Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7818
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7818, 598 aa
1>>>pF1KB7818 598 - 598 aa - 598 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5671+/-0.000785; mu= 10.2248+/- 0.048
mean_var=148.8679+/-29.792, 0's: 0 Z-trim(113.4): 128 B-trim: 61 in 1/53
Lambda= 0.105117
statistics sampled from 14046 (14186) to 14046 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.757), E-opt: 0.2 (0.424), width: 16
Scan time: 1.770
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS2201.1 NR4A2 gene_id:4929|Hs109|chr2 ( 598) 4148 640.7 1.6e-183
CCDS86887.1 NR4A2 gene_id:4929|Hs109|chr2 ( 535) 3735 578.0 1.1e-164
CCDS8818.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs109|chr12 ( 598) 1922 303.1 6.8e-82
CCDS55828.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs109|chr12 ( 611) 1922 303.1 6.9e-82
CCDS73471.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs109|chr12 ( 652) 1922 303.1 7.3e-82
CCDS6743.1 NR4A3 gene_id:8013|Hs109|chr9 ( 626) 1822 288.0 2.6e-77
CCDS6742.1 NR4A3 gene_id:8013|Hs109|chr9 ( 637) 1822 288.0 2.6e-77
CCDS6744.1 NR4A3 gene_id:8013|Hs109|chr9 ( 443) 883 145.4 1.5e-34
CCDS42317.1 RARA gene_id:5914|Hs109|chr17 ( 457) 731 122.4 1.3e-27
CCDS11366.1 RARA gene_id:5914|Hs109|chr17 ( 462) 723 121.2 3e-27
CCDS41790.1 RARG gene_id:5916|Hs109|chr12 ( 443) 716 120.1 6.1e-27
CCDS2642.1 RARB gene_id:5915|Hs109|chr3 ( 448) 714 119.8 7.6e-27
CCDS8850.1 RARG gene_id:5916|Hs109|chr12 ( 454) 709 119.1 1.3e-26
CCDS58236.1 RARG gene_id:5916|Hs109|chr12 ( 382) 701 117.8 2.6e-26
CCDS58061.1 ESRRG gene_id:2104|Hs109|chr1 ( 470) 687 115.7 1.4e-25
CCDS1517.1 ESRRG gene_id:2104|Hs109|chr1 ( 435) 685 115.4 1.6e-25
CCDS41468.1 ESRRG gene_id:2104|Hs109|chr1 ( 458) 685 115.4 1.6e-25
CCDS9850.2 ESRRB gene_id:2103|Hs109|chr14 ( 508) 648 109.9 8.7e-24
CCDS58237.1 RARG gene_id:5916|Hs109|chr12 ( 432) 605 103.3 7e-22
CCDS12352.1 NR2F6 gene_id:2063|Hs109|chr19 ( 404) 580 99.5 9.2e-21
CCDS41667.1 ESRRA gene_id:2101|Hs109|chr11 ( 423) 564 97.1 5.1e-20
CCDS60830.1 ESRRA gene_id:2101|Hs109|chr11 ( 422) 560 96.5 7.8e-20
CCDS4068.1 NR2F1 gene_id:7025|Hs109|chr5 ( 423) 527 91.4 2.5e-18
CCDS46775.1 RARB gene_id:5915|Hs109|chr3 ( 336) 518 90.0 5.4e-18
CCDS4768.1 RXRB gene_id:6257|Hs109|chr6 ( 533) 520 90.5 6.3e-18
CCDS10375.1 NR2F2 gene_id:7026|Hs109|chr15 ( 414) 518 90.1 6.3e-18
CCDS59007.1 RXRB gene_id:6257|Hs109|chr6 ( 537) 514 89.5 1.2e-17
CCDS61470.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14 ( 474) 500 87.4 4.7e-17
CCDS55920.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14 ( 481) 500 87.4 4.7e-17
CCDS32096.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14 ( 495) 500 87.4 4.8e-17
CCDS9762.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14 ( 530) 500 87.4 5.1e-17
CCDS35172.1 RXRA gene_id:6256|Hs109|chr9 ( 462) 462 81.6 2.5e-15
CCDS4278.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs109|chr5 ( 777) 458 81.2 5.7e-15
CCDS47298.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs109|chr5 ( 742) 457 81.0 6.1e-15
CCDS34258.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs109|chr5 ( 778) 446 79.3 2e-14
CCDS60383.1 NR5A2 gene_id:2494|Hs109|chr1 ( 469) 404 72.8 1.1e-12
CCDS1400.1 NR5A2 gene_id:2494|Hs109|chr1 ( 495) 404 72.8 1.2e-12
CCDS1401.1 NR5A2 gene_id:2494|Hs109|chr1 ( 541) 404 72.9 1.3e-12
CCDS1248.1 RXRG gene_id:6258|Hs109|chr1 ( 463) 395 71.5 2.9e-12
