FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6295, 808 aa 1>>>pF1KB6295 808 - 808 aa - 808 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7093+/-0.00123; mu= -3.9383+/- 0.074 mean_var=266.8582+/-52.241, 0's: 0 Z-trim(109.8): 19 B-trim: 14 in 1/51 Lambda= 0.078512 statistics sampled from 11145 (11162) to 11145 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.673), E-opt: 0.2 (0.343), width: 16 Scan time: 4.710 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS46552.1 LRRFIP1 gene_id:9208|Hs108|chr2 ( 808) 5214 604.6 2.1e-172 CCDS2521.1 LRRFIP1 gene_id:9208|Hs108|chr2 ( 784) 4242 494.5 2.9e-139 CCDS46553.1 LRRFIP1 gene_id:9208|Hs108|chr2 ( 752) 4229 493.0 7.7e-139 CCDS46551.1 LRRFIP1 gene_id:9208|Hs108|chr2 ( 640) 1084 136.7 1.2e-31 CCDS46791.1 LRRFIP2 gene_id:9209|Hs108|chr3 ( 424) 733 96.9 7.6e-20 CCDS2664.1 LRRFIP2 gene_id:9209|Hs108|chr3 ( 721) 677 90.7 9.6e-18 CCDS2665.1 LRRFIP2 gene_id:9209|Hs108|chr3 ( 400) 474 67.5 4.9e-11 >>CCDS46552.1 LRRFIP1 gene_id:9208|Hs108|chr2 (808 aa) initn: 5214 init1: 5214 opt: 5214 Z-score: 3208.6 bits: 604.6 E(32554): 2.1e-172 Smith-Waterman score: 5214; 99.9% identity (100.0% similar) in 808 aa overlap (1-808:1-808) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 MTSPAAAQSREIDCLSPEAQKLAEARLAAKRAARAEAREIRMKELERQQKEEDSERYSRR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 MTSPAAAQSREIDCLSPEAQKLAEARLAAKRAARAEAREIRMKELERQQKEEDSERYSRR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 SRRNTSASDEDERMSVGSRGSLRVEERPEKDFTEKGSRNMPGLSAATLASLGGTSSRRGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 SRRNTSASDEDERMSVGSRGSLRVEERPEKDFTEKGSRNMPGLSAATLASLGGTSSRRGS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 GDTSISIDTEASIREIKELNELKDQIQDVEGKYMQGLKEMKDSLAEVEEKYKKAMVSNAQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 GDTSISIDTEASIREIKELNELKDQIQDVEGKYMQGLKEMKDSLAEVEEKYKKAMVSNAQ 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 LDNEKTNFMYQVDTLKDMLLELEEQLAESRRQYEEKNKEFEREKHAHSILQFQFAEVKEA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 LDNEKTNFMYQVDTLKDMLLELEEQLAESRRQYEEKNKEFEREKHAHSILQFQFAEVKEA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 LKQREEMLEKHGIILNSEIATNGETSDTLNNVGYQGPTKMTKEELNALKSTGDGTLGRAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 LKQREEMLEKHGIILNSEIATNGETSDTLNNVGYQGPTKMTKEELNALKSTGDGTLGRAS 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB6 EVEVKNEIVANVGKREILHNTEKEQHTEDTVKDCVDIEVFPAGENTEDQKSSEDTAPFLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 EVEVKNEIVANVGKREILHNTEKEQHTEDTVKDCVDIEVFPAGENTEDQKSSEDTAPFLG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB6 TLAGATYEEQVQSQILESSSLPENTVQVESNEVMGAPDDRTRTPLEPSNCWSDLDGGNHT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 