Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2651
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2651, 827 aa
1>>>pF1KE2651 827 - 827 aa - 827 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2237+/-0.000456; mu= 21.4389+/- 0.028
mean_var=76.6243+/-15.152, 0's: 0 Z-trim(109.9): 226 B-trim: 140 in 1/56
Lambda= 0.146518
statistics sampled from 17892 (18120) to 17892 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.555), E-opt: 0.2 (0.212), width: 16
Scan time: 11.070
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_009058 (OMIM: 193040) villin-1 [Homo sapiens] ( 827) 5543 1182.2 0
XP_016874199 (OMIM: 613397) PREDICTED: advillin is ( 819) 3489 748.0 3.9e-215
NP_006567 (OMIM: 613397) advillin [Homo sapiens] ( 819) 3489 748.0 3.9e-215
XP_016874200 (OMIM: 613397) PREDICTED: advillin is ( 796) 3436 736.8 9e-212
XP_016874202 (OMIM: 613397) PREDICTED: advillin is ( 796) 3436 736.8 9e-212
XP_016874201 (OMIM: 613397) PREDICTED: advillin is ( 796) 3436 736.8 9e-212
XP_011516895 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 731) 2350 507.2 1.1e-142
XP_005252002 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 731) 2350 507.2 1.1e-142
NP_001121137 (OMIM: 105120,137350) gelsolin isofor ( 731) 2350 507.2 1.1e-142
NP_937895 (OMIM: 105120,137350) gelsolin isoform b ( 731) 2350 507.2 1.1e-142
NP_001121136 (OMIM: 105120,137350) gelsolin isofor ( 731) 2350 507.2 1.1e-142
XP_011516894 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 731) 2350 507.2 1.1e-142
NP_001121134 (OMIM: 105120,137350) gelsolin isofor ( 731) 2350 507.2 1.1e-142
XP_011516893 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 731) 2350 507.2 1.1e-142
NP_001244959 (OMIM: 105120,137350) gelsolin isofor ( 739) 2350 507.2 1.1e-142
XP_006717142 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 742) 2350 507.2 1.1e-142
XP_016870135 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 742) 2350 507.2 1.1e-142
XP_005252001 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 742) 2350 507.2 1.1e-142
XP_011516888 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 742) 2350 507.2 1.1e-142
XP_011516891 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 742) 2350 507.2 1.1e-142
XP_011516889 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 742) 2350 507.2 1.1e-142
XP_005252000 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 742) 2350 507.2 1.1e-142
NP_001121138 (OMIM: 105120,137350) gelsolin isofor ( 742) 2350 507.2 1.1e-142
XP_016870136 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 742) 2350 507.2 1.1e-142
XP_011516892 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 742) 2350 507.2 1.1e-142
XP_011516890 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 742) 2350 507.2 1.1e-142
XP_016870137 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 742) 2350 507.2 1.1e-142
NP_001121139 (OMIM: 105120,137350) gelsolin isofor ( 742) 2350 507.2 1.1e-142
NP_001244958 (OMIM: 105120,137350) gelsolin isofor ( 748) 2350 507.2 1.1e-142
XP_016870134 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 752) 2350 507.2 1.1e-142
XP_011516887 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 761) 2350 507.2 1.1e-142