CCDS72970.1 RXRG gene_id:6258|Hs109|chr1 ( 340) 390 70.6 3.8e-12
CCDS43965.1 AR gene_id:367|Hs109|chrX ( 388) 377 68.7 1.6e-11
CCDS6856.1 NR5A1 gene_id:2516|Hs109|chr9 ( 461) 378 68.9 1.7e-11
CCDS14387.1 AR gene_id:367|Hs109|chrX ( 920) 377 68.9 3.3e-11
CCDS13331.1 HNF4A gene_id:3172|Hs109|chr20 ( 417) 369 67.5 4e-11
CCDS46605.1 HNF4A gene_id:3172|Hs109|chr20 ( 464) 369 67.5 4.4e-11
CCDS41821.1 NR2C1 gene_id:7181|Hs109|chr12 ( 467) 369 67.5 4.4e-11
CCDS13330.1 HNF4A gene_id:3172|Hs109|chr20 ( 474) 369 67.5 4.5e-11
CCDS44953.1 NR2C1 gene_id:7181|Hs109|chr12 ( 483) 369 67.5 4.5e-11
CCDS68131.1 HNF4A gene_id:3172|Hs109|chr20 ( 395) 367 67.2 4.8e-11
CCDS61469.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14 ( 439) 367 67.2 5.2e-11
>>CCDS2201.1 NR4A2 gene_id:4929|Hs109|chr2 (598 aa)
initn: 4148 init1: 4148 opt: 4148 Z-score: 3408.3 bits: 640.7 E(33420): 1.6e-183
Smith-Waterman score: 4148; 100.0% identity (100.0% similar) in 598 aa overlap (1-598:1-598)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPCVQAQYGSSPQGASPASQSYSYHSSGEYSSDFLTPEFVKFSMDLTNTEITATTSLPSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MPCVQAQYGSSPQGASPASQSYSYHSSGEYSSDFLTPEFVKFSMDLTNTEITATTSLPSF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 STFMDNYSTGYDVKPPCLYQMPLSGQQSSIKVEDIQMHNYQQHSHLPPQSEEMMPHSGSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 STFMDNYSTGYDVKPPCLYQMPLSGQQSSIKVEDIQMHNYQQHSHLPPQSEEMMPHSGSV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YYKPSSPPTPTTPGFQVQHSPMWDDPGSLHNFHQNYVATTHMIEQRKTPVSRLSLFSFKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 YYKPSSPPTPTTPGFQVQHSPMWDDPGSLHNFHQNYVATTHMIEQRKTPVSRLSLFSFKQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SPPGTPVSSCQMRFDGPLHVPMNPEPAGSHHVVDGQTFAVPNPIRKPASMGFPGLQIGHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SPPGTPVSSCQMRFDGPLHVPMNPEPAGSHHVVDGQTFAVPNPIRKPASMGFPGLQIGHA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SQLLDTQVPSPPSRGSPSNEGLCAVCGDNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SQLLDTQVPSPPSRGSPSNEGLCAVCGDNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ANKNCPVDKRRRNRCQYCRFQKCLAVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKSPQEPSPPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 ANKNCPVDKRRRNRCQYCRFQKCLAVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKSPQEPSPPSP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 PVSLISALVRAHVDSNPAMTSLDYSRFQANPDYQMSGDDTQHIQQFYDLLTGSMEIIRGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 PVSLISALVRAHVDSNPAMTSLDYSRFQANPDYQMSGDDTQHIQQFYDLLTGSMEIIRGW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 AEKIPGFADLPKADQDLLFESAFLELFVLRLAYRSNPVEGKLIFCNGVVLHRLQCVRGFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 AEKIPGFADLPKADQDLLFESAFLELFVLRLAYRSNPVEGKLIFCNGVVLHRLQCVRGFG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 EWIDSIVEFSSNLQNMNIDISAFSCIAALAMVTERHGLKEPKRVEELQNKIVNCLKDHVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 EWIDSIVEFSSNLQNMNIDISAFSCIAALAMVTERHGLKEPKRVEELQNKIVNCLKDHVT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KB7 FNNGGLNRPNYLSKLLGKLPELRTLCTQGLQRIFYLKLEDLVPPPAIIDKLFLDTLPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 FNNGGLNRPNYLSKLLGKLPELRTLCTQGLQRIFYLKLEDLVPPPAIIDKLFLDTLPF
550 560 570 580 590
>>CCDS86887.1 NR4A2 gene_id:4929|Hs109|chr2 (535 aa)
initn: 3735 init1: 3735 opt: 3735 Z-score: 3070.5 bits: 578.0 E(33420): 1.1e-164
