FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9966, 695 aa 1>>>pF1KB9966 695 - 695 aa - 695 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0814+/-0.00176; mu= 5.9171+/- 0.101 mean_var=310.4809+/-95.651, 0's: 0 Z-trim(101.5): 183 B-trim: 414 in 1/49 Lambda= 0.072787 statistics sampled from 6390 (6551) to 6390 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.529), E-opt: 0.2 (0.201), width: 16 Scan time: 3.590 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1843.1 FSHR gene_id:2492|Hs108|chr2 ( 695) 4582 497.0 3.8e-140 CCDS1844.2 FSHR gene_id:2492|Hs108|chr2 ( 669) 3540 387.6 3.2e-107 CCDS1842.1 LHCGR gene_id:3973|Hs108|chr2 ( 699) 2284 255.7 1.7e-67 CCDS9872.1 TSHR gene_id:7253|Hs108|chr14 ( 764) 1561 179.8 1.3e-44 CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11 ( 951) 652 84.5 7.8e-16 CCDS61194.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 883) 577 76.6 1.8e-13 CCDS61195.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 835) 576 76.4 1.8e-13 CCDS9000.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 907) 576 76.5 1.9e-13 CCDS30972.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 828) 552 73.9 1e-12 CCDS1424.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 915) 552 74.0 1.1e-12 CCDS30971.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 967) 552 74.0 1.1e-12 >>CCDS1843.1 FSHR gene_id:2492|Hs108|chr2 (695 aa) initn: 4582 init1: 4582 opt: 4582 Z-score: 2629.5 bits: 497.0 E(32554): 3.8e-140 Smith-Waterman score: 4582; 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CCDS18 MKQRFSALQLLKLLLLLQPPLPRALREALCPEPCN-----CVPDGALRCPG--PTAGLTR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB9 LRFVLTKLRVIQKGAFSGFGDLEKIEISQNDVLEVIEADVFSNLPKLHEIRIEKANNLLY : .. ..:: . :: :.... :::::: : :: :::..:.:: .: :: :....:: : CCDS18 LSLAYLPVKVIPSQAFRGLNEVIKIEISQIDSLERIEANAFDNLLNLSEILIQNTKNLRY 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KB9 INPEAFQNLPNLQYLLISNTGIKHLPDVHKIHSLQK-VLLDIQDNINIHTIERNSFVGLS :.: :: ::: :.:: : ::::...::: :. : .. .:.: ::..: :: :.: :.. CCDS18 IEPGAFINLPRLKYLSICNTGIRKFPDVTKVFSSESNFILEICDNLHITTIPGNAFQGMN 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB9 FESVILWLNKNGIQEIHNCAFNGTQLDELNLSDNNNLEELPNDVFHGASGPVILDISRTR ::: : : ::..:... ::::: : :.:..: .::.. : .:.::.:: :::: :. CCDS18 NESVTLKLYGNGFEEVQSHAFNGTTLTSLELKENVHLEKMHNGAFRGATGPKTLDISSTK 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB9 IHSLPSYGLENLKKLRARSTYNLKKLPTLEKLVALMEASLTYPSHCCAFANWRRQISELH ...:::::::....: : :.:.:::::. : .: :.::.:::::::::: : . ... CCDS18 LQALPSYGLESIQRLIATSSYSLKKLPSRETFVNLLEATLTYPSHCCAFRNLPTKEQNFS 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB9 PICNKSILRQEVDYMTQTRGQR--SSLAEDNESSYSRGFDMTYTEFDYDLCNEVVDVTCS .... .: . . .. .. ::. ..: : :.: ..: .: . :. CCDS18 