FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3958, 446 aa 1>>>pF1KE3958 446 - 446 aa - 446 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4094+/-0.00046; mu= 8.8015+/- 0.028 mean_var=200.4244+/-44.240, 0's: 0 Z-trim(116.0): 244 B-trim: 1321 in 1/55 Lambda= 0.090594 statistics sampled from 26549 (26856) to 26549 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.315), width: 16 Scan time: 6.810 The best scores are: opt bits E(85289) NP_065091 (OMIM: 606124) tripartite motif-containi ( 452) 1576 219.0 2e-56 NP_660215 (OMIM: 607868) E3 ubiquitin-protein liga ( 468) 900 130.7 8.1e-30 XP_016857901 (OMIM: 607868) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 467) 890 129.4 2e-29 NP_003132 (OMIM: 109092) E3 ubiquitin-protein liga ( 475) 787 115.9 2.3e-25 XP_016873516 (OMIM: 606124) PREDICTED: tripartite ( 375) 731 108.5 3.1e-23 NP_057186 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein liga ( 477) 593 90.6 9.8e-18 XP_006711842 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 593 90.6 9.8e-18 XP_011542511 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 593 90.6 9.8e-18 XP_011542512 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 593 90.6 9.8e-18 NP_001020111 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein l ( 477) 593 90.6 9.8e-18 NP_067629 (OMIM: 605684) tripartite motif-containi ( 488) 549 84.8 5.4e-16 NP_001003827 (OMIM: 605684) tripartite motif-conta ( 488) 549 84.8 5.4e-16 NP_742013 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein liga ( 488) 537 83.3 1.6e-15 NP_001128327 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein l ( 343) 534 82.7 1.6e-15 XP_016856907 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 262) 514 80.0 8.4e-15 XP_016856908 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 262) 514 80.0 8.4e-15 NP_067076 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein liga ( 518) 516 80.6 1.1e-14 XP_011542513 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 450) 507 79.3 2.3e-14 NP_006501 (OMIM: 602165) zinc finger protein RFP [ ( 513) 497 78.1 6.2e-14 NP_477514 (OMIM: 607564) tripartite motif-containi ( 488) 480 75.8 2.8e-13 NP_001003818 (OMIM: 607564) tripartite motif-conta ( 516) 480 75.8 2.9e-13 XP_016873951 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 300) 463 73.4 9.4e-13 NP_149084 (OMIM: 608487) tripartite motif-containi ( 326) 463 73.4 9.9e-13 XP_005253241 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 326) 463 73.4 9.9e-13 NP_149083 (OMIM: 608487) tripartite motif-containi ( 347) 463 73.4 1e-12 XP_005253240 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 493) 463 73.6 1.3e-12 NP_149023 (OMIM: 608487) tripartite motif-containi ( 493) 463 73.6 1.3e-12 NP_006065 (OMIM: 606559) E3 ubiquitin-protein liga ( 498) 463 73.6 1.3e-12 NP_001186502 (OMIM: 606559) E3 ubiquitin-protein l ( 494) 448 71.6 5.1e-12 XP_016873952 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 265) 437 69.9 9.1e-12 XP_006718421 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 265) 437 69.9 9.1e-12 XP_011518728 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 310) 437 70.0 1e-11 XP_016873950 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 310) 437 70.0 1e-11 NP_569074 (OMIM: 605684) tripartite motif-containi ( 270) 433 69.4 1.3e-11 XP_011518729 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 271) 430 69.0 1.7e-11 NP_439893 (OMIM: 605701) tripartite motif-containi ( 395) 431 69.3 2e-11 NP_006769 (OMIM: 605701) tripartite motif-containi ( 481) 431 69.4 2.3e-11 XP_011542587 (OMIM: 607868) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 391) 428 68.9 2.7e-11 XP_016873949 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 314) 426 68.6 2.8e-11 XP_005249431 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 539) 427 68.9 3.6e-11 NP_001229712 (OMIM: 600830) tripartite motif-conta ( 539) 427 68.9 3.6e-11 XP_006715243 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 539) 427 68.9 3.6e-11 XP_005249433 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 539) 427 68.9 3.6e-11 XP_005249435 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 539) 427 68.9 3.6e-11 XP_005249432 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 539) 427 68.9 3.6e-11 XP_005249434 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 539) 427 68.9 3.6e-11 NP_003440 (OMIM: 600830) tripartite motif-containi ( 539) 427 68.9 3.6e-11 XP_011512567 (OMIM: 609316) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 421) 425 68.6 3.7e-11 NP_008959 (OMIM: 609316) E3 ubiquitin-protein liga ( 425) 425 68.6 3.7e-11 NP_060543 (OMIM: 613184) E3 ubiquitin-protein liga ( 485) 422 68.2 5.3e-11 >>NP_065091 (OMIM: 606124) tripartite motif-containing p (452 aa) initn: 1589 init1: 1229 opt: 1576 Z-score: 1134.0 bits: 219.0 E(85289): 2e-56 Smith-Waterman score: 1576; 51.9% identity (77.2% similar) in 451 aa overlap (1-445:1-451) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MDSDFSHAFQKELTCVICLNYLVDPVTICCGHSFCRPCLCLSWEEAQSPANCPACREPSP :.: . ..:: :: : .:.::..::::: :::::::::. :.:.. ..: : . . NP_065 MNSGILQVFQGELICPLCMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWQDIPFLVQCSECTKSTE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 KMDFKTNILLKNLVTIARKASLWQFLSSEKQICGTHRQTKKMFCDMDKSLLCLLCSNSQE ....:::: ::.....:::.::: :::::.:.:::::.:::.::..:.::::::::.::: NP_065 QINLKTNIHLKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKIFCEVDRSLLCLLCSSSQE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 HGAHKHHPIEEAAEEHREKLLKQMRILWKKIQENQRNLYEEGRTAFLWRGNVVLRAQMIR : :.:.::: ::::::::::..:. ::.: ::.::: : . :. : :: . :: NP_065 HRYHRHRPIEWAAEEHREKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTRCWKDYVNLRLEAIR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 NEYRKLHPVLHKEEKQHLERLNKEYQEIFQQLQRSWVKMDQKSKHLKEMYQELMEMCHKP ::.:. :.:::..:: :.:. .:::..:. : .:: .. . :. ::.:: :::::: NP_065 AEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKEIFHRLHLSKAKMAHRMEILRGMYEELNEMCHKP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 DVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQPVNPELTAGPITGLVYRLNRFRVEISFHFEVTNHNI :::::: .:::. ::::::::::::.::::.::::::: :::.:::.:..: : .:..: NP_065 DVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNPELSAGPITGLRDRLNQFRVHITLHHEEANNDI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 RLFEDVRSWMF----RRGPLNSDRSDYFAAWGARVFSFGKHYWELDVDNSCDWALGVCNN :.: .:: . . : . : :::...:. ::.:::. : .: .::.:::: NP_065 FLYEILRSMCIGCDHQDVPYFTATPRSFLAWGVQTFTSGKYYWEVHVGDSWNWAFGVCNM 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 SWIRKNST--MVNSEDIFLLLCLKVDNHFNLLTTSPVFPHYIEKPLGRVGVFLDFESGSV .::.. . .. .::: :.: : . .:.::::.. .:: :: .:::.::: :. .: NP_065 YRKEKNQNEKIDGKAGLFLLGCVKNDIQCSLFTTSPLMLQYIPKPTSRVGLFLDCEAKTV 370 380 390 400 410 420 420 430 440 pF1KE3 SFLNVTKSSLIWSYPAGSLTFPVRPFFYTGHR ::..:..::::.. : :.. :.::.: : NP_065 SFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFCCIHF 430 440 450 >>NP_660215 (OMIM: 607868) E3 ubiquitin-protein ligase T (468 aa) initn: 798 init1: 373 opt: 900 Z-score: 656.3 bits: 130.7 E(85289): 8.1e-30 Smith-Waterman score: 900; 34.3% identity (63.0% similar) in 446 aa overlap (4-441:5-442) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MDSDFSHAFQKELTCVICLNYLVDPVTICCGHSFCRPCLCLSWEEAQSPANCPACREPS :.: .:.: ::.:::.:..::: :::.::: :. : . ..: :: ::: : NP_660 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPYACPECRELS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 PKMDFKTNILLKNLVTIARKASLWQFLSSEKQICGTHRQTKKMFCDMDKSLLCLLCSNSQ :. ... : : ... .::. : . .: .::. :: . ::: : : NP_660 PQRNLRPNRPLAKMAEMARR--LHPPSPVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAACERSG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 EHGAHKHHPIEEAAEEHREKLLKQMRILWKKIQENQRNLYEEGRTAFLWRGNVVLRAQMI :: ::. .:...:::. . :: :... : :..:. . .: ::. : . : . 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NP_660 GVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVF-LGSYYNS-SERALAP--LRDPPRRVGIFLDYEA 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 GSVSFLNVTKSSLIWSYPAGSLTFPVRPFFYTGHR : .:: ..: .::.. .: .. .::.: NP_660 GHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPTPMTICRPKGGSGDTLAPQ 420 430 440 450 460 >>XP_016857901 (OMIM: 607868) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (467 aa) initn: 840 init1: 267 opt: 890 Z-score: 649.3 bits: 129.4 E(85289): 2e-29 Smith-Waterman score: 890; 34.3% identity (63.0% similar) in 446 aa overlap (4-441:5-441) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MDSDFSHAFQKELTCVICLNYLVDPVTICCGHSFCRPCLCLSWEEAQSPANCPACREPS :.: .:.: ::.:::.:..::: :::.::: :. : . ..: :: ::: : XP_016 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPYACPECRELS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 PKMDFKTNILLKNLVTIARKASLWQFLSSEKQICGTHRQTKKMFCDMDKSLLCLLCSNSQ :. ... : : ... .::. : . .: .::. :: . ::: : : XP_016 PQRNLRPNRPLAKMAEMARR--LHPPSPVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAACERSG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 EHGAHKHHPIEEAAEEHREKLLKQMRILWKKIQENQRNLYEEGRTAFLWRGNVVLRAQMI :: ::. .:...:::. . :: :... : :..:. . .: ::. : . : . XP_016 EHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQ-MVESQRQNV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 RNEYRKLHPVLHKEEKQHLERLNKEYQEIFQQLQRSWVKMDQKSKHLKEMYQELMEMCHK .:...:. .: .::.: :.::..: :.. .:... ... :.: :: :. :: :. XP_016 LGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEGRCQL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 PDVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQPVNPEL-TAGPITGLVYRLNRFRVEISFHFEVTNH : . ::::. : . : ..: :. :. : :: :. . ::: : ::: .... ...: XP_016 PALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPDTANP 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 NIRLFEDVRSWMFRRGPLNS---DRSDYF----AAWGARVFSFGKHYWELDVDNSCDWAL .. : :: :: .:: : . : . : . : . :. :.::::..: . .::: XP_016 ELILSEDRRS--VQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGDRTSWAL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 GVCNNSWIRKNSTMVNSEDIFLLLCLKVDNHFNLLTTSPVFPHYIEKPLGRVGVFLDFES ::: .. ::.. ... . : .: . . ...: . . : .. : :::.:::.:. XP_016 GVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVF-LGSYYNS-SERALAP--LRDPPRRVGIFLDYEA 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 GSVSFLNVTKSSLIWSYPAGSLTFPVRPFFYTGHR : .:: ..: .::.. .: .. .::.: XP_016 GHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPTPMTICRPKGGSGDTLAPQ 420 430 440 450 460 >>NP_003132 (OMIM: 109092) E3 ubiquitin-protein ligase T (475 aa) initn: 713 init1: 360 opt: 787 Z-score: 576.4 bits: 115.9 E(85289): 2.3e-25 Smith-Waterman score: 787; 33.6% identity (62.5% similar) in 443 aa overlap (11-444:12-449) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MDSDFSHAFQKELTCVICLNYLVDPVTICCGHSFCRPCLCLSWEEAQSPANCPACREPS .:.:: :::. .:.::.: ::::::. : .: . . ::.::. NP_003 MASAARLTMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQEC--ISQVGKGGGSVCPVCRQRF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 PKMDFKTNILLKNLVTIARKASLWQFLSSEKQICGTHRQTKKMFCDMDKSLLCLLCSNSQ ... : : :.:. .. : ... . :..: . ..::. : . :: .:..:. NP_003 LLKNLRPNRQLANMVNNLKEISQEAREGTQGERCAVHGERLHLFCEKDGKALCWVCAQSR 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 EHGAHKHHPIEEAAEEHREKLLKQMRILWKKIQENQRNLYEEGRTAFLWRGNVVLRAQMI .: : :.::::.:..::: . : .: . .. : . :. .: . . : NP_003 KHRDHAMVPLEEAAQEYQEKLQVALGELRRKQELAEKLEVEIAIKRADWKKTVETQKSRI 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 RNEYRKLHPVLHKEEKQHLERLNKEYQEIFQQLQRSWVKMDQKSKHLKEMYQELMEMCHK . :. . . : .::...:..:.:. .: .. : .. .:. :.:. :.:. .:: . ::. NP_003 HAEFVQQKNFLVEEEQRQLQELEKDEREQLRILGEKEAKLAQQSQALQELISELDRRCHS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 PDVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQPVNPEL-TAGPITGLVYRLNRFRVEISFHFEVTNH .::::.. .. :::: :. . ..::: .. . :: : :.:.. ...: NP_003 SALELLQEVIIVLERSESWNLKDLDITSPELRSVCHVPGLKKMLRTCAVHITLDPDTANP 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 NIRLFEDVRSWMFRRG------PLNSDRSD-YFAAWGARVFSFGKHYWELDVDNSCDWAL . : :: :. : : : : .: : : . ::. : ::::::.:: .. : : NP_003 WLILSEDRRQ--VRLGDTQQSIPGNEERFDSYPMVLGAQHFHSGKHYWEVDVTGKEAWDL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 GVCNNSWIRKNSTMVNSEDIFLLLCLKVDNHFNLLTTSPVFPHYIEKPLGRVGVFLDFES ::: .: ::. ...:.. : . : .... : : : ... : .::.:::.:. NP_003 GVCRDSVRRKGHFLLSSKSGFWTIWLWNKQKYEA-GTYPQTPLHLQVPPCQVGIFLDYEA 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 GSVSFLNVT-KSSLIWSYPAGSLTFPVRPFFYTGHR : ::: :.: ..:::.:. ..: :.:::: : NP_003 GMVSFYNITDHGSLIYSFSECAFTGPLRPFFSPGFNDGGKNTAPLTLCPLNIGSQGSTDY 420 430 440 450 460 470 >>XP_016873516 (OMIM: 606124) PREDICTED: tripartite moti (375 aa) initn: 1323 init1: 707 opt: 731 Z-score: 538.1 bits: 108.5 E(85289): 3.1e-23 Smith-Waterman score: 1171; 43.6% identity (64.6% similar) in 452 aa overlap (1-445:1-374) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MDSDFSHAFQKELTCVICLNYLVDPVTICCGHSFCRPCLCLSWEEAQSPANCPACREPSP :.: . ..:: :: : .:.::..::::: :::::::::. :.:.. ..: : . . XP_016 MNSGILQVFQGELICPLCMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWQDIPFLVQCSECTKSTE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 KMDFKTNILLKNLVTIARKASLWQFLSSEKQICGTHRQTKKMFCDMDKSLLCLLCSNSQE ....:::: ::.....:::.::: :::::.:.:::::.:::.::..:.::::::::.::: XP_016 QINLKTNIHLKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKIFCEVDRSLLCLLCSSSQE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 HGAHKHHPIEEAAEEHREKLLKQMRILWKKIQENQRNL-YEEGRTAFLWRGNVVLRAQMI : :.:.::: ::::::::::..:. ::.: ::.::: : :: XP_016 HRYHRHRPIEWAAEEHREKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRT--------------- 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 RNEYRKLHPVLHKEEKQHLERLNKEYQEIFQQLQRSWVKMDQKSKHLKEMYQELMEMCHK : : XP_016 ----------------------------------RCW----------------------- 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 PDVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQPVNPELTAGPITGLVYRLNRFRVEISFHFEVTNHN . .:::. ::::::::::::.::::.::::::: :::.:::.:..: : .:.. XP_016 ------KAFGDILHRSESVLLHMPQPLNPELSAGPITGLRDRLNQFRVHITLHHEEANND 170 180 190 200 210 220 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 IRLFEDVRSWMF----RRGPLNSDRSDYFAAWGARVFSFGKHYWELDVDNSCDWALGVCN : :.: .:: . . : . : :::...:. ::.:::. : .: .::.:::: XP_016 IFLYEILRSMCIGCDHQDVPYFTATPRSFLAWGVQTFTSGKYYWEVHVGDSWNWAFGVCN 230 240 250 260 270 280 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 NSWIRKNST--MVNSEDIFLLLCLKVDNHFNLLTTSPVFPHYIEKPLGRVGVFLDFESGS .::.. . .. .::: :.: : . .:.::::.. .:: :: .:::.::: :. . XP_016 MYRKEKNQNEKIDGKAGLFLLGCVKNDIQCSLFTTSPLMLQYIPKPTSRVGLFLDCEAKT 290 300 310 320 330 340 420 430 440 pF1KE3 VSFLNVTKSSLIWSYPAGSLTFPVRPFFYTGHR :::..:..::::.. : :.. :.::.: : XP_016 VSFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFCCIHF 350 360 370 >>NP_057186 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein ligase T (477 aa) initn: 720 init1: 269 opt: 593 Z-score: 439.4 bits: 90.6 E(85289): 9.8e-18 Smith-Waterman score: 783; 30.4% identity (62.5% similar) in 461 aa overlap (4-444:5-459) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MDSDFSHAFQKELTCVICLNYLVDPVTICCGHSFCRPCLCLSWEEAQSPAN-------- .... .:.: :: :::.:..::: :::.::: :. ::::.:.. . 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NP_057 KVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELLL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 QELMEMCHKPDVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQ---PVNPELTAGPITGLVYRLNRFRV .: : . ...:::. . ..:...: .. :. :. :. :. . : . : : NP_057 LQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPR-TVCRVPGQIEVLRGFLE 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 EISFHFEVTNHNIRLFEDVRSWMFRRGPLNSD--RSDYFAAW----GARVFSFGKHYWEL .. . . :.:. . .. .: .: .: :.:. : .:: :.::::. 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XP_006 KVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELLL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 QELMEMCHKPDVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQ---PVNPELTAGPITGLVYRLNRFRV .: : . ...:::. . ..:...: .. :. :. :. :. . : . : : XP_006 LQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPR-TVCRVPGQIEVLRGFLE 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 EISFHFEVTNHNIRLFEDVRSWMFRRGPLNSD--RSDYFAAW----GARVFSFGKHYWEL .. . . :.:. . .. .: .: .: :.:. : .:: :.::::. XP_006 DVVPDATSAYPYLLLYESRQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQTAFSSGRHYWEV 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 pF1KE3 DVDNSCD--WALGVCNNSWIRKNSTMVNSEDIFLLLCLKVDNHFNLLTTSPVFPHYIEKP .. . : :::::: .. ::. . :. : .. :. ... : : : . : .. .: XP_006 GMNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKY-LSTFSALTPVMLMEP 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 pF1KE3 LGRVGVFLDFESGSVSFLNVTKSSLIWSYPAGSLTFPVRPFFYTGHR ...:.:::::.: ::: .:. .: . .: ... :..::: : XP_006 PSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCLGAPKSGQMVISTVTMW 420 430 440 450 460 470 XP_006 VKG >>XP_011542511 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (477 aa) initn: 720 init1: 269 opt: 593 Z-score: 439.4 bits: 90.6 E(85289): 9.8e-18 Smith-Waterman score: 783; 30.4% identity (62.5% similar) in 461 aa overlap (4-444:5-459) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MDSDFSHAFQKELTCVICLNYLVDPVTICCGHSFCRPCLCLSWEEAQSPAN-------- .... .:.: :: :::.:..::: :::.::: :. ::::.:.. . XP_011 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 -CPACREPSPKMDFKTNILLKNLVTIARKASLWQFLSSEKQICGTHRQTKKMFCDMDKSL :: ::: ::. .. : :: ... .:.. : ....: :.. :.::. :.: XP_011 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQHPGLQ----KQDLCQEHHEPLKLFCQKDQSP 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 LCLLCSNSQEHGAHKHHPIEEAAEEHREKLLKQMRILWKKIQENQRNLYEEGRTAFLWRG .:..: .:.:: :. : :::.. .. :: ..:. : ..: .. .: .. :.: XP_011 ICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 NVVLRAQMIRNEYRKLHPVLHKEEKQHLERLNKEYQEIFQQLQRSWVKMDQKSKHLKEMY .: : . : :..:.. : .::.. :. :. : .: ..:..: . .:.... :. . 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XP_011 KVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELLL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 QELMEMCHKPDVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQ---PVNPELTAGPITGLVYRLNRFRV .: : . ...:::. . ..:...: .. :. :. :. :. . : . : : XP_011 LQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPR-TVCRVPGQIEVLRGFLE 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 EISFHFEVTNHNIRLFEDVRSWMFRRGPLNSD--RSDYFAAW----GARVFSFGKHYWEL .. . . :.:. . .. .: .: .: :.:. : .:: :.::::. 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