FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2081, 754 aa 1>>>pF1KE2081 754 - 754 aa - 754 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.0720+/-0.000541; mu= -15.2567+/- 0.034 mean_var=505.4755+/-99.042, 0's: 0 Z-trim(121.1): 469 B-trim: 0 in 0/55 Lambda= 0.057046 statistics sampled from 36746 (37260) to 36746 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.437), width: 16 Scan time: 14.780 The best scores are: opt bits E(85289) NP_004783 (OMIM: 606093) peptidyl-prolyl cis-trans ( 754) 4981 425.2 4.8e-118 XP_005247023 (OMIM: 606093) PREDICTED: peptidyl-pr ( 754) 4981 425.2 4.8e-118 XP_005247024 (OMIM: 606093) PREDICTED: peptidyl-pr ( 754) 4981 425.2 4.8e-118 XP_016860791 (OMIM: 606093) PREDICTED: peptidyl-pr ( 272) 1687 153.7 9.2e-37 XP_016861963 (OMIM: 161565) PREDICTED: NK-tumor re (1435) 1460 135.7 1.3e-30 XP_006713234 (OMIM: 161565) PREDICTED: NK-tumor re (1436) 1460 135.7 1.3e-30 NP_005376 (OMIM: 161565) NK-tumor recognition prot (1462) 1460 135.7 1.4e-30 XP_005265230 (OMIM: 161565) PREDICTED: NK-tumor re (1463) 1460 135.7 1.4e-30 XP_006713236 (OMIM: 161565) PREDICTED: NK-tumor re (1353) 892 88.9 1.5e-16 NP_005029 (OMIM: 601753) peptidyl-prolyl cis-trans ( 370) 735 75.5 4.4e-13 NP_000933 (OMIM: 123841,259440) peptidyl-prolyl ci ( 216) 604 64.5 5.2e-10 NP_006338 (OMIM: 606095) peptidyl-prolyl cis-trans ( 177) 579 62.4 1.9e-09 XP_016855546 (OMIM: 606095) PREDICTED: peptidyl-pr ( 177) 579 62.4 1.9e-09 XP_005270419 (OMIM: 606095) PREDICTED: peptidyl-pr ( 177) 579 62.4 1.9e-09 XP_016855541 (OMIM: 602435) PREDICTED: peptidyl-pr ( 217) 573 62.0 3.1e-09 NP_006103 (OMIM: 602435) peptidyl-prolyl cis-trans ( 301) 573 62.1 3.9e-09 XP_006710353 (OMIM: 602435) PREDICTED: peptidyl-pr ( 288) 568 61.7 5.1e-09 NP_066953 (OMIM: 123840) peptidyl-prolyl cis-trans ( 165) 558 60.6 5.9e-09 NP_000934 (OMIM: 123842) peptidyl-prolyl cis-trans ( 212) 554 60.4 9e-09 NP_982281 (OMIM: 602435) peptidyl-prolyl cis-trans ( 296) 553 60.4 1.2e-08 NP_005720 (OMIM: 604486) peptidyl-prolyl cis-trans ( 207) 548 59.9 1.2e-08 NP_001306222 (OMIM: 602435) peptidyl-prolyl cis-tr ( 283) 548 60.0 1.6e-08 XP_011538803 (OMIM: 602435) PREDICTED: peptidyl-pr ( 230) 544 59.6 1.7e-08 XP_011532052 (OMIM: 161565) PREDICTED: NK-tumor re (1210) 562 61.7 2.1e-08 XP_016861964 (OMIM: 161565) PREDICTED: NK-tumor re (1210) 562 61.7 2.1e-08 XP_011532049 (OMIM: 161565) PREDICTED: NK-tumor re (1210) 562 61.7 2.1e-08 NP_001181936 (OMIM: 602435) peptidyl-prolyl cis-tr ( 314) 544 59.7 2.1e-08 XP_016855540 (OMIM: 602435) PREDICTED: peptidyl-pr ( 314) 544 59.7 2.1e-08 XP_006710352 (OMIM: 602435) PREDICTED: peptidyl-pr ( 301) 539 59.3 2.7e-08 XP_011509880 (OMIM: 601181,608033) PREDICTED: E3 S (2281) 544 60.4 9.3e-08 XP_005264064 (OMIM: 601181,608033) PREDICTED: E3 S (2282) 544 60.4 9.3e-08 XP_011509878 (OMIM: 601181,608033) PREDICTED: E3 S (3199) 544 60.6 1.2e-07 NP_006258 (OMIM: 601181,608033) E3 SUMO-protein