FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9426, 797 aa 1>>>pF1KE9426 797 - 797 aa - 797 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1993+/-0.00141; mu= 15.7276+/- 0.083 mean_var=89.1968+/-18.193, 0's: 0 Z-trim(100.0): 106 B-trim: 13 in 1/47 Lambda= 0.135800 statistics sampled from 5827 (5934) to 5827 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.519), E-opt: 0.2 (0.182), width: 16 Scan time: 3.060 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS2938.1 ADGRG7 gene_id:84873|Hs108|chr3 ( 797) 5171 1024.5 0 CCDS77778.1 ADGRG7 gene_id:84873|Hs108|chr3 ( 502) 3150 628.4 8.8e-180 CCDS47491.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1193) 318 73.8 1.9e-12 CCDS47490.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1221) 318 73.8 2e-12 CCDS55064.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1222) 318 73.8 2e-12 CCDS47489.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1250) 318 73.8 2e-12 CCDS55379.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 966) 292 68.6 5.5e-11 CCDS55377.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 987) 292 68.6 5.6e-11 CCDS55376.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 993) 292 68.6 5.6e-11 CCDS43921.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 995) 292 68.6 5.7e-11 CCDS55378.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1001) 292 68.6 5.7e-11 CCDS43922.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1003) 292 68.6 5.7e-11 CCDS14191.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1014) 292 68.6 5.7e-11 CCDS43923.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1017) 292 68.6 5.8e-11 >>CCDS2938.1 ADGRG7 gene_id:84873|Hs108|chr3 (797 aa) initn: 5171 init1: 5171 opt: 5171 Z-score: 5478.0 bits: 1024.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5171; 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CCDS47 -FYVTCAGYFGVMFFLNIAMFIVVMVQICGRNGKRSNRTLREEVLRNLRSVVSLTFLLGM 1000 1010 1020 1030 1040 1050 690 700 710 720 730 740 pF1KE9 TWILAYLMLVNDDSIRIVFSYIFCLFNTTQGLQIFILYTVRTKVFQSEASKVLMLLSSIG :: .:.. . : : :.: .::. ::: :::.. . . :.. 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CCDS47 CPDKPGFSASRICFYNATNPLVTYWGPVDISNC----------LKEA----NEVANQILN 550 560 570 580 590 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 LTSDANKLTAENITSATRVVGQIFNTSRNASPEAKKVAIVTVSQLLDASEDAFQRVAATA ::.:...::. :::. .. : .: : .: . .. . :..:..:.. . . . CCDS47 LTADGQNLTSANITNIVEQVKRIVNKEENIDITLGSTLMNIFSNILSSSDSDLLE----S 600 610 620 630 640 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 NDDALTTLIEQMETYSL-SLGNQSVVEPNIAIQ-SANFSSENAVGPSNVRFSVQKGASSS ...:: :. : .: : .. ... :.:.. :. . . ::. :: ::. ... CCDS47 SSEALKTIDELAFKIDLNSTSHVNITTRNLALSVSSLLPGTNAI--SN--FSIGLPSNNE 650 660 670 680 690 700 290 300 310 320 330 pF1KE9 LVSSSTFIHTNVDGLNPDAQTEL--QVLLNMTKNYT---KTCGFVVYQNDKLFQSKTFTA . : .:: : :.. : ..: :.. . . . :. ... :::. CCDS47 SYFQMDFESGQVD---PLASVILPPNLLENLSPEDSVLVRRAQFTFFNKTGLFQDVGPQR 710 720 730 740 750 760 340 350 360 370 380 390 pF1KE9 KSDFSQKIISSKTDENEQDQSASVDMVFSPKYNQKEFQLYSYACVYWNLSAKD----WDT :. : . : . . :. . :.. .. .: ... :..:.:. . :.: CCDS47 KTLVSYVMACSIGNITIQNLKDPVQIKIKHTRTQ---EVHHPICAFWDLNKNKSFGGWNT 770 780 790 800 810 400 410 420 430 440 pF1KE9 YGCQKDKGTDGFLR-CRCNHTTNFAVLMTFRK-----DYQYPKSLDILSNVGCALSVTGL :: . .:. : ::: :.:.::: . . : . : : ..: .::..:. 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CCDS47 -FYVTCAGYFGVMFFLNIAMFIVVMVQICGRNGKRSNRTLREEVLRNLRSVVSLTFLLGM 1030 1040 1050 1060 1070 690 700 710 720 730 740 pF1KE9 TWILAYLMLVNDDSIRIVFSYIFCLFNTTQGLQIFILYTVRTKVFQSEASKVLMLLSSIG :: .:.. . : : :.: .::. ::: :::.. . . :.. CCDS47 TWGFAFFAW---GPLNIPFMYLFSIFNSLQGLFIFIFHCAMKENVQKQWRQHLCCGRFRL 1080 1090 1100 1110 1120 1130 750 760 770 780 790 pF1KE9 RRKSLPSVTRPRLRVKMYNFLRSLPTLHERFRLLETSPSTEEITLSESDNAKESI CCDS47 ADNSDWSKTATNIIKKSSDNLGKSLSSSSIGSNSTYLTSKSKSSSTTYFKRNSHTDNVSY 1140 1150 1160 1170 1180 1190 >>CCDS55064.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1222 aa) initn: 405 init1: 228 opt: 318 Z-score: 336.7 bits: 73.8 E(32554): 2e-12 Smith-Waterman score: 651; 25.7% identity (56.3% similar) in 678 aa overlap (82-730:490-1096) 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 CRNGGTWENGRCICTEEWKGLRCTIANFCENSTYMGFTFA-RIPVGRYGPSLQTCGKDTP : .: .: . : : : ::.: : CCDS55 NNTNLEGKIIQQKLLKNNESLDEGLRLHTVNVRQLGHCLAMEEPKGYYWPSIQPSEYVLP 460 470 480 490 500 510 120 130 140 150 160 pF1KE9 NAGNP--MAVRLCSLSLYGEIELQ--KVTIGNCNENLETLEKQVKDVTAPLNNISSEVQI .: : :.: . . . : :.:: .:.. :...... CCDS55 CPDKPGFSASRICFYNATNPLVTYWGPVDISNC----------LKEA----NEVANQILN 520 530 540 550 560 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 LTSDANKLTAENITSATRVVGQIFNTSRNASPEAKKVAIVTVSQLLDASEDAFQRVAATA ::.:...::. :::. .. : .: : .: . .. . :..:..:.. . . . CCDS55 LTADGQNLTSANITNIVEQVKRIVNKEENIDITLGSTLMNIFSNILSSSDSDLLE----S 570 580 590 600 610 620 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 NDDALTTLIEQMETYSL-SLGNQSVVEPNIAIQ-SANFSSENAVGPSNVRFSVQKGASSS ...:: :. : .: : .. ... :.:.. :. . . ::. :: ::. ... CCDS55 SSEALKTIDELAFKIDLNSTSHVNITTRNLALSVSSLLPGTNAI--SN--FSIGLPSNNE 630 640 650 660 670 290 300 310 320 330 pF1KE9 LVSSSTFIHTNVDGLNPDAQTEL--QVLLNMTKNYT---KTCGFVVYQNDKLFQSKTFTA . : .:: : :.. : ..: :.. . . . :. ... :::. 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CCDS55 -FYVTCAGYFGVMFFLNIAMFIVVMVQICGRNGKRSNRTLREEVLRNLRSVVSLTFLLGM 1000 1010 1020 1030 1040 1050 690 700 710 720 730 740 pF1KE9 TWILAYLMLVNDDSIRIVFSYIFCLFNTTQGLQIFILYTVRTKVFQSEASKVLMLLSSIG :: .:.. . : : :.: .::. ::: :::.. . . :.. 