FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3979, 436 aa 1>>>pF1KE3979 436 - 436 aa - 436 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1933+/-0.000933; mu= 17.7391+/- 0.056 mean_var=70.6758+/-13.778, 0's: 0 Z-trim(105.0): 88 B-trim: 41 in 1/47 Lambda= 0.152559 statistics sampled from 8120 (8211) to 8120 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.624), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16 Scan time: 2.170 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 436) 2928 653.9 8.6e-188 CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 425) 1435 325.3 7e-89 CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 ( 513) 1116 255.2 1.1e-67 CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 ( 519) 921 212.3 9.3e-55 CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 ( 526) 878 202.8 6.6e-52 CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 ( 477) 812 188.3 1.5e-47 CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 ( 545) 806 187.0 4e-47 CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 ( 491) 796 184.7 1.7e-46 CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 ( 466) 733 170.9 2.4e-42 CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 ( 495) 685 160.3 3.9e-39 CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 ( 575) 661 155.1 1.7e-37 CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 ( 858) 646 151.9 2.3e-36 CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 ( 911) 643 151.2 3.8e-36 CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 ( 511) 623 146.7 5.1e-35 CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 ( 500) 611 144.0 3.1e-34 CCDS7827.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 511) 590 139.4 7.8e-33 CCDS44547.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 585) 590 139.5 8.7e-33 CCDS44193.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 626) 583 137.9 2.7e-32 CCDS821.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 635) 583 137.9 2.7e-32 CCDS9006.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 558) 578 136.8 5.2e-32 CCDS58255.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 583) 578 136.8 5.4e-32 CCDS9005.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 613) 578 136.8 5.6e-32 CCDS58257.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 618) 578 136.8 5.7e-32 CCDS58256.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 629) 578 136.8 5.8e-32 CCDS9007.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 638) 578 136.8 5.8e-32 CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 ( 653) 571 135.3 1.7e-31 CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 ( 456) 541 128.6 1.3e-29 CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 ( 529) 537 127.8 2.6e-29 CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 499) 534 127.1 3.9e-29 CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 ( 613) 535 127.4 4e-29 CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 ( 494) 526 125.3 1.3e-28 CCDS12793.1 KCNC3 gene_id:3748|Hs108|chr19 ( 757) 493 118.2 2.9e-26 CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX ( 647) 398 97.2 5e-20 CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 ( 630) 395 96.6 7.7e-20 CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 636) 393 96.1 1.1e-19 CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 655) 393 96.1 1.1e-19 >>CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 (436 aa) initn: 2928 init1: 2928 opt: 2928 Z-score: 3485.0 bits: 653.9 E(32554): 8.6e-188 Smith-Waterman score: 2928; 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CCDS13 IKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPEDRRRRIIINVGGIKYSLPWTTLDEFPLTRLGQLKA 40 50 60 70 80 90 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 CRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIY : . :.:.:::::: ::.::::. ::: :: ..:. ::::. .:: ::: .:..: CCDS13 CTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGAFGTILTFLRA-GKLRLLREMCALSFQEELLY 100 110 120 130 140 150 110 120 130 140 150 pF1KE3 WGLEGAHLEYCCQRRLDDRMSDTYTFYS-ADEPGVL---GRDEARPGGAEAAPSRRWLER ::. ::. ::.:: ... . . .: .: ::: :. .:. .: ..: CCDS13 WGIAEDHLDGCCKRRYLQKIEEFAEMVEREEEDDALDSEGRDSEGPAEGEGRLGRC-MRR 160 170 180 190 200 210 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 MRRTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSRYSAGP .: :.: :.: ....: .::.:: :. : : .::::. : ... . . CCDS13 LRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVNLSVSTLPSLR---------EEEEQGHCSQ 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 GREPSGIIEAICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMT-VFT . :.:..:.:::. : ..:.: . .: :.. ::..:::.:: ::::..:. . . CCDS13 MCHNVFIVESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTLIDLVAILPYYITLLVDGAAA 270 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 pF1KE3 GE------NSQLQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVF :. :: :...:..::::: .::..:..:::: .:::::::: .:: ::. .::.: CCDS13 GRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTARRCTREFGLLLLF 330 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 ICVAMAIFSALSQLLEHGLDLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRIL .:::.:.:. : ..:. . ... .:::::: ::..:.::::::::: : ..::... CCDS13 LCVAIALFAPLLYVIENEM---ADSPEFTSIPACYWWAVITMTTVGYGDMVPRSTPGQVV 390 400 410 420 430 440 390 400 410 420 430 pF1KE3 GGVCVVSGIVLLALPITFIYHSFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN . ..:::.:.:.:.: :.:.: . : ::: .. : CCDS13 ALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQFLIKTKSQLSVSQDSDI 450 460 470 480 490 500 CCDS13 LFGSASSDTRDNN 510 >>CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 (519 aa) initn: 940 init1: 291 opt: 921 Z-score: 1096.5 bits: 212.3 E(32554): 9.3e-55 Smith-Waterman score: 1144; 43.4% identity (70.3% similar) in 424 aa overlap (11-420:61-465) 10 20 30 40 pF1KE3 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRLHG ...:::: :: : : ::: :.:.:. CCDS10 METPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDLKKEILINVGGRRYLLPWSTLDRFPLSRLSKLRL 40 50 60 70 80 90 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 CRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIY ::: ......:::::.. .:.:::: ::: :. .. . ::: . .:: ::: .:. : CCDS10 CRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAFGVIVSFLAA-GKLVLLQEMCALSFQEELAY 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 pF1KE3 WGLEGAHLEYCCQRRLDDRMSDTYTFYSADEPGVL--GRDEARPGGAEAAPSRRW---LE ::.: :::: :: :.: .. . . . . :: :. :: :. : :: .. CCDS10 WGIEEAHLERCCLRKLLRKLEELEELAKLHREDVLRQQRETRRP----ASHSSRWGLCMN 150 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 RMRRTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSRYSAG :.:. :.: :.: ....: .:..:: .. : ::.::.:: : : .... .:. : CCDS10 RLREMVENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCVSTMPDLR--AEEDQGECSRKCYYIF 210 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 PGREPSGIIEAICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFT :.:.::..::. : .::. ...::.: . ::::::.:::.:::.:. .. CCDS10 -------IVETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDILAISPYYVSLAVSEEP 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 pF1KE3 GEN-------SQLQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLV :. : :...:..::::: .::..:..:::: .::::::::..:: ::. .::. CCDS10 PEDGERPSGSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTVRRCTREFGLLLL 320 330 340 350 360 370 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 FICVAMAIFSALSQLLEH--GLDLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPG :. ::...:: : . :. : :: ::::::. ::.:::::::::::: : .::: CCDS10 FLAVAITLFSPLVYVAEKESGRVLE-----FTSIPASYWWAIISMTTVGYGDMVPRSVPG 380 390 400 410 420 430 390 400 410 420 430 pF1KE3 RILGGVCVVSGIVLLALPITFIYHSFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN .... ..:::...:.: : :.:.: . : ::: CCDS10 QMVALSSILSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLRHLQNTGPASECELLD 440 450 460 470 480 490 CCDS10 PHVASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM 500 510 >>CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 (526 aa) initn: 751 init1: 239 opt: 878 Z-score: 1045.3 bits: 202.8 E(32554): 6.6e-52 Smith-Waterman score: 878; 35.5% identity (65.0% similar) in 454 aa overlap (5-434:46-482) 10 20 30 pF1KE3 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRR : . .. .::::.: .:: . : :: : CCDS13 SKVVLPTPLGGRSTETFVSEFPGPDTGIRWRRSDEALRVNVGGVRRQLSARALARFPGTR 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 VSRLHGCRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSF ..::.. ::... ..:::::. :..:::: .: . ::. :.:. ..: ..: CCDS13 LGRLQAAASEEQARRLCDDYDEAAREFYFDRHP-GFFLSLLHFYRTGHLHVLDELCVFAF 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 pF1KE3 