 5-hydroxytryptamine recep ( 456) 1782 368.6 1.9e-101 NP_001243543 (OMIM: 610123) 5-hydroxytryptamine re ( 482) 1549 321.7 2.6e-87 NP_001155244 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine re ( 463) 929 196.9 9.3e-50 NP_000860 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine recep ( 484) 929 196.9 9.6e-50 NP_001157118 (OMIM: 610122) 5-hydroxytryptamine re ( 454) 912 193.5 9.8e-49 NP_998786 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine recep ( 516) 785 168.0 5.3e-41 XP_011541365 (OMIM: 604654) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 430) 708 152.4 2.1e-36 NP_006019 (OMIM: 604654) 5-hydroxytryptamine recep ( 441) 708 152.4 2.2e-36 XP_016874041 (OMIM: 604654) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 372) 657 142.1 2.4e-33 NP_060051 (OMIM: 605116) neuronal acetylcholine re ( 479) 570 124.7 5.3e-28 NP_004189 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine re ( 494) 553 121.3 5.9e-27 NP_065135 (OMIM: 606372) neuronal acetylcholine re ( 450) 545 119.6 1.7e-26 NP_000740 (OMIM: 118508) neuronal acetylcholine re ( 458) 543 119.2 2.2e-26 NP_000733 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetylcho ( 529) 539 118.5 4.3e-26 XP_006716345 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 529) 539 118.5 4.3e-26 XP_011542690 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 529) 539 118.5 4.3e-26 NP_001160166 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetyl ( 489) 537 118.1 5.4e-26 NP_000734 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetylcho ( 505) 537 118.1 5.6e-26 XP_016861343 (OMIM: 610122) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 233) 530 116.4 8.2e-26 NP_872343 (OMIM: 610122) 5-hydroxytryptamine recep ( 279) 530 116.4 9.4e-26 NP_000737 (OMIM: 118511,612001) neuronal acetylcho ( 502) 533 117.3 9.7e-26 NP_001177384 (OMIM: 118511,612001) neuronal acetyl ( 531) 533 117.3 1e-25 NP_001138615 (OMIM: 610122) 5-hydroxytryptamine re ( 404) 530 116.6 1.2e-25 NP_000735 (OMIM: 118504,188890,600513) neuronal ac ( 627) 530 116.7 1.7e-25 NP_000739 (OMIM: 118507,605375) neuronal acetylcho ( 502) 519 114.4 6.8e-25 NP_001269384 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetyl ( 514) 510 112.6 2.4e-24 XP_016877378 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 449) 496 109.8 1.5e-23 XP_016877377 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 462) 496 109.8 1.6e-23 XP_016877376 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 463) 496 109.8 1.6e-23 NP_000741 (OMIM: 118509) neuronal acetylcholine re ( 498) 496 109.8 1.7e-23 XP_006720445 (OMIM: 118503,612052) PREDICTED: neur ( 438) 491 108.8 3.1e-23 NP_000736 (OMIM: 118505,612052) neuronal acetylcho ( 468) 484 107.4 8.5e-23 XP_016877374 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 468) 483 107.2 9.8e-23 XP_016877375 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 468) 483 107.2 9.8e-23 XP_011519488 