Result of FASTA (ccds) for pFN21AE1960
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1960, 522 aa
  1>>>pF1KE1960 522 - 522 aa - 522 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7565+/-0.00101; mu= 16.2809+/- 0.061
 mean_var=81.0344+/-15.683, 0's: 0 Z-trim(104.5): 46  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.142475
 statistics sampled from 7875 (7920) to 7875 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.617), E-opt: 0.2 (0.243), width:  16
 Scan time:  2.610

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2340.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2           ( 522) 3432 715.6 3.4e-206
CCDS2338.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2           ( 521) 3116 650.7 1.2e-186
CCDS2339.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2           ( 479) 1695 358.6 9.4e-99
CCDS56159.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2          ( 455) 1547 328.1 1.3e-89
CCDS77506.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2          ( 247) 1469 311.9 5.3e-85
CCDS56160.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2          ( 478) 1460 310.3 3.3e-84
CCDS42799.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2           ( 496)  825 179.7 6.6e-45
CCDS2342.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2            ( 479)  733 160.8 3.2e-39
CCDS42798.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2           ( 538)  733 160.9 3.5e-39
CCDS2343.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2            ( 464)  711 156.3 7.1e-38
CCDS7581.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10           ( 303)  583 129.9 4.1e-30
CCDS7580.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10           ( 336)  583 129.9 4.5e-30
CCDS73200.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10          ( 388)  571 127.5 2.8e-29
CCDS58096.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10          ( 278)  568 126.8 3.3e-29
CCDS3836.1 CASP3 gene_id:836|Hs108|chr4            ( 277)  460 104.6 1.6e-22
CCDS3684.1 CASP6 gene_id:839|Hs108|chr4            ( 293)  409 94.1 2.4e-19
CCDS3685.1 CASP6 gene_id:839|Hs108|chr4            ( 204)  349 81.7   9e-16
CCDS12323.1 CASP14 gene_id:23581|Hs108|chr19       ( 242)  319 75.5 7.4e-14
CCDS5879.1 CASP2 gene_id:835|Hs108|chr7            ( 452)  320 75.9 1.1e-13
CCDS2345.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2            ( 235)  286 68.8   8e-12
CCDS8329.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11           ( 383)  285 68.7 1.4e-11
CCDS53704.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11          ( 311)  282 68.0 1.8e-11
CCDS8330.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11           ( 404)  282 68.1 2.2e-11


>>CCDS2340.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2                (522 aa)
 initn: 3432 init1: 3432 opt: 3432  Z-score: 3815.4  bits: 715.6 E(32554): 3.4e-206
Smith-Waterman score: 3432; 99.8% identity (100.0% similar) in 522 aa overlap (1-522:1-522)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MKSQGQHWYSSSDKNCKVSFREKLLIIDSNLGVQDVENLKFLCIGLVPNKKLEKSSSASD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 MKSQGQHWYSSSDKNCKVSFREKLLIIDSNLGVQDVENLKFLCIGLVPNKKLEKSSSASD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 VFEHLLAEDLLSEEDPFFLAELLYIIRQKKLLQHLNCTKEEVERLLPTRQRVSLFRNLLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 VFEHLLAEDLLSEEDPFFLAELLYIIRQKKLLQHLNCTKEEVERLLPTRQRVSLFRNLLY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 ELSEGIDSENLKDMIFLLKDSLPKTEMTSLSFLAFLEKQGKIDEDNLTCLEDLCKTVVPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 ELSEGIDSENLKDMIFLLKDSLPKTEMTSLSFLAFLEKQGKIDEDNLTCLEDLCKTVVPK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 LLRNIEKYKREKAIQIVTPPVDKEAESYQGEEELVSQTDVKTFLEALPQESWQNKHAGSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 LLRNIEKYKREKAIQIVTPPVDKEAESYQGEEELVSQTDVKTFLEALPQESWQNKHAGSN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 GNRATNGAPSLVSRGMQGASANTLNSETSTKRAAVYRMNRNHRGLCVIVNNHSFTSLKDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 GNRATNGAPSLVSRGMQGASANTLNSETSTKRAAVYRMNRNHRGLCVIVNNHSFTSLKDR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 QGTHKDAEILSHVFQWLGFTVHIHNNVTKVEMEMVLQKQKCNPAHADGDCFVFCILTHGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 QGTHKDAEILSHVFQWLGFTVHIHNNVTKVEMEMVLQKQKCNPAHADGDCFVFCILTHGR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 FGAVYSSDEALIPIREIMSHFTALQCPRLAEKPKLFFIQACQGEEIQPSISIEADALNPE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS23 FGAVYSSDEALIPIREIMSHFTALQCPRLAEKPKLFFIQACQGEEIQPSVSIEADALNPE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 QAPTSLQDSIPAEADFLLGLATVPGYVSFRHVEEGSWYIQSLCNHLKKLVPRHEDILSIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 QAPTSLQDSIPAEADFLLGLATVPGYVSFRHVEEGSWYIQSLCNHLKKLVPRHEDILSIL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520  
pF1KE1 TAVNDDVSRRVDKQGTKKQMPQPAFTLRKKLVFPVPLDALSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 TAVNDDVSRRVDKQGTKKQMPQPAFTLRKKLVFPVPLDALSL
              490       500       510       520  

