FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9409, 361 aa 1>>>pF1KE9409 361 - 361 aa - 361 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0570+/-0.000694; mu= 18.3969+/- 0.042 mean_var=94.9267+/-24.241, 0's: 0 Z-trim(111.7): 272 B-trim: 1487 in 2/49 Lambda= 0.131638 statistics sampled from 12197 (12611) to 12197 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.743), E-opt: 0.2 (0.387), width: 16 Scan time: 3.240 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 2456 476.5 1.6e-134 CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 615 126.8 2.8e-29 CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 570 118.3 1e-26 CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 570 118.3 1.1e-26 CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 570 118.3 1.1e-26 CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 540 112.6 5.5e-25 CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 540 112.7 5.9e-25 CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 501 105.2 9.2e-23 CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 499 104.8 1.2e-22 CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 498 104.6 1.4e-22 CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 485 102.2 7.6e-22 CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 483 101.8 9.9e-22 CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 482 101.6 1.1e-21 CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 482 101.6 1.1e-21 CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 482 101.6 1.2e-21 CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 468 98.9 7.1e-21 CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 464 98.2 1.2e-20 CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19 ( 385) 459 97.2 2.4e-20 CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 456 96.7 3.5e-20 CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 453 96.1 5.1e-20 CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 453 96.1 5.3e-20 CCDS1124.1 RXFP4 gene_id:339403|Hs108|chr1 ( 374) 447 95.0 1.1e-19 CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 444 94.4 1.6e-19 CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 444 94.4 1.7e-19 CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 355) 438 93.2 3.6e-19 CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 387) 438 93.3 3.8e-19 CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3 ( 350) 437 93.0 4.1e-19 CCDS14004.1 MCHR1 gene_id:2847|Hs108|chr22 ( 422) 437 93.1 4.6e-19 CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 435 92.7 5.5e-19 CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 ( 350) 434 92.5 6.1e-19 CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 432 92.1 7.9e-19 CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 432 92.1 8e-19 CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 431 91.9 9.7e-19 CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 430 91.7 1.1e-18 CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 429 91.5 1.2e-18 CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 428 91.3 1.4e-18 CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 428 91.3 1.4e-18 CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 428 91.4 1.4e-18 CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 427 91.1 1.6e-18 CCDS13958.1 GALR3 gene_id:8484|Hs108|chr22 ( 368) 426 91.0 1.8e-18 CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 424 90.5 2.3e-18 CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17 ( 362) 423 90.4 2.6e-18 CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 422 90.2 3.1e-18 CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 421 90.0 3.4e-18 CCDS9626.1 LTB4R gene_id:1241|Hs108|chr14 ( 352) 415 88.8 7.4e-18 CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 415 88.9 8.3e-18 CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 407 87.3 2.1e-17 CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 406 87.2 2.5e-17 CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 405 87.0 2.8e-17 CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 405 87.0 2.9e-17 >>CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 (361 aa) initn: 2456 init1: 2456 opt: 2456 Z-score: 2528.7 bits: 476.5 E(32554): 1.6e-134 Smith-Waterman score: 2456; 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CCDS29 HFKPGSRRLIDIFIINLAASDFIFLVTLPLWVDKEASLGLWRTGSFLCKGSSYMISVNMH 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 AGALLLAGMSVDRYLAVVKLLEARPLRTPRCALASCCGVWAVALLAGLPSLVYRGLQPLP ..:::. ::::::::.: . .: .: :: . : ..: .. : :::.:. : : . CCDS29 CSVLLLTCMSVDRYLAIVWPVVSRKFRRTDCAYVVCASIWFISCLLGLPTLLSRELTLID 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE9 GGQDSQCGEEPSHAFQGL-SLLLLLLTFVLPLVVTLFCYCRISRRL----RRPPHVGRAR . :.:. . .. . ::. :..:: .::. . ::: :.:.: .. . .. CCDS29 --DKPYCAEKKATPIKLIWSLVALIFTFFVPLLSIVTCYCCIARKLCAHYQQSGKHNKKL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 RNSLRIIFAIESTFVGSWLPFSALRAVFHLARLGALPLPCPLLLA-LRWGLTIATCLAFV ..:..::: . ..:. :::::.... :: ...: : : :. :. .. :::. CCDS29 KKSIKIIFIVVAAFLVSWLPFNTFK---FLAIVSGLRQEHYLPSAILQLGMEVSGPLAFA 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 NSCANPLIYLLLDRSFRARALDGACGRTGRLARRISSASSLSRDDSSVFRCRAQAANTAS :::.::.:: ..: .: . : CCDS29 NSCVNPFIYYIFDSYIRRAIVHCLCPCLKNYDFGSSTETSDSHLTKALSTFIHAEDFARR 300 310 320 330 340 350 >>CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (359 aa) initn: 463 init1: 392 opt: 570 Z-score: 593.0 bits: 118.3 E(32554): 1e-26 Smith-Waterman score: 570; 34.0% identity (67.0% similar) in 303 aa overlap (22-315:9-310) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MAPTEPWSPSPGSAPWDYSGLDGLEELEL-CP-AGDLPYGYVYIPALYLAAFAVGLLGNA ::..... :: :: : .:.::.:: :.::..::. CCDS31 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNS 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 FVVWLLAGRRGPRRLVDTFVLHLAAADLGFVLTLPLWAAAAALGGRWPFGDGLCKLSSFA .:: .. . ....:.:.:: ::: :.:::::::. .:. :::::. :::..: . CCDS31 LVVIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASAS 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 LAGTRCAGALLLAGMSVDRYLAVVKLLEARPLRTPRCALASCCGVWAVALLAGLPSLVYR .. . :...::. .:.:::::.:. ...: :: : ..: .: .: ::.::....: CCDS31 VSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHR 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 GLQPLPGGQDSQCG---EEPSHAFQ-GLSLLLLLLTFVLPLVVTLFCYCRISRRLRRPPH .. . . . . :. : . .. ::.: .: :..:... : : : . :.. . CCDS31 NVFFIENTNITVCAFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYE 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 VGRAR-RNS--LRIIFAIESTFVGSWLPFSALRAVFHLARLGALPLPCPLLLALRWGLTI . . . ::. ..::.:: : ::.: . . . : .:: . : . . .. : CCDS31 IQKNKPRNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIR-DCRIADIVDTAMPI 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 ATCLAFVNSCANPLIYLLLDRSFRARALDGACGRTGRLARRISSASSLSRDDSSVFRCRA . :.:. :.: :::.: .: ..:. CCDS31 TICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVS 290 300 310 320 330 340 >>CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (388 aa) initn: 463 init1: 392 opt: 570 Z-score: 592.6 bits: 118.3 E(32554): 1.1e-26 Smith-Waterman score: 570; 34.0% identity (67.0% similar) in 303 aa overlap (22-315:38-339) 10 20 30 40 pF1KE9 MAPTEPWSPSPGSAPWDYSGLDGLEELEL-CP-AGDLPYGYVYIPALYLAA ::..... :: :: : .:.::.:: CCDS82 CGCTTFGVFDIVFATNSTQVIKMILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSII 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 FAVGLLGNAFVVWLLAGRRGPRRLVDTFVLHLAAADLGFVLTLPLWAAAAALGGRWPFGD :.::..::..:: .. . ....:.:.:: ::: :.:::::::. .:. :::::. CCDS82 FVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGN 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 GLCKLSSFALAGTRCAGALLLAGMSVDRYLAVVKLLEARPLRTPRCALASCCGVWAVALL :::..: ... . :...::. .:.:::::.:. ...: :: : ..: .: .: : CCDS82 YLCKIASASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGL 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 AGLPSLVYRGLQPLPGGQDSQCG---EEPSHAFQ-GLSLLLLLLTFVLPLVVTLFCYCRI :.::....:.. . . . . :. : . .. ::.: .: :..:... : : : CCDS82 ASLPAIIHRNVFFIENTNITVCAFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLI 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 SRRLRRPPHVGRAR-RNS--LRIIFAIESTFVGSWLPFSALRAVFHLARLGALPLPCPLL . :.. .. . . ::. ..::.:: : ::.: . . . : .:: . : . CCDS82 WKALKKAYEIQKNKPRNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIR-DCRIA 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 LALRWGLTIATCLAFVNSCANPLIYLLLDRSFRARALDGACGRTGRLARRISSASSLSRD . .. :. :.:. :.: :::.: .: ..:. CCDS82 DIVDTAMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTL 310 320 330 340 350 360 350 360 pF1KE9 DSSVFRCRAQAANTASASW CCDS82 SYRPSDNVSSSTKKPAPCFEVE 370 380 >>CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (394 aa) initn: 463 init1: 392 opt: 570 Z-score: 592.5 bits: 118.3 E(32554): 1.1e-26 Smith-Waterman score: 570; 34.0% identity (67.0% similar) in 303 aa overlap (22-315:44-345) 10 20 30 40 pF1KE9 MAPTEPWSPSPGSAPWDYSGLDGLEELEL-CP-AGDLPYGYVYIPALYLAA ::..... :: :: : .:.::.:: CCDS82 APQLRGGVFDIVFATNSTQVIKMILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSII 20 30 40 50 60 70 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 FAVGLLGNAFVVWLLAGRRGPRRLVDTFVLHLAAADLGFVLTLPLWAAAAALGGRWPFGD :.::..::..:: .. . ....:.:.:: ::: :.:::::::. .:. :::::. CCDS82 FVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGN 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 GLCKLSSFALAGTRCAGALLLAGMSVDRYLAVVKLLEARPLRTPRCALASCCGVWAVALL :::..: ... . :...::. .:.:::::.:. ...: :: : ..: .: .: : CCDS82 YLCKIASASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGL 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 AGLPSLVYRGLQPLPGGQDSQCG---EEPSHAFQ-GLSLLLLLLTFVLPLVVTLFCYCRI :.::....:.. . . . . :. : . .. ::.: .: :..:... : : : CCDS82 ASLPAIIHRNVFFIENTNITVCAFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLI 200 210 220 230 240 250 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 SRRLRRPPHVGRAR-RNS--LRIIFAIESTFVGSWLPFSALRAVFHLARLGALPLPCPLL . :.. .. . . ::. ..::.:: : ::.: . . . : .:: . : . CCDS82 WKALKKAYEIQKNKPRNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIR-DCRIA 260 270 280 290 300 310 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 LALRWGLTIATCLAFVNSCANPLIYLLLDRSFRARALDGACGRTGRLARRISSASSLSRD . .. :. :.:. :.: :::.: .: ..:. CCDS82 DIVDTAMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTL 320 330 340 350 360 370 350 360 pF1KE9 DSSVFRCRAQAANTASASW CCDS82 SYRPSDNVSSSTKKPAPCFEVE 380 390 >>CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (368 aa) initn: 472 init1: 199 opt: 540 Z-score: 562.1 bits: 112.6 E(32554): 5.5e-25 Smith-Waterman score: 540; 34.5% identity (59.0% similar) in 322 aa overlap (30-345:43-356) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MAPTEPWSPSPGSAPWDYSGLDGLEELELCPAG-DLPYGYVYIPALYLAAFAVGLLGNA :: .: . ...:::: : .:::::. CCDS14 DAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPPCPQDFSLNFDRAFLPALYSLLFLLGLLGNG 20 30 40 50 60 70 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 FVVWLLAGRRGPRRLVDTFVLHLAAADLGFVLTLPLWAAAAALGGRWPFGDGLCKLSSFA :. .: .:: .:::.::::.:: .::::::::. ::. .: ::.::::... CCDS14 AVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAAV--QWVFGSGLCKVAGAL 80 90 100 110 120 130 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 LAGTRCAGALLLAGMSVDRYLAVVKLLEARPLRTPRCALASCCGVWAVALLAGLPSLVYR . . ::::::: .: :::: .:. . : . .: .::.. :: .::.... CCDS14 FNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTLTCLAVWGLCLLFALPDFIFL 140 150 160 170 180 190 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 GLQPLPGGQDSQCGEE-PSHAFQGLSLLLLLLTFVLPLVVTLFCYCRISRRLRRPPHVGR . . . ..: . :. . .: .: :. :.:::.: .:: .: : :. CCDS14 SAHHDERLNATHCQYNFPQVGRTALRVLQLVAGFLLPLLVMAYCYAHILAVLLVSR--GQ 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 ARRNSLRIIFAIESTFVGSWLPFSALRAVFHLARLGALPLPCPLLLALRWGLTIATCLAF : ..:.. .. .:. : :. . : : :::: : . . .... :.. CCDS14 RRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNCGRESRVDVAKSVTSGLGY 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 VNSCANPLIYLLLDRSFRARA----LDGACGRTGRLARRISSASSLSRDDSSVFRCRAQA .. : :::.: .. .:: : : .: : :. :: :: ::: CCDS14 MHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQPSS----SRRDSSWSETSEAS 310 320 330 340 350 360 360 pF1KE9 ANTASASW CCDS14 YSGL >>CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (415 aa) initn: 472 init1: 199 opt: 540 Z-score: 561.5 bits: 112.7 E(32554): 5.9e-25 Smith-Waterman score: 540; 34.5% identity (59.0% similar) in 322 aa overlap (30-345:90-403) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MAPTEPWSPSPGSAPWDYSGLDGLEELELCPAG-DLPYGYVYIPALYLAAFAVGLLGNA :: .: . ...:::: : .:::::. CCDS48 DAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPPCPQDFSLNFDRAFLPALYSLLFLLGLLGNG 60 70 80 90 100 110 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 FVVWLLAGRRGPRRLVDTFVLHLAAADLGFVLTLPLWAAAAALGGRWPFGDGLCKLSSFA :. .: .:: .:::.::::.:: .::::::::. ::. .: ::.::::... CCDS48 AVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAAV--QWVFGSGLCKVAGAL 120 130 140 150 160 170 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 LAGTRCAGALLLAGMSVDRYLAVVKLLEARPLRTPRCALASCCGVWAVALLAGLPSLVYR . . ::::::: .: :::: .:. . : . .: .::.. :: .::.... CCDS48 FNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTLTCLAVWGLCLLFALPDFIFL 180 190 200 210 220 230 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 GLQPLPGGQDSQCGEE-PSHAFQGLSLLLLLLTFVLPLVVTLFCYCRISRRLRRPPHVGR . . . ..: . :. . .: .: :. :.:::.: .:: .: : :. CCDS48 SAHHDERLNATHCQYNFPQVGRTALRVLQLVAGFLLPLLVMAYCYAHILAVLLVSR--GQ 240 250 260 270 280 290 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 ARRNSLRIIFAIESTFVGSWLPFSALRAVFHLARLGALPLPCPLLLALRWGLTIATCLAF : ..:.. .. .:. : :. . : : :::: : . . .... :.. CCDS48 RRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNCGRESRVDVAKSVTSGLGY 300 310 320 330 340 350 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 VNSCANPLIYLLLDRSFRARA----LDGACGRTGRLARRISSASSLSRDDSSVFRCRAQA .. : :::.: .. .:: : : .: : :. :: :: ::: CCDS48 MHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQPSS----SRRDSSWSETSEAS 360 370 380 390 400 410 360 pF1KE9 ANTASASW CCDS48 YSGL >>CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 (360 aa) initn: 396 init1: 178 opt: 501 Z-score: 522.2 bits: 105.2 E(32554): 9.2e-23 Smith-Waterman score: 501; 33.6% identity (62.6% similar) in 289 aa overlap (37-319:37-316) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 WSPSPGSAPWDYSGLDGLEELELCPAGDLPYGYVYIPALYLAAFAVGLLGNAFVVWLLAG .: ...: :: .:. :::::. :: .: CCDS26 ADTTLDESIYSNYYLYESIPKPCTKEGIKAFGELFLPPLYSLVFVFGLLGNSVVVLVLFK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 RRGPRRLVDTFVLHLAAADLGFVLTLPLWAAAAALGGRWPFGDGLCKLSSFA-LAGTRCA . : ..:...:.:: .:: ::..::.:. :: .: :: ::::. :. :.: . CCDS26 YKRLRSMTDVYLLNLAISDLLFVFSLPFWGYYAA--DQWVFGLGLCKMISWMYLVGFY-S 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 GALLLAGMSVDRYLAVVKLLEARPLRTPRCALASCCGVWAVALLAGLPSLVYRGLQPLPG : ... ::.:::::.:. . . :: .. . ..:.::..:.::.... . CCDS26 GIFFVMLMSIDRYLAIVHAVFSLRARTLTYGVITSLATWSVAVFASLPGFLFSTCYTERN 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 GQDSQCGEE---PSHAFQGLSLLLL-LLTFVLPLVVTLFCYCRISRRLRRPPHVGRARRN . : . : ... :: : . .: .:.:: . :::: : : :. : ..: CCDS26 --HTYCKTKYSLNSTTWKVLSSLEINILGLVIPLGIMLFCYSMIIRTLQ---HCKNEKKN 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 -SLRIIFAIESTFVGSWLPFSALRAVFHLARLGALPLPCPLLLALRWGLTIATCLAFVNS ....:::. :.: : :.. . . :..: .: : . : ... . ::::. CCDS26 KAVKMIFAVVVLFLGFWTPYNIVLFLETLVELEVLQ-DCTFERYLDYAIQATETLAFVHC 