Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5752
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5752, 694 aa
1>>>pF1KE5752 694 - 694 aa - 694 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7184+/-0.00115; mu= 12.4026+/- 0.069
mean_var=89.9081+/-17.546, 0's: 0 Z-trim(104.0): 41 B-trim: 50 in 1/49
Lambda= 0.135262
statistics sampled from 7660 (7695) to 7660 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.602), E-opt: 0.2 (0.236), width: 16
Scan time: 2.950
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2034.1 CNGA3 gene_id:1261|Hs108|chr2 ( 694) 4540 896.7 0
CCDS42719.1 CNGA3 gene_id:1261|Hs108|chr2 ( 676) 3550 703.5 2.5e-202
CCDS43226.1 CNGA1 gene_id:1259|Hs108|chr4 ( 690) 2759 549.2 7.4e-156
CCDS47050.1 CNGA1 gene_id:1259|Hs108|chr4 ( 759) 2759 549.2 8.1e-156
CCDS14701.1 CNGA2 gene_id:1260|Hs108|chrX ( 664) 2594 517.0 3.5e-146
CCDS31408.1 CNGA4 gene_id:1262|Hs108|chr11 ( 575) 1984 397.9 2.1e-110
CCDS67042.1 CNGB1 gene_id:1258|Hs108|chr16 (1245) 944 195.1 5.3e-49
CCDS42169.1 CNGB1 gene_id:1258|Hs108|chr16 (1251) 944 195.1 5.3e-49
CCDS6244.1 CNGB3 gene_id:54714|Hs108|chr8 ( 809) 887 183.9 8e-46
CCDS3952.1 HCN1 gene_id:348980|Hs108|chr5 ( 890) 576 123.2 1.6e-27
CCDS10248.1 HCN4 gene_id:10021|Hs108|chr15 (1203) 574 122.9 2.8e-27
CCDS5911.1 KCNH2 gene_id:3757|Hs108|chr7 ( 819) 570 122.0 3.4e-27
CCDS5910.1 KCNH2 gene_id:3757|Hs108|chr7 (1159) 570 122.1 4.6e-27
CCDS1108.1 HCN3 gene_id:57657|Hs108|chr1 ( 774) 550 118.1 4.8e-26
CCDS12035.1 HCN2 gene_id:610|Hs108|chr19 ( 889) 545 117.2 1.1e-25
CCDS2219.1 KCNH7 gene_id:90134|Hs108|chr2 (1196) 493 107.1 1.6e-22
CCDS62290.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs108|chr17 ( 958) 485 105.5 3.8e-22
CCDS11638.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs108|chr17 ( 994) 485 105.5 4e-22
CCDS11420.1 KCNH4 gene_id:23415|Hs108|chr17 (1017) 415 91.8 5.2e-18
CCDS11639.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs108|chr17 ( 905) 412 91.2 7.1e-18
CCDS31015.1 KCNH1 gene_id:3756|Hs108|chr1 ( 962) 390 86.9 1.5e-16
CCDS1496.1 KCNH1 gene_id:3756|Hs108|chr1 ( 989) 390 86.9 1.5e-16
CCDS9756.1 KCNH5 gene_id:27133|Hs108|chr14 ( 988) 372 83.4 1.7e-15
CCDS45122.1 KCNH5 gene_id:27133|Hs108|chr14 ( 611) 315 72.2 2.5e-12
>>CCDS2034.1 CNGA3 gene_id:1261|Hs108|chr2 (694 aa)
initn: 4540 init1: 4540 opt: 4540 Z-score: 4789.8 bits: 896.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4540; 100.0% identity (100.0% similar) in 694 aa overlap (1-694:1-694)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAKINTQYSHPSRTHLKVKTSDRDLNRAENGLSRAHSSSEETSSVLQPGIAMETRGLADS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 MAKINTQYSHPSRTHLKVKTSDRDLNRAENGLSRAHSSSEETSSVLQPGIAMETRGLADS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 GQGSFTGQGIARLSRLIFLLRRWAARHVHHQDQGPDSFPDRFRGAELKEVSSQESNAQAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 GQGSFTGQGIARLSRLIFLLRRWAARHVHHQDQGPDSFPDRFRGAELKEVSSQESNAQAN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 VGSQEPADRGRSAWPLAKCNTNTSNNTEEEKKTKKKDAIVVDPSSNLYYRWLTAIALPVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 