TLAGATYEEQVQSQILESSSLPENTVQVESNEVMGAPDDRTRTPLEPSNCWSDLDGGNHT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB6 ENVGEAAVTQVEEQAGTVASCPLGHSDDTVYHDDKCMVEVPQELETSTGHSLEKEFTNQE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 ENVGEAAVTQVEEQAGTVASCPLGHSDDTVYHDDKCMVEVPQELETSTGHSLEKEFTNQE 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB6 AAEPKEVPAHSTEVGRDHNEEEGEETGLRDEKPIKTEVPGSPAGTEGNCQEATGPSTVDT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 AAEPKEVPAHSTEVGRDHNEEEGEETGLRDEKPIKTEVPGSPAGTEGNCQEATGPSTVDT 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB6 QNEPLDMKEPDEEKSDQQGEAFDSSQKKTKNKKKKNKKKKSPVPVETLKDVKKELTYQNT :::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 QNEPLDMKEPDEEKSDQQGEALDSSQKKTKNKKKKNKKKKSPVPVETLKDVKKELTYQNT 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KB6 DLSEIKEEEQVKSTDRKSAVEAQNEVTENPKQKIAAESSENVDCPENPKIKLDGKLDQEG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 DLSEIKEEEQVKSTDRKSAVEAQNEVTENPKQKIAAESSENVDCPENPKIKLDGKLDQEG 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KB6 DDVQTAAEEVLADGDTLDFEDDTVQSSGPRAGGEELDEGVAKDNAKIDGATQSSPAEPKS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 DDVQTAAEEVLADGDTLDFEDDTVQSSGPRAGGEELDEGVAKDNAKIDGATQSSPAEPKS 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KB6 EDADRCTLPEHESPSQDISDACEAESTERCEMSEHPSQTVRKALDSNSLENDDLSAPGRE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 EDADRCTLPEHESPSQDISDACEAESTERCEMSEHPSQTVRKALDSNSLENDDLSAPGRE 730 740 750 760 770 780 790 800 pF1KB6 PGHFNPESREDTRGGNEKGKSKEDCTMS :::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 PGHFNPESREDTRGGNEKGKSKEDCTMS 790 800 >>CCDS2521.1 LRRFIP1 gene_id:9208|Hs108|chr2 (784 aa) initn: 4229 init1: 4229 opt: 4242 Z-score: 2613.8 bits: 494.5 E(32554): 2.9e-139 Smith-Waterman score: 5001; 96.9% identity (97.0% similar) in 808 aa overlap (1-808:1-784) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 MTSPAAAQSREIDCLSPEAQKLAEARLAAKRAARAEAREIRMKELERQQKEEDSERYSRR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS25 MTSPAAAQSREIDCLSPEAQKLAEARLAAKRAARAEAREIRMKELERQQKEEDSERYSRR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 SRRNTSASDEDERMSVGSRGSLRVEERPEKDFTEKGSRNMPGLSAATLASLGGTSSRRGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS25 SRRNTSASDEDERMSVGSRGSLRVEERPEKDFTEKGSRNMPGLSAATLASLGGTSSRRGS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 GDTSISIDTEASIREIKELNELKDQIQDVEGKYMQGLKEMKDSLAEVEEKYKKAMVSNAQ ::::::::::::::::: ::::::::::::::::::: CCDS25 GDTSISIDTEASIREIK------------------------DSLAEVEEKYKKAMVSNAQ 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 LDNEKTNFMYQVDTLKDMLLELEEQLAESRRQYEEKNKEFEREKHAHSILQFQFAEVKEA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS25 LDNEKTNFMYQVDTLKDMLLELEEQLAESRRQYEEKNKEFEREKHAHSILQFQFAEVKEA 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 