Result of FASTA (ccds) for pFN21AE2298
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2298, 424 aa
  1>>>pF1KE2298 424 - 424 aa - 424 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6114+/-0.000928; mu= 15.6937+/- 0.056
 mean_var=72.8840+/-14.187, 0's: 0 Z-trim(104.4): 44  B-trim: 52 in 1/50
 Lambda= 0.150231
 statistics sampled from 7846 (7890) to 7846 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.613), E-opt: 0.2 (0.242), width:  16
 Scan time:  2.890

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1890.1 BMP10 gene_id:27302|Hs108|chr2          ( 424) 2815 619.7 1.7e-177
CCDS73118.1 GDF2 gene_id:2658|Hs108|chr10          ( 429) 1052 237.6 1.8e-62
CCDS34926.1 GDF6 gene_id:392255|Hs108|chr8         ( 455)  443 105.6   1e-22
CCDS1701.1 GDF7 gene_id:151449|Hs108|chr2          ( 450)  433 103.4 4.5e-22
CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20           ( 396)  430 102.8 6.4e-22
CCDS9715.1 BMP4 gene_id:652|Hs108|chr14            ( 408)  411 98.6 1.1e-20
CCDS13254.1 GDF5 gene_id:8200|Hs108|chr20          ( 501)  409 98.3 1.8e-20
CCDS13455.1 BMP7 gene_id:655|Hs108|chr20           ( 431)  394 95.0 1.5e-19
CCDS4503.1 BMP6 gene_id:654|Hs108|chr6             ( 513)  384 92.8   8e-19
CCDS4958.1 BMP5 gene_id:653|Hs108|chr6             ( 454)  383 92.6 8.3e-19
CCDS437.1 BMP8A gene_id:353500|Hs108|chr1          ( 402)  368 89.3 7.2e-18
CCDS444.1 BMP8B gene_id:656|Hs108|chr1             ( 402)  363 88.2 1.5e-17
CCDS7304.1 NODAL gene_id:4838|Hs108|chr10          ( 347)  338 82.8 5.7e-16
CCDS42526.1 GDF1 gene_id:2657|Hs108|chr19          ( 372)  329 80.9 2.4e-15
CCDS8581.1 GDF3 gene_id:9573|Hs108|chr12           ( 364)  325 80.0 4.2e-15
CCDS14334.1 BMP15 gene_id:9210|Hs108|chrX          ( 392)  316 78.0 1.7e-14
CCDS8891.1 GDF11 gene_id:10220|Hs108|chr12         ( 407)  314 77.6 2.4e-14
CCDS3588.1 BMP3 gene_id:651|Hs108|chr4             ( 472)  308 76.4 6.7e-14
CCDS73117.1 GDF10 gene_id:2662|Hs108|chr10         ( 478)  308 76.4 6.8e-14
CCDS2303.1 MSTN gene_id:2660|Hs108|chr2            ( 375)  298 74.1 2.5e-13
CCDS5464.1 INHBA gene_id:3624|Hs108|chr7           ( 426)  293 73.1 5.9e-13
CCDS2132.1 INHBB gene_id:3625|Hs108|chr2           ( 407)  287 71.8 1.4e-12
CCDS8939.1 INHBE gene_id:83729|Hs108|chr12         ( 350)  282 70.7 2.6e-12


>>CCDS1890.1 BMP10 gene_id:27302|Hs108|chr2               (424 aa)
 initn: 2815 init1: 2815 opt: 2815  Z-score: 3300.2  bits: 619.7 E(32554): 1.7e-177
Smith-Waterman score: 2815; 100.0% identity (100.0% similar) in 424 aa overlap (1-424:1-424)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MGSLVLTLCALFCLAAYLVSGSPIMNLEQSPLEEDMSLFGDVFSEQDGVDFNTLLQSMKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 MGSLVLTLCALFCLAAYLVSGSPIMNLEQSPLEEDMSLFGDVFSEQDGVDFNTLLQSMKD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 EFLKTLNLSDIPTQDSAKVDPPEYMLELYNKFATDRTSMPSANIIRSFKNEDLFSQPVSF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 EFLKTLNLSDIPTQDSAKVDPPEYMLELYNKFATDRTSMPSANIIRSFKNEDLFSQPVSF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 NGLRKYPLLFNVSIPHHEEVIMAELRLYTLVQRDRMIYDGVDRKITIFEVLESKGDNEGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 NGLRKYPLLFNVSIPHHEEVIMAELRLYTLVQRDRMIYDGVDRKITIFEVLESKGDNEGE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 RNMLVLVSGEIYGTNSEWETFDVTDAIRRWQKSGSSTHQLEVHIESKHDEAEDASSGRLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 RNMLVLVSGEIYGTNSEWETFDVTDAIRRWQKSGSSTHQLEVHIESKHDEAEDASSGRLE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 IDTSAQNKHNPLLIVFSDDQSSDKERKEELNEMISHEQLPELDNLGLDSFSSGPGEEALL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 IDTSAQNKHNPLLIVFSDDQSSDKERKEELNEMISHEQLPELDNLGLDSFSSGPGEEALL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 QMRSNIIYDSTARIRRNAKGNYCKRTPLYIDFKEIGWDSWIIAPPGYEAYECRGVCNYPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 QMRSNIIYDSTARIRRNAKGNYCKRTPLYIDFKEIGWDSWIIAPPGYEAYECRGVCNYPL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 AEHLTPTKHAIIQALVHLKNSQKASKACCVPTKLEPISILYLDKGVVTYKFKYEGMAVSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 AEHLTPTKHAIIQALVHLKNSQKASKACCVPTKLEPISILYLDKGVVTYKFKYEGMAVSE
              370       380       390       400       410       420