NP_001121135 (OMIM: 105120,137350) gelsolin isofor ( 767) 2350 507.2 1.1e-142
XP_016870132 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 780) 2350 507.2 1.1e-142
XP_011516886 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 780) 2350 507.2 1.1e-142
XP_016870133 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 780) 2350 507.2 1.1e-142
NP_000168 (OMIM: 105120,137350) gelsolin isoform a ( 782) 2350 507.2 1.1e-142
NP_001106177 (OMIM: 613416) adseverin isoform 1 [H ( 715) 2294 495.4 3.8e-139
XP_016874203 (OMIM: 613397) PREDICTED: advillin is ( 520) 2100 454.2 6.7e-127
XP_016874204 (OMIM: 613397) PREDICTED: advillin is ( 502) 2082 450.4 9.1e-126
XP_011516896 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 573) 1700 369.7 2e-101
NP_149119 (OMIM: 613416) adseverin isoform 2 [Homo ( 468) 1598 348.1 5.4e-95
XP_011531424 (OMIM: 153615) PREDICTED: macrophage- ( 348) 905 201.5 5.4e-51
XP_011531425 (OMIM: 153615) PREDICTED: macrophage- ( 348) 905 201.5 5.4e-51
NP_001307662 (OMIM: 153615) macrophage-capping pro ( 348) 905 201.5 5.4e-51
NP_001307661 (OMIM: 153615) macrophage-capping pro ( 348) 905 201.5 5.4e-51
NP_001243068 (OMIM: 153615) macrophage-capping pro ( 348) 905 201.5 5.4e-51
NP_001738 (OMIM: 153615) macrophage-capping protei ( 348) 905 201.5 5.4e-51
NP_001307663 (OMIM: 153615) macrophage-capping pro ( 317) 595 135.9 2.7e-31
NP_001243069 (OMIM: 153615) macrophage-capping pro ( 333) 577 132.2 3.9e-30
NP_001243194 (OMIM: 600362) protein flightless-1 h (1214) 489 114.0 4.1e-24
>>NP_009058 (OMIM: 193040) villin-1 [Homo sapiens] (827 aa)
initn: 5543 init1: 5543 opt: 5543 Z-score: 6329.8 bits: 1182.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5543; 100.0% identity (100.0% similar) in 827 aa overlap (1-827:1-827)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTKLSAQVKGSLNITTPGLQIWRIEAMQMVPVPSSTFGSFFDGDCYIILAIHKTASSLSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 MTKLSAQVKGSLNITTPGLQIWRIEAMQMVPVPSSTFGSFFDGDCYIILAIHKTASSLSY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 DIHYWIGQDSSLDEQGAAAIYTTQMDDFLKGRAVQHREVQGNESEAFRGYFKQGLVIRKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 DIHYWIGQDSSLDEQGAAAIYTTQMDDFLKGRAVQHREVQGNESEAFRGYFKQGLVIRKG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GVASGMKHVETNSYDVQRLLHVKGKRNVVAGEVEMSWKSFNRGDVFLLDLGKLIIQWNGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 GVASGMKHVETNSYDVQRLLHVKGKRNVVAGEVEMSWKSFNRGDVFLLDLGKLIIQWNGP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ESTRMERLRGMTLAKEIRDQERGGRTYVGVVDGENELASPKLMEVMNHVLGKRRELKAAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 ESTRMERLRGMTLAKEIRDQERGGRTYVGVVDGENELASPKLMEVMNHVLGKRRELKAAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PDTVVEPALKAALKLYHVSDSEGNLVVREVATRPLTQDLLSHEDCYILDQGGLKIYVWKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 PDTVVEPALKAALKLYHVSDSEGNLVVREVATRPLTQDLLSHEDCYILDQGGLKIYVWKG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 KKANEQEKKGAMSHALNFIKAKQYPPSTQVEVQNDGAESAVFQQLFQKWTASNRTSGLGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 KKANEQEKKGAMSHALNFIKAKQYPPSTQVEVQNDGAESAVFQQLFQKWTASNRTSGLGK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 THTVGSVAKVEQVKFDATSMHVKPQVAAQQKMVDDGSGEVQVWRIENLELVPVDSKWLGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 THTVGSVAKVEQVKFDATSMHVKPQVAAQQKMVDDGSGEVQVWRIENLELVPVDSKWLGH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 FYGGDCYLLLYTYLIGEKQHYLLYVWQGSQASQDEITASAYQAVILDQKYNGEPVQIRVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 FYGGDCYLLLYTYLIGEKQHYLLYVWQGSQASQDEITASAYQAVILDQKYNGEPVQIRVP