VGSQEPADRGRSAWPLAKCNTNTSNNTEEEKKTKKKDAIVVDPSSNLYYRWLTAIALPVF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 YNWYLLICRACFDELQSEYLMLWLVLDYSADVLYVLDVLVRARTGFLEQGLMVSDTNRLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 YNWYLLICRACFDELQSEYLMLWLVLDYSADVLYVLDVLVRARTGFLEQGLMVSDTNRLW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 QHYKTTTQFKLDVLSLVPTDLAYLKVGTNYPEVRFNRLLKFSRLFEFFDRTETRTNYPNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 QHYKTTTQFKLDVLSLVPTDLAYLKVGTNYPEVRFNRLLKFSRLFEFFDRTETRTNYPNM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 FRIGNLVLYILIIIHWNACIYFAISKFIGFGTDSWVYPNISIPEHGRLSRKYIYSLYWST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 FRIGNLVLYILIIIHWNACIYFAISKFIGFGTDSWVYPNISIPEHGRLSRKYIYSLYWST
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 LTLTTIGETPPPVKDEEYLFVVVDFLVGVLIFATIVGNVGSMISNMNASRAEFQAKIDSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 LTLTTIGETPPPVKDEEYLFVVVDFLVGVLIFATIVGNVGSMISNMNASRAEFQAKIDSI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 KQYMQFRKVTKDLETRVIRWFDYLWANKKTVDEKEVLKSLPDKLKAEIAINVHLDTLKKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 KQYMQFRKVTKDLETRVIRWFDYLWANKKTVDEKEVLKSLPDKLKAEIAINVHLDTLKKV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 RIFQDCEAGLLVELVLKLRPTVFSPGDYICKKGDIGKEMYIINEGKLAVVADDGVTQFVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 RIFQDCEAGLLVELVLKLRPTVFSPGDYICKKGDIGKEMYIINEGKLAVVADDGVTQFVV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 LSDGSYFGEISILNIKGSKSGNRRTANIRSIGYSDLFCLSKDDLMEALTEYPEAKKALEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 LSDGSYFGEISILNIKGSKSGNRRTANIRSIGYSDLFCLSKDDLMEALTEYPEAKKALEE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 KGRQILMKDNLIDEELARAGADPKDLEEKVEQLGSSLDTLQTRFARLLAEYNATQMKMKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 KGRQILMKDNLIDEELARAGADPKDLEEKVEQLGSSLDTLQTRFARLLAEYNATQMKMKQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KE5 RLSQLESQVKGGGDKPLADGEVPGDATKTEDKQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 RLSQLESQVKGGGDKPLADGEVPGDATKTEDKQQ
670 680 690
>>CCDS42719.1 CNGA3 gene_id:1261|Hs108|chr2 (676 aa)
initn: 4396 init1: 3549 opt: 3550 Z-score: 3745.9 bits: 703.5 E(32554): 2.5e-202
Smith-Waterman score: 4364; 97.3% identity (97.4% similar) in 694 aa overlap (1-694:1-676)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAKINTQYSHPSRTHLKVKTSDRDLNRAENGLSRAHSSSEETSSVLQPGIAMETRGLADS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MAKINTQYSHPSRTHLKVKTSDRDLNRAENGLSRAHSSSEETSSVLQPGIAMETRGLADS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 GQGSFTGQGIARLSRLIFLLRRWAARHVHHQDQGPDSFPDRFRGAELKEVSSQESNAQAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GQGSFTGQGIARLSRLIFLLRRWAARHVHHQDQGPDSFPDRFRGAELKEVSSQESNAQAN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 VGSQEPADRGRSAWPLAKCNTNTSNNTEEEKKTKKKDAIVVDPSSNLYYRWLTAIALPVF
::::::::::: .::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VGSQEPADRGR------------------RKKTKKKDAIVVDPSSNLYYRWLTAIALPVF