LKQREEMLEKHGIILNSEIATNGETSDTLNNVGYQGPTKMTKEELNALKSTGDGTLGRAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS25 LKQREEMLEKHGIILNSEIATNGETSDTLNNVGYQGPTKMTKEELNALKSTGDGTLGRAS 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KB6 EVEVKNEIVANVGKREILHNTEKEQHTEDTVKDCVDIEVFPAGENTEDQKSSEDTAPFLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS25 EVEVKNEIVANVGKREILHNTEKEQHTEDTVKDCVDIEVFPAGENTEDQKSSEDTAPFLG 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KB6 TLAGATYEEQVQSQILESSSLPENTVQVESNEVMGAPDDRTRTPLEPSNCWSDLDGGNHT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS25 TLAGATYEEQVQSQILESSSLPENTVQVESNEVMGAPDDRTRTPLEPSNCWSDLDGGNHT 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 pF1KB6 ENVGEAAVTQVEEQAGTVASCPLGHSDDTVYHDDKCMVEVPQELETSTGHSLEKEFTNQE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS25 ENVGEAAVTQVEEQAGTVASCPLGHSDDTVYHDDKCMVEVPQELETSTGHSLEKEFTNQE 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 pF1KB6 AAEPKEVPAHSTEVGRDHNEEEGEETGLRDEKPIKTEVPGSPAGTEGNCQEATGPSTVDT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS25 AAEPKEVPAHSTEVGRDHNEEEGEETGLRDEKPIKTEVPGSPAGTEGNCQEATGPSTVDT 460 470 480 490 500 510 550 560 570 580 590 600 pF1KB6 QNEPLDMKEPDEEKSDQQGEAFDSSQKKTKNKKKKNKKKKSPVPVETLKDVKKELTYQNT :::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS25 QNEPLDMKEPDEEKSDQQGEALDSSQKKTKNKKKKNKKKKSPVPVETLKDVKKELTYQNT 520 530 540 550 560 570 610 620 630 640 650 660 pF1KB6 DLSEIKEEEQVKSTDRKSAVEAQNEVTENPKQKIAAESSENVDCPENPKIKLDGKLDQEG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS25 DLSEIKEEEQVKSTDRKSAVEAQNEVTENPKQKIAAESSENVDCPENPKIKLDGKLDQEG 580 590 600 610 620 630 670 680 690 700 710 720 pF1KB6 DDVQTAAEEVLADGDTLDFEDDTVQSSGPRAGGEELDEGVAKDNAKIDGATQSSPAEPKS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS25 DDVQTAAEEVLADGDTLDFEDDTVQSSGPRAGGEELDEGVAKDNAKIDGATQSSPAEPKS 640 650 660 670 680 690 730 740 750 760 770 780 pF1KB6 EDADRCTLPEHESPSQDISDACEAESTERCEMSEHPSQTVRKALDSNSLENDDLSAPGRE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS25 EDADRCTLPEHESPSQDISDACEAESTERCEMSEHPSQTVRKALDSNSLENDDLSAPGRE 700 710 720 730 740 750 790 800 pF1KB6 PGHFNPESREDTRGGNEKGKSKEDCTMS :::::::::::::::::::::::::::: CCDS25 PGHFNPESREDTRGGNEKGKSKEDCTMS 760 770 780 >>CCDS46553.1 LRRFIP1 gene_id:9208|Hs108|chr2 (752 aa) initn: 4529 init1: 4229 opt: 4229 Z-score: 2606.1 bits: 493.0 E(32554): 7.7e-139 Smith-Waterman score: 4725; 92.9% identity (93.1% similar) in 808 aa overlap (1-808:1-752) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 MTSPAAAQSREIDCLSPEAQKLAEARLAAKRAARAEAREIRMKELERQQKEEDSERYSRR ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 MTSPAAAQSREIDCLSPEAQKLAEARLAAKRAARAEAREIRMKELERQQKE--------- 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 SRRNTSASDEDERMSVGSRGSLRVEERPEKDFTEKGSRNMPGLSAATLASLGGTSSRRGS ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 -----------------------VEERPEKDFTEKGSRNMPGLSAATLASLGGTSSRRGS 60 70 80 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 GDTSISIDTEASIREIKELNELKDQIQDVEGKYMQGLKEMKDSLAEVEEKYKKAMVSNAQ ::::::::::::::::: ::::::::::::::::::: CCDS46 GDTSISIDTEASIREIK------------------------DSLAEVEEKYKKAMVSNAQ 90 100 110 120 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 LDNEKTNFMYQVDTLKDMLLELEEQLAESRRQYEEKNKEFEREKHAHSILQFQFAEVKEA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 LDNEKTNFMYQVDTLKDMLLELEEQLAESRRQYEEKNKEFEREKHAHSILQFQFAEVKEA 130 140 150 160 170 180 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 LKQREEMLEKHGIILNSEIATNGETSDTLNNVGYQGPTKMTKEELNALKSTGDGTLGRAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 LKQREEMLEKHGIILNSEIATNGETSDTLNNVGYQGPTKMTKEELNALKSTGDGTLGRAS 190 200 210 220 230 240 310 320 330 340 350 360 pF1KB6 EVEVKNEIVANVGKREILHNTEKEQHTEDTVKDCVDIEVFPAGENTEDQKSSEDTAPFLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 EVEVKNEIVANVGKREILHNTEKEQHTEDTVKDCVDIEVFPAGENTEDQKSSEDTAPFLG 250 260 270 280 290 300 370 380 390 400 410 420 pF1KB6 TLAGATYEEQVQSQILESSSLPENTVQVESNEVMGAPDDRTRTPLEPSNCWSDLDGGNHT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 TLAGATYEEQVQSQILESSSLPENTVQVESNEVMGAPDDRTRTPLEPSNCWSDLDGGNHT 310 320 330 340 350 360 430 440 450 460 470 480 pF1KB6 ENVGEAAVTQVEEQAGTVASCPLGHSDDTVYHDDKCMVEVPQELETSTGHSLEKEFTNQE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 ENVGEAAVTQVEEQAGTVASCPLGHSDDTVYHDDKCMVEVPQELETSTGHSLEKEFTNQE 370 380 390 400 410 420 490 500 510 520 530 540 pF1KB6 AAEPKEVPAHSTEVGRDHNEEEGEETGLRDEKPIKTEVPGSPAGTEGNCQEATGPSTVDT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 AAEPKEVPAHSTEVGRDHNEEEGEETGLRDEKPIKTEVPGSPAGTEGNCQEATGPSTVDT 430 440 450 460 470 480 550 560 570 580 590 600 pF1KB6 QNEPLDMKEPDEEKSDQQGEAFDSSQKKTKNKKKKNKKKKSPVPVETLKDVKKELTYQNT :::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 QNEPLDMKEPDEEKSDQQGEALDSSQKKTKNKKKKNKKKKSPVPVETLKDVKKELTYQNT 490 500 510 520 530 540 610 620 630 640 650 660 pF1KB6 DLSEIKEEEQVKSTDRKSAVEAQNEVTENPKQKIAAESSENVDCPENPKIKLDGKLDQEG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 DLSEIKEEEQVKSTDRKSAVEAQNEVTENPKQKIAAESSENVDCPENPKIKLDGKLDQEG 550 560 570 580 590 600 670 680 690 700 710 720 pF1KB6 DDVQTAAEEVLADGDTLDFEDDTVQSSGPRAGGEELDEGVAKDNAKIDGATQSSPAEPKS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 DDVQTAAEEVLADGDTLDFEDDTVQSSGPRAGGEELDEGVAKDNAKIDGATQSSPAEPKS 610 620 630 640 650 660 730 740 750 760 770 780 pF1KB6 EDADRCTLPEHESPSQDISDACEAESTERCEMSEHPSQTVRKALDSNSLENDDLSAPGRE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 EDADRCTLPEHESPSQDISDACEAESTERCEMSEHPSQTVRKALDSNSLENDDLSAPGRE 670 680 690 700 710 720 790 800 pF1KB6 PGHFNPESREDTRGGNEKGKSKEDCTMS :::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 PGHFNPESREDTRGGNEKGKSKEDCTMS 