Result of FASTA (omim) for pFN21AE6468
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE6468, 592 aa
  1>>>pF1KE6468 592 - 592 aa - 592 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6548+/-0.000563; mu= 22.7561+/- 0.034
 mean_var=70.1251+/-14.881, 0's: 0 Z-trim(106.1): 98  B-trim: 76 in 1/48
 Lambda= 0.153157
 statistics sampled from 14176 (14275) to 14176 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.489), E-opt: 0.2 (0.167), width:  16
 Scan time:  5.820

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_064593 (OMIM: 138500,242600,605616) sodium- and ( 592) 3938 880.4       0
XP_011532149 (OMIM: 138500,242600,605616) PREDICTE ( 493) 3267 732.0 1.1e-210
NP_071800 (OMIM: 138500,242600,605616) sodium- and ( 555) 2350 529.5 1.2e-149
XP_011532150 (OMIM: 138500,242600,605616) PREDICTE ( 321) 2133 481.3 2.1e-135
NP_872438 (OMIM: 610300) sodium-dependent neutral  ( 628) 2046 462.3 2.1e-129
NP_001003841 (OMIM: 138500,234500,242600,608893) s ( 634) 2016 455.7 2.1e-127
NP_877499 (OMIM: 607971) sodium-dependent neutral  ( 730) 1593 362.3 3.2e-99
XP_006710706 (OMIM: 610299,616269) PREDICTED: sodi ( 727) 1528 347.9 6.6e-95
NP_001010898 (OMIM: 610299,616269) sodium-dependen ( 727) 1528 347.9 6.6e-95
NP_001139807 (OMIM: 607971) sodium-dependent neutr ( 623) 1351 308.8 3.5e-83
XP_011536827 (OMIM: 607971) PREDICTED: sodium-depe ( 554) 1265 289.7 1.7e-77
NP_054756 (OMIM: 607972) orphan sodium- and chlori ( 736) 1264 289.6 2.4e-77
XP_005258877 (OMIM: 607972) PREDICTED: orphan sodi ( 736) 1264 289.6 2.4e-77
XP_006723231 (OMIM: 607972) PREDICTED: orphan sodi ( 736) 1264 289.6 2.4e-77
XP_011525162 (OMIM: 607972) PREDICTED: orphan sodi ( 758) 1264 289.6 2.5e-77
XP_016882201 (OMIM: 607972) PREDICTED: orphan sodi ( 818) 1264 289.7 2.6e-77
XP_011525163 (OMIM: 607972) PREDICTED: orphan sodi ( 589) 1144 263.0   2e-69
XP_016862561 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599)  975 225.7 3.5e-58
XP_016862560 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599)  975 225.7 3.5e-58
XP_005265468 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599)  975 225.7 3.5e-58
XP_006713369 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599)  975 225.7 3.5e-58
XP_011532329 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599)  975 225.7 3.5e-58
XP_011532327 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599)  975 225.7 3.5e-58
NP_003033 (OMIM: 137165,616421) sodium- and chlori ( 599)  975 225.7 3.5e-58
XP_005265467 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599)  975 225.7 3.5e-58
NP_060527 (OMIM: 607971) sodium-dependent neutral  ( 289)  838 195.1 2.7e-49
XP_011525161 (OMIM: 607972) PREDICTED: orphan sodi ( 781)  623 148.0 1.1e-34
NP_005620 (OMIM: 300036,300352) sodium- and chlori ( 635)  580 138.4 6.9e-32
NP_001136278 (OMIM: 300036,300352) sodium- and chl ( 520)  578 137.9 8.1e-32
NP_001177926 (OMIM: 615097) sodium- and chloride-d ( 510)  570 136.1 2.7e-31
XP_006719068 (OMIM: 603080) PREDICTED: sodium- and ( 570)  566 135.3 5.4e-31
XP_005253805 (OMIM: 603080) PREDICTED: sodium- and ( 571)  566 135.3 5.4e-31
XP_005253804 (OMIM: 603080) PREDICTED: sodium- and ( 610)  566 135.3 5.7e-31
NP_001193860 (OMIM: 603080) sodium- and chloride-d ( 614)  566 135.3 5.7e-31
XP_011519312 (OMIM: 603080) PREDICTED: sodium- and ( 614)  566 135.3 5.7e-31
NP_001116319 (OMIM: 603080) sodium- and chloride-d ( 614)  566 135.3 5.7e-31
NP_001116320 (OMIM: 603080) sodium- and chloride-d ( 614)  566 135.3 5.7e-31
NP_003035 (OMIM: 603080) sodium- and chloride-depe ( 614)  566 135.3 5.7e-31
XP_016875333 (OMIM: 615097) PREDICTED: sodium- and ( 394)  556 132.9 1.9e-30
NP_057699 (OMIM: 615097) sodium- and chloride-depe ( 602)  556 133.1 2.6e-30
XP_011519314 (OMIM: 615097) PREDICTED: sodium- and ( 483)  552 132.1 4.1e-30
XP_011519315 (OMIM: 615097) PREDICTED: sodium- and ( 440)  550 131.6 5.2e-30
XP_011519316 (OMIM: 615097) PREDICTED: sodium- and ( 440)  550 131.6 5.2e-30
XP_016875330 (OMIM: 603080) PREDICTED: sodium- and ( 426)  544 130.3 1.3e-29
XP_016862562 (OMIM: 607952) PREDICTED: sodium- and ( 458)  537 128.8 3.9e-29
XP_016874034 (OMIM: 604159,614618) PREDICTED: sodi ( 450)  532 127.7 8.4e-29
XP_016874033 (OMIM: 604159,614618) PREDICTED: sodi ( 505)  532 127.7 9.1e-29
XP_016865259 (OMIM: 606205) PREDICTED: sodium-depe ( 555)  532 127.8 9.7e-29
NP_001305298 (OMIM: 604159,614618) sodium- and chl ( 563)  532 127.8 9.8e-29
NP_055043 (OMIM: 606205) sodium-dependent proline  ( 636)  532 127.8 1.1e-28