130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 YNWYLLICRACFDELQSEYLMLWLVLDYSADVLYVLDVLVRARTGFLEQGLMVSDTNRLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 YNWYLLICRACFDELQSEYLMLWLVLDYSADVLYVLDVLVRARTGFLEQGLMVSDTNRLW
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 QHYKTTTQFKLDVLSLVPTDLAYLKVGTNYPEVRFNRLLKFSRLFEFFDRTETRTNYPNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QHYKTTTQFKLDVLSLVPTDLAYLKVGTNYPEVRFNRLLKFSRLFEFFDRTETRTNYPNM
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 FRIGNLVLYILIIIHWNACIYFAISKFIGFGTDSWVYPNISIPEHGRLSRKYIYSLYWST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FRIGNLVLYILIIIHWNACIYFAISKFIGFGTDSWVYPNISIPEHGRLSRKYIYSLYWST
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 LTLTTIGETPPPVKDEEYLFVVVDFLVGVLIFATIVGNVGSMISNMNASRAEFQAKIDSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LTLTTIGETPPPVKDEEYLFVVVDFLVGVLIFATIVGNVGSMISNMNASRAEFQAKIDSI
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 KQYMQFRKVTKDLETRVIRWFDYLWANKKTVDEKEVLKSLPDKLKAEIAINVHLDTLKKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KQYMQFRKVTKDLETRVIRWFDYLWANKKTVDEKEVLKSLPDKLKAEIAINVHLDTLKKV
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 RIFQDCEAGLLVELVLKLRPTVFSPGDYICKKGDIGKEMYIINEGKLAVVADDGVTQFVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RIFQDCEAGLLVELVLKLRPTVFSPGDYICKKGDIGKEMYIINEGKLAVVADDGVTQFVV
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 LSDGSYFGEISILNIKGSKSGNRRTANIRSIGYSDLFCLSKDDLMEALTEYPEAKKALEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSDGSYFGEISILNIKGSKSGNRRTANIRSIGYSDLFCLSKDDLMEALTEYPEAKKALEE
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 KGRQILMKDNLIDEELARAGADPKDLEEKVEQLGSSLDTLQTRFARLLAEYNATQMKMKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KGRQILMKDNLIDEELARAGADPKDLEEKVEQLGSSLDTLQTRFARLLAEYNATQMKMKQ
590 600 610 620 630 640
670 680 690
pF1KE5 RLSQLESQVKGGGDKPLADGEVPGDATKTEDKQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RLSQLESQVKGGGDKPLADGEVPGDATKTEDKQQ
650 660 670
>>CCDS43226.1 CNGA1 gene_id:1259|Hs108|chr4 (690 aa)
initn: 2803 init1: 2748 opt: 2759 Z-score: 2911.6 bits: 549.2 E(32554): 7.4e-156
Smith-Waterman score: 2806; 62.3% identity (84.5% similar) in 684 aa overlap (4-684:10-681)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MAKINTQYSHPSRTHLKVKTSDRDLNRAENGLSRAHSSSEETSSVLQPGIAMET
:::: : . .. : .... : ::: . : .....:. . :.
CCDS43 MKLSMKNNIINTQQSFVTMPNVIVPDIEKEIRRMENGACSSFSEDDDSAST-----SEES
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 RGLADSGQGSFTGQGIAR---LSRLIFLLRRWAARHVHHQDQGPDSFPDRFRGAELKEVS
.. ..:::. ... . .: .: : .:..... :. :.. . . :: .
CCDS43 ENENPHARGSFSYKSLRKGGPSQREQYLPGAIALFNVNNSSN-KDQEPEE-KKKKKKEKK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 SQESNAQANVGSQEPADRGRSAWPLAKCNTNTSNNTEEEKKTKKKDAIVVDPSSNLYYRW
:. .. . : .. : . .. : . . ......:. .::...:.:::.: :: :
CCDS43 SKSDDKNENKNDPEKKKKKKD-----KEKKKKEEKSKDKKEEEKKEVVVIDPSGNTYYNW
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LTAIALPVFYNWYLLICRACFDELQSEYLMLWLVLDYSADVLYVLDVLVRARTGFLEQGL