li (3224) 544 60.6 1.2e-07 XP_005264061 (OMIM: 601181,608033) PREDICTED: E3 S (3232) 544 60.6 1.2e-07 XP_005264062 (OMIM: 601181,608033) PREDICTED: E3 S (3232) 544 60.6 1.2e-07 XP_005264060 (OMIM: 601181,608033) PREDICTED: E3 S (3250) 544 60.6 1.2e-07 XP_011509877 (OMIM: 601181,608033) PREDICTED: E3 S (3257) 544 60.6 1.2e-07 XP_005264059 (OMIM: 601181,608033) PREDICTED: E3 S (3258) 544 60.6 1.2e-07 NP_001137504 (OMIM: 608608) peptidyl-prolyl cis-tr ( 164) 461 52.7 1.5e-06 XP_005255283 (OMIM: 606032) PREDICTED: serine/argi (2751) 486 55.7 2.9e-06 NP_057417 (OMIM: 606032) serine/arginine repetitiv (2752) 486 55.7 2.9e-06 XP_016855548 (OMIM: 606095) PREDICTED: peptidyl-pr ( 134) 433 50.3 6.3e-06 NP_001317439 (OMIM: 606095) peptidyl-prolyl cis-tr ( 134) 433 50.3 6.3e-06 XP_016855547 (OMIM: 606095) PREDICTED: peptidyl-pr ( 134) 433 50.3 6.3e-06 XP_005269436 (OMIM: 604486) PREDICTED: peptidyl-pr ( 201) 437 50.8 6.8e-06 XP_016861966 (OMIM: 161565) PREDICTED: NK-tumor re (1163) 458 53.1 7.6e-06 XP_016861965 (OMIM: 161565) PREDICTED: NK-tumor re (1163) 458 53.1 7.6e-06 NP_055885 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domain-c (1564) 450 52.6 1.5e-05 XP_005266369 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1564) 450 52.6 1.5e-05 NP_001317495 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domai (1668) 450 52.6 1.6e-05 >>NP_004783 (OMIM: 606093) peptidyl-prolyl cis-trans iso (754 aa) initn: 4981 init1: 4981 opt: 4981 Z-score: 2240.2 bits: 425.2 E(85289): 4.8e-118 Smith-Waterman score: 4981; 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99.9% identity (100.0% similar) in 754 aa overlap (1-754:1-754) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 KSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 KSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTN 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 GSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGELIPK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 GSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGELIPK 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 SKVKKEEKKRHKSSSSSSSSSSDSDSSSDSQSSSDSSDSESATEEKSKKRKKKHRKNSRK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 SKVKKEEKKRHKSSSSSSSSSSDSDSSSDSQSSSDSSDSESATEEKSKKRKKKHRKNSRK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 HKKEKKKRKKSKKSASSESEAENLEAQPQSTVRPEEIPPIPENRFLMRKSPPKADEKERK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 HKKEKKKRKKSKKSASSESEAENLEAQPQSTVRPEEIPPIPENRFLMRKSPPKADEKERK 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 NRERERERECNPPNSQPASYQRRLLVTRSGRKIKGRGPRRYRTPSRSRSRDRFRRSETPP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 NRERERERECNPPNSQPASYQRRLLVTRSGRKIKGRGPRRYRTPSRSRSRDRFRRSETPP 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 HWRQEMQRAQRMRVSSGERWIKGDKSELNEIKENQRSPVRVKERKITDHRNVSESPNRKN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 