HSISENFSKQCESTVRKVNNKTLYSSMLAESELS---GWD-----YEYGFCLPKTP-RCA 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KB9 PKPDAFNPCEDIMGYNILRVLIWFISILAITGNIIVLVILTTSQYKLTVPRFLMCNLAFA :.:::::::::::::..::::::.:.:::: ::. :: .: ::.:::::::::::::.:: CCDS18 PEPDAFNPCEDIMGYDFLRVLIWLINILAIMGNMTVLFVLLTSRYKLTVPRFLMCNLSFA 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KB9 DLCIGIYLLLIASVDIHTKSQYHNYAIDWQTGAGCDAAGFFTVFASELSVYTLTAITLER :.:.:.::::::::: .::.::.:.:::::::.::..:::::::::::::::::.::::: CCDS18 DFCMGLYLLLIASVDSQTKGQYYNHAIDWQTGSGCSTAGFFTVFASELSVYTLTVITLER 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KB9 WHTITHAMQLDCKVQLRHAASVMVMGWIFAFAAALFPIFGISSYMKVSICLPMDIDSPLS :::::.:..:: :..:::: .:. ::.:. :..:. :.:.:::::::.:::... :: CCDS18 WHTITYAIHLDQKLRLRHAILIMLGGWLFSSLIAMLPLVGVSNYMKVSICFPMDVETTLS 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KB9 QLYVMSLLVLNVLAFVVICGCYIHIYLTVRNPNIVSSSSDTRIAKRMAMLIFTDFLCMAP :.:....:.:::.:: .::.:::.::..::::.......::.:::.::.:::::: :::: CCDS18 QVYILTILILNVVAFFIICACYIKIYFAVRNPELMATNKDTKIAKKMAILIFTDFTCMAP 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 pF1KB9 ISFFAISASLKVPLITVSKAKILLVLFHPINSCANPFLYAIFTKNFRRDFFILLSKCGCY ::::::::..:::::::...:.:::::.::::::::::::::::.:.::::.:::: :: CCDS18 ISFFAISAAFKVPLITVTNSKVLLVLFYPINSCANPFLYAIFTKTFQRDFFLLLSKFGCC 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 pF1KB9 EMQAQIYRTETSSTVHNTHPRNGHCSSAPRVTNGSTYILVPLSHLAQN . .:..:: . :. .... .:: .: CCDS18 KRRAELYRRKDFSA-YTSNCKNGFTGSNKPSQSTLKLSTLHCQGTALLDKTRYTEC 650 660 670 680 690 >>CCDS9872.1 TSHR gene_id:7253|Hs108|chr14 (764 aa) initn: 2216 init1: 1540 opt: 1561 Z-score: 914.6 bits: 179.8 E(32554): 1.3e-44 Smith-Waterman score: 2119; 49.1% identity (74.5% similar) in 691 aa overlap (15-655:21-707) 10 20 30 40 50 pF1KB9 MALLLVSLLAFLSLGSGCHHRICHCSN----RVFLCQESKVTEIPSDLPRNAIE : :: :.: . :: :.. . .::: :: .. CCDS98 MRPADLLQLVLLLDLPRDLGGMGCSSPPCECHQEEDFRV-TCKD--IQRIPS-LPPSTQT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB9 LRFVLTKLRVIQKGAFSGFGDLEKIEISQNDVLEVIEADVFSNLPKLHEIRIEKANNLLY :... :.::.: . :::.. .. .: .: . .:. .:. : :: :. .:.:... :: : CCDS98 LKLIETHLRTIPSHAFSNLPNISRIYVSIDVTLQQLESHSFYNLSKVTHIEIRNTRNLTY 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KB9 INPEAFQNLPNLQYLLISNTGIKHLPDVHKIHSLQKV-LLDIQDNINIHTIERNSFVGLS :.:.:...:: :..: : :::.: .::. :..: . .:.: :: . .: :.: :: CCDS98 IDPDALKELPLLKFLGIFNTGLKMFPDLTKVYSTDIFFILEITDNPYMTSIPVNAFQGLC 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB9 FESVILWLNKNGIQEIHNCAFNGTQLDELNLSDNNNLEELPNDVFHGA-SGPVILDISRT :.. : : .::. ... :::::.:: . :. :. : . .:.: :. ::: .::.:.: CCDS98 NETLTLKLYNNGFTSVQGYAFNGTKLDAVYLNKNKYLTVIDKDAFGGVYSGPSLLDVSQT 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB9 RIHSLPSYGLENLKKLRARSTYNLKKLPTLEKLVALMEASLTYPSHCCAFANWRRQISEL . .::: :::.::.: ::.:..::::: ... : .:.:.:::::::: : .. . : CCDS98 SVTALPSKGLEHLKELIARNTWTLKKLPLSLSFLHLTRADLSYPSHCCAFKNQKKIRGIL 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 pF1KB9 HPI-CNKSIL-----RQEVDYMTQTRGQ---------------RSSLAEDNESSYSR--- . . ::.: . :. :. ... : .:.. . ..... CCDS98 ESLMCNESSMQSLRQRKSVNALNSPLHQEYEENLGDSIVGYKEKSKFQDTHNNAHYYVFF 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 pF1KB9 --------GFDMTY------------TEFDYDLCNEVVDVTCSPKPDAFNPCEDIMGYNI :: . ...:: .:.. :..:.:: : ::::::::::.. CCDS98 EEQEDEIIGFGQELKNPQEETLQAFDSHYDYTICGDSEDMVCTPKSDEFNPCEDIMGYKF 360 370 380 390 400 410 370 380 390 400 410 420 pF1KB9 LRVLIWFISILAITGNIIVLVILTTSQYKLTVPRFLMCNLAFADLCIGIYLLLIASVDIH ::...::.:.::. ::..::.:: ::.:::.:::::::::::::.:.:.:::::::::.. CCDS98 LRIVVWFVSLLALLGNVFVLLILLTSHYKLNVPRFLMCNLAFADFCMGMYLLLIASVDLY 420 430 440 450 460 470 430 440 450 460 470 480 pF1KB9 TKSQYHNYAIDWQTGAGCDAAGFFTVFASELSVYTLTAITLERWHTITHAMQLDCKVQLR :.:.:.:.::::::: ::..:::::::::::::::::.::::::..:: ::.:: :..:: CCDS98 THSEYYNHAIDWQTGPGCNTAGFFTVFASELSVYTLTVITLERWYAITFAMRLDRKIRLR 480 490 500 510 520 530 490 500 510 520 530 540 pF1KB9 HAASVMVMGWIFAFAAALFPIFGISSYMKVSICLPMDIDSPLSQLYVMSLLVLNVLAFVV :: ..:: ::. : ::.:. ::::: ::::::::: ..::. :.. .:.::..:::. CCDS98 HACAIMVGGWVCCFLLALLPLVGISSYAKVSICLPMDTETPLALAYIVFVLTLNIVAFVI 540 550 560 570 580 590 550 560 570 580 590 600 pF1KB9 ICGCYIHIYLTVRNPNIVSSSSDTRIAKRMAMLIFTDFLCMAPISFFAISASLKVPLITV .: ::..::.:::::. ...::.::::::.::::::.:::::::.:.:: :. ::::: CCDS98 VCCCYVKIYITVRNPQYNPGDKDTKIAKRMAVLIFTDFICMAPISFYALSAILNKPLITV 600 610 620 630 640 650 610 620 630 640 650 660 pF1KB9 SKAKILLVLFHPINSCANPFLYAIFTKNFRRDFFILLSKCGCYEMQAQIYRTETSSTVHN :..:::::::.:.:::::::::::::: :.:: :::::: : . ::: :: CCDS98 SNSKILLVLFYPLNSCANPFLYAIFTKAFQRDVFILLSKFGICKRQAQAYRGQRVPPKNS 660 670 680 690 700 710 670 680 690 pF1KB9 THPRNGHCSSAPRVTNGSTYILVPLSHLAQN CCDS98 TDIQVQKVTHEMRQGLHNMEDVYELIENSHLTPKKQGQISEEYMQTVL 720 730 740 750 760 >>CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11 (951 aa) initn: 671 init1: 355 opt: 652 Z-score: 397.7 bits: 84.5 E(32554): 7.8e-16 Smith-Waterman score: 748; 27.8% identity (62.3% similar) in 600 aa overlap (50-640:252-815) 20 30 40 50 60 70 pF1KB9 HRICHCSNRVFLCQESKVTEIPSDLPRNAIELRFVLTKLRVIQKGAFSGFGDLEKIEISQ :: : ... :: :::.: :. :.. . CCDS31 DGLDNLETLDLNYNNLGEFPQAIKALPSLKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPLLRTIHLYD 230 240 250 260 270 280 80 90 100 110 120 130 pF1KB9 NDVLEVIEADVFSNLPKLHEIRIEKANNLLYINPEAFQNLP---NLQYLLISNTGIKHLP : : . ..: :: :: . :. :. . . : :: .:. : ...: :. .: CCDS31 NP-LSFVGNSAFHNLSDLHSLVIRGASMV-----QQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSIP 290 300 310 320 330 140 150 160 170 180 190 pF1KB9 DVHKIHSLQKVL--LDIQDNINIHTIERNSFVGL-SFESVILWLNKNGIQEIHNCAFNGT . .. . ::.: ::.. : ::. . :: : ..: . : ..: : .:.. .:.: CCDS31 N--NLCQEQKMLRTLDLSYN-NIRDLP--SFNGCHALEEISL--QRNQIYQIKEGTFQGL 340 350 360 370 380 200 210 220 230 240 250 pF1KB9 -QLDELNLSDNNNLEELPNDVFHGASGPVI-LDISRTRIHSLPSYGLENLKKLRARSTYN .: :.:: : ..:. . .: .. ::. ::.: ... :.:. ::..:..:. .... CCDS31 ISLRILDLS-RNLIHEIHSRAF-ATLGPITNLDVSFNELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFK 390 400 410 420 430 440 260 270 280 290 300 310 pF1KB9 LKKLPTLEKLVALMEASLTYPSHCCAFANWRRQISELHPICNK-SILRQEVDYMTQTRGQ ::. . . .: : :. : .:::: : :.. . : : . . : CCDS31 LKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCCAF--WG---------CDSYANLNTEDNSL-----Q 450 460 470 480 490 320 330 340 350 360 370 pF1KB9 RSSLAEDNESSYSRGFDMTYTEFDYDLCNEVVDVTCSPKPDAFNPCEDIMGYNILRVLIW :.:. :.. . . ..: : .. . .... . :.:. ::.::: ..: ..:. .: CCDS31 DHSVAQ--EKGTADAANVTST-LENEEHSQII-IHCTPSTGAFKPCEYLLGSWMIRLTVW 500 510 520 530 540 380 390 400 410 420 430 pF1KB9 FISILAITGNIIVLVILTTSQYKLTVPRFLMCNLAFADLCIGIYLLLIASVDIHTKSQYH :: ..:. :..:.. .: .: .... .. ..: .::: ... .: . ... CCDS31 FIFLVALFFNLLVILTTFASCTSLPSSKLFIGLISVSNLFMGIYTGILTFLDAVSWGRFA 550 560 570 580 590 600 440 450 460 470 480 490 pF1KB9 NYAIDWQTGAGCDAAGFFTVFASELSVYTLTAITLERWHTITHAMQLDCKVQLRHAASVM ...: :.::.:: .:::..::.:: ... : :.:: . :. . .:.. . CCDS31 EFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATVERSLSAKDIMKNGKSNHLKQFRVAA 610 620 630 640 650 660 500 510 520 530 540 550 pF1KB9 VMGWIFAFAAALFPIFGISSYMKVSICLPMDIDSPLSQLYVMSLLVLNVLAFVVICGCYI ..... : .:. ::.: . : .:::. : ....:..:: :::... : CCDS31 LLAFLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPFPTGETPSLGFTVTLVLLNSLAFLLMAVIYT 670 680 690 700 710 720 560 570 580 590 600 610 pF1KB9 HIYLTVRNPNIVSSSSDTRIAKRMAMLIFTDFLCMAPISFFAISASLKVPLITVSKAKIL ..: .... .. : .:.. . :..: ::::. . . :..::... . . :. : . CCDS31 KLYCNLEKEDL-SENSQSSMIKHVAWLIFTNCIFFCPVAFFSFAPLITAISISPEIMKSV 730 740 750 760 770 780 620 630 640 650 660 670 pF1KB9 LVLFHPINSCANPFLYAIFTKNFRRDFFILLSKCGCYEMQAQIYRTETSSTVHNTHPRNG ..: :. .: :: ::..:. .:..:. .: CCDS31 TLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKLLKRRVTKKSGSVSVSISSQGGCLEQDFYYDC 790 800 810 820 830 840 >>CCDS61194.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 (883 aa) initn: 630 init1: 424 opt: 577 Z-score: 355.5 bits: 76.6 E(32554): 1.8e-13 Smith-Waterman score: 745; 26.2% identity (59.2% similar) in 608 aa overlap (57-640:221-810) 30 40 50 60 70 80 pF1KB9 NRVFLCQESKVTEIPSDLPRNAIELRFVLTKLRVIQKGAFSGFGDLEKIEISQNDVLEVI ... . : :.:. .:: .... :.. : CCDS61 MTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLDLNYNNLDEFP 200 210 220 230 240 250 90 100 110 120 130 pF1KB9 EA-DVFSNLPKLHEIRIEKANNLLYINPEAFQNLPNLQYLLISNTG-IKHLPDVH----- : ..::: .:: : . ... :::.::.:. : ..... : ..::. CCDS61 