FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5577, 447 aa 1>>>pF1KE5577 447 - 447 aa - 447 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5164+/-0.00087; mu= 17.1853+/- 0.052 mean_var=85.5427+/-17.300, 0's: 0 Z-trim(108.4): 75 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.138670 statistics sampled from 10137 (10212) to 10137 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.684), E-opt: 0.2 (0.314), width: 16 Scan time: 2.160 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3250.1 HTR3C gene_id:170572|Hs108|chr3 ( 447) 3020 614.1 8.8e-176 CCDS58868.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3 ( 456) 2147 439.5 3.4e-123 CCDS3251.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3 ( 471) 2115 433.1 2.9e-121 CCDS58869.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3 ( 441) 1782 366.4 3.1e-101 CCDS58870.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3 ( 456) 1782 366.5 3.2e-101 CCDS58871.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3 ( 482) 1549 319.9 3.6e-87 CCDS53710.1 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 463) 929 195.8 7.7e-50 CCDS8365.2 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 484) 929 195.8 7.9e-50 CCDS54685.1 HTR3D gene_id:200909|Hs108|chr3 ( 454) 912 192.4 8e-49 CCDS8366.2 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 516) 785 167.0 3.9e-41 CCDS8364.1 HTR3B gene_id:9177|Hs108|chr11 ( 441) 708 151.6 1.5e-36 CCDS3459.1 CHRNA9 gene_id:55584|Hs108|chr4 ( 479) 570 124.0 3.3e-28 CCDS6135.1 CHRNA6 gene_id:8973|Hs108|chr8 ( 494) 553 120.6 3.6e-27 CCDS7745.1 CHRNA10 gene_id:57053|Hs108|chr11 ( 450) 545 119.0 1e-26 CCDS6134.1 CHRNB3 gene_id:1142|Hs108|chr8 ( 458) 543 118.6 1.3e-26 CCDS6059.1 CHRNA2 gene_id:1135|Hs108|chr8 ( 529) 539 117.8 2.6e-26 CCDS53964.1 CHRNA3 gene_id:1136|Hs108|chr15 ( 489) 537 117.4 3.2e-26 CCDS10305.1 CHRNA3 gene_id:1136|Hs108|chr15 ( 505) 537 117.4 3.3e-26 CCDS3249.1 HTR3D gene_id:200909|Hs108|chr3 ( 279) 530 115.8 5.6e-26 CCDS10027.1 CHRNA7 gene_id:1139|Hs108|chr15 ( 502) 533 116.6 5.8e-26 CCDS53924.1 CHRNA7 gene_id:1139|Hs108|chr15 ( 531) 533 116.6 6e-26 CCDS46966.1 HTR3D gene_id:200909|Hs108|chr3 ( 404) 530 115.9 7.4e-26 CCDS13517.1 CHRNA4 gene_id:1137|Hs108|chr20 ( 627) 530 116.1 1e-25 CCDS1070.1 CHRNB2 gene_id:1141|Hs108|chr1 ( 502) 519 113.8 4e-25 CCDS64856.1 CHRNA2 gene_id:1135|Hs108|chr8 ( 514) 510 112.0 1.4e-24 CCDS10306.1 CHRNB4 gene_id:1143|Hs108|chr15 ( 498) 496 109.2 9.7e-24 CCDS10304.1 CHRNA5 gene_id:1138|Hs108|chr15 ( 468) 484 106.8 4.9e-23 CCDS56536.1 CHRNA6 gene_id:8973|Hs108|chr8 ( 479) 480 106.0 8.6e-23 CCDS2261.1 CHRNA1 gene_id:1134|Hs108|chr2 ( 457) 441 98.2 1.9e-20 CCDS33400.1 CHRNG gene_id:1146|Hs108|chr2 ( 517) 409 91.8 1.7e-18 CCDS33331.1 CHRNA1 gene_id:1134|Hs108|chr2 ( 482) 402 90.4 4.3e-18 CCDS32184.1 CHRFAM7A gene_id:89832|Hs108|chr15 ( 412) 383 86.5 5.3e-17 CCDS59029.1 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 