FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1901, 429 aa 1>>>pF1KE1901 429 - 429 aa - 429 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0924+/-0.00095; mu= 18.4087+/- 0.057 mean_var=64.2540+/-12.866, 0's: 0 Z-trim(104.2): 39 B-trim: 47 in 1/48 Lambda= 0.160002 statistics sampled from 7759 (7797) to 7759 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16 Scan time: 2.870 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3231.1 ACTL6A gene_id:86|Hs108|chr3 ( 429) 2901 678.7 3e-195 CCDS43174.1 ACTL6A gene_id:86|Hs108|chr3 ( 387) 2612 611.9 3.4e-175 CCDS5702.1 ACTL6B gene_id:51412|Hs108|chr7 ( 426) 2505 587.2 9.9e-168 CCDS5934.1 ACTR3B gene_id:57180|Hs108|chr7 ( 418) 387 98.3 1.5e-20 CCDS33277.1 ACTR3 gene_id:10096|Hs108|chr2 ( 418) 379 96.5 5.3e-20 CCDS1578.1 ACTA1 gene_id:58|Hs108|chr1 ( 377) 366 93.5 3.9e-19 CCDS10041.1 ACTC1 gene_id:70|Hs108|chr15 ( 377) 366 93.5 3.9e-19 CCDS1930.1 ACTG2 gene_id:72|Hs108|chr2 ( 376) 363 92.8 6.2e-19 CCDS7392.1 ACTA2 gene_id:59|Hs108|chr10 ( 377) 363 92.8 6.2e-19 CCDS11782.1 ACTG1 gene_id:71|Hs108|chr17 ( 375) 361 92.3 8.6e-19 CCDS5341.1 ACTB gene_id:60|Hs108|chr7 ( 375) 361 92.3 8.6e-19 CCDS34163.1 ACTBL2 gene_id:345651|Hs108|chr5 ( 376) 352 90.2 3.6e-18 CCDS63000.1 ACTR3 gene_id:10096|Hs108|chr2 ( 367) 348 89.3 6.7e-18 CCDS59432.1 POTEJ gene_id:653781|Hs108|chr2 (1038) 348 89.6 1.6e-17 CCDS59431.1 POTEI gene_id:653269|Hs108|chr2 (1075) 348 89.6 1.6e-17 CCDS2033.1 ACTR1B gene_id:10120|Hs108|chr2 ( 376) 342 87.9 1.8e-17 CCDS34782.1 ACTR3B gene_id:57180|Hs108|chr7 ( 348) 340 87.4 2.3e-17 CCDS7536.1 ACTR1A gene_id:10121|Hs108|chr10 ( 376) 337 86.8 4e-17 CCDS46409.1 POTEF gene_id:728378|Hs108|chr2 (1075) 331 85.7 2.5e-16 CCDS46414.1 POTEE gene_id:445582|Hs108|chr2 (1075) 331 85.7 2.5e-16 CCDS3206.1 ACTRT3 gene_id:84517|Hs108|chr3 ( 372) 319 82.6 7.1e-16 CCDS45.1 ACTRT2 gene_id:140625|Hs108|chr1 ( 377) 315 81.7 1.4e-15 CCDS46307.1 ACTR2 gene_id:10097|Hs108|chr2 ( 399) 312 81.0 2.3e-15 CCDS56124.1 ACTG2 gene_id:72|Hs108|chr2 ( 333) 310 80.5 2.7e-15 CCDS14611.1 ACTRT1 gene_id:139741|Hs108|chrX ( 376) 310 80.5 3e-15 CCDS12207.1 ACTL9 gene_id:284382|Hs108|chr19 ( 416) 303 78.9 1e-14 CCDS1881.1 ACTR2 gene_id:10097|Hs108|chr2 ( 394) 300 78.2 1.5e-14 CCDS6771.1 ACTL7B gene_id:10880|Hs108|chr9 ( 415) 283 74.3 2.4e-13 CCDS6772.1 ACTL7A gene_id:10881|Hs108|chr9 ( 435) 273 72.0 1.3e-12 CCDS9074.1 ACTR6 gene_id:64431|Hs108|chr12 ( 396) 259 68.8 1.1e-11 >>CCDS3231.1 ACTL6A gene_id:86|Hs108|chr3 (429 aa) initn: 2901 init1: 2901 opt: 2901 Z-score: 3618.7 bits: 678.7 E(32554): 3e-195 Smith-Waterman score: 2901; 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83.9% identity (95.6% similar) in 429 aa overlap (1-429:1-426) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MSGGVYGGDEVGALVFDIGSYTVRAGYAGEDCPKVDFPTAIGMVVERDDGSTLMEIDGDK ::::::::::::::::::::..::::::::::::.::::..:... .. :. .:..::: CCDS57 MSGGVYGGDEVGALVFDIGSFSVRAGYAGEDCPKADFPTTVGLLAAEEGGG--LELEGDK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 GKQGGPTYYIDTNALRVPRENMEAISPLKNGMVEDWDSFQAILDHTYKMHVKSEASLHPV :.: ..::::::.:::.. :..:::::::.:::. :.:::::::. ::::: .:::: CCDS57 EKKG-KIFHIDTNALHVPRDGAEVMSPLKNGMIEDWECFRAILDHTYSKHVKSEPNLHPV 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 LMSEAPWNTRAKREKLTELMFEHYNIPAFFLCKTAVLTAFANGRSTGLILDSGATHTTAI ::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::::::::::: CCDS57 LMSEAPWNTRAKREKLTELMFEQYNIPAFFLCKTAVLTAFANGRSTGLVLDSGATHTTAI 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 PVHDGYVLQQGIVKSPLAGDFITMQCRELFQEMNIELVPPYMIASKEAVREGSPANWKRK ::::::::::::::::::::::.:::::::::: :...::::::.:: ::::.: :::.: CCDS57 PVHDGYVLQQGIVKSPLAGDFISMQCRELFQEMAIDIIPPYMIAAKEPVREGAPPNWKKK 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 EKLPQVTRSWHNYMCNCVIQDFQASVLQVSDSTYDEQVAAQMPTVHYEFPNGYNCDFGAE ::::::..:::::::: ::::::::::::::: :::::::::::::::.::::: :.::: CCDS57 EKLPQVSKSWHNYMCNEVIQDFQASVLQVSDSPYDEQVAAQMPTVHYEMPNGYNTDYGAE 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 RLKIPEGLFDPSNVKGLSGNTMLGVSHVVTTSVGMCDIDIRPGLYGSVIVAGGNTLIQSF ::.::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::.:::::.:.: CCDS57 RLRIPEGLFDPSNVKGLSGNTMLGVGHVVTTSIGMCDIDIRPGLYGSVIVTGGNTLLQGF 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 TDRLNRELSQKTPPSMRLKLIANNTTVERRFSSWIGGSILASLGTFQQMWISKQEYEEGG ::::::::::::::::::::::.:.:.::.:: ::::::::::::::::::::::::::: CCDS57 TDRLNRELSQKTPPSMRLKLIASNSTMERKFSPWIGGSILASLGTFQQMWISKQEYEEGG 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 KQCVERKCP ::::::::: CCDS57 KQCVERKCP 420 >>CCDS5934.1 ACTR3B gene_id:57180|Hs108|chr7 (418 aa) initn: 527 init1: 197 opt: 387 Z-score: 482.6 bits: 98.3 E(32554): 1.5e-20 Smith-Waterman score: 530; 27.9% identity (55.8% similar) in 441 aa overlap (15-429:9-412) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MSGGVYGGDEVGALVFDIGSYTVRAGYAGEDCPKVDFPTAIGM-----VVERDDGSTLME : : :. .. ::::. :. .:. :.. ::.. . .: CCDS59 MAGSLPPCVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIRESAKVVDQAQRRVLRG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 IDGDKGKQGGPTYYIDTNALRVPRENMEAISPLKNGMVEDWDSFQAILDHTYKMHVKSEA .: ..: .:. : . :...:..:::: .. ..... ....: CCDS59 VDD-------LDFFIGDEAIDKPTYATKW--PIRHGIIEDWDLMERFMEQVVFKYLRAEP 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 pF1KE1 SLHPVLMSEAPWNTRAKREKLTELMFEHYNIPAFFLCKTAVLTAFANGRS--------TG : ::.: : :: .:: :.:.::: .:.:.... :::. :. : :: CCDS59 EDHYFLMTEPPLNTPENREYLAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTG 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 LILDSGATHTTAIPVHDGYVLQQGIVKSPLAGDFITMQCRELFQEMNIELVPPYMIASKE ...::: : .::: .:::. . : . :.:: ::. ..:..: .. . : . . . CCDS59 IVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLREREVGIPPEQSLETAK 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 AVREGSPANWKRKEKLPQVTRSWHNYMCNCVIQDFQASVLQVSDSTYDEQVAAQMPTVHY :. ::: . :.: ....: .:. . .: .. . CCDS59 AI----------KEK--------YCYICPDIVKEFAK--YDVDPRKWIKQYTGINAINQK 230 240 250 260 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 EFPNGYNCDFGAERLKIPEGLFDPSNVKGLSGNTMLGVSHVVTTSVGMCDIDIRPGLYGS .: : : ::. :: .: : . . . : ..: :: . : ::.: :: . CCDS59 KFV----IDVGYERFLGPEIFFHPEFA---NPDFMESISDVVDEVIQNCPIDVRRPLYKN 