TAIRTLSNLKELHFYD----NPIQFVGRSAFQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANL 260 270 280 290 300 140 150 160 170 180 pF1KB9 --------KIHSLQKVLLDIQDNINIHTIERNSFVGLSFESVILWLNK-----NGIQEIH .: :: ... . :... . : . : :: :.: : : ::. CCDS61 ESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLSYNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIK 310 320 330 340 350 360 190 200 210 220 230 240 pF1KB9 NCAFNGT-QLDELNLSDNNNLEELPNDVFHGASGPVILDISRTRIHSLPSYGLENLKKLR .:. .: :::. :. :: .: . . ::.: . . :.: ::..: .:. CCDS61 VDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPN-AFSTLPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLK 370 380 390 400 410 420 250 260 270 280 290 300 pF1KB9 ARSTYNLKKLPTLEKLVALMEASLTYPSHCCAFA---NWRRQISELHPICNKSILRQEVD ... :..: . :.. : . : .::::. : . .. . :.:. : CCDS61 LTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCCAFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMD----D 430 440 450 460 470 480 310 320 330 340 350 360 pF1KB9 YMTQTRGQRSSLAEDNESSYSRGFDMTYTEFDYDLCNEVVDVTCSPKPDAFNPCEDIMGY . :. . :.:. : .. .:. :: . . .: :::.: :.::: .. CCDS61 LHKKDAGMFQ--AQDE-----RDLEDFLLDFEEDL-KALHSVQCSPSPGPFKPCEHLLDG 490 500 510 520 530 370 380 390 400 410 420 pF1KB9 NILRVLIWFISILAITGNIIVLVILTTSQYKLTVPRFLMCNLAFADLCIGIYLLLIASVD ..:. .: :..::.: : .: . : .. ..:. .: ... :. ..:.:: CCDS61 WLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIAAVNMLTGVSSAVLAGVD 540 550 560 570 580 590 430 440 450 460 470 480 pF1KB9 IHTKSQYHNYAIDWQTGAGCDAAGFFTVFASELSVYTLTAITLERWHTITHAMQLDCKVQ : ... .. :..:.:: . ::...:::: ::. :: .::: .. .. ... :. CCDS61 AFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAALERGFSVKYSAKFETKAP 600 610 620 630 640 650 490 500 510 520 530 540 pF1KB9 LRHAASVMVMGWIFAFAAALFPIFGISSYMKVSICLPMDIDSPLSQLYVMSLLVLNVLAF . .... ..:.. : :..: :.: .:::. . : .. :...:..:: : : CCDS61 FSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEPSTMGYMVALILLNSLCF 660 670 680 690 700 710 550 560 570 580 590 600 pF1KB9 VVICGCYIHIYLTVRNPNIVSSSSDTRIAKRMAMLIFTDFLCMAPISFFAISASLKVPLI ... : ..: .. . .. . : ..:..:.:.::. . :..:...:. ... .: CCDS61 LMMTIAYTKLYCNLDKGDL-ENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNCPVAFLSFSSLINLTFI 720 730 740 750 760 770 610 620 630 640 650 660 pF1KB9 TVSKAKILLVLFHPINSCANPFLYAIFTKNFRRDFFILLSKCGCYEMQAQIYRTETSSTV . :..:.. :. .: ::.:: .:. .:..:. : CCDS61 SPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYVWTRSKHPSLMSINSDD 780 790 800 810 820 830 670 680 690 pF1KB9 HNTHPRNGHCSSAPRVTNGSTYILVPLSHLAQN CCDS61 VEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSSVAFVPCL 840 850 860 870 880 >>CCDS61195.