: :.:::.::: ..: :::::::::.:: ::.::: .:..:..:..::.:::.:::::
CCDS43 LFCITLPVMYNWTMVIARACFDELQSDYLEYWLILDYVSDIVYLIDMFVRTRTGYLEQGL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 MVSDTNRLWQHYKTTTQFKLDVLSLVPTDLAYLKVGTNYPEVRFNRLLKFSRLFEFFDRT
.:.. .: ..::.. :::::::::.:::: :.:.: ::::.:.::::.:::.::::.::
CCDS43 LVKEELKLINKYKSNLQFKLDVLSLIPTDLLYFKLGWNYPEIRLNRLLRFSRMFEFFQRT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 ETRTNYPNMFRIGNLVLYILIIIHWNACIYFAISKFIGFGTDSWVYPNISIPEHGRLSRK
::::::::.:::.:::.::.::::::::....::: ::::.:.::::.:. :: :::.::
CCDS43 ETRTNYPNIFRISNLVMYIVIIIHWNACVFYSISKAIGFGNDTWVYPDINDPEFGRLARK
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 YIYSLYWSTLTLTTIGETPPPVKDEEYLFVVVDFLVGVLIFATIVGNVGSMISNMNASRA
:.::::::::::::::::::::.: ::.:::::::.:::::::::::.:::::::::.::
CCDS43 YVYSLYWSTLTLTTIGETPPPVRDSEYVFVVVDFLIGVLIFATIVGNIGSMISNMNAARA
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 EFQAKIDSIKQYMQFRKVTKDLETRVIRWFDYLWANKKTVDEKEVLKSLPDKLKAEIAIN
::::.::.:::::.::.:.::.: :::.::::::.:::::::::::: :::::.::::::
CCDS43 EFQARIDAIKQYMHFRNVSKDMEKRVIKWFDYLWTNKKTVDEKEVLKYLPDKLRAEIAIN
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 VHLDTLKKVRIFQDCEAGLLVELVLKLRPTVFSPGDYICKKGDIGKEMYIINEGKLAVVA
:::::::::::: ::::::::::::::.: :.:::::::::::::.:::::.::::::::
CCDS43 VHLDTLKKVRIFADCEAGLLVELVLKLQPQVYSPGDYICKKGDIGREMYIIKEGKLAVVA
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 DDGVTQFVVLSDGSYFGEISILNIKGSKSGNRRTANIRSIGYSDLFCLSKDDLMEALTEY
::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS43 DDGVTQFVVLSDGSYFGEISILNIKGSKAGNRRTANIKSIGYSDLFCLSKDDLMEALTEY
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KE5 PEAKKALEEKGRQILMKDNLIDEELARAGADPKDLEEKVEQLGSSLDTLQTRFARLLAEY
:.:: :::::.::::::.:.: ..: ::.::::::::: .. .:.: :::::::.::::
CCDS43 PDAKTMLEEKGKQILMKDGLLDLNIANAGSDPKDLEEKVTRMEGSVDLLQTRFARILAEY
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690
pF1KE5 NATQMKMKQRLSQLESQVKGGGDKPLADGEVPGDATKTEDKQQ
.. :.:.::::...:. .: : ... : ::
CCDS43 ESMQQKLKQRLTKVEKFLKPLIDTEFSSIEGPGAESGPIDST
650 660 670 680 690
>>CCDS47050.1 CNGA1 gene_id:1259|Hs108|chr4 (759 aa)
initn: 2803 init1: 2748 opt: 2759 Z-score: 2910.9 bits: 549.2 E(32554): 8.1e-156
Smith-Waterman score: 2806; 62.3% identity (84.5% similar) in 684 aa overlap (4-684:79-750)
10 20 30
pF1KE5 MAKINTQYSHPSRTHLKVKTSDRDLNRAENGLS
:::: : . .. : .... : :::
CCDS47 LELLISSDLPTSASQSAGITDMKLSMKNNIINTQQSFVTMPNVIVPDIEKEIRRMENGAC
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 RAHSSSEETSSVLQPGIAMETRGLADSGQGSFTGQGIAR---LSRLIFLLRRWAARHVHH
. : .....:. . :... ..:::. ... . .: .: : .:..
CCDS47 SSFSEDDDSAST-----SEESENENPHARGSFSYKSLRKGGPSQREQYLPGAIALFNVNN
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 QDQGPDSFPDRFRGAELKEVSSQESNAQANVGSQEPADRGRSAWPLAKCNTNTSNNTEEE
... :. :.. . . :: .:. .. . : .. : . .. : . . ......
CCDS47 SSN-KDQEPEE-KKKKKKEKKSKSDDKNENKNDPEKKKKKKD-----KEKKKKEEKSKDK
170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 KKTKKKDAIVVDPSSNLYYRWLTAIALPVFYNWYLLICRACFDELQSEYLMLWLVLDYSA
:. .::...:.:::.: :: :: :.:::.::: ..: :::::::::.:: ::.::: .
