Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6267
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6267, 301 aa
1>>>pF1KE6267 301 - 301 aa - 301 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5033+/-0.000366; mu= 19.9702+/- 0.023
mean_var=63.8926+/-13.127, 0's: 0 Z-trim(113.5): 37 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.160453
statistics sampled from 22887 (22924) to 22887 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.631), E-opt: 0.2 (0.269), width: 16
Scan time: 6.790
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_536354 (OMIM: 606578) aquaporin-10 [Homo sapien ( 301) 1981 467.2 1.8e-131
XP_011508406 (OMIM: 606578) PREDICTED: aquaporin-1 ( 302) 1969 464.4 1.2e-130
NP_066190 (OMIM: 602914) aquaporin-9 isoform 1 [Ho ( 295) 960 230.8 2.5e-60
NP_004916 (OMIM: 600170,607457) aquaporin-3 isofor ( 292) 937 225.5 9.7e-59
NP_001307565 (OMIM: 602914) aquaporin-9 isoform 3 ( 230) 846 204.4 1.8e-52
XP_016870189 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 341) 802 194.3 2.8e-49
NP_001161 (OMIM: 602974,614411) aquaporin-7 isofor ( 342) 802 194.3 2.8e-49
XP_005251510 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 342) 802 194.3 2.8e-49
XP_011516168 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 342) 802 194.3 2.8e-49
XP_006716828 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 285) 738 179.4 7.1e-45
XP_011516169 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 285) 738 179.4 7.1e-45
XP_016870193 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 250) 665 162.5 7.8e-40
XP_016870192 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 250) 665 162.5 7.8e-40
XP_016870190 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 250) 665 162.5 7.8e-40
XP_016870191 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 250) 665 162.5 7.8e-40
XP_016870194 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 250) 665 162.5 7.8e-40
NP_001305086 (OMIM: 602974,614411) aquaporin-7 iso ( 256) 656 160.4 3.4e-39
NP_001305087 (OMIM: 602974,614411) aquaporin-7 iso ( 257) 656 160.4 3.4e-39
NP_001305085 (OMIM: 602974,614411) aquaporin-7 iso ( 216) 615 150.9 2.1e-36
XP_016870195 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 200) 592 145.5 8.1e-35
NP_001307564 (OMIM: 602914) aquaporin-9 isoform 2 ( 193) 514 127.4 2.2e-29
NP_001305073 (OMIM: 600170,607457) aquaporin-3 iso ( 237) 513 127.3 2.9e-29
NP_001160 (OMIM: 603750) aquaporin-8 [Homo sapiens ( 261) 154 44.2 0.00033
XP_011544124 (OMIM: 603750) PREDICTED: aquaporin-8 ( 262) 154 44.2 0.00033
NP_001304316 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform de ( 296) 150 43.3 0.00068
NP_004019 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform M23 [ ( 301) 150 43.3 0.00069
XP_011524244 (OMIM: 600308) PREDICTED: aquaporin-4 ( 316) 150 43.4 0.00072
NP_001641 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform M1 [H ( 323) 150 43.4 0.00073
NP_001304313 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform M1 ( 352) 150 43.4 0.00077
XP_005268895 (OMIM: 600442) PREDICTED: aquaporin-5 ( 222) 144 41.8 0.0015
NP_001642 (OMIM: 600442) aquaporin-5 [Homo sapiens ( 265) 144 41.9 0.0017
NP_000477 (OMIM: 107777,125800) aquaporin-2 [Homo ( 271) 143 41.7 0.002
>>NP_536354 (OMIM: 606578) aquaporin-10 [Homo sapiens] (301 aa)
initn: 1981 init1: 1981 opt: 1981 Z-score: 2481.4 bits: 467.2 E(85289): 1.8e-131