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CCDS47 CPDKPGFSASRICFYNATNPLVTYWGPVDISNC----------LKEA----NEVANQILN 550 560 570 580 590 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 LTSDANKLTAENITSATRVVGQIFNTSRNASPEAKKVAIVTVSQLLDASEDAFQRVAATA ::.:...::. :::. .. : .: : .: . .. . :..:..:.. . . . CCDS47 LTADGQNLTSANITNIVEQVKRIVNKEENIDITLGSTLMNIFSNILSSSDSDLLE----S 600 610 620 630 640 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 NDDALTTLIEQMETYSL-SLGNQSVVEPNIAIQ-SANFSSENAVGPSNVRFSVQKGASSS ...:: :. : .: : .. ... :.:.. :. . . ::. :: ::. ... CCDS47 SSEALKTIDELAFKIDLNSTSHVNITTRNLALSVSSLLPGTNAI--SN--FSIGLPSNNE 650 660 670 680 690 700 290 300 310 320 330 pF1KE9 LVSSSTFIHTNVDGLNPDAQTEL--QVLLNMTKNYT---KTCGFVVYQNDKLFQSKTFTA . : .:: : :.. : ..: :.. . . . :. ... :::. CCDS47 SYFQMDFESGQVD---PLASVILPPNLLENLSPEDSVLVRRAQFTFFNKTGLFQDVGPQR 710 720 730 740 750 760 340 350 360 370 380 390 pF1KE9 KSDFSQKIISSKTDENEQDQSASVDMVFSPKYNQKEFQLYSYACVYWNLSAKD----WDT :. : . : . . :. . :.. .. .: ... :..:.:. . :.: CCDS47 KTLVSYVMACSIGNITIQNLKDPVQIKIKHTRTQ---EVHHPICAFWDLNKNKSFGGWNT 770 780 790 800 810 400 410 420 430 440 pF1KE9 YGCQKDKGTDGFLR-CRCNHTTNFAVLMTFRK-----DYQYPKSLDILSNVGCALSVTGL :: . .:. : ::: :.:.::: . . : . : : ..: .::..:. CCDS47 SGCVAHRDSDASETVCLCNHFTHFGVLMDLPRSASQLDARNTKVLTFISYIGCGISAIFS 820 830 840 850 860 870 450 460 470 480 490 500 pF1KE9 ALTVIFQIVTRKVRKTSVTWVLVNLCISMLIFNLLFVFGIENSNKNLQTSDGDINNIDFD : :.. .. .:.:. . .:.:: ..:..::::.. :: :.... : CCDS47 AATLLTYVAFEKLRRDYPSKILMNLSTALLFLNLLFLL------------DGWITSFNVD 880 890 900 910 920 510 520 530 540 550 560 pF1KE9 NNDIPRTDTINIPNPMCTAIAALLHYFLLVTFTWNALSAAQLYYLLIRTMKPLPRHFILF . .: :.:.:::.:::.:::: .: : ..: :..... :..:: CCDS47 G--------------LCIAVAVLLHFFLLATFTWMGLEAIHMYIALVKVFNTYIRRYILK 930 940 950 960 970 570 580 590 600 610 620 pF1KE9 ISLIGWGVPAIVVAITVGVIYSQNGNNPQWELDYRQEK---ICWLAIPEPNGVIKSPLLW . .::::.::.::.. :. :.:.:. . .: .:: .:: :..:.. CCDS47 FCIIGWGLPALVVSV---VLASRNNNEVYGKESYGKEKGDEFCW---------IQDPVI- 980 990 1000 1010 1020 630 640 650 660 670 680 pF1KE9 SFIVPVT----IILISNVVMFITISIKVLWKNNQNLTSTKKVSSMKKIVSTLSVAVVFGI : : . .... :..:::.. ... .:.. . : . .... :..:.. ..:. CCDS47 -FYVTCAGYFGVMFFLNIAMFIVVMVQICGRNGKRSNRTLREEVLRNLRSVVSLTFLLGM 1030 1040 1050 1060 1070 690 700 710 720 730 740 pF1KE9 TWILAYLMLVNDDSIRIVFSYIFCLFNTTQGLQIFILYTVRTKVFQSEASKVLMLLSSIG :: .:.. . : : :.: .::. ::: :::.. . . :.. CCDS47 TWGFAFFAW---GPLNIPFMYLFSIFNSLQGLFIFIFHCAMKENVQKQWRQHLCCGRFRL 1080 1090 1100 1110 1120 1130 750 760 770 780 790 pF1KE9 RRKSLPSVTRPRLRVKMYNFLRSLPTLHERFRLLETSPSTEEITLSESDNAKESI CCDS47 ADNSDWSKTATNIIKKSSDNLGKSLSSSSIGSNSTYLTSKSKSSSTTYFKRNSHTDSASM 1140 1150 1160 1170 1180 1190 >>CCDS55379.