Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6594
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6594, 406 aa
1>>>pF1KB6594 406 - 406 aa - 406 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1620+/-0.000925; mu= 10.3382+/- 0.056
mean_var=161.5715+/-33.455, 0's: 0 Z-trim(111.6): 99 B-trim: 758 in 1/51
Lambda= 0.100900
statistics sampled from 12429 (12540) to 12429 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.731), E-opt: 0.2 (0.385), width: 16
Scan time: 2.080
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2213.1 RBMS1 gene_id:5937|Hs108|chr2 ( 406) 2734 409.8 2.4e-114
CCDS33726.1 RBMS3 gene_id:27303|Hs108|chr3 ( 420) 1993 301.9 7.3e-82
CCDS54558.1 RBMS3 gene_id:27303|Hs108|chr3 ( 421) 1993 301.9 7.3e-82
CCDS33724.1 RBMS3 gene_id:27303|Hs108|chr3 ( 437) 1922 291.6 9.7e-79
CCDS8923.1 RBMS2 gene_id:5939|Hs108|chr12 ( 407) 1831 278.3 8.9e-75
CCDS33725.1 RBMS3 gene_id:27303|Hs108|chr3 ( 419) 1718 261.9 8.2e-70
CCDS54557.1 RBMS3 gene_id:27303|Hs108|chr3 ( 433) 1488 228.4 1e-59
CCDS55298.1 ELAVL2 gene_id:1993|Hs108|chr9 ( 346) 417 72.4 7.3e-13
CCDS6515.1 ELAVL2 gene_id:1993|Hs108|chr9 ( 359) 417 72.4 7.5e-13
CCDS44138.1 ELAVL4 gene_id:1996|Hs108|chr1 ( 366) 391 68.6 1e-11
CCDS53315.1 ELAVL4 gene_id:1996|Hs108|chr1 ( 369) 391 68.7 1.1e-11
CCDS44140.1 ELAVL4 gene_id:1996|Hs108|chr1 ( 366) 386 67.9 1.7e-11
CCDS72788.1 ELAVL4 gene_id:1996|Hs108|chr1 ( 371) 386 67.9 1.7e-11
CCDS553.1 ELAVL4 gene_id:1996|Hs108|chr1 ( 380) 386 67.9 1.8e-11
CCDS81321.1 ELAVL4 gene_id:1996|Hs108|chr1 ( 385) 386 67.9 1.8e-11
CCDS44139.2 ELAVL4 gene_id:1996|Hs108|chr1 ( 402) 386 68.0 1.9e-11
CCDS45978.1 ELAVL3 gene_id:1995|Hs108|chr19 ( 360) 378 66.7 3.8e-11
CCDS32912.1 ELAVL3 gene_id:1995|Hs108|chr19 ( 367) 378 66.8 3.9e-11
>>CCDS2213.1 RBMS1 gene_id:5937|Hs108|chr2 (406 aa)
initn: 2734 init1: 2734 opt: 2734 Z-score: 2166.3 bits: 409.8 E(32554): 2.4e-114
Smith-Waterman score: 2734; 100.0% identity (100.0% similar) in 406 aa overlap (1-406:1-406)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGKVWKQQMYPQYATYYYPQYLQAKQSLVPAHPMAPPSPSTTSSNNNSSSSSNSGWDQLS
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CCDS22 MGKVWKQQMYPQYATYYYPQYLQAKQSLVPAHPMAPPSPSTTSSNNNSSSSSNSGWDQLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 KTNLYIRGLPPHTTDQDLVKLCQPYGKIVSTKAILDKTTNKCKGYGFVDFDSPAAAQKAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 KTNLYIRGLPPHTTDQDLVKLCQPYGKIVSTKAILDKTTNKCKGYGFVDFDSPAAAQKAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SALKASGVQAQMAKQQEQDPTNLYISNLPLSMDEQELENMLKPFGQVISTRILRDSSGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SALKASGVQAQMAKQQEQDPTNLYISNLPLSMDEQELENMLKPFGQVISTRILRDSSGTS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 RGVGFARMESTEKCEAVIGHFNGKFIKTPPGVSAPTEPLLCKFADGGQKKRQNPNKYIPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 