462) 340 78.0 2.3e-14 CCDS59028.1 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 392) 339 77.7 2.3e-14 CCDS5019.2 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 479) 340 78.0 2.3e-14 CCDS11058.1 CHRNE gene_id:1145|Hs108|chr17 ( 493) 336 77.2 4.2e-14 CCDS5020.3 GABRR2 gene_id:2570|Hs108|chr6 ( 465) 335 77.0 4.6e-14 CCDS11106.1 CHRNB1 gene_id:1140|Hs108|chr17 ( 501) 324 74.8 2.2e-13 CCDS14707.1 GABRQ gene_id:55879|Hs108|chrX ( 632) 322 74.5 3.5e-13 CCDS3796.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 ( 497) 287 67.4 3.7e-11 CCDS36.1 GABRD gene_id:2563|Hs108|chr1 ( 452) 285 67.0 4.6e-11 >>CCDS3250.1 HTR3C gene_id:170572|Hs108|chr3 (447 aa) initn: 3020 init1: 3020 opt: 3020 Z-score: 3269.3 bits: 614.1 E(32554): 8.8e-176 Smith-Waterman score: 3020; 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CCDS32 MLAFILSRATPRPALGPLSYREHRVALLHLTHSMSTTGRGVTFTINCSGFGQHGADPTAL 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 QAVFDRKAFRPFTNYSIPTRVNISFTLSAILGVDAQLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPK ..::.:: ::: :: :.::.:::::..:::: :. ::.::.::::...:::::::.:::. CCDS32 NSVFNRKPFRPVTNISVPTQVNISFAMSAILDVNEQLHLLSSFLWLEMVWDNPFISWNPE 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 ECVGINKLTVLAENLWLPDIFIVESMDVDQTPSGLTAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLD :: ::.:... :.:::::::::.: ::::.::.:::::.:.::::.: :::.: :::::: CCDS32 ECEGITKMSMAAKNLWLPDIFIIELMDVDKTPKGLTAYVSNEGRIRYKKPMKVDSICNLD 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 IFYFPFDQQNCTFTFSSFLYTVDSMLLGMDKEVWEITDTSRKVIQTQGEWELLGINKATP ::::::::::::.:::::::::::::: :.::::::::.::...::.:::::::..::: CCDS32 IFYFPFDQQNCTLTFSSFLYTVDSMLLDMEKEVWEITDASRNILQTHGEWELLGLSKATA 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 KMSMGNNLYDQIMFYVAIRRRPSLYIINLLVPSSFLVAIDALSFYLPAESENRAPFKITL :.: :.::::::.::::::::::::.:::::::.:::::::::::::..: ::.:::::: CCDS32 KLSRGGNLYDQIVFYVAIRRRPSLYVINLLVPSGFLVAIDALSFYLPVKSGNRVPFKITL 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 LLGYNVFLLMMNDLLPASGTPLISVYFALCLSLMVVSLLETVFITYLLHVATTQPPPMPR :::::::::::.::::.::::::.::::::::::: :::::.:::.:::::::::::.:: CCDS32 LLGYNVFLLMMSDLLPTSGTPLIGVYFALCLSLMVGSLLETIFITHLLHVATTQPPPLPR 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 WLHSLLLHCTSPGRCCPTAPQKGNKGLGLTLTHLPGPKEPGELAGKKLGPRETEPDGGSG :::::::::.:::::::::::: ::: ::: ::::: ::: ::. :: :.: ::: CCDS32 WLHSLLLHCNSPGRCCPTAPQKENKGPGLTPTHLPGVKEPEVSAGQMPGPAEAELTGGSE 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 pF1KE5 WTKTQL---------MELWVQFSHAMDTLLFRLYLLFMASSILTVIVLWNT ::..: .:::.:::::::..:::::::::::::.::: :::: CCDS32 WTRAQREHEAQKQHSVELWLQFSHAMDAMLFRLYLLFMASSIITVICLWNT 430 440 450 460 470 >>CCDS58869.