YNEMIYWGLEGAHLEYCC-----QRRLD-----DRMSDTYTFYSA--DEPGVLGRDEARP .: :::: : :: .::: :. ::: . . :: . . :. :: CCDS13 GQEADYWGLGENALAACCRARYLERRLTQPHAWDEDSDTPSSVDPCPDEISDVQRELARY 140 150 160 170 180 190 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 GGAEAAPSRRWLERMRRTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDW--RNAA :.:. . :: :. :.:.: :: ..... ::. :..:....: .::.. :.:: CCDS13 GAARCGRLRR---RLWLTMENPGYSLPSKLFSCVSISVVLASIAAMCIHSLPEYQAREAA 200 210 220 230 240 250 210 220 230 240 250 pF1KE3 ADNRSLDDRSRYSAGPGREPSGI--------IEAICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKR : . ... :: : :. .: .::.::. : :.... . .: . CCDS13 A--------AVAAVAAGRSPEGVRDDPVLRRLEYFCIAWFSFEVSSRLLLAPSTRNFFCH 260 270 280 290 300 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 PLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTGENS--QLQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQ :::.::.... :.:...: : :... .. . : ...:.:.:::: :.::::: ::. CCDS13 PLNLIDIVSVLPFYLTLLAGVALGDQGGKEFGHLGKVVQVFRLMRIFRVLKLARHSTGLR 310 320 330 340 350 360 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 TLGLTLKRCYREMVMLLVFICVAMAIFSALSQLLEHGLDLETSNKDFTSIPAACWWVIIS .:: :::. :::. .::... :....::... :. :. :..::: :: .: CCDS13 SLGATLKHSYREVGILLLYLAVGVSVFSGVAYTAEKEEDV-----GFNTIPACWWWGTVS 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 430 pF1KE3 MTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCVVSGIVLLALPITFIYHSFVQCYHELKFRSARYSRSL ::::::::. :.:: :.. .. :...::...:::::.:...: . :.. : : : CCDS13 MTTVGYGDVVPVTVAGKLAASGCILGGILVVALPITIIFNKFSHFYRRQKALEAAVRNSN 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 STEFLN :: CCDS13 HQEFEDLLSSIDGVSEASLETSRETSQEGQSADLESQAPSEPPHPQMY 480 490 500 510 520 >>CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 (477 aa) initn: 824 init1: 324 opt: 812 Z-score: 967.4 bits: 188.3 E(32554): 1.5e-47 Smith-Waterman score: 871; 33.9% identity (66.1% similar) in 433 aa overlap (11-427:19-429) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRLHGCRSERDVLEVCD . .:::: . : . : :: :..:: :.:.. .::.:: CCDS62 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLLCHSREAILELCD 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 DYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIYWGLEGAHLEYCC ::: . :..:::. : : ..: . . :::. ..: .:: .:. :::.. .. :: CCDS62 DYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHT-GKLHVMAELCVFSFSQEIEYWGINEFFIDSCC 70 80 90 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 ------------QRRLDDRMSDTYTFYSADEPGVLGRDEARPGGAEAAPSRR--WLERMR :.. :.. .. : : :: .. : .. : . :: :: CCDS62 SYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGNFRRQLWL---- 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 RTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSRYSAGPGR ....: :. ..... .:.. :. :....: ..:::.. :... .::. CCDS62 -ALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQ--IPDSQG---------NPGE 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 EPS-GIIEAICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTGE .: :.: . :.::: : ..:: :. . .: : ::.:::..:.:.::...... . CCDS62 DPRFEIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVES 230 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 NSQLQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVFICVAMAIF . : : . .:::.:::: ..::::: ::..:: ::: :.:. .::... :...:: CCDS62 TPTLANLGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVGISIF 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 SALSQLLEHGLDLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCVVSG :... .: . :. ...::: ::. .:::::::::. : :. :.. ...:...: CCDS62 SVVAYTIE-----KEENEGLATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAG 350 360 370 380 390 400 410 420 430 pF1KE3 IVLLALPITFIYHSFVQCYHELK-FRSARYSRSLSTEFLN :....::::.:...: . :.. : ..:: : CCDS62 ILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMAS 400 410 420 430 440 450 CCDS62 LTNMSRSSPSELSLNDSLR 460 470 >>CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 (545 aa) initn: 460 init1: 229 opt: 806 Z-score: 959.5 bits: 187.0 E(32554): 4e-47 Smith-Waterman score: 818; 34.7% identity (64.2% similar) in 430 aa overlap (9-420:97-504) 10 20 30 pF1KE3 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRL ... .:::: :.:. : :: :..:: CCDS64 WKDDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCELAGFPKTRLGRL 70 80 90 100 110 120 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 HGCRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEM :. : .::::... .:::::: .: .. . . : : .: : .:. CCDS64 ATSTSRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYLS-GVLLVLDGLCPRRFLEEL 130 140 150 160 170 180 100 110 120 130 140 pF1KE3 IYWGLEGAHLEYCC-----QRR--LDDRMSDTYTFYS---ADEPGVLGRDEARPGGAEAA :::.. . :: .:: :..:.. . . . ..: : :: : CCDS64 GYWGVRLKYTPRCCRICFEERRDELSERLKIQHELRAQAQVEEAEELFRDMRFYG----- 190 200 210 220 230 240 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 PSRRWLERMRRTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDD :.:: :. .:.: ::.::. .. .: .::.::.:.: .:. . .. ...... CCDS64 PQRR---RLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHSGQGEG--- 250 260 270 280 290 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 RSRYSAGPGREPS-GIIEAICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYI :: .: .: .:.:.:: : ..:. . . .:.. ::..::.:: : :. CCDS64 ------GPDLRPILEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAILPLYL 300 310 320 330 340 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 SVLMTVFTGENSQ-------LQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCY ..:. ::::. : . ..: .:::.:.:::: ..::::: ::...:.::..:: CCDS64 QLLLECFTGEGHQRGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFTLRQCY 350 360 370 380 390 400 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 REMVMLLVFICVAMAIFSALSQLLEHGLDLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMY ... ::.:: ... ::: .:: :. ..: ::.:: . ::. .:..:::::::: CCDS64 QQVGCLLLFIAMGIFTFSAAVYSVEH--DVPSTN--FTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDMY 410 420 430 440 450 460 390 400 410 420 430 pF1KE3 PITVPGRILGGVCVVSGIVLLALPITFIYHSFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN : : ::... .:.. ::.: ..::...:..: . : .:: CCDS64 PETHLGRFFAFLCIAFGIILNGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFMQRA 470 480 490 500 510 520 CCDS64 RKKIAECLLGSNPQLTPRQEN 530 540 >>CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 (491 aa) initn: 863 init1: 332 opt: 796 Z-score: 948.2 bits: 184.7 E(32554): 1.7e-46 Smith-Waterman score: 869; 35.3% identity (65.7% similar) in 434 aa overlap (3-420:7-417) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MTFGRSGAAS--VVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRLHGCRSERDVLEVCDDY : : : : ::::: . :... : :: :...: :.::. .::.:::: CCDS16 MVFGEFFHRPGQDEELVNLNVGGFKQSVDQSTLLRFPHTRLGKLLTCHSEEAILELCDDY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 DRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIYWGLEGAHLEYCCQR . .::.:::. : ..: . :::. ..: .:: .:. :::.. .. ::. CCDS16 SVADKEYYFDRNPSLFRYVLNFYYT-GKLHVMEELCVFSFCQEIEYWGINELFIDSCCSN 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 RL------------DDRMSDTYTFYSADEPGVLGRDEARPGGAEAAPSRR--WLERMRRT : :.. :. : : .: ... .. . . . :. :. :: CCDS16 RYQERKEENHEKDWDQKSHDVSTDSSFEESSLFEKELEKFDTLRFGQLRKKIWI-RM--- 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 FEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSRYSAGPGREP :.:. :.:...: :. :..:.:..:. .. ...: .. .:: : : CCDS16 -ENPAYCLSAKLIAISSLSVVLASIVAMCVHSMSEFQN---EDGEVDD-------PVLE- 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 SGIIEAICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTGENSQ :. : ::.:::.: ::. .. . .: : ::::::...: :.: .. . . :. . CCDS16 -GV-EIACIAWFTGELAVRLAAAPCQKKFWKNPLNIIDFVSIIPFYATLAVDTKEEESED 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 LQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVFICVAMAIFSAL .. : ....::.:::: ..::::: .::..:: ::.. :.:. .::.:. :...:::.: CCDS16 IENMGKVVQILRLMRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYHEVGLLLLFLSVGISIFSVL 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 SQLLEHGLDLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCVVSGIVL .:. : .::. .:::: ::. :::::::::: .:.:. :......:.. ::.. CCDS16 IYSVEK--DDHTSS--LTSIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAGKLIASTCIICGILV 350 360 370 380 390 410 420 430 pF1KE3 LALPITFIYHSFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN .:::::.:...: . :.. : CCDS16 VALPITIIFNKFSKYYQKQKDIDVDQCSEDAPEKCHELPYFNIRDIYAQRMHTFITSLSS 400 410 420 430 440 450 >>CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 (466 aa) initn: 1177 init1: 279 opt: 733 Z-score: 873.6 bits: 170.9 E(32554): 2.4e-42 Smith-Waterman score: 1141; 42.4% identity (70.6% similar) in 425 aa overlap (4-425:12-421) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRLHGCRSERDVLEVCD : . : :..:::: : :. : :: :. ::..::.. :.:.::: CCDS12 MEPWPCSPGGGGGTRARHVIINVGGCRVRLAWAALARCPLARLERLRACRGHDDLLRVCD 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 DYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIYWGLEGAHLEYCC ::: :.:.:::: :: :. .:. ::::. : :.: .:. :::.. :.:: :: CCDS12 DYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRA-GKLRLLRGPCALAFRDELAYWGIDEARLERCC 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 QRRLDDRMSDTYTFYSAD-EPGVLGRDEARPGGAEAAPSRRWLERMRRTFEEPTSSLAAQ ::: : .. .. : :. : . :: : .. .: .:.: . ..: :.::.. CCDS12 LRRLRRREEEAAEARAGPTERGAQG-SPARALGPRGR-LQRGRRRLRDVVDNPHSGLAGK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 ILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSRYSAGPGREPSGIIEAICIGW ..: ::: :: :. : :: ::.:: : .. : .: . ..:..:..: CCDS12 LFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRA---------EEERGECSPKCRSLFVLETVCVAW 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 pF1KE3 FTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTGENSQ--LQRAGVTLR :. : ..: . ...:: :.. ::::::.::. :.:.:.:. . .: .. :.:::..:: CCDS12 FSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPGGTKLLERAGLVLR 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 VLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVFICVAMAIFSALSQLLEHGLD .:: .:...:..:::: .::..::::..:: ::. .::.:.:::::.:. : .: :. : CCDS12 LLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPLVHLAERELG 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 LETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCVVSGIVLLALPITFIY . .::.:.::. ::..::::::::::: : ..::.... ..:::.:.:.:.: :. CCDS12 ---ARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSIF 350 360 370 380 390 400 410 420 430 pF1KE3 HSFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN :.: . : ::: .. : CCDS12 HTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADALWVRAG 410 420 430 440 450 460 >>CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 (495 aa) initn: 783 init1: 273 opt: 685 Z-score: 816.1 bits: 160.3 E(32554): 3.9e-39 Smith-Waterman score: 775; 34.3% identity (61.6% similar) in 414 aa overlap (11-417:39-416) 10 20 30 40 pF1KE3 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRLHG ::.:..: :. . . : .:: . : : CCDS85 VDEASAAPGHPQDGSYPRQADHDDHECCERVVINISGLRFETQLKTLAQFP----NTLLG 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 CRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIY ..: .: ::::::::. .: :: : .. :.:: : :....: : CCDS85 NPKKR-----MRYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGRLR-RPVNVPLDMFSEEIK 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 WGLEGAHLEYCCQRRLDDRMSDTYTFYSADEPGVLGRDEARPGGAEAAPSRRWLERMRRT . : .. : . :: : . ..: :: . . :: CCDS85 FYELG-----------EEAMEK----FREDE-GFI-KEEERPLPEKEYQRQVWL-----L 120 130 140 150 170 180 190 200 210 pF1KE3 FEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLP---DWRNAAADNRSLDDRSR-YSAGP :: : :: :...: :::. ...:.:..: ::: : .. .. . .:. . :... CCDS85 FEYPESSGPARVIAIVSVMVILISIVIFCLETLPELKDDKDFTGTVHRIDNTTVIYNSNI 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 GREPSGIIEAICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTG .: :.:..:: ::. : .:::.. .: .: : .:.::..:: ::.:.. . CCDS85 FTDPFFIVETLCIIWFSFELVVRFFACPSKTDFFKNIMNFIDIVAIIPYFITLGTEIAEQ 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 ENSQLQRAGVTL---RVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVFICVA :..: . ...: ::.:..:.: ..::.:: ::: :: ::: .::. .:. :. .. CCDS85 EGNQKGEQATSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASMRELGLLIFFLFIG 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 MAIFSALSQLLEHGLDLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRILGGVC . .::. . : : ... :.::: : ::...::::::::::::.:. :.:.:..: CCDS85 VILFSSAVYFAEA----EEAESHFSSIPDAFWWAVVSMTTVGYGDMYPVTIGGKIVGSLC 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 pF1KE3 VVSGIVLLALPITFIYHSFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN ...:.. .:::. : .: :: CCDS85 AIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETEGEEQAQLLHVSSPNLASDSDLSRRSSSTMSKS 400 410 420 430 440 450 436 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 08:23:46 2016 done: Sun Nov 6 08:23:47 2016 Total Scan time: 2.170 Total Display time: 0.050 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]