Smith-Waterman score: 3735; 100.0% identity (100.0% similar) in 535 aa overlap (64-598:1-535)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 FLTPEFVKFSMDLTNTEITATTSLPSFSTFMDNYSTGYDVKPPCLYQMPLSGQQSSIKVE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 MDNYSTGYDVKPPCLYQMPLSGQQSSIKVE
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 DIQMHNYQQHSHLPPQSEEMMPHSGSVYYKPSSPPTPTTPGFQVQHSPMWDDPGSLHNFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 DIQMHNYQQHSHLPPQSEEMMPHSGSVYYKPSSPPTPTTPGFQVQHSPMWDDPGSLHNFH
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 QNYVATTHMIEQRKTPVSRLSLFSFKQSPPGTPVSSCQMRFDGPLHVPMNPEPAGSHHVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 QNYVATTHMIEQRKTPVSRLSLFSFKQSPPGTPVSSCQMRFDGPLHVPMNPEPAGSHHVV
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220 230 240 250 260 270
pF1KB7 DGQTFAVPNPIRKPASMGFPGLQIGHASQLLDTQVPSPPSRGSPSNEGLCAVCGDNAACQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 DGQTFAVPNPIRKPASMGFPGLQIGHASQLLDTQVPSPPSRGSPSNEGLCAVCGDNAACQ
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 HYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCLANKNCPVDKRRRNRCQYCRFQKCLAVGMVKEVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 HYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCLANKNCPVDKRRRNRCQYCRFQKCLAVGMVKEVV
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 RTDSLKGRRGRLPSKPKSPQEPSPPSPPVSLISALVRAHVDSNPAMTSLDYSRFQANPDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 RTDSLKGRRGRLPSKPKSPQEPSPPSPPVSLISALVRAHVDSNPAMTSLDYSRFQANPDY
280 290 300 310 320 330
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pF1KB7 QMSGDDTQHIQQFYDLLTGSMEIIRGWAEKIPGFADLPKADQDLLFESAFLELFVLRLAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 QMSGDDTQHIQQFYDLLTGSMEIIRGWAEKIPGFADLPKADQDLLFESAFLELFVLRLAY
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 RSNPVEGKLIFCNGVVLHRLQCVRGFGEWIDSIVEFSSNLQNMNIDISAFSCIAALAMVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 RSNPVEGKLIFCNGVVLHRLQCVRGFGEWIDSIVEFSSNLQNMNIDISAFSCIAALAMVT
400 410 420 430 440 450
520 530 540 550 560 570
pF1KB7 ERHGLKEPKRVEELQNKIVNCLKDHVTFNNGGLNRPNYLSKLLGKLPELRTLCTQGLQRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 ERHGLKEPKRVEELQNKIVNCLKDHVTFNNGGLNRPNYLSKLLGKLPELRTLCTQGLQRI
460 470 480 490 500 510
580 590
pF1KB7 FYLKLEDLVPPPAIIDKLFLDTLPF
:::::::::::::::::::::::::
CCDS86 FYLKLEDLVPPPAIIDKLFLDTLPF
520 530
>>CCDS8818.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs109|chr12 (598 aa)
initn: 1349 init1: 1124 opt: 1922 Z-score: 1583.9 bits: 303.1 E(33420): 6.8e-82
Smith-Waterman score: 2117; 55.2% identity (75.8% similar) in 631 aa overlap (1-598:1-598)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPCVQAQYGSSPQGASPASQSYSYHSSGEYSSDFLTPEFVKFSMDLTNTEIT--ATTSLP
:::.:::::. : . ::. ... .:: :::::.: .:::.. : . : :.::
CCDS88 MPCIQAQYGT-P-APSPGPRDH-------LASDPLTPEFIKPTMDLASPEAAPAAPTALP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KB7 SFSTFMDNYSTGYDVKPPCLYQMP----------------LSGQQSSIKVEDIQMHNYQQ
:::::::.:. .:. :::.: :.. .: .......:
CCDS88 SFSTFMDGYTGEFDT---FLYQLPGTVQPCSSASSSASSTSSSSATSPASASFKFEDFQV
60 70 80 90 100
110 120 130 140 150
pF1KB7 HSHLP-PQS---EEMMPHSGSVYY-KPSSPPTPTTPGFQV-QHSPMWDDPGSLHNFH--Q
.. : : : .: . ::: :: .: : :.:.::.:: : :: :: ::. .: :
CCDS88 YGCYPGPLSGPVDEALSSSGSDYYGSPCSAPSPSTPSFQPPQLSP-WD--GSFGHFSPSQ
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 NYV---ATTHMIEQRKTPVSRLSLFSFKQSPPGTPVSSCQMRFDGPLHVPMNPEPAGSHH
.: : :... . . : . ..::: ::: : : . .::. . : : .:.