>>NP_064593 (OMIM: 138500,242600,605616) sodium- and chl  (592 aa)
 initn: 3938 init1: 3938 opt: 3938  Z-score: 4703.9  bits: 880.4 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3938; 100.0% identity (100.0% similar) in 592 aa overlap (1-592:1-592)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MEKARPLWANSLQFVFACISYAVGLGNVWRFPYLCQMYGGGSFLVPYIIMLIVEGMPLLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 MEKARPLWANSLQFVFACISYAVGLGNVWRFPYLCQMYGGGSFLVPYIIMLIVEGMPLLY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 LELAVGQRMRQGSIGAWRTISPYLSGVGVASVVVSFFLSMYYNVINAWAFWYLFHSFQDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 LELAVGQRMRQGSIGAWRTISPYLSGVGVASVVVSFFLSMYYNVINAWAFWYLFHSFQDP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 LPWSVCPLNGNHTGYDEECEKASSTQYFWYRKTLNISPSLQENGGVQWEPALCLLLAWLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 LPWSVCPLNGNHTGYDEECEKASSTQYFWYRKTLNISPSLQENGGVQWEPALCLLLAWLV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 VYLCILRGTESTGKVVYFTASLPYCVLIIYLIRGLTLHGATNGLMYMFTPKIEQLANPKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 VYLCILRGTESTGKVVYFTASLPYCVLIIYLIRGLTLHGATNGLMYMFTPKIEQLANPKA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 WINAATQIFFSLGLGFGSLIAFASYNEPSNNCQKHAIIVSLINSFTSIFASIVTFSIYGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 WINAATQIFFSLGLGFGSLIAFASYNEPSNNCQKHAIIVSLINSFTSIFASIVTFSIYGF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE6 KATFNYENCLKKVSLLLTNTFDLEDGFLTASNLEQVKGYLASAYPSKYSEMFPQIKNCSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 KATFNYENCLKKVSLLLTNTFDLEDGFLTASNLEQVKGYLASAYPSKYSEMFPQIKNCSL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE6 ESELDTAVQGTGLAFIVYTEAIKNMEVSQLWSVLYFFMLLMLGIGSMLGNTAAILTPLTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 ESELDTAVQGTGLAFIVYTEAIKNMEVSQLWSVLYFFMLLMLGIGSMLGNTAAILTPLTD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE6 SKIISSHLPKEAISGLVCLVNCAIGMVFTMEAGNYWFDIFNDYAATLSLLLIVLVETIAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 SKIISSHLPKEAISGLVCLVNCAIGMVFTMEAGNYWFDIFNDYAATLSLLLIVLVETIAV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE6 CYVYGLRRFESDLKAMTGRAVSWYWKVMWAGVSPLLIVSLFVFYLSDYILTGTLKYQAWD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 CYVYGLRRFESDLKAMTGRAVSWYWKVMWAGVSPLLIVSLFVFYLSDYILTGTLKYQAWD
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590  
pF1KE6 ASQGQLVTKDYPAYALAVIGLLVASSTMCIPLAALGTFVQRRLKRGDADPVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 ASQGQLVTKDYPAYALAVIGLLVASSTMCIPLAALGTFVQRRLKRGDADPVA
              550       560       570       580       590  

>>XP_011532149 (OMIM: 138500,242600,605616) PREDICTED: s  (493 aa)
 initn: 3267 init1: 3267 opt: 3267  Z-score: 3903.6  bits: 732.0 E(85289): 1.1e-210
Smith-Waterman score: 3267; 100.0% identity (100.0% similar) in 493 aa overlap (100-592:1-493)

      70        80        90       100       110       120         
pF1KE6 RQGSIGAWRTISPYLSGVGVASVVVSFFLSMYYNVINAWAFWYLFHSFQDPLPWSVCPLN
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011                               MYYNVINAWAFWYLFHSFQDPLPWSVCPLN
                                             10        20        30

     130       140       150       160       170       180         
pF1KE6 GNHTGYDEECEKASSTQYFWYRKTLNISPSLQENGGVQWEPALCLLLAWLVVYLCILRGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GNHTGYDEECEKASSTQYFWYRKTLNISPSLQENGGVQWEPALCLLLAWLVVYLCILRGT
               40        50        60        70        80        90

     190       200       210       220       230       240         
pF1KE6 ESTGKVVYFTASLPYCVLIIYLIRGLTLHGATNGLMYMFTPKIEQLANPKAWINAATQIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ESTGKVVYFTASLPYCVLIIYLIRGLTLHGATNGLMYMFTPKIEQLANPKAWINAATQIF
              100       110       120       130       140       150

