FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2330, 1386 aa 1>>>pF1KE2330 1386 - 1386 aa - 1386 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8180+/-0.00133; mu= 13.4646+/- 0.080 mean_var=224.3043+/-44.770, 0's: 0 Z-trim(107.4): 66 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.085636 statistics sampled from 9526 (9563) to 9526 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.627), E-opt: 0.2 (0.294), width: 16 Scan time: 5.650 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1800.1 DHX57 gene_id:90957|Hs108|chr2 (1386) 9127 1142.4 0 CCDS4113.1 YTHDC2 gene_id:64848|Hs108|chr5 (1430) 866 121.8 1.4e-26 CCDS34158.1 DHX29 gene_id:54505|Hs108|chr5 (1369) 771 110.1 4.5e-23 CCDS54657.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 ( 994) 753 107.7 1.7e-22 CCDS3171.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 (1008) 753 107.7 1.7e-22 CCDS9261.1 DHX37 gene_id:57647|Hs108|chr12 (1157) 754 107.9 1.7e-22 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS18 KPPAGVTKIIISTNIAETSITIDDVVYVIDSGKMKEKRYDASKGMESLEDTFVSQANALQ 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE2 RKGRAGRVASGVCFHLFTSHHYNHQLLKQQLPEIQRVPLEQLCLRIKILEMFSAHNLQSV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS18 RKGRAGRVASGVCFHLFTSHHYNHQLLKQQLPEIQRVPLEQLCLRIKILEMFSAHNLQSV 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE2 FSRLIEPPHTDSLRASKIRLRDLGALTPDERLTPLGYHLASLPVDVRIGKLMLFGSIFRC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS18 FSRLIEPPHTDSLRASKIRLRDLGALTPDERLTPLGYHLASLPVDVRIGKLMLFGSIFRC 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE2 LDPALTIAASLAFKSPFVSPWDKKEEANQKKLEFAFANSDYLALLQAYKGWQLSTKEGVR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS18 LDPALTIAASLAFKSPFVSPWDKKEEANQKKLEFAFANSDYLALLQAYKGWQLSTKEGVR 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KE2 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KLVTTQ :::::: CCDS18 KLVTTQ >>CCDS4113.1 YTHDC2 gene_id:64848|Hs108|chr5 (1430 aa) initn: 1239 init1: 434 opt: 866 Z-score: 590.9 bits: 121.8 E(32554): 1.4e-26 Smith-Waterman score: 1495; 35.1% identity (60.0% similar) in 929 aa overlap (524-1310:176-1065) 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 ESYVNLKKKISKRYDWQAKSVHAENGKICKQFRMKQASRQFQSILQERQSLPAWEERETI :. .:.. .:.:. :::::..:..: : CCDS41 PKTERGNVFAVEAENREMSKTSGRLNNGIPQIPVKRGESEFDSF---RQSLPVFEKQEEI 150 160 170 180 190 200 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 LNLLRKHQVVVISGMTGCGKTTQIPQFILDDSL-SGPPEKVANIICTQPRRISAISVAER ........::.: : :: :::::::::.::: . .: : . :.::::::..::.:::: CCDS41 VKIIKENKVVLIVGETGSGKTTQIPQFLLDDCFKNGIPCR---IFCTQPRRLAAIAVAER 210 220 230 240 250 620 630 640 650 660 670 pF1KE2 VAKERAERVGLTVGYQIRLESVKSSATRLLYCTTGVLLRRL-EGDTALQGVSHIIVDEVH :: :: ::.: :.:::::::: : : : .::.::::: : ::..:. :.:.:::::: CCDS41 VAAERRERIGQTIGYQIRLESRVSPKTLLTFCTNGVLLRTLMAGDSTLSTVTHVIVDEVH 260 270 280 290 300 310 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 ERTEESDFLLLVLKDIVSQRPGLQVILMSATLNAELFSDYFNSCPVITIPGRTFPVDQFF :: . ::::: :.:.....: :..:: ::.:...:: ::.::::: : :: : : ..: CCDS41 ERDRFSDFLLTKLRDLLQKHPTLKLILSSAALDVNLFIRYFGSCPVIYIQGRPFEVKEMF 320 330 340 350 360 370 740 750 760 770 pF1KE2 LEDAIAVTRYVLQDGSPYMRSMKQISKE---------------KLKARRNRTAFEEVEE- ::: . .: :. .. : . .: :. : ...:.::... ..: CCDS41 LEDILRTTGYTNKEMLKYKKEKQQEEKQQTTLTEWYSAQENSFKPESQRQRTVLNVTDEY 380 390 400 410 420 430 780 790 pF1KE2 ------------------------------DLRLS---LHLQDQDSVKDA-----VPDQQ : :: :: .: :. .. . . . CCDS41 DLLDDGGDAVFSQLTEKDVNCLEPWLIKEMDACLSDIWLH-KDIDAFAQVFHLILTENVS 440 450 460 470 480 490 800 810 820 pF1KE2 LDFKQ--------LLARYKGVSKSVIKTMS--------------------------IMDF .:... ..: .: ...: . .: :.:. CCDS41 VDYRHSETSATALMVAAGRGFASQVEQLISMGANVHSKASNGWMALDWAKHFGQTEIVDL 500 510 520 530 540 550 830 840 pF1KE2 -------------------------------------------EKVNLELIEALLEWIVD :::.:.:: :: : CCDS41 LESYSATLEFGNLDESSLVQTNGSDLSAEDRELLKAYHHSFDDEKVDLDLIMHLLYNIC- 560 570 580 590 600 610 850 860 870 880 890 pF1KE2 GKHSYPPGAILVFLPGLAEIKMLYEQLQSNSLFNNRR----SNRCVIHPLHSSLSSEEQQ :: ::.:.:::: :: : ... ::...: ..: . :::.... .:. CCDS41 --HSCDAGAVLIFLPGYDEIVGLRDRI----LFDDKRFADSTHRYQVFMLHSNMQTSDQK 620 630 640 650 660 670 900 910 920 930 