270 280 290 300 310 350 360 370 380 390 pF1KE1 VIVAGGNTLIQSFTDRLNRELSQKTPPSMRL-------KLIANNTTVE------RRFSSW :...::.:....: ::.:.:.. . .:: .. . . :. .:.. : CCDS59 VVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRVVDARLRLSEELSGGRIKPKPVEVQVVTHHMQRYAVW 320 330 340 350 360 370 400 410 420 pF1KE1 IGGSILASLGTFQQMWISKQEYEEGGKQCVERKCP .:::.::: : :. .:..::: : . . :. : CCDS59 FGGSMLASTPEFFQVCHTKKDYEEYGPS-ICRHNPVFGVMS 380 390 400 410 >>CCDS33277.1 ACTR3 gene_id:10096|Hs108|chr2 (418 aa) initn: 499 init1: 188 opt: 379 Z-score: 472.6 bits: 96.5 E(32554): 5.3e-20 Smith-Waterman score: 514; 27.2% identity (55.7% similar) in 438 aa overlap (13-429:7-412) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MSGGVYGGDEVGALVFDIGSYTVRAGYAGEDCPKVDFPTAIGMVVERDDGSTLMEIDGDK : : : :. .. ::::. :. .:. :. . : . . : CCDS33 MAGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIA-IKESAKVGDQAQRRVMK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 GKQGGPTYYIDTNALRVPRENMEAISPLKNGMVEDWDSFQAILDHTYKMHVKSEASLHPV : . ..: .:.. : . :...:.::::: .. ..... ....: : CCDS33 GVDDLD-FFIGDEAIEKPTYATKW--PIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYF 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE1 LMSEAPWNTRAKREKLTELMFEHYNIPAFFLCKTAVLTAFANGRS--------TGLILDS :..: : :: .:: .:.::: .:.:.... :::. :. : :: ..:: CCDS33 LLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 GATHTTAIPVHDGYVLQQGIVKSPLAGDFITMQCRELFQEMNIELVPPYMIASKEAVREG : : .::: .:::. . : . :.:: ::. ..:... .. . : . . .::.: CCDS33 GDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKER 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 SPANWKRKEKLPQVTRSWHNYMCNCVIQDFQASVLQVSDSTYDEQVAAQMPTVHYEFPNG ..:.: ....:. ... : . .: .. . :: CCDS33 ------------------YSYVCPDLVKEFNK--YDTDGSKWIKQYTGINAISKKEF--- 240 250 260 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 YNCDFGAERLKIPEGLFDPSNVKGLSGNTMLGVSHVVTTSVGMCDIDIRPGLYGSVIVAG . : : ::. :: .: : . . . .:.:: . : ::.: :: .....: CCDS33 -SIDVGYERFLGPEIFFHPEFA---NPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSG 270 280 290 300 310 320 360 370 380 390 pF1KE1 GNTLIQSFTDRLNRELSQKTPPSMRL-------KLIANNTTVE------RRFSSWIGGSI :.:....: ::.:.:.. . ..: .: . :. .:.. :.:::. CCDS33 GSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSM 330 340 350 360 370 380 400 410 420 pF1KE1 LASLGTFQQMWISKQEYEEGGKQCVERKCP ::: : :. .:..::: : . . :. : CCDS33 LASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPS-ICRHNPVFGVMS 390 400 410 >>CCDS1578.1 ACTA1 gene_id:58|Hs108|chr1 (377 aa) initn: 887 init1: 358 opt: 366 Z-score: 457.1 bits: 93.5 E(32554): 3.9e-19 Smith-Waterman score: 856; 36.7% identity (63.6% similar) in 420 aa overlap (9-428:5-376) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MSGGVYGGDEVGALVFDIGSYTVRAGYAGEDCPKVDFPTAIGMVVERDDGSTLMEIDGDK ::. ::: : :: :.::.::.: :.. ::. .: : .: .: :.: CCDS15 MCDEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR--PRHQG--VMVGMGQK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 GKQGGPTYYIDTNALRVPRENMEAISPLKNGMVEDWDSFQAILDHTYKMHVKSEASLHPV . :. .: . : . :...:.. .::... : ::. ... ::. CCDS15 