Smith-Waterman score: 1981; 99.7% identity (100.0% similar) in 301 aa overlap (1-301:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MVFTQAPAEIMGHLRIRSLLARQCLAEFLGVFVLMLLTQGAVAQAVTSGETKGNFFTMFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_536 MVFTQAPAEIMGHLRIRSLLARQCLAEFLGVFVLMLLTQGAVAQAVTSGETKGNFFTMFL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AGSLAVTIAIYVGGNVSGAHLNPAFSLAMCIVGRLPWVKLPIYILVQLLSAFCASGATYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_536 AGSLAVTIAIYVGGNVSGAHLNPAFSLAMCIVGRLPWVKLPIYILVQLLSAFCASGATYV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LYYDALQNYTGGNLTVTGPKETASIFATYPAPYLSLNNGFLDQVLGTGMLIVGLLAILDR
::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_536 LYHDALQNYTGGNLTVTGPKETASIFATYPAPYLSLNNGFLDQVLGTGMLIVGLLAILDR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RNKGVPAGLEPVVVGMLILALGLSMGANCGIPLNPARDLGPRLFTYVAGWGPEVFSAGNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_536 RNKGVPAGLEPVVVGMLILALGLSMGANCGIPLNPARDLGPRLFTYVAGWGPEVFSAGNG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 WWWVPVVAPLVGATVGTATYQLLVALHHPEGPEPAQDLVSAQHKASELETPASAQMLECK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_536 WWWVPVVAPLVGATVGTATYQLLVALHHPEGPEPAQDLVSAQHKASELETPASAQMLECK
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 L
:
NP_536 L
>>XP_011508406 (OMIM: 606578) PREDICTED: aquaporin-10 is (302 aa)
initn: 1759 init1: 1759 opt: 1969 Z-score: 2466.4 bits: 464.4 E(85289): 1.2e-130
Smith-Waterman score: 1969; 99.3% identity (99.7% similar) in 302 aa overlap (1-301:1-302)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MVFTQAPAEIMGHLRIRSLLARQCLAEFLGVFVLM-LLTQGAVAQAVTSGETKGNFFTMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
XP_011 MVFTQAPAEIMGHLRIRSLLARQCLAEFLGVFVLMQLLTQGAVAQAVTSGETKGNFFTMF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 LAGSLAVTIAIYVGGNVSGAHLNPAFSLAMCIVGRLPWVKLPIYILVQLLSAFCASGATY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LAGSLAVTIAIYVGGNVSGAHLNPAFSLAMCIVGRLPWVKLPIYILVQLLSAFCASGATY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 VLYYDALQNYTGGNLTVTGPKETASIFATYPAPYLSLNNGFLDQVLGTGMLIVGLLAILD
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VLYHDALQNYTGGNLTVTGPKETASIFATYPAPYLSLNNGFLDQVLGTGMLIVGLLAILD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 RRNKGVPAGLEPVVVGMLILALGLSMGANCGIPLNPARDLGPRLFTYVAGWGPEVFSAGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RRNKGVPAGLEPVVVGMLILALGLSMGANCGIPLNPARDLGPRLFTYVAGWGPEVFSAGN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 GWWWVPVVAPLVGATVGTATYQLLVALHHPEGPEPAQDLVSAQHKASELETPASAQMLEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GWWWVPVVAPLVGATVGTATYQLLVALHHPEGPEPAQDLVSAQHKASELETPASAQMLEC
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE6 KL
::
XP_011 KL
>>NP_066190 (OMIM: 602914) aquaporin-9 isoform 1 [Homo s (295 aa)
initn: 958 init1: 958 opt: 960 Z-score: 1204.2 bits: 230.8 E(85289): 2.5e-60
Smith-Waterman score: 960; 50.4% identity (80.1% similar) in 276 aa overlap (14-289:16-290)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MVFTQAPAEIMGHLRIRSLLARQCLAEFLGVFVLMLLTQGAVAQAVTSGETKGNFFTM
: ..: ::.. :.::::.:.:..: : ::::. : :. .:.
NP_066 MQPEGAEKGKSFKQRLVLKSSLAKETLSEFLGTFILIVLGCGCVAQAILSRGRFGGVITI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 FLAGSLAVTIAIYVGGNVSGAHLNPAFSLAMCIVGRLPWVKLPIYILVQLLSAFCASGAT
.. :.::..::::.:.:::.:.::: :::::. ::. : :::.:. .:.:.:: .....