RGVGFARMESTEKCEAVIGHFNGKFIKTPPGVSAPTEPLLCKFADGGQKKRQNPNKYIPN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 GRPWHREGEVRLAGMTLTYDPTTAAIQNGFYPSPYSIATNRMITQTSITPYIASPVSAYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 GRPWHREGEVRLAGMTLTYDPTTAAIQNGFYPSPYSIATNRMITQTSITPYIASPVSAYQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 VQSPSWMQPQPYILQHPGAVLTPSMEHTMSLQPASMISPLAQQMSHLSLGSTGTYMPATS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 VQSPSWMQPQPYILQHPGAVLTPSMEHTMSLQPASMISPLAQQMSHLSLGSTGTYMPATS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KB6 AMQGAYLPQYAHMQTTAVPVEEASGQQQVAVETSNDHSPYTFQPNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 AMQGAYLPQYAHMQTTAVPVEEASGQQQVAVETSNDHSPYTFQPNK
370 380 390 400
>>CCDS33726.1 RBMS3 gene_id:27303|Hs108|chr3 (420 aa)
initn: 1865 init1: 1217 opt: 1993 Z-score: 1583.2 bits: 301.9 E(32554): 7.3e-82
Smith-Waterman score: 2037; 73.8% identity (86.9% similar) in 427 aa overlap (1-406:1-420)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MGKVWKQ-QMYPQYATYYYPQYLQAKQSLVPA-HPMAPPSPSTTSSNNNSSSSSNSGWDQ
::: : :::::: :::::.:::.::: .:: ::::::::::.::.::::. ::. .:
CCDS33 MGKRLDQPQMYPQY-TYYYPHYLQTKQSYAPAPHPMAPPSPSTNSSSNNSSN--NSSGEQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 LSKTNLYIRGLPPHTTDQDLVKLCQPYGKIVSTKAILDKTTNKCKGYGFVDFDSPAAAQK
::::::::::::: ::::::.::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::
CCDS33 LSKTNLYIRGLPPGTTDQDLIKLCQPYGKIVSTKAILDKNTNQCKGYGFVDFDSPAAAQK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 AVSALKASGVQAQMAKQQEQDPTNLYISNLPLSMDEQELENMLKPFGQVISTRILRDSSG
::..:::.:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::..:
CCDS33 AVASLKANGVQAQMAKQQEQDPTNLYISNLPISMDEQELENMLKPFGHVISTRILRDANG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 TSRGVGFARMESTEKCEAVIGHFNGKFIKTPPGVSAPTEPLLCKFADGGQKKRQNPNKYI
.::::::::::::::::.:: :::::..:::::. ::.::::::::::::::::: .::
CCDS33 VSRGVGFARMESTEKCEVVIQHFNGKYLKTPPGIPAPSEPLLCKFADGGQKKRQNQSKYT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 PNGRPWHREGEVRLAGMTLTYDPTTAAIQNGFYPSPYSIATNRMITQTSITPYIA-SPVS
::::: :::: :::.:::::: :::::::: ::::::::::: ::::::.:: ::::
CCDS33 QNGRPWPREGE---AGMALTYDPT-AAIQNGFYSSPYSIATNRMIPQTSITPFIAASPVS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 AYQVQSPSWMQPQPYILQHPGAVLTPSMEHTMSLQPASMISPLAQQMSHLSLGSTGTYMP
.::::: ::: ::..: :::.::.:.: ::.:::.:..::.:::.:::::.:::::
CCDS33 TYQVQSTSWMPHPPYVMQPTGAVITPTMDHPMSMQPANMMGPLTQQMNHLSLGTTGTYMT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB6 ATSAMQGAYLPQYAHMQTTAVPVE----------------EASGQQQ-VAVETSNDHSP-
:.. :::.:.:::. . ::: .: ..::::: .::.:::.:.:
CCDS33 AAAPMQGTYIPQYTPVPPTAVSIEGVVADTSPQTVAPSSQDTSGQQQQIAVDTSNEHAPA
360 370 380 390 400 410
400
pF1KB6 YTFQPNK
:..: .:
CCDS33 YSYQQSK
420
