Result of FASTA (ccds) for pFN21AE2668
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2668, 1358 aa
  1>>>pF1KE2668     1358 - 1358 aa - 1358 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2418+/-0.00157; mu= 8.2901+/- 0.094
 mean_var=237.5930+/-43.926, 0's: 0 Z-trim(103.9): 169  B-trim: 41 in 2/51
 Lambda= 0.083207
 statistics sampled from 7465 (7628) to 7465 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.579), E-opt: 0.2 (0.234), width:  16
 Scan time:  4.700

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1318.1 TNR gene_id:7143|Hs108|chr1             (1358) 9150 1114.0       0
CCDS30943.1 TNN gene_id:63923|Hs108|chr1           (1299) 2701 339.8 2.9e-92
CCDS6811.1 TNC gene_id:3371|Hs108|chr9             (2201) 2044 261.2 2.3e-68
CCDS4736.1 TNXB gene_id:7148|Hs108|chr6            ( 673) 1456 190.1 1.8e-47
CCDS6983.1 FCN2 gene_id:2220|Hs108|chr9            ( 313)  726 102.1 2.6e-21
CCDS301.1 FCN3 gene_id:8547|Hs108|chr1             ( 288)  708 99.9 1.1e-20
CCDS6985.1 FCN1 gene_id:2219|Hs108|chr9            ( 326)  701 99.1 2.1e-20
CCDS300.1 FCN3 gene_id:8547|Hs108|chr1             ( 299)  698 98.7 2.5e-20
CCDS6868.1 ANGPTL2 gene_id:23452|Hs108|chr9        ( 493)  660 94.4 8.5e-19
CCDS6937.1 FIBCD1 gene_id:84929|Hs108|chr9         ( 461)  656 93.9 1.1e-18
CCDS1327.1 ANGPTL1 gene_id:9068|Hs108|chr1         ( 491)  640 92.0 4.5e-18
CCDS12224.1 ANGPTL6 gene_id:83854|Hs108|chr19      ( 470)  636 91.5   6e-18
CCDS128.1 ANGPTL7 gene_id:10218|Hs108|chr1         ( 346)  625 90.0 1.2e-17
CCDS11208.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17         ( 255)  597 86.5   1e-16
CCDS56023.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17         ( 279)  597 86.6 1.1e-16
CCDS47761.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8          ( 444)  579 84.6 6.7e-16
CCDS47762.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8          ( 495)  579 84.7 7.2e-16
CCDS5958.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8           ( 496)  579 84.7 7.2e-16
CCDS83313.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8          ( 298)  573 83.7 8.4e-16
CCDS56551.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8          ( 497)  574 84.1 1.1e-15
CCDS6306.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8           ( 498)  573 83.9 1.2e-15
CCDS13009.1 ANGPT4 gene_id:51378|Hs108|chr20       ( 503)  554 81.7 5.8e-15
CCDS5591.1 FGL2 gene_id:10875|Hs108|chr7           ( 439)  531 78.8 3.6e-14
CCDS81713.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12         (2127)  516 77.8 3.7e-13
CCDS55846.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12         (1907)  481 73.5 6.3e-12
CCDS44944.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12         (1997)  481 73.5 6.5e-12
CCDS44943.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12         (2215)  481 73.6   7e-12
CCDS55845.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12         (1907)  468 71.9 1.9e-11
CCDS46628.1 COL20A1 gene_id:57642|Hs108|chr20      (1284)  456 70.3 3.8e-11