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 495) 483 107.2 1e-22 XP_011519489 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 495) 483 107.2 1e-22 XP_016883113 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 546) 482 107.0 1.3e-22 NP_001186208 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine ( 479) 480 106.6 1.5e-22 XP_011519478 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 486) 479 106.4 1.8e-22 XP_011519480 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 380) 471 104.7 4.5e-22 NP_000070 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) acet ( 457) 441 98.7 3.4e-20 XP_016858746 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) P ( 464) 441 98.7 3.4e-20 XP_011519493 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 424) 438 98.1 4.8e-20 XP_011519492 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 424) 438 98.1 4.8e-20 NP_005190 (OMIM: 100730,253290,265000) acetylcholi ( 517) 409 92.3 3.2e-18 NP_001034612 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) a ( 482) 402 90.9 8.1e-18 >>NP_570126 (OMIM: 610121) 5-hydroxytryptamine receptor (447 aa) initn: 3020 init1: 3020 opt: 3020 Z-score: 3288.9 bits: 617.8 E(85289): 1.9e-176 Smith-Waterman score: 3020; 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NP_872 MLAFILSRATPRPALGPLSYREHRVALLHLTHSMSTTGRGVTFTINCSGFGQHGADPTAL 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 QAVFDRKAFRPFTNYSIPTRVNISFTLSAILGVDAQLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPK ..::.:: ::: :: :.::.:::::..:::: :. ::.::.::::...:::::::.:::. NP_872 NSVFNRKPFRPVTNISVPTQVNISFAMSAILDVNEQLHLLSSFLWLEMVWDNPFISWNPE 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 ECVGINKLTVLAENLWLPDIFIVESMDVDQTPSGLTAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLD :: ::.:... :.:::::::::.: ::::.::.:::::.:.::::.: :::.: :::::: NP_872 ECEGITKMSMAAKNLWLPDIFIIELMDVDKTPKGLTAYVSNEGRIRYKKPMKVDSICNLD 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 IFYFPFDQQNCTFTFSSFLYTVDSMLLGMDKEVWEITDTSRKVIQTQGEWELLGINKATP ::::::::::::.:::::::::::::: :.::::::::.::...::.:::::::..::: NP_872 IFYFPFDQQNCTLTFSSFLYTVDSMLLDMEKEVWEITDASRNILQTHGEWELLGLSKATA 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 KMSMGNNLYDQIMFYVAIRRRPSLYIINLLVPSSFLVAIDALSFYLPAESENRAPFKITL :.: :.::::::.::::::::::::.:::::::.:::::::::::::..: ::.:::::: NP_872 KLSRGGNLYDQIVFYVAIRRRPSLYVINLLVPSGFLVAIDALSFYLPVKSGNRVPFKITL 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 LLGYNVFLLMMNDLLPASGTPLISVYFALCLSLMVVSLLETVFITYLLHVATTQPPPMPR :::::::::::.::::.::::::.::::::::::: :::::.:::.:::::::::::.:: NP_872 LLGYNVFLLMMSDLLPTSGTPLIGVYFALCLSLMVGSLLETIFITHLLHVATTQPPPLPR 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 WLHSLLLHCTSPGRCCPTAPQKGNKGLGLTLTHLPGPKEPGELAGKKLGPRETEPDGGSG :::::::::.:::::::::::: ::: ::: ::::: ::: ::. :: :.: ::: NP_872 WLHSLLLHCNSPGRCCPTAPQKENKGPGLTPTHLPGVKEPEVSAGQMPGPAEAELTGGSE 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 pF1KE5 