>>CCDS54558.1 RBMS3 gene_id:27303|Hs108|chr3 (421 aa)
initn: 1865 init1: 1217 opt: 1993 Z-score: 1583.2 bits: 301.9 E(32554): 7.3e-82
Smith-Waterman score: 2037; 73.8% identity (86.9% similar) in 427 aa overlap (1-406:1-420)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MGKVWKQ-QMYPQYATYYYPQYLQAKQSLVPA-HPMAPPSPSTTSSNNNSSSSSNSGWDQ
::: : :::::: :::::.:::.::: .:: ::::::::::.::.::::. ::. .:
CCDS54 MGKRLDQPQMYPQY-TYYYPHYLQTKQSYAPAPHPMAPPSPSTNSSSNNSSN--NSSGEQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 LSKTNLYIRGLPPHTTDQDLVKLCQPYGKIVSTKAILDKTTNKCKGYGFVDFDSPAAAQK
::::::::::::: ::::::.::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::
CCDS54 LSKTNLYIRGLPPGTTDQDLIKLCQPYGKIVSTKAILDKNTNQCKGYGFVDFDSPAAAQK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 AVSALKASGVQAQMAKQQEQDPTNLYISNLPLSMDEQELENMLKPFGQVISTRILRDSSG
::..:::.:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::..:
CCDS54 AVASLKANGVQAQMAKQQEQDPTNLYISNLPISMDEQELENMLKPFGHVISTRILRDANG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 TSRGVGFARMESTEKCEAVIGHFNGKFIKTPPGVSAPTEPLLCKFADGGQKKRQNPNKYI
.::::::::::::::::.:: :::::..:::::. ::.::::::::::::::::: .::
CCDS54 VSRGVGFARMESTEKCEVVIQHFNGKYLKTPPGIPAPSEPLLCKFADGGQKKRQNQSKYT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 PNGRPWHREGEVRLAGMTLTYDPTTAAIQNGFYPSPYSIATNRMITQTSITPYIA-SPVS
::::: :::: :::.:::::: :::::::: ::::::::::: ::::::.:: ::::
CCDS54 QNGRPWPREGE---AGMALTYDPT-AAIQNGFYSSPYSIATNRMIPQTSITPFIAASPVS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 AYQVQSPSWMQPQPYILQHPGAVLTPSMEHTMSLQPASMISPLAQQMSHLSLGSTGTYMP
.::::: ::: ::..: :::.::.:.: ::.:::.:..::.:::.:::::.:::::
CCDS54 TYQVQSTSWMPHPPYVMQPTGAVITPTMDHPMSMQPANMMGPLTQQMNHLSLGTTGTYMT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB6 ATSAMQGAYLPQYAHMQTTAVPVE----------------EASGQQQ-VAVETSNDHSP-
:.. :::.:.:::. . ::: .: ..::::: .::.:::.:.:
CCDS54 AAAPMQGTYIPQYTPVPPTAVSIEGVVADTSPQTVAPSSQDTSGQQQQIAVDTSNEHAPA
360 370 380 390 400 410
400
pF1KB6 YTFQPNK
:..: .:
CCDS54 YSYQQSKP
420
>>CCDS33724.1 RBMS3 gene_id:27303|Hs108|chr3 (437 aa)
initn: 1526 init1: 1217 opt: 1922 Z-score: 1527.1 bits: 291.6 E(32554): 9.7e-79
Smith-Waterman score: 1995; 71.1% identity (83.7% similar) in 443 aa overlap (1-406:1-436)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MGKVWKQ-QMYPQYATYYYPQYLQAKQSLVPA-HPMAPPSPSTTSSNNNSSSSSNSGWDQ
::: : :::::: :::::.:::.::: .:: ::::::::::.::.::::. ::. .:
CCDS33 MGKRLDQPQMYPQY-TYYYPHYLQTKQSYAPAPHPMAPPSPSTNSSSNNSSN--NSSGEQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 LSKTNLYIRGLPPHTTDQDLVKLCQPYGKIVSTKAILDKTTNKCKGYGFVDFDSPAAAQK
::::::::::::: ::::::.::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::
CCDS33 LSKTNLYIRGLPPGTTDQDLIKLCQPYGKIVSTKAILDKNTNQCKGYGFVDFDSPAAAQK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 AVSALKASGVQAQMAKQQEQDPTNLYISNLPLSMDEQELENMLKPFGQVISTRILRDSSG