>>CCDS1318.1 TNR gene_id:7143|Hs108|chr1                  (1358 aa)
 initn: 9150 init1: 9150 opt: 9150  Z-score: 5953.5  bits: 1114.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9150; 100.0% identity (100.0% similar) in 1358 aa overlap (1-1358:1-1358)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MGADGETVVLKNMLIGINLILLGSMIKPSECQLEVTTERVQRQSVEEEGGIANYNTSSKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MGADGETVVLKNMLIGINLILLGSMIKPSECQLEVTTERVQRQSVEEEGGIANYNTSSKE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 QPVVFNHVYNINVPLDNLCSSGLEASAEQEVSAEDETLAEYMGQTSDHESQVTFTHRINF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QPVVFNHVYNINVPLDNLCSSGLEASAEQEVSAEDETLAEYMGQTSDHESQVTFTHRINF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 PKKACPCASSAQVLQELLSRIEMLEREVSVLRDQCNANCCQESAATGQLDYIPHCSGHGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PKKACPCASSAQVLQELLSRIEMLEREVSVLRDQCNANCCQESAATGQLDYIPHCSGHGN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 FSFESCGCICNEGWFGKNCSEPYCPLGCSSRGVCVDGQCICDSEYSGDDCSELRCPTDCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FSFESCGCICNEGWFGKNCSEPYCPLGCSSRGVCVDGQCICDSEYSGDDCSELRCPTDCS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 SRGLCVDGECVCEEPYTGEDCRELRCPGDCSGKGRCANGTCLCEEGYVGEDCGQRQCLNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SRGLCVDGECVCEEPYTGEDCRELRCPGDCSGKGRCANGTCLCEEGYVGEDCGQRQCLNA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 CSGRGQCEEGLCVCEEGYQGPDCSAVAPPEDLRVAGISDRSIELEWDGPMAVTEYVISYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CSGRGQCEEGLCVCEEGYQGPDCSAVAPPEDLRVAGISDRSIELEWDGPMAVTEYVISYQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 PTALGGLQLQQRVPGDWSGVTITELEPGLTYNISVYAVISNILSLPITAKVATHLSTPQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PTALGGLQLQQRVPGDWSGVTITELEPGLTYNISVYAVISNILSLPITAKVATHLSTPQG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 LQFKTITETTVEVQWEPFSFSFDGWEISFIPKNNEGGVIAQVPSDVTSFNQTGLKPGEEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LQFKTITETTVEVQWEPFSFSFDGWEISFIPKNNEGGVIAQVPSDVTSFNQTGLKPGEEY
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 IVNVVALKEQARSPPTSASVSTVIDGPTQILVRDVSDTVAFVEWIPPRAKVDFILLKYGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IVNVVALKEQARSPPTSASVSTVIDGPTQILVRDVSDTVAFVEWIPPRAKVDFILLKYGL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 VGGEGGRTTFRLQPPLSQYSVQALRPGSRYEVSVSAVRGTNESDSATTQFTTEIDAPKNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VGGEGGRTTFRLQPPLSQYSVQALRPGSRYEVSVSAVRGTNESDSATTQFTTEIDAPKNL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 RVGSRTATSLDLEWDNSEAEVQEYKVVYSTLAGEQYHEVLVPRGIGPTTRATLTDLVPGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RVGSRTATSLDLEWDNSEAEVQEYKVVYSTLAGEQYHEVLVPRGIGPTTRATLTDLVPGT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 EYGVGISAVMNSQQSVPATMNARTELDSPRDLMVTASSETSISLIWTKASGPIDHYRITF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EYGVGISAVMNSQQSVPATMNARTELDSPRDLMVTASSETSISLIWTKASGPIDHYRITF
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 TPSSGIASEVTVPKDRTSYTLTDLEPGAEYIISVTAERGRQQSLESTVDAFTGFRPISHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TPSSGIASEVTVPKDRTSYTLTDLEPGAEYIISVTAERGRQQSLESTVDAFTGFRPISHL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 HFSHVTSSSVNITWSDPSPPADRLILNYSPRDEEEEMMEVSLDATKRHAVLMGLQPATEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HFSHVTSSSVNITWSDPSPPADRLILNYSPRDEEEEMMEVSLDATKRHAVLMGLQPATEY
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 IVNLVAVHGTVTSEPIVGSITTGIDPPKDITISNVTKDSVMVSWSPPVASFDYYRVSYRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IVNLVAVHGTVTSEPIVGSITTGIDPPKDITISNVTKDSVMVSWSPPVASFDYYRVSYRP
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE2 TQVGRLDSSVVPNTVTEFTITRLNPATEYEISLNSVRGREESERICTLVHTAMDNPVDLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TQVGRLDSSVVPNTVTEFTITRLNPATEYEISLNSVRGREESERICTLVHTAMDNPVDLI
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE2 ATNITPTEALLQWKAPVGEVENYVIVLTHFAVAGETILVDGVSEEFRLVDLLPSTHYTAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ATNITPTEALLQWKAPVGEVENYVIVLTHFAVAGETILVDGVSEEFRLVDLLPSTHYTAT
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE2 MYATNGPLTSGTISTNFSTLLDPPANLTASEVTRQSALISWQPPRAEIENYVLTYKSTDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MYATNGPLTSGTISTNFSTLLDPPANLTASEVTRQSALISWQPPRAEIENYVLTYKSTDG
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE2 SRKELIVDAEDTWIRLEGLLENTDYTVLLQAAQDTTWSSITSTAFTTGGRVFPHPQDCAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SRKELIVDAEDTWIRLEGLLENTDYTVLLQAAQDTTWSSITSTAFTTGGRVFPHPQDCAQ
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE2 HLMNGDTLSGVYPIFLNGELSQKLQVYCDMTTDGGGWIVFQRRQNGQTDFFRKWADYRVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HLMNGDTLSGVYPIFLNGELSQKLQVYCDMTTDGGGWIVFQRRQNGQTDFFRKWADYRVG
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE2 FGNVEDEFWLGLDNIHRITSQGRYELRVDMRDGQEAAFASYDRFSVEDSRNLYKLRIGSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FGNVEDEFWLGLDNIHRITSQGRYELRVDMRDGQEAAFASYDRFSVEDSRNLYKLRIGSY
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE2 NGTAGDSLSYHQGRPFSTEDRDNDVAVTNCAMSYKGAWWYKNCHRTNLNGKYGESRHSQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NGTAGDSLSYHQGRPFSTEDRDNDVAVTNCAMSYKGAWWYKNCHRTNLNGKYGESRHSQG
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350        
pF1KE2 INWYHWKGHEFSIPFVEMKMRPYNHRLMAGRKRQSLQF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 INWYHWKGHEFSIPFVEMKMRPYNHRLMAGRKRQSLQF
             1330      1340      1350        

>>CCDS30943.1 TNN gene_id:63923|Hs108|chr1                (1299 aa)
 initn: 2844 init1: 626 opt: 2701  Z-score: 1769.9  bits: 339.8 E(32554): 2.9e-92
Smith-Waterman score: 2898; 36.5% identity (64.8% similar) in 1317 aa overlap (57-1357:34-1293)

         30        40        50        60        70        80      
pF1KE2 KPSECQLEVTTERVQRQSVEEEGGIANYNTSSKEQPVVFNHVYNINVPLDNLCSSGLEAS
                                     :.::: :. .:.:.:.:: . :    ....
CCDS30 QEMFRFPMGLLLGSVLLVASAPATLEPPGCSNKEQQVTVSHTYKIDVPKSAL----VQVD
            10        20        30        40        50             