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 (835 aa) initn: 630 init1: 424 opt: 576 Z-score: 355.2 bits: 76.4 E(32554): 1.8e-13 Smith-Waterman score: 738; 25.9% identity (60.8% similar) in 636 aa overlap (13-640:152-762) 10 20 30 40 pF1KB9 MALLLVSLLAFLSLGSGCHHRICHCSNRVFLCQESKVTEIPS :::. : . : . . : . ... :.:. CCDS61 QNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLHLHNNRIHSLGKKCFDGL-HSLETLDL-NYNNLDEFPT 130 140 150 160 170 50 60 70 80 90 100 pF1KB9 DLPR--NAIELRFVLTKLRVIQKGAFSGFGDLEKIEISQNDVLEVIEADVFSNLPKLHEI . : :: : ...: : . :: : .: :.. .: . . . ..:..::.:. . CCDS61 AIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPI-QFVGRSAFQHLPELRTL 180 190 200 210 220 230 110 120 130 140 150 pF1KB9 RIEKANNLLYINPEAFQNLPNLQYLLISNTGIKHLPDV--HKIHSLQKVLLDIQDNINIH .. :... . :. . . ::. : .... :. ::.. ... .:: .::.. :. .. CCDS61 TLNGASQITEF-PD-LTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQ--VLDLSYNL-LE 240 250 260 270 280 290 160 170 180 190 200 210 pF1KB9 TIERNSFVGLSFESVILWLNKNGIQEIHNCAFNGT-QLDELNLSDNNNLEELPNDVFHGA . : : ..... : .: : ::. .:. .: :::. :. :: .: CCDS61 DLPSFS-VCQKLQKIDL--RHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPN-AFSTL 300 310 320 330 340 220 230 240 250 260 270 pF1KB9 SGPVILDISRTRIHSLPSYGLENLKKLRARSTYNLKKLPTLEKLVALMEASLTYPSHCCA . . ::.: . . :.: ::..: .:. ... :..: . :.. : . : .::: CCDS61 PSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCCA 350 360 370 380 390 400 280 290 300 310 320 330 pF1KB9 FA---NWRRQISELHPICNKSILRQEVDYMTQTRGQRSSLAEDNESSYSRGFDMTYTEFD :. : . .. . :.:. : . :. . :.:. : .. .:. CCDS61 FGVCENAYKISNQWNKGDNSSMD----DLHKKDAGMFQ--AQDE-----RDLEDFLLDFE 410 420 430 440 450 340 350 360 370 380 390 pF1KB9 YDLCNEVVDVTCSPKPDAFNPCEDIMGYNILRVLIWFISILAITGNIIVLVILTTSQYKL :: . . .: :::.: :.::: .. ..:. .: :..::.: : .: . : . CCDS61 EDL-KALHSVQCSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYI 460 470 480 490 500 510 400 410 420 430 440 450 pF1KB9 TVPRFLMCNLAFADLCIGIYLLLIASVDIHTKSQYHNYAIDWQTGAGCDAAGFFTVFASE . ..:. .: ... :. ..:.:: : ... .. :..:.:: . ::...:::: CCDS61 SPIKLLIGVIAAVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASE 520 530 540 550 560 570 460 470 480 490 500 510 pF1KB9 LSVYTLTAITLERWHTITHAMQLDCKVQLRHAASVMVMGWIFAFAAALFPIFGISSYMKV ::. :: .::: .. .. ... :. . .... ..:.. : :..: :.: CCDS61 SSVFLLTLAALERGFSVKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGAS 580 590 600 610 620 630 520 530 540 550 560 570 pF1KB9 SICLPMDIDSPLSQLYVMSLLVLNVLAFVVICGCYIHIYLTVRNPNIVSSSSDTRIAKRM .:::. . : .. :...:..:: : :... : ..: .. . .. . : ..:.. CCDS61 PLCLPLPFGEPSTMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDL-ENIWDCSMVKHI 640 650 660 670 680 690 580 590 600 610 620 630 pF1KB9 AMLIFTDFLCMAPISFFAISASLKVPLITVSKAKILLVLFHPINSCANPFLYAIFTKNFR :.:.::. . :..:...:. ... .:. :..:.. :. .: ::.:: .:. .:. CCDS61 ALLLFTNCILNCPVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFK 700 710 720 730 740 750 640 650 660 670 680 690 pF1KB9 RDFFILLSKCGCYEMQAQIYRTETSSTVHNTHPRNGHCSSAPRVTNGSTYILVPLSHLAQ .:. : CCDS61 EDLVSLRKQTYVWTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSP 760 770 780 790 800 810 >>CCDS9000.