Result of FASTA (ccds) for pFN21AB6295
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6295, 808 aa
  1>>>pF1KB6295 808 - 808 aa - 808 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7093+/-0.00123; mu= -3.9383+/- 0.074
 mean_var=266.8582+/-52.241, 0's: 0 Z-trim(109.8): 19  B-trim: 14 in 1/51
 Lambda= 0.078512
 statistics sampled from 11145 (11162) to 11145 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.673), E-opt: 0.2 (0.343), width:  16
 Scan time:  4.710

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS46552.1 LRRFIP1 gene_id:9208|Hs108|chr2        ( 808) 5214 604.6 2.1e-172
CCDS2521.1 LRRFIP1 gene_id:9208|Hs108|chr2         ( 784) 4242 494.5 2.9e-139
CCDS46553.1 LRRFIP1 gene_id:9208|Hs108|chr2        ( 752) 4229 493.0 7.7e-139
CCDS46551.1 LRRFIP1 gene_id:9208|Hs108|chr2        ( 640) 1084 136.7 1.2e-31
CCDS46791.1 LRRFIP2 gene_id:9209|Hs108|chr3        ( 424)  733 96.9 7.6e-20
CCDS2664.1 LRRFIP2 gene_id:9209|Hs108|chr3         ( 721)  677 90.7 9.6e-18
CCDS2665.1 LRRFIP2 gene_id:9209|Hs108|chr3         ( 400)  474 67.5 4.9e-11


>>CCDS46552.1 LRRFIP1 gene_id:9208|Hs108|chr2             (808 aa)
 initn: 5214 init1: 5214 opt: 5214  Z-score: 3208.6  bits: 604.6 E(32554): 2.1e-172
Smith-Waterman score: 5214; 99.9% identity (100.0% similar) in 808 aa overlap (1-808:1-808)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MTSPAAAQSREIDCLSPEAQKLAEARLAAKRAARAEAREIRMKELERQQKEEDSERYSRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MTSPAAAQSREIDCLSPEAQKLAEARLAAKRAARAEAREIRMKELERQQKEEDSERYSRR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 SRRNTSASDEDERMSVGSRGSLRVEERPEKDFTEKGSRNMPGLSAATLASLGGTSSRRGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SRRNTSASDEDERMSVGSRGSLRVEERPEKDFTEKGSRNMPGLSAATLASLGGTSSRRGS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 GDTSISIDTEASIREIKELNELKDQIQDVEGKYMQGLKEMKDSLAEVEEKYKKAMVSNAQ
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CCDS46 GDTSISIDTEASIREIKELNELKDQIQDVEGKYMQGLKEMKDSLAEVEEKYKKAMVSNAQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 LDNEKTNFMYQVDTLKDMLLELEEQLAESRRQYEEKNKEFEREKHAHSILQFQFAEVKEA
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CCDS46 LDNEKTNFMYQVDTLKDMLLELEEQLAESRRQYEEKNKEFEREKHAHSILQFQFAEVKEA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 LKQREEMLEKHGIILNSEIATNGETSDTLNNVGYQGPTKMTKEELNALKSTGDGTLGRAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LKQREEMLEKHGIILNSEIATNGETSDTLNNVGYQGPTKMTKEELNALKSTGDGTLGRAS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 EVEVKNEIVANVGKREILHNTEKEQHTEDTVKDCVDIEVFPAGENTEDQKSSEDTAPFLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EVEVKNEIVANVGKREILHNTEKEQHTEDTVKDCVDIEVFPAGENTEDQKSSEDTAPFLG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 TLAGATYEEQVQSQILESSSLPENTVQVESNEVMGAPDDRTRTPLEPSNCWSDLDGGNHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TLAGATYEEQVQSQILESSSLPENTVQVESNEVMGAPDDRTRTPLEPSNCWSDLDGGNHT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 ENVGEAAVTQVEEQAGTVASCPLGHSDDTVYHDDKCMVEVPQELETSTGHSLEKEFTNQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ENVGEAAVTQVEEQAGTVASCPLGHSDDTVYHDDKCMVEVPQELETSTGHSLEKEFTNQE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 AAEPKEVPAHSTEVGRDHNEEEGEETGLRDEKPIKTEVPGSPAGTEGNCQEATGPSTVDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AAEPKEVPAHSTEVGRDHNEEEGEETGLRDEKPIKTEVPGSPAGTEGNCQEATGPSTVDT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 QNEPLDMKEPDEEKSDQQGEAFDSSQKKTKNKKKKNKKKKSPVPVETLKDVKKELTYQNT
       :::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QNEPLDMKEPDEEKSDQQGEALDSSQKKTKNKKKKNKKKKSPVPVETLKDVKKELTYQNT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB6 DLSEIKEEEQVKSTDRKSAVEAQNEVTENPKQKIAAESSENVDCPENPKIKLDGKLDQEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DLSEIKEEEQVKSTDRKSAVEAQNEVTENPKQKIAAESSENVDCPENPKIKLDGKLDQEG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB6 DDVQTAAEEVLADGDTLDFEDDTVQSSGPRAGGEELDEGVAKDNAKIDGATQSSPAEPKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DDVQTAAEEVLADGDTLDFEDDTVQSSGPRAGGEELDEGVAKDNAKIDGATQSSPAEPKS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB6 EDADRCTLPEHESPSQDISDACEAESTERCEMSEHPSQTVRKALDSNSLENDDLSAPGRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EDADRCTLPEHESPSQDISDACEAESTERCEMSEHPSQTVRKALDSNSLENDDLSAPGRE
              730       740       750       760       770       780