CCDS88 TYEGLRAWTEQLPKASGPPQPPAFFSF--SPPTGPSPSLAQ---SPLK--LFPSQA-THQ
170 180 190 200 210
220 230 240 250 260
pF1KB7 VVDGQTFAVPN--PIRKPASMGFPGLQIGHASQLLDTQVPSPPSR-GSPS-NEGLCAVCG
. .:.....:. : :.: : :. .: .::: : : .: :.:. .:: :::::
CCDS88 LGEGESYSMPTAFPGLAPTS---PHLE---GSGILDTPVTSTKARSGAPGGSEGRCAVCG
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 DNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCLANKNCPVDKRRRNRCQYCRFQKCLAVG
:::.::::::::::::::::::::::::::.:::::.::::::::::::.::::::::::
CCDS88 DNASCQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYICLANKDCPVDKRRRNRCQFCRFQKCLAVG
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 MVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKSPQEPSPPSPPVSLISALVRAHVDSNPAMTSLDYSRF
:::::::::::::::::::::::.: : . :..:...:::::.::.:. ..::::.:
CCDS88 MVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKQP----PDASPANLLTSLVRAHLDSGPSTAKLDYSKF
340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 QANPDYQMSGDDTQHIQQFYDLLTGSMEIIRGWAEKIPGFADLPKADQDLLFESAFLELF
: ... .:. .:::::::.::.:.:: :::::::::.: ::::::.::::::::
CCDS88 QELVLPHFGKEDAGDVQQFYDLLSGSLEVIRKWAEKIPGFAELSPADQDLLLESAFLELF
390 400 410 420 430 440
450 460 470 480 490 500
pF1KB7 VLRLAYRSNPVEGKLIFCNGVVLHRLQCVRGFGEWIDSIVEFSSNLQNMNIDISAFSCIA
.:::::::.: :::::::.:.:::::::.::::.:::::. :: .:... .:. ::.:..
CCDS88 ILRLAYRSKPGEGKLIFCSGLVLHRLQCARGFGDWIDSILAFSRSLHSLLVDVPAFACLS
450 460 470 480 490 500
510 520 530 540 550 560
pF1KB7 ALAMVTERHGLKEPKRVEELQNKIVNCLKDHVTFNNGGLNRPNYLSKLLGKLPELRTLCT
::...:.::::.::.:::::::.:..:::.::. : . . ::.:::::::::::::
CCDS88 ALVLITDRHGLQEPRRVEELQNRIASCLKEHVAAVAGEPQPASCLSRLLGKLPELRTLCT
510 520 530 540 550 560
570 580 590
pF1KB7 QGLQRIFYLKLEDLVPPPAIIDKLFLDTLPF
:::::::::::::::::: ::::.:.:::::
CCDS88 QGLQRIFYLKLEDLVPPPPIIDKIFMDTLPF
570 580 590
>>CCDS55828.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs109|chr12 (611 aa)
initn: 1349 init1: 1124 opt: 1922 Z-score: 1583.8 bits: 303.1 E(33420): 6.9e-82
Smith-Waterman score: 2117; 55.2% identity (75.8% similar) in 631 aa overlap (1-598:14-611)
10 20 30 40
pF1KB7 MPCVQAQYGSSPQGASPASQSYSYHSSGEYSSDFLTPEFVKFSMDLT
:::.:::::. : . ::. ... .:: :::::.: .:::.