     250       260       270       280       290       300         
pF1KE6 FSLGLGFGSLIAFASYNEPSNNCQKHAIIVSLINSFTSIFASIVTFSIYGFKATFNYENC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FSLGLGFGSLIAFASYNEPSNNCQKHAIIVSLINSFTSIFASIVTFSIYGFKATFNYENC
              160       170       180       190       200       210

     310       320       330       340       350       360         
pF1KE6 LKKVSLLLTNTFDLEDGFLTASNLEQVKGYLASAYPSKYSEMFPQIKNCSLESELDTAVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LKKVSLLLTNTFDLEDGFLTASNLEQVKGYLASAYPSKYSEMFPQIKNCSLESELDTAVQ
              220       230       240       250       260       270

     370       380       390       400       410       420         
pF1KE6 GTGLAFIVYTEAIKNMEVSQLWSVLYFFMLLMLGIGSMLGNTAAILTPLTDSKIISSHLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GTGLAFIVYTEAIKNMEVSQLWSVLYFFMLLMLGIGSMLGNTAAILTPLTDSKIISSHLP
              280       290       300       310       320       330

     430       440       450       460       470       480         
pF1KE6 KEAISGLVCLVNCAIGMVFTMEAGNYWFDIFNDYAATLSLLLIVLVETIAVCYVYGLRRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KEAISGLVCLVNCAIGMVFTMEAGNYWFDIFNDYAATLSLLLIVLVETIAVCYVYGLRRF
              340       350       360       370       380       390

     490       500       510       520       530       540         
pF1KE6 ESDLKAMTGRAVSWYWKVMWAGVSPLLIVSLFVFYLSDYILTGTLKYQAWDASQGQLVTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ESDLKAMTGRAVSWYWKVMWAGVSPLLIVSLFVFYLSDYILTGTLKYQAWDASQGQLVTK
              400       410       420       430       440       450

     550       560       570       580       590  
pF1KE6 DYPAYALAVIGLLVASSTMCIPLAALGTFVQRRLKRGDADPVA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DYPAYALAVIGLLVASSTMCIPLAALGTFVQRRLKRGDADPVA
              460       470       480       490   

>>NP_071800 (OMIM: 138500,242600,605616) sodium- and chl  (555 aa)
 initn: 2338 init1: 2338 opt: 2350  Z-score: 2807.9  bits: 529.5 E(85289): 1.2e-149
Smith-Waterman score: 3610; 93.8% identity (93.8% similar) in 592 aa overlap (1-592:1-555)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MEKARPLWANSLQFVFACISYAVGLGNVWRFPYLCQMYGGGSFLVPYIIMLIVEGMPLLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 MEKARPLWANSLQFVFACISYAVGLGNVWRFPYLCQMYGGGSFLVPYIIMLIVEGMPLLY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 LELAVGQRMRQGSIGAWRTISPYLSGVGVASVVVSFFLSMYYNVINAWAFWYLFHSFQDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 LELAVGQRMRQGSIGAWRTISPYLSGVGVASVVVSFFLSMYYNVINAWAFWYLFHSFQDP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 LPWSVCPLNGNHTGYDEECEKASSTQYFWYRKTLNISPSLQENGGVQWEPALCLLLAWLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 LPWSVCPLNGNHTGYDEECEKASSTQYFWYRKTLNISPSLQENGGVQWEPALCLLLAWLV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 VYLCILRGTESTGKVVYFTASLPYCVLIIYLIRGLTLHGATNGLMYMFTPKIEQLANPKA
       ::::::::::::::                                     :::::::::
NP_071 VYLCILRGTESTGK-------------------------------------IEQLANPKA
              190                                            200   

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 WINAATQIFFSLGLGFGSLIAFASYNEPSNNCQKHAIIVSLINSFTSIFASIVTFSIYGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 WINAATQIFFSLGLGFGSLIAFASYNEPSNNCQKHAIIVSLINSFTSIFASIVTFSIYGF
           210       220       230       240       250       260   

              310       320       330       340       350       360
pF1KE6 KATFNYENCLKKVSLLLTNTFDLEDGFLTASNLEQVKGYLASAYPSKYSEMFPQIKNCSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 KATFNYENCLKKVSLLLTNTFDLEDGFLTASNLEQVKGYLASAYPSKYSEMFPQIKNCSL
           270       280       290       300       310       320   

              370       380       390       400       410       420
pF1KE6 ESELDTAVQGTGLAFIVYTEAIKNMEVSQLWSVLYFFMLLMLGIGSMLGNTAAILTPLTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 ESELDTAVQGTGLAFIVYTEAIKNMEVSQLWSVLYFFMLLMLGIGSMLGNTAAILTPLTD
           330       340       350       360       370       380   

              430       440       450       460       470       480
pF1KE6 SKIISSHLPKEAISGLVCLVNCAIGMVFTMEAGNYWFDIFNDYAATLSLLLIVLVETIAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 SKIISSHLPKEAISGLVCLVNCAIGMVFTMEAGNYWFDIFNDYAATLSLLLIVLVETIAV
           390       400       410       420       430       440   

              490       500       510       520       530       540
pF1KE6 CYVYGLRRFESDLKAMTGRAVSWYWKVMWAGVSPLLIVSLFVFYLSDYILTGTLKYQAWD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 CYVYGLRRFESDLKAMTGRAVSWYWKVMWAGVSPLLIVSLFVFYLSDYILTGTLKYQAWD
           450       460       470       480       490       500   