::..:::.:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::..:
CCDS33 AVASLKANGVQAQMAKQQEQDPTNLYISNLPISMDEQELENMLKPFGHVISTRILRDANG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 TSRGVGFARMESTEKCEAVIGHFNGKFIKTPPGVSAPTEPLLCKFADGGQKKRQNPNKYI
.::::::::::::::::.:: :::::..:::::. ::.::::::::::::::::: .::
CCDS33 VSRGVGFARMESTEKCEVVIQHFNGKYLKTPPGIPAPSEPLLCKFADGGQKKRQNQSKYT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 PNGRPWHREGEVRLAGMTLTYDPTTAAIQNGFYPSPYSIATNRMITQTSITPYIA-SPVS
::::: :::: :::.:::::: :::::::: ::::::::::: ::::::.:: ::::
CCDS33 QNGRPWPREGE---AGMALTYDPT-AAIQNGFYSSPYSIATNRMIPQTSITPFIAASPVS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 AYQVQSPSWMQPQPYILQHPGAVLTPSMEHTMSLQPASMISPLAQQMSHLSLGSTGT---
.::::: ::: ::..: :::.::.:.: ::.:::.:..::.:::.:::::.:::
CCDS33 TYQVQSTSWMPHPPYVMQPTGAVITPTMDHPMSMQPANMMGPLTQQMNHLSLGTTGTIQS
300 310 320 330 340 350
360 370 380
pF1KB6 -------------YMPATSAMQGAYLPQYAHMQTTAVPVE----------------EASG
:: :.. :::.:.:::. . ::: .: ..::
CCDS33 QDRIMILHQLLCQYMTAAAPMQGTYIPQYTPVPPTAVSIEGVVADTSPQTVAPSSQDTSG
360 370 380 390 400 410
390 400
pF1KB6 QQQ-VAVETSNDHSP-YTFQPNK
::: .::.:::.:.: :..: .:
CCDS33 QQQQIAVDTSNEHAPAYSYQQSKP
420 430
>>CCDS8923.1 RBMS2 gene_id:5939|Hs108|chr12 (407 aa)
initn: 1564 init1: 1195 opt: 1831 Z-score: 1455.9 bits: 278.3 E(32554): 8.9e-75
Smith-Waterman score: 1831; 69.5% identity (86.7% similar) in 407 aa overlap (11-406:9-407)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MGKVWKQQMYPQYATYYYPQYLQAKQSLVP-AHPMAPPSPSTTSSNNNSSSSSNSGWDQL
: .:. : . . :. : :. ::::::: .:. ::::.:: : :::
CCDS89 MLLSVTSRPGISTFGYNR--NNKKPYVSLAQQMAPPSPS--NSTPNSSSGSN-GNDQL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 SKTNLYIRGLPPHTTDQDLVKLCQPYGKIVSTKAILDKTTNKCKGYGFVDFDSPAAAQKA
:::::::::: : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS89 SKTNLYIRGLQPGTTDQDLVKLCQPYGKIVSTKAILDKTTNKCKGYGFVDFDSPSAAQKA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 VSALKASGVQAQMAKQQEQDPTNLYISNLPLSMDEQELENMLKPFGQVISTRILRDSSGT
:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::.:::
CCDS89 VTALKASGVQAQMAKQQEQDPTNLYISNLPLSMDEQELEGMLKPFGQVISTRILRDTSGT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 SRGVGFARMESTEKCEAVIGHFNGKFIKTPPGVSAPTEPLLCKFADGGQKKRQNPNKYIP
:::::::::::::::::.: :::::.::::::: ::..:::::::::: ::::: .:..
CCDS89 SRGVGFARMESTEKCEAIITHFNGKYIKTPPGVPAPSDPLLCKFADGGPKKRQNQGKFVQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 NGRPWHREGEVRLAGMTLTYDPTTAAIQNGFYPSPYSIATNRMITQTSITPYIASPVSAY
::: : :.... . :.:::::::: .::::::.::.:. :::..:....::..::::.:
CCDS89 NGRAWPRNADMGV--MALTYDPTTA-LQNGFYPAPYNITPNRMLAQSALSPYLSSPVSSY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 Q---------VQSPSWMQPQPYILQHPGAVLTPSMEHTMSLQPASMISPLAQQMSHLSLG
: : .::::. . :..: :.::::.:.: .:::::::..::.::..::::.