940 950 pF1KE2 AVFVKPPAGVTKIIISTNIAETSITIDDVVYVIDSGKMKEKRYDASKGMESLEDTFVSQA :. .::::: :::.::::::::::..:::.::::::.::: .:: . . :. ...:.: CCDS41 KVLKNPPAGVRKIILSTNIAETSITVNDVVFVIDSGKVKEKSFDALNFVTMLKMVWISKA 680 690 700 710 720 730 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE2 NALQRKGRAGRVASGVCFHLFTSHHYNHQLLKQQLPEIQRVPLEQLCLRIKILEMFSAHN .:.:::::::: :.::.::. .. ...:. : ::. :.::..:::. :.: . CCDS41 SAIQRKGRAGRCRPGICFRLFSRLRF-QNMLEFQTPELLRMPLQELCLHTKLLAPVNCP- 740 750 760 770 780 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE2 LQSVFSRLIEPPHTDSLRASKIRLRDLGALTPDERLTPLGYHLASLPVDVRIGKLMLFGS . . . . ::: . .: . :. . :. : :: ::::::.:::. ..::..: . CCDS41 IADFLMKAPEPPPALIVRNAVQMLKTIDAMDTWEDLTELGYHLADLPVEPHLGKMVLCAV 790 800 810 820 830 840 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE2 IFRCLDPALTIAASLAFKSPFVSPWD--KKEEANQKKLEF-AFANSDYLALLQAYKGWQL ...:::: :::: .::...::: : . .:. : . .: : : ::..:::.:...:: CCDS41 VLKCLDPILTIACTLAYRDPFVLPTQASQKRAAMLCRKRFTAGAFSDHMALLRAFQAWQK 850 860 870 880 890 900 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KE2 STKEGVRASYNYCRQNFLSGRVLQEMASLKRQFTELLSDIGFAREGLRAREIEKRAQGGD . ..: . .. :..:::: ... . ... :. : ::.: :.:: CCDS41 ARSDGWERAF--CEKNFLSQATMEIIIGMRTQLLGQLRASGFVR-----------ARGGG 910 920 930 940 950 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KE2 GVLDATGEEANSNAENPKLISAMLCAALYPNVVQVKSPEGKFQKTSTGAVRMQPKSAELK . :. :.:.:: ...: : :..:::.:.: . . . ::..: : CCDS41 DIRDV-----NTNSENWAVVKAALVAGMYPNLVHVDRENLVLTGPKEKKVRFHPAS---- 960 970 980 990 1000 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KE2 FVTKNDGYVHIHPSSVNYQ-VRHFDSPYLLYHEKIKTSRVF-IRDCSMVSVYPLVLFGGG : .. : .: :.. . .. . . .:.: : .. :. :: :: :. ...: : CCDS41 -VLSQPQYKKIPPANGQAAAIKALPTDWLIYDEMTRAHRIANIRCCSAVTPVTILVFCGP 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KE2 QVNVQLQRGEFVVSLDDGWIRFVAASHQVAELVKELRCELDQLLQDKIKNPSIDLCMCPR CCDS41 ARLASNALQEPSSFRVDGIPNDSSDSEMEDKTTANLAALKLDEWLHFTLEPEAASLLLQL 1070 1080 1090 1100 1110 1120 >>CCDS34158.1 DHX29 gene_id:54505|Hs108|chr5 (1369 aa) initn: 1763 init1: 477 opt: 771 Z-score: 527.7 bits: 110.1 E(32554): 4.5e-23 Smith-Waterman score: 1978; 37.9% identity (68.2% similar) in 956 aa overlap (445-1386:476-1367) 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 LEEESEIVKLLTNTHHKYSDPPVNFLPVPSRTRINNPACHKTVIPNNSFVSNQIPEVEKA : ..:. .: : . :... . .... CCDS34 YRLVKGQSVHQLLPPTYRDVWLEWSDAEKKREELNKMETNK---PRDLFIAKLLNKLKQQ 450 460 470 480 490 500 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 SESEESDEDDGPAPVIVENESYVNLKKKISKRYDWQAKSVHAENGK----ICKQFRMKQA ...... .. .::. :: .: . :..: :... : . . . :: :. CCDS34 QQQQQQHSENKRENSEDPEESWENL---VSDE-DFSALSLESANVEDLEPVRNLFRKLQS 510 520 530 540 550 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 SRQFQSILQERQSLPAWEERETILNLLRKHQVVVISGMTGCGKTTQIPQFILDDSLSGPP . ..:..:.:::.::....:..:.. :..:.:::..: :: ::.::.:.:.:.: : . CCDS34 TPKYQKLLKERQQLPVFKHRDSIVETLKRHRVVVVAGETGSGKSTQVPHFLLEDLLLNEW 560 570 580 590 600 610 600 610 620 630 640 pF1KE2 EKVA-NIICTQPRRISAISVAERVAKERAERVG-----LTVGYQIRLESVKSSATRLLYC : ::.:::::::::.:.:.:: : . . : :::::.:: .:::::: CCDS34 EASKCNIVCTQPRRISAVSLANRVCDELGCENGPGGRNSLCGYQIRMESRACESTRLLYC 620 630 640 650 660 670 650 660 670 680 690 700 pF1KE2 TTGVLLRRLEGDTALQGVSHIIVDEVHERTEESDFLLLVLKDIVSQRPGLQVILMSATLN :::::::.:. : :..:::.::::::::. .:::::..::.:...: :..::::::.. CCDS34 TTGVLLRKLQEDGLLSNVSHVIVDEVHERSVQSDFLLIILKEILQKRSDLHLILMSATVD 680 690 700 710 720 730 710 720 730 740 750 760 pF1KE2 AELFSDYFNSCPVITIPGRTFPVDQFFLEDAIAVTRYVLQDGSPYMRSMKQISKEKLKAR .: :: ::. ::.. : ::..::. : ::: : : .::. : : ... . CCDS34 SEKFSTYFTHCPILRISGRSYPVEVFHLEDIIEETGFVLEKDSEYCQKFLE--------- 740 750 760 770 780 770 780 790 800 810 820 pF1KE2 RNRTAFEEVEEDLRLSLHLQDQDSVKDAVPDQQLDFKQLLARYKGVSKSVIKTMSIMDFE :: : . .. . . .. .: : .: :. :. . ... :. . CCDS34 ------EEEEVTINVTSKAGGIKKYQEYIPVQTGAHADLNPFYQKYSSRTQHAILYMNPH 790 800 810 820 830 840 830 840 850 860 870 880 pF1KE2 KVNLELIEALLEWIVDGKHSYP--PGAILVFLPGLAEIKMLYEQLQSNSLFNNRRSNRCV :.::.:: :: .. : . .. ::.:.::::::.:..::. :... : :.: CCDS34 KINLDLILELLAYL-DKSPQFRNIEGAVLIFLPGLAHIQQLYDLLSNDRRF---YSERYK 850 860 870 880 890 890 900 910 920 930 940 pF1KE2 IHPLHSSLSSEEQQAVFVKPPAGVTKIIISTNIAETSITIDDVVYVIDSGKMKEKRYDAS . ::: ::...: :.:. :: :: ::...::::::.::: :::.:::.:. ::..: : CCDS34 VIALHSILSTQDQAAAFTLPPPGVRKIVLATNIAETGITIPDVVFVIDTGRTKENKYHES 900 910 920 930 940 950 950 960 970 980 990 1000 pF1KE2 KGMESLEDTFVSQANALQRKGRAGRVASGVCFHLFTSHHYNHQLLKQQLPEIQRVPLEQL . : :: .::::.:.::::.:::::: .: ::...: .... .. ..::: :::::.: CCDS34 SQMSSLVETFVSKASALQRQGRAGRVRDGFCFRMYTRERFEG-FMDYSVPEILRVPLEEL 960 970 980 990 1000 1010 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE2 CLRIKILEMFSAHNLQSVFSRLIEPPHTDSLRASKIRLRDLGALTPDE-RLTPLGYHLAS ::.: .. : ... .:. ..::. . . . :: .:: .: .::::: :::. CCDS34 CLHIMKCNLGSPEDF---LSKALDPPQLQVISNAMNLLRKIGACELNEPKLTPLGQHLAA 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KE2 LPVDVRIGKLMLFGSIFRCLDPALTIAASLAFKSPFVSPWDKKEEANQKKLEFAFANSDY :::.:.:::...::.:: ::::. :.:: .. ::::..: .:.::. : .:.:.::. CCDS34 LPVNVKIGKMLIFGAIFGCLDPVATLAAVMTEKSPFTTPIGRKDEADLAKSALAMADSDH 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE2 LALLQAYKGWQLSTKEG-VRASYNYCRQNFLSGRVLQEMASLKRQFTELLSDIGFAREGL :.. .:: ::. . .:: :. .:::.:::. : . ..:... .:.. ::. CCDS34 LTIYNAYLGWKKARQEGGYRSEITYCRRNFLNRTSLLTLEDVKQELIKLVKAAGFSSSTT 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE2 RAREIEKRAQGGDGVLDATGEEANSNAENPKLISAMLCAALYPNVVQVKSPEGKFQKTST . .::. . . .. :..:.: :.:: :: ::. :.. CCDS34 STSWEGNRAS------------QTLSFQEIALLKAVLVAGLYDNV-------GKIIYTKS 1200 1210 1220 1230 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KE2 GAVRMQPKSAELKFVTKNDGYVHIHPSSVNYQVRHFDSPYLLYHEKIKTSRVFIRDCSMV : . : : . : .: ...:::::: ... .:::.:::. .::..:. ... CCDS34 --VDVTEKLACI--VETAQGKAQVHPSSVNRDLQTHG--WLLYQEKIRYARVYLRETTLI 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KE2 SVYPLVLFGGGQVNVQLQRGEFVVSLDDGWIRFVAASHQVAELVKELRCELDQLLQDKIK . .:..:::: ....:. : ..:.: ::: : : ..: . :.:: .:..:. :.. CCDS34 TPFPVLLFGG---DIEVQHRERLLSID-GWIYF-QAPVKIAVIFKQLRVLIDSVLRKKLE 1300 1310 1320 1330 1340 1370 1380 pF1KE2 NPSIDLCMCPRGSRIISTIVKLVTTQ ::...: ....:.. :..:. :. CCDS34 NPKMSL----ENDKILQIITELIKTENN 1350 1360 >>CCDS54657.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 (994 aa) initn: 1951 init1: 399 opt: 753 Z-score: 517.3 bits: 107.7 E(32554): 1.7e-22 Smith-Waterman score: 2015; 41.1% identity (68.1% similar) in 903 aa overlap (491-1386:157-976) 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 NSFVSNQIPEVEKASESEESDEDDGPAPVIVENESYVNLKKKISKRYDWQAKSVHAENGK ..:.::.. . :. . . . . : CCDS54 EVSTKNTPCSENKLDIQEKKLINQEKKMFRIRNRSYID---RDSEYLLQENEPDGTLDQK 130 140 150 160 170 180 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 ICKQFRMKQASRQFQSILQERQSLPAWEERETILNLLRKHQVVVISGMTGCGKTTQIPQF . .... :. . .. . . :..::.. .. ..::. .:::.:::: ::::::::. :: CCDS54 LLEDLQKKKNDLRYIEMQHFREKLPSYGMQKELVNLIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQF 190 200 210 220 230 240 590 600 610 620 630 pF1KE2 ILDDSLSGPPEKVANIICTQPRRISAISVAERVAKERAERVGL--TVGYQIRLES-VKSS :::. . .. :.::::::::::::::::: :::: : ..::::::.: . . CCDS54 ILDNYIERGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERVAAERAESCGSGNSTGYQIRLQSRLPRK 250 260 270 280 290 300 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 ATRLLYCTTGVLLRRLEGDTALQGVSHIIVDEVHERTEESDFLLLVLKDIVSQRPGLQVI .::::::..:. :..: :..::::..::.:::. .:: :. :.::... : :.:: CCDS54 QGSILYCTTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLDEIHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVI 310 320 330 340 350 360 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 LMSATLNAELFSDYFNSCPVITIPGRTFPVDQFFLEDAIAVTRYVLQDGSPYMRSMK-QI ::::::::: ::.::..::.: ::: :::: ...:::.: ::: : .. . :. CCDS54 LMSATLNAEKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVVEYLLEDVIEKIRYV-----PEQKEHRSQF 370 380 390 400 410 760 770 780 790 800 810 pF1KE2 SKEKLKARRNRTAFEEVEEDLRLSLHLQDQDSVKDAVPDQQLDFKQLLARYKGVSKSVIK .. .... :: :: : ... :. :: ..: :: : :.. CCDS54 KRGFMQGHVNRQEKEEKE-----AIY-------KERWPDY---VRELRRRY---SASTVD 420 430 440 450 460 820 830 840 850 860 870 pF1KE2 TMSIMDFEKVNLELIEALLEWIVDGKHSYPPGAILVFLPGLAEIKMLYEQLQSNSLFNNR .. .:. .::.:.:: ::...:: ... ::::::::: .:. :.. :.:. .:. CCDS54 VIEMMEDDKVDLNLIVALIRYIVLEEED---GAILVFLPGWDNISTLHDLLMSQVMFK-- 470 480 490 500 510 880 890 900 910 920 930 pF1KE2 RSNRCVIHPLHSSLSSEEQQAVFVKPPAGVTKIIISTNIAETSITIDDVVYVIDSGKMKE : .: :: . : :: ::.:.::::::::::::::::::.::.:: CCDS54 ---------------SVNQTQVFKRTPPGVRKIVIATNIAETSITIDDVVYVIDGGKIKE 520 530 540 550 560 940 950 960 970 980 990 pF1KE2 KRYDASKGMESLEDTFVSQANALQRKGRAGRVASGVCFHLFTSHHYNHQLLKQQLPEIQR ..:..... .. .::.::: ::::::::: : :.::... . . : ::::: : CCDS54 THFDTQNNISTMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGHCYHLYNGLRAS-LLDDYQLPEILR 570 580 590 600 610 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE2 VPLEQLCLRIKILEMFSAHNLQSVFSRLIEPPHTDSLRASKIRLRDLGALTPDERLTPLG .:::.:::.::::.. .. .:::..:: .... : .: .:.:: .:.::::: CCDS54 TPLEELCLQIKILRL---GGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLSIRHLMELNALDKQEELTPLG 620 630 640 650 660 670 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE2 YHLASLPVDVRIGKLMLFGSIFRCLDPALTIAASLAFKSPFVSPWDKKEEANQKKLEFAF ::: :::. .:::..:::..: ::::.:::::::.::.::: : :.. :. .. :.: CCDS54 VHLARLPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDPFVIPLGKEKIADARRKELAK 680 690 700 710 720 730 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KE2 -ANSDYLALLQAYKGWQLSTKEGVRASYNYCRQNFLSGRVLQEMASLKRQFTELLSDIGF . ::.:....:..::. . ..: : .:: . :::. .:: . ..: ::.: : :: CCDS54 DTRSDHLTVVNAFEGWEEARRRGFRYEKDYCWEYFLSSNTLQMLHNMKGQFAEHLLGAGF 740 750 760 770 780 790 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KE2 AREGLRAREIEKRAQGGDGVLDATGEEANSNAENPKLISAMLCAALYPNVVQVKSPEGKF . .: . :.: :..: :.:.:..::.:::.:.... :: CCDS54 ---------VSSR--------NPKDPESNINSDNEKIIKAVICAGLYPKVAKIRLNLGKK 800 810 820 830 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KE2 QKTSTGAVRMQPKSAELKFVTKNDGYVHIHPSSVNYQVRHFDSPYLLYHEKIKTSRVFIR .: .: ::.:: : .::.::: . : .:.:: :..:: ... CCDS54 RKM-------------VKVYTKTDGLVAVHPKSVNVEQTDFHYNWLIYHLKMRTSSIYLY 840 850 860 870 880 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KE2 DCSMVSVYPLVLFGGGQVNVQLQRGEFVVSLDDGWIRFVAASHQVAELVKELRCELDQLL ::. :: : :..::: ....: . . ....:. :: : . . ..:.:::::: ::: :: CCDS54 DCTEVSPYCLLFFGG-DISIQKDNDQETIAVDE-WIVFQSPA-RIAHLVKELRKELDILL 890 900 910 920 930 940 1360 1370 1380 pF1KE2 QDKIKNPS-IDLC-MCPRGSRIISTIVKLVTTQ :.::..: .: : ..:.:. :. :: CCDS54 QEKIESPHPVDWNDTKSRDCAVLSAIIDLIKTQEKATPRNFPPRFQDGYYS 950 960 970 980 990 >>CCDS3171.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 (1008 aa) initn: 1998 init1: 399 opt: 753 Z-score: 517.2 bits: 107.7 E(32554): 1.7e-22 Smith-Waterman score: 2082; 41.6% identity (69.2% similar) in 903 aa overlap (491-1386:157-990) 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 NSFVSNQIPEVEKASESEESDEDDGPAPVIVENESYVNLKKKISKRYDWQAKSVHAENGK ..:.::.. . :. . . . . : CCDS31 EVSTKNTPCSENKLDIQEKKLINQEKKMFRIRNRSYID---RDSEYLLQENEPDGTLDQK 130 140 150 160 170 180 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 ICKQFRMKQASRQFQSILQERQSLPAWEERETILNLLRKHQVVVISGMTGCGKTTQIPQF . .... :. . .. . . :..::.. .. ..::. .:::.:::: ::::::::. :: CCDS31 LLEDLQKKKNDLRYIEMQHFREKLPSYGMQKELVNLIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQF 190 200 210 220 230 240 590 600 610 620 630 pF1KE2 ILDDSLSGPPEKVANIICTQPRRISAISVAERVAKERAERVGL--TVGYQIRLES-VKSS :::. . .. :.::::::::::::::::: :::: : ..::::::.: . . CCDS31 ILDNYIERGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERVAAERAESCGSGNSTGYQIRLQSRLPRK 250 260 270 280 290 300 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 ATRLLYCTTGVLLRRLEGDTALQGVSHIIVDEVHERTEESDFLLLVLKDIVSQRPGLQVI .::::::..:. :..: :..::::..::.:::. .:: :. :.::... : :.:: CCDS31 QGSILYCTTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLDEIHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVI 310 320 330 340 350 360 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 LMSATLNAELFSDYFNSCPVITIPGRTFPVDQFFLEDAIAVTRYVLQDGSPYMRSMK-QI ::::::::: ::.::..::.: ::: :::: ...:::.: ::: : .. . :. CCDS31 LMSATLNAEKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVVEYLLEDVIEKIRYV-----PEQKEHRSQF 370 380 390 400 410 760 770 780 790 800 810 pF1KE2 SKEKLKARRNRTAFEEVEEDLRLSLHLQDQDSVKDAVPDQQLDFKQLLARYKGVSKSVIK .. .... :: :: : ... :. :: ..: :: : :.. CCDS31 KRGFMQGHVNRQEKEEKE-----AIY-------KERWPDY---VRELRRRY---SASTVD 420 430 440 450 460 820 830 840 850 860 870 pF1KE2 TMSIMDFEKVNLELIEALLEWIVDGKHSYPPGAILVFLPGLAEIKMLYEQLQSNSLFNNR .. .:. .::.:.:: ::...:: ... ::::::::: .:. :.. :.:. .: CCDS31 VIEMMEDDKVDLNLIVALIRYIVLEEED---GAILVFLPGWDNISTLHDLLMSQVMF--- 470 480 490 500 510 880 890 900 910 920 930 pF1KE2 RSNRCVIHPLHSSLSSEEQQAVFVKPPAGVTKIIISTNIAETSITIDDVVYVIDSGKMKE .:.. .: :::: . . .: :: . : :: ::.:.::::::::::::::::::.::.:: CCDS31 KSDKFLIIPLHSLMPTVNQTQVFKRTPPGVRKIVIATNIAETSITIDDVVYVIDGGKIKE 520 530 540 550 560 570 940 950 960 970 980 990 pF1KE2 KRYDASKGMESLEDTFVSQANALQRKGRAGRVASGVCFHLFTSHHYNHQLLKQQLPEIQR ..:..... .. .::.::: ::::::::: : :.::... . . : ::::: : CCDS31 THFDTQNNISTMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGHCYHLYNGLRAS-LLDDYQLPEILR 580 590 600 610 620 630 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE2 VPLEQLCLRIKILEMFSAHNLQSVFSRLIEPPHTDSLRASKIRLRDLGALTPDERLTPLG .:::.:::.::::.. .. .:::..:: .... : .: .:.:: .:.::::: CCDS31 TPLEELCLQIKILRL---GGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLSIRHLMELNALDKQEELTPLG 640 650 660 670 680 690 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE2 YHLASLPVDVRIGKLMLFGSIFRCLDPALTIAASLAFKSPFVSPWDKKEEANQKKLEFAF ::: :::. .:::..:::..: ::::.:::::::.::.::: : :.. :. .. :.: CCDS31 VHLARLPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDPFVIPLGKEKIADARRKELAK 700 710 720 730 740 750 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KE2 -ANSDYLALLQAYKGWQLSTKEGVRASYNYCRQNFLSGRVLQEMASLKRQFTELLSDIGF . ::.:....:..::. . ..: : .:: . :::. .:: . ..: ::.: : :: CCDS31 DTRSDHLTVVNAFEGWEEARRRGFRYEKDYCWEYFLSSNTLQMLHNMKGQFAEHLLGAGF 760 770 780 790 800 810 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KE2 AREGLRAREIEKRAQGGDGVLDATGEEANSNAENPKLISAMLCAALYPNVVQVKSPEGKF . .: . :.: :..: :.:.:..::.:::.:.... :: CCDS31 ---------VSSR--------NPKDPESNINSDNEKIIKAVICAGLYPKVAKIRLNLGKK 820 830 840 850 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KE2 QKTSTGAVRMQPKSAELKFVTKNDGYVHIHPSSVNYQVRHFDSPYLLYHEKIKTSRVFIR .: .: ::.:: : .::.::: . : .:.:: :..:: ... CCDS31 RKM-------------VKVYTKTDGLVAVHPKSVNVEQTDFHYNWLIYHLKMRTSSIYLY 860 870 880 890 900 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KE2 DCSMVSVYPLVLFGGGQVNVQLQRGEFVVSLDDGWIRFVAASHQVAELVKELRCELDQLL ::. :: : :..::: ....: . . ....:. :: : . . ..:.:::::: ::: :: CCDS31 DCTEVSPYCLLFFGG-DISIQKDNDQETIAVDE-WIVFQSPA-RIAHLVKELRKELDILL 910 920 930 940 950 1360 1370 1380 pF1KE2 QDKIKNPS-IDLC-MCPRGSRIISTIVKLVTTQ :.::..: .: : ..:.:. :. :: CCDS31 QEKIESPHPVDWNDTKSRDCAVLSAIIDLIKTQEKATPRNFPPRFQDGYYS 960 970 980 990 1000 >>CCDS9261.1 DHX37 gene_id:57647|Hs108|chr12 (1157 aa) initn: 751 init1: 306 opt: 754 Z-score: 517.2 bits: 107.9 E(32554): 1.7e-22 Smith-Waterman score: 837; 29.5% identity (55.1% similar) in 810 aa overlap (539-1302:247-1001) 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 WQAKSVHAENGKICKQFRMKQASRQFQSILQERQSLPAWEERETILNLLRKHQVVVISGM .:: .:: :...:.. . .: .:.. : CCDS92 PPPPAAAPPLPRALAKPAVFIPVNRSPEMQEERLKLPILSEEQVIMEAVAEHPIVIVCGE 220 230 240 250 260 270 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 TGCGKTTQIPQFILDDSLSGPPEKVANIICTQPRRISAISVAERVAKER--AERVGLTVG :: :::::.:::. . ..:. ... .. :.:::..:.....::::: ..:: :. CCDS92 TGSGKTTQVPQFLYEAGFSSE-DSIIGV--TEPRRVAAVAMSQRVAKEMNLSQRV---VS 280 290 300 310 320 330 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 YQIRLESVKSSATRLLYCTTGVLLRRLEGDTALQGVSHIIVDEVHERTEESDFLLLVLKD :::: :. . ::. . : ::::.... : : . .:.::.:::. .:.:. .:. CCDS92 YQIRYEGNVTEETRIKFMTDGVLLKEIQKDFLLLRYKVVIIDEAHERSVYTDILIGLLSR 340 350 360 370 380 390 690 700 710 720 730 pF1KE2 IVSQRPG----LQVILMSATLNAELFSD----YFNSCPVITIPGRTFPVDQFF-----LE ::. : :....::::: .: :.. . . ::: . .: ::: : :: CCDS92 IVTLRAKRNLPLKLLIMSATLRVEDFTQNPRLFAKPPPVIKVESRQFPVTVHFNKRTPLE 400 410 420 430 440 450 740 750 760 770 780 pF1KE2 D-------AIAVTRYVLQDGSPYMRSMKQISKEKLKARRNRTAFEEVEEDLRLSLHLQDQ : . . .: :. . : . : :: : :: : . .:. CCDS92 DYSGECFRKVCKIHRMLPAGGILVFLTGQAEVHAL-CRRLRKAFPPS----RARPQEKDD 460 470 480 490 500 790 800 810 820 830 840 pF1KE2 DSVKDAVPDQQLDFKQLLARYKGVSKSVIKTMSIMDFEKVNLELIEALLEWIVDGKHSYP :. ::.: ... ::. :: : . :. ..::. .: :. . CCDS92 DQ-KDSVEEMR-KFKKSRARAKKARAEVLP--------QINLDHYSVLPA----GEGDED 510 520 530 540 550 850 860 870 880 890 900 pF1KE2 PGAILVFLPGLAEIKMLYEQLQSNSLFNNRRSNRCVIH--PLHSSLSSEEQQAVFVKPPA : . : . . . .... ... . .: ::.: :. :.: :: :: CCDS92 REAEVDEEEGALDSDLDLDLGDGGQDGGEQPDASLPLHVLPLYSLLAPEKQAQVFKPPPE 560 570 580 590 600 610 910 920 930 940 950 960 pF1KE2 GVTKIIISTNIAETSITIDDVVYVIDSGKMKEKRYDASKGMESLEDTFVSQANALQRKGR :. ...::.::::.:: . ::.: ::.:.. :: :. :.. :.::::.: :: :: CCDS92 GTRLCVVATNVAETSLTIPGIKYVVDCGKVKKRYYDRVTGVSSFRVTWVSQASADQRAGR 620 630 640 650 660 670 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE2 AGRVASGVCFHLFTSHHYNHQLLKQQLPEIQRVPLEQLCLRIKILEMFSAHNLQSVFSRL :::. : :..:..: .. .. . ::: : :.:.: :..: :.. .. :. . CCDS92 AGRTEPGHCYRLYSSAVFG-DFEQFPPPEITRRPVEDLILQMKALNVEKVINFP-----F 680 690 700 710 720 1030 1040 1050 1060 pF1KE2 IEPPHTDSLRASKIRLRDLGALTPDER---------------LTPLGYHLASLPVDVRIG :: ...: :.. : :::: : .. .: :: .:..:: : . CCDS92 PTPPSVEALLAAEELLIALGALQPPQKAERVKQLQENRLSCPITALGRTMATFPVAPRYA 730 740 750 760 770 780 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KE2 KLMLFGSIFRCLDPALTIAASLAFKSPFVSPWDKKEEANQKKLEFAFANSDYLALLQAYK :.. .. :: :.::.::.. . : :. ... :.. .: . : . CCDS92 KMLALSRQHGCLPYAITIVASMTVRELF-EELDRPAASDE---ELTRLKSKRARVAQMKR 790 800 810 820 830 840 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE2 GWQLSTKEGVRASYNYCRQNFLSGRVLQ-EMASLKRQFTELLSDIGFAREGLRAR---EI : : :: . : : : :.:: :: : .::: . :: CCDS92 TWA-----GQGASLKLGDLMVLLGAVGACEYASCTPQFCEA--------NGLRYKAMMEI 850 860 870 880 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE2 EK-RAQGGDGVLDATGEEANSNAENPKLISAMLCAALYPNVVQVKSPEGKFQKTSTGAVR .. :.: .: .:. ::. .. ::. . : . : . : . . . CCDS92 RRLRGQLTTAV-NAVCPEAELFVD-PKMQPPTESQVTYLRQI-VTAGLGDHLARRVQSEE 890 900 910 920 930 940 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KE2 MQPKSAELKFVTKN-DGYVHIHPSSVNYQVRHFDSP-YLLYHEKIKTSRVFIRDCSMVSV : . . . : : : :::::: .. . : ...:.: ..:...... : : : CCDS92 MLEDKWRNAYKTPLLDDPVFIHPSSVLFK----ELPEFVVYQEIVETTKMYMKGVSSVEV 950 960 970 980 990 1000 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KE2 YPLVLFGGGQVNVQLQRGEFVVSLDDGWIRFVAASHQVAELVKELRCELDQLLQDKIKNP CCDS92 QWIPALLPSYCQFDKPLEEPAPTYCPERGRVLCHRASVFYRVGWPLPAIEVDFPEGIDRY 1010 1020 1030 1040 1050 1060 >>CCDS41444.1 DHX9 gene_id:1660|Hs108|chr1 (1270 aa) initn: 1258 init1: 354 opt: 732 Z-score: 502.0 bits: 105.2 E(32554): 1.2e-21 Smith-Waterman score: 1567; 31.7% identity (59.2% similar) in 1132 aa overlap (272-1382:139-1138) 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 DECMEQRQEEAFALKSICGEKFIERIQNRVWTIGLELEYLTSRFRKSKPKESTKNVQENS : : .:. :: .. . ..: . .: . CCDS41 MGGPLPPHLALKAENNSEVGASGYGVPGPTWDRGANLKDYYSR-KEEQEVQATLESEEVD 110 120 130 140 150 160 310 320 330 340 350 pF1KE2 LEICKFYLKGNCKF-GSKCRFKHEVPPNQIVGRIERS-VDDSHLNAIEDASFLYELEIRF :. :.:: . ..: :... ..: :. . . : .: . ::. :. : . CCDS41 LNAG---LHGNWTLENAKARLNQYFQKEKIQGEYKYTQVGPDH-----NRSFIAEMTIYI 170 180 190 200 210 360 370 380 390 400 pF1KE2 SKDHKYPYQAPLVAFYSTNENLPL-ACRLHISEFLYDKALTFA----------ETSEPVV .. . . ...:..: .: : . . :: ... : :: :: CCDS41 KQLGRRIFARE----HGSNKKLAAQSCALSLVRQLYHLGVVEAYSGLTKKKEGETVEP-- 220 230 240 250 260 270 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 YSLITLLEEESEIVKLLTNTHHKYSDPPVNFLP-VPSRTRINNPACHKTVIPNNSF-VSN :.. . : .. ... . . . :: . : :: :.. : . .:. : CCDS41 YKVNLSQDLEHQLQNIIQELNLEILPPPED--PSVPVALNIGKLAQFEPSQRQNQVGVVP 280 290 300 310 320 330 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 QIPEVEKASESEESDEDDGPAPVIVENESYVNLKKKISKRYDWQAKSVHAENGKICKQFR : . . :. :.:: . .. ..::... ... CCDS41 WSPPQSNWNPWTSSNIDEGPLAFATPEQISMDLKNEL--------------------MYQ 340 350 360 370 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 MKQASRQFQSILQERQSLPAWEERETILNLLRKHQVVVISGMTGCGKTTQIPQFILDDSL ..: ....:.:::::. ::. . . ::. . ...::.: : ::::::::.::::::: . CCDS41 LEQ-DHDLQAILQERELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATGCGKTTQVPQFILDDFI 380 390 400 410 420 430 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 SGPPEKVANIICTQPRRISAISVAERVAKERAERVGLTVGYQIRLESV-KSSATRLLYCT .. ::. ::::::::.::::::: ::.:. : . ::..:.::. . ...:: CCDS41 QNDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEEPGKSCGYSVRFESILPRPHASIMFCT 440 450 460 470 480 490 650 660 670 680 690 700 pF1KE2 TGVLLRRLEGDTALQGVSHIIVDEVHERTEESDFLLLVLKDIVSQRPGLQVILMSATLNA .:::::.:: ....:.::.::::.::: ..::::.::.:.:. : ....:::::... CCDS41 