CCDS47 KEEEKKEVVVIDPSGNTYYNWLFCITLPVMYNWTMVIARACFDELQSDYLEYWLILDYVS
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 DVLYVLDVLVRARTGFLEQGLMVSDTNRLWQHYKTTTQFKLDVLSLVPTDLAYLKVGTNY
:..:..:..::.:::.:::::.:.. .: ..::.. :::::::::.:::: :.:.: ::
CCDS47 DIVYLIDMFVRTRTGYLEQGLLVKEELKLINKYKSNLQFKLDVLSLIPTDLLYFKLGWNY
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 PEVRFNRLLKFSRLFEFFDRTETRTNYPNMFRIGNLVLYILIIIHWNACIYFAISKFIGF
::.:.::::.:::.::::.::::::::::.:::.:::.::.::::::::....::: :::
CCDS47 PEIRLNRLLRFSRMFEFFQRTETRTNYPNIFRISNLVMYIVIIIHWNACVFYSISKAIGF
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 GTDSWVYPNISIPEHGRLSRKYIYSLYWSTLTLTTIGETPPPVKDEEYLFVVVDFLVGVL
:.:.::::.:. :: :::.:::.::::::::::::::::::::.: ::.:::::::.:::
CCDS47 GNDTWVYPDINDPEFGRLARKYVYSLYWSTLTLTTIGETPPPVRDSEYVFVVVDFLIGVL
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 IFATIVGNVGSMISNMNASRAEFQAKIDSIKQYMQFRKVTKDLETRVIRWFDYLWANKKT
::::::::.:::::::::.::::::.::.:::::.::.:.::.: :::.::::::.::::
CCDS47 IFATIVGNIGSMISNMNAARAEFQARIDAIKQYMHFRNVSKDMEKRVIKWFDYLWTNKKT
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 VDEKEVLKSLPDKLKAEIAINVHLDTLKKVRIFQDCEAGLLVELVLKLRPTVFSPGDYIC
:::::::: :::::.:::::::::::::::::: ::::::::::::::.: :.:::::::
CCDS47 VDEKEVLKYLPDKLRAEIAINVHLDTLKKVRIFADCEAGLLVELVLKLQPQVYSPGDYIC
520 530 540 550 560 570
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 KKGDIGKEMYIINEGKLAVVADDGVTQFVVLSDGSYFGEISILNIKGSKSGNRRTANIRS
::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.:
CCDS47 KKGDIGREMYIIKEGKLAVVADDGVTQFVVLSDGSYFGEISILNIKGSKAGNRRTANIKS
580 590 600 610 620 630
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 IGYSDLFCLSKDDLMEALTEYPEAKKALEEKGRQILMKDNLIDEELARAGADPKDLEEKV
::::::::::::::::::::::.:: :::::.::::::.:.: ..: ::.:::::::::
CCDS47 IGYSDLFCLSKDDLMEALTEYPDAKTMLEEKGKQILMKDGLLDLNIANAGSDPKDLEEKV
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640 650 660 670 680 690
pF1KE5 EQLGSSLDTLQTRFARLLAEYNATQMKMKQRLSQLESQVKGGGDKPLADGEVPGDATKTE
.. .:.: :::::::.::::.. :.:.::::...:. .: : ... : ::
CCDS47 TRMEGSVDLLQTRFARILAEYESMQQKLKQRLTKVEKFLKPLIDTEFSSIEGPGAESGPI
700 710 720 730 740 750
pF1KE5 DKQQ
CCDS47 DST
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10 20 30 40 50
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: : : :. .: . .:.. .: .:. :: ::.... .: :
CCDS14 MTEKTNGVKSSPANNHNHHAPPAIKANGKDDHRTS---SRPHSAADDDTSS-------EL
10 20 30 40 50
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. ::: . .:. :. ::. ..:.:: .. .... :::: .:::: ::. :..::
CCDS14 QRLADVDAPQQGRSGFRRIVRLVGIIREWANKNFREEEPRPDSFLERFRGPELQTVTTQE