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (966 aa) initn: 448 init1: 216 opt: 292 Z-score: 310.7 bits: 68.6 E(32554): 5.5e-11 Smith-Waterman score: 599; 24.4% identity (57.8% similar) in 586 aa overlap (153-722:350-881) 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 LSLYGEIELQKVTIGNCNENLETLEKQVKDVTAPLN-NISSEVQILTSDANKLTAENITS :.:: : : .: . :. .: . .. . CCDS55 PQSETISSPMPQTHVSGTPPPVKASFSSPTVSAPANVNTTSAPPVQTDIVNTSSISDLEN 320 330 340 350 360 370 190 200 210 220 230 pF1KE9 ATRVVGQIFNTSRNASPEAKKVAIVTVSQLLDASEDAF----QRVAATANDDALTTLIEQ . . . .. . . :. : ::.:: . : . ::. ...: .: . CCDS55 QVLQMEKALSLG-SLEPNLAGEMINQVSRLLHSPPDMLAPLAQRLLKVVDDIGLQL---N 380 390 400 410 420 430 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 METYSLSLGNQSVVEPNIAIQSANFSSENAVG--PSNVRFSVQKGASSSLVSSSTFIHTN . . ..:: . :.. : .....:.. . :. :.:.. :.. : . ... :. . CCDS55 FSNTTISLTSPSLALAVIRVNASSFNTTTFVAQDPANLQVSLETQAPENSIGTITLPSSL 440 450 460 470 480 490 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 VDGLNPDAQTELQVLLNMTKNYTKTCGFVVYQNDKLFQSKTFTAKSDFSQKIISSKTDEN ...: : . :: .. : ... :::. .. : .: : :: .. . 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CCDS55 PQSETISSPMPQTHVSGTPPPVKASFSSPTVSAPANVNTTSAPPVQTDIVNTSSISDLEN 290 300 310 320 330 340 190 200 210 220 230 pF1KE9 ATRVVGQIFNTSRNASPEAKKVAIVTVSQLLDASEDAF----QRVAATANDDALTTLIEQ . . . .. . . :. : ::.:: . : . ::. ...: .: . CCDS55 QVLQMEKALSLG-SLEPNLAGEMINQVSRLLHSPPDMLAPLAQRLLKVVDDIGLQL---N 350 360 370 380 390 400 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 METYSLSLGNQSVVEPNIAIQSANFSSENAVG--PSNVRFSVQKGASSSLVSSSTFIHTN . . ..:: . :.. : .....:.. . :. :.:.. :.. : . ... :. . CCDS55 FSNTTISLTSPSLALAVIRVNASSFNTTTFVAQDPANLQVSLETQAPENSIGTITLPSSL 410 420 430 440 450 460 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 VDGLNPDAQTELQVLLNMTKNYTKTCGFVVYQNDKLFQSKTFTAKSDFSQKIISSKTDEN ...: : . :: .. : ... :::. .. : .: : :: .. . CCDS55 MNNL-PAHDMEL----------ASRVQFNFFETPALFQDPSLENLSLISYVISSSVANLT 470 480 490 500 510 360 370 380 390 400 410 pF1KE9 EQDQSASVDMVFSPKYNQKEFQLYSYACVYWNLSAKD----WDTYGCQ-KDKGTDGFLRC .. . .: .... . : .. .: . ::.:.:. . :. ::. ::. . . : CCDS55 VRNLTRNVTVTLK-HINPSQDEL-TVRCVFWDLGRNGGRGGWSDNGCSVKDRRLNETI-C 520 530 540 550 560 570 420 430 440 450 460 pF1KE9 RCNHTTNFAVLMTFRKDYQYPK---SLDILSNVGCALSVTGLALTVIFQIVTRKVRKTSV :.: :.:.::. . . : .: ... .::.:: :..:.. :. .:.:. CCDS55 TCSHLTSFGVLLDLSRTSVLPAQMMALTFITYIGCGLSSIFLSVTLVTYIAFEKIRRDYP 580 590 600 610 620 630 470 480 490 500 510 520 pF1KE9 TWVLVNLCISMLIFNLLFVFGIENSNKNLQTSDGDINNIDFDNNDIPRTDTINIPNPMCT . .:..:: ..:..::.:.. .: : .: .: CCDS55 SKILIQLCAALLLLNLVFLL---DSWIALYKMQG-----------------------LCI 640 650 660 530 540 550 560 570 580 pF1KE9 AIAALLHYFLLVTFTWNALSAAQLYYLLIRTMKPLPRHFILFISLIGWGVPAIVVAITVG ..:..:::::::.::: .: : ..: :..... :..:: . ..::::::.::.: . CCDS55 SVAVFLHYFLLVSFTWMGLEAFHMYLALVKVFNTYIRKYILKFCIVGWGVPAVVVTIILT 670 680 690 700 710 720 590 600 610 620 630 640 pF1KE9 VIYSQNGNNPQWEL-DYRQEKICWLAIPEPNGVIKSPLLWSFIVPVTIILISNVVMFITI . .. : . .. . . .::. . :.:. .. : .:.. :: :::.. 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