              790       800        
pF1KB6 PGHFNPESREDTRGGNEKGKSKEDCTMS
       ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PGHFNPESREDTRGGNEKGKSKEDCTMS
              790       800        

>>CCDS2521.1 LRRFIP1 gene_id:9208|Hs108|chr2              (784 aa)
 initn: 4229 init1: 4229 opt: 4242  Z-score: 2613.8  bits: 494.5 E(32554): 2.9e-139
Smith-Waterman score: 5001; 96.9% identity (97.0% similar) in 808 aa overlap (1-808:1-784)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MTSPAAAQSREIDCLSPEAQKLAEARLAAKRAARAEAREIRMKELERQQKEEDSERYSRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 MTSPAAAQSREIDCLSPEAQKLAEARLAAKRAARAEAREIRMKELERQQKEEDSERYSRR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 SRRNTSASDEDERMSVGSRGSLRVEERPEKDFTEKGSRNMPGLSAATLASLGGTSSRRGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 SRRNTSASDEDERMSVGSRGSLRVEERPEKDFTEKGSRNMPGLSAATLASLGGTSSRRGS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 GDTSISIDTEASIREIKELNELKDQIQDVEGKYMQGLKEMKDSLAEVEEKYKKAMVSNAQ
       :::::::::::::::::                        :::::::::::::::::::
CCDS25 GDTSISIDTEASIREIK------------------------DSLAEVEEKYKKAMVSNAQ
              130                               140       150      

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 LDNEKTNFMYQVDTLKDMLLELEEQLAESRRQYEEKNKEFEREKHAHSILQFQFAEVKEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LDNEKTNFMYQVDTLKDMLLELEEQLAESRRQYEEKNKEFEREKHAHSILQFQFAEVKEA
        160       170       180       190       200       210      

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 LKQREEMLEKHGIILNSEIATNGETSDTLNNVGYQGPTKMTKEELNALKSTGDGTLGRAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LKQREEMLEKHGIILNSEIATNGETSDTLNNVGYQGPTKMTKEELNALKSTGDGTLGRAS
        220       230       240       250       260       270      

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 EVEVKNEIVANVGKREILHNTEKEQHTEDTVKDCVDIEVFPAGENTEDQKSSEDTAPFLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 EVEVKNEIVANVGKREILHNTEKEQHTEDTVKDCVDIEVFPAGENTEDQKSSEDTAPFLG
        280       290       300       310       320       330      