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pF1KE2 MGKEPPHLMSIFKGRMVVYQGGTSRTNNLETGPSTRLFQVQGTGANNTKAFEVPARANFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 MGKEPPHLMSIFKGRMVVYQGGTSRTNNLETGPSTRLFQVQGTGANNTKAFEVPARANFL
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pF1KE2 NSNDVFVLKTQSCCYLWCGKGCSGDEREMAKMVADTISRTEKQVVVEGQEPANFWMALGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 NSNDVFVLKTQSCCYLWCGKGCSGDEREMAKMVADTISRTEKQVVVEGQEPANFWMALGG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 KAPYANTKRLQEENLVITPRLFECSNKTGRFLATEIPDFNQDDLEEDDVFLLDVWDQVFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 KAPYANTKRLQEENLVITPRLFECSNKTGRFLATEIPDFNQDDLEEDDVFLLDVWDQVFF
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670 680 690 700 710 720
pF1KE2 WIGKHANEEEKKAAATTAQEYLKTHPSGRDPETPIIVVKQGHEPPTFTGWFLAWDPFKWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 WIGKHANEEEKKAAATTAQEYLKTHPSGRDPETPIIVVKQGHEPPTFTGWFLAWDPFKWS
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730 740 750 760 770 780
pF1KE2 NTKSYEDLKAELGNSRDWSQITAEVTSPKVDVFNANSNLSSGPLPIFPLEQLVNKPVEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 NTKSYEDLKAELGNSRDWSQITAEVTSPKVDVFNANSNLSSGPLPIFPLEQLVNKPVEEL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820
pF1KE2 PEGVDPSRKEEHLSIEDFTQAFGMTPAAFSALPRWKQQNLKKEKGLF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 PEGVDPSRKEEHLSIEDFTQAFGMTPAAFSALPRWKQQNLKKEKGLF
790 800 810 820
>>XP_016874199 (OMIM: 613397) PREDICTED: advillin isofor (819 aa)
initn: 3821 init1: 3282 opt: 3489 Z-score: 3983.4 bits: 748.0 E(85289): 3.9e-215
Smith-Waterman score: 3489; 61.8% identity (84.6% similar) in 811 aa overlap (17-827:14-819)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTKLSAQVKGSLNITTPGLQIWRIEAMQMVPVPSSTFGSFFDGDCYIILAIHKTASSLSY
::. .:::: :... :: :. :.:..::::.::. ...:: ::
XP_016 MPLTSAFRAVDNDPGIIVWRIEKMELALVPVSAHGNFYEGDCYVILSTRRVASLLSQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 DIHYWIGQDSSLDEQGAAAIYTTQMDDFLKGRAVQHREVQGNESEAFRGYFKQGLVIRKG
:::.:::.::: :::. :::::::.::.: : ::::::: .::..::::::::.. ..:
XP_016 DIHFWIGKDSSQDEQSCAAIYTTQLDDYLGGSPVQHREVQYHESDTFRGYFKQGIIYKQG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GVASGMKHVETNSYDVQRLLHVKGKRNVVAGEVEMSWKSFNRGDVFLLDLGKLIIQWNGP
::::::::::::.:::.::::::::::. : :::::: ::::::::::::::.:::::::
XP_016 GVASGMKHVETNTYDVKRLLHVKGKRNIRATEVEMSWDSFNRGDVFLLDLGKVIIQWNGP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ESTRMERLRGMTLAKEIRDQERGGRTYVGVVDGENELASPKLMEVMNHVLGKRRELKAAV
::. :::..: :::.:::.:::::. .::..:..: :::.::.:.. .::.: .: .:
XP_016 ESNSGERLKAMLLAKDIRDRERGGRAKIGVIEGDKEAASPELMKVLQDTLGRRSIIKPTV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PDTVVEPALKAALKLYHVSDSEGNLVVREVATRPLTQDLLSHEDCYILDQGGLKIYVWKG