WTKTQL---------MELWVQFSHAMDTLLFRLYLLFMASSILTVIVLWNT ::..: .:::.:::::::..:::::::::::::.::: :::: NP_872 WTRAQREHEAQKQHSVELWLQFSHAMDAMLFRLYLLFMASSIITVICLWNT 430 440 450 460 470 >>NP_938055 (OMIM: 610123) 5-hydroxytryptamine receptor (441 aa) initn: 2257 init1: 1756 opt: 1782 Z-score: 1942.4 bits: 368.6 E(85289): 1.9e-101 Smith-Waterman score: 2216; 72.1% identity (86.6% similar) in 456 aa overlap (1-447:1-441) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MEGGWPARQSALLCLTVSLLLQGRGDAFTINCSGFDQHGVDPAVFQAVFDRKAFRPFTNY :::.: :. . : ...:::::: .:::::::: :::.::.....::.:: ::: :: NP_938 MEGSWFHRKRFSFYLLLGFLLQGRGVTFTINCSGFGQHGADPTALNSVFNRKPFRPVTNI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 SIPTRVNISFTLSAILGVDAQLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPKECVGINKLTVLAENL :.::.:::::..:::: :.:::::::.:::.:: ::.:... :.:: NP_938 SVPTQVNISFAMSAIL---------------DVVWDNPFISWNPEECEGITKMSMAAKNL 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 WLPDIFIVESMDVDQTPSGLTAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLDIFYFPFDQQNCTFTF :::::::.: ::::.::.:::::.:.::::.: :::.: ::::::::::::::::::.:: NP_938 WLPDIFIIELMDVDKTPKGLTAYVSNEGRIRYKKPMKVDSICNLDIFYFPFDQQNCTLTF 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 SSFLYTVDSMLLGMDKEVWEITDTSRKVIQTQGEWELLGINKATPKMSMGNNLYDQIMFY :::::::::::: :.::::::::.::...::.:::::::..::: :.: :.::::::.:: NP_938 SSFLYTVDSMLLDMEKEVWEITDASRNILQTHGEWELLGLSKATAKLSRGGNLYDQIVFY 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 VAIRRRPSLYIINLLVPSSFLVAIDALSFYLPAESENRAPFKITLLLGYNVFLLMMNDLL ::::::::::.:::::::.:::::::::::::..: ::.:::::::::::::::::.::: NP_938 VAIRRRPSLYVINLLVPSGFLVAIDALSFYLPVKSGNRVPFKITLLLGYNVFLLMMSDLL 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 PASGTPLISVYFALCLSLMVVSLLETVFITYLLHVATTQPPPMPRWLHSLLLHCTSPGRC :.::::::.::::::::::: :::::.:::.:::::::::::.:::::::::::.::::: NP_938 PTSGTPLIGVYFALCLSLMVGSLLETIFITHLLHVATTQPPPLPRWLHSLLLHCNSPGRC 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 pF1KE5 CPTAPQKGNKGLGLTLTHLPGPKEPGELAGKKLGPRETEPDGGSGWTKTQL--------- ::::::: ::: ::: ::::: ::: ::. :: :.: ::: ::..: NP_938 CPTAPQKENKGPGLTPTHLPGVKEPEVSAGQMPGPAEAELTGGSEWTRAQREHEAQKQHS 350 360 370 380 390 400 420 430 440 pF1KE5 MELWVQFSHAMDTLLFRLYLLFMASSILTVIVLWNT .:::.:::::::..:::::::::::::.::: :::: NP_938 VELWLQFSHAMDAMLFRLYLLFMASSIITVICLWNT 410 420 430 440 >>NP_938056 (OMIM: 610123) 5-hydroxytryptamine receptor (456 aa) initn: 2225 init1: 1756 opt: 1782 Z-score: 1942.2 bits: 368.6 E(85289): 1.9e-101 Smith-Waterman score: 2184; 73.1% identity (86.8% similar) in 446 aa overlap (11-447:26-456) 10 20 30 40 pF1KE5 MEGGWPARQSALLCLTVSLLLQGRGDAFTINCSGFDQHGVDPAVF ::: :: :. ::: .:::::::: :::.::... NP_938 MLAFILSRATPRPALGPLSYREHRVALLHLTHSMSTTGRGVTFTINCSGFGQHGADPTAL 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 QAVFDRKAFRPFTNYSIPTRVNISFTLSAILGVDAQLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPK ..::.:: ::: :: :.::.:::::..:::: :.:::::::.:::. NP_938 