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3 (441 aa) initn: 2257 init1: 1756 opt: 1782 Z-score: 1930.9 bits: 366.4 E(32554): 3.1e-101 Smith-Waterman score: 2216; 72.1% identity (86.6% similar) in 456 aa overlap (1-447:1-441) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MEGGWPARQSALLCLTVSLLLQGRGDAFTINCSGFDQHGVDPAVFQAVFDRKAFRPFTNY :::.: :. . : ...:::::: .:::::::: :::.::.....::.:: ::: :: CCDS58 MEGSWFHRKRFSFYLLLGFLLQGRGVTFTINCSGFGQHGADPTALNSVFNRKPFRPVTNI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 SIPTRVNISFTLSAILGVDAQLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPKECVGINKLTVLAENL :.::.:::::..:::: :.:::::::.:::.:: ::.:... :.:: CCDS58 SVPTQVNISFAMSAIL---------------DVVWDNPFISWNPEECEGITKMSMAAKNL 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 WLPDIFIVESMDVDQTPSGLTAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLDIFYFPFDQQNCTFTF :::::::.: ::::.::.:::::.:.::::.: :::.: ::::::::::::::::::.:: CCDS58 WLPDIFIIELMDVDKTPKGLTAYVSNEGRIRYKKPMKVDSICNLDIFYFPFDQQNCTLTF 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 SSFLYTVDSMLLGMDKEVWEITDTSRKVIQTQGEWELLGINKATPKMSMGNNLYDQIMFY :::::::::::: :.::::::::.::...::.:::::::..::: :.: :.::::::.:: CCDS58 SSFLYTVDSMLLDMEKEVWEITDASRNILQTHGEWELLGLSKATAKLSRGGNLYDQIVFY 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 VAIRRRPSLYIINLLVPSSFLVAIDALSFYLPAESENRAPFKITLLLGYNVFLLMMNDLL ::::::::::.:::::::.:::::::::::::..: ::.:::::::::::::::::.::: CCDS58 VAIRRRPSLYVINLLVPSGFLVAIDALSFYLPVKSGNRVPFKITLLLGYNVFLLMMSDLL 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 PASGTPLISVYFALCLSLMVVSLLETVFITYLLHVATTQPPPMPRWLHSLLLHCTSPGRC :.::::::.::::::::::: :::::.:::.:::::::::::.:::::::::::.::::: CCDS58 PTSGTPLIGVYFALCLSLMVGSLLETIFITHLLHVATTQPPPLPRWLHSLLLHCNSPGRC 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 pF1KE5 CPTAPQKGNKGLGLTLTHLPGPKEPGELAGKKLGPRETEPDGGSGWTKTQL--------- ::::::: ::: ::: ::::: ::: ::. :: :.: ::: ::..: CCDS58 CPTAPQKENKGPGLTPTHLPGVKEPEVSAGQMPGPAEAELTGGSEWTRAQREHEAQKQHS 350 360 370 380 390 400 420 430 440 pF1KE5 MELWVQFSHAMDTLLFRLYLLFMASSILTVIVLWNT .:::.:::::::..:::::::::::::.::: :::: CCDS58 VELWLQFSHAMDAMLFRLYLLFMASSIITVICLWNT 410 420 430 440 >>CCDS58870.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3 (456 aa) initn: 2225 init1: 1756 opt: 1782 Z-score: 1930.7 bits: 366.5 E(32554): 3.2e-101 Smith-Waterman score: 2184; 73.1% identity (86.8% similar) in 446 aa overlap (11-447:26-456) 10 20 30 40 pF1KE5 MEGGWPARQSALLCLTVSLLLQGRGDAFTINCSGFDQHGVDPAVF ::: :: :. ::: .:::::::: :::.::... CCDS58 MLAFILSRATPRPALGPLSYREHRVALLHLTHSMSTTGRGVTFTINCSGFGQHGADPTAL 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 QAVFDRKAFRPFTNYSIPTRVNISFTLSAILGVDAQLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPK ..::.:: ::: :: :.::.:::::..:::: :.:::::::.:::. CCDS58 NSVFNRKPFRPVTNISVPTQVNISFAMSAIL---------------DVVWDNPFISWNPE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 ECVGINKLTVLAENLWLPDIFIVESMDVDQTPSGLTAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLD :: ::.:... :.:::::::::.: ::::.::.:::::.:.::::.: :::.: :::::: CCDS58 ECEGITKMSMAAKNLWLPDIFIIELMDVDKTPKGLTAYVSNEGRIRYKKPMKVDSICNLD 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 