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 TLAGATYEEQVQSQILESSSLPENTVQVESNEVMGAPDDRTRTPLEPSNCWSDLDGGNHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 TLAGATYEEQVQSQILESSSLPENTVQVESNEVMGAPDDRTRTPLEPSNCWSDLDGGNHT
        340       350       360       370       380       390      

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 ENVGEAAVTQVEEQAGTVASCPLGHSDDTVYHDDKCMVEVPQELETSTGHSLEKEFTNQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 ENVGEAAVTQVEEQAGTVASCPLGHSDDTVYHDDKCMVEVPQELETSTGHSLEKEFTNQE
        400       410       420       430       440       450      

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 AAEPKEVPAHSTEVGRDHNEEEGEETGLRDEKPIKTEVPGSPAGTEGNCQEATGPSTVDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 AAEPKEVPAHSTEVGRDHNEEEGEETGLRDEKPIKTEVPGSPAGTEGNCQEATGPSTVDT
        460       470       480       490       500       510      

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 QNEPLDMKEPDEEKSDQQGEAFDSSQKKTKNKKKKNKKKKSPVPVETLKDVKKELTYQNT
       :::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 QNEPLDMKEPDEEKSDQQGEALDSSQKKTKNKKKKNKKKKSPVPVETLKDVKKELTYQNT
        520       530       540       550       560       570      

              610       620       630       640       650       660
pF1KB6 DLSEIKEEEQVKSTDRKSAVEAQNEVTENPKQKIAAESSENVDCPENPKIKLDGKLDQEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 DLSEIKEEEQVKSTDRKSAVEAQNEVTENPKQKIAAESSENVDCPENPKIKLDGKLDQEG
        580       590       600       610       620       630      

              670       680       690       700       710       720
pF1KB6 DDVQTAAEEVLADGDTLDFEDDTVQSSGPRAGGEELDEGVAKDNAKIDGATQSSPAEPKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 DDVQTAAEEVLADGDTLDFEDDTVQSSGPRAGGEELDEGVAKDNAKIDGATQSSPAEPKS
        640       650       660       670       680       690      

              730       740       750       760       770       780
pF1KB6 EDADRCTLPEHESPSQDISDACEAESTERCEMSEHPSQTVRKALDSNSLENDDLSAPGRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 EDADRCTLPEHESPSQDISDACEAESTERCEMSEHPSQTVRKALDSNSLENDDLSAPGRE
        700       710       720       730       740       750      

              790       800        
pF1KB6 PGHFNPESREDTRGGNEKGKSKEDCTMS
       ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 PGHFNPESREDTRGGNEKGKSKEDCTMS
        760       770       780    

>>CCDS46553.1 LRRFIP1 gene_id:9208|Hs108|chr2             (752 aa)
 initn: 4529 init1: 4229 opt: 4229  Z-score: 2606.1  bits: 493.0 E(32554): 7.7e-139
Smith-Waterman score: 4725; 92.9% identity (93.1% similar) in 808 aa overlap (1-808:1-752)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MTSPAAAQSREIDCLSPEAQKLAEARLAAKRAARAEAREIRMKELERQQKEEDSERYSRR
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::         
CCDS46 MTSPAAAQSREIDCLSPEAQKLAEARLAAKRAARAEAREIRMKELERQQKE---------
               10        20        30        40        50          

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 SRRNTSASDEDERMSVGSRGSLRVEERPEKDFTEKGSRNMPGLSAATLASLGGTSSRRGS
                              :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 -----------------------VEERPEKDFTEKGSRNMPGLSAATLASLGGTSSRRGS
                                     60        70        80        

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 GDTSISIDTEASIREIKELNELKDQIQDVEGKYMQGLKEMKDSLAEVEEKYKKAMVSNAQ
       :::::::::::::::::                        :::::::::::::::::::
CCDS46 GDTSISIDTEASIREIK------------------------DSLAEVEEKYKKAMVSNAQ
       90       100                               110       120    