NSVFNRKPFRPVTNISVPTQVNISFAMSAIL---------------DVVWDNPFISWNPE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 ECVGINKLTVLAENLWLPDIFIVESMDVDQTPSGLTAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLD :: ::.:... :.:::::::::.: ::::.::.:::::.:.::::.: :::.: :::::: NP_938 ECEGITKMSMAAKNLWLPDIFIIELMDVDKTPKGLTAYVSNEGRIRYKKPMKVDSICNLD 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 IFYFPFDQQNCTFTFSSFLYTVDSMLLGMDKEVWEITDTSRKVIQTQGEWELLGINKATP ::::::::::::.:::::::::::::: :.::::::::.::...::.:::::::..::: NP_938 IFYFPFDQQNCTLTFSSFLYTVDSMLLDMEKEVWEITDASRNILQTHGEWELLGLSKATA 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 KMSMGNNLYDQIMFYVAIRRRPSLYIINLLVPSSFLVAIDALSFYLPAESENRAPFKITL :.: :.::::::.::::::::::::.:::::::.:::::::::::::..: ::.:::::: NP_938 KLSRGGNLYDQIVFYVAIRRRPSLYVINLLVPSGFLVAIDALSFYLPVKSGNRVPFKITL 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 LLGYNVFLLMMNDLLPASGTPLISVYFALCLSLMVVSLLETVFITYLLHVATTQPPPMPR :::::::::::.::::.::::::.::::::::::: :::::.:::.:::::::::::.:: NP_938 LLGYNVFLLMMSDLLPTSGTPLIGVYFALCLSLMVGSLLETIFITHLLHVATTQPPPLPR 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 WLHSLLLHCTSPGRCCPTAPQKGNKGLGLTLTHLPGPKEPGELAGKKLGPRETEPDGGSG :::::::::.:::::::::::: ::: ::: ::::: ::: ::. :: :.: ::: NP_938 WLHSLLLHCNSPGRCCPTAPQKENKGPGLTPTHLPGVKEPEVSAGQMPGPAEAELTGGSE 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 WTKTQL---------MELWVQFSHAMDTLLFRLYLLFMASSILTVIVLWNT ::..: .:::.:::::::..:::::::::::::.::: :::: NP_938 WTRAQREHEAQKQHSVELWLQFSHAMDAMLFRLYLLFMASSIITVICLWNT 410 420 430 440 450 >>NP_001243543 (OMIM: 610123) 5-hydroxytryptamine recept (482 aa) initn: 2013 init1: 1544 opt: 1549 Z-score: 1688.5 bits: 321.7 E(85289): 2.6e-87 Smith-Waterman score: 2122; 69.1% identity (82.0% similar) in 472 aa overlap (11-447:26-482) 10 20 30 40 pF1KE5 MEGGWPARQSALLCLTVSLLLQGRGDAFTINCSGFDQHGVDPAVF ::: :: :. ::: .:::::::: :::.::... NP_001 MLAFILSRATPRPALGPLSYREHRVALLHLTHSMSTTGRGVTFTINCSGFGQHGADPTAL 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 QAVFDRKAFRPFTNYSIPTRVNISFTLSAILGVDAQLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPK ..::.:: ::: :: :.::.:::::..:::: :.:::::::.:::. NP_001 NSVFNRKPFRPVTNISVPTQVNISFAMSAIL---------------DVVWDNPFISWNPE 70 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 ECVGINKLTVLAENLWLPDIFIVES--------------------------MDVDQTPSG :: ::.:... :.:::::::::.: ::::.::.: NP_001 ECEGITKMSMAAKNLWLPDIFIIELCVSRAGQREVPSPGSHRDHSLPLGPLMDVDKTPKG 110 120 130 140 150 160 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 LTAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLDIFYFPFDQQNCTFTFSSFLYTVDSMLLGMDKEVW ::::.:.::::.: :::.: ::::::::::::::::::.:::::::::::::: :.:::: NP_001 LTAYVSNEGRIRYKKPMKVDSICNLDIFYFPFDQQNCTLTFSSFLYTVDSMLLDMEKEVW 170 180 190 200 210 220 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 EITDTSRKVIQTQGEWELLGINKATPKMSMGNNLYDQIMFYVAIRRRPSLYIINLLVPSS ::::.::...::.:::::::..::: :.: :.::::::.::::::::::::.:::::::. NP_001 