HWRQEMQRAQRMRVSSGERWIKGDKSELNEIKENQRSPVRVKERKITDHRNVSESPNRKN 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 EKEKKVKDHKSNSKERDIRRNSEKEDKYKNKVKKRAKSKSRSKSKEKSKSKERDSKHNRN ::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 EKEKKVKDHKSNSKERDIRRNSEKDDKYKNKVKKRAKSKSRSKSKEKSKSKERDSKHNRN 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 EEKRMRSRSKGRDHENVKEKEKQSDSKGKDQERSRSKEKSKQLESKSNEHDHSKSKEKDR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 EEKRMRSRSKGRDHENVKEKEKQSDSKGKDQERSRSKEKSKQLESKSNEHDHSKSKEKDR 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 RAQSRSRECDITKGKHSYNSRTRERSRSRDRSRRVRSRTHDRDRSRSKEYHRYREQEYRR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 RAQSRSRECDITKGKHSYNSRTRERSRSRDRSRRVRSRTHDRDRSRSKEYHRYREQEYRR 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 RGRSRSRERRTPPGRSRSKDRRRRRRDSRSSEREESQSRNKDKYRNQESKSSHRKENSES :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 RGRSRSRERRTPPGRSRSKDRRRRRRDSRSSEREESQSRNKDKYRNQESKSSHRKENSES 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 EKRMYSKSRDHNSSNNSREKKADRDQSPFSKIKQSSQDNELKSSMLKNKEDEKIRSSVEK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 EKRMYSKSRDHNSSNNSREKKADRDQSPFSKIKQSSQDNELKSSMLKNKEDEKIRSSVEK 670 680 690 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 ENQKSKGQENDHVHEKNKKFDHESSPGTDEDKSG :::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 ENQKSKGQENDHVHEKNKKFDHESSPGTDEDKSG 730 740 750 >>XP_016860791 (OMIM: 606093) PREDICTED: peptidyl-prolyl (272 aa) initn: 1687 init1: 1687 opt: 1687 Z-score: 781.0 bits: 153.7 E(85289): 9.2e-37 Smith-Waterman score: 1687; 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XP_016 HRKRASKSPRKTASQLSENKPVKTEPLRATMAQNENVVVQPVVAENIPVIPLSDSPPPSR 560 570 580 590 600 610 640 650 660 670 680 pF1KE2 REESQSRNKDKY-RNQE--SKSSHRKENSESEKRMYSKSRDHNSSNNSREKKADRDQSPF . .:. : .: : :: .:..: . . . : .:: ..:::... ::: . 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XP_006 PPRSRSCSESDDDDSSETPPHWKEEMQRLRAYRPPSGEKWSKGDKLSDPCSSRWDERSLS 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 QRSPVRVKERKITDHRNVSESPN-RKNEKEKKVKDHKSNSKERDIRRNSEKEDKYKNKVK ::: . .: .. .: . .: .:::::: .:...:.. :: .:. : XP_006 QRSRSWSYNGYYSDLSTARHSGHHKKRRKEKKVKHKKKGKKQKHCRR-------HKQTKK 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 KRAKSKSRSKSKEKSKSKERDSKHNRNEEKRMRSRSKGRDHENVKEKEKQSDSKGKDQER .: : . :.:::. : : . ..:. :: : . .:.. :. ..:: :: . XP_006 RRILIPS---DIESSKSSTRRMKSSCDRERSSRSSSLS-SHHSSKRDWSKSD---KDVQS 460 470 480 490 500 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 SRSKEKSKQLESKSNEHDHSKSKEKDRRAQSRSRECDITKGKHSYNSRTRERSRSRDRS- : .. . . .::: ::.: :..:::: : .: : .::.: .::: ..: XP_006 SLTHSSRDSYRSKS----HSQSYS---RGSSRSR----TASKSSSHSRSRSKSRSSSKSG 510 520 530 540 550 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 RRVRSRTHDRDRSRSKEYHRYREQEYRRRGRSRSRERRTPPGRSRSKDRRRRRRDSRSSE .: :. : . . .. . : : ..... . : ... . :. 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