NP_066 NVGFSMAVAMAIYVAGGVSGGHINPAVSLAMCLFGRMKWFKLPFYVGAQFLGAFVGAATV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 YVLYYDALQNYTGGNLTVTGPKETASIFATYPAPYLSLNNGFLDQVLGTGMLIVGLLAIL
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NP_066 FGIYYDGLMSFAGGKLLIVGENATAHIFATYPAPYLSLANAFADQVVATMILLIIVFAIF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 DRRNKGVPAGLEPVVVGMLILALGLSMGANCGIPLNPARDLGPRLFTYVAGWGPEVFSAG
: :: :.: ::::...:.::.... :.: : : .::::::.::::: .:::: ::: ::
NP_066 DSRNLGAPRGLEPIAIGLLIIVIASSLGLNSGCAMNPARDLSPRLFTALAGWGFEVFRAG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 NGWWWVPVVAPLVGATVGTATYQLLVALHHPEGPEPAQDLVSAQHKASELETPASAQMLE
:..::.:::.:::::..: : :.. .:::: :. . ... : . :
NP_066 NNFWWIPVVGPLVGAVIGGLIYVLVIEIHHPE-PDSVFKTEQSEDKPEKYELSVIM
250 260 270 280 290
300
pF1KE6 CKL
>>NP_004916 (OMIM: 600170,607457) aquaporin-3 isoform 1 (292 aa)
initn: 984 init1: 924 opt: 937 Z-score: 1175.5 bits: 225.5 E(85289): 9.7e-59
Smith-Waterman score: 937; 50.5% identity (78.9% similar) in 279 aa overlap (11-284:14-289)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MVFTQAPAEIMGHLRIRSLLARQCLAEFLGVFVLMLLTQGAVAQAVTSGETKGNFFT
: :.: : : :: ::: ::...:... :.:::.: : :.:.:.:
NP_004 MGRQKELVSRCGEMLHIRYR--LLRQALAECLGTLILVMFGCGSVAQVVLSRGTHGGFLT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 MFLAGSLAVTIAIYVGGNVSGAHLNPAFSLAMCIVGRLPWVKLPIYILVQLLSAFCASGA
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NP_004 INLAFGFAVTLGILIAGQVSGAHLNPAVTFAMCFLAREPWIKLPIYTLAQTLGAFLGAGI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 TYVLYYDALQNYTGGNLTVTGPKETASIFATYPAPYLSLNNGFLDQVLGTGMLIVGLLAI
.. :::::. ... ..: :.::. ::.::::::. .:.. :::.:: .::. ::: .:::
NP_004 VFGLYYDAIWHFADNQLFVSGPNGTAGIFATYPSGHLDMINGFFDQFIGTASLIVCVLAI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LDRRNKGVPAGLEPVVVGMLILALGLSMGANCGIPLNPARDLGPRLFTYVAGWGPEVFSA
.: :. :: ::: .::...:..: ::: : : .:::::.:::::: .:::: ::..
NP_004 VDPYNNPVPRGLEAFTVGLVVLVIGTSMGFNSGYAVNPARDFGPRLFTALAGWGSAVFTT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 GNGWWWVPVVAPLVGATVGTATYQLLVALHHPEGPEPAQD-----LVSAQHKASELETPA
:. :::::.:.::.:. .:. .:::... : : : :... :. ..::
NP_004 GQHWWWVPIVSPLLGSIAGVFVYQLMIGCHL-EQPPPSNEEENVKLAHVKHKEQI
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE6 SAQMLECKL
>>NP_001307565 (OMIM: 602914) aquaporin-9 isoform 3 [Hom (230 aa)
initn: 844 init1: 844 opt: 846 Z-score: 1063.0 bits: 204.4 E(85289): 1.8e-52
Smith-Waterman score: 846; 52.2% identity (81.9% similar) in 226 aa overlap (64-289:1-225)
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 LMLLTQGAVAQAVTSGETKGNFFTMFLAGSLAVTIAIYVGGNVSGAHLNPAFSLAMCIVG
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NP_001 MAVAMAIYVAGGVSGGHINPAVSLAMCLFG
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 RLPWVKLPIYILVQLLSAFCASGATYVLYYDALQNYTGGNLTVTGPKETASIFATYPAPY
:. : :::.:. .:.:.:: ...... .:::.:....::.: ..: . :: :::::::::
NP_001 RMKWFKLPFYVGAQFLGAFVGAATVFGIYYDGLMSFAGGKLLIVGENATAHIFATYPAPY
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 LSLNNGFLDQVLGTGMLIVGLLAILDRRNKGVPAGLEPVVVGMLILALGLSMGANCGIPL
::: :.: :::..: .:.. ..::.: :: :.: ::::...:.::.... :.: : : .