EITDASRNILQTHGEWELLGLSKATAKLSRGGNLYDQIVFYVAIRRRPSLYVINLLVPSG 230 240 250 260 270 280 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 FLVAIDALSFYLPAESENRAPFKITLLLGYNVFLLMMNDLLPASGTPLISVYFALCLSLM :::::::::::::..: ::.:::::::::::::::::.::::.::::::.:::::::::: NP_001 FLVAIDALSFYLPVKSGNRVPFKITLLLGYNVFLLMMSDLLPTSGTPLIGVYFALCLSLM 290 300 310 320 330 340 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 VVSLLETVFITYLLHVATTQPPPMPRWLHSLLLHCTSPGRCCPTAPQKGNKGLGLTLTHL : :::::.:::.:::::::::::.:::::::::::.:::::::::::: ::: ::: ::: NP_001 VGSLLETIFITHLLHVATTQPPPLPRWLHSLLLHCNSPGRCCPTAPQKENKGPGLTPTHL 350 360 370 380 390 400 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 PGPKEPGELAGKKLGPRETEPDGGSGWTKTQL---------MELWVQFSHAMDTLLFRLY :: ::: ::. :: :.: ::: ::..: .:::.:::::::..::::: NP_001 PGVKEPEVSAGQMPGPAEAELTGGSEWTRAQREHEAQKQHSVELWLQFSHAMDAMLFRLY 410 420 430 440 450 460 440 pF1KE5 LLFMASSILTVIVLWNT ::::::::.::: :::: NP_001 LLFMASSIITVICLWNT 470 480 >>NP_001155244 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine recept (463 aa) initn: 968 init1: 667 opt: 929 Z-score: 1014.3 bits: 196.9 E(85289): 9.3e-50 Smith-Waterman score: 978; 37.6% identity (68.9% similar) in 431 aa overlap (51-446:31-458) 30 40 50 60 70 80 pF1KE5 LQGRGDAFTINCSGFDQHGVDPAVFQAVFDRKAFRPFTNYSIPTRVNISFTLSAILGVDA ::. :: .. :: :.:. . :::.:: NP_001 MHRSFLQARRSRNTTRPALLRLSDYLLTNYRKGVRPVRDWRKPTTVSIDVIVYAILNVDE 10 20 30 40 50 60 90 100 110 120 130 140 pF1KE5 QLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPKECVGINKLTVLAENLWLPDIFIVESMDVDQTPSGL . :.::...:. : . :..:::.. .:.::.. ....:.:::.: : .:: ..:. NP_001 KNQVLTTYIWYRQYWTDEFLQWNPEDFDNITKLSIPTDSIWVPDILINEFVDVGKSPNIP 70 80 90 100 110 120 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 TAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLDIFYFPFDQQNCTFTFSSFLYTVDSMLLGMDKEVWE .:: .:... ::..:.. :.:::. :::: :::..::.:.:.:.... ... . . : NP_001 YVYIRHQGEVQNYKPLQVVTACSLDIYNFPFDVQNCSLTFTSWLHTIQDINISLWR-LPE 130 140 150 160 170 210 220 230 240 250 pF1KE5 ITDTSRKVIQTQGEWELLGINKATPKMSM-GNNLYDQIMFYVAIRRRPSLYIINLLVPSS . ..:.:...::::::::. ..:: ..: : .. :::.::::: .:...::.:: NP_001 KVKSDRSVFMNQGEWELLGVLPYFREFSMESSNYYAEMKFYVVIRRRPLFYVVSLLLPSI 180 190 200 210 220 230 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 FLVAIDALSFYLPAESENRAPFKITLLLGYNVFLLMMNDLLPAS--GTPLISVYFALCLS ::...: ..:::: .: .:. :::::::::.:::....: :::. :::::.:::..:.. NP_001 FLMVMDIVGFYLPPNSGERVSFKITLLLGYSVFLIIVSDTLPATAIGTPLIGVYFVVCMA 240 250 260 270 280 290 320 330 340 350 360 pF1KE5 LMVVSLLETVFITYLLHVATTQPPPMPRWLHSLLLHCTSPGRCC--------PTAPQKGN :.:.:: ::.::. :.: : : .: ::. :.:. . : : : .... NP_001 LLVISLAETIFIVRLVHKQDLQQP-VPAWLRHLVLERIAWLLCLREQSTSQRPPATSQAT 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 pF1KE5 K-----GLGLTLTHLPGP----KEPGELAGKKLGPRETEPDGGSGWTKT-----QLMEL- : ..: .:. :: : : . . :::. . : . :..: NP_001 KTDDCSAMGNHCSHMGGPQDFEKSPRDRCSPPPPPREASL-AVCGLLQELSSIRQFLEKR 