              550       560       570       580       590  
pF1KE6 ASQGQLVTKDYPAYALAVIGLLVASSTMCIPLAALGTFVQRRLKRGDADPVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 ASQGQLVTKDYPAYALAVIGLLVASSTMCIPLAALGTFVQRRLKRGDADPVA
           510       520       530       540       550     

>>XP_011532150 (OMIM: 138500,242600,605616) PREDICTED: s  (321 aa)
 initn: 2133 init1: 2133 opt: 2133  Z-score: 2551.8  bits: 481.3 E(85289): 2.1e-135
Smith-Waterman score: 2133; 100.0% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MEKARPLWANSLQFVFACISYAVGLGNVWRFPYLCQMYGGGSFLVPYIIMLIVEGMPLLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MEKARPLWANSLQFVFACISYAVGLGNVWRFPYLCQMYGGGSFLVPYIIMLIVEGMPLLY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 LELAVGQRMRQGSIGAWRTISPYLSGVGVASVVVSFFLSMYYNVINAWAFWYLFHSFQDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LELAVGQRMRQGSIGAWRTISPYLSGVGVASVVVSFFLSMYYNVINAWAFWYLFHSFQDP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 LPWSVCPLNGNHTGYDEECEKASSTQYFWYRKTLNISPSLQENGGVQWEPALCLLLAWLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPWSVCPLNGNHTGYDEECEKASSTQYFWYRKTLNISPSLQENGGVQWEPALCLLLAWLV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 VYLCILRGTESTGKVVYFTASLPYCVLIIYLIRGLTLHGATNGLMYMFTPKIEQLANPKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VYLCILRGTESTGKVVYFTASLPYCVLIIYLIRGLTLHGATNGLMYMFTPKIEQLANPKA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 WINAATQIFFSLGLGFGSLIAFASYNEPSNNCQKHAIIVSLINSFTSIFASIVTFSIYGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WINAATQIFFSLGLGFGSLIAFASYNEPSNNCQKHAIIVSLINSFTSIFASIVTFSIYGF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE6 KATFNYENCLKKVSLLLTNTFDLEDGFLTASNLEQVKGYLASAYPSKYSEMFPQIKNCSL
       ::::::::::::                                                
XP_011 KATFNYENCLKKKEEADGRLW                                       
              310       320                                        

>>NP_872438 (OMIM: 610300) sodium-dependent neutral amin  (628 aa)
 initn: 2005 init1: 1454 opt: 2046  Z-score: 2444.2  bits: 462.3 E(85289): 2.1e-129
Smith-Waterman score: 2046; 48.1% identity (78.9% similar) in 592 aa overlap (5-590:18-605)

                            10        20        30        40       
pF1KE6              MEKARPLWANSLQFVFACISYAVGLGNVWRFPYLCQMYGGGSFLVPY
                        :: : :. :....: ..::::::.:::::::: ::::.::.::
NP_872 MAHAPEPDPAACDLGDERPKWDNKAQYLLSCTGFAVGLGNIWRFPYLCQTYGGGAFLIPY
               10        20        30        40        50        60

        50        60        70        80        90       100       
pF1KE6 IIMLIVEGMPLLYLELAVGQRMRQGSIGAWRTISPYLSGVGVASVVVSFFLSMYYNVINA
       .: :. ::.:....:::.:::.:.::.:.: .:::::::::.. :..::..:.:::.: :
NP_872 VIALVFEGIPIFHVELAIGQRLRKGSVGVWTAISPYLSGVGLGCVTLSFLISLYYNTIVA
               70        80        90       100       110       120

       110       120       130       140       150       160       
pF1KE6 WAFWYLFHSFQDPLPWSVCPLNGNHTGYDEECEKASSTQYFWYRKTLNISPSLQENGGVQ
       :..:::..::: ::::: :: . :.::. :::. .:...:::::.::::. .....:..:
NP_872 WVLWYLLNSFQHPLPWSSCPPDLNRTGFVEECQGSSAVSYFWYRQTLNITADINDSGSIQ
              130       140       150       160       170       180

       170       180       190       200       210       220       
pF1KE6 WEPALCLLLAWLVVYLCILRGTESTGKVVYFTASLPYCVLIIYLIRGLTLHGATNGLMYM
       :   .::  .: :::.:..:: :.::::.:::: .:: :: :.::::::: :::.::.:.
NP_872 WWLLICLAASWAVVYMCVIRGIETTGKVIYFTALFPYLVLTIFLIRGLTLPGATKGLIYL
              190       200       210       220       230       240

       230       240       250       260       270       280       
pF1KE6 FTPKIEQLANPKAWINAATQIFFSLGLGFGSLIAFASYNEPSNNCQKHAIIVSLINSFTS
       :::... : ::..:..:::::::::.:.::. ::::::: : :.::: :....:.: .::
NP_872 FTPNMHILQNPRVWLDAATQIFFSLSLAFGGHIAFASYNSPRNDCQKDAVVIALVNRMTS
              250       260       270       280       290       300

       290       300       310       320       330       340       
pF1KE6 IFASIVTFSIYGFKATFNYENCLKKVSLLLTNTFDLEDGFLTASNLEQVKGYLASAYPSK
       ..:::..::. ::::: .::.:: .  : : : ::. .  .. ..   :  .: ...:..
NP_872 LYASIAVFSVLGFKATNDYEHCLDRNILSLINDFDFPEQSISRDDYPAVLMHLNATWPKR
              310       320       330       340       350       360