NP_001 LSLANAFADQVVATMILLIIVFAIFDSRNLGAPRGLEPIAIGLLIIVIASSLGLNSGCAM
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 NPARDLGPRLFTYVAGWGPEVFSAGNGWWWVPVVAPLVGATVGTATYQLLVALHHPEGPE
::::::.::::: .:::: ::: :::..::.:::.:::::..: : :.. .:::: :.
NP_001 NPARDLSPRLFTALAGWGFEVFRAGNNFWWIPVVGPLVGAVIGGLIYVLVIEIHHPE-PD
160 170 180 190 200
280 290 300
pF1KE6 PAQDLVSAQHKASELETPASAQMLECKL
. ... : . :
NP_001 SVFKTEQSEDKPEKYELSVIM
210 220 230
>>XP_016870189 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aquapori (341 aa)
initn: 805 init1: 712 opt: 802 Z-score: 1005.7 bits: 194.3 E(85289): 2.8e-49
Smith-Waterman score: 802; 43.3% identity (76.2% similar) in 261 aa overlap (20-280:32-291)
10 20 30 40
pF1KE6 MVFTQAPAEIMGHLRIRSLLARQCLAEFLGVFVLMLLTQGAVAQAVTSG
..:. ::::....:.:.. :.::. : .
XP_016 GSGHCLRSTRGSKMVSWSVIAKIQEILQRKMVREFLAEFMSTYVMMVFGLGSVAHMVLN-
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 ETKGNFFTMFLAGSLAVTIAIYVGGNVSGAHLNPAFSLAMCIVGRLPWVKLPIYILVQLL
. :... . :. ...::....:.: .::::.: : ..: : .::.:: :.:.:.: :.:
XP_016 KKYGSYLGVNLGFGFGVTMGVHVAGRISGAHMNAAVTFANCALGRVPWRKFPVYVLGQFL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 SAFCASGATYVLYYDALQNYTGGNLTVTGPKETASIFATYPAPYLSLNNGFLDQVLGTGM
..: :... : :.: :. ...::.: :::: ::.::::: ...: :::... :::
XP_016 GSFLAAATIYSLFYTAILHFSGGQLMVTGPVATAGIFATYLPDHMTLWRGFLNEAWLTGM
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 LIVGLLAILDRRNKGVPAGLEPVVVGMLILALGLSMGANCGIPLNPARDLGPRLFTYVAG
: . :.:: :..:. . : : .:.:.:.. .:.:.: : : .::.::: ::.::..::
XP_016 LQLCLFAITDQENNPALPGTEALVIGILVVIIGVSLGMNTGYAINPSRDLPPRIFTFIAG
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 WGPEVFSAGNGWWWVPVVAPLVGATVGTATYQLLVALHHPEGPEPAQDLVSAQHKASELE
:: .::: :..::::::::::.:: .: : .... :. : .: :.
XP_016 WGKQVFSNGENWWWVPVVAPLLGAYLGGIIYLVFIGSTIPREPLKLEDSVAYEDHGITVL
250 260 270 280 290 300
290 300
pF1KE6 TPASAQMLECKL
XP_016 PKMGSHEPTISPLTPVSVSPANRSSVHPAPPLHESMALEHF
310 320 330 340
>>NP_001161 (OMIM: 602974,614411) aquaporin-7 isoform 1 (342 aa