DS------YVGDEA-QSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPT 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 LMSEAPWNTRAKREKLTELMFEHYNIPAFFLCKTAVLTAFANGRSTGLILDSGATHTTAI :..::: : .:.:::.:..::: .:.::... :::. .:.::.::..:::: : . CCDS15 LLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNV 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 PVHDGYVLQQGIVKSPLAGDFITMQCRELFQEMNIELVPPYMIASKEAVREGSPANWKRK :...::.: ..:.. ::: .: ... : . .: : .: ::. : CCDS15 PIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFV---TTAEREIVRDI-------K 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 EKLPQVTRSWHNYMCNCVIQDFQASVLQVSDSTYDEQVAAQMPTVHYEFPNGYNCDFGAE ::: : : ::. . ...:. :. ::.:.: .: : CCDS15 EKL-----------CY-VALDFENEMATAASSSSLEK--------SYELPDGQVITIGNE 220 230 240 250 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 RLKIPEGLFDPSNVKGLSGNTMLGVSHVVTTSVGMCDIDIRPGLYGSVIVAGGNTLIQSF :.. :: ::.:: . : :. ... .:. :::::: ::.. ...::.:. .. 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CCDS19 DS------YVGDEA-QSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHSFYNELRVAPEEHPT 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 LMSEAPWNTRAKREKLTELMFEHYNIPAFFLCKTAVLTAFANGRSTGLILDSGATHTTAI :..::: : .:.:::.:..::: .:.::... :::. .:.::.::..:::: : . CCDS19 LLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNV 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 PVHDGYVLQQGIVKSPLAGDFITMQCRELFQEMNIELVPPYMIASKEAVREGSPANWKRK :...::.: ..:.. ::: .: ... : . .: : .: ::. : CCDS19 PIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFV---TTAEREIVRDI-------K 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 EKLPQVTRSWHNYMCNCVIQDFQASVLQVSDSTYDEQVAAQMPTVHYEFPNGYNCDFGAE ::: : : ::. . ...:. :. ::.:.: .: : CCDS19 EKL-----------CY-VALDFENEMATAASSSSLEK--------SYELPDGQVITIGNE 220 230 240 250 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 RLKIPEGLFDPSNVKGLSGNTMLGVSHVVTTSVGMCDIDIRPGLYGSVIVAGGNTLIQSF :.. :: ::.:: . : :. ... .:. :::::: ::.. ...::.:. .. 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CCDS73 DS------YVGDEA-QSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHSFYNELRVAPEEHPT 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 LMSEAPWNTRAKREKLTELMFEHYNIPAFFLCKTAVLTAFANGRSTGLILDSGATHTTAI :..::: : .:.:::.:..::: .:.::... :::. .:.::.::..:::: : . CCDS73 LLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNV 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 PVHDGYVLQQGIVKSPLAGDFITMQCRELFQEMNIELVPPYMIASKEAVREGSPANWKRK :...::.: ..:.. ::: .: ... : . .: : .: ::. : CCDS73 PIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTT---AEREIVRDI-------K 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 EKLPQVTRSWHNYMCNCVIQDFQASVLQVSDSTYDEQVAAQMPTVHYEFPNGYNCDFGAE ::: : : ::. . ...:. :. ::.:.: .: : CCDS73 EKL-----------CY-VALDFENEMATAASSSSLEK--------SYELPDGQVITIGNE 220 230 240 250 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 RLKIPEGLFDPSNVKGLSGNTMLGVSHVVTTSVGMCDIDIRPGLYGSVIVAGGNTLIQSF :.. :: ::.:: . : :. ... .:. :::::: ::.. ...::.:. .. 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