CCDS89 QRVTQTSPLQVPNPSWMHHHSYLMQPSGSVLTPGMDHPISLQPASMMGPLTQQLGHLSLS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB6 STGTYMPATSAMQGAYLPQYAHMQTTAVPVEEASGQQ-QVAVETSNDHSPYTFQPNK
:::::::...::::::. ::. . ...: :::.:::: ::::.. ..:. :.:: ::
CCDS89 STGTYMPTAAAMQGAYISQYTPVPSSSVSVEESSGQQNQVAVDAPSEHGVYSFQFNK
360 370 380 390 400
>>CCDS33725.1 RBMS3 gene_id:27303|Hs108|chr3 (419 aa)
initn: 1947 init1: 1211 opt: 1718 Z-score: 1366.9 bits: 261.9 E(32554): 8.2e-70
Smith-Waterman score: 1864; 68.8% identity (81.0% similar) in 443 aa overlap (1-406:1-418)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MGKVWKQ-QMYPQYATYYYPQYLQAKQSLVPA-HPMAPPSPSTTSSNNNSSSSSNSGWDQ
::: : :::::: :::::.:::.: : .:: ::::::::::.::.::::. ::. .:
CCDS33 MGKRLDQPQMYPQY-TYYYPHYLQTK-SYAPAPHPMAPPSPSTNSSSNNSSN--NSSGEQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 LSKTNLYIRGLPPHTTDQDLVKLCQPYGKIVSTKAILDKTTNKCKGYGFVDFDSPAAAQK
::::::::::::: ::::::.::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::
CCDS33 LSKTNLYIRGLPPGTTDQDLIKLCQPYGKIVSTKAILDKNTNQCKGYGFVDFDSPAAAQK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 AVSALKASGVQAQMAKQQEQDPTNLYISNLPLSMDEQELENMLKPFGQVISTRILRDSSG
::..:::.:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::..:
CCDS33 AVASLKANGVQAQMAKQQEQDPTNLYISNLPISMDEQELENMLKPFGHVISTRILRDANG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 TSRGVGFARMESTEKCEAVIGHFNGKFIKTPPGVSAPTEPLLCKFADGGQKKRQNPNKYI
.::::::::::::::::.:: :::::..:::::. ::.::::::::::::::::: .::
CCDS33 VSRGVGFARMESTEKCEVVIQHFNGKYLKTPPGIPAPSEPLLCKFADGGQKKRQNQSKYT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 PNGRPWHREGEVRLAGMTLTYDPTTAAIQNGFYPSPYSIATNRMITQTSITPYIA-SPVS
::::: :::: :::.:::::: :::::::: ::::::::::: ::::::.:: ::::
CCDS33 QNGRPWPREGE---AGMALTYDPT-AAIQNGFYSSPYSIATNRMIPQTSITPFIAASPVS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 AYQVQSPSWMQPQPYILQHPGAVLTPSMEHTMSLQPASMISPLAQQMSHLSLGSTGT---
.:: :::.::.:.: ::.:::.:..::.:::.:::::.:::
CCDS33 TYQ-----------------GAVITPTMDHPMSMQPANMMGPLTQQMNHLSLGTTGTIQS
300 310 320 330
360 370 380
pF1KB6 -------------YMPATSAMQGAYLPQYAHMQTTAVPVE----------------EASG
:: :.. :::.:.:::. . ::: .: ..::
CCDS33 QDRIMILHQLLCQYMTAAAPMQGTYIPQYTPVPPTAVSIEGVVADTSPQTVAPSSQDTSG
340 350 360 370 380 390
390 400
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CCDS33 QQQQIAVDTSNEHAPAYSYQQSKP
400 410
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CCDS54 LSKTNLYIRGLPPGTTDQDLIKLCQPYGKIVSTKAILDKNTNQCKGYGFVDFDSPAAAQK
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CCDS54 TPFIAASPVSTYQVQSTSWMPHPPYVMQPTGAVITPTMDHPMSMQPANMMGPLTQQMNHL
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350 360 370 380 390
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CCDS54 SLGTTGTYMTAAAPMQGTYIPQYTPVPPTAVSIEGVVADTSPQTVAPSSQDTSGQQQQIA
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400
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CCDS54 VDTSNEHAPAYSYQQSK
420 430
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: . :. :::.:.:: .: ..:::.... .:..:..::: :. .: ::::
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CCDS65 METQLSNGPTCNNTANGPTTINNNCSSPVDSGNTEDSKTNLIVNYLPQ
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pF1KB6 HTTDQDLVKLCQPYGKIVSTKAILDKTTNKCKGYGFVDFDSPAAAQKAVSALKASGVQAQ
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CCDS65 NMTQEELKSLFGSIGEIESCKLVRDKITGQSLGYGFVNYIDPKDAEKAINTLNGLRLQTK
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pF1KB6 GFARMESTEKCEAVIGHFNGKFIKTPPGVSAPTEPLLCKFADGGQKKR---------QNP
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CCDS65 GFIRFDKRIEAEEAIKGLNGQ---KPPGA---TEPITVKFANNPSQKTNQAILSQLYQSP
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:. :
CCDS65 NRRYPGPLAQQAQRFRLDNLLNMAYGVKRFSPMTIDGMTSLAGINIPGHPGTGWCIFVYN
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CCDS44 MEQIISTMEPQVSNGPTSNTSNGPSSNNRNCPSPMQTGATTDD
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CCDS44 LVDQVTGVSRGVGFIRFDKRIEAEEAIKGLNGQ---KPSGA---TEPITVKFANNPSQKS
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CCDS44 SQALLSQLYQSPNRRYPG--PLHHQAQRFRLDNLLNMAYGVKRFSPITIDGMTSLVGMNI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]