         90       100       110         120       130       140    
pF1KE2 AEQEVSAEDETLAEYMGQTSDHESQVTFTH--RINFPKKACPCASSAQVLQELLSRIEML
       :. .  ..: .    .:.. . :... : :  :.. :.: :  :.:   .:.::.:.. :
CCDS30 ADPQPLSDDGASLLALGEARE-EQNIIFRHNIRLQTPQKDCELAGS---VQDLLARVKKL
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pF1KE2 EREVSVLRDQCNAN-CCQESAATGQLDYIPHCSGHGNFSFESCGCICNEGWFGKNCSEPY
       :.:.  ...::.:. :::     :  :   ::::::.::.:.:.: :.::  :  : .  
CCDS30 EEEMVEMKEQCSAQRCCQ-----GVTDLSRHCSGHGTFSLETCSCHCEEGREGPACERLA
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pF1KE2 CPLGCSSRGVCVDGQCICDSEYSGDDCSELRCPTDCSSRGLCVDGECVCEEPYTGEDCRE
       :: .::..: ::::.:.:   : : ::.   :: .::..: :: : : :.: . .::: :
CCDS30 CPGACSGHGRCVDGRCLCHEPYVGADCGYPACPENCSGHGECVRGVCQCHEDFMSEDCSE
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pF1KE2 LRCPGDCSGKGRCANGTCLCEEGYVGEDCGQRQCLNACSGRGQCEEGLCVCEEGYQGPDC
        ::::::::.: : .: : ::::..: ::.:                             
CCDS30 KRCPGDCSGHGFCDTGECYCEEGFTGLDCAQ-----------------------------
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pF1KE2 SAVAPPEDLRVAGISDRSIELEWDGPMAVTEYVISYQPTA--LGGLQLQQRVPGDWSGVT
         :. :. :..   .. :. . :.    : .:..:: : .  :.: :.:  :: .  .  
CCDS30 --VVTPQGLQLLKNTEDSLLVSWEPSSQVDHYLLSYYPLGKELSGKQIQ--VPKEQHSYE
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pF1KE2 ITELEPGLTYNISVYAVISNILSLPITAKVATHLSTPQGLQFKTITETTVEVQWEPFSFS
       :  : ::  : ...  : ... : :    ..: :..         ::....:.::  :  
CCDS30 ILGLLPGTKYIVTLRNVKNEVSSSPQHLLATTDLAVLGTAWVTDETENSLDVEWENPSTE
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pF1KE2 FDGWEISFIPKNNEGGVIAQVP--SDVTS-FNQTGLKPGEEYIVNVVALKEQARSPPTSA
        : ... . : ...  . . ::  ::  : .. :::.:: :: ..:: .. . .. :   
CCDS30 VDYYKLRYGPMTGQEVAEVTVPKSSDPKSRYDITGLHPGTEYKITVVPMRGELEGKPILL
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pF1KE2 SVSTVIDGPTQILVRDVSDTVAFVEWIPPRAKVDFILLKYGLVGGEGGRTTFRLQPPLSQ
       .  : ::.::....  :.. .: : : : .: .:  ...:  ....:    . ..   :.
CCDS30 NGRTEIDSPTNVVTDRVTEDTATVSWDPVQAVIDKYVVRY--TSADGDTKEMAVHKDESS
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pF1KE2 YSVQALRPGSRYEVSVSAVRGTNESDSATTQFTTEIDAPKNLRVGSRTATSLDLEWDNSE
         . .:.::  :.: : : ::.. : .: :.  ::::.: :: .   : ..  . ::  .
CCDS30 TVLTGLKPGEAYKVYVWAERGNQGSKKADTNALTEIDSPANLVTDRVTENTATISWDPVQ
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CCDS30 ATIDKYVVRYTSADDQETREVLVGK---EQSSTVLTGLRPGVEYTVHVWAQKGDRESKKA
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pF1KE2 TMNARTELDSPRDLMVTASSETSISLIWTKASGPIDHYRITFTPSSGIASEVTVPKDRTS
         :: :..:::..:..   .:.  .. :  ... ::.: . .: ..: . :: : :...:
CCDS30 DTNAPTDIDSPKNLVTDRVTENMATVSWDPVQAAIDKYVVRYTSAGGETREVPVGKEQSS
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pF1KE2 YTLTDLEPGAEYIISVTAERGRQQSLESTVDAFTGFRPISHLHFSHVTSSSVNITWSDPS
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pF1KE2 PPADRLILNY-SPRDEEEEMMEVSLDATKRHAVLMGLQPATEYIVNLVAVHGTVTSEPIV
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CCDS30 ATIDRYVVRYTSAKDGETR--EVPVGKEQSSTVLTGLRPGVEYTVHVWAQKGAQESKKAD
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pF1KE2 GSITTGIDPPKDITISNVTKDSVMVSWSPPVASFDYYRVSYRPTQVGRLDSSVVPNTVTE
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CCDS30 TKAQTDIDSPQNLVTDWVTENTATVSWDPVQATIDRYVVHYTSAN-GETREVPVGKEQSS
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pF1KE2 FTITRLNPATEYEISLNSVRGREESERICTLVHTAMDNPVDLIATNITPTEALLQWKAPV
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pF1KE2 GEVENYVIVLTHFAVAGETILVDGVSEEFR---LVDLLPSTHYTATMYATNGPLTSGTIS
       . ...:..  :  .. :::  :  :..:     :. : :. .: . ..: .:   :   .
CCDS30 ATIDKYMVRYT--SADGETREVP-VGKEHSSTVLTGLRPGMEYMVHVWAQKGAQESKKAD
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pF1KE2 TNFSTLLDPPANLTASEVTRQSALISWQPPRAEIENYVLTYKSTDGSRKELIVDAEDTWI
       :. .: :::: ::  : ::.......: :: :.:..:.:::.  ::. ::. .  ::  .
CCDS30 TKAQTELDPPRNLRPSAVTQSGGILTWTPPSAQIHGYILTYQFPDGTVKEMQLGREDQRF
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pF1KE2 RLEGLLENTDYTVLLQAAQDTTWSSITSTAFTTGGRVFPHPQDCAQHLMNGDTLSGVYPI
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CCDS30 ALQGLEQGATYPVSLVAFKGGRRSRNVSTTLSTVGARFPHPSDCSQVQQNSNAASGLYTI
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pF1KE2 FLNGELSQKLQVYCDMTTDGGGWIVFQRRQNGQTDFFRKWADYRVGFGNVEDEFWLGLDN
       .:.:. :. ::::::: ::::::::::::..:: :::..: .:  :::.   :::::::.
CCDS30 YLHGDASRPLQVYCDMETDGGGWIVFQRRNTGQLDFFKRWRSYVEGFGDPMKEFWLGLDK
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pF1KE2 IHRITS--QGRYELRVDMRDGQEAAFASYDRFSVEDSRNLYKLRIGSYNGTAGDSLSYHQ
       .: .:.   .:::.:::.. ..:.:.: :: :.: .:.. ::: .:.: :::::.:.::.
CCDS30 LHNLTTGTPARYEVRVDLQTANESAYAIYDFFQVASSKERYKLTVGKYRGTAGDALTYHN
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pF1KE2 GRPFSTEDRDNDVAVTNCAMSYKGAWWYKNCHRTNLNGKYGESRHSQGINWYHWKGHEFS
       :  :.: :::::.:..:::....:.::::::: .: ::.:::..::.:.::  :::::::
CCDS30 GWKFTTFDRDNDIALSNCALTHHGGWWYKNCHLANPNGRYGETKHSEGVNWEPWKGHEFS
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pF1KE2 IPFVEMKMRP--YNHRLMAGRKRQSLQF     
       ::.::.:.::  :... . :::...:.      
CCDS30 IPYVELKIRPHGYSREPVLGRKKRTLRGRLRTF
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CCDS68 GRCVNGQCVCDEGYTGEDCSQLRCPNDCHSRGRCVEGKCVCEQGFKGYDCSDMSCPNDCH
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CCDS68 NDCHGQGRCVNGQCVCHEGFMGKDCKEQRCPSDCHGQGRCVDGQCICHEGFTGLDCGQHS
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CCDS68 CPSDCNNLGQCVSGRCICNEGYSGEDCSEVSPPKDLVVTEVTEETVNLAWDNEMRVTEYL
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CCDS68 VVYTPTHEGGLEMQFRVPGDQTSTIIQELEPGVEYFIRVFAILENKKSIPVSARVATYLP
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CCDS68 APEGLKFKSIKETSVEVEWDPLDIAFETWEIIFRNMNKEDEGEITKSLRRPETSYRQTGL
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CCDS68 APGQEYEISLHIVKNNTRGPGLKRVTTTRLDAPSQIEVKDVTDTTALITWFKPLAEIDGI
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CCDS68 ELTYGIKDVPGDRTTIDLTEDENQYSIGNLKPDTEYEVSLISRRGDMSSNPAKETFTTGL
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CCDS68 DAPRNLRRVSQTDNSITLEWRNGKAAIDSYRIKYAPISGGDHAEVDVPKSQQATTKTTLT
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CCDS68 GLRPGTEYGIGVSAVKEDKESNPATINAATELDTPKDLQVSETAETSLTLLWKTPLAKFD
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       .::....  .:    : .:.. :::.:  :::: :: . .:::.::..:  . : : :  
CCDS68 RYRLNYSLPTGQWVGVQLPRNTTSYVLRGLEPGQEYNVLLTAEKGRHKSKPARVKASTEQ
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pF1KE2 RP-ISHLHFSHVTSSSVNITWSDPSPPADRLILNYSPRDEEEEMMEVSLDATKRHAVLMG
        : . .:  ..:  ... ..:.  .   ...:.. .  .. :   .... .. : . . :
CCDS68 APELENLTVTEVGWDGLRLNWTAADQAYEHFIIQVQEANKVEAARNLTVPGSLRAVDIPG
          1080      1090      1100      1110      1120      1130   