:: ... :... :::.::: :.:.: :::::::.::::.:.:::::::.: :::::::
XP_016 PDEIIDQKQKSTIMLYHISDSAGQLAVTEVATRPLVQDLLNHDDCYILDQSGTKIYVWKG
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 KKANEQEKKGAMSHALNFIKAKQYPPSTQVEVQNDGAESAVFQQLFQKWTASNRTSGLGK
: :.. ::..:::.::.::: :.:: ::.::. :::::::.:.::::::.....: ::::
XP_016 KGATKAEKQAAMSKALGFIKMKSYPSSTNVETVNDGAESAMFKQLFQKWSVKDQTMGLGK
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 THTVGSVAKVEQVKFDATSMHVKPQVAAQQKMVDDGSGEVQVWRIENLELVPVDSKWLGH
: ..:..::: : :::.: .:.::.::::..:::::.:.:.::::::::::::. .: :
XP_016 TFSIGKIAKVFQDKFDVTLLHTKPEVAAQERMVDDGNGKVEVWRIENLELVPVEYQWYGF
360 370 380 390 400 410
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pF1KE2 FYGGDCYLLLYTYLIGEKQHYLLYVWQGSQASQDEITASAYQAVILDQKYNGEPVQIRVP
::::::::.:::: .. : :..::.::: .:::::..::::::: .:....: ::.::
XP_016 FYGGDCYLVLYTYEVNGKPHHILYIWQGRHASQDELAASAYQAVEVDRQFDGAAVQVRVR
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 MGKEPPHLMSIFKGRMVVYQGGTSRTNNLETGPSTRLFQVQGTGANNTKAFEVPARANFL
:: :: :.:.::::..:...::::: .: : : .::::..:. .:::: :::: :. :
XP_016 MGTEPRHFMAIFKGKLVIFEGGTSRKGNAEPDPPVRLFQIHGNDKSNTKAVEVPAFASSL
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 NSNDVFVLKTQSCCYLWCGKGCSGDEREMAKMVADTISRTEKQVVVEGQEPANFWMALGG
::::::.:.::. ::: ::: ::::: ::: .:. . ...:.::::::.:: :::
XP_016 NSNDVFLLRTQAEHYLWYGKGSSGDERAMAKELASLLCDGSENTVAEGQEPAEFWDLLGG
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 KAPYANTKRLQEENLVITPRLFECSNKTGRFLATEIPDFNQDDLEEDDVFLLDVWDQVFF
:.:::: ::::.: : . ::::::::::.:..::: ::.::::. ::.:::.:::::.
XP_016 KTPYANDKRLQQEILDVQSRLFECSNKTGQFVVTEITDFTQDDLNPTDVMLLDTWDQVFL
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 WIGKHANEEEKKAAATTAQEYLKTHPSGRDPETPIIVVKQGHEPPTFTGWFLAWDPFKWS
::: .:: ::..: .:::.::.::::::::.:::...::: ::: :::::::::: ::
XP_016 WIGAEANATEKESALATAQQYLHTHPSGRDPDTPILIIKQGFEPPIFTGWFLAWDPNIWS
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 NTKSYEDLKAELGNSRDWSQITAEVTSPKVDVFNANSNLSSGPLPIFPLEQLVNKPVEEL
:.::.:: :::.. .:::.. : ... ::: .: : .:. :... .::
XP_016 AGKTYEQLKEELGDAAAIMRITADM---KNATLSLNSN-DSEP-KYYPIAVLLKNQNQEL
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820
pF1KE2 PEGVDPSRKEEHLSIEDFTQAFGMTPAAFSALPRWKQQNLKKEKGLF
:: :.:..::..:: .::...::.: . :.::: ::: ..:::::::
XP_016 PEDVNPAKKENYLSEQDFVSVFGITRGQFAALPGWKQLQMKKEKGLF
780 790 800 810
>>NP_006567 (OMIM: 613397) advillin [Homo sapiens] (819 aa)
initn: 3821 init1: 3282 opt: 3489 Z-score: 3983.4 bits: 748.0 E(85289): 3.9e-215
Smith-Waterman score: 3489; 61.8% identity (84.6% similar) in 811 aa overlap (17-827:14-819)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTKLSAQVKGSLNITTPGLQIWRIEAMQMVPVPSSTFGSFFDGDCYIILAIHKTASSLSY
::. .:::: :... :: :. :.:..::::.::. ...:: ::
NP_006 MPLTSAFRAVDNDPGIIVWRIEKMELALVPVSAHGNFYEGDCYVILSTRRVASLLSQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 DIHYWIGQDSSLDEQGAAAIYTTQMDDFLKGRAVQHREVQGNESEAFRGYFKQGLVIRKG
:::.:::.::: :::. :::::::.::.: : ::::::: .::..::::::::.. ..:
NP_006 DIHFWIGKDSSQDEQSCAAIYTTQLDDYLGGSPVQHREVQYHESDTFRGYFKQGIIYKQG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GVASGMKHVETNSYDVQRLLHVKGKRNVVAGEVEMSWKSFNRGDVFLLDLGKLIIQWNGP
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