FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7891, 588 aa 1>>>pF1KB7891 588 - 588 aa - 588 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1536+/-0.000938; mu= 1.3024+/- 0.057 mean_var=374.2413+/-76.195, 0's: 0 Z-trim(116.5): 46 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.066298 statistics sampled from 17037 (17077) to 17037 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.801), E-opt: 0.2 (0.525), width: 16 Scan time: 4.280 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1971.1 TCF7L1 gene_id:83439|Hs108|chr2 ( 588) 4010 397.4 2.7e-110 CCDS73197.1 TCF7L2 gene_id:6934|Hs108|chr10 ( 579) 2082 213.0 8.6e-55 CCDS73196.1 TCF7L2 gene_id:6934|Hs108|chr10 ( 476) 2068 211.5 1.9e-54 CCDS55729.1 TCF7L2 gene_id:6934|Hs108|chr10 ( 459) 2031 208.0 2.2e-53 CCDS7576.1 TCF7L2 gene_id:6934|Hs108|chr10 ( 596) 2031 208.1 2.6e-53 CCDS53577.1 TCF7L2 gene_id:6934|Hs108|chr10 ( 602) 1601 167.0 6.2e-41 CCDS81504.1 TCF7L2 gene_id:6934|Hs108|chr10 ( 455) 1522 159.3 9.7e-39 CCDS73198.1 TCF7L2 gene_id:6934|Hs108|chr10 ( 408) 1411 148.6 1.4e-35 CCDS53578.1 TCF7L2 gene_id:6934|Hs108|chr10 ( 489) 1385 146.2 8.9e-35 CCDS3679.1 LEF1 gene_id:51176|Hs108|chr4 ( 399) 813 91.4 2.3e-18 CCDS47123.1 LEF1 gene_id:51176|Hs108|chr4 ( 371) 734 83.8 4.1e-16 CCDS47122.1 LEF1 gene_id:51176|Hs108|chr4 ( 386) 734 83.9 4.2e-16 CCDS54791.1 LEF1 gene_id:51176|Hs108|chr4 ( 303) 731 83.5 4.4e-16 CCDS4170.1 TCF7 gene_id:6932|Hs108|chr5 ( 269) 670 77.6 2.3e-14 CCDS4169.1 TCF7 gene_id:6932|Hs108|chr5 ( 384) 670 77.7 2.9e-14 CCDS47263.2 TCF7 gene_id:6932|Hs108|chr5 ( 269) 661 76.7 4.2e-14 CCDS43362.1 TCF7 gene_id:6932|Hs108|chr5 ( 268) 656 76.2 5.8e-14 >>CCDS1971.1 TCF7L1 gene_id:83439|Hs108|chr2 (588 aa) initn: 4010 init1: 4010 opt: 4010 Z-score: 2093.7 bits: 397.4 E(32554): 2.7e-110 Smith-Waterman score: 4010; 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CCDS53 PYPTALTVNASMS-----RFPPHMVPPHHT-LHTTGIPHPAIVTPTVKQESSQSDVGSLH 280 290 300 310 320 330 330 340 350 360 370 380 pF1KB7 SVKSPVTVKKEEEKKPHVKKPLNAFMLYMKEMRAKVVAECTLKESAAINQILGRKWHNLS : : . :.::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: :: CCDS53 SSKHQDSKKEEEKKKPHIKKPLNAFMLYMKEMRAKVVAECTLKESAAINQILGRRWHALS 340 350 360 370 380 390 390 400 410 420 430 440 pF1KB7 REEQAKYYELARKERQLHSQLYPTWSARDNYGKKKKRKREKQLSQTQSQQQVQEAEGALA :::::::::::::::::: :::: :::::::::::::::.:: ..:.. . .. .. .. 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