60 70 80 90 100 110
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pF1KE5 SNAQANVGSQEPADRGRSAWPLAKCNTNTSNNTEEEKKTKKK-DAIVVDPSSNLYYRWLT
.... :... :.: :::: . .:.::... :: ::
CCDS14 GDGK---GDKDGEDKG----------------------TKKKFELFVLDPAGDWYYCWLF
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.::.::.::: ::. ::::..::. : ..:::::: .::.:. :...: :::::::::.:
CCDS14 VIAMPVLYNWCLLVARACFSDLQKGYYLVWLVLDYVSDVVYIADLFIRLRTGFLEQGLLV
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.::..: ..: : :::::: :..:::: :. : . :::::::::.:.:.:::::::::
CCDS14 KDTKKLRDNYIHTLQFKLDVASIIPTDLIYFAVDIHSPEVRFNRLLHFARMFEFFDRTET
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pF1KE5 RTNYPNMFRIGNLVLYILIIIHWNACIYFAISKFIGFGTDSWVYPNISIPEHGRLSRKYI
::::::.:::.:::::::.:::::::::.:::: ::::.:.::::::. ::.: :.:.::
CCDS14 RTNYPNIFRISNLVLYILVIIHWNACIYYAISKSIGFGVDTWVYPNITDPEYGYLAREYI
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: ::::::::::::::::::::::::::. :::.:::::::::::::::::::::.::::
CCDS14 YCLYWSTLTLTTIGETPPPVKDEEYLFVIFDFLIGVLIFATIVGNVGSMISNMNATRAEF
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pF1KE5 QAKIDSIKQYMQFRKVTKDLETRVIRWFDYLWANKKTVDEKEVLKSLPDKLKAEIAINVH
:::::..:.:::::::.: .:..:::::::::.:::::::.:.::.:: ::.::::::::
CCDS14 QAKIDAVKHYMQFRKVSKGMEAKVIRWFDYLWTNKKTVDEREILKNLPAKLRAEIAINVH
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pF1KE5 LDTLKKVRIFQDCEAGLLVELVLKLRPTVFSPGDYICKKGDIGKEMYIINEGKLAVVADD
:.::::::::.:::::::::::::::: :::::::::.:::::::::::.::::::::::
CCDS14 LSTLKKVRIFHDCEAGLLVELVLKLRPQVFSPGDYICRKGDIGKEMYIIKEGKLAVVADD
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pF1KE5 GVTQFVVLSDGSYFGEISILNIKGSKSGNRRTANIRSIGYSDLFCLSKDDLMEALTEYPE
::::...:: :: ::::::::::::: ::::::::::.::::::::::::::::.::::.
CCDS14 GVTQYALLSAGSCFGEISILNIKGSKMGNRRTANIRSLGYSDLFCLSKDDLMEAVTEYPD
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pF1KE5 AKKALEEKGRQILMKDNLIDEELARAGADPKDLEEKVEQLGSSLDTLQTRFARLLAEYNA
:::.:::.::.::::..:.::. . : . :..::. :: ....:: :::.::::::..
CCDS14 AKKVLEERGREILMKEGLLDENEV-ATSMEVDVQEKLGQLETNMETLYTRFGRLLAEYTG
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pF1KE5 TQMKMKQRLSQLESQVKGGG-DKPLADGEVPGDATKTEDKQQ
.:.:.:::.. ::...: .. : :.::
CCDS14 AQQKLKQRITVLETKMKQNNEDDYLSDGMNSPELAAADEP
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pF1KE5 QESNAQANVGSQEPADRGRSAWPLAKCNTNTSNNTEEEKKTKKKDAIVVDPSSNLYYRWL
:.... . .: :.:::.. :: ::
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pF1KE5 TAIALPVFYNWYLLICRACFDELQSEYLMLWLVLDYSADVLYVLDVLVRARTGFLEQGLM
.....::.:: .:.::::: .:: ::. ::::::..:.::.::..:: .:::::::..