       350       360       370       380       390       400       
pF1KE6 YSEMFPQIKNCSLESELDTAVQGTGLAFIVYTEAIKNMEVSQLWSVLYFFMLLMLGIGSM
        ... : .: : ::. :: ...: ::::.:.::.  .:  . .:..:.: ::. ::...:
NP_872 VAQL-P-LKACLLEDFLDKSASGPGLAFVVFTETDLHMPGAPVWAMLFFGMLFTLGLSTM
                370       380       390       400       410        

       410       420       430       440       450       460       
pF1KE6 LGNTAAILTPLTDSKIISSHLPKEAISGLVCLVNCAIGMVFTMEAGNYWFDIFNDYAATL
       .:.. :..::: :  ..   .::::..::::::    .  ::...::::..::...::. 
NP_872 FGTVEAVITPLLDVGVLPRWVPKEALTGLVCLVCFLSATCFTLQSGNYWLEIFDNFAASP
      420       430       440       450       460       470        

       470       480       490       500       510       520       
pF1KE6 SLLLIVLVETIAVCYVYGLRRFESDLKAMTGRAVSWYWKVMWAGVSPLLIVSLFVFYLSD
       .::.....:...: ::::..:: .:.  ::::  : ::.. :  :::::. ..:: :.  
NP_872 NLLMLAFLEVVGVVYVYGMKRFCDDIAWMTGRRPSPYWRLTWRVVSPLLL-TIFVAYII-
      480       490       500       510       520        530       

       530       540       550          560       570       580    
pF1KE6 YILTGTLKYQAWDASQGQLVTKD---YPAYALAVIGLLVASSTMCIPLAALGTFVQRRLK
        ..   :.:.::. .   . ...   ::..: :.  ::    .. .:.:::. .. :: .
NP_872 LLFWKPLRYKAWNPKYELFPSRQEKLYPGWARAACVLLSLLPVLWVPVAALAQLLTRRRR
        540       550       560       570       580       590      

             590                       
pF1KE6 RG---DADPVA                     
            :: :                       
NP_872 TWRDRDARPDTDMRPDTDTRPDTDMRPDTDMR
        600       610       620        

>>NP_001003841 (OMIM: 138500,234500,242600,608893) sodiu  (634 aa)
 initn: 1978 init1: 1426 opt: 2016  Z-score: 2408.3  bits: 455.7 E(85289): 2.1e-127
Smith-Waterman score: 2016; 46.3% identity (80.4% similar) in 588 aa overlap (4-587:31-615)

                                          10        20        30   
pF1KE6                            MEKARPLWANSLQFVFACISYAVGLGNVWRFPY
                                     .:: : :. :....:... :::::::::::
NP_001 MVRLVLPNPGLDARIPSLAELETIEQEEASSRPKWDNKAQYMLTCLGFCVGLGNVWRFPY
               10        20        30        40        50        60

            40        50        60        70        80        90   
pF1KE6 LCQMYGGGSFLVPYIIMLIVEGMPLLYLELAVGQRMRQGSIGAWRTISPYLSGVGVASVV
       ::: .:::.:..:..:.:..::.::::::.:.:::.:.::.:.: .: : :.:.:.::..
NP_001 LCQSHGGGAFMIPFLILLVLEGIPLLYLEFAIGQRLRRGSLGVWSSIHPALKGLGLASML
               70        80        90       100       110       120

           100       110       120       130       140       150   
pF1KE6 VSFFLSMYYNVINAWAFWYLFHSFQDPLPWSVCPLNGNHTGYDEECEKASSTQYFWYRKT
       .::....:::.: .: .::::.:::.::::: :::: :.::: .:: ..: ..:::::.:
NP_001 TSFMVGLYYNTIISWIMWYLFNSFQEPLPWSDCPLNENQTGYVDECARSSPVDYFWYRET
              130       140       150       160       170       180

           160       170       180       190       200       210   
pF1KE6 LNISPSLQENGGVQWEPALCLLLAWLVVYLCILRGTESTGKVVYFTASLPYCVLIIYLIR
       :::: :....:..::   :::  :: :.:.: .:: :.:::.::.:..::: :: :.:::
NP_001 LNISTSISDSGSIQWWMLLCLACAWSVLYMCTIRGIETTGKAVYITSTLPYVVLTIFLIR
              190       200       210       220       230       240

           220       230       240       250       260       270   
pF1KE6 GLTLHGATNGLMYMFTPKIEQLANPKAWINAATQIFFSLGLGFGSLIAFASYNEPSNNCQ
       ::::.:::::....:::.. .::.: .:..:..:.:::..:.::.::.:.:::   :::.
NP_001 GLTLKGATNGIVFLFTPNVTELAQPDTWLDAGAQVFFSFSLAFGGLISFSSYNSVHNNCE
              250       260       270       280       290       300

           280       290       300       310       320       330   
pF1KE6 KHAIIVSLINSFTSIFASIVTFSIYGFKATFNYENCLKKVSLLLTNTFDLEDGFLTASNL
       : ..:::.::.:::....::..:. ::.::  :..:..   : : : ::: .: .:  :.
NP_001 KDSVIVSIINGFTSVYVAIVVYSVIGFRATQRYDDCFSTNILTLINGFDLPEGNVTQENF
              310       320       330       340       350       360