CCDS55 MWLAKACWSIQSEMPCIQAQYGT-P-APSPGPRDH-------LASDPLTPEFIKPTMDLA
10 20 30 40 50
50 60 70 80
pF1KB7 NTEIT--ATTSLPSFSTFMDNYSTGYDVKPPCLYQMP----------------LSGQQSS
. : . : :.:::::::::.:. .:. :::.: :.. .:
CCDS55 SPEAAPAAPTALPSFSTFMDGYTGEFDT---FLYQLPGTVQPCSSASSSASSTSSSSATS
60 70 80 90 100
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 IKVEDIQMHNYQQHSHLP-PQS---EEMMPHSGSVYY-KPSSPPTPTTPGFQV-QHSPMW
.......: .. : : : .: . ::: :: .: : :.:.::.:: : :: :
CCDS55 PASASFKFEDFQVYGCYPGPLSGPVDEALSSSGSDYYGSPCSAPSPSTPSFQPPQLSP-W
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190
pF1KB7 DDPGSLHNFH--QNYV---ATTHMIEQRKTPVSRLSLFSFKQSPPGTPVSSCQMRFDGPL
: ::. .: :.: : :... . . : . ..::: ::: : : . .::
CCDS55 D--GSFGHFSPSQTYEGLRAWTEQLPKASGPPQPPAFFSF--SPPTGPSPSLAQ---SPL
170 180 190 200 210 220
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 HVPMNPEPAGSHHVVDGQTFAVPN--PIRKPASMGFPGLQIGHASQLLDTQVPSPPSR-G
. . : : .:.. .:.....:. : :.: : :. .: .::: : : .: :
CCDS55 K--LFPSQA-THQLGEGESYSMPTAFPGLAPTS---PHLE---GSGILDTPVTSTKARSG
230 240 250 260 270
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 SPS-NEGLCAVCGDNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCLANKNCPVDKRRRNR
.:. .:: ::::::::.::::::::::::::::::::::::::.:::::.::::::::::
CCDS55 APGGSEGRCAVCGDNASCQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYICLANKDCPVDKRRRNR
280 290 300 310 320 330
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 CQYCRFQKCLAVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKSPQEPSPPSPPVSLISALVRAHVD
::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.: : . :..:...:::::.:
CCDS55 CQFCRFQKCLAVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKQP----PDASPANLLTSLVRAHLD
340 350 360 370 380
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 SNPAMTSLDYSRFQANPDYQMSGDDTQHIQQFYDLLTGSMEIIRGWAEKIPGFADLPKAD
:.:. ..::::.:: ... .:. .:::::::.::.:.:: :::::::::.: ::
CCDS55 SGPSTAKLDYSKFQELVLPHFGKEDAGDVQQFYDLLSGSLEVIRKWAEKIPGFAELSPAD
390 400 410 420 430 440
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 QDLLFESAFLELFVLRLAYRSNPVEGKLIFCNGVVLHRLQCVRGFGEWIDSIVEFSSNLQ
::::.::::::::.:::::::.: :::::::.:.:::::::.::::.:::::. :: .:.
CCDS55 QDLLLESAFLELFILRLAYRSKPGEGKLIFCSGLVLHRLQCARGFGDWIDSILAFSRSLH
450 460 470 480 490 500
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 NMNIDISAFSCIAALAMVTERHGLKEPKRVEELQNKIVNCLKDHVTFNNGGLNRPNYLSK
.. .:. ::.:..::...:.::::.::.:::::::.:..:::.::. : . . ::.
CCDS55 SLLVDVPAFACLSALVLITDRHGLQEPRRVEELQNRIASCLKEHVAAVAGEPQPASCLSR
510 520 530 540 550 560
560 570 580 590
pF1KB7 LLGKLPELRTLCTQGLQRIFYLKLEDLVPPPAIIDKLFLDTLPF
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:.:::::
CCDS55 LLGKLPELRTLCTQGLQRIFYLKLEDLVPPPPIIDKIFMDTLPF
570 580 590 600 610
>>CCDS73471.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs109|chr12 (652 aa)
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10 20 30
pF1KB7 MPCVQAQYGSSPQGASPASQSYSYHSSGEY
:::.:::::. : . ::. ...
CCDS73 PPRQPGSFCWALKADGIMWLAKACWSIQSEMPCIQAQYGT-P-APSPGPRDH-------L
30 40 50 60 70
40 50 60 70 80
pF1KB7 SSDFLTPEFVKFSMDLTNTEIT--ATTSLPSFSTFMDNYSTGYDVKPPCLYQMP------
.:: :::::.: .:::.. : . : :.:::::::::.:. .:. :::.:
CCDS73 ASDPLTPEFIKPTMDLASPEAAPAAPTALPSFSTFMDGYTGEFDT---FLYQLPGTVQPC
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120
pF1KB7 ----------LSGQQSSIKVEDIQMHNYQQHSHLP-PQS---EEMMPHSGSVYY-KPSSP
:.. .: .......: .. : : : .: . ::: :: .: :
CCDS73 SSASSSASSTSSSSATSPASASFKFEDFQVYGCYPGPLSGPVDEALSSSGSDYYGSPCSA
140 150 160 170 180 190
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 PTPTTPGFQV-QHSPMWDDPGSLHNFH--QNYV---ATTHMIEQRKTPVSRLSLFSFKQS
:.:.::.:: : :: :: ::. .: :.: : :... . . : . ..::: :
CCDS73 PSPSTPSFQPPQLSP-WD--GSFGHFSPSQTYEGLRAWTEQLPKASGPPQPPAFFSF--S
200 210 220 230 240
190 200 210 220 230
pF1KB7 PPGTPVSSCQMRFDGPLHVPMNPEPAGSHHVVDGQTFAVPN--PIRKPASMGFPGLQIGH
:: : : . .::. . : : .:.. .:.....:. : :.: : :.