CCDS31 NTMVFPVMYNLIILVCRACFPDLQHGYLVAWLVLDYTSDLLYLLDMVVRFHTGFLEQGIL
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: : .:. ..: : .: ::. ::.:::..:...: . : .:.::.:. :::: :::::
CCDS31 VVDKGRISSRYVRTWSFFLDLASLMPTDVVYVRLGPHTPTLRLNRFLRAPRLFEAFDRTE
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::: ::: :::..:.:::...::::.:.:::.:...::: :.::::. . : :: :.:
CCDS31 TRTAYPNAFRIAKLMLYIFVVIHWNSCLYFALSRYLGFGRDAWVYPDPAQPGFERLRRQY
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pF1KE5 IYSLYWSTLTLTTIGETPPPVKDEEYLFVVVDFLVGVLIFATIVGNVGSMISNMNASRAE
.::.:.::: :::.:.::::...:::::.: :::..:. ::::.:...:.: :::.. :
CCDS31 LYSFYFSTLILTTVGDTPPPAREEEYLFMVGDFLLAVMGFATIMGSMSSVIYNMNTADAA
220 230 240 250 260 270
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pF1KE5 FQAKIDSIKQYMQFRKVTKDLETRVIRWFDYLWANKKTVDEKEVLKSLPDKLKAEIAINV
: .:.::....:.. :: ::: :...: ::: ..: .:. ::..:.::.:..:
CCDS31 FYPDHALVKKYMKLQHVNRKLERRVIDWYQHLQINKKMTNEVAILQHLPERLRAEVAVSV
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::.::..:.:::.:::.:: ::::::.: ..:::.:.:.:::::.::::: ::.::::::
CCDS31 HLSTLSRVQIFQNCEASLLEELVLKLQPQTYSPGEYVCRKGDIGQEMYIIREGQLAVVAD
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pF1KE5 DGVTQFVVLSDGSYFGEISILNIKGSKSGNRRTANIRSIGYSDLFCLSKDDLMEALTEYP
::.::..::. : :::::::.::::. :::::::::.:.::::::::::.:: :.:.:::
CCDS31 DGITQYAVLGAGLYFGEISIINIKGNMSGNRRTANIKSLGYSDLFCLSKEDLREVLSEYP
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pF1KE5 EAKKALEEKGRQILMKDNLIDEELARAG-ADPKDLEEKVEQLGSSLDTLQTRFARLLAEY
.:. .:::::.::.: : .: . : : . : ... : ..:: :::.:::::::
CCDS31 QAQTIMEEKGREILLKMNKLDVNAEAAEIALQEATESRLRGLDQQLDDLQTKFARLLAEL
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... .:. :. .:: :.. . ::... :. . .:..
CCDS31 ESSALKIAYRIERLEWQTREWPMPEDLAEADDEGEPEEGTSKDEEGRASQEGPPGPE
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10 20 30
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: : :: : :. : . ..:: :.:
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:. : .: : ... . :...: ::..:. :... . . :... ::
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: : : . : :. .. : . : :. . . . ... ::
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. .:: .::.: :: ... .: .:. : : . . ::..:: :..
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pF1KE5 YVLDVLV-RARTGFLEQGLMVSDTNRLWQHYKTTTQFKLDVLSLVPTDLAYLKVGTNYPE
: ::. : ..: :.. : ...: . . ..: . .::.:.:::.: :. :::::.: :
CCDS67 YFLDITVFQTRLQFVRGGDIITDKKDMRNNYLKSRRFKMDLLSLLPLDFLYLKVGVN-PL
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.:. : ::. .::: .: :. . ..:. . :.: .: :.:.:. : . :.:.
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pF1KE5 DSWVYPNISIPEHGRLSRKYIYSLYWSTLTLTTIGETPPPVKDEEYLFVVVDFLVGVLIF
::: ... .:: :... :: ::: : : : .: ......::. :
CCDS67 THWVYDGVG--------NSYIRCYYFAVKTLITIGGLPDPKTLFEIVFQLLNYFTGVFAF
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pF1KE5 ATIVGNVGSMISNMNASRAEFQAKIDSIKQYMQFRKVTKDLETRVIRWFDYLWANKKTVD
....:.. .... .:... ... .:: .::.: :. :....:: :..: : .. .:
CCDS67 SVMIGQMRDVVGAATAGQTYYRSCMDSTVKYMNFYKIPKSVQNRVKTWYEYTWHSQGMLD
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pF1KE5 EKEVLKSLPDKLKAEIAINVHLDTLKKVRIFQDCEAGLLVELVLKLRPTVFSPGDYICKK
:.:.. .::::.. ..::.:. . ..:: .:: :. .. ... .:: .:. :.::.:::
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pF1KE5 GDIGKEMYIINEGKLAVVAD-DGVTQFVVLSDGSYFGEISILNIKGSKSGNRRTANIRSI