           340       350       360       370       380       390   
pF1KE6 EQVKGYLASAYPSKYSEMFPQIKNCSLESELDTAVQGTGLAFIVYTEAIKNMEVSQLWSV
        ...    .. :. :...  :  .:.... :. ::.::::::::.:::: .: .: ::::
NP_001 VDMQQRCNASDPAAYAQLVFQ--TCDINAFLSEAVEGTGLAFIVFTEAITKMPLSPLWSV
              370       380         390       400       410        

           400       410       420       430       440       450   
pF1KE6 LYFFMLLMLGIGSMLGNTAAILTPLTDSKIISSHLPKEAISGLVCLVNCAIGMVFTMEAG
       :.:.::. ::..::.::  ....:: : ..:  . :::...::.:: .  ::..::...:
NP_001 LFFIMLFCLGLSSMFGNMEGVVVPLQDLRVIPPKWPKEVLTGLICLGTFLIGFIFTLNSG
      420       430       440       450       460       470        

           460       470       480       490       500       510   
pF1KE6 NYWFDIFNDYAATLSLLLIVLVETIAVCYVYGLRRFESDLKAMTGRAVSWYWKVMWAGVS
       .::......::... ::.:.. : ..: ::::. ::..:.. : :.  . .:.: :  ::
NP_001 QYWLSLLDSYAGSIPLLIIAFCEMFSVVYVYGVDRFNKDIEFMIGHKPNIFWQVTWRVVS
      480       490       500       510       520       530        

           520       530       540       550          560       570
pF1KE6 PLLIVSLFVFYLSDYILTGTLKYQAWDASQGQLVTKD---YPAYALAVIGLLVASSTMCI
       :::.. .:.:..   . .  : :. :: .  ..  ..   :: .. .:. ....  .. :
NP_001 PLLMLIIFLFFFVVEV-SQELTYSIWDPGYEEFPKSQKISYPNWVYVVVVIVAGVPSLTI
      540       550        560       570       580       590       

              580        590                
pF1KE6 PLAALGTFVQRRLKR-GDADPVA              
       :  :.  ... . .. ::                   
NP_001 PGYAIYKLIRNHCQKPGDHQGLVSTLSTASMNGDLKY
       600       610       620       630    

>>NP_877499 (OMIM: 607971) sodium-dependent neutral amin  (730 aa)
 initn: 1267 init1: 695 opt: 1593  Z-score: 1902.4  bits: 362.3 E(85289): 3.2e-99
Smith-Waterman score: 1825; 44.7% identity (76.6% similar) in 599 aa overlap (1-587:57-646)

                                             10        20        30
pF1KE6                               MEKARPLWANSLQFVFACISYAVGLGNVWR
                                     .:  :: : ..::...: ....::::::::
NP_877 EDAADDAFKTSELIVDGQEEKDTDVEEGSEVEDERPAWNSKLQYILAQVGFSVGLGNVWR
         30        40        50        60        70        80      

               40        50        60        70        80        90
pF1KE6 FPYLCQMYGGGSFLVPYIIMLIVEGMPLLYLELAVGQRMRQGSIGAWRTISPYLSGVGVA
       ::::::  :::..:.::.:.:.: :.::..:::.::::.:.::::.:  ::: :.:.: :
NP_877 FPYLCQKNGGGAYLLPYLILLMVIGIPLFFLELSVGQRIRRGSIGVWNYISPKLGGIGFA
         90       100       110       120       130       140      

              100       110       120         130       140        
pF1KE6 SVVVSFFLSMYYNVINAWAFWYLFHSFQDPLPWSVCPL--NGNHTGYDEECEKASSTQYF
       : :: .:...::::: .:...:. .:::.::::. :::  :..::  . :::..:.: :.
NP_877 SCVVCYFVALYYNVIIGWSLFYFSQSFQQPLPWDQCPLVKNASHTFVEPECEQSSATTYY
        150       160       170       180       190       200      

      150       160       170       180       190       200        
pF1KE6 WYRKTLNISPSLQENGGVQWEPALCLLLAWLVVYLCILRGTESTGKVVYFTASLPYCVLI
       :::..:::: :..:.::..:. ..::: ::..: : ...: .:.::..::.. .:: :::
NP_877 WYREALNISSSISESGGLNWKMTICLLAAWVMVCLAMIKGIQSSGKIIYFSSLFPYVVLI
        210       220       230       240       250       260      

      210       220       230       240       250       260        
pF1KE6 IYLIRGLTLHGATNGLMYMFTPKIEQLANPKAWINAATQIFFSLGLGFGSLIAFASYNEP
        .:::.. :.:. .:. .:::::.: . .::.: .::::.::.::::::..:::.:::. 
NP_877 CFLIRAFLLNGSIDGIRHMFTPKLEIMLEPKVWREAATQVFFALGLGFGGVIAFSSYNKR
        270       280       290       300       310       320      

      270       280       290       300       310       320        
pF1KE6 SNNCQKHAIIVSLINSFTSIFASIVTFSIYGFKATFNYENCLKKVSLLLTNTFDL----E
       .:::.  :..::.:: :::..:..:.:.. ::::.   :.:. . :  . . . .    .
NP_877 DNNCHFDAVLVSFINFFTSVLATLVVFAVLGFKANVINEKCITQNSETIMKFLKMGNISQ
        330       340       350       360       370       380      