CCDS73 PPTGPSPSLAQ---SPLK--LFPSQA-THQLGEGESYSMPTAFPGLAPTS---PHLE---
250 260 270 280 290
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 ASQLLDTQVPSPPSR-GSPS-NEGLCAVCGDNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKY
.: .::: : : .: :.:. .:: ::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GSGILDTPVTSTKARSGAPGGSEGRCAVCGDNASCQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKY
300 310 320 330 340 350
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 VCLANKNCPVDKRRRNRCQYCRFQKCLAVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKSPQEPSP
.:::::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.: :
CCDS73 ICLANKDCPVDKRRRNRCQFCRFQKCLAVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKQP----P
360 370 380 390 400 410
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 PSPPVSLISALVRAHVDSNPAMTSLDYSRFQANPDYQMSGDDTQHIQQFYDLLTGSMEII
. :..:...:::::.::.:. ..::::.:: ... .:. .:::::::.::.:.:
CCDS73 DASPANLLTSLVRAHLDSGPSTAKLDYSKFQELVLPHFGKEDAGDVQQFYDLLSGSLEVI
420 430 440 450 460 470
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 RGWAEKIPGFADLPKADQDLLFESAFLELFVLRLAYRSNPVEGKLIFCNGVVLHRLQCVR
: :::::::::.: ::::::.::::::::.:::::::.: :::::::.:.:::::::.:
CCDS73 RKWAEKIPGFAELSPADQDLLLESAFLELFILRLAYRSKPGEGKLIFCSGLVLHRLQCAR
480 490 500 510 520 530
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 GFGEWIDSIVEFSSNLQNMNIDISAFSCIAALAMVTERHGLKEPKRVEELQNKIVNCLKD
:::.:::::. :: .:... .:. ::.:..::...:.::::.::.:::::::.:..:::.
CCDS73 GFGDWIDSILAFSRSLHSLLVDVPAFACLSALVLITDRHGLQEPRRVEELQNRIASCLKE
540 550 560 570 580 590
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 HVTFNNGGLNRPNYLSKLLGKLPELRTLCTQGLQRIFYLKLEDLVPPPAIIDKLFLDTLP
::. : . . ::.::::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:.::::
CCDS73 HVAAVAGEPQPASCLSRLLGKLPELRTLCTQGLQRIFYLKLEDLVPPPPIIDKIFMDTLP
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pF1KB7 F
:
CCDS73 F
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10 20 30 40 50
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::::::::. :: :.: :.:.:: .::......:...:..::: .:::::: ::::
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10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KB7 SFSTFMDNYSTGYDVKPPCLYQMPLSGQQSSIKVEDIQMHNYQQHSH-------------
:.:::...::..:..:: :.::: :. ::::. . .:..: :
CCDS67 SISTFVEGYSSNYELKPSCVYQM----QRPLIKVEEGRAPSYHHHHHHHHHHHHHHQQQH
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
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120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KB7 VATTHMIEQRKTPVSRLSLFSFKQSPPGTPVSS----CQMRFD----GPLHVPMNPEPAG
. : . .:. :: :: ::: :. : .. .: . : .:.. :.