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 ---------WVQFSHAMDTLLFRLYLLFMASSILTVIVLWNT :.. . ..: :::..::: . . .:...::. NP_001 DEIREVARDWLRVGSVLDKLLFHIYLLAVLAYSITLVMLWSIWQYA 420 430 440 450 460 >>NP_000860 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine receptor (484 aa) initn: 968 init1: 667 opt: 929 Z-score: 1014.1 bits: 196.9 E(85289): 9.6e-50 Smith-Waterman score: 978; 37.6% identity (68.9% similar) in 431 aa overlap (51-446:52-479) 30 40 50 60 70 80 pF1KE5 LQGRGDAFTINCSGFDQHGVDPAVFQAVFDRKAFRPFTNYSIPTRVNISFTLSAILGVDA ::. :: .. :: :.:. . :::.:: NP_000 TLLAQGEARRSRNTTRPALLRLSDYLLTNYRKGVRPVRDWRKPTTVSIDVIVYAILNVDE 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 pF1KE5 QLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPKECVGINKLTVLAENLWLPDIFIVESMDVDQTPSGL . :.::...:. : . :..:::.. .:.::.. ....:.:::.: : .:: ..:. NP_000 KNQVLTTYIWYRQYWTDEFLQWNPEDFDNITKLSIPTDSIWVPDILINEFVDVGKSPNIP 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 TAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLDIFYFPFDQQNCTFTFSSFLYTVDSMLLGMDKEVWE .:: .:... ::..:.. :.:::. :::: :::..::.:.:.:.... ... . . : NP_000 YVYIRHQGEVQNYKPLQVVTACSLDIYNFPFDVQNCSLTFTSWLHTIQDINISLWR-LPE 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 ITDTSRKVIQTQGEWELLGINKATPKMSM-GNNLYDQIMFYVAIRRRPSLYIINLLVPSS . ..:.:...::::::::. ..:: ..: : .. :::.::::: .:...::.:: NP_000 KVKSDRSVFMNQGEWELLGVLPYFREFSMESSNYYAEMKFYVVIRRRPLFYVVSLLLPSI 210 220 230 240 250 260 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 FLVAIDALSFYLPAESENRAPFKITLLLGYNVFLLMMNDLLPAS--GTPLISVYFALCLS ::...: ..:::: .: .:. :::::::::.:::....: :::. :::::.:::..:.. NP_000 FLMVMDIVGFYLPPNSGERVSFKITLLLGYSVFLIIVSDTLPATAIGTPLIGVYFVVCMA 270 280 290 300 310 320 320 330 340 350 360 pF1KE5 LMVVSLLETVFITYLLHVATTQPPPMPRWLHSLLLHCTSPGRCC--------PTAPQKGN :.:.:: ::.::. :.: : : .: ::. :.:. . : : : .... 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NP_000 DEIREVARDWLRVGSVLDKLLFHIYLLAVLAYSITLVMLWSIWQYA 440 450 460 470 480 >>NP_001157118 (OMIM: 610122) 5-hydroxytryptamine recept (454 aa) initn: 1598 init1: 527 opt: 912 Z-score: 996.0 bits: 193.5 E(85289): 9.8e-49 Smith-Waterman score: 1483; 55.7% identity (71.3% similar) in 470 aa overlap (11-447:10-454) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MEGGWPARQSALLCLTVSLLLQGRGDAFTINCSGFDQHGVDPAVFQAVFDRKAFRPFTNY :: :. ::: : ::.. ::: :: :: ::::.:::::::::. : ::: NP_001 MQKHSPGPPALALLSQSLLTTGNGDTLIINCPGFGQHRVDPAAFQAVFDRKAIGPVTNY 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 SIPTRVNISFTLSAILGVDAQLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPKECVGINKLTVLAENL :. :.:::::::::: . .... .. : : :..::: :: ::.: . .::: NP_001 SVATHVNISFTLSAIWNCYSRIHTFNCH--HARPWHNQFVQWNPDECGGIKKSGMATENL 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 WLPDIFIVESMDVDQTPSGLTAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLDIFYFPFDQQNCTFTF :: :.:: :: :::::.:: : .: ...:: ..: : .. 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