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 (907 aa) initn: 630 init1: 424 opt: 576 Z-score: 354.8 bits: 76.5 E(32554): 1.9e-13 Smith-Waterman score: 738; 25.9% identity (60.8% similar) in 636 aa overlap (13-640:224-834) 10 20 30 40 pF1KB9 MALLLVSLLAFLSLGSGCHHRICHCSNRVFLCQESKVTEIPS :::. : . : . . : . ... :.:. CCDS90 ALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGL-HSLETLDL-NYNNLDEFPT 200 210 220 230 240 250 50 60 70 80 90 100 pF1KB9 DLPR--NAIELRFVLTKLRVIQKGAFSGFGDLEKIEISQNDVLEVIEADVFSNLPKLHEI . : :: : ...: : . :: : .: :.. .: . . . ..:..::.:. . CCDS90 AIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPI-QFVGRSAFQHLPELRTL 260 270 280 290 300 310 110 120 130 140 150 pF1KB9 RIEKANNLLYINPEAFQNLPNLQYLLISNTGIKHLPDV--HKIHSLQKVLLDIQDNINIH .. :... . :. . . ::. : .... :. ::.. ... .:: .::.. :. .. CCDS90 TLNGASQITEF-PD-LTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQ--VLDLSYNL-LE 320 330 340 350 360 160 170 180 190 200 210 pF1KB9 TIERNSFVGLSFESVILWLNKNGIQEIHNCAFNGT-QLDELNLSDNNNLEELPNDVFHGA . : : ..... : .: : ::. .:. .: :::. :. :: .: CCDS90 DLPSFS-VCQKLQKIDL--RHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPN-AFSTL 370 380 390 400 410 420 220 230 240 250 260 270 pF1KB9 SGPVILDISRTRIHSLPSYGLENLKKLRARSTYNLKKLPTLEKLVALMEASLTYPSHCCA . . ::.: . . :.: ::..: .:. ... :..: . :.. : . : .::: CCDS90 PSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCCA 430 440 450 460 470 480 280 290 300 310 320 330 pF1KB9 FA---NWRRQISELHPICNKSILRQEVDYMTQTRGQRSSLAEDNESSYSRGFDMTYTEFD :. : . .. . :.:. : . :. . :.:. : .. .:. 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CCDS90 PLCLPLPFGEPSTMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDL-ENIWDCSMVKHI 710 720 730 740 750 760 580 590 600 610 620 630 pF1KB9 AMLIFTDFLCMAPISFFAISASLKVPLITVSKAKILLVLFHPINSCANPFLYAIFTKNFR :.:.::. . :..:...:. ... .:. :..:.. :. .: ::.:: .:. .:. CCDS90 ALLLFTNCILNCPVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFK 770 780 790 800 810 820 640 650 660 670 680 690 pF1KB9 RDFFILLSKCGCYEMQAQIYRTETSSTVHNTHPRNGHCSSAPRVTNGSTYILVPLSHLAQ .:. : CCDS90 EDLVSLRKQTYVWTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSP 830 840 850 860 870 880 >>CCDS30972.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 (828 aa) initn: 464 init1: 187 opt: 552 Z-score: 341.6 bits: 73.9 E(32554): 1e-12 Smith-Waterman score: 627; 24.9% identity (58.7% similar) in 606 aa overlap (50-645:122-707) 20 30 40 50 60 70 pF1KB9 HRICHCSNRVFLCQESKVTEIPSDLPRNAIELRFVLTKLRVIQKGAFSGFGDLEKIEISQ :: : .....: . :: : :. :.. . 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