CCDS67 LLDPPMKAVPTVAGARFPLFHFKPSPPHPPAPSPAGGHHLGYDPTAAAALSLPLGAAAAA
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 SHHVVDGQTFAVPNPI-RKPASMGFPGLQIGH---ASQLL--DTQVPSPPSRGSPSNEGL
. ... .. :. .. : ..:: : . ::.:: . ..::::::.: :.::
CCDS67 GSQAAALESHPYGLPLAKRAAPLAFPPLGLTPSPTASSLLGESPSLPSPPSRSSSSGEGT
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 CAVCGDNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCLANKNCPVDKRRRNRCQYCRFQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 CAVCGDNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCLANKNCPVDKRRRNRCQYCRFQK
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370
pF1KB7 CLAVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKSP--QEPS---PPSPPVSLISALVRAHVDSNP
::.::::::::::::::::::::::::::: :::: :::::. ...::::: .::.:
CCDS67 CLSVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKSPLQQEPSQPSPPSPPICMMNALVRALTDSTP
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 AMTSLDYSRFQANPDYQMSGDDTQHIQQFYDLLTGSMEIIRGWAEKIPGFADLPKADQDL
.:::::. : .: :..:.::::.:::.:... :.::::::::.:::: :: :
CCDS67 --RDLDYSRY-CPTDQAAAGTDAEHVQQFYNLLTASIDVSRSWAEKIPGFTDLPKEDQTL
420 430 440 450 460
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 LFESAFLELFVLRLAYRSNPVEGKLIFCNGVVLHRLQCVRGFGEWIDSIVEFSSNLQNMN
:.::::::::::::. ::: .: :..::::.:::::::.::::::.::: .:: :::..:
CCDS67 LIESAFLELFVLRLSIRSNTAEDKFVFCNGLVLHRLQCLRGFGEWLDSIKDFSLNLQSLN
470 480 490 500 510 520
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 IDISAFSCIAALAMVTERHGLKEPKRVEELQNKIVNCLKDHVTFNNGGLNRPNYLSKLLG
.::.:..:..::.:.::::::::::::::: :::.. :::: . .: .:. ::.::
CCDS67 LDIQALACLSALSMITERHGLKEPKRVEELCNKITSSLKDHQS--KGQALEPTE-SKVLG
530 540 550 560 570 580
560 570 580 590
pF1KB7 KLPELRTLCTQGLQRIFYLKLEDLVPPPAIIDKLFLDTLPF
: ::: .:: :::::::::::::: ::.::::::::::::
CCDS67 ALVELRKICTLGLQRIFYLKLEDLVSPPSIIDKLFLDTLPF
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10 20 30 40
pF1KB7 MPCVQAQYGSSPQGASPASQSYSYHSSGEYSSDFLTPEFVKFSMDLTNT
::::::::. :: :.: :.:.:: .::......:...:..::: .:
CCDS67 MHDSIRFGNVDMPCVQAQYSPSPPGSSYAAQTYS----SEYTTEIMNPDYTKLTMDLGST
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 EITAT--TSLPSFSTFMDNYSTGYDVKPPCLYQMPLSGQQSSIKVEDIQMHNYQQHSH--
::::: :::::.:::...::..:..:: :.::: :. ::::. . .:..: :
CCDS67 EITATATTSLPSISTFVEGYSSNYELKPSCVYQM----QRPLIKVEEGRAPSYHHHHHHH
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140
pF1KB7 ---------------LPPQS---EEMMPHSGSVYYKPSSPPTPTTPGFQVQHSPMWDD--
.:: : .:..: : :.:.: : : :::::.: : . .::.
CCDS67 HHHHHHHQQQHQQPSIPPASSPEDEVLP-STSMYFKQSPPSTPTTPAFPPQAGALWDEAL
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190
pF1KB7 PGSLHNFHQNYVATTHMIEQRKTPVSRLSLFSFKQSPPGTPVSS----CQMRFD----GP
:.. . . . : . .:. :: :: ::: :. : .. .: .
CCDS67 PSAPGCIAPGPLLDPPMKAVPTVAGARFPLFHFKPSPPHPPAPSPAGGHHLGYDPTAAAA
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 LHVPMNPEPAGSHHVVDGQTFAVPNPI-RKPASMGFPGLQIGH---ASQLL--DTQVPSP
: .:.. :.. ... .. :. .. : ..:: : . ::.:: . ..:::
CCDS67 LSLPLGAAAAAGSQAAALESHPYGLPLAKRAAPLAFPPLGLTPSPTASSLLGESPSLPSP
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 PSRGSPSNEGLCAVCGDNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCLANKNCPVDKRR
:::.: :.:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 PSRSSSSGEGTCAVCGDNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCLANKNCPVDKRR
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360
pF1KB7 RNRCQYCRFQKCLAVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKSP--QEPS---PPSPPVSLIS
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :::: :::::. ...
CCDS67 RNRCQYCRFQKCLSVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKSPLQQEPSQPSPPSPPICMMN
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 ALVRAHVDSNPAMTSLDYSRFQANPDYQMSGDDTQHIQQFYDLLTGSMEIIRGWAEKIPG
::::: .::.: .:::::. : .: :..:.::::.:::.:... :.:::::::
CCDS67 ALVRALTDSTP--RDLDYSRY-CPTDQAAAGTDAEHVQQFYNLLTASIDVSRSWAEKIPG
420 430 440 450 460
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 FADLPKADQDLLFESAFLELFVLRLAYRSNPVEGKLIFCNGVVLHRLQCVRGFGEWIDSI
:.:::: :: ::.::::::::::::. ::: .: :..::::.:::::::.::::::.:::
CCDS67 FTDLPKEDQTLLIESAFLELFVLRLSIRSNTAEDKFVFCNGLVLHRLQCLRGFGEWLDSI
470 480 490 500 510 520
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 VEFSSNLQNMNIDISAFSCIAALAMVTERHGLKEPKRVEELQNKIVNCLKDHVTFNNGGL
.:: :::..:.::.:..:..::.:.::::::::::::::: :::.. :::: . .:
CCDS67 KDFSLNLQSLNLDIQALACLSALSMITERHGLKEPKRVEELCNKITSSLKDHQS--KGQA
530 540 550 560 570 580
550 560 570 580 590
pF1KB7 NRPNYLSKLLGKLPELRTLCTQGLQRIFYLKLEDLVPPPAIIDKLFLDTLPF
.:. ::.:: : ::: .:: :::::::::::::: ::.::::::::::::
CCDS67 LEPTE-SKVLGALVELRKICTLGLQRIFYLKLEDLVSPPSIIDKLFLDTLPF
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pF1KB7 MPCVQAQYGSSPQGASPASQSYSYHSSGEYSSDFLTPEFVKFSMDLTNTEITAT--TSLP
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CCDS67 MPCVQAQYSPSPPGSSYAAQTYS----SEYTTEIMNPDYTKLTMDLGSTEITATATTSLP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KB7 SFSTFMDNYSTGYDVKPPCLYQMPLSGQQSSIKVEDIQMHNYQQHSH-------------
:.:::...::..:..:: :.::: :. ::::. . .:..: :
CCDS67 SISTFVEGYSSNYELKPSCVYQM----QRPLIKVEEGRAPSYHHHHHHHHHHHHHHQQQH
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KB7 ----LPPQS---EEMMPHSGSVYYKPSSPPTPTTPGFQVQHSPMWDD--PGSLHNFHQNY
.:: : .:..: : :.:.: : : :::::.: : . .::. :.. . .
CCDS67 QQPSIPPASSPEDEVLP-STSMYFKQSPPSTPTTPAFPPQAGALWDEALPSAPGCIAPGP
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KB7 VATTHMIEQRKTPVSRLSLFSFKQSPPGTPVSS----CQMRFD----GPLHVPMNPEPAG
. : . .:. :: :: ::: :. : .. .: . : .:.. :.
CCDS67 LLDPPMKAVPTVAGARFPLFHFKPSPPHPPAPSPAGGHHLGYDPTAAAALSLPLGAAAAA
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 SHHVVDGQTFAVPNPI-RKPASMGFPGLQIGH---ASQLL--DTQVPSPPSRGSPSNEGL
. ... .. :. .. : ..:: : . ::.:: . ..::::::.: :.::
CCDS67 GSQAAALESHPYGLPLAKRAAPLAFPPLGLTPSPTASSLLGESPSLPSPPSRSSSSGEGT
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 CAVCGDNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCLANKNCPVDKRRRNRCQYCRFQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 CAVCGDNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCLANKNCPVDKRRRNRCQYCRFQK
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370
pF1KB7 CLAVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKSP--QEPS---PPSPPVSLISALVRAHVDSNP
::.::::::::::::::::::::::::::: :::: :::::. ...::::: .::.:
CCDS67 CLSVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKSPLQQEPSQPSPPSPPICMMNALVRALTDSTP
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 AMTSLDYSRFQANPDYQMSGDDTQHIQQFYDLLTGSMEIIRGWAEKIPGFADLPKADQDL
.:::::
CCDS67 --RDLDYSRVSFMISCFQMNDQGLYLWLLVIRVD
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pF1KB7 RFDGPLHVPMNPEPAGSHHVVDGQTFAVPNPIRKPASMGFPGLQIGHASQLLDTQVPSPP
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CCDS42 NPFLVVDFYNQNRACLLPEKGLPAPGPYSTPLRTPLWNG-SNHSIETQSSSSEEIVPSPP
20 30 40 50 60 70
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 SRGS-PSNEGLCAVCGDNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCLANKNCPVDKRR
: : : :: :... :::: .::::::::.:..::: :.: .::: ..:
CCDS42 SPPPLPRIYKPCFVCQDKSSGYHYGVSACEGCKGFFRRSIQKNMVYTCHRDKNCIINKVT
80 90 100 110 120 130
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 RNRCQYCRFQKCLAVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKSPQEPSPPSPPVS-LISALVR
::::::::.:::. ::: :: ::.: : .. ..: ::. .: .: :. :: . .
CCDS42 RNRCQYCRLQKCFEVGMSKESVRNDRNK-KKKEVP-KPEC-SESYTLTPEVGELIEKVRK
140 150 160 170 180
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 AHVDSNPAMTSLDYSRFQANPDYQMSGDDTQHIQQFYDLLTGSMEIIRGWAEKIPGFADL
:: .. ::. .: . : . : . : . ..: .: : . .:...:::. :
CCDS42 AHQETFPALCQLG-KYTTNNSSEQRVSLDIDLWDKFSELSTKCIIKTVEFAKQLPGFTTL
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