730 740 750 >>CCDS46551.1 LRRFIP1 gene_id:9208|Hs108|chr2 (640 aa) initn: 1392 init1: 1046 opt: 1084 Z-score: 682.0 bits: 136.7 E(32554): 1.2e-31 Smith-Waterman score: 1228; 57.3% identity (69.5% similar) in 417 aa overlap (47-389:176-591) 20 30 40 50 60 70 pF1KB6 PEAQKLAEARLAAKRAARAEAREIRMKELERQQKEEDSERYSRRSRRNTSASDEDERMSV :. . :. :. : . .:.: . : : CCDS46 SGRPSCLYSAARPSGSYRASVLDEGSFGGTRRGSTSGSRAPSEYSGHLNSSSRASSRAS- 150 160 170 180 190 200 80 90 100 110 120 130 pF1KB6 GSRGSLRVEERPEKDFTEKGSRNMPGLSAATLASLGGTSSRRGSGDTSISIDTEASIREI ..:.: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 SARASPVVEERPEKDFTEKGSRNMPGLSAATLASLGGTSSRRGSGDTSISIDTEASIREI 210 220 230 240 250 260 140 150 160 170 180 190 pF1KB6 KELNELKDQIQDVEGKYMQGLKEMKDSLAEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKTNFMYQVDTLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 KELNELKDQIQDVEGKYMQGLKEMKDSLAEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKTNFMYQVDTLK 270 280 290 300 310 320 200 210 220 230 240 pF1KB6 DMLLELEEQLAESRRQYEEKNKEFEREKHAHSILQFQFAEVKEALKQREEMLE------- ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 DMLLELEEQLAESRRQYEEKNKEFEREKHAHSILQFQFAEVKEALKQREEMLEEIRQLQQ 330 340 350 360 370 380 250 pF1KB6 -------------------------------------------------------KHGII ::::: CCDS46 KQASSIREISDLQETIEWKDKKIGALERQKEFFDSVRSERDDLREEVVMLKEELKKHGII 390 400 410 420 430 440 260 270 280 290 300 pF1KB6 LNSEIATNGETSDTLNNVGYQGPTKMTKEELNALKSTGDGTLG---------RASEVEVK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: : .: CCDS46 LNSEIATNGETSDTLNNVGYQGPTKMTKEELNALKSTGDGTLDIRLKKLVDERECLLEQI 450 460 470 480 490 500 310 320 330 340 350 360 pF1KB6 NEIVANVGKREILHNTEKEQHTEDTVKDCVDIEVFPAGENTEDQKSSEDTAPFLGTLAGA ... ... .:. . . .. . .:.... .:..:. .... : :. . . CCDS46 KKLKGQLEERQKIGKLDNLRSEDDVLENGTDMHVMDLQRDANRQISDLKFKLAKSEQEIT 510 520 530 540 550 560 370 380 390 400 410 420 pF1KB6 TYEEQV---QSQILESSSLPENTVQVESNEVMGAPDDRTRTPLEPSNCWSDLDGGNHTEN . :..: .::. . .: ::. ..: CCDS46 ALEQNVIRLESQVSRYKSAAENAEKIEDELKAEKRKLQRELRSALDKTEELEVSNGHLVK 570 580 590 600 610 620 >>CCDS46791.1 LRRFIP2 gene_id:9209|Hs108|chr3 (424 aa) initn: 893 init1: 662 opt: 733 Z-score: 469.8 bits: 96.9 E(32554): 7.6e-20 Smith-Waterman score: 822; 41.5% identity (68.3% similar) in 410 aa overlap (1-389:1-375) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MTSPAAAQSREI--DCLSPEAQKL------AEARLAAKRAARAEAREIRMKELERQQKEE : .::....: : .: : . : ::::::::::::::::.:::.:::::::: CCDS46 MGTPASGRKRTPVKDRFSAEDEALSNIAREAEARLAAKRAARAEARDIRMRELERQQKEL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 DSERYSRRSRRNTSASDEDERMSVGSRGSLRVEERPEKDFTEKGSRNMPGLSAATLASLG : . ::.. ...:. .::: ::.. . :. CCDS46 DEK------------SDKQY----------------AENYTRPSSRN----SASATTPLS 70 80 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 