              190       200       210       220       230       240
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LDNEKTNFMYQVDTLKDMLLELEEQLAESRRQYEEKNKEFEREKHAHSILQFQFAEVKEA
          130       140       150       160       170       180    

              250       260       270       280       290       300
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LKQREEMLEKHGIILNSEIATNGETSDTLNNVGYQGPTKMTKEELNALKSTGDGTLGRAS
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pF1KB6 EVEVKNEIVANVGKREILHNTEKEQHTEDTVKDCVDIEVFPAGENTEDQKSSEDTAPFLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EVEVKNEIVANVGKREILHNTEKEQHTEDTVKDCVDIEVFPAGENTEDQKSSEDTAPFLG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TLAGATYEEQVQSQILESSSLPENTVQVESNEVMGAPDDRTRTPLEPSNCWSDLDGGNHT
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ENVGEAAVTQVEEQAGTVASCPLGHSDDTVYHDDKCMVEVPQELETSTGHSLEKEFTNQE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AAEPKEVPAHSTEVGRDHNEEEGEETGLRDEKPIKTEVPGSPAGTEGNCQEATGPSTVDT
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       :::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QNEPLDMKEPDEEKSDQQGEALDSSQKKTKNKKKKNKKKKSPVPVETLKDVKKELTYQNT
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DLSEIKEEEQVKSTDRKSAVEAQNEVTENPKQKIAAESSENVDCPENPKIKLDGKLDQEG
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pF1KB6 DDVQTAAEEVLADGDTLDFEDDTVQSSGPRAGGEELDEGVAKDNAKIDGATQSSPAEPKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DDVQTAAEEVLADGDTLDFEDDTVQSSGPRAGGEELDEGVAKDNAKIDGATQSSPAEPKS
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pF1KB6 EDADRCTLPEHESPSQDISDACEAESTERCEMSEHPSQTVRKALDSNSLENDDLSAPGRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EDADRCTLPEHESPSQDISDACEAESTERCEMSEHPSQTVRKALDSNSLENDDLSAPGRE
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pF1KB6 PGHFNPESREDTRGGNEKGKSKEDCTMS
       ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PGHFNPESREDTRGGNEKGKSKEDCTMS
          730       740       750  

>>CCDS46551.1 LRRFIP1 gene_id:9208|Hs108|chr2             (640 aa)
 initn: 1392 init1: 1046 opt: 1084  Z-score: 682.0  bits: 136.7 E(32554): 1.2e-31
Smith-Waterman score: 1228; 57.3% identity (69.5% similar) in 417 aa overlap (47-389:176-591)

         20        30        40        50        60        70      
pF1KB6 PEAQKLAEARLAAKRAARAEAREIRMKELERQQKEEDSERYSRRSRRNTSASDEDERMSV
                                     :. .   :.  :. : . .:.:  . : : 
CCDS46 SGRPSCLYSAARPSGSYRASVLDEGSFGGTRRGSTSGSRAPSEYSGHLNSSSRASSRAS-
         150       160       170       180       190       200     

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pF1KB6 GSRGSLRVEERPEKDFTEKGSRNMPGLSAATLASLGGTSSRRGSGDTSISIDTEASIREI
       ..:.:  :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SARASPVVEERPEKDFTEKGSRNMPGLSAATLASLGGTSSRRGSGDTSISIDTEASIREI
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        140       150       160       170       180       190      
pF1KB6 KELNELKDQIQDVEGKYMQGLKEMKDSLAEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKTNFMYQVDTLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KELNELKDQIQDVEGKYMQGLKEMKDSLAEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKTNFMYQVDTLK
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        200       210       220       230       240                
pF1KB6 DMLLELEEQLAESRRQYEEKNKEFEREKHAHSILQFQFAEVKEALKQREEMLE-------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::       
CCDS46 DMLLELEEQLAESRRQYEEKNKEFEREKHAHSILQFQFAEVKEALKQREEMLEEIRQLQQ
          330       340       350       360       370       380    

