FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2449, 940 aa 1>>>pF1KE2449 940 - 940 aa - 940 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5561+/-0.000467; mu= 15.5601+/- 0.029 mean_var=122.3595+/-24.570, 0's: 0 Z-trim(111.8): 116 B-trim: 123 in 1/56 Lambda= 0.115946 statistics sampled from 20358 (20474) to 20358 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.598), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16 Scan time: 9.800 The best scores are: opt bits E(85289) NP_055383 (OMIM: 615129) polypeptide N-acetylgalac ( 940) 6312 1068.4 0 XP_016858726 (OMIM: 615129) PREDICTED: polypeptide ( 956) 6000 1016.2 0 NP_001316797 (OMIM: 615129) polypeptide N-acetylga ( 470) 3167 542.1 2.5e-153 XP_016858727 (OMIM: 615129) PREDICTED: polypeptide ( 501) 3153 539.7 1.3e-152 XP_016881181 (OMIM: 602273) PREDICTED: polypeptide ( 559) 1397 246.0 3.9e-64 NP_065207 (OMIM: 602273) polypeptide N-acetylgalac ( 559) 1397 246.0 3.9e-64 XP_005258296 (OMIM: 602273) PREDICTED: polypeptide ( 559) 1397 246.0 3.9e-64 XP_016858747 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 571) 1383 243.7 2e-63 XP_011508839 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 571) 1383 243.7 2e-63 XP_016858748 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 571) 1383 243.7 2e-63 NP_443149 (OMIM: 608369) polypeptide N-acetylgalac ( 556) 1372 241.9 7e-63 XP_016858750 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 556) 1372 241.9 7e-63 XP_016858749 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 561) 1371 241.7 7.9e-63 NP_001288556 (OMIM: 608369) polypeptide N-acetylga ( 561) 1371 241.7 7.9e-63 XP_011530295 (OMIM: 615138) PREDICTED: polypeptide ( 522) 1263 223.6 2.1e-57 NP_001030017 (OMIM: 615138) polypeptide N-acetylga ( 601) 1263 223.6 2.3e-57 XP_016863733 (OMIM: 615138) PREDICTED: polypeptide ( 609) 1263 223.7 2.3e-57 NP_938080 (OMIM: 608043) polypeptide N-acetylgalac ( 603) 1253 222.0 7.3e-57 NP_003765 (OMIM: 603565) polypeptide N-acetylgalac ( 578) 1246 220.8 1.6e-56 XP_011509231 (OMIM: 601756) PREDICTED: polypeptide ( 633) 1232 218.5 8.6e-56 XP_005246506 (OMIM: 601756) PREDICTED: polypeptide ( 633) 1232 218.5 8.6e-56 NP_004473 (OMIM: 601756) polypeptide N-acetylgalac ( 633) 1232 218.5 8.6e-56 XP_016859259 (OMIM: 601756) PREDICTED: polypeptide ( 633) 1232 218.5 8.6e-56 XP_011536124 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1186 210.8 1.8e-53 XP_016874234 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1186 210.8 1.8e-53 XP_005268664 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1186 210.8 1.8e-53 XP_006719277 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1186 210.8 1.8e-53 XP_016874233 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1186 210.8 1.8e-53 XP_011536121 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1186 210.8 1.8e-53 NP_009141 (OMIM: 605148) polypeptide N-acetylgalac ( 622) 1186 210.8 1.8e-53 NP_001278795 (OMIM: 602274) polypeptide N-acetylga ( 533) 1182 210.1 2.5e-53 NP_004472 (OMIM: 602274) polypeptide N-acetylgalac ( 571) 1182 210.1 2.6e-53 NP_078918 (OMIM: 608812,610290) polypeptide N-acet ( 581) 1169 207.9 1.2e-52 NP_001291443 (OMIM: 615130) polypeptide N-acetylga ( 527) 1165 207.2 1.8e-52 XP_006716146 (OMIM: 615130) PREDICTED: polypeptide ( 608) 1165 207.3 2e-52 XP_006716147 (OMIM: 615130) PREDICTED: polypeptide ( 608) 1165 207.3 2e-52 NP_071370 (OMIM: 615130) polypeptide N-acetylgalac ( 608) 1165 207.3 2e-52 XP_006716145 (OMIM: 615130) PREDICTED: polypeptide ( 608) 1165 207.3 2e-52 XP_016860395 (OMIM: 608225) PREDICTED: polypeptide ( 563) 1149 204.6 1.2e-51 NP_001316024 (OMIM: 608225) polypeptide N-acetylga ( 517) 1145 203.9 1.8e-51 NP_001316025 (OMIM: 608225) polypeptide N-acetylga ( 532) 1145 203.9 1.8e-51 NP_001240756 (OMIM: 608225) polypeptide N-acetylga ( 532) 1145 203.9 1.8e-51 NP_078848 (OMIM: 608225) polypeptide N-acetylgalac ( 552) 1145 203.9 1.9e-51 XP_011535309 (OMIM: 615132) PREDICTED: polypeptide ( 514) 1136 202.3 5e-51 XP_016876987 (OMIM: 615132) PREDICTED: polypeptide ( 558) 1136 202.4 5.4e-51 XP_011535308 (OMIM: 615132) PREDICTED: polypeptide ( 558) 1136 202.4 5.4e-51 XP_011535307 (OMIM: 615132) PREDICTED: polypeptide ( 558) 1136 202.4 5.4e-51 NP_065743 (OMIM: 615132) polypeptide N-acetylgalac ( 558) 1136 202.4 5.4e-51 NP_001161840 (OMIM: 615132) polypeptide N-acetylga ( 558) 1136 202.4 5.4e-51 XP_016856454 (OMIM: 602274) PREDICTED: polypeptide ( 598) 1134 202.1 7.1e-51 >>NP_055383 (OMIM: 615129) polypeptide N-acetylgalactosa (940 aa) initn: 6312 init1: 6312 opt: 6312 Z-score: 5712.7 bits: 1068.4 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 6312; 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