GTSSRRGSGDTSISIDTEASIREIKELNELKDQIQDVEGKYMQGLKEMKDSLAEVEEKYK :.:::::::::: :: ..:. :.... .::::::::::.:::::::.:.::.::::::: CCDS46 GNSSRRGSGDTSSLIDPDTSLSELRDIYDLKDQIQDVEGRYMQGLKELKESLSEVEEKYK 90 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KB6 KAMVSNAQLDNEKTNFMYQVDTLKDMLLELEEQLAESRRQYEEKNKEFEREKHAHSILQF :::::::::::::.:..::::::::.. : :::.:: :. :::.::.::.:: :.:: CCDS46 KAMVSNAQLDNEKNNLIYQVDTLKDVIEEQEEQMAEFYRENEEKSKELERQKHMCSVLQH 150 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KB6 QFAEVKEALKQREEMLEKHGIILNSEIATNGETSDTLNNVGYQGPTKMTKEELNALKSTG .. :.::.:.::.:..::::... . . ::..: .: . : ...: ..:.:.: CCDS46 KMEELKEGLRQRDELIEKHGLVIIPDGTPNGDVSHE-PVAG--AITVVSQEAAQVLESAG 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 pF1KB6 DGTLG-RASEVE-VKNEIVANVGKREILHNTEKEQHTED--TVKDCVDIEVFPAGENTED .: : : .. :.:..... : .. . :... ... :: : . .. . : CCDS46 EGPLDVRLRKLAGEKEELLSQIRKLKLQLEEERQKCSRNDGTVGDLAGLQNGSDLQFIEM 270 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 pF1KB6 QK-SSEDTAPFLGTLAGA-----TYEEQV---QSQILESSSLPENTVQVESNEVMGAPDD :. .... . . :. : : :... ..:.:. .. ::. .:: CCDS46 QRDANRQISEYKFKLSKAEQDITTLEQSISRLEGQVLRYKTAAENAEKVEDELKAEKRKL 330 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 pF1KB6 RTRTPLEPSNCWSDLDGGNHTENVGEAAVTQVEEQAGTVASCPLGHSDDTVYHDDKCMVE CCDS46 QRELRTALDKIEEMEMTNSHLAKRLEKMKANRTALLAQQ 390 400 410 420 >>CCDS2664.1 LRRFIP2 gene_id:9209|Hs108|chr3 (721 aa) initn: 861 init1: 616 opt: 677 Z-score: 432.0 bits: 90.7 E(32554): 9.6e-18 Smith-Waterman score: 679; 39.5% identity (67.1% similar) in 362 aa overlap (41-399:252-579) 20 30 40 50 60 70 pF1KB6 EIDCLSPEAQKLAEARLAAKRAARAEAREIRMKELERQQKEEDSERYSRRSRRNTSASDE : .. .:.. .. .:: .::.. .:. CCDS26 ECSYYSSRISSARSSPGFTNDDTASIVSSDRASRGRRESVVSAADYFSRSNRRGSVVSEV 230 240 250 260 270 280 80 90 100 110 120 130 pF1KB6 DERMSVGSRGSLRVEERPEKDFTEKGSRNMPGLSAATLASLGGTSSRRGSGDTSISIDTE :. .:. . .:: .:. .:...:. .: ::.. . :.:.:::::::::: :: . CCDS26 DD-ISIPDLSSL--DEKSDKQYAENYTRPSSRNSASATTPLSGNSSRRGSGDTSSLIDPD 290 300 310 320 330 140 150 160 170 180 190 pF1KB6 ASIREIKELNELKDQIQDVEGKYMQGLKEMKDSLAEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKTNFMY .:. :.... .::::::::::.:::::::.:.::.::::::::::::::::::::.:..: CCDS26 TSLSELRDIYDLKDQIQDVEGRYMQGLKELKESLSEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKNNLIY 340 350 360 370 380 390 200 210 220 230 240 250 pF1KB6 QVDTLKDMLLELEEQLAESRRQYEEKNKEFEREKHAHSILQFQFAEVKEALKQREEMLEK :::::::.. : :::.:: :. :::.::.::.:: :.:: .. :.::.:.::.:..: CCDS26 QVDTLKDVIEEQEEQMAEFYRENEEKSKELERQKHMCSVLQHKMEELKEGLRQRDELIE- 400 410 420 430 440 450 260 270 280 290 300 310 pF1KB6 HGIILNSEIATNGETSDTLNNVGYQGPTKMTKEELNALKSTGDGTLGRASEVEVKNEIVA : . :: :::: .. :. : . . .: ..: .: CCDS26 -------EKQRMQQKIDT-----------MTKEVFD-LQETLLWKDKKIGALEKQKEYIA 460 470 480 490 320 330 340 350 360 pF1KB6 