                                                            250    
pF1KB6 -------------------------------------------------------KHGII
                                                              :::::
CCDS46 KQASSIREISDLQETIEWKDKKIGALERQKEFFDSVRSERDDLREEVVMLKEELKKHGII
          390       400       410       420       430       440    

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pF1KB6 LNSEIATNGETSDTLNNVGYQGPTKMTKEELNALKSTGDGTLG---------RASEVEVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::          :   .:  
CCDS46 LNSEIATNGETSDTLNNVGYQGPTKMTKEELNALKSTGDGTLDIRLKKLVDERECLLEQI
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pF1KB6 NEIVANVGKREILHNTEKEQHTEDTVKDCVDIEVFPAGENTEDQKSSEDTAPFLGTLAGA
       ... ... .:. . . .. .  .:.... .:..:.   .... : :.       .    .
CCDS46 KKLKGQLEERQKIGKLDNLRSEDDVLENGTDMHVMDLQRDANRQISDLKFKLAKSEQEIT
          510       520       530       540       550       560    

         370          380       390       400       410       420  
pF1KB6 TYEEQV---QSQILESSSLPENTVQVESNEVMGAPDDRTRTPLEPSNCWSDLDGGNHTEN
       . :..:   .::. . .:  ::. ..:                                 
CCDS46 ALEQNVIRLESQVSRYKSAAENAEKIEDELKAEKRKLQRELRSALDKTEELEVSNGHLVK
          570       580       590       600       610       620    

>>CCDS46791.1 LRRFIP2 gene_id:9209|Hs108|chr3             (424 aa)
 initn: 893 init1: 662 opt: 733  Z-score: 469.8  bits: 96.9 E(32554): 7.6e-20
Smith-Waterman score: 822; 41.5% identity (68.3% similar) in 410 aa overlap (1-389:1-375)

               10          20              30        40        50  
pF1KB6 MTSPAAAQSREI--DCLSPEAQKL------AEARLAAKRAARAEAREIRMKELERQQKEE
       : .::....:    : .: : . :      ::::::::::::::::.:::.:::::::: 
CCDS46 MGTPASGRKRTPVKDRFSAEDEALSNIAREAEARLAAKRAARAEARDIRMRELERQQKEL
               10        20        30        40        50        60

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB6 DSERYSRRSRRNTSASDEDERMSVGSRGSLRVEERPEKDFTEKGSRNMPGLSAATLASLG
       : .            ::..                  ...:. .:::    ::.. . :.
CCDS46 DEK------------SDKQY----------------AENYTRPSSRN----SASATTPLS
                                           70            80        

            120       130       140       150       160       170  
pF1KB6 GTSSRRGSGDTSISIDTEASIREIKELNELKDQIQDVEGKYMQGLKEMKDSLAEVEEKYK
       :.::::::::::  :: ..:. :.... .::::::::::.:::::::.:.::.:::::::
CCDS46 GNSSRRGSGDTSSLIDPDTSLSELRDIYDLKDQIQDVEGRYMQGLKELKESLSEVEEKYK
       90       100       110       120       130       140        

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB6 KAMVSNAQLDNEKTNFMYQVDTLKDMLLELEEQLAESRRQYEEKNKEFEREKHAHSILQF
       :::::::::::::.:..::::::::.. : :::.::  :. :::.::.::.::  :.:: 
CCDS46 KAMVSNAQLDNEKNNLIYQVDTLKDVIEEQEEQMAEFYRENEEKSKELERQKHMCSVLQH
      150       160       170       180       190       200        

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB6 QFAEVKEALKQREEMLEKHGIILNSEIATNGETSDTLNNVGYQGPTKMTKEELNALKSTG
       .. :.::.:.::.:..::::...  . . ::..:     .:  . : ...:  ..:.:.:
CCDS46 KMEELKEGLRQRDELIEKHGLVIIPDGTPNGDVSHE-PVAG--AITVVSQEAAQVLESAG
      210       220       230       240          250       260     