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pF1KE2 LQPATEYIVNLVAVHGTVTSEPIVGSITTGIDPPKDITISNVTKDSVMVSWSPPVASFDY
       :. :: : :.. .:                                              
CCDS68 LKAATPYTVSIYGVIQGYRTPVLSAEASTGETPNLGEVVVAEVGWDALKLNWTAPEGAYE
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>--
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Smith-Waterman score: 2054; 33.6% identity (63.5% similar) in 1059 aa overlap (316-1355:1149-2201)

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pF1KE2 GYVGEDCGQRQCLNACSGRGQCEEGLCVCEEGYQGPDCSAVAP----PE--DLRVAGISD
                                     .::. :  :: :     :.  .. :: .. 
CCDS68 NLTVPGSLRAVDIPGLKAATPYTVSIYGVIQGYRTPVLSAEASTGETPNLGEVVVAEVGW
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pF1KE2 RSIELEWDGPMAVTEYV-ISYQPTALGGLQLQQRVPGDWSGVTITELEPGLTYNISVYAV
        ...:.: .: .. ::  :. : .       .  :::   .. .  :. .  :.:.. .:
CCDS68 DALKLNWTAPEGAYEYFFIQVQEADTVEAAQNLTVPGGLRSTDLPGLKAATHYTITIRGV
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pF1KE2 ISNILSLPITAKVATHLSTPQG-LQFKTITETTVEVQWEPFSFSFDGWEISFIPKNN-EG
        ... . :....: :.    .: :    ..  .....:   . ..: . :.    .. : 
CCDS68 TQDFSTTPLSVEVLTEEVPDMGNLTVTEVSWDALRLNWTTPDGTYDQFTIQVQEADQVEE
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pF1KE2 GVIAQVPSDVTSFNQTGLKPGEEYIVNVVALKEQARSPPTSASVSTVIDGPT--QILVRD
       .    ::... :..  ::. :  : :.. .  .   . : .. : :  : :   .. : .
CCDS68 AHNLTVPGSLRSMEIPGLRAGTPYTVTLHGEVRGHSTRPLAVEVVTE-DLPQLGDLAVSE
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pF1KE2 VSDTVAFVEWIPPRAKVDFILLKYGLVGGEGGRTTFRLQPPLSQYSVQALRPGSRYEVSV
       :.     ..:       . ....   :.   .  .. :   :   .. .:. .. :.::.
CCDS68 VGWDGLRLNWTAADNAYEHFVIQVQEVNKVEAAQNLTLPGSLRAVDIPGLEAATPYRVSI
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pF1KE2 -SAVRGTNE---SDSATTQFTTEIDAPKNLRVGSRTATSLDLEWDNSEAEVQEYKVVYST
        ...::      :  :.:    ::    :: :.. :  :..: :  ...  . . .    
CCDS68 YGVIRGYRTPVLSAEASTAKEPEIG---NLNVSDITPESFNLSWMATDGIFETFTI--EI
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pF1KE2 LAGEQYHEVLVPRGIGPTTRATLTDLVPGTEYGVGISAVMNSQQSVPATMNARTE-LDSP
       . ...  :..     :    : .. : :.:.. : .:..  : ..   . .: :: :   
CCDS68 IDSNRLLETVEYNISGAERTAHISGLPPSTDFIVYLSGLAPSIRTKTISATATTEALPLL
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pF1KE2 RDLMVTASSETSISLIWTKASGPIDHYRITFTPSSGI--ASEVTVPKDRTSYTLTDLEPG
       ..: ..  .  .... :  . . .: . .: . :. .   .: :.   . .  :  :  :
CCDS68 ENLTISDINPYGFTVSWMASENAFDSFLVTVVDSGKLLDPQEFTLSGTQRKLELRGLITG
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pF1KE2 AEYIISVTAERGRQQSLESTVDAFTGFRP-ISHLHFSHVTSSSVNITWSDPSPPADRLIL
         : . :..    .:.    ..  :  .: ...:  : .: ..  ..:.      : ..:
CCDS68 IGYEVMVSGFTQGHQTKPLRAEIVTEAEPEVDNLLVSDATPDGFRLSWTADEGVFDNFVL
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pF1KE2 NYSPRDEEEEMMEVSLDATKRHAVLMGLQPATEYIVNLVAVHGTVTSEPIVGSITTGIDP
       .     .. : .:..: : .:   . ::. :::: ..: ..     :. . .  ::..  
CCDS68 KIRDTKKQSEPLEITLLAPERTRDITGLREATEYEIELYGISKGRRSQTVSAIATTAMGS
           1660      1670      1680      1690      1700      1710  

