FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2084, 759 aa 1>>>pF1KE2084 759 - 759 aa - 759 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2799+/-0.00041; mu= 21.3325+/- 0.026 mean_var=79.6763+/-16.367, 0's: 0 Z-trim(112.1): 95 B-trim: 562 in 2/54 Lambda= 0.143684 statistics sampled from 20838 (20951) to 20838 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.6), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16 Scan time: 9.580 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003295 (OMIM: 602343) short transient receptor ( 759) 5030 1053.0 0 XP_016862611 (OMIM: 602343) PREDICTED: short trans ( 709) 4683 981.0 0 XP_005247795 (OMIM: 602343) PREDICTED: short trans ( 695) 4345 911.0 0 XP_016862610 (OMIM: 602343) PREDICTED: short trans ( 732) 4345 911.0 0 NP_001238774 (OMIM: 602343) short transient recept ( 793) 4345 911.0 0 XP_005247796 (OMIM: 602343) PREDICTED: short trans ( 661) 4339 909.7 0 NP_001129427 (OMIM: 603651) short transient recept ( 893) 2019 428.9 4.5e-119 NP_057263 (OMIM: 603651) short transient receptor ( 977) 2019 428.9 4.8e-119 NP_003297 (OMIM: 603651) short transient receptor ( 982) 2007 426.4 2.7e-118 NP_036603 (OMIM: 300334) short transient receptor ( 973) 1998 424.6 9.8e-118 XP_016885263 (OMIM: 300334) PREDICTED: short trans ( 973) 1998 424.6 9.8e-118 NP_001129429 (OMIM: 603651) short transient recept ( 836) 1946 413.7 1.5e-114 NP_001129428 (OMIM: 603651) short transient recept ( 828) 1656 353.6 1.9e-96 NP_001129430 (OMIM: 603651) short transient recept ( 804) 1397 299.9 2.7e-80 XP_016876213 (OMIM: 603651) PREDICTED: short trans ( 557) 999 217.3 1.4e-55 XP_011533508 (OMIM: 603651) PREDICTED: short trans ( 562) 987 214.8 7.9e-55 XP_016876212 (OMIM: 603651) PREDICTED: short trans ( 562) 987 214.8 7.9e-55 NP_003296 (OMIM: 602345,616410) short transient re ( 848) 747 165.2 1e-39 XP_016864068 (OMIM: 602345,616410) PREDICTED: shor ( 893) 747 165.2 1.1e-39 XP_011530520 (OMIM: 602345,616410) PREDICTED: shor ( 920) 747 165.2 1.1e-39 NP_001124170 (OMIM: 602345,616410) short transient ( 921) 747 165.2 1.1e-39 XP_016864067 (OMIM: 602345,616410) PREDICTED: shor ( 936) 747 165.2 1.1e-39 XP_011530519 (OMIM: 602345,616410) PREDICTED: shor ( 937) 747 165.2 1.1e-39 XP_016873711 (OMIM: 603652,603965) PREDICTED: shor ( 845) 737 163.1 4.3e-39 XP_011541270 (OMIM: 603652,603965) PREDICTED: shor ( 876) 737 163.1 4.4e-39 NP_004612 (OMIM: 603652,603965) short transient re ( 931) 737 163.2 4.6e-39 XP_016873710 (OMIM: 603652,603965) PREDICTED: shor ( 815) 390 91.2 1.9e-17 NP_001307280 (OMIM: 603749) transient receptor pot (1469) 261 64.6 3.3e-09 XP_016883946 (OMIM: 603749) PREDICTED: transient r (1499) 261 64.7 3.3e-09 NP_003298 (OMIM: 603749) transient receptor potent (1503) 261 64.7 3.4e-09 XP_005261228 (OMIM: 603749) PREDICTED: transient r (1503) 261 64.7 3.4e-09 XP_016883945 (OMIM: 603749) PREDICTED: transient r (1533) 261 64.7 3.4e-09 XP_011528038 (OMIM: 603749) PREDICTED: transient r (1533) 261 64.7 3.4e-09 NP_001307279 (OMIM: 603749) transient receptor pot (1553) 261 64.7 3.4e-09 NP_002411 (OMIM: 603576,613216) transient receptor (1603) 193 50.6 6.2e-05 NP_001238953 (OMIM: 603576,613216) transient recep (1625) 193 50.6 6.2e-05 NP_001238949 (OMIM: 603576,613216) transient recep (1642) 193 50.6 6.3e-05 NP_061197 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 184 48.5 0.00014 NP_542437 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 184 48.5 0.00014 NP_542436 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 184 48.5 0.00014 NP_542435 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 184 48.5 0.00014 NP_001308211 (OMIM: 604559,606936) transient recep ( 678) 167 44.9 0.0013 XP_005259074 (OMIM: 604559,606936) PREDICTED: tran ( 785) 167 44.9 0.0015 NP_001308214 (OMIM: 604559,606936) transient recep ( 860) 167 45.0 0.0016 NP_001308212 (OMIM: 604559,606936) transient recep (1040) 167 45.0 0.0019 NP_001182156 (OMIM: 604559,606936) transient recep (1069) 167 45.1 0.0019 NP_001308210 (OMIM: 604559,606936) transient recep (1099) 167 45.1 0.0019 NP_060106 (OMIM: 604559,606936) transient receptor (1214) 167 45.1 0.0021 XP_016870649 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1172) 162 44.0 0.0042 XP_016870648 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1184) 162 44.0 0.0042 >>NP_003295 (OMIM: 602343) short transient receptor pote (759 aa) initn: 5030 init1: 5030 opt: 5030 Z-score: 5632.9 bits: 1053.0 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5030; 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