>>CCDS2338.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2                (521 aa)
 initn: 3111 init1: 3111 opt: 3116  Z-score: 3464.4  bits: 650.7 E(32554): 1.2e-186
Smith-Waterman score: 3116; 95.6% identity (97.6% similar) in 498 aa overlap (1-498:1-495)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MKSQGQHWYSSSDKNCKVSFREKLLIIDSNLGVQDVENLKFLCIGLVPNKKLEKSSSASD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 MKSQGQHWYSSSDKNCKVSFREKLLIIDSNLGVQDVENLKFLCIGLVPNKKLEKSSSASD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 VFEHLLAEDLLSEEDPFFLAELLYIIRQKKLLQHLNCTKEEVERLLPTRQRVSLFRNLLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 VFEHLLAEDLLSEEDPFFLAELLYIIRQKKLLQHLNCTKEEVERLLPTRQRVSLFRNLLY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 ELSEGIDSENLKDMIFLLKDSLPKTEMTSLSFLAFLEKQGKIDEDNLTCLEDLCKTVVPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 ELSEGIDSENLKDMIFLLKDSLPKTEMTSLSFLAFLEKQGKIDEDNLTCLEDLCKTVVPK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 LLRNIEKYKREKAIQIVTPPVDKEAESYQGEEELVSQTDVKTFLEALPQESWQNKHAGSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 LLRNIEKYKREKAIQIVTPPVDKEAESYQGEEELVSQTDVKTFLEALPQESWQNKHAGSN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 GNRATNGAPSLVSRGMQGASANTLNSETSTKRAAVYRMNRNHRGLCVIVNNHSFTSLKDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 GNRATNGAPSLVSRGMQGASANTLNSETSTKRAAVYRMNRNHRGLCVIVNNHSFTSLKDR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 QGTHKDAEILSHVFQWLGFTVHIHNNVTKVEMEMVLQKQKCNPAHADGDCFVFCILTHGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 QGTHKDAEILSHVFQWLGFTVHIHNNVTKVEMEMVLQKQKCNPAHADGDCFVFCILTHGR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 FGAVYSSDEALIPIREIMSHFTALQCPRLAEKPKLFFIQACQGEEIQPSISIEADALNPE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS23 FGAVYSSDEALIPIREIMSHFTALQCPRLAEKPKLFFIQACQGEEIQPSVSIEADALNPE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 QAPTSLQDSIPAEADFLLGLATVPGYVSFRHVEEGSWYIQSLCNHLKKLVPRHEDILSIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::   .:..:
CCDS23 QAPTSLQDSIPAEADFLLGLATVPGYVSFRHVEEGSWYIQSLCNHLKKLVPR---MLKFL
              430       440       450       460       470          

              490       500       510       520    
pF1KE1 TAVNDDVSRRVDKQGTKKQMPQPAFTLRKKLVFPVPLDALSL  
         . .  .:.    :.:.                          
CCDS23 EKTMEIRGRKRTVWGAKQISATSLPTAISAQTPRPPMRRWSSVS
       480       490       500       510       520 

>>CCDS2339.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2                (479 aa)
 initn: 1695 init1: 1695 opt: 1695  Z-score: 1886.4  bits: 358.6 E(32554): 9.4e-99
Smith-Waterman score: 3058; 91.6% identity (91.8% similar) in 522 aa overlap (1-522:1-479)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MKSQGQHWYSSSDKNCKVSFREKLLIIDSNLGVQDVENLKFLCIGLVPNKKLEKSSSASD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 MKSQGQHWYSSSDKNCKVSFREKLLIIDSNLGVQDVENLKFLCIGLVPNKKLEKSSSASD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 VFEHLLAEDLLSEEDPFFLAELLYIIRQKKLLQHLNCTKEEVERLLPTRQRVSLFRNLLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 VFEHLLAEDLLSEEDPFFLAELLYIIRQKKLLQHLNCTKEEVERLLPTRQRVSLFRNLLY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 ELSEGIDSENLKDMIFLLKDSLPKTEMTSLSFLAFLEKQGKIDEDNLTCLEDLCKTVVPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 ELSEGIDSENLKDMIFLLKDSLPKTEMTSLSFLAFLEKQGKIDEDNLTCLEDLCKTVVPK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 LLRNIEKYKREKAIQIVTPPVDKEAESYQGEEELVSQTDVKTFLEALPQESWQNKHAGSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::            
CCDS23 LLRNIEKYKREKAIQIVTPPVDKEAESYQGEEELVSQTDVKTFLEALP------------
              190       200       210       220                    