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pF1KE2 PKDITISNVTKDSVMVSWSPPVASFDYYRVSYRPTQVGRLDSSVVPNTVTEFTITRLNPA
       ::.. .:..:..:. :::  :.:. . .:..: :   :  .  .: .: :.  ...: :.
CCDS68 PKEVIFSDITENSATVSWRAPTAQVESFRITYVPITGGTPSMVTVDGTKTQTRLVKLIPG
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pF1KE2 TEYEISLNSVRGREESERICTLVHTAMDNPVDLIATNITPTEALLQWKAPVGEVENYVIV
       .:: .:. ...: :::: .     ::.:.:  :...::: .::: .:.  .. :..::: 
CCDS68 VEYLVSIIAMKGFEESEPVSGSFTTALDGPSGLVTANITDSEALARWQPAIATVDSYVIS
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pF1KE2 LTHFAVAGETILVDGVSEEFRLVDLLPSTHYTATMYATNGPLTSGTISTNFSTLLDPPAN
        :   :   :  :.: . :. :.:: :.:.::  ..: .::  :.::...:.: :: : .
CCDS68 YTGEKVPEITRTVSGNTVEYALTDLEPATEYTLRIFAEKGPQKSSTITAKFTTDLDSPRD
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pF1KE2 LTASEVTRQSALISWQPPRAEIENYVLTYKSTDGSRKELIVDAEDTWIRLEGLLENTDYT
       :::.::  ..::..:.:::: . .:.:.:.:.::. ::.::  . :   :  :  .: ::
CCDS68 LTATEVQSETALLTWRPPRASVTGYLLVYESVDGTVKEVIVGPDTTSYSLADLSPSTHYT
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pF1KE2 VLLQAAQDTTWSSITSTAFTTGGRVFPHPQDCAQHLMNGDTLSGVYPIFLNGELSQKLQV
       . .:: .    :.. .: ::: : ..: :.::.: ..:::: ::.: :.:::. .. :.:
CCDS68 AKIQALNGPLRSNMIQTIFTTIGLLYPFPKDCSQAMLNGDTTSGLYTIYLNGDKAEALEV
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pF1KE2 YCDMTTDGGGWIVFQRRQNGQTDFFRKWADYRVGFGNVEDEFWLGLDNIHRITSQGRYEL
       .::::.:::::::: ::.::. .:...:  : .:::. ..::::::::...::.::.:::
CCDS68 FCDMTSDGGGWIVFLRRKNGRENFYQNWKAYAAGFGDRREEFWLGLDNLNKITAQGQYEL
           2020      2030      2040      2050      2060      2070  

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pF1KE2 RVDMRDGQEAAFASYDRFSVEDSRNLYKLRIGSYNGTAGDSLSYHQGRPFSTEDRDNDVA
       :::.::  :.::: ::.::: :... :::.. .:.::::::..::.:: ::: :.:.: :
CCDS68 RVDLRDHGETAFAVYDKFSVGDAKTRYKLKVEGYSGTAGDSMAYHNGRSFSTFDKDTDSA
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pF1KE2 VTNCAMSYKGAWWYKNCHRTNLNGKYGESRHSQGINWYHWKGHEFSIPFVEMKMRPYNHR
       .::::.:::::.::.::::.:: :.::.. ::::.::.:::::: :: :.:::.:: : :
CCDS68 ITNCALSYKGAFWYRNCHRVNLMGRYGDNNHSQGVNWFHWKGHEHSIQFAEMKLRPSNFR
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pF1KE2 LMAGRKRQSLQF
        . ::....   
CCDS68 NLEGRRKRA   
           2200    

>--
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pF1KE2 VLKNMLIGINLILLGSMIKPSECQLEVTTERVQRQSVEEEGGIANYNTSSKEQPVVFNHV
                                     : .:::     :. : .   ..::::::::
CCDS68  MGAMTQLLAGVFLAFLALATEGGVLKKVIRHKRQS-----GV-NATLPEENQPVVFNHV
                10        20        30              40        50   

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pF1KE2 YNINVPLDNLCSSGLE-ASAEQEVSAEDETLAEYMGQTSDHESQVTFTHRINFPKKACPC
       :::..:. . ::  :: ::.:....  .:    .. .: : :.:..::::::.:..:: :
CCDS68 YNIKLPVGSQCSVDLESASGEKDLAPPSEPSESFQEHTVDGENQIVFTHRINIPRRACGC
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pF1KE2 ASSAQVLQELLSRIEMLEREVSVLRDQCNAN--CCQESAATGQLDYIPHCSGHGNFSFES
       :.. .: .:::::.: ::  :: ::.::.:.  :: . : ::.::  : :::.:::: :.
CCDS68 AAAPDV-KELLSRLEELENLVSSLREQCTAGAGCCLQPA-TGRLDTRPFCSGRGNFSTEG
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pF1KE2 CGCICNEGWFGKNCSEPYCPLGCSSRGVCVDGQCICDSEYSGDDCSELRCPTDCSSRGLC
       :::.:. :: : ::::: :: .:  :: :.:::::::. ..:.:::.: ::.::...: :
CCDS68 CGCVCEPGWKGPNCSEPECPGNCHLRGRCIDGQCICDDGFTGEDCSQLACPSDCNDQGKC
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       :.: :.: : :.: :: .  ::  :: . : :..: :.:..:..:.::..  ::: : .:
CCDS68 VNGVCICFEGYAGADCSREICPVPCSEEHGTCVDGLCVCHDGFAGDDCNKPLCLNNCYNR
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pF1KE2 GQCEEGLCVCEEGYQGPDCSAVAPPEDLRVAGISDRSIELEWDGPMAVTEYVISYQPTAL
       :.: :. :::.::. : ::: .  :.:                                 
CCDS68 GRCVENECVCDEGFTGEDCSELICPNDCFDRGRCINGTCYCEEGFTGEDCGKPTCPHACH
             300       310       320       330       340       350 

