FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3979, 436 aa 1>>>pF1KE3979 436 - 436 aa - 436 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8897+/-0.000424; mu= 19.4125+/- 0.026 mean_var=67.1995+/-13.351, 0's: 0 Z-trim(111.3): 228 B-trim: 200 in 2/50 Lambda= 0.156456 statistics sampled from 19505 (19804) to 19505 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.601), E-opt: 0.2 (0.232), width: 16 Scan time: 6.940 The best scores are: opt bits E(85289) NP_579875 (OMIM: 606767) potassium voltage-gated c ( 436) 2928 670.3 2.7e-192 NP_758847 (OMIM: 606767) potassium voltage-gated c ( 425) 1435 333.3 7.4e-91 XP_011527105 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513) 1116 261.3 4.1e-69 XP_011527107 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513) 1116 261.3 4.1e-69 XP_011527108 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513) 1116 261.3 4.1e-69 XP_011527106 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513) 1116 261.3 4.1e-69 XP_011527103 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513) 1116 261.3 4.1e-69 XP_006723848 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513) 1116 261.3 4.1e-69 XP_011527102 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513) 1116 261.3 4.1e-69 XP_011527104 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513) 1116 261.3 4.1e-69 NP_002228 (OMIM: 603788) potassium voltage-gated c ( 513) 1116 261.3 4.1e-69 NP_758857 (OMIM: 607603) potassium voltage-gated c ( 519) 921 217.3 7.3e-56 NP_001309728 (OMIM: 602905) potassium voltage-gate ( 526) 878 207.6 6.1e-53 NP_002242 (OMIM: 602905) potassium voltage-gated c ( 526) 878 207.6 6.1e-53 XP_016883335 (OMIM: 602905) PREDICTED: potassium v ( 527) 878 207.6 6.2e-53 NP_065748 (OMIM: 602906) potassium voltage-gated c ( 477) 812 192.7 1.7e-48 NP_598004 (OMIM: 607604,610356) potassium voltage- ( 545) 806 191.4 4.9e-48 NP_002243 (OMIM: 603888) potassium voltage-gated c ( 491) 796 189.1 2.2e-47 XP_011531127 (OMIM: 603888) PREDICTED: potassium v ( 491) 796 189.1 2.2e-47 NP_001269357 (OMIM: 603888) potassium voltage-gate ( 491) 796 189.1 2.2e-47 XP_016859548 (OMIM: 603888) PREDICTED: potassium v ( 491) 796 189.1 2.2e-47 XP_011524220 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 466) 733 174.9 4e-43 XP_011524222 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 466) 733 174.9 4e-43 XP_016881194 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 466) 733 174.9 4e-43 NP_036415 (OMIM: 605696) potassium voltage-gated c ( 466) 733 174.9 4e-43 XP_016881193 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 509) 733 174.9 4.3e-43 NP_000208 (OMIM: 160120,176260) potassium voltage- ( 495) 685 164.0 7.6e-40 NP_002223 (OMIM: 176263) potassium voltage-gated c ( 575) 661 158.7 3.7e-38 XP_011527101 (OMIM: 600397,616056) PREDICTED: pota ( 858) 646 155.4 5.2e-37 XP_006723847 (OMIM: 600397,616056) PREDICTED: pota ( 858) 646 155.4 5.2e-37 NP_004966 (OMIM: 600397,616056) potassium voltage- ( 858) 646 155.4 5.2e-37 NP_004761 (OMIM: 607738) potassium voltage-gated c ( 911) 643 154.8 8.7e-37 NP_005540 (OMIM: 602420) potassium voltage-gated c ( 511) 623 150.1 1.3e-35 NP_055194 (OMIM: 608164) potassium voltage-gated c ( 500) 611 147.3 8.2e-35 NP_004967 (OMIM: 176258,616187) potassium voltage- ( 511) 590 142.6 2.2e-33 XP_011518382 (OMIM: 176258,616187) PREDICTED: pota ( 535) 590 142.6 2.3e-33 NP_001106212 (OMIM: 176258,616187) potassium volta ( 585) 590 142.7 2.5e-33 XP_011539703 (OMIM: 176265) PREDICTED: potassium v ( 609) 583 141.1 7.6e-33 XP_006710688 (OMIM: 176265) PREDICTED: potassium v ( 618) 583 141.1 7.7e-33 XP_006710690 (OMIM: 176265) PREDICTED: potassium v ( 624) 583 141.1 7.8e-33 NP_001034663 (OMIM: 176265) potassium voltage-gate ( 626) 583 141.1 7.8e-33 NP_004969 (OMIM: 176265) potassium voltage-gated c ( 635) 583 141.1 7.9e-33 NP_715624 (OMIM: 176256) potassium voltage-gated c ( 558) 578 139.9 1.6e-32 XP_005268912 (OMIM: 176256) PREDICTED: potassium v ( 574) 578 139.9 1.6e-32 NP_001247428 (OMIM: 176256) potassium voltage-gate ( 583) 578 139.9 1.6e-32 XP_006719446 (OMIM: 176256) PREDICTED: potassium v ( 612) 578 140.0 1.7e-32 XP_006719447 (OMIM: 176256) PREDICTED: potassium v ( 612) 578 140.0 1.7e-32 XP_016874771 (OMIM: 176256) PREDICTED: potassium v ( 612) 578 140.0 1.7e-32 XP_006719448 (OMIM: 176256) PREDICTED: potassium v ( 612) 578 140.0 1.7e-32 XP_006719445 (OMIM: 176256) PREDICTED: potassium v ( 613) 578 140.0 1.7e-32 >>NP_579875 (OMIM: 606767) potassium voltage-gated chann (436 aa) initn: 2928 init1: 2928 opt: 2928 Z-score: 3573.3 bits: 670.3 E(85289): 2.7e-192 Smith-Waterman score: 2928; 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