IFYFPFDQQNCTFTFSSFLYTVDSMLLGMDKEVWEITDTSRKVIQTQGEWELLGINKATP ::::::::::::.:::::::::::::: :.::::::::.::...::.:::::::..::: CCDS58 IFYFPFDQQNCTLTFSSFLYTVDSMLLDMEKEVWEITDASRNILQTHGEWELLGLSKATA 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 KMSMGNNLYDQIMFYVAIRRRPSLYIINLLVPSSFLVAIDALSFYLPAESENRAPFKITL :.: :.::::::.::::::::::::.:::::::.:::::::::::::..: ::.:::::: CCDS58 KLSRGGNLYDQIVFYVAIRRRPSLYVINLLVPSGFLVAIDALSFYLPVKSGNRVPFKITL 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 LLGYNVFLLMMNDLLPASGTPLISVYFALCLSLMVVSLLETVFITYLLHVATTQPPPMPR :::::::::::.::::.::::::.::::::::::: :::::.:::.:::::::::::.:: CCDS58 LLGYNVFLLMMSDLLPTSGTPLIGVYFALCLSLMVGSLLETIFITHLLHVATTQPPPLPR 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 WLHSLLLHCTSPGRCCPTAPQKGNKGLGLTLTHLPGPKEPGELAGKKLGPRETEPDGGSG :::::::::.:::::::::::: ::: ::: ::::: ::: ::. :: :.: ::: CCDS58 WLHSLLLHCNSPGRCCPTAPQKENKGPGLTPTHLPGVKEPEVSAGQMPGPAEAELTGGSE 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 WTKTQL---------MELWVQFSHAMDTLLFRLYLLFMASSILTVIVLWNT ::..: .:::.:::::::..:::::::::::::.::: :::: CCDS58 WTRAQREHEAQKQHSVELWLQFSHAMDAMLFRLYLLFMASSIITVICLWNT 410 420 430 440 450 >>CCDS58871.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3 (482 aa) initn: 2013 init1: 1544 opt: 1549 Z-score: 1678.4 bits: 319.9 E(32554): 3.6e-87 Smith-Waterman score: 2122; 69.1% identity (82.0% similar) in 472 aa overlap (11-447:26-482) 10 20 30 40 pF1KE5 MEGGWPARQSALLCLTVSLLLQGRGDAFTINCSGFDQHGVDPAVF ::: :: :. ::: .:::::::: :::.::... CCDS58 MLAFILSRATPRPALGPLSYREHRVALLHLTHSMSTTGRGVTFTINCSGFGQHGADPTAL 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 QAVFDRKAFRPFTNYSIPTRVNISFTLSAILGVDAQLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPK ..::.:: ::: :: :.::.:::::..:::: :.:::::::.:::. CCDS58 NSVFNRKPFRPVTNISVPTQVNISFAMSAIL---------------DVVWDNPFISWNPE 70 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 ECVGINKLTVLAENLWLPDIFIVES--------------------------MDVDQTPSG :: ::.:... :.:::::::::.: ::::.::.: CCDS58 ECEGITKMSMAAKNLWLPDIFIIELCVSRAGQREVPSPGSHRDHSLPLGPLMDVDKTPKG 110 120 130 140 150 160 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 LTAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLDIFYFPFDQQNCTFTFSSFLYTVDSMLLGMDKEVW ::::.:.::::.: :::.: ::::::::::::::::::.:::::::::::::: :.:::: CCDS58 LTAYVSNEGRIRYKKPMKVDSICNLDIFYFPFDQQNCTLTFSSFLYTVDSMLLDMEKEVW 170 180 190 200 210 220 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 EITDTSRKVIQTQGEWELLGINKATPKMSMGNNLYDQIMFYVAIRRRPSLYIINLLVPSS ::::.::...::.:::::::..::: :.: :.::::::.::::::::::::.:::::::. CCDS58 EITDASRNILQTHGEWELLGLSKATAKLSRGGNLYDQIVFYVAIRRRPSLYVINLLVPSG 230 240 250 260 270 280 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 FLVAIDALSFYLPAESENRAPFKITLLLGYNVFLLMMNDLLPASGTPLISVYFALCLSLM :::::::::::::..: ::.:::::::::::::::::.::::.::::::.:::::::::: CCDS58 FLVAIDALSFYLPVKSGNRVPFKITLLLGYNVFLLMMSDLLPTSGTPLIGVYFALCLSLM 290 300 310 320 