NV-GKREILHNTEKEQHTEDTVK--DCVDIEVFPAGENTEDQKSSEDTAPFLGTLAGATY . ..:..:. :. ..::: . . ..: : . : : : : :.. : CCDS26 CLRNERDMLR--EELADLQETVKTGEKHGLVIIPDGTPNGDV-SHE---PVAGAI---TV 500 510 520 530 540 370 380 390 400 410 420 pF1KB6 EEQVQSQILESSSLPENTVQVESNEVMGAPDDRTRTPLEPSNCWSDLDGGNHTENVGEAA : .:.:::.. :. ..:. .. : .. CCDS26 VSQEAAQVLESAG--EGPLDVRLRKLAGEKEELLSQIRKLKLQLEEERQKCSRNDGTVGD 550 560 570 580 590 600 430 440 450 460 470 480 pF1KB6 VTQVEEQAGTVASCPLGHSDDTVYHDDKCMVEVPQELETSTGHSLEKEFTNQEAAEPKEV CCDS26 LAGLQNGSDLQFIEMQRDANRQISEYKFKLSKAEQDITTLEQSISRLEGQVLRYKTAAEN 610 620 630 640 650 660 >>CCDS2665.1 LRRFIP2 gene_id:9209|Hs108|chr3 (400 aa) initn: 706 init1: 422 opt: 474 Z-score: 311.6 bits: 67.5 E(32554): 4.9e-11 Smith-Waterman score: 641; 37.3% identity (62.9% similar) in 410 aa overlap (1-389:1-351) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MTSPAAAQSREI--DCLSPEAQKL------AEARLAAKRAARAEAREIRMKELERQQKEE : .::....: : .: : . : ::::::::::::::::.:::.:::::::: CCDS26 MGTPASGRKRTPVKDRFSAEDEALSNIAREAEARLAAKRAARAEARDIRMRELERQQKEL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 DSERYSRRSRRNTSASDEDERMSVGSRGSLRVEERPEKDFTEKGSRNMPGLSAATLASLG : . ::.. ...:. .::: ::.. . :. CCDS26 DEK------------SDKQY----------------AENYTRPSSRN----SASATTPLS 70 80 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 GTSSRRGSGDTSISIDTEASIREIKELNELKDQIQDVEGKYMQGLKEMKDSLAEVEEKYK :.:::::::::: :: ..: :.:...::.::::::: CCDS26 GNSSRRGSGDTSSLIDPDTS------------------------LSELRESLSEVEEKYK 90 100 110 120 180 190 200 210 220 230 pF1KB6 KAMVSNAQLDNEKTNFMYQVDTLKDMLLELEEQLAESRRQYEEKNKEFEREKHAHSILQF :::::::::::::.:..::::::::.. : :::.:: :. :::.::.::.:: :.:: CCDS26 KAMVSNAQLDNEKNNLIYQVDTLKDVIEEQEEQMAEFYRENEEKSKELERQKHMCSVLQH 130 140 150 160 170 180 240 250 260 270 280 290 pF1KB6 QFAEVKEALKQREEMLEKHGIILNSEIATNGETSDTLNNVGYQGPTKMTKEELNALKSTG .. :.::.:.::.:..::::... . . ::..: .: . : ...: ..:.:.: CCDS26 KMEELKEGLRQRDELIEKHGLVIIPDGTPNGDVSHE-PVAG--AITVVSQEAAQVLESAG 190 200 210 220 230 240 300 310 320 330 340 pF1KB6 DGTLG-RASEVE-VKNEIVANVGKREILHNTEKEQHTED--TVKDCVDIEVFPAGENTED .: : : .. :.:..... : .. . :... ... :: : . .. . : CCDS26 EGPLDVRLRKLAGEKEELLSQIRKLKLQLEEERQKCSRNDGTVGDLAGLQNGSDLQFIEM 250 260 270 280 290 300 350 360 370 380 390 pF1KB6 QK-SSEDTAPFLGTLAGA-----TYEEQV---QSQILESSSLPENTVQVESNEVMGAPDD :. .... . . :. : : :... ..:.:. .. ::. .:: CCDS26 QRDANRQISEYKFKLSKAEQDITTLEQSISRLEGQVLRYKTAAENAEKVEDELKAEKRKL 310 320 330 340 350 360 400 410 420 430 440 450 pF1KB6 RTRTPLEPSNCWSDLDGGNHTENVGEAAVTQVEEQAGTVASCPLGHSDDTVYHDDKCMVE CCDS26 QRELRTALDKIEEMEMTNSHLAKRLEKMKANRTALLAQQ 370 380 390 400 808 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 06:24:31 2016 done: Tue Nov 8 06:24:32 2016 Total Scan time: 4.710 Total Display time: 0.120 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]