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE9 CANPLIYLLLDRSFRARALDGACGRTGRLARRISSASSLSRDDSSVFRCRAQAANTASAS : ::.::..: ..:: : CCDS26 CLNPIIYFFLGEKFRKYILQLFKTCRGLFVLCQYCGLLQIYSADTPSSSYTQSTMDHDLH 300 310 320 330 340 350 >>CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 (350 aa) initn: 179 init1: 177 opt: 499 Z-score: 520.3 bits: 104.8 E(32554): 1.2e-22 Smith-Waterman score: 499; 33.0% identity (58.0% similar) in 348 aa overlap (16-345:10-348) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MAPTEPWSPSPGSAPWDYSGLD--GL----EELELCP-AGDLPYGYVYIPALYLAAFAVG ::.. :. :. :. : . :: : : : .: .. CCDS24 MSNITDPQMWDFDDLNFTGMPPADEDYSPCMLETETLNKYVVIIA-YALVFLLS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 LLGNAFVVWLLAGRRGPRRLVDTFVLHLAAADLGFVLTLPLWAAAAALGGRWPFGDGLCK ::::..:. .. : : ..:...:.:: ::: :.::::.:::. . : : :: ::: CCDS24 LLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNG--WIFGTFLCK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 LSSFALAGTRCAGALLLAGMSVDRYLAVVKLLEARPLRTPRCALASCC-GVWAVALLAGL . :. . .: :::: .:::::::.:. .: : : . : : :.... .: CCDS24 VVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVH--ATRTLTQKRHLVKFVCLGCWGLSMNLSL 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 pF1KE9 PSLVYRGLQPLPGGQDSQC----GEEPSHAFQGLSLLLLLLTFVLPLVVTLFCYCRISRR : ...: :.... : :.. .. . : .: . :..:: : :::: : CCDS24 PFFLFRQAYH-PNNSSPVCYEVLGNDTAKWRMVLRILPHTFGFIVPLFVMLFCYGFTLRT 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 LRRPPHVGRARRNSLRIIFAIESTFVGSWLPFSALRAVFHLARLGALPLPCPLLLALRWG : . :.:. .: ..:.:::. :. :::.. . . : : .. : . . CCDS24 LFKA-HMGQKHR-AMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQESCERRNNIGRA 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 LTIATCLAFVNSCANPLIYLLLDRSFR-----ARALDGACGRTGRLAR-RISSASSLSRD : . :.:..:: ::.:: .. ..:: :. : .. ::: :..: .: : . CCDS24 LDATEILGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRHGFLKILAMHGLVSKE-FLARHRVTSYTSSSVN 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE9 DSSVFRCRAQAANTASASW :: CCDS24 VSSNL 350 >>CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 (360 aa) initn: 180 init1: 179 opt: 498 Z-score: 519.1 bits: 104.6 E(32554): 1.4e-22 Smith-Waterman score: 498; 33.3% identity (60.5% similar) in 291 aa overlap (30-315:39-322) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MAPTEPWSPSPGSAPWDYSGLDGLEELELCPAGDLPYGYVYIPALYLAAFAVGLLGNAF : .: . .. .: .: ..::::.. CCDS24 DSFEDFWKGEDLSNYSYSSTLPPFLLDAAPCEPESLEINKYFVVIIYALVFLLSLLGNSL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 VVWLLAGRRGPRRLVDTFVLHLAAADLGFVLTLPLWAAAAALGGRWPFGDGLCKLSSFAL :. .. : : ..:...:.:: ::: :.::::.:::. . : : :: :::. :. CCDS24 VMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNG--WIFGTFLCKVVSLLK 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 AGTRCAGALLLAGMSVDRYLAVVKLLEARPLRTPRCALASCC-GVWAVALLAGLPSLVYR . .: :::: .:::::::.:. .: : : . : ..:...:: .:: :..: CCDS24 EVNFYSGILLLACISVDRYLAIVH--ATRTLTQKRYLVKFICLSIWGLSLLLALPVLLFR 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 GLQPLPGGQDSQCGEEPSHAFQGLSLLLLLLT----FVLPLVVTLFCYCRISRRLRRPPH .. . : :. .. . .:: .: :..::.. :::: : : . : CCDS24 RTV-YSSNVSPACYEDMGNNTANWRMLLRILPQSFGFIVPLLIMLFCYGFTLRTLFKA-H 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 VGRARRNSLRIIFAIESTFVGSWLPFSALRAVFHLARLGALPLPCPLLLALRWGLTIATC .:. .: ..:.:::. :. :::.. . . : : .. : . .: . CCDS24 MGQKHR-AMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQETCERRNHIDRALDATEI 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 LAFVNSCANPLIYLLLDRSFRARALDGACGRTGRLARRISSASSLSRDDSSVFRCRAQAA :....:: ::::: .. ..:: CCDS24 LGILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILAIHGLISKDSLPKDSRPSFVGSSSGHTSTTL 310 320 330 340 350 360 361 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 18:44:14 2016 done: Sun Nov 6 18:44:14 2016 Total Scan time: 3.240 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]