FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3958, 446 aa 1>>>pF1KE3958 446 - 446 aa - 446 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9978+/-0.0012; mu= 11.3847+/- 0.071 mean_var=194.1387+/-41.151, 0's: 0 Z-trim(108.8): 140 B-trim: 399 in 1/52 Lambda= 0.092049 statistics sampled from 10316 (10467) to 10316 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.692), E-opt: 0.2 (0.322), width: 16 Scan time: 2.980 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS2015.1 TRIM43 gene_id:129868|Hs108|chr2 ( 446) 3119 427.1 1.8e-119 CCDS55762.1 TRIM49B gene_id:283116|Hs108|chr11 ( 452) 1599 225.2 1e-58 CCDS53694.1 TRIM49C gene_id:642612|Hs108|chr11 ( 452) 1582 223.0 4.9e-58 CCDS8287.1 TRIM49 gene_id:57093|Hs108|chr11 ( 452) 1576 222.2 8.5e-58 CCDS60930.1 TRIM49D1 gene_id:399939|Hs108|chr11 ( 452) 1521 214.9 1.4e-55 CCDS60929.1 TRIM77 gene_id:390231|Hs108|chr11 ( 450) 1473 208.5 1.1e-53 CCDS73363.1 TRIM64 gene_id:120146|Hs108|chr11 ( 449) 1457 206.4 4.9e-53 CCDS53693.1 TRIM64B gene_id:642446|Hs108|chr11 ( 449) 1446 204.9 1.3e-52 CCDS73287.1 TRIM64C gene_id:646754|Hs108|chr11 ( 450) 1416 200.9 2.1e-51 CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 ( 468) 900 132.4 9.2e-31 CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4 ( 468) 871 128.6 1.3e-29 CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 ( 475) 787 117.4 3.1e-26 CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1 ( 486) 781 116.7 5.4e-26 CCDS7947.2 TRIM48 gene_id:79097|Hs108|chr11 ( 224) 729 109.3 3.9e-24 CCDS5678.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7 ( 474) 623 95.7 1.1e-19 CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 477) 593 91.7 1.8e-18 CCDS31391.1 TRIM34 gene_id:53840|Hs108|chr11 ( 488) 549 85.8 1e-16 CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 488) 537 84.2 3.1e-16 CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6 ( 503) 537 84.3 3.1e-16 CCDS44327.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 343) 534 83.7 3.2e-16 CCDS34377.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 518) 516 81.5 2.2e-15 CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6 ( 513) 497 79.0 1.3e-14 CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 ( 471) 481 76.8 5.2e-14 CCDS31390.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 488) 480 76.7 5.9e-14 CCDS31389.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 516) 480 76.7 6.1e-14 CCDS31388.1 TRIM34 gene_id:445372|Hs108|chr11 ( 842) 478 76.7 1e-13 CCDS31392.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 326) 463 74.2 2.2e-13 CCDS31394.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 347) 463 74.2 2.2e-13 CCDS31393.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 493) 463 74.4 2.8e-13 CCDS41612.1 TRIM22 gene_id:10346|Hs108|chr11 ( 498) 463 74.4 2.8e-13 CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 ( 465) 462 74.3 3e-13 CCDS4676.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 395) 431 70.1 4.6e-12 CCDS34375.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 481) 431 70.2 5.3e-12 CCDS4678.1 TRIM26 gene_id:7726|Hs108|chr6 ( 539) 427 69.7 8.2e-12 CCDS34374.1 TRIM31 gene_id:11074|Hs108|chr6 ( 425) 425 69.3 8.5e-12 CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11 ( 485) 422 69.0 1.2e-11 CCDS6056.2 TRIM35 gene_id:23087|Hs108|chr8 ( 493) 409 67.3 4.1e-11 CCDS5679.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7 ( 500) 406 66.9 5.4e-11 CCDS3850.2 TRIML2 gene_id:205860|Hs108|chr4 ( 437) 401 66.1 7.8e-11 >>CCDS2015.1 TRIM43 gene_id:129868|Hs108|chr2 (446 aa) initn: 3119 init1: 3119 opt: 3119 Z-score: 2258.5 bits: 427.1 E(32554): 1.8e-119 Smith-Waterman score: 3119; 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CCDS82 MNSGILQVFQGELICPLCMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWQDIPFLVQCSECTKSTE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 KMDFKTNILLKNLVTIARKASLWQFLSSEKQICGTHRQTKKMFCDMDKSLLCLLCSNSQE ....:::: ::.....:::.::: :::::.:.:::::.:::.::..:.::::::::.::: CCDS82 QINLKTNIHLKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKIFCEVDRSLLCLLCSSSQE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 HGAHKHHPIEEAAEEHREKLLKQMRILWKKIQENQRNLYEEGRTAFLWRGNVVLRAQMIR : :.:.::: ::::::::::..:. ::.: ::.::: : . :. : :: . :: CCDS82 HRYHRHRPIEWAAEEHREKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTRCWKDYVNLRLEAIR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 NEYRKLHPVLHKEEKQHLERLNKEYQEIFQQLQRSWVKMDQKSKHLKEMYQELMEMCHKP ::.:. :.:::..:: :.:. .:::..:. : .:: .. . :. ::.:: :::::: CCDS82 AEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKEIFHRLHLSKAKMAHRMEILRGMYEELNEMCHKP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 DVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQPVNPELTAGPITGLVYRLNRFRVEISFHFEVTNHNI :::::: .:::. ::::::::::::.::::.::::::: :::.:::.:..: : .:..: CCDS82 DVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNPELSAGPITGLRDRLNQFRVHITLHHEEANNDI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 RLFEDVRSWMF----RRGPLNSDRSDYFAAWGARVFSFGKHYWELDVDNSCDWALGVCNN :.: .:: . . : . : :::...:. ::.:::. : .: .::.:::: CCDS82 FLYEILRSMCIGCDHQDVPYFTATPRSFLAWGVQTFTSGKYYWEVHVGDSWNWAFGVCNM 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 SWIRKNST--MVNSEDIFLLLCLKVDNHFNLLTTSPVFPHYIEKPLGRVGVFLDFESGSV .::.. . .. .::: :.: : . .:.::::.. .:: :: .:::.::: :. .: CCDS82 YRKEKNQNEKIDGKAGLFLLGCVKNDIQCSLFTTSPLMLQYIPKPTSRVGLFLDCEAKTV 370 380 390 400 410 420 420 430 440 pF1KE3 SFLNVTKSSLIWSYPAGSLTFPVRPFFYTGHR ::..:..::::.. : :.. :.::.: : CCDS82 SFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFCCIHF 430 440 450 >>CCDS60930.1 TRIM49D1 gene_id:399939|Hs108|chr11 (452 aa) initn: 1475 init1: 1176 opt: 1521 Z-score: 1111.6 bits: 214.9 E(32554): 1.4e-55 Smith-Waterman score: 1521; 51.1% identity (75.2% similar) in 452 aa overlap (1-445:1-451) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MDSDFSHAFQKELTCVICLNYLVDPVTICCGHSFCRPCLCLSWEEAQSPANCPACREPSP :.: .:..::.:::: :::::..::::: :::::::::. :.:.. ..: : . . CCDS60 MNSGISQVFQRELTCPICLNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWQDIPILTQCFECLKTTQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 KMDFKTNILLKNLVTIARKASLWQFLSSEKQICGTHRQTKKMFCDMDKSLLCLLCSNSQE . ..:::: ::.... ::::::: :::::.:.:::::.:::.::..:.::::::::.: : CCDS60 QRNLKTNIRLKKMASRARKASLWLFLSSEEQMCGTHRETKKIFCEVDRSLLCLLCSSSLE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 HGAHKHHPIEEAAEEHREKLLKQMRILWKKIQENQRNLYEEGRTAFLWRGNVVLRAQMIR : :.: : : :::::::::::.:. ::.:. :::::: : :. : .: . :: CCDS60 HRYHRHCPAEWAAEEHREKLLKKMQSLWEKVCENQRNLNVETTRISHWKDYVNVRLEAIR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 NEYRKLHPVLHKEEKQHLERLNKEYQEIFQQLQRSWVKMDQKSKHLKEMYQELMEMCHKP ::.:. :.:::..:: :.:. ..::..:. : .:: .. . :. : :::.::::: CCDS60 AEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKDIFHRLHLSKAKMAHRREILRGTYAELMKMCHKP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 DVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQPVNPELTAGPITGLVYRLNRFRVEISF-HFEVTNHN :::::: .:::. ::::::::::::.: :: ::::::: :::.:::.:.. : :...: CCDS60 DVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNLELRAGPITGLRDRLNQFRVDITLPHNEANSHI 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 IRLFEDVRSWMF----RRGPLNSDRSDYFAAWGARVFSFGKHYWELDVDNSCDWALGVCN .: :.:: . . .: . : ::::..:. ::.:::. : .: .::.:::: CCDS60 FRR-GDLRSICIGCDRQNAPHITATPTSFLAWGAQTFTSGKYYWEVHVGDSWNWAFGVCN 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 NSW--IRKNSTMVNSEDIFLLLCLKVDNHFNLLTTSPVFPHYIEKPLGRVGVFLDFESGS . : .:... . : .: : :.: : . .:.::::. .:. .: ..::.::: :. . CCDS60 KYWKGTNQNGNIHGEEGLFSLGCVKNDIQCSLFTTSPLTLQYVPRPTNHVGLFLDCEART 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 VSFLNVTKSSLIWSYPAGSLTFPVRPFFYTGHR :::..:..:: : . : :.. :.::.: : CCDS60 VSFVDVNQSSPIHTIPNCSFSPPLRPIFCCVHL 420 430 440 450 >>CCDS60929.1 TRIM77 gene_id:390231|Hs108|chr11 (450 aa) initn: 1477 init1: 973 opt: 1473 Z-score: 1077.2 bits: 208.5 E(32554): 1.1e-53 Smith-Waterman score: 1473; 48.1% identity (73.2% similar) in 451 aa overlap (1-446:1-450) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MDSDFSHAFQKELTCVICLNYLVDPVTICCGHSFCRPCLCLSWEEAQSPANCPACREPSP : : ... .:::: :: .::.::::::::: :: ::::: ::.. .: ::.::: : CCDS60 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREISQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 KMDFKTNILLKNLVTIARKASLWQFLSSEKQICGTHRQTKKMFCDMDKSLLCLLCSNSQE .: :: :. .. : .:.. :. :: :: :.. :...:. :.::::.:::.: . CCDS60 QMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSLLCFLCSQSPR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 HGAHKHHPIEEAAEEHREKLLKQMRILWKKIQENQRNLYEEGRTAFLWRGNVVLRAQMIR :..:::. .:: : .:.::: ::. .::: :.::::: .: :. . ::..:: CCDS60 HATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLNRETNIIGTWEVFINLRSMMIS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 NEYRKLHPVLHKEEKQHLERLNKEYQEIFQQLQRSWVKMDQKSKHLKEMYQELMEMCHKP :: :. :..::..:.: : .: . :::::.:: ..: . . :.:::..: :: : CCDS60 AEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLREMYEKLKEMSCKA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 DVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQPVNPELTAGPITGLVYRLNRFRVEISFHFEV-TNHN ::.: :::::.. :.: . : :::::::.:.: :::. ::: ::: :.. .. .::. CCDS60 DVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQLSAWTITGVSERLNFFRVYITLDRKICSNHK 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 IRLFEDVRSWMFRRGPL----NSDRSDYFAAWGARVFSFGKHYWELDVDNSCDWALGVCN . ::::.: . : ..: ..:::...: ::::::.:: .::.:..:.: CCDS60 L-LFEDLRHLQCSLDDTDMSCNPTSTQYTSSWGAQILSSGKHYWEVDVKDSCNWVIGLCR 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 NSWIRKNSTMVNSEDIFLLLCLKVDNHFNLLTTSPVFPHYIEKPLGRVGVFLDFESGSVS ..: ..:. ..:: ::::::::::.::.:..:::..:::: .: : .:::::.: : :: CCDS60 EAWTKRNDMRLDSEGIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRPQGWLGVFLDYECGIVS 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 FLNVTKSSLIWSYPAGSLTFPVRPFFYTGHR :.::..:::: :. . . ::.:::. : . CCDS60 FVNVAQSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK 420 430 440 450 >>CCDS73363.1 TRIM64 gene_id:120146|Hs108|chr11 (449 aa) initn: 1455 init1: 676 opt: 1457 Z-score: 1065.7 bits: 206.4 E(32554): 4.9e-53 Smith-Waterman score: 1457; 48.2% identity (74.3% similar) in 448 aa overlap (1-444:1-447) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MDSDFSHAFQKELTCVICLNYLVDPVTICCGHSFCRPCLCLSWEEAQSPANCPACREPSP :::: ..::.:: : ::.::..::::: :::::::::::: ::...: ::.::. : CCDS73 MDSDDLQVFQNELICCICVNYFIDPVTIDCGHSFCRPCLCLCSEEGRAPMRCPSCRKISE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 KMDFKTNILLKNLVTIARKASLWQFLSSEKQICGTHRQTKKMFCDMDKSLLCLLCSNSQE : .:.::..::.: ..::.. : ..: .:: :..::..::. :: ::: ::.: : CCDS73 KPNFNTNVVLKKLSSLARQTRP-QNINSSDNICVLHEETKELFCEADKRLLCGPCSESPE 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 HGAHKHHPIEEAAEEHREKLLKQMRILWKKIQENQRNLYEEGRTAFLWRGNVVLRAQMIR : ::.: :: :::: ::::.:.: ::. ::.. :: .: :: . : .: ..: CCDS73 HMAHSHSPIGWAAEECREKLIKEMDYLWEINQETRNNLNQETRTFHSLKDYVSVRKRIIT 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 NEYRKLHPVLHKEEKQHLERLNKEYQEIFQQLQRSWVKMDQKSKHLKEMYQELMEMCHKP .:.:. : .::..::. :..: .:.::::: : :.: :. ...:.::.:: : :: : CCDS73 IQYQKMPIFLDEEEQRHLQALEREAEELFQQLQDSQVRMTQHLERMKDMYRELWETCHVP 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 DVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQPVNPELTAGPITGLVYRLNRFRVEISFHFEVTNHNI :::::::. .. ::.. . .. :::::::::. :::.. :: :::. .. :. : CCDS73 DVELLQDVRNVSARTDLAQMQKPQPVNPELTSWCITGVLDMLNNFRVDSALSTEMIPCYI 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 pF1KE3 RLFEDVRSWMFR----RGPLNSDRSDYFAAWGARVFSFGKHYWELDVDNSCDWALGVCNN : :::: .: .: . . : ::.:::..:. ::::::.:: : .: ::::.. CCDS73 SLSEDVRYVIFGDDHLSAPTDPQGVDSFAVWGAQAFTSGKHYWEVDVTLSSNWILGVCQD 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 SWIRKNSTMVNSEDIFLLLCLKVDNHFNLLTTSPVFPHYIEKPLGRVGVFLDFESGSVSF : . ...:.. :.:. : .::..: :.:: . .:...:::.::::::...::::: CCDS73 SRTADANFVIDSDERFFLISSKRSNHYSLSTNSPPLIQYVQRPLGQVGVFLDYDNGSVSF 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 LNVTKSSLIWSYPAGSLTFPVRPFFYTGHR ..:.:.:::...: .:.. :.:::: : CCDS73 FDVSKGSLIYGFPPSSFSSPLRPFFCFGCT 420 430 440 >>CCDS53693.1 TRIM64B gene_id:642446|Hs108|chr11 (449 aa) initn: 1444 init1: 660 opt: 1446 Z-score: 1057.8 bits: 204.9 E(32554): 1.3e-52 Smith-Waterman score: 1446; 48.0% identity (73.7% similar) in 448 aa overlap (1-444:1-447) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MDSDFSHAFQKELTCVICLNYLVDPVTICCGHSFCRPCLCLSWEEAQSPANCPACREPSP :::: ..::.:: : ::.::..::::: :::::::::::: ::...: ::.::. : CCDS53 MDSDDLQVFQNELICCICVNYFIDPVTIDCGHSFCRPCLCLCSEEGRAPMRCPSCRKTSE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 KMDFKTNILLKNLVTIARKASLWQFLSSEKQICGTHRQTKKMFCDMDKSLLCLLCSNSQE : .:.::..::.: ..::.. : ..: .:: :..::..::. :: ::: ::.: : CCDS53 KPNFNTNLVLKKLSSLARQTRP-QNINSSDNICVLHEETKELFCEADKRLLCGPCSESPE 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 HGAHKHHPIEEAAEEHREKLLKQMRILWKKIQENQRNLYEEGRTAFLWRGNVVLRAQMIR : ::.: :: :::: ::::.:.: ::. ::.. :: .: : . : .: ..: CCDS53 HMAHSHSPIGWAAEECREKLIKEMDYLWEINQETRNNLNQETSTFHSLKDYVSVRKRIIT 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 NEYRKLHPVLHKEEKQHLERLNKEYQEIFQQLQRSWVKMDQKSKHLKEMYQELMEMCHKP .:.:. : .::..::. :..: .:.::::: : :.: :. ...:.::.:: : :: : CCDS53 IQYQKMPIFLDEEEQRHLQALEREAEELFQQLQDSQVRMTQHLERMKDMYRELWETCHMP 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 DVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQPVNPELTAGPITGLVYRLNRFRVEISFHFEVTNHNI :: ::::. .. ::.. . .. :::::::::. :::.. :: :::. .. :. : CCDS53 DVVLLQDVRNVSARTDLAQMQKPQPVNPELTSWCITGVLDMLNNFRVDSALSTEMIPCYI 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 pF1KE3 RLFEDVRSWMFR----RGPLNSDRSDYFAAWGARVFSFGKHYWELDVDNSCDWALGVCNN : :::: .: .: . . : ::.:::..:. ::::::.:: : .: :::: . CCDS53 SLSEDVRYVIFGDDHLSAPTDPQGVDSFAVWGAQAFTSGKHYWEVDVTLSSNWILGVCRD 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 SWIRKNSTMVNSEDIFLLLCLKVDNHFNLLTTSPVFPHYIEKPLGRVGVFLDFESGSVSF : . ...:.. :.:. : .::..: :.:: . .:...::::::::::...::::: CCDS53 SRTADANFVIDSDERFFLISSKRSNHYSLSTNSPPLIQYVQRPLGRVGVFLDYDNGSVSF 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 LNVTKSSLIWSYPAGSLTFPVRPFFYTGHR ..:.:.:::...: .:.. :.:::: : CCDS53 FDVSKGSLIYGFPPSSFSSPLRPFFCFGCT 420 430 440 >>CCDS73287.1 TRIM64C gene_id:646754|Hs108|chr11 (450 aa) initn: 1410 init1: 780 opt: 1416 Z-score: 1036.3 bits: 200.9 E(32554): 2.1e-51 Smith-Waterman score: 1416; 47.9% identity (72.6% similar) in 449 aa overlap (1-444:1-448) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MDSDFSHAFQKELTCVICLNYLVDPVTICCGHSFCRPCLCLSWEEAQSPANCPACREPSP :::: ..::.:: : ::.::..:::: : :::::::::: ::...: :: ::. : CCDS73 MDSDTLRVFQNELICCICVNYFIDPVTTDCVHSFCRPCLCLCSEEGRAPMRCPLCRKISE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 KMDFKTNILLKNLVTIARKASLWQFLSSEKQICGTHRQTKKMFCDMDKSLLCLLCSNSQE : .:.::. ::.:...::.. : ..: .:: :..::..::. :: ::: ::.: : CCDS73 KPNFNTNVALKKLASLARQTRP-QNINSSDNICVLHEETKELFCEADKRLLCGPCSESPE 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE3 HGAHKHHPIEEAAEEHR-EKLLKQMRILWKKIQENQRNLYEEGRTAFLWRGNVVLRAQMI : ::.: :: :::: : .::.:.: ::: ::.: :: .: : :: .: CCDS73 HMAHSHSPIGWAAEECRVQKLIKEMDYLWKINQETQNNLNQETSKFCSLVDYVSLRKVII 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 RNEYRKLHPVLHKEEKQHLERLNKEYQEIFQQLQRSWVKMDQKSKHLKEMYQELMEMCHK .:.:.: : .::..::. :..: .:.::::: : :.: :. . .:.::.:: : : CCDS73 TIQYQKMHIFLDEEEQRHLQALEREAKELFQQLQDSQVRMTQHLEGMKDMYRELWETYHM 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 PDVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQPVNPELTAGPITGLVYRLNRFRVEISFHFEVTNHN ::::::::.:.: ::.. . . :::::::::. :::.. :: :::. .. :.: CCDS73 PDVELLQDVGNISARTDLAQMPKPQPVNPELTSWCITGVLDMLNNFRVDNALSTEMTPCY 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 IRLFEDVRSWMF----RRGPLNSDRSDYFAAWGARVFSFGKHYWELDVDNSCDWALGVCN : : :::: .: : .:.. . . ::.: :..:. ::::::.:: .: .: :::: CCDS73 ISLSEDVRRVIFGDDHRSAPMDPQGVESFAVWCAQAFTSGKHYWEVDVTHSSNWILGVCR 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 NSWIRKNSTMVNSEDIFLLLCLKVDNHFNLLTTSPVFPHYIEKPLGRVGVFLDFESGSVS .: .. ...:. :. . :..::..: :.:: . .:...::: ::::::...:::: CCDS73 DSRTADTNIVIDSDKTFFSISSKTSNHYSLSTNSPPLIQYVQRPLGWVGVFLDYDNGSVS 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 FLNVTKSSLIWSYPAGSLTFPVRPFFYTGHR :..:.:.:::...: .:.. :.:::: : CCDS73 FFDVSKGSLIYGFPPSSFSSPLRPFFCFGCT 420 430 440 450 >>CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 (468 aa) initn: 798 init1: 373 opt: 900 Z-score: 665.7 bits: 132.4 E(32554): 9.2e-31 Smith-Waterman score: 900; 34.3% identity (63.0% similar) in 446 aa overlap (4-441:5-442) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MDSDFSHAFQKELTCVICLNYLVDPVTICCGHSFCRPCLCLSWEEAQSPANCPACREPS :.: .:.: ::.:::.:..::: :::.::: :. : . ..: :: ::: : CCDS31 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPYACPECRELS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 PKMDFKTNILLKNLVTIARKASLWQFLSSEKQICGTHRQTKKMFCDMDKSLLCLLCSNSQ :. ... : : ... .::. : . .: .::. :: . ::: : : CCDS31 PQRNLRPNRPLAKMAEMARR--LHPPSPVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAACERSG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 EHGAHKHHPIEEAAEEHREKLLKQMRILWKKIQENQRNLYEEGRTAFLWRGNVVLRAQMI :: ::. .:...:::. . :: :... : :..:. . .: ::. : . : . CCDS31 EHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQRQNV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 RNEYRKLHPVLHKEEKQHLERLNKEYQEIFQQLQRSWVKMDQKSKHLKEMYQELMEMCHK .:...:. .: .::.: :.::..: :.. .:... ... :.: :: :. :: :. CCDS31 LGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEGRCQL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 PDVELLQDLGDIVARSESVLLHMPQPVNPEL-TAGPITGLVYRLNRFRVEISFHFEVTNH : . ::::. : . : ..: :. :. : :: :. . ::: : ::: .... ...: CCDS31 PALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPDTANP 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 NIRLFEDVRSWMFRRGPLNS---DRSDYF----AAWGARVFSFGKHYWELDVDNSCDWAL .. : :: :: .:: : . : . : . : . :. :.::::..: . .::: CCDS31 ELILSEDRRS--VQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGDRTSWAL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 GVCNNSWIRKNSTMVNSEDIFLLLCLKVDNHFNLLTTSPVFPHYIEKPLGRVGVFLDFES ::: .. ::.. ... . : .: . . ...: . . : .. : :::.:::.:. 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