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 GNRATNGAPSLVSRGMQGASANTLNSETSTKRAAVYRMNRNHRGLCVIVNNHSFTSLKDR
                                      :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 -------------------------------RAAVYRMNRNHRGLCVIVNNHSFTSLKDR
                                     230       240       250       

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 QGTHKDAEILSHVFQWLGFTVHIHNNVTKVEMEMVLQKQKCNPAHADGDCFVFCILTHGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 QGTHKDAEILSHVFQWLGFTVHIHNNVTKVEMEMVLQKQKCNPAHADGDCFVFCILTHGR
       260       270       280       290       300       310       

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 FGAVYSSDEALIPIREIMSHFTALQCPRLAEKPKLFFIQACQGEEIQPSISIEADALNPE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS23 FGAVYSSDEALIPIREIMSHFTALQCPRLAEKPKLFFIQACQGEEIQPSVSIEADALNPE
       320       330       340       350       360       370       

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 QAPTSLQDSIPAEADFLLGLATVPGYVSFRHVEEGSWYIQSLCNHLKKLVPRHEDILSIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 QAPTSLQDSIPAEADFLLGLATVPGYVSFRHVEEGSWYIQSLCNHLKKLVPRHEDILSIL
       380       390       400       410       420       430       

              490       500       510       520  
pF1KE1 TAVNDDVSRRVDKQGTKKQMPQPAFTLRKKLVFPVPLDALSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 TAVNDDVSRRVDKQGTKKQMPQPAFTLRKKLVFPVPLDALSL
       440       450       460       470         

>>CCDS56159.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2               (455 aa)
 initn: 2983 init1: 1547 opt: 1547  Z-score: 1722.3  bits: 328.1 E(32554): 1.3e-89
Smith-Waterman score: 2853; 87.0% identity (87.2% similar) in 522 aa overlap (1-522:1-455)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MKSQGQHWYSSSDKNCKVSFREKLLIIDSNLGVQDVENLKFLCIGLVPNKKLEKSSSASD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MKSQGQHWYSSSDKNCKVSFREKLLIIDSNLGVQDVENLKFLCIGLVPNKKLEKSSSASD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 VFEHLLAEDLLSEEDPFFLAELLYIIRQKKLLQHLNCTKEEVERLLPTRQRVSLFRNLLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VFEHLLAEDLLSEEDPFFLAELLYIIRQKKLLQHLNCTKEEVERLLPTRQRVSLFRNLLY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 ELSEGIDSENLKDMIFLLKDSLPKTEMTSLSFLAFLEKQGKIDEDNLTCLEDLCKTVVPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ELSEGIDSENLKDMIFLLKDSLPKTEMTSLSFLAFLEKQGKIDEDNLTCLEDLCKTVVPK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 LLRNIEKYKREKAIQIVTPPVDKEAESYQGEEELVSQTDVKTFLEALPQESWQNKHAGSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LLRNIEKYKREKAIQIVTPPVDKEAESYQGEEELVSQTDVKTFLEALPQESWQNKHAGSN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 GNRATNGAPSLVSRGMQGASANTLNSETSTKRAAVYRMNRNHRGLCVIVNNHSFTSLKDR
                                                                   
CCDS56 ------------------------------------------------------------
                                                                   

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 QGTHKDAEILSHVFQWLGFTVHIHNNVTKVEMEMVLQKQKCNPAHADGDCFVFCILTHGR
              :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 -------EILSHVFQWLGFTVHIHNNVTKVEMEMVLQKQKCNPAHADGDCFVFCILTHGR
                     250       260       270       280       290   

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 FGAVYSSDEALIPIREIMSHFTALQCPRLAEKPKLFFIQACQGEEIQPSISIEADALNPE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS56 FGAVYSSDEALIPIREIMSHFTALQCPRLAEKPKLFFIQACQGEEIQPSVSIEADALNPE
           300       310       320       330       340       350   

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 QAPTSLQDSIPAEADFLLGLATVPGYVSFRHVEEGSWYIQSLCNHLKKLVPRHEDILSIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QAPTSLQDSIPAEADFLLGLATVPGYVSFRHVEEGSWYIQSLCNHLKKLVPRHEDILSIL
           360       370       380       390       400       410   