330 340 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 VVSLLETVFITYLLHVATTQPPPMPRWLHSLLLHCTSPGRCCPTAPQKGNKGLGLTLTHL : :::::.:::.:::::::::::.:::::::::::.:::::::::::: ::: ::: ::: CCDS58 VGSLLETIFITHLLHVATTQPPPLPRWLHSLLLHCNSPGRCCPTAPQKENKGPGLTPTHL 350 360 370 380 390 400 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 PGPKEPGELAGKKLGPRETEPDGGSGWTKTQL---------MELWVQFSHAMDTLLFRLY :: ::: ::. :: :.: ::: ::..: .:::.:::::::..::::: CCDS58 PGVKEPEVSAGQMPGPAEAELTGGSEWTRAQREHEAQKQHSVELWLQFSHAMDAMLFRLY 410 420 430 440 450 460 440 pF1KE5 LLFMASSILTVIVLWNT ::::::::.::: :::: CCDS58 LLFMASSIITVICLWNT 470 480 >>CCDS53710.1 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 (463 aa) initn: 968 init1: 667 opt: 929 Z-score: 1008.3 bits: 195.8 E(32554): 7.7e-50 Smith-Waterman score: 978; 37.6% identity (68.9% similar) in 431 aa overlap (51-446:31-458) 30 40 50 60 70 80 pF1KE5 LQGRGDAFTINCSGFDQHGVDPAVFQAVFDRKAFRPFTNYSIPTRVNISFTLSAILGVDA ::. :: .. :: :.:. . :::.:: CCDS53 MHRSFLQARRSRNTTRPALLRLSDYLLTNYRKGVRPVRDWRKPTTVSIDVIVYAILNVDE 10 20 30 40 50 60 90 100 110 120 130 140 pF1KE5 QLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPKECVGINKLTVLAENLWLPDIFIVESMDVDQTPSGL . :.::...:. : . :..:::.. .:.::.. ....:.:::.: : .:: ..:. CCDS53 KNQVLTTYIWYRQYWTDEFLQWNPEDFDNITKLSIPTDSIWVPDILINEFVDVGKSPNIP 70 80 90 100 110 120 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 TAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLDIFYFPFDQQNCTFTFSSFLYTVDSMLLGMDKEVWE .:: .:... ::..:.. :.:::. :::: :::..::.:.:.:.... ... . . : CCDS53 YVYIRHQGEVQNYKPLQVVTACSLDIYNFPFDVQNCSLTFTSWLHTIQDINISLWR-LPE 130 140 150 160 170 210 220 230 240 250 pF1KE5 ITDTSRKVIQTQGEWELLGINKATPKMSM-GNNLYDQIMFYVAIRRRPSLYIINLLVPSS . ..:.:...::::::::. ..:: ..: : .. :::.::::: .:...::.:: CCDS53 KVKSDRSVFMNQGEWELLGVLPYFREFSMESSNYYAEMKFYVVIRRRPLFYVVSLLLPSI 180 190 200 210 220 230 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 FLVAIDALSFYLPAESENRAPFKITLLLGYNVFLLMMNDLLPAS--GTPLISVYFALCLS ::...: ..:::: .: .:. :::::::::.:::....: :::. :::::.:::..:.. CCDS53 FLMVMDIVGFYLPPNSGERVSFKITLLLGYSVFLIIVSDTLPATAIGTPLIGVYFVVCMA 240 250 260 270 280 290 320 330 340 350 360 pF1KE5 LMVVSLLETVFITYLLHVATTQPPPMPRWLHSLLLHCTSPGRCC--------PTAPQKGN :.:.:: ::.::. :.: : : .: ::. :.:. . : : : .... CCDS53 LLVISLAETIFIVRLVHKQDLQQP-VPAWLRHLVLERIAWLLCLREQSTSQRPPATSQAT 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 pF1KE5 K-----GLGLTLTHLPGP----KEPGELAGKKLGPRETEPDGGSGWTKT-----QLMEL- : ..: .:. :: : : . . :::. . : . :..: CCDS53 KTDDCSAMGNHCSHMGGPQDFEKSPRDRCSPPPPPREASL-AVCGLLQELSSIRQFLEKR 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 ---------WVQFSHAMDTLLFRLYLLFMASSILTVIVLWNT :.. . ..: :::..::: . . .:...::. CCDS53 DEIREVARDWLRVGSVLDKLLFHIYLLAVLAYSITLVMLWSIWQYA 420 430 440 450 460 >>CCDS8365.2 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 (484 aa) initn: 968 init1: 667 opt: 929 Z-score: 1008.0 bits: 195.8 E(32554): 7.9e-50 