FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0994, 647 aa 1>>>pF1KE0994 647 - 647 aa - 647 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8804+/-0.000995; mu= 12.7584+/- 0.060 mean_var=112.7246+/-22.278, 0's: 0 Z-trim(107.4): 20 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.120799 statistics sampled from 9521 (9527) to 9521 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.293), width: 16 Scan time: 2.590 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1557.1 COQ8A gene_id:56997|Hs108|chr1 ( 647) 4310 762.4 0 CCDS12562.1 COQ8B gene_id:79934|Hs108|chr19 ( 544) 1986 357.4 3e-98 CCDS46081.1 COQ8B gene_id:79934|Hs108|chr19 ( 503) 1518 275.8 1e-73 CCDS9869.1 ADCK1 gene_id:57143|Hs108|chr14 ( 523) 362 74.3 4.6e-13 >>CCDS1557.1 COQ8A gene_id:56997|Hs108|chr1 (647 aa) initn: 4310 init1: 4310 opt: 4310 Z-score: 4065.1 bits: 762.4 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4310; 100.0% identity (100.0% similar) in 647 aa overlap (1-647:1-647) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MAAILGDTIMVAKGLVKLTQAAVETHLQHLGIGGELIMAARALQSTAVEQIGMFLGKVQG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS15 MAAILGDTIMVAKGLVKLTQAAVETHLQHLGIGGELIMAARALQSTAVEQIGMFLGKVQG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 QDKHEEYFAENFGGPEGEFHFSVPHAAGASTDFSSASAPDQSAPPSLGHAHSEGPAPAYV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS15 QDKHEEYFAENFGGPEGEFHFSVPHAAGASTDFSSASAPDQSAPPSLGHAHSEGPAPAYV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 ASGPFREAGFPGQASSPLGRANGRLFANPRDSFSAMGFQRRFFHQDQSPVGGLTAEDIEK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS15 ASGPFREAGFPGQASSPLGRANGRLFANPRDSFSAMGFQRRFFHQDQSPVGGLTAEDIEK 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE0 ARQAKARPENKQHKQTLSEHARERKVPVTRIGRLANFGGLAVGLGFGALAEVAKKSLRSE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS15 ARQAKARPENKQHKQTLSEHARERKVPVTRIGRLANFGGLAVGLGFGALAEVAKKSLRSE 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE0 DPSGKKAVLGSSPFLSEANAERIVRTLCKVRGAALKLGQMLSIQDDAFINPHLAKIFERV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS15 DPSGKKAVLGSSPFLSEANAERIVRTLCKVRGAALKLGQMLSIQDDAFINPHLAKIFERV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE0 RQSADFMPLKQMMKTLNNDLGPNWRDKLEYFEERPFAAASIGQVHLARMKGGREVAMKIQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS15 RQSADFMPLKQMMKTLNNDLGPNWRDKLEYFEERPFAAASIGQVHLARMKGGREVAMKIQ 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE0 YPGVAQSINSDVNNLMAVLNMSNMLPEGLFPEHLIDVLRRELALECDYQREAACARKFRD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS15 YPGVAQSINSDVNNLMAVLNMSNMLPEGLFPEHLIDVLRRELALECDYQREAACARKFRD 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE0 LLKGHPFFYVPEIVDELCSPHVLTTELVSGFPLDQAEGLSQEIRNEICYNILVLCLRELF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS15 LLKGHPFFYVPEIVDELCSPHVLTTELVSGFPLDQAEGLSQEIRNEICYNILVLCLRELF 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE0 EFHFMQTDPNWSNFFYDPQQHKVALLDFGATREYDRSFTDLYIQIIRAAADRDRETVRAK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS15 EFHFMQTDPNWSNFFYDPQQHKVALLDFGATREYDRSFTDLYIQIIRAAADRDRETVRAK 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE0 SIEMKFLTGYEVKVMEDAHLDAILILGEAFASDEPFDFGTQSTTEKIHNLIPVMLRHRLV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS15 SIEMKFLTGYEVKVMEDAHLDAILILGEAFASDEPFDFGTQSTTEKIHNLIPVMLRHRLV 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 pF1KE0 PPPEETYSLHRKMGGSFLICSKLKARFPCKAMFEEAYSNYCKRQAQQ ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS15 PPPEETYSLHRKMGGSFLICSKLKARFPCKAMFEEAYSNYCKRQAQQ 610 620 630 640 >>CCDS12562.1 COQ8B gene_id:79934|Hs108|chr19 (544 aa) initn: 1948 init1: 1709 opt: 1986 Z-score: 1877.3 bits: 357.4 E(32554): 3e-98 Smith-Waterman score: 1986; 58.0% identity (81.4% similar) in 522 aa overlap (129-644:11-524) 100 110 120 130 140 150 pF1KE0 PDQSAPPSLGHAHSEGPAPAYVASGPFREAGFPGQASSPLGRANGRLFANPRDSFSAMGF : :: .. .: : : .:. : CCDS12 MWLKVGGLLRGTGGQLGQTVGWPCGALGPGPHRWGPCGGS 10 20 30 40 160 170 180 190 200 210 pF1KE0 QRRFFHQDQSPVGGLTAEDIEKARQAKARPENKQHKQTLSEHARERKVPVTRIGRLANFG . :.:: .: :: :::..::.:. : : . ::...::::::..::.:::::: CCDS12 WAQKFYQD-GPGRGLGEEDIRRAREARPR---KTPRPQLSDRSRERKVPASRISRLANFG 50 60 70 80 90 220 230 240 250 260 270 pF1KE0 GLAVGLGFGALAEVAKKS-----LRSEDPSGKKAVLGSSPFLSEANAERIVRTLCKVRGA :::::::.:.:::.:::: :.:: :: : ::::::::::::::.::: :::: CCDS12 GLAVGLGLGVLAEMAKKSMPGGRLQSEGGSG----LDSSPFLSEANAERIVQTLCTVRGA 100 110 120 130 140 150 280 290 300 310 320 330 pF1KE0 ALKLGQMLSIQDDAFINPHLAKIFERVRQSADFMPLKQMMKTLNNDLGPNWRDKLEYFEE :::.::::::::..::.:.: .::::::::::::: ::...:...:: .:. :. .:: CCDS12 ALKVGQMLSIQDNSFISPQLQHIFERVRQSADFMPRWQMLRVLEEELGRDWQAKVASLEE 160 170 180 190 200 210 340 350 360 370 380 390 pF1KE0 RPFAAASIGQVHLARMKGGREVAMKIQYPGVAQSINSDVNNLMAVLNMSNMLPEGLFPEH ::::::::::: . .. : :::.::::::.::::.:::.::.:::.:: :: ::: :. 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CCDS98 EMIFVNGFVHCDPHPGNVLVRKHPGTGKAEIVLLDHGLYQMLTEEFRLNYCHLWQSLIWT 300 310 320 330 340 350 530 540 550 560 570 580 pF1KE0 AADRDRETVRAKSIEMKFLTGYEVKVMEDAHLDAILILGEAFASDEPFDFGTQSTTEKIH : .: CCDS98 DMKRVKEYSQRLGAGDLYPLFACMLTARSWDSVNRGISQAPVTATEDLEIRNNAANYLPQ 360 370 380 390 400 410 647 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 05:49:21 2016 done: Sun Nov 6 05:49:22 2016 Total Scan time: 2.590 Total Display time: 0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]