              490       500       510       520  
pF1KE1 TAVNDDVSRRVDKQGTKKQMPQPAFTLRKKLVFPVPLDALSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TAVNDDVSRRVDKQGTKKQMPQPAFTLRKKLVFPVPLDALSL
           420       430       440       450     

>>CCDS77506.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2               (247 aa)
 initn: 1469 init1: 1469 opt: 1469  Z-score: 1639.6  bits: 311.9 E(32554): 5.3e-85
Smith-Waterman score: 1469; 95.5% identity (97.1% similar) in 242 aa overlap (1-242:1-242)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MKSQGQHWYSSSDKNCKVSFREKLLIIDSNLGVQDVENLKFLCIGLVPNKKLEKSSSASD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MKSQGQHWYSSSDKNCKVSFREKLLIIDSNLGVQDVENLKFLCIGLVPNKKLEKSSSASD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 VFEHLLAEDLLSEEDPFFLAELLYIIRQKKLLQHLNCTKEEVERLLPTRQRVSLFRNLLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VFEHLLAEDLLSEEDPFFLAELLYIIRQKKLLQHLNCTKEEVERLLPTRQRVSLFRNLLY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 ELSEGIDSENLKDMIFLLKDSLPKTEMTSLSFLAFLEKQGKIDEDNLTCLEDLCKTVVPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ELSEGIDSENLKDMIFLLKDSLPKTEMTSLSFLAFLEKQGKIDEDNLTCLEDLCKTVVPK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 LLRNIEKYKREKAIQIVTPPVDKEAESYQGEEELVSQTDVKTFLEALPQESWQNKHAGSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.  .   . :. 
CCDS77 LLRNIEKYKREKAIQIVTPPVDKEAESYQGEEELVSQTDVKTFLEALPEGVFVFLNEGDR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 GNRATNGAPSLVSRGMQGASANTLNSETSTKRAAVYRMNRNHRGLCVIVNNHSFTSLKDR
       ::                                                          
CCDS77 GNSPDDL                                                     
                                                                   

>>CCDS56160.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2               (478 aa)
 initn: 1493 init1: 1460 opt: 1460  Z-score: 1625.4  bits: 310.3 E(32554): 3.3e-84
Smith-Waterman score: 2742; 86.9% identity (89.0% similar) in 498 aa overlap (1-498:1-452)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MKSQGQHWYSSSDKNCKVSFREKLLIIDSNLGVQDVENLKFLCIGLVPNKKLEKSSSASD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MKSQGQHWYSSSDKNCKVSFREKLLIIDSNLGVQDVENLKFLCIGLVPNKKLEKSSSASD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 VFEHLLAEDLLSEEDPFFLAELLYIIRQKKLLQHLNCTKEEVERLLPTRQRVSLFRNLLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VFEHLLAEDLLSEEDPFFLAELLYIIRQKKLLQHLNCTKEEVERLLPTRQRVSLFRNLLY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 ELSEGIDSENLKDMIFLLKDSLPKTEMTSLSFLAFLEKQGKIDEDNLTCLEDLCKTVVPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ELSEGIDSENLKDMIFLLKDSLPKTEMTSLSFLAFLEKQGKIDEDNLTCLEDLCKTVVPK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 LLRNIEKYKREKAIQIVTPPVDKEAESYQGEEELVSQTDVKTFLEALPQESWQNKHAGSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::            
CCDS56 LLRNIEKYKREKAIQIVTPPVDKEAESYQGEEELVSQTDVKTFLEALP------------
              190       200       210       220                    

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 GNRATNGAPSLVSRGMQGASANTLNSETSTKRAAVYRMNRNHRGLCVIVNNHSFTSLKDR
                                      :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 -------------------------------RAAVYRMNRNHRGLCVIVNNHSFTSLKDR
                                     230       240       250       

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 QGTHKDAEILSHVFQWLGFTVHIHNNVTKVEMEMVLQKQKCNPAHADGDCFVFCILTHGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QGTHKDAEILSHVFQWLGFTVHIHNNVTKVEMEMVLQKQKCNPAHADGDCFVFCILTHGR
       260       270       280       290       300       310       

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 FGAVYSSDEALIPIREIMSHFTALQCPRLAEKPKLFFIQACQGEEIQPSISIEADALNPE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS56 FGAVYSSDEALIPIREIMSHFTALQCPRLAEKPKLFFIQACQGEEIQPSVSIEADALNPE
       320       330       340       350       360       370       