Smith-Waterman score: 978; 37.6% identity (68.9% similar) in 431 aa overlap (51-446:52-479) 30 40 50 60 70 80 pF1KE5 LQGRGDAFTINCSGFDQHGVDPAVFQAVFDRKAFRPFTNYSIPTRVNISFTLSAILGVDA ::. :: .. :: :.:. . :::.:: CCDS83 TLLAQGEARRSRNTTRPALLRLSDYLLTNYRKGVRPVRDWRKPTTVSIDVIVYAILNVDE 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 pF1KE5 QLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPKECVGINKLTVLAENLWLPDIFIVESMDVDQTPSGL . :.::...:. : . :..:::.. .:.::.. ....:.:::.: : .:: ..:. CCDS83 KNQVLTTYIWYRQYWTDEFLQWNPEDFDNITKLSIPTDSIWVPDILINEFVDVGKSPNIP 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 TAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLDIFYFPFDQQNCTFTFSSFLYTVDSMLLGMDKEVWE .:: .:... ::..:.. :.:::. :::: :::..::.:.:.:.... ... . . : CCDS83 YVYIRHQGEVQNYKPLQVVTACSLDIYNFPFDVQNCSLTFTSWLHTIQDINISLWR-LPE 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 ITDTSRKVIQTQGEWELLGINKATPKMSM-GNNLYDQIMFYVAIRRRPSLYIINLLVPSS . ..:.:...::::::::. ..:: ..: : .. :::.::::: .:...::.:: CCDS83 KVKSDRSVFMNQGEWELLGVLPYFREFSMESSNYYAEMKFYVVIRRRPLFYVVSLLLPSI 210 220 230 240 250 260 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 FLVAIDALSFYLPAESENRAPFKITLLLGYNVFLLMMNDLLPAS--GTPLISVYFALCLS ::...: ..:::: .: .:. :::::::::.:::....: :::. :::::.:::..:.. CCDS83 FLMVMDIVGFYLPPNSGERVSFKITLLLGYSVFLIIVSDTLPATAIGTPLIGVYFVVCMA 270 280 290 300 310 320 320 330 340 350 360 pF1KE5 LMVVSLLETVFITYLLHVATTQPPPMPRWLHSLLLHCTSPGRCC--------PTAPQKGN :.:.:: ::.::. :.: : : .: ::. :.:. . : : : .... CCDS83 LLVISLAETIFIVRLVHKQDLQQP-VPAWLRHLVLERIAWLLCLREQSTSQRPPATSQAT 330 340 350 360 370 370 380 390 400 410 pF1KE5 K-----GLGLTLTHLPGP----KEPGELAGKKLGPRETEPDGGSGWTKT-----QLMEL- : ..: .:. :: : : . . :::. . : . :..: CCDS83 KTDDCSAMGNHCSHMGGPQDFEKSPRDRCSPPPPPREASL-AVCGLLQELSSIRQFLEKR 380 390 400 410 420 430 420 430 440 pF1KE5 ---------WVQFSHAMDTLLFRLYLLFMASSILTVIVLWNT :.. . ..: :::..::: . . .:...::. CCDS83 DEIREVARDWLRVGSVLDKLLFHIYLLAVLAYSITLVMLWSIWQYA 440 450 460 470 480 >>CCDS54685.1 HTR3D gene_id:200909|Hs108|chr3 (454 aa) initn: 1598 init1: 527 opt: 912 Z-score: 990.0 bits: 192.4 E(32554): 8e-49 Smith-Waterman score: 1483; 55.7% identity (71.3% similar) in 470 aa overlap (11-447:10-454) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MEGGWPARQSALLCLTVSLLLQGRGDAFTINCSGFDQHGVDPAVFQAVFDRKAFRPFTNY :: :. ::: : ::.. ::: :: :: ::::.:::::::::. : ::: CCDS54 MQKHSPGPPALALLSQSLLTTGNGDTLIINCPGFGQHRVDPAAFQAVFDRKAIGPVTNY 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 SIPTRVNISFTLSAILGVDAQLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPKECVGINKLTVLAENL :. :.:::::::::: . .... .. : : :..::: :: ::.: . .::: CCDS54 SVATHVNISFTLSAIWNCYSRIHTFNCH--HARPWHNQFVQWNPDECGGIKKSGMATENL 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 WLPDIFIVESMDVDQTPSGLTAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLDIFYFPFDQQNCTFTF :: :.:: :: :::::.:: : .: ...:: ..: : .. 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