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CCDS67 GEIGREMYIIQAGQVQVLGGPDGKSVLVTLKAGSVFGEISLLAVGG---GNRRTANVVAH
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:...:: :.: :: : :..:::..: :..:.:..: ..: :: . :::. ::
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.. . . :. . . ..:.: : : : . ::. .: :.:.. : .:
CCDS67 FNAALAMTGKMGGKGAKGGKLAHLRARLKELAALEAAAKQQ--ELVEQAKSSQDVKGEEG
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690
pF1KE5 EVPGDATKTEDKQQ
. :
CCDS67 SAAPDQHTHPKEAATDPPAPRTPPEPPGSPPSSPPPASLGRPEGEEEGPAEPEEHSVRIC
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10 20 30
pF1KE5 MAKINTQYSHPSRTHLKVKTSDRDLNRAENGLSRAHSS
: : :: : :. : . ..:: :.:
CCDS42 DSCPLMAEENPPSTVLPPPSPAKSDTLIVPSSASGTHRKKLPSEDDEAEELKALSPAESP
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pF1KE5 SEETSSVLQPGIAMETRGLADSGQGSFTGQGIA--RLSRLIFLLRRWAARHVHHQDQGPD
:. : .: : ... . :...: ::..:. :... . . :... ::
CCDS42 VVAWSD---PTTPKDTDGQDRAASTASTNSAIINDRLQELVKLFKERTEK-VKEKLIDPD
540 550 560 570 580 590
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pF1KE5 SFPDRFRGAELKEVSSQESNAQANVGSQEPADRGRSAWPLAKCNTNTSNNTEEEKKTKKK
: : : . : :. .. : . : :. . . . ... ::
CCDS42 VTSD--------EESPKPSPAK-KAPEPAPDTKPAEAEPVEEEHYCDMLCCKFKHRPWKK
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160 170 180 190 200 210
pF1KE5 DAI--VVDPSSNLYYR-WLTAIALPVFYNWYLLICRACFDELQSEYLMLWLVLDYSADVL
. .:: .::.: :: ... .: .:. : : . . ::..:: :..
CCDS42 YQFPQSIDPLTNLMYVLWLFFVVMAWNWNCWLIPVRWAFPYQTPDNIHHWLLMDYLCDLI
650 660 670 680 690 700
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pF1KE5 YVLDVLV-RARTGFLEQGLMVSDTNRLWQHYKTTTQFKLDVLSLVPTDLAYLKVGTNYPE
: ::. : ..: :.. : ...: . . ..: . .::.:.:::.: :. :::::.: :
CCDS42 YFLDITVFQTRLQFVRGGDIITDKKDMRNNYLKSRRFKMDLLSLLPLDFLYLKVGVN-PL
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pF1KE5 VRFNRLLKFSRLFEFFDRTETRTNYPNMFRIGNLVLYILIIIHWNACIYFAISKFIGFGT
.:. : ::. .::: .: :. . ..:. . :.: .: :.:.:. : . :.:.
CCDS42 LRLPRCLKYMAFFEFNSRLESILSKAYVYRVIRTTAYLLYSLHLNSCLYYWASAYQGLGS
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pF1KE5 DSWVYPNISIPEHGRLSRKYIYSLYWSTLTLTTIGETPPPVKDEEYLFVVVDFLVGVLIF
::: ... .:: :... :: ::: : : : .: ......::. :
CCDS42 THWVYDGVG--------NSYIRCYYFAVKTLITIGGLPDPKTLFEIVFQLLNYFTGVFAF
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pF1KE5 ATIVGNVGSMISNMNASRAEFQAKIDSIKQYMQFRKVTKDLETRVIRWFDYLWANKKTVD
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CCDS42 SVMIGQMRDVVGAATAGQTYYRSCMDSTVKYMNFYKIPKSVQNRVKTWYEYTWHSQGMLD
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pF1KE5 EKEVLKSLPDKLKAEIAINVHLDTLKKVRIFQDCEAGLLVELVLKLRPTVFSPGDYICKK
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CCDS42 ESELMVQLPDKMRLDLAIDVNYNIVSKVALFQGCDRQMIFDMLKRLRSVVYLPNDYVCKK
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pF1KE5 GDIGKEMYIINEGKLAVVAD-DGVTQFVVLSDGSYFGEISILNIKGSKSGNRRTANIRSI
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CCDS42 GEIGREMYIIQAGQVQVLGGPDGKSVLVTLKAGSVFGEISLLAVGG---GNRRTANVVAH
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CCDS42 GFTNLFILDKKDLNEILVHYPESQKLLRKKARRMLRSNNKPKEEKSVLILPPRAGT-PKL
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CCDS42 FNAALAMTGKMGGKGAKGGKLAHLRARLKELAALEAAAKQQ--ELVEQAKSSQDVKGEEG
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pF1KE5 EVPGDATKTEDKQQ
. :
CCDS42 SAAPDQHTHPKEAATDPPAPRTPPEPPGSPPSSPPPASLGRPEGEEEGPAEPEEHSVRIC
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]