             300        310       320         330       340        
pF1KB6 DGTLG-RASEVE-VKNEIVANVGKREILHNTEKEQHTED--TVKDCVDIEVFPAGENTED
       .: :  :  ..   :.:..... : ..  . :... ...  :: : . ..     .  : 
CCDS46 EGPLDVRLRKLAGEKEELLSQIRKLKLQLEEERQKCSRNDGTVGDLAGLQNGSDLQFIEM
         270       280       290       300       310       320     

      350        360            370          380       390         
pF1KB6 QK-SSEDTAPFLGTLAGA-----TYEEQV---QSQILESSSLPENTVQVESNEVMGAPDD
       :. .... . .   :. :     : :...   ..:.:. ..  ::. .::          
CCDS46 QRDANRQISEYKFKLSKAEQDITTLEQSISRLEGQVLRYKTAAENAEKVEDELKAEKRKL
         330       340       350       360       370       380     

     400       410       420       430       440       450         
pF1KB6 RTRTPLEPSNCWSDLDGGNHTENVGEAAVTQVEEQAGTVASCPLGHSDDTVYHDDKCMVE
                                                                   
CCDS46 QRELRTALDKIEEMEMTNSHLAKRLEKMKANRTALLAQQ                     
         390       400       410       420                         

>>CCDS2664.1 LRRFIP2 gene_id:9209|Hs108|chr3              (721 aa)
 initn: 861 init1: 616 opt: 677  Z-score: 432.0  bits: 90.7 E(32554): 9.6e-18
Smith-Waterman score: 679; 39.5% identity (67.1% similar) in 362 aa overlap (41-399:252-579)

               20        30        40        50        60        70
pF1KB6 EIDCLSPEAQKLAEARLAAKRAARAEAREIRMKELERQQKEEDSERYSRRSRRNTSASDE
                                     : .. .:..    .. .:: .::.. .:. 
CCDS26 ECSYYSSRISSARSSPGFTNDDTASIVSSDRASRGRRESVVSAADYFSRSNRRGSVVSEV
             230       240       250       260       270       280 

               80        90       100       110       120       130
pF1KB6 DERMSVGSRGSLRVEERPEKDFTEKGSRNMPGLSAATLASLGGTSSRRGSGDTSISIDTE
       :. .:. . .::  .:. .:...:. .:     ::.. . :.:.::::::::::  :: .
CCDS26 DD-ISIPDLSSL--DEKSDKQYAENYTRPSSRNSASATTPLSGNSSRRGSGDTSSLIDPD
              290         300       310       320       330        

              140       150       160       170       180       190
pF1KB6 ASIREIKELNELKDQIQDVEGKYMQGLKEMKDSLAEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKTNFMY
       .:. :.... .::::::::::.:::::::.:.::.::::::::::::::::::::.:..:
CCDS26 TSLSELRDIYDLKDQIQDVEGRYMQGLKELKESLSEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKNNLIY
      340       350       360       370       380       390        

              200       210       220       230       240       250
pF1KB6 QVDTLKDMLLELEEQLAESRRQYEEKNKEFEREKHAHSILQFQFAEVKEALKQREEMLEK
       :::::::.. : :::.::  :. :::.::.::.::  :.:: .. :.::.:.::.:..: 
CCDS26 QVDTLKDVIEEQEEQMAEFYRENEEKSKELERQKHMCSVLQHKMEELKEGLRQRDELIE-
      400       410       420       430       440       450        

              260       270       280       290       300       310
pF1KB6 HGIILNSEIATNGETSDTLNNVGYQGPTKMTKEELNALKSTGDGTLGRASEVEVKNEIVA
              :     .  ::           :::: .. :. :      . . .: ..: .:
CCDS26 -------EKQRMQQKIDT-----------MTKEVFD-LQETLLWKDKKIGALEKQKEYIA
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        . ..:..:.  :.    ..:::  .   . ..: :  . :  : :   :  :..   : 
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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