>--
 initn: 563 init1: 563 opt: 588  Z-score: 396.3  bits: 86.4 E(32554): 9.5e-16
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pF1KE2 NCCQESAATGQLDYIPHCSGHGNFSFESCGCICNEGWFGKNCSEPYCPLGCSSRGVCVDG
                                     : :.::. :..:..: :: .: ..: : .:
CCDS68 VCDEGFTGEDCSELICPNDCFDRGRCINGTCYCEEGFTGEDCGKPTCPHACHTQGRCEEG
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pF1KE2 QCICDSEYSGDDCSELRCPTDCSSRGLCVDGECVCEEPYTGEDCRELRCPGDCSGKGRCA
       ::.::  ..: :::: :::.:: .:: ::::.: :.. .:: :: ::.::. :::.:::.
CCDS68 QCVCDEGFAGVDCSEKRCPADCHNRGRCVDGRCECDDGFTGADCGELKCPNGCSGHGRCV
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pF1KE2 NGTCLCEEGYVGEDCGQRQCLNACSGRGQCEEGLCVCEEGYQGPDCSAVAPPEDLRVAGI
       :: :.:.:::.::::.: .: : :                                    
CCDS68 NGQCVCDEGYTGEDCSQLRCPNDCHSRGRCVEGKCVCEQGFKGYDCSDMSCPNDCHQHGR
     420       430       440       450       460       470         

>>CCDS4736.1 TNXB gene_id:7148|Hs108|chr6                 (673 aa)
 initn: 1410 init1: 1410 opt: 1456  Z-score: 965.7  bits: 190.1 E(32554): 1.8e-47
Smith-Waterman score: 1566; 37.5% identity (66.4% similar) in 672 aa overlap (702-1350:1-671)

             680       690       700       710       720       730 
pF1KE2 SQQSVPATMNARTELDSPRDLMVTASSETSISLIWTKASGPIDHYRITFTPSSGIASEVT
                                     . : :. :.::.: . . .  ..:  . . 
CCDS47                               MRLSWSVAQGPFDSFVVQYEDTNGQPQALL
                                             10        20        30

             740       750        760       770                    
pF1KE2 VPKDRTSYTLTDLEPGAEY-IISVTAERGRQQSLESTVDAFTGFRP-----------ISH
       :  :...  .. :::.. : ..    ..:.. .  :. .. ::. :           .:.
CCDS47 VDGDQSKILISGLEPSTPYRFLLYGLHEGKRLGPLSA-EGTTGLAPAGQTSEESRPRLSQ
               40        50        60         70        80         

     780       790       800          810            820       830 
pF1KE2 LHFSHVTSSSVNITWSDPSPPADRLILNY---SPRDEEEE-----MMEVSLDATKRHAVL
       :  . ::.::. ..:  :    : ..: .   ::   : .     . :. . .:.. :::
CCDS47 LSVTDVTTSSLRLNWEAPPGAFDSFLLRFGVPSPSTLEPHPRPLLQRELMVPGTRHSAVL
      90       100       110       120       130       140         

             840       850       860          870       880        
pF1KE2 MGLQPATEYIVNLVAVHGTVTSEPIVGSITTG---IDPPKDITISNVTKDSVMVSWSPPV
         :. .: : ..: ...:   .. : :.  :    .. :.:. .:.. . :. :.: :: 
CCDS47 RDLRSGTLYSLTLYGLRGPHKADSIQGTARTLSPVLESPRDLQFSEIRETSAKVNWMPPP
     150       160       170       180       190       200         

      890       900       910       920       930       940        
pF1KE2 ASFDYYRVSYRPTQVGRLDSSVVPNTVTEFTITRLNPATEYEISLNSVRGREESERICTL
       .  : ..:::. .. :. .:  : . .    .  : :...::... :::: :::: .  .
CCDS47 SRADSFKVSYQLADGGEPQSVQVDGQARTQKLQGLIPGARYEVTVVSVRGFEESEPLTGF
     210       220       230       240       250       260         

      950       960       970       980       990      1000        
pF1KE2 VHTAMDNPVDLIATNITPTEALLQWKAPVGEVENYVIVLTHFAVAGETILVDGVSEEFRL
       . :. :.:..: : :.:   :.:.:: : . :..: . .:  ..      . : . .. :
CCDS47 LTTVPDGPTQLRALNLTEGFAVLHWKPPQNPVDTYDVQVTAPGAPPLQAETPGSAVDYPL
     270       280       290       300       310       320         

     1010      1020      1030      1040      1050      1060        
pF1KE2 VDLLPSTHYTATMYATNGPLTSGTISTNFSTLLDPPANLTASEVTRQSALISWQPPRAEI
        ::.  :.::::. .  ::  ..  : .:.: :. : .: :.::: ..::..:  : .. 
CCDS47 HDLVLHTNYTATVRGLRGPNLTSPASITFTTGLEAPRDLEAKEVTPRTALLTWTEPPVRP
     330       340       350       360       370       380         

     1070      1080      1090      1100      1110      1120        
pF1KE2 ENYVLTYKSTDGSRKELIVDAEDTWIRLEGLLENTDYTVLLQAAQDTTWSSITSTAFTTG
        .:.:....  :. .:... .  :  .: ::. .:.:.. :::    .    .::.::::
CCDS47 AGYLLSFHTPGGQNQEILLPGGITSHQLLGLFPSTSYNARLQAMWGQSLLPPVSTSFTTG
     390       400       410       420       430       440         

     1130      1140      1150      1160      1170      1180        
pF1KE2 GRVFPHPQDCAQHLMNGDTLSGVYPIFLNGELSQKLQVYCDMTTDGGGWIVFQRRQNGQT
       :  .: :.::.....::   : .  :::::.  . :.:.::: ::::::.:::::..:::
CCDS47 GLRIPFPRDCGEEMQNGAGASRTSTIFLNGNRERPLNVFCDMETDGGGWLVFQRRMDGQT
     450       460       470       480       490       500         