          330          340       350          360       370        
pF1KE6 DGFLTASNLEQVKG---YLASAYPSKYSEM-FP--QIKNCSLESELDTAVQGTGLAFIVY
       : .    ::  : .   .:.    .: .:  ::  ....:..: ::. ::::::::::..
NP_877 DIIPHHINLSTVTAEDYHLVYDIIQKVKEEEFPALHLNSCKIEEELNKAVQGTGLAFIAF
        390       400       410       420       430       440      

      380       390       400       410       420       430        
pF1KE6 TEAIKNMEVSQLWSVLYFFMLLMLGIGSMLGNTAAILTPLTDSKIISSHLPKEAISGLVC
       :::. .. .: .:::..:.::. ::.:::.:.  .:.::..:.  .     :: .. . :
NP_877 TEAMTHFPASPFWSVMFFLMLVNLGLGSMFGTIEGIVTPIVDTFKVR----KEILTVICC
        450       460       470       480       490           500  

      440       450       460       470       480       490        
pF1KE6 LVNCAIGMVFTMEAGNYWFDIFNDYAATLSLLLIVLVETIAVCYVYGLRRFESDLKAMTG
       :.   ::..:....:::.  .:.::.::: ::..:..:.::::.:::. .:  ::: : :
NP_877 LLAFCIGLIFVQRSGNYFVTMFDDYSATLPLLIVVILENIAVCFVYGIDKFMEDLKDMLG
            510       520       530       540       550       560  

      500       510       520       530       540       550        
pF1KE6 RAVSWYWKVMWAGVSPLLIVSLFVFYLSDYILTGTLKYQAWDASQGQLVTKDYPAYALAV
        : : :.  ::  .:::...::..  . .. :.    :.::  ....    .::...:.:
NP_877 FAPSRYYYYMWKYISPLMLLSLLIASVVNMGLSPP-GYNAWIEDKASEEFLSYPTWGLVV
            570       580       590        600       610       620 

      560       570       580       590                            
pF1KE6 IGLLVASSTMCIPLAALGTFVQRRLKRGDADPVA                          
          ::. . . .:..    :. ::..  :                               
NP_877 CVSLVVFAILPVPVV----FIVRRFNLIDDSSGNLASVTYKRGRVLKEPVNLEGDDTSLI
             630           640       650       660       670       

>>XP_006710706 (OMIM: 610299,616269) PREDICTED: sodium-d  (727 aa)
 initn: 1177 init1: 697 opt: 1528  Z-score: 1824.8  bits: 347.9 E(85289): 6.6e-95
Smith-Waterman score: 1756; 44.0% identity (75.5% similar) in 596 aa overlap (5-583:60-641)

                                         10        20        30    
pF1KE6                           MEKARPLWANSLQFVFACISYAVGLGNVWRFPYL
                                     :: : ..::...: :...:::::.::::::
XP_006 PVDYKQSVLNVAGEAGGKQKAVEEELDAEDRPAWNSKLQYILAQIGFSVGLGNIWRFPYL
      30        40        50        60        70        80         

           40        50        60        70        80        90    
pF1KE6 CQMYGGGSFLVPYIIMLIVEGMPLLYLELAVGQRMRQGSIGAWRTISPYLSGVGVASVVV
       ::  :::..::::...::. :.::..::::::::.:.::::.:. : : :.:.: .: .:
XP_006 CQKNGGGAYLVPYLVLLIIIGIPLFFLELAVGQRIRRGSIGVWHYICPRLGGIGFSSCIV
      90       100       110       120       130       140         

          100       110       120         130       140       150  
pF1KE6 SFFLSMYYNVINAWAFWYLFHSFQDPLPWSVCPL--NGNHTGYDEECEKASSTQYFWYRK
        .:...::::: .:...:.:.::: ::::: ::.  ::. .  . ::::.:.: :::::.
XP_006 CLFVGLYYNVIIGWSIFYFFKSFQYPLPWSECPVVRNGSVAVVEAECEKSSATTYFWYRE
     150       160       170       180       190       200         

            160       170       180       190       200       210  
pF1KE6 TLNISPSLQENGGVQWEPALCLLLAWLVVYLCILRGTESTGKVVYFTASLPYCVLIIYLI
       .:.:: :..:.::..:. .::::.:: .: . ...: .:.:::.::.. .:: ::  .:.
XP_006 ALDISDSISESGGLNWKMTLCLLVAWSIVGMAVVKGIQSSGKVMYFSSLFPYVVLACFLV
     210       220       230       240       250       260         

            220       230       240       250       260       270  
pF1KE6 RGLTLHGATNGLMYMFTPKIEQLANPKAWINAATQIFFSLGLGFGSLIAFASYNEPSNNC
       ::: :.::..:...:::::.... .:..: .::::.::.::::::..:::.:::. .:::
XP_006 RGLLLRGAVDGILHMFTPKLDKMLDPQVWREAATQVFFALGLGFGGVIAFSSYNKQDNNC
     270       280       290       300       310       320         