VGVLLRKLE--AGIRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVVQAYPEVRIVLMSATIDT 500 510 520 530 540 710 720 730 740 750 760 pF1KE2 ELFSDYFNSCPVITIPGRTFPVDQFFLEDAIAVTRYVLQDGSPYMRSMKQISKEKLKARR .: .:: .::.: . :::.::...:::: : .:..: : :.: : . CCDS41 SMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFV----PP--------PKDKKKKDK 550 560 570 580 590 770 780 790 800 810 820 pF1KE2 NRTAFEEVEEDLRLSLHLQDQDSVKDAVPDQQLDFKQLLARYKGVSKSVIKTMSIMDFEK . . : ..: .: :. . :. .: .:: .. .. CCDS41 DDDGGE--DDDANCNLICGDEYG-----PETRL------------------SMSQLNEKE 600 610 620 630 830 840 850 860 870 880 pF1KE2 VNLELIEALLEWIVDGKHSYPPGAILVFLPGLAEIKMLYEQLQSNSLFNNRRSNRCVIHP . .:::::::..: . :::.:::::: : . ..:. : :. :.: : : CCDS41 TPFELIEALLKYI---ETLNVPGAVLVFLPGWNLIYTMQKHLEMNPHFG---SHRYQILP 640 650 660 670 680 890 900 910 920 930 940 pF1KE2 LHSSLSSEEQQAVFVKPPAGVTKIIISTNIAETSITIDDVVYVIDSGKMKEKRYDASKGM :::.. :::. :: :.::::.:.:::::::::::.:::::::: :.: : . : ..: CCDS41 LHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETSITINDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNM 690 700 710 720 730 740 950 960 970 980 990 1000 pF1KE2 ESLEDTFVSQANALQRKGRAGRVASGVCFHLFTSHHYNHQLLKQQLPEIQRVPLEQLCLR . ...:..: ::::::::: : :::: . ... .: .. ::. :.::... : CCDS41 TNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSRARFE-RLETHMTPEMFRTPLHEIALS 750 760 770 780 790 800 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE2 IKILEMFSAHNLQSVFSRLIEPPHTDSLRASKIRLRDLGALTPDERLTPLGYHLASLPVD ::.:.. .. . ... :::: :.. .. ::.: :: ...::::: ::.::.. CCDS41 IKLLRL---GGIGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLRELDALDANDELTPLGRILAKLPIE 810 820 830 840 850 860 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KE2 VRIGKLMLFGSIFRCLDPALTIAASLAFKSPFVSPWDKKEEANQKKLEFAFAN-SDYLAL :.::.:..: :: : ::::. : ::. .. .. . . .:: ::..:: CCDS41 PRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFI---NEGKRLGYIHRNFAGNRFSDHVAL 870 880 890 900 910 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE2 LQAYKGWQLSTKEGVRASYNYCRQNFLSGRVLQEMASLKRQFTELLSDIGFAREGLRARE :.....:. . : .: .:... :. .:. : :. :.: . :: .. : .. CCDS41 LSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTWEAKVQLKEILINSGFPEDCLLTQ- 920 930 940 950 960 970 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE2 IEKRAQGGDGVLDATGEEANSNAENPKLISAMLCAALYPNVVQVKSPEGKFQKTSTGAVR :. :: . : . .. ..: ..:::: ..: . . CCDS41 ----------VFTNTGPDNNLD-----VVISLLAFGVYPNVC--------YHKEKRKILT 980 990 1000 1010 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KE2 MQPKSAELKFVTKNDGYVHIHPSSVN----YQVRHFDSPYLLYHEKIKTSRVFIRDCSMV . ..: :: :::: : .. ::.... :::.: . . ..: CCDS41 TEGRNAL------------IHKSSVNCPFSSQDMKYPSPFFVFGEKIRTRAISAKGMTLV 1020 1030 1040 1050 1060 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KE2 SVYPLVLFGGGQVNVQLQRGEFVVSLDDGWIRFVAASHQVAELVKELRCELDQLLQDKIK . :.::.. .:. . : .: .:: ::.. ::..: . :: .. :. . : CCDS41 TPLQLLLFASKKVQSDGQ----IVLVDD-WIKL-QISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTK 1070 1080 1090 1100 1110 1370 1380 pF1KE2 NPSIDLCMCPRGSRIISTIVKLVTTQ .:.: . : . :... : .. CCDS41 QPAIISQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMIGSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRG 1120 1130 1140 1150 1160 1170 >>CCDS2759.1 DHX30 gene_id:22907|Hs108|chr3 (1194 aa) initn: 1339 init1: 369 opt: 659 Z-score: 453.6 bits: 96.2 E(32554): 6e-19 Smith-Waterman score: 1435; 32.4% identity (61.4% similar) in 989 aa overlap (378-1361:302-1155) 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 DASFLYELEIRFSKDHKYPYQAPLVAFYSTNENLPLACRLHISEFLYDKALTFAETSEPV :. :::. : : :. ..::. CCDS27 GTKTKLSTLTLLWPCPMTFVAKGRRKAEAENKAAALACKKLKSLGLVDR------NNEPL 280 290 300 310 320 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 VYSLITLLEEESEIVKLLTNTHHKYSDPPVNFLPVPSRTRINNPACHKTVIPNNSFVSNQ .... .: .. : .:... : . .: : .:.. : : ..:... CCDS27 THAMYNLAS-----LRELGETQRR---PCTIQVPEPILRKIETFLNHYPV--ESSWIA-- 330 340 350 360 370 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 IPEVEKASES-EESDEDDGPAPVIVENESYVNLKKKISKRYDWQAKSVHAENGKICKQFR ::.. :.. .:.:: . .. :: : ..::. .. .. CCDS27 -PELRLQSDDILPLGKDSGPLSDPITGKPYVPL--------------LEAEEVRLSQS-- 380 390 400 410 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 MKQASRQFQSILQERQSLPAWEERETILNLLRKHQVVVISGMTGCGKTTQIPQFILDDSL . . :. . :: .::. .:.:::: ...: :::::: :::::::.:::..:. . CCDS27 LLELWRRRGPVWQEAPQLPVDPHRDTILNAIEQHPVVVISGDTGCGKTTRIPQLLLERYV 420 430 440 450 460 470 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 SGPPEKVANIICTQPRRISAISVAERVAKERAERVGLTVGYQIRLESVKSS-ATRLLYCT . :.: ::::::::.:::.::..: . . .::.:.:::: : . ::.:: CCDS27 TEGRGARCNVIITQPRRISAVSVAQRVSHELGPSLRRNVGFQVRLESKPPSRGGALLFCT 480 490 500 510 520 530 650 660 670 680 690 700 pF1KE2 TGVLLRRLEGDTALQGVSHIIVDEVHERTEESDFLLLVLKDIVSQRPGLQVILMSATLNA .:.:::.:... .:.::::.:::::::: ..::::..:: . :.:...::::: . CCDS27 VGILLRKLQSNPSLEGVSHVIVDEVHERDVNTDFLLILLKGLQRLNPALRLVLMSATGDN 540 550 560 570 580 590 710 720 730 740 750 760 pF1KE2 ELFSDYFNSCPVITIPGRTFPVDQFFLEDAIAVTRYVLQDGSPYMRSMKQISKEKLKARR : :: ::..:::: .:: .:: . .::: .: : ... :. .: CCDS27 ERFSRYFGGCPVIKVPGFMYPVKEHYLEDILA----------------KLGKHQYLHRHR 600 610 620 630 640 770 780 790 800 810 820 pF1KE2 NRTAFEEVEEDLRLSLHLQDQDSVKDAVPDQQLDFKQLLARYKGVSKSVIKTMSIMDFEK .. . .: :: : : : : ..: :: CCDS27 HHESEDECALDL---------DLVTDLV--LHID-----AR------------------- 650 660 830 840 850 860 870 880 pF1KE2 VNLELIEALLEWIVDGKHSYPPGAILVFLPGLAEIKMLYEQLQSNSLFNNRRSNRCVIHP :. ::.:: :::: ::: . ..:: ..: . . .. .: : CCDS27 ---------------GE----PGGILCFLPGWQEIKGVQQRLQ-EAL--GMHESKYLILP 670 680 690 700 890 900 910 920 930 940 pF1KE2 LHSSLSSEEQQAVFVKPPAGVTKIIISTNIAETSITIDDVVYVIDSGKMKEKRYDASKGM .::.. .:.:.: .::.:: ::...::::::::::.:.:.:.::: ::.::: . . CCDS27 VHSNIPMMDQKAIFQQPPVGVRKIVLATNIAETSITINDIVHVVDSGLHKEERYDLKTKV 710 720 730 740 750 760 950 960 970 980 990 1000 pF1KE2 ESLEDTFVSQANALQRKGRAGRVASGVCFHLFTSHHYNHQLLKQQLPEIQRVPLEQLCLR :: ..::.::..::.::::: :: .::: . . ... :.::: :.:::.: :. CCDS27 SCLETVWVSRANVIQRRGRAGRCQSGFAYHLFPRSRLE-KMVPFQVPEILRTPLENLVLQ 770 780 790 800 810 820 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE2 IKILEMFSAHNLQSVFSRLIEPPHTDSLRASKIRLRDLGALTPDERLTPLGYHLASLPVD :: . .. .:. .. :. .. . : :...:.: : :: :: .:: . .: CCDS27 AKI--HMPEKTAVEFLSKAVDSPNIKAVDEAVILLQEIGVLDQREYLTTLGQRLAHISTD 830 840 850 860 870 880 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KE2 VRIGKLMLFGSIFRCLDPALTIAASLAFKSPFVSPWDKKEEANQKKLEFAF-ANSDYLAL :..: .....::::: : :.... :. ..:: : ... :... : .. ..::.::. CCDS27 PRLAKAIVLAAIFRCLHPLLVVVSCLT-RDPFSSSLQNRAEVDKVKALLSHDSGSDHLAF 890 900 910 920 930 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE2 LQAYKGWQLSTKEGVRASY-NYCRQNFLSGRVLQEMASLKRQFTELLSDIGFAREGLRAR ..: ::. . :.: :: ..:.: . :. . .: .::.: . . .. CCDS27 VRAVAGWEEVLRWQDRSSRENYLEENLLYAPSLRFIHGLIKQFSENIYEAFLV------- 940 950 960 970 980 990 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE2 EIEKRAQGGDGVLDATGEEANSNAENPKLISAMLCAALYPNVVQVKSPEGKFQKTSTGAV .. .: .: .. . : .:. .:....: :.::::..::. .:: : : CCDS27 -----GKPSDCTLASA--QCNEYSEEEELVKGVLMAGLYPNLIQVR--QGKV--TRQG-- 1000 1010 1020 1030 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KE2 RMQPKSAELKFVTKNDGYVHIHPSSVNYQVRHFDSPYLLYHEKIKTS-RVFIRDCSMVSV ...:.:. . ::. : . .: :..: .. .. : .: : .:.. ::.:: :.: CCDS27 KFKPNSVTYR--TKS-GNILLHKSTINREATRLRSRWLTYFMAVKSNGSVFVRDSSQVHP 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KE2 YPLVLFGGGQVNVQLQRGEFVVSLDDGWIRFVAASHQVAELVKELRCELDQLLQDKIKNP ..:. :.:... . . ..::.:. . . .. ....:.:::: : .... .... CCDS27 LAVLLLTDGDVHIRDDGRRATISLSDSDLLRLEGDSRTVRLLKELRRALGRMVERSLRSE 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1370 1380 pF1KE2 SIDLCMCPRGSRIISTIVKLVTTQ CCDS27 LAALPPSVQEEHGQLLALLAELLRGPCGSFDVRKTADD 1160 1170 1180 1190 >>CCDS4685.1 DHX16 gene_id:8449|Hs108|chr6 (1041 aa) initn: 1109 init1: 448 opt: 636 Z-score: 438.9 bits: 93.3 E(32554): 4e-18 Smith-Waterman score: 1053; 34.0% identity (58.7% similar) in 644 aa overlap (531-1173:386-925) 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 KKISKRYDWQAKSVHAENGKICKQFRMKQASRQFQSILQERQSLPAWEERETILNLLRKH ..: .:: :.:::.. :: .: . .: CCDS46 VLEEEETIEFVRATQLQGDEEPSAPPTSTQAQQKESIQAVRRSLPVFPFREELLAAIANH 360 370 380 390 400 410 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 QVVVISGMTGCGKTTQIPQFILDDSLSGPPEKVANIICTQPRRISAISVAERVAKERAER ::..: : :: ::::::::...... .. :.: ::::::..:.::: :::.: . . 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