     1190      1200      1210      1220      1230      1240        
pF1KE2 DFFRKWADYRVGFGNVEDEFWLGLDNIHRITSQGRYELRVDMRDGQEAAFASYDRFSVED
       ::.: : ::  ::::.  ::::: . .: .:. : : .:::.: :.::.::.:: : :..
CCDS47 DFWRDWEDYAHGFGNISGEFWLGNEALHSLTQAGDYSMRVDLRAGDEAVFAQYDSFHVDS
     510       520       530       540       550       560         

     1250      1260      1270      1280      1290      1300        
pF1KE2 SRNLYKLRIGSYNGTAGDSLSYHQGRPFSTEDRDNDVAVTNCAMSYKGAWWYKNCHRTNL
       . . :.:.. .:.::::::.:::.:  ::..::: .  . .::.::.:::::.::: .::
CCDS47 AAEYYRLHLEGYHGTAGDSMSYHSGSVFSARDRDPNSLLISCAVSYRGAWWYRNCHYANL
     570       580       590       600       610       620         

     1310      1320      1330      1340      1350        
pF1KE2 NGKYGESRHSQGINWYHWKGHEFSIPFVEMKMRPYNHRLMAGRKRQSLQF
       :: :: .   ::..:::::: :::.::.:::.:: : :  ::        
CCDS47 NGLYGSTVDHQGVSWYHWKGFEFSVPFTEMKLRPRNFRSPAGGG      
     630       640       650       660       670         

>>CCDS6983.1 FCN2 gene_id:2220|Hs108|chr9                 (313 aa)
 initn: 586 init1: 315 opt: 726  Z-score: 496.2  bits: 102.1 E(32554): 2.6e-21
Smith-Waterman score: 726; 49.8% identity (71.8% similar) in 213 aa overlap (1135-1342:102-312)

         1110      1120      1130      1140      1150      1160    
pF1KE2 YTVLLQAAQDTTWSSITSTAFTTGGRVFPHPQDCAQHLMNGDTLSGVYPIFLNGELSQKL
                                     :. : . :  :  ::: . :.:     . :
CCDS69 GERGPPGPPGKAGPPGPNGAPGEPQPCLTGPRTCKDLLDRGHFLSGWHTIYLPD--CRPL
              80        90       100       110       120           

         1170      1180      1190      1200      1210      1220    
pF1KE2 QVYCDMTTDGGGWIVFQRRQNGQTDFFRKWADYRVGFGNVEDEFWLGLDNIHRITSQGRY
        : ::: :::::: ::::: .:..::.: :: :. :::.   ::::: :::: .:.::  
CCDS69 TVLCDMDTDGGGWTVFQRRVDGSVDFYRDWATYKQGFGSRLGEFWLGNDNIHALTAQGTS
     130       140       150       160       170       180         

         1230       1240      1250      1260       1270      1280  
pF1KE2 ELRVDMRDGQEA-AFASYDRFSVEDSRNLYKLRIGSY-NGTAGDSLSYHQGRPFSTEDRD
       :::::. : ..   ::.:  :.: :  . :.: .:.. .:.:::::..:... :::.:.:
CCDS69 ELRVDLVDFEDNYQFAKYRSFKVADEAEKYNLVLGAFVEGSAGDSLTFHNNQSFSTKDQD
     190       200       210       220       230       240         

           1290      1300      1310         1320      1330         
pF1KE2 NDVAVTNCAMSYKGAWWYKNCHRTNLNGKYGESRH---SQGINWYHWKGHEFSIPFVEMK
       ::. . :::. ..::::::::: .::::.: .. :   ..::::   ::...:    :::
CCDS69 NDLNTGNCAVMFQGAWWYKNCHVSNLNGRYLRGTHGSFANGINWKSGKGYNYSYKVSEMK
     250       260       270       280       290       300         

    1340      1350        
pF1KE2 MRPYNHRLMAGRKRQSLQF
       .::                
CCDS69 VRPA               
     310                  

>>CCDS301.1 FCN3 gene_id:8547|Hs108|chr1                  (288 aa)
 initn: 578 init1: 338 opt: 708  Z-score: 485.0  bits: 99.9 E(32554): 1.1e-20
Smith-Waterman score: 708; 47.5% identity (72.6% similar) in 219 aa overlap (1128-1341:72-288)

      1100      1110      1120      1130      1140      1150       
pF1KE2 GLLENTDYTVLLQAAQDTTWSSITSTAFTTGGRVFPHPQDCAQHLMNGDTLSGVYPIFLN
                                     : .  : :..: . : .: :::: : . : 
CCDS30 LLPSCPGAPGSPGEKGAPGPQGPPGPPGKMGPKGEPGPRNCRELLSQGATLSGWYHLCL-
              50        60        70        80        90       100 

      1160      1170      1180      1190      1200      1210       
pF1KE2 GELSQKLQVYCDMTTDGGGWIVFQRRQNGQTDFFRKWADYRVGFGNVEDEFWLGLDNIHR
          .. : :.::: :.::::.::::::.:..::::.:..::.:::: :.::::: .:.:.
CCDS30 -PEGRALPVFCDMDTEGGGWLVFQRRQDGSVDFFRSWSSYRAGFGNQESEFWLGNENLHQ
               110       120       130       140       150         

      1220      1230       1240      1250      1260       1270     
pF1KE2 ITSQGRYELRVDMRD-GQEAAFASYDRFSVEDSRNLYKLRIGSYN-GTAGDSLSYHQGRP
       .: :: .::::...: . . .:: :  : .    . :.: .:... :::::::: :.:::
CCDS30 LTLQGNWELRVELEDFNGNRTFAHYATFRLLGEVDHYQLALGKFSEGTAGDSLSLHSGRP
     160       170       180       190       200       210         