            280       290       300       310            320       
pF1KE6 QKHAIIVSLINSFTSIFASIVTFSIYGFKATFNYENCL-----KKVSLLLTNTF--DLED
       .  : .::.:: :::..:..:.:.. ::::..  :.:.     : .. : ::..  ::  
XP_006 HFDAALVSFINFFTSVLATLVVFAVLGFKANIMNEKCVVENAEKILGYLNTNVLSRDLIP
     330       340       350       360       370       380         

              330       340       350       360       370       380
pF1KE6 -----GFLTASNLEQVKGYLASAYPSKYSEMFPQIKNCSLESELDTAVQGTGLAFIVYTE
            . ::...  .. . . ..  ...: .   .  : ::.::: .:::::::::..::
XP_006 PHVNFSHLTTKDYMEMYNVIMTVKEDQFSAL--GLDPCLLEDELDKSVQGTGLAFIAFTE
     390       400       410       420         430       440       

              390       400       410       420       430       440
pF1KE6 AIKNMEVSQLWSVLYFFMLLMLGIGSMLGNTAAILTPLTDSKIISSHLPKEAISGLVCLV
       :. .. .: .:::..:.::. ::.:::.:. :.: ::. :.     ..::: ..   :. 
XP_006 AMTHFPASPFWSVMFFLMLINLGLGSMIGTMAGITTPIIDT----FKVPKEMFTVGCCVF
       450       460       470       480           490       500   

              450       460       470       480       490          
pF1KE6 NCAIGMVFTMEAGNYWFDIFNDYAATLSLLLIVLVETIAVCYVYGLRRFESDLKAMTG-R
          .:..:....:::.  .:.::.::: : :::..:.::: ..:: ..: ..:  : : :
XP_006 AFLVGLLFVQRSGNYFVTMFDDYSATLPLTLIVILENIAVAWIYGTKKFMQELTEMLGFR
           510       520       530       540       550       560   

     500       510       520       530         540       550       
pF1KE6 AVSWYWKVMWAGVSPLLIVSLFVFYLSDYILTGTLK--YQAWDASQGQLVTKDYPAYALA
          .:.  ::  :::: ..   :.  .. :  :.    :.::   ..      .: .:.:
XP_006 PYRFYF-YMWKFVSPLCMA---VLTTASIIQLGVTPPGYSAWIKEEAAERYLYFPNWAMA
            570       580          590       600       610         

       560       570       580       590                           
pF1KE6 VIGLLVASSTMCIPLAALGTFVQRRLKRGDADPVA                         
       ..  :.. .:. ::..    :: :..                                  
XP_006 LLITLIVVATLPIPVV----FVLRHFHLLSDGSNTLSVSYKKGRMMKDISNLEENDETRF
     620       630           640       650       660       670     

>>NP_001010898 (OMIM: 610299,616269) sodium-dependent ne  (727 aa)
 initn: 1177 init1: 697 opt: 1528  Z-score: 1824.8  bits: 347.9 E(85289): 6.6e-95
Smith-Waterman score: 1756; 44.0% identity (75.5% similar) in 596 aa overlap (5-583:60-641)

                                         10        20        30    
pF1KE6                           MEKARPLWANSLQFVFACISYAVGLGNVWRFPYL
                                     :: : ..::...: :...:::::.::::::
NP_001 PVDYKQSVLNVAGEAGGKQKAVEEELDAEDRPAWNSKLQYILAQIGFSVGLGNIWRFPYL
      30        40        50        60        70        80         

           40        50        60        70        80        90    
pF1KE6 CQMYGGGSFLVPYIIMLIVEGMPLLYLELAVGQRMRQGSIGAWRTISPYLSGVGVASVVV
       ::  :::..::::...::. :.::..::::::::.:.::::.:. : : :.:.: .: .:
NP_001 CQKNGGGAYLVPYLVLLIIIGIPLFFLELAVGQRIRRGSIGVWHYICPRLGGIGFSSCIV
      90       100       110       120       130       140         

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        .:...::::: .:...:.:.::: ::::: ::.  ::. .  . ::::.:.: :::::.
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       .:.:: :..:.::..:. .::::.:: .: . ...: .:.:::.::.. .:: ::  .:.
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       ::: :.::..:...:::::.... .:..: .::::.::.::::::..:::.:::. .:::
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       .  : .::.:: :::..:..:.:.. ::::..  :.:.     : .. : ::..  ::  
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            . ::...  .. . . ..  ...: .   .  : ::.::: .:::::::::..::
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       :. .. .: .:::..:.::. ::.:::.:. :.: ::. :.     ..::: ..   :. 
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          .:.  ::  :::: ..   :.  .. :  :.    :.::   ..      .: .:.:
NP_001 PYRFYF-YMWKFVSPLCMA---VLTTASIIQLGVTPPGYSAWIKEEAAERYLYFPNWAMA
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NP_001 LLITLIVVATLPIPVV----FVLRHFHLLSDGSNTLSVSYKKGRMMKDISNLEENDETRF
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>>NP_001139807 (OMIM: 607971) sodium-dependent neutral a  (623 aa)
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NP_001                               MVIGIPLFFLELSVGQRIRRGSIGVWNYIS
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pF1KE6 PYLSGVGVASVVVSFFLSMYYNVINAWAFWYLFHSFQDPLPWSVCPL--NGNHTGYDEEC
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60827320 residues in 85289 library sequences
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 start: Tue Nov  8 13:35:33 2016 done: Tue Nov  8 13:35:34 2016
 Total Scan time:  5.820 Total Display time:  0.070

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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