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 QAPTSLQDSIPAEADFLLGLATVPGYVSFRHVEEGSWYIQSLCNHLKKLVPRHEDILSIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::   .:..:
CCDS56 QAPTSLQDSIPAEADFLLGLATVPGYVSFRHVEEGSWYIQSLCNHLKKLVPR---MLKFL
       380       390       400       410       420          430    

              490       500       510       520    
pF1KE1 TAVNDDVSRRVDKQGTKKQMPQPAFTLRKKLVFPVPLDALSL  
         . .  .:.    :.:.                          
CCDS56 EKTMEIRGRKRTVWGAKQISATSLPTAISAQTPRPPMRRWSSVS
          440       450       460       470        

>>CCDS42799.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2                (496 aa)
 initn: 985 init1: 362 opt: 825  Z-score: 919.7  bits: 179.7 E(32554): 6.6e-45
Smith-Waterman score: 886; 35.1% identity (59.6% similar) in 530 aa overlap (18-514:1-494)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MKSQGQHWYSSSDKNCKVSFREKLLIIDSNLGVQDVENLKFLCIGLVPNKKLEKSSSASD
                        ..: ..:  :  .:  .:. .:::: .  .:..: :  ..:  
CCDS42                  MDFSRNLYDIGEQLDSEDLASLKFLSLDYIPQRKQEPIKDALM
                                10        20        30        40   

               70        80         90       100         110       
pF1KE1 VFEHLLAEDLLSEEDPFFLAELLY-IIRQKKLLQHLNCTKEEVERLL--PTRQRVSLFRN
       .:..:  . .: : .  :: :::. : :   :. .::  :::.:: :  : : ..: .: 
CCDS42 LFQRLQEKRMLEESNLSFLKELLFRINRLDLLITYLNTRKEEMERELQTPGRAQISAYRF
            50        60        70        80        90       100   

       120                       130       140       150       160 
pF1KE1 LLYELSEG----------------IDSENLKDMIFLLKDSLPKTEMTSLSFLAFLEKQGK
        . ..: .                .:   .. :.. ... . ..:. :..:: . :. .:
CCDS42 HFCRMSWAEANSQCQTQSVPFWRRVDHLLIRVMLYQISEEVSRSELRSFKFL-LQEEISK
           110       120       130       140       150        160  

             170       180       190       200       210       220 
pF1KE1 IDEDNLTCLEDLCKTVVPKLLRNIEKYKREKAIQIVTPPVDKEAESYQGEEELVSQTDVK
          :.   : :.           ::  ::   . .    .:         ... .: . :
CCDS42 CKLDDDMNLLDIF----------IEMEKR---VILGEGKLDI-------LKRVCAQIN-K
            170                 180          190              200  

             230       240       250       260       270       280 
pF1KE1 TFLEALPQESWQNKHAGSNGNRATNGAPSLVSRGMQGASANTLNSETSTKRAAVYRMNRN
       ..:. . .    .:     :  . . .:       : . ..::..        ::.:. .
CCDS42 SLLKIINDYEEFSKGEELCGVMTISDSPR-----EQDSESQTLDK--------VYQMKSK
             210       220       230            240                

             290                 300       310       320       330 
pF1KE1 HRGLCVIVNNHSFT----------SLKDRQGTHKDAEILSHVFQWLGFTVHIHNNVTKVE
        :: :.:.:::.:.          :..::.::: ::  :. .:. : : .. :.. :  .
CCDS42 PRGYCLIINNHNFAKAREKVPKLHSIRDRNGTHLDAGALTTTFEELHFEIKPHDDCTVEQ
      250       260       270       280       290       300        

             340       350       360       370       380       390 
pF1KE1 MEMVLQKQKCNPAHADGDCFVFCILTHGRFGAVYSSDEALIPIREIMSHFTALQCPRLAE
       .  .:.  .    :.. :::. :::.::  : .:..:    :: :. :.::.:.:: :: 
CCDS42 IYEILKIYQLMD-HSNMDCFICCILSHGDKGIIYGTDGQEAPIYELTSQFTGLKCPSLAG
      310       320        330       340       350       360       

             400       410          420        430       440       
pF1KE1 KPKLFFIQACQGEEIQPSISIEADALN-P--EQAPTSLQDS-IPAEADFLLGLATVPGYV
       :::.::::::::.. : .: .:.:. . :  :.  .: :   :: :::::::.::: . :
CCDS42 KPKVFFIQACQGDNYQKGIPVETDSEEQPYLEMDLSSPQTRYIPDEADFLLGMATVNNCV
       370       380       390       400       410       420       

       450       460       470       480       490       500       
pF1KE1 SFRHVEEGSWYIQSLCNHLKKLVPRHEDILSILTAVNDDVSRRVDKQGTKKQMPQPAFTL
       :.:.  ::.:::::::. :..  :: .:::.::: :: .:: . ::..  ::::::.:::
CCDS42 SYRNPAEGTWYIQSLCQSLRERCPRGDDILTILTEVNYEVSNKDDKKNMGKQMPQPTFTL
       430       440       450       460       470       480       

       510       520  
pF1KE1 RKKLVFPVPLDALSL
       :::::::        
CCDS42 RKKLVFPSD      
       490            

>>CCDS2342.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2                 (479 aa)
 initn: 985 init1: 362 opt: 733  Z-score: 817.7  bits: 160.8 E(32554): 3.2e-39
Smith-Waterman score: 983; 37.8% identity (62.2% similar) in 518 aa overlap (18-514:1-477)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MKSQGQHWYSSSDKNCKVSFREKLLIIDSNLGVQDVENLKFLCIGLVPNKKLEKSSSASD
                        ..: ..:  :  .:  .:. .:::: .  .:..: :  ..:  
CCDS23                  MDFSRNLYDIGEQLDSEDLASLKFLSLDYIPQRKQEPIKDALM
                                10        20        30        40   

               70        80         90       100         110       
pF1KE1 VFEHLLAEDLLSEEDPFFLAELLY-IIRQKKLLQHLNCTKEEVERLL--PTRQRVSLFRN
       .:..:  . .: : .  :: :::. : :   :. .::  :::.:: :  : : ..: .: 
CCDS23 LFQRLQEKRMLEESNLSFLKELLFRINRLDLLITYLNTRKEEMERELQTPGRAQISAYRV
            50        60        70        80        90       100   

       120       130       140           150       160       170   
pF1KE1 LLYELSEGIDSENLKDMIFLLKDSLPKT----EMTSLSFLAFLEKQGKIDEDNLTCLEDL
       .::..:: ..  .:... :::.. . :     .:. :...  .::.  . : .:  :. .
CCDS23 MLYQISEEVSRSELRSFKFLLQEEISKCKLDDDMNLLDIFIEMEKRVILGEGKLDILKRV
           110       120       130       140       150       160   

           180       190       200       210       220       230   
pF1KE1 CKTVVPKLLRNIEKYKREKAIQIVTPPVDKEAESYQGEEELVSQTDVKTFLEALPQESWQ
       :  .  .::. :. :..           .::  :                ::. :.:   
CCDS23 CAQINKSLLKIINDYEE----------FSKERSSS---------------LEGSPDEF--
           170       180                                190        

           240       250       260       270       280       290   
pF1KE1 NKHAGSNGNRATNGAPSLVSRGMQGASANTLNSETSTKRAAVYRMNRNHRGLCVIVNNHS
            :::..   :. ..      . :    .::..:    ::.:. . :: :.:.:::.
CCDS23 -----SNGEE-LCGVMTI------SDSPREQDSESQTLDK-VYQMKSKPRGYCLIINNHN
             200              210       220        230       240   

                     300       310       320       330       340   
pF1KE1 FT----------SLKDRQGTHKDAEILSHVFQWLGFTVHIHNNVTKVEMEMVLQKQKCNP
       :.          :..::.::: ::  :. .:. : : .. :.. :  ..  .:.  .   
CCDS23 FAKAREKVPKLHSIRDRNGTHLDAGALTTTFEELHFEIKPHDDCTVEQIYEILKIYQLMD
           250       260       270       280       290       300   

           350       360       370       380       390       400   
pF1KE1 AHADGDCFVFCILTHGRFGAVYSSDEALIPIREIMSHFTALQCPRLAEKPKLFFIQACQG
        :.. :::. :::.::  : .:..:    :: :. :.::.:.:: :: :::.::::::::
CCDS23 -HSNMDCFICCILSHGDKGIIYGTDGQEAPIYELTSQFTGLKCPSLAGKPKVFFIQACQG
            310       320       330       340       350       360  

           410          420        430       440       450         
pF1KE1 EEIQPSISIEADALN-P--EQAPTSLQDS-IPAEADFLLGLATVPGYVSFRHVEEGSWYI
       .. : .: .:.:. . :  :.  .: :   :: :::::::.::: . ::.:.  ::.:::
CCDS23 DNYQKGIPVETDSEEQPYLEMDLSSPQTRYIPDEADFLLGMATVNNCVSYRNPAEGTWYI
            370       380       390       400       410       420  

     460       470       480       490       500       510         
pF1KE1 QSLCNHLKKLVPRHEDILSILTAVNDDVSRRVDKQGTKKQMPQPAFTLRKKLVFPVPLDA
       ::::. :..  :: .:::.::: :: .:: . ::..  ::::::.::::::::::     
CCDS23 QSLCQSLRERCPRGDDILTILTEVNYEVSNKDDKKNMGKQMPQPTFTLRKKLVFPSD   
            430       440       450       460       470            

     520  
pF1KE1 LSL

>>CCDS42798.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2                (538 aa)
 initn: 985 init1: 362 opt: 733  Z-score: 817.0  bits: 160.9 E(32554): 3.5e-39
Smith-Waterman score: 989; 38.0% identity (62.2% similar) in 519 aa overlap (17-514:59-536)

                             10        20        30        40      
pF1KE1               MKSQGQHWYSSSDKNCKVSFREKLLIIDSNLGVQDVENLKFLCIGL
                                     :..: ..:  :  .:  .:. .:::: .  
CCDS42 EHVELGRLGDSETAMVPGKGGADYILLPFKKMDFSRNLYDIGEQLDSEDLASLKFLSLDY
       30        40        50        60        70        80        

         50        60        70        80         90       100     
pF1KE1 VPNKKLEKSSSASDVFEHLLAEDLLSEEDPFFLAELLY-IIRQKKLLQHLNCTKEEVERL
       .:..: :  ..:  .:..:  . .: : .  :: :::. : :   :. .::  :::.:: 
CCDS42 IPQRKQEPIKDALMLFQRLQEKRMLEESNLSFLKELLFRINRLDLLITYLNTRKEEMERE
       90       100       110       120       130       140        

           110       120       130       140           150         
pF1KE1 L--PTRQRVSLFRNLLYELSEGIDSENLKDMIFLLKDSLPKT----EMTSLSFLAFLEKQ
       :  : : ..: .: .::..:: ..  .:... :::.. . :     .:. :...  .::.
CCDS42 LQTPGRAQISAYRVMLYQISEEVSRSELRSFKFLLQEEISKCKLDDDMNLLDIFIEMEKR
      150       160       170       180       190       200        

     160       170       180       190       200       210         
pF1KE1 GKIDEDNLTCLEDLCKTVVPKLLRNIEKYKREKAIQIVTPPVDKEAESYQGEEELVSQTD
         . : .:  :. .:  .  .::. :. :..           .::  :            
CCDS42 VILGEGKLDILKRVCAQINKSLLKIINDYEE----------FSKERSSS-----------
      210       220       230                 240                  

     220       230       240       250       260       270         
pF1KE1 VKTFLEALPQESWQNKHAGSNGNRATNGAPSLVSRGMQGASANTLNSETSTKRAAVYRMN
           ::. :.:        :::..   :. ..      . :    .::..:    ::.:.
CCDS42 ----LEGSPDEF-------SNGEELC-GVMTI------SDSPREQDSESQTLDK-VYQMK
           250              260              270       280         

     280       290                 300       310       320         
pF1KE1 RNHRGLCVIVNNHSFT----------SLKDRQGTHKDAEILSHVFQWLGFTVHIHNNVTK
        . :: :.:.:::.:.          :..::.::: ::  :. .:. : : .. :.. : 
CCDS42 SKPRGYCLIINNHNFAKAREKVPKLHSIRDRNGTHLDAGALTTTFEELHFEIKPHDDCTV
      290       300       310       320       330       340        

     330       340       350       360       370       380         
pF1KE1 VEMEMVLQKQKCNPAHADGDCFVFCILTHGRFGAVYSSDEALIPIREIMSHFTALQCPRL
        ..  .:.  .    :.. :::. :::.::  : .:..:    :: :. :.::.:.:: :
CCDS42 EQIYEILKIYQLMD-HSNMDCFICCILSHGDKGIIYGTDGQEAPIYELTSQFTGLKCPSL
      350       360        370       380       390       400       

     390       400       410          420        430       440     
pF1KE1 AEKPKLFFIQACQGEEIQPSISIEADALN-P--EQAPTSLQDS-IPAEADFLLGLATVPG
       : :::.::::::::.. : .: .:.:. . :  :.  .: :   :: :::::::.::: .
CCDS42 AGKPKVFFIQACQGDNYQKGIPVETDSEEQPYLEMDLSSPQTRYIPDEADFLLGMATVNN
       410       420       430       440       450       460       

         450       460       470       480       490       500     
pF1KE1 YVSFRHVEEGSWYIQSLCNHLKKLVPRHEDILSILTAVNDDVSRRVDKQGTKKQMPQPAF
        ::.:.  ::.:::::::. :..  :: .:::.::: :: .:: . ::..  ::::::.:
CCDS42 CVSYRNPAEGTWYIQSLCQSLRERCPRGDDILTILTEVNYEVSNKDDKKNMGKQMPQPTF
       470       480       490       500       510       520       

         510       520  
pF1KE1 TLRKKLVFPVPLDALSL
       :::::::::        
CCDS42 TLRKKLVFPSD      
       530              

>>CCDS2343.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2                 (464 aa)
 initn: 985 init1: 362 opt: 711  Z-score: 793.5  bits: 156.3 E(32554): 7.1e-38
Smith-Waterman score: 956; 37.1% identity (60.8% similar) in 518 aa overlap (18-514:1-462)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MKSQGQHWYSSSDKNCKVSFREKLLIIDSNLGVQDVENLKFLCIGLVPNKKLEKSSSASD
                        ..: ..:  :  .:  .:. .:::: .  .:..: :  ..:  
CCDS23                  MDFSRNLYDIGEQLDSEDLASLKFLSLDYIPQRKQEPIKDALM
                                10        20        30        40   

               70        80         90       100         110       
pF1KE1 VFEHLLAEDLLSEEDPFFLAELLY-IIRQKKLLQHLNCTKEEVERLL--PTRQRVSLFRN
       .:..:  . .: : .  :: :::. : :   :. .::  :::.:: :  : : ..: .: 
CCDS23 LFQRLQEKRMLEESNLSFLKELLFRINRLDLLITYLNTRKEEMERELQTPGRAQISAYRV
            50        60        70        80        90       100   

       120       130       140           150       160       170   
pF1KE1 LLYELSEGIDSENLKDMIFLLKDSLPKT----EMTSLSFLAFLEKQGKIDEDNLTCLEDL
       .::..:: ..  .:... :::.. . :     .:. :...  .::.  . : .:  :. .
CCDS23 MLYQISEEVSRSELRSFKFLLQEEISKCKLDDDMNLLDIFIEMEKRVILGEGKLDILKRV
           110       120       130       140       150       160   

           180       190       200       210       220       230   
pF1KE1 CKTVVPKLLRNIEKYKREKAIQIVTPPVDKEAESYQGEEELVSQTDVKTFLEALPQESWQ
       :  .  .::. :. :.                :  .:::       : :. .. :.:   
CCDS23 CAQINKSLLKIINDYE----------------EFSKGEE----LCGVMTISDS-PRE---
           170                       180           190             

           240       250       260       270       280       290   
pF1KE1 NKHAGSNGNRATNGAPSLVSRGMQGASANTLNSETSTKRAAVYRMNRNHRGLCVIVNNHS
                              : . ..::..        ::.:. . :: :.:.:::.
CCDS23 -----------------------QDSESQTLDK--------VYQMKSKPRGYCLIINNHN
                            200               210       220        

                     300       310       320       330       340   
pF1KE1 FT----------SLKDRQGTHKDAEILSHVFQWLGFTVHIHNNVTKVEMEMVLQKQKCNP
       :.          :..::.::: ::  :. .:. : : .. :.. :  ..  .:.  .   
CCDS23 FAKAREKVPKLHSIRDRNGTHLDAGALTTTFEELHFEIKPHDDCTVEQIYEILKIYQLMD
      230       240       250       260       270       280        

           350       360       370       380       390       400   
pF1KE1 AHADGDCFVFCILTHGRFGAVYSSDEALIPIREIMSHFTALQCPRLAEKPKLFFIQACQG
        :.. :::. :::.::  : .:..:    :: :. :.::.:.:: :: :::.::::::::
CCDS23 -HSNMDCFICCILSHGDKGIIYGTDGQEAPIYELTSQFTGLKCPSLAGKPKVFFIQACQG
       290       300       310       320       330       340       

           410          420        430       440       450         
pF1KE1 EEIQPSISIEADALN-P--EQAPTSLQDS-IPAEADFLLGLATVPGYVSFRHVEEGSWYI
       .. : .: .:.:. . :  :.  .: :   :: :::::::.::: . ::.:.  ::.:::
CCDS23 DNYQKGIPVETDSEEQPYLEMDLSSPQTRYIPDEADFLLGMATVNNCVSYRNPAEGTWYI
       350       360       370       380       390       400       

     460       470       480       490       500       510         
pF1KE1 QSLCNHLKKLVPRHEDILSILTAVNDDVSRRVDKQGTKKQMPQPAFTLRKKLVFPVPLDA
       ::::. :..  :: .:::.::: :: .:: . ::..  ::::::.::::::::::     
CCDS23 QSLCQSLRERCPRGDDILTILTEVNYEVSNKDDKKNMGKQMPQPTFTLRKKLVFPSD   
       410       420       430       440       450       460       

     520  
pF1KE1 LSL




522 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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