        1280      1290      1300      1310         1320      1330  
pF1KE2 FSTEDRDNDVAVTNCAMSYKGAWWYKNCHRTNLNGKYGESR---HSQGINWYHWKGHEFS
       :.: : :.: . .:::.  .::::: .:.:.::::.:. :.   :. ::.:   .:    
CCDS30 FTTYDADHDSSNSNCAVIVHGAWWYASCYRSNLNGRYAVSEAAAHKYGIDWASGRGVGHP
     220       230       240       250       260       270         

           1340      1350        
pF1KE2 IPFVEMKMRPYNHRLMAGRKRQSLQF
          :.: .:                 
CCDS30 YRRVRMMLR                 
     280                         

>>CCDS6985.1 FCN1 gene_id:2219|Hs108|chr9                 (326 aa)
 initn: 600 init1: 317 opt: 701  Z-score: 479.8  bits: 99.1 E(32554): 2.1e-20
Smith-Waterman score: 701; 49.3% identity (70.9% similar) in 213 aa overlap (1135-1342:115-325)

         1110      1120      1130      1140      1150      1160    
pF1KE2 YTVLLQAAQDTTWSSITSTAFTTGGRVFPHPQDCAQHLMNGDTLSGVYPIFLNGELSQKL
                                     :..: . :  :  ::: . :.:     . :
CCDS69 GPVGPKGDRGEKGMRGEKGDAGQSQSCATGPRNCKDLLDRGYFLSGWHTIYLPD--CRPL
           90       100       110       120       130         140  

         1170      1180      1190      1200      1210      1220    
pF1KE2 QVYCDMTTDGGGWIVFQRRQNGQTDFFRKWADYRVGFGNVEDEFWLGLDNIHRITSQGRY
        : ::: :::::: :::::..:..::.: :: :. :::.   ::::: :::: .:.::  
CCDS69 TVLCDMDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFYRDWAAYKQGFGSQLGEFWLGNDNIHALTAQGSS
            150       160       170       180       190       200  

         1230       1240      1250      1260       1270      1280  
pF1KE2 ELRVDMRDGQ-EAAFASYDRFSVEDSRNLYKLRIGSY-NGTAGDSLSYHQGRPFSTEDRD
       :::::. : . .  ::.:  :.: :  . ::: .:.. .:.::.::. :..  :::.:.:
CCDS69 ELRVDLVDFEGNHQFAKYKSFKVADEAEKYKLVLGAFVGGSAGNSLTGHNNNFFSTKDQD
            210       220       230       240       250       260  

           1290      1300      1310         1320      1330         
pF1KE2 NDVAVTNCAMSYKGAWWYKNCHRTNLNGKYGESRH---SQGINWYHWKGHEFSIPFVEMK
       :::. .::: ...::::: .:: .:::: :  . :   ..::::   ::...:    :::
CCDS69 NDVSSSNCAEKFQGAWWYADCHASNLNGLYLMGPHESYANGINWSAAKGYKYSYKVSEMK
            270       280       290       300       310       320  

    1340      1350        
pF1KE2 MRPYNHRLMAGRKRQSLQF
       .::                
CCDS69 VRPA               
                          

>>CCDS300.1 FCN3 gene_id:8547|Hs108|chr1                  (299 aa)
 initn: 614 init1: 338 opt: 698  Z-score: 478.3  bits: 98.7 E(32554): 2.5e-20
Smith-Waterman score: 698; 48.1% identity (73.6% similar) in 212 aa overlap (1135-1341:90-299)

         1110      1120      1130      1140      1150      1160    
pF1KE2 YTVLLQAAQDTTWSSITSTAFTTGGRVFPHPQDCAQHLMNGDTLSGVYPIFLNGELSQKL
                                     :..: . : .: :::: : . :    .. :
CCDS30 GPQGPPGPPGKMGPKGEPGDPVNLLRCQEGPRNCRELLSQGATLSGWYHLCL--PEGRAL
      60        70        80        90       100       110         

         1170      1180      1190      1200      1210      1220    
pF1KE2 QVYCDMTTDGGGWIVFQRRQNGQTDFFRKWADYRVGFGNVEDEFWLGLDNIHRITSQGRY
        :.::: :.::::.::::::.:..::::.:..::.:::: :.::::: .:.:..: :: .
CCDS30 PVFCDMDTEGGGWLVFQRRQDGSVDFFRSWSSYRAGFGNQESEFWLGNENLHQLTLQGNW
       120       130       140       150       160       170       

         1230       1240      1250      1260       1270      1280  
pF1KE2 ELRVDMRD-GQEAAFASYDRFSVEDSRNLYKLRIGSYN-GTAGDSLSYHQGRPFSTEDRD
       ::::...: . . .:: :  : .    . :.: .:... :::::::: :.::::.: : :
CCDS30 ELRVELEDFNGNRTFAHYATFRLLGEVDHYQLALGKFSEGTAGDSLSLHSGRPFTTYDAD
       180       190       200       210       220       230       

           1290      1300      1310         1320      1330         
pF1KE2 NDVAVTNCAMSYKGAWWYKNCHRTNLNGKYGESR---HSQGINWYHWKGHEFSIPFVEMK
       .: . .:::.  .::::: .:.:.::::.:. :.   :. ::.:   .:       :.: 
CCDS30 HDSSNSNCAVIVHGAWWYASCYRSNLNGRYAVSEAAAHKYGIDWASGRGVGHPYRRVRMM
       240       250       260       270       280       290       

    1340      1350        
pF1KE2 MRPYNHRLMAGRKRQSLQF
       .:                 
CCDS30 LR                 
                          

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CCDS68 PPTYNRIINQISTNEIQSDQNLKVLPPPLPTMPTLTSLPSSTDKPSGPW-RDCLQALEDG
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       . :.::::.::. .:.:: :.: : :.: . . .:: :  : .:   . ::::.: :.:.
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       .:. : ...:  .:.  : : .::                
CCDS68 DGVYWAEFRGGSYSLKKVVMMIRPNPNTFH          
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>>CCDS6937.1 FIBCD1 gene_id:84929|Hs108|chr9              (461 aa)
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pF1KE2 NGELSQKLQVYCDMTTDGGGWIVFQRRQNGQTDFFRKWADYRVGFGNVEDEFWLGLDNIH
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CCDS69 PTHYPAGFQVYCDMRTDGGGWTVFQRREDGSVNFFRGWDAYRDGFGRLTGEHWLGLKRIH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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