           
pF1KE2 CGCR
       ::::
CCDS18 CGCR
           

>>CCDS73118.1 GDF2 gene_id:2658|Hs108|chr10               (429 aa)
 initn: 821 init1: 540 opt: 1052  Z-score: 1235.1  bits: 237.6 E(32554): 1.8e-62
Smith-Waterman score: 1052; 41.9% identity (71.6% similar) in 437 aa overlap (2-424:4-429)

                 10        20        30            40        50    
pF1KE2   MGSLVLTLCALFCLAAYLVSGSPIMNLEQSPL----EEDMSLFGDVFSEQDGVDFNTL
          :.: ..:  :. : :  ..:.:...  ..      .  ... :  . :.   ... .
CCDS73 MCPGALWVAL-PLLSLLAGSLQGKPLQSWGRGSAGGNAHSPLGVPGGGLPEHT-FNLKMF
               10         20        30        40        50         

           60        70        80        90       100       110    
pF1KE2 LQSMKDEFLKTLNLSDIPTQDSAKVDPPEYMLELYNKFATDRTSMPSANIIRSFKNEDLF
       :...: .::..:::: .:.::...:.::.::..:::....:... :..::.:::. :: .
CCDS73 LENVKVDFLRSLNLSGVPSQDKTRVEPPQYMIDLYNRYTSDKSTTPASNIVRSFSMEDAI
       60        70        80        90       100       110        

          120        130       140       150       160       170   
pF1KE2 SQPVSFN-GLRKYPLLFNVSIPHHEEVIMAELRLYTLVQRDRMIYDGVDRKITIFEVLES
       :  .. .  ..:. ::::.:::.::..  ::::::.  :        .  ...:..::..
CCDS73 SITATEDFPFQKHILLFNISIPRHEQITRAELRLYVSCQNHVDPSHDLKGSVVIYDVLDG
      120       130       140       150       160       170        

             180       190       200       210         220         
pF1KE2 KG--DNEGERNMLVLVSGEIYGTNSEWETFDVTDAIRRWQKSGS--STHQLEVHIESKHD
           :.  : . . ::: .:   .  :::..:..:..:: .: :  : ..::: .:: : 
CCDS73 TDAWDSATETKTF-LVSQDIQ--DEGWETLEVSSAVKRWVRSDSTKSKNKLEVTVES-HR
      180       190          200       210       220       230     

     230       240       250       260        270       280        
pF1KE2 EAEDASSGRLEIDTSAQNKHNPLLIVFSDDQSSD-KERKEELNEMISHEQLPELDNLGLD
       .. :.    :.:..   ... :...:::.:.::  :: . :: :::::::   : .:. :
CCDS73 KGCDT----LDISVPPGSRNLPFFVVFSNDHSSGTKETRLELREMISHEQESVLKKLSKD
              240       250       260       270       280       290

      290       300        310         320       330       340     
pF1KE2 SFSSGPGEEALLQ-MRSNIIYDST-ARIRRNA-KGNYCKRTPLYIDFKEIGWDSWIIAPP
       . :.  :: .  .   ...   :: :: .:.:  :..:..: : ..:..:::::::::: 
CCDS73 G-STEAGESSHEEDTDGHVAAGSTLARRKRSAGAGSHCQKTSLRVNFEDIGWDSWIIAPK
               300       310       320       330       340         

         350       360       370       380       390       400     
pF1KE2 GYEAYECRGVCNYPLAEHLTPTKHAIIQALVHLKNSQKASKACCVPTKLEPISILYLDK-
        ::::::.: : .:::. .:::::::.:.:::::   :..::::::::: :::.:: :  
CCDS73 EYEAYECKGGCFFPLADDVTPTKHAIVQTLVHLKFPTKVGKACCVPTKLSPISVLYKDDM
     350       360       370       380       390       400         

          410       420    
pF1KE2 GVVTYKFKYEGMAVSECGCR
       :: : :..::::.:.:::::
CCDS73 GVPTLKYHYEGMSVAECGCR
     410       420         

>>CCDS34926.1 GDF6 gene_id:392255|Hs108|chr8              (455 aa)
 initn: 588 init1: 433 opt: 443  Z-score: 521.3  bits: 105.6 E(32554): 1e-22
Smith-Waterman score: 510; 32.6% identity (52.7% similar) in 389 aa overlap (72-424:85-455)

              50        60        70        80        90           
pF1KE2 VFSEQDGVDFNTLLQSMKDEFLKTLNLSDIPTQDSAKVDPPEYMLELYNKF---------
                                     :   . .: : :::: .:  .         
CCDS34 PRDSDAGREGQEPQPRPQDEPRAQQPRAQEPPGRGPRVVPHEYMLSIYRTYSIAEKLGIN
           60        70        80        90       100       110    

            100       110       120       130        140       150 
pF1KE2 ATDRTSMPSANIIRSFKNEDLFSQPVSFNGLRKYPLLFNVSI-PHHEEVIMAELRLYTLV
       :.   :  ::: : :: .. :  . .: . ::.   ::.::.   .::.. :::::.  .
CCDS34 ASFFQSSKSANTITSFVDRGL--DDLSHTPLRRQKYLFDVSMLSDKEELVGAELRLFRQA
          120       130         140       150       160       170  

             160       170       180       190        200       210
pF1KE2 QRDRMIYDGVDRKITIFEVLESKGDNEGERNMLVLVSGEIYGTNSE-WETFDVTDAIRRW
               .   .. .:  :           .:   . .  :.    ::.::: ...:. 
CCDS34 PSAPWGPPAGPLHVQLFPCLSPL--------LLDARTLDPQGAPPAGWEVFDVWQGLRHQ
            180       190               200       210       220    

              220       230       240                  250         
pF1KE2 QKSGSSTHQLEVHIESKHDEAEDASSGRLEI---DTSAQN--------KHNPLLIVFSDD
         .    .   .  :    :::  . :  .    :  . .        ..  ::.::. .
CCDS34 PWKQLCLELRAAWGELDAGEAEARARGPQQPPPPDLRSLGFGRRVRPPQERALLVVFTRS
          230       240       250       260       270       280    

     260       270       280       290               300           
pF1KE2 QSSDKERKEELNEMISHEQLPELDNLGLDSFSSG--------PGEEALL----QMRSNII
       :     ::. . ::  .:::   .  :  . . :        :  .  :    . :    
CCDS34 Q-----RKNLFAEM--REQLGSAEAAGPGAGAEGSWPPPSGAPDARPWLPSPGRRRRRTA
               290         300       310       320       330       

       310       320        330       340       350       360      
pF1KE2 YDSTARIRRNAKGNY-CKRTPLYIDFKEIGWDSWIIAPPGYEAYECRGVCNYPLAEHLTP
       . :    :.. :.   :.. ::...:::.:::.:::::  ::::.:.:::..::  :: :
CCDS34 FASRHGKRHGKKSRLRCSKKPLHVNFKELGWDDWIIAPLEYEAYHCEGVCDFPLRSHLEP
       340       350       360       370       380       390       

        370       380       390       400        410       420    
pF1KE2 TKHAIIQALVHLKNSQKASKACCVPTKLEPISILYLDKGV-VTYKFKYEGMAVSECGCR
       :.:::::.:..  .  ..  .::::::: ::::::.: :  :.:: .:: :.:  ::::
CCDS34 TNHAIIQTLMNSMDPGSTPPSCCVPTKLTPISILYIDAGNNVVYK-QYEDMVVESCGCR
       400       410       420       430       440        450     

>>CCDS1701.1 GDF7 gene_id:151449|Hs108|chr2               (450 aa)
 initn: 508 init1: 428 opt: 433  Z-score: 509.7  bits: 103.4 E(32554): 4.5e-22
Smith-Waterman score: 473; 29.4% identity (56.2% similar) in 377 aa overlap (76-424:83-450)

          50        60        70        80        90               
pF1KE2 QDGVDFNTLLQSMKDEFLKTLNLSDIPTQDSAKVDPPEYMLELYNKFA---------TDR
                                     ...: : ..:. :: ..:         .. 
CCDS17 LAQAAGAAAVPAAAVPRARAARRAAGSGFRNGSVVPHHFMMSLYRSLAGRAPAGAAAVSA
             60        70        80        90       100       110  

        100       110       120       130        140       150     
pF1KE2 TSMPSANIIRSFKNEDLFSQPVSFNGLRKYPLLFNVS-IPHHEEVIMAELRLYTLVQRDR
       ..   :. : .: ..   .. .. .:     .::.:: .   .::. ::::.  : . . 
CCDS17 SGHGRADTITGFTDQATQDESAAETG---QSFLFDVSSLNDADEVVGAELRV--LRRGSP
            120       130          140       150       160         

         160       170       180       190       200       210     
pF1KE2 MIYDGVDRKITIFEVLESKGDNEGERNMLVLVSGEIYGTNSEWETFDVTDAIRRWQKSGS
           :   .  .. .    :  .. : .   ..  . :  ..::.:::.::.:: ..   
CCDS17 ESGPGSWTSPPLLLLSTCPGAARAPRLLYSRAAEPLVG--QRWEAFDVADAMRRHRREPR
       170       180       190       200         210       220     

         220       230            240       250       260          
pF1KE2 STHQLEVHIESKHDEAEDASSGR-----LEIDTSAQNKHNPLLIVFSDDQSSDKERKE--
         . . . ...    . .  . :          ..  ..  .:.: :  : ...  .:  
CCDS17 PPRAFCLLLRAVAGPVPSPLALRRLGFGWPGGGGSAAEERAVLVVSSRTQRKESLFREIR
         230       240       250       260       270       280     

          270       280       290            300       310         
pF1KE2 ----ELNEMISHEQLPELDNLGLDSFSSGPG-----EEALLQMRSNIIYDSTARIRRNAK
            :.  .. : ::.  . :  :  .  :     . ::   :.     . :   .. .
CCDS17 AQARALGAALASEPLPD-PGTGTASPRAVIGGRRRRRTALAGTRTAQGSGGGAGRGHGRR
         290       300        310       320       330       340    

     320        330       340       350       360       370        
pF1KE2 G-NYCKRTPLYIDFKEIGWDSWIIAPPGYEAYECRGVCNYPLAEHLTPTKHAIIQALVHL
       : . :.: ::..::::.:::.:::::  ::::.:.:.:..::  :: ::.:::::.:.. 
CCDS17 GRSRCSRKPLHVDFKELGWDDWIIAPLDYEAYHCEGLCDFPLRSHLEPTNHAIIQTLLNS
          350       360       370       380       390       400    

      380       390       400        410       420    
pF1KE2 KNSQKASKACCVPTKLEPISILYLDKGV-VTYKFKYEGMAVSECGCR
          . :  .::::..: ::::::.: .  :.:: .:: :.:  ::::
CCDS17 MAPDAAPASCCVPARLSPISILYIDAANNVVYK-QYEDMVVEACGCR
          410       420       430        440       450

>>CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20                (396 aa)
 initn: 511 init1: 294 opt: 430  Z-score: 507.0  bits: 102.8 E(32554): 6.4e-22
Smith-Waterman score: 607; 31.7% identity (59.8% similar) in 391 aa overlap (52-424:47-396)

              30        40        50        60        70        80 
pF1KE2 SPIMNLEQSPLEEDMSLFGDVFSEQDGVDFNTLLQSMKDEFLKTLNLSDIPTQDSAKVDP
                                     . .:. .. ..:. ..:.. :: .   : :
CCDS13 LLGGAAGLVPELGRRKFAAASSGRPSSQPSDEVLSEFELRLLSMFGLKQRPTPSRDAVVP
         20        30        40        50        60        70      

              90                 100       110       120       130 
pF1KE2 PEYMLELYNKF-------ATDRT---SMPSANIIRSFKNEDLFSQPVSFNGLRKYPLLFN
       : :::.:: .        : :.    .   :: .:::..:. . .    .:     ..::
CCDS13 P-YMLDLYRRHSGQPGSPAPDHRLERAASRANTVRSFHHEESLEELPETSGKTTRRFFFN
          80        90       100       110       120       130     

              140       150       160        170       180         
pF1KE2 VS-IPHHEEVIMAELRLYTLVQRDRMIYDG-VDRKITIFEVLESKGDNEGERNMLVLVSG
       .: :: .: .  :::...   ..: .  ..   ..:.:.:...    :       .: . 
CCDS13 LSSIPTEEFITSAELQVFREQMQDALGNNSSFHHRINIYEIIKPATANSKFPVTRLLDTR
         140       150       160       170       180       190     

     190       200       210       220       230       240         
pF1KE2 EIYGTNSEWETFDVTDAIRRWQKSGSSTHQLEVHIESKHDEAEDASSGRLEIDTSA-QNK
        .  . :.::.:::: :. ::  .: ..: . :.. .. .: . .:. ...:. :  :..
CCDS13 LVNQNASRWESFDVTPAVMRWTAQGHANHGFVVEV-AHLEEKQGVSKRHVRISRSLHQDE
         200       210       220       230        240       250    

      250            260       270       280       290       300   
pF1KE2 HN-----PLLIVFSDDQSSDKERKEELNEMISHEQLPELDNLGLDSFSSGPGEEALLQMR
       :.     :::..:. : ..   .:.: ... .:.:                         
CCDS13 HSWSQIRPLLVTFGHDGKGHPLHKRE-KRQAKHKQ-------------------------
          260       270       280                                  

           310       320       330       340       350       360   
pF1KE2 SNIIYDSTARIRRNAKGNYCKRTPLYIDFKEIGWDSWIIAPPGYEAYECRGVCNYPLAEH
                  :.  :.. ::: :::.::...::..::.:::::.:. :.: : .:::.:
CCDS13 -----------RKRLKSS-CKRHPLYVDFSDVGWNDWIVAPPGYHAFYCHGECPFPLADH
                 290        300       310       320       330      

           370       380       390       400       410       420   
pF1KE2 LTPTKHAIIQALVHLKNSQKASKACCVPTKLEPISILYLDKGVVTYKFKYEGMAVSECGC
       :. :.:::.:.::.  :: :  :::::::.:  ::.::::..  .   .:. :.:  :::
CCDS13 LNSTNHAIVQTLVNSVNS-KIPKACCVPTELSAISMLYLDENEKVVLKNYQDMVVEGCGC
        340       350        360       370       380       390     

        
pF1KE2 R
       :
CCDS13 R
        

>>CCDS9715.1 BMP4 gene_id:652|Hs108|chr14                 (408 aa)
 initn: 536 init1: 286 opt: 411  Z-score: 484.6  bits: 98.6 E(32554): 1.1e-20
Smith-Waterman score: 537; 31.6% identity (57.3% similar) in 393 aa overlap (54-424:53-408)

            30        40        50        60        70        80   
pF1KE2 IMNLEQSPLEEDMSLFGDVFSEQDGVDFNTLLQSMKDEFLKTLNLSDIPTQDSAKVDPPE
                                     ::....  .:. ..:   : : : ..  :.
CCDS97 HASLIPETGKKKVAEIQGHAGGRRSGQSHELLRDFEATLLQMFGLRRRP-QPSKSAVIPD
             30        40        50        60        70         80 

                        90       100         110       120         
pF1KE2 YMLELY------------NKFATDRTSMPS--ANIIRSFKNEDLFSQPVSFNGLRKYPLL
       :: .::            .. . .    :.  :: .:::..:. . .  . .    . .:
CCDS97 YMRDLYRLQSGEEEEEQIHSTGLEYPERPASRANTVRSFHHEEHLENIPGTSENSAFRFL
              90       100       110       120       130       140 

     130        140       150       160            170        180  
pF1KE2 FNVS-IPHHEEVIMAELRLYTLVQRDRMIYDGVD-----RKITIFEVLESKGDN-EGERN
       ::.: ::..: .  :::::.    :.. . .: :     ..:.:.::..  ..   :.  
CCDS97 FNLSSIPENEVISSAELRLF----REQ-VDQGPDWERGFHRINIYEVMKPPAEVVPGHLI
             150       160            170       180       190      

            190       200       210       220       230       240  
pF1KE2 MLVLVSGEIYGTNSEWETFDVTDAIRRWQKSGSSTHQLEVHIESKHDEAEDASSGRLEID
         .: .  .. . ..::::::. :. :: .  . .. : ...   :.             
CCDS97 TRLLDTRLVHHNVTRWETFDVSPAVLRWTREKQPNYGLAIEVTHLHQT------------
        200       210       220       230       240                

            250       260       270        280       290       300 
pF1KE2 TSAQNKHNPLLIVFSDDQSSDKERKEELNEMISHEQL-PELDNLGLDSFSSGPGEEALLQ
        . :..:  . :  :  :.:            .  :: : : ..: :    : :. :: .
CCDS97 RTHQGQH--VRISRSLPQGSG-----------NWAQLRPLLVTFGHD----GRGH-ALTR
          250         260                  270           280       

             310       320       330       340       350       360 
pF1KE2 MRSNIIYDSTARIRRNAKGNYCKRTPLYIDFKEIGWDSWIIAPPGYEAYECRGVCNYPLA
        :      .    :   :.. :.:  ::.::...::..::.:::::.:. :.: : .:::
CCDS97 RRRAKRSPKHHSQRARKKNKNCRRHSLYVDFSDVGWNDWIVAPPGYQAFYCHGDCPFPLA
        290       300       310       320       330       340      

             370       380       390       400       410       420 
pF1KE2 EHLTPTKHAIIQALVHLKNSQKASKACCVPTKLEPISILYLDKGVVTYKFKYEGMAVSEC
       .::. :.:::.:.::.  ::.   :::::::.:  ::.::::.   .   .:. :.:  :
CCDS97 DHLNSTNHAIVQTLVNSVNSS-IPKACCVPTELSAISMLYLDEYDKVVLKNYQEMVVEGC
        350       360        370       380       390       400     

          
pF1KE2 GCR
       :::
CCDS97 GCR
          

>>CCDS13254.1 GDF5 gene_id:8200|Hs108|chr20               (501 aa)
 initn: 511 init1: 400 opt: 409  Z-score: 480.9  bits: 98.3 E(32554): 1.8e-20
Smith-Waterman score: 483; 32.8% identity (59.0% similar) in 363 aa overlap (79-424:167-501)

       50        60        70        80        90        100       
pF1KE2 VDFNTLLQSMKDEFLKTLNLSDIPTQDSAKVDPPEYMLELYNKFA-TDRTSMPS------
                                     . : :::: ::  .. .:: .  :      
CCDS13 AGSVPSSFLLKKAREPGPPREPKEPFRPPPITPHEYMLSLYRTLSDADRKGGNSSVKLEA
        140       150       160       170       180       190      

                 110       120       130       140       150       
pF1KE2 --ANIIRSF--KNEDLFSQPVSFNGLRKYPLLFNVSIPHHEEVIMAELRLYTLVQRD--R
         :: : ::  :..:    ::    .::   .:..:  ... .. ::::.      :  .
CCDS13 GLANTITSFIDKGQDD-RGPV----VRKQRYVFDISALEKDGLLGAELRILRKKPSDTAK
        200       210            220       230       240       250 

         160       170       180       190        200       210    
pF1KE2 MIYDGVDRKITIFEVLESKGDNEGERNMLVLVSGEIYGTN-SEWETFDVTDAIRRWQKSG
           :  :       :. ..   :..   .:    . : . : ::.::.   .: ...:.
CCDS13 PAAPGGGRAAQ----LKLSSCPSGRQPAALLDVRSVPGLDGSGWEVFDIWKLFRNFKNSA
             260           270       280       290       300       

          220        230       240       250        260       270  
pF1KE2 SSTHQLEVHIES-KHDEAEDASSGRLEIDTSAQNKHNP-LLIVFSDDQSSDKERKEELNE
           :: ...:. .. .: :  .  : .: .:.. :.  :..::.      :.:   .::
CCDS13 ----QLCLELEAWERGRAVDLRG--LGFDRAARQVHEKALFLVFG----RTKKRDLFFNE
           310       320         330       340           350       

            280       290       300       310       320       330  
pF1KE2 MISHEQLPELDNLGLDSFSSGPGEEALLQMRSNIIYDSTARIRRNAKGNYCKRTPLYIDF
        :. ..  .  ..    ::.   ..: :  :..       :  .: :.  :.:  :...:
CCDS13 -IKARSGQDDKTVYEYLFSQRRKRRAPLATRQG------KRPSKNLKAR-CSRKALHVNF
        360       370       380             390        400         

            340       350       360       370       380       390  
pF1KE2 KEIGWDSWIIAPPGYEAYECRGVCNYPLAEHLTPTKHAIIQALVHLKNSQKASKACCVPT
       :..:::.:::::  :::..:.:.:..::  :: ::.::.::.:..  . ...  .:::::
CCDS13 KDMGWDDWIIAPLEYEAFHCEGLCEFPLRSHLEPTNHAVIQTLMNSMDPESTPPTCCVPT
     410       420       430       440       450       460         

            400        410       420    
pF1KE2 KLEPISILYLDKGV-VTYKFKYEGMAVSECGCR
       .: :::::..:..  :.:: .:: :.:  ::::
CCDS13 RLSPISILFIDSANNVVYK-QYEDMVVESCGCR
     470       480        490       500 

>>CCDS13455.1 BMP7 gene_id:655|Hs108|chr20                (431 aa)
 initn: 408 init1: 382 opt: 394  Z-score: 464.3  bits: 95.0 E(32554): 1.5e-19
Smith-Waterman score: 499; 29.0% identity (59.8% similar) in 331 aa overlap (95-423:123-430)

           70        80        90       100       110       120    
pF1KE2 TLNLSDIPTQDSAKVDPPEYMLELYNKFATDRTSMPSANIIRSFKNEDLFSQPVSFNGLR
                                     :   . .:... :: :    ..       .
CCDS13 EEGGGPGGQGFSYPYKAVFSTQGPPLASLQDSHFLTDADMVMSFVNLVEHDKEFFHPRYH
            100       110       120       130       140       150  

          130        140       150       160       170        180  
pF1KE2 KYPLLFNVS-IPHHEEVIMAELRLYTLVQRDRMIYDGVDRKITIFEVLESKGDNEG-ERN
       .  . :..: ::. : :  ::.:.:    :.:  .:.   .:....::.   .. : : .
CCDS13 HREFRFDLSKIPEGEAVTAAEFRIYKDYIRER--FDNETFRISVYQVLQ---EHLGRESD
            160       170       180         190          200       

            190       200       210       220       230       240  
pF1KE2 MLVLVSGEIYGTNSEWETFDVTDAIRRWQKSGSSTHQLEVHIESKHDEAEDASSGRLEID
       ...: :  .....  : .::.: .  .:  .   .  :.. .:.   .. . . . :   
CCDS13 LFLLDSRTLWASEEGWLVFDITATSNHWVVNPRHNLGLQLSVETLDGQSINPKLAGLIGR
       210       220       230       240       250       260       

            250       260       270       280       290       300  
pF1KE2 TSAQNKHNPLLIVFSDDQSSDKERKEELNEMISHEQLPELDNLGLDSFSSGPGEEALLQM
        . :::. :....:       :  . ..  . :  .  . .:      :. : ..  :.:
CCDS13 HGPQNKQ-PFMVAFF------KATEVHFRSIRSTGSKQRSQN-----RSKTPKNQEALRM
       270        280             290       300            310     

            310       320       330       340       350       360  
pF1KE2 RSNIIYDSTARIRRNAKGNYCKRTPLYIDFKEIGWDSWIIAPPGYEAYECRGVCNYPLAE
        .:.  .:..  :.      ::.  ::..:...::..::::: :: :: :.: : .::  
CCDS13 -ANVAENSSSDQRQA-----CKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAYYCEGECAFPLNS
          320            330       340       350       360         

            370       380       390       400       410       420  
pF1KE2 HLTPTKHAIIQALVHLKNSQKASKACCVPTKLEPISILYLDKGVVTYKFKYEGMAVSECG
       ... :.:::.:.:::. : . . : ::.::.:. ::.::.: .  .   ::..:.:  ::
CCDS13 YMNATNHAIVQTLVHFINPETVPKPCCAPTQLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRACG
     370       380       390       400       410       420         

         
pF1KE2 CR
       : 
CCDS13 CH
     430 

>>CCDS4503.1 BMP6 gene_id:654|Hs108|chr6                  (513 aa)
 initn: 413 init1: 384 opt: 384  Z-score: 451.4  bits: 92.8 E(32554): 8e-19
Smith-Waterman score: 440; 26.9% identity (58.4% similar) in 334 aa overlap (93-423:203-512)

             70        80        90       100       110       120  
pF1KE2 LKTLNLSDIPTQDSAKVDPPEYMLELYNKFATDRTSMPSANIIRSFKNEDLFSQPVSFNG
                                     : : . . .:... :: :   ...  :   
CCDS45 QPPPGAAHPLNRKSLLAPGSGSGGASPLTSAQDSAFLNDADMVMSFVNLVEYDKEFSPRQ
            180       190       200       210       220       230  

            130        140       150         160       170         
pF1KE2 LRKYPLLFNVS-IPHHEEVIMAELRLYTLVQRDRMI--YDGVDRKITIFEVLESKGDNEG
        ..  . ::.: ::. : :  ::.:.:    .: ..  . .    :.:..::. .   ..
CCDS45 RHHKEFKFNLSQIPEGEVVTAAEFRIY----KDCVMGSFKNQTFLISIYQVLQEHQHRDS
            240       250           260       270       280        

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE2 ERNMLVLVSGEIYGTNSEWETFDVTDAIRRWQKSGSSTHQLEVHIESKHDEAEDASSGRL
         ....: .  .....  :  ::.: .   :  . . .  :.. . ..        .. :
CCDS45 --DLFLLDTRVVWASEEGWLEFDITATSNLWVVTPQHNMGLQLSVVTRDGVHVHPRAAGL
        290       300       310       320       330       340      

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE2 EIDTSAQNKHNPLLIVFSDDQSSDKERKEELNEMISHEQLPELDNLGLDSFSSGPGEEAL
        .  ..   ..:....:     . .: . . ..  : ..  .  : . .:       . .
CCDS45 -VGRDGPYDKQPFMVAFF----KVSEVHVRTTRSASSRRRQQSRNRSTQS-------QDV
         350       360           370       380       390           

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE2 LQMRSNIIYDSTARIRRNAKGNYCKRTPLYIDFKEIGWDSWIIAPPGYEAYECRGVCNYP
        .. :   :.:.    ..:    :..  ::..:...::..::::: :: :  : : :..:
CCDS45 ARVSSASDYNSSEL--KTA----CRKHELYVSFQDLGWQDWIIAPKGYAANYCDGECSFP
          400         410           420       430       440        

     360       370       380       390       400       410         
pF1KE2 LAEHLTPTKHAIIQALVHLKNSQKASKACCVPTKLEPISILYLDKGVVTYKFKYEGMAVS
       :  :.. :.:::.:.:::: : . . : ::.::::. ::.::.: .  .   ::..:.: 
CCDS45 LNAHMNATNHAIVQTLVHLMNPEYVPKPCCAPTKLNAISVLYFDDNSNVILKKYRNMVVR
      450       460       470       480       490       500        

     420    
pF1KE2 ECGCR
        ::: 
CCDS45 ACGCH
      510   

>>CCDS4958.1 BMP5 gene_id:653|Hs108|chr6                  (454 aa)
 initn: 451 init1: 383 opt: 383  Z-score: 451.1  bits: 92.6 E(32554): 8.3e-19
Smith-Waterman score: 480; 26.8% identity (60.9% similar) in 340 aa overlap (95-423:147-453)

           70        80        90       100       110       120    
pF1KE2 TLNLSDIPTQDSAKVDPPEYMLELYNKFATDRTSMPSANIIRSFKNEDLFSQPVSFNGLR
                                     : . . .:... :: :  :  .  .:.  :
CCDS49 PASPNGYPRRIQLSRTTPLTTQSPPLASLHDTNFLNDADMVMSFVN--LVERDKDFSHQR
        120       130       140       150       160         170    

            130        140       150       160       170       180 
pF1KE2 KY--PLLFNVS-IPHHEEVIMAELRLYTLVQRDRMIYDGVDRKITIFEVLESKGDNEGER
       ..   . :... ::: : :  ::.:.:   . .:  ...   ::.:.....   . ..  
CCDS49 RHYKEFRFDLTQIPHGEAVTAAEFRIYKDRSNNR--FENETIKISIYQIIKEYTNRDA--
          180       190       200         210       220       230  

             190       200       210       220       230       240 
pF1KE2 NMLVLVSGEIYGTNSEWETFDVTDAIRRWQKSGSSTHQLEVHIESKHDEAEDASSGRLEI
       ....: . .  . .  : .::.: .  .:  . ...  :..  :.   .. ...:. :  
CCDS49 DLFLLDTRKAQALDVGWLVFDITVTSNHWVINPQNNLGLQLCAETGDGRSINVKSAGLVG
              240       250       260       270       280       290

             250               260       270       280       290   
pF1KE2 DTSAQNKHNPLLIVF--------SDDQSSDKERKEELNEMISHEQLPELDNLGLDSFSSG
         . :.:. :....:         . ....:..... :.  ::..  .....:  .....
CCDS49 RQGPQSKQ-PFMVAFFKASEVLLRSVRAANKRKNQNRNKSSSHQDSSRMSSVG--DYNTS
               300       310       320       330       340         

           300       310       320       330       340       350   
pF1KE2 PGEEALLQMRSNIIYDSTARIRRNAKGNYCKRTPLYIDFKEIGWDSWIIAPPGYEAYECR
         ..:                        ::.  ::..:...::..::::: :: :. : 
CCDS49 EQKQA------------------------CKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAFYCD
       350                               360       370       380   

           360       370       380       390       400       410   
pF1KE2 GVCNYPLAEHLTPTKHAIIQALVHLKNSQKASKACCVPTKLEPISILYLDKGVVTYKFKY
       : :..::  :.. :.:::.:.::::   ... : ::.::::. ::.::.: .  .   ::
CCDS49 GECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMFPDHVPKPCCAPTKLNAISVLYFDDSSNVILKKY
           390       400       410       420       430       440   

           420    
pF1KE2 EGMAVSECGCR
       ..:.:  ::: 
CCDS49 RNMVVRSCGCH
           450    




424 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sun Nov  6 18:27:00 2016 done: Sun Nov  6 18:27:01 2016
 Total Scan time:  2.890 Total Display time:  0.070

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com