FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1988, 564 aa 1>>>pF1KE1988 564 - 564 aa - 564 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.5295+/-0.00116; mu= -11.0142+/- 0.071 mean_var=572.4475+/-115.555, 0's: 0 Z-trim(116.3): 26 B-trim: 69 in 1/53 Lambda= 0.053605 statistics sampled from 16890 (16913) to 16890 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.791), E-opt: 0.2 (0.52), width: 16 Scan time: 4.120 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1892.1 ANTXR1 gene_id:84168|Hs108|chr2 ( 564) 3905 316.8 4.6e-86 CCDS46313.1 ANTXR1 gene_id:84168|Hs108|chr2 ( 368) 2424 202.0 1e-51 CCDS46314.1 ANTXR1 gene_id:84168|Hs108|chr2 ( 333) 2105 177.3 2.6e-44 CCDS47085.1 ANTXR2 gene_id:118429|Hs108|chr4 ( 488) 1851 157.8 2.7e-38 CCDS47086.1 ANTXR2 gene_id:118429|Hs108|chr4 ( 489) 1792 153.3 6.4e-37 CCDS68733.1 ANTXR2 gene_id:118429|Hs108|chr4 ( 411) 1625 140.3 4.4e-33 CCDS60524.1 ANTXRL gene_id:195977|Hs108|chr10 ( 631) 961 89.1 1.7e-17 >>CCDS1892.1 ANTXR1 gene_id:84168|Hs108|chr2 (564 aa) initn: 3905 init1: 3905 opt: 3905 Z-score: 1658.7 bits: 316.8 E(32554): 4.6e-86 Smith-Waterman score: 3905; 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100.0% identity (100.0% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-318) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MATAERRALGIGFQWLSLATLVLICAGQGGRREDGGPACYGGFDLYFILDKSGSVLHHWN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 MATAERRALGIGFQWLSLATLVLICAGQGGRREDGGPACYGGFDLYFILDKSGSVLHHWN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 EIYYFVEQLAHKFISPQLRMSFIVFSTRGTTLMKLTEDREQIRQGLEELQKVLPGGDTYM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 EIYYFVEQLAHKFISPQLRMSFIVFSTRGTTLMKLTEDREQIRQGLEELQKVLPGGDTYM 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 HEGFERASEQIYYENRQGYRTASVIIALTDGELHEDLFFYSEREANRSRDLGAIVYCVGV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 HEGFERASEQIYYENRQGYRTASVIIALTDGELHEDLFFYSEREANRSRDLGAIVYCVGV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 KDFNETQLARIADSKDHVFPVNDGFQALQGIIHSILKKSCIEILAAEPSTICAGESFQVV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 KDFNETQLARIADSKDHVFPVNDGFQALQGIIHSILKKSCIEILAAEPSTICAGESFQVV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 VRGNGFRHARNVDRVLCSFKINDSVTLNEKPFSVEDTYLLCPAPILKEVGMKAALQVSMN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 VRGNGFRHARNVDRVLCSFKINDSVTLNEKPFSVEDTYLLCPAPILKEVGMKAALQVSMN 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 DGLSFISSSVIITTTHCSDGSILAIALLILFLLLALALLWWFWPLCCTVIIKEVPPPPAE :::::::::::::::::: CCDS46 DGLSFISSSVIITTTHCSLHKIASGPTTAACME 310 320 330 >>CCDS47085.1 ANTXR2 gene_id:118429|Hs108|chr4 (488 aa) initn: 1823 init1: 1443 opt: 1851 Z-score: 800.9 bits: 157.8 E(32554): 2.7e-38 Smith-Waterman score: 1851; 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CCDS47 VLDFEQAQLERIADSKEQVFPVKGGFQALKGIINSILAQSCTEILELQPSSVCVGEEFQI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 VVRGNGFRHARNVDRVLCSFKINDSVTLNEKPFSVEDTYLLCPAPILKEVGMKAALQVSM :. : :: . :::.. .:.. : . :: ::. . .:::::::...: ..::. CCDS47 VLSGRGFMLGSRNGSVLCTYTVNETYTTSVKPVSVQLNSMLCPAPILNKAGETLDVSVSF 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 NDGLSFISSSVIITTTHCSDGSILAIALLILFLLLALALLWWFWPLCCTVIIKEVPPPPA : : : ::.:.:.:.:.::.: :..:.:.:::...:.:::::::: :.::. ::::: CCDS47 NGGKSVISGSLIVTATECSNGIAAIIVILVLLLLLGIGLMWWFWPLCCKVVIKDPPPPPA 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 EESEEEDDDGLPKKKWPTVDASYYGGRGVGGIKRMEVRWGEKGSTEEGAKLEKAKNARVK .::... :: :::::::::::::::::::::::::::.::::::::.::::::: :: CCDS47 PAPKEEEEEPLPTKKWPTVDASYYGGRGVGGIKRMEVRWGDKGSTEEGARLEKAKNAVVK 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 MPEQEYEFPEPRNLNNNMRRPSSPRKWYSPIKGKLDALWVLLRKGYDRVSVMRPQPGDTG .::. : .:: . . :::.::::.:::::.:::. :::::.:::: :: : CCDS47 IPEETEEPIRPRPPRPKPTHQPPQTKWYTPIKGRLDALWALLRRQYDRVSLMRPQEGDEG 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE1 RCINFTRVKNNQPAKYPLNNAYHTSSPPPAPIYTPPPPAPHCPPPPPSAPTPPIPSPPST :::::.:: CCDS47 RCINFSRVPSQ 480 >>CCDS47086.1 ANTXR2 gene_id:118429|Hs108|chr4 (489 aa) initn: 1762 init1: 1382 opt: 1792 Z-score: 776.3 bits: 153.3 E(32554): 6.4e-37 Smith-Waterman score: 1792; 55.6% identity (77.9% similar) in 480 aa overlap (4-482:3-479) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MATAERRALGIGFQWLSLATLVLICAGQGGR-REDGGPACYGGFDLYFILDKSGSVLHHW ::: .:: . .:. .: :: : . :.: .:::::.::::::: ..: CCDS47 MVAERSPARSPGSWLFPGLWLLVLSGPGGLLRAQEQPSCRRAFDLYFVLDKSGSVANNW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 NEIYYFVEQLAHKFISPQLRMSFIVFSTRGTTLMKLTEDREQIRQGLEELQKVLPGGDTY ::: ::.:::..:.::..:.::::::...: .. :: :: .: .:::.:..: : :.:: CCDS47 IEIYNFVQQLAERFVSPEMRLSFIVFSSQATIILPLTGDRGKISKGLEDLKRVSPVGETY 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 MHEGFERASEQIYYENRQGYRTASVIIALTDGELHEDLFFYSEREANRSRDLGAIVYCVG .:::.. :.::: .. : .:.:.:::::::.: . :.:.::. ::.::: ::::: CCDS47 IHEGLKLANEQI--QKAGGLKTSSIIIALTDGKLDGLVPSYAEKEAKISRSLGASVYCVG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 VKDFNETQLARIADSKDHVFPVNDGFQALQGIIHSILKKSCIEILAAEPSTICAGESFQV : ::...:: ::::::..::::. :::::.:::.::: .:: ::: .::..:.:: ::. CCDS47 VLDFEQAQLERIADSKEQVFPVKGGFQALKGIINSILAQSCTEILELQPSSVCVGEEFQI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 VVRGNGFRHARNVDRVLCSFKINDSVTLNEKPFSVEDTYLLCPAPILKEVGMKAALQVSM :. : :: . :::.. .:.. : . :: ::. . .:::::::...: ..::. CCDS47 VLSGRGFMLGSRNGSVLCTYTVNETYTTSVKPVSVQLNSMLCPAPILNKAGETLDVSVSF 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 NDGLSFISSSVIITTTHCSDGSILAIALLILFLLLALALLWWFWPLCCTVIIKEVPPPPA : : : ::.:.:.:.:.::.: :..:.:.:::...:.:::::::: :.::. ::::: CCDS47 NGGKSVISGSLIVTATECSNGIAAIIVILVLLLLLGIGLMWWFWPLCCKVVIKDPPPPPA 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 EESEEEDDDGLPKKKWPTVDASYYGGRGVGGIKRMEVRWGEKGSTEEGAKLEKAKNARVK .::... :: :::::::::::::::::::::::::::.::::::::.::::::: :: CCDS47 PAPKEEEEEPLPTKKWPTVDASYYGGRGVGGIKRMEVRWGDKGSTEEGARLEKAKNAVVK 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 MPEQEYEFPEPRNLNNNMRRPSSPRKWYSPIKGKLDALWVLLRKGYDRVSVMRPQPGDTG .::. : .:: . . :::.::::.:::::.:::. :::::.:::: :: CCDS47 IPEETEEPIRPRPPRPKPTHQPPQTKWYTPIKGRLDALWALLRRQYDRVSLMRPQEGDE- 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE1 RCINFTRVKNNQPAKYPLNNAYHTSSPPPAPIYTPPPPAPHCPPPPPSAPTPPIPSPPST :: CCDS47 VCIWECIEKELTA 480 >>CCDS68733.1 ANTXR2 gene_id:118429|Hs108|chr4 (411 aa) initn: 1627 init1: 1443 opt: 1625 Z-score: 707.4 bits: 140.3 E(32554): 4.4e-33 Smith-Waterman score: 1625; 57.8% identity (80.2% similar) in 410 aa overlap (78-487:1-408) 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 ILDKSGSVLHHWNEIYYFVEQLAHKFISPQLRMSFIVFSTRGTTLMKLTEDREQIRQGLE .:.::::::...: .. :: :: .: .::: CCDS68 MRLSFIVFSSQATIILPLTGDRGKISKGLE 10 20 30 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 ELQKVLPGGDTYMHEGFERASEQIYYENRQGYRTASVIIALTDGELHEDLFFYSEREANR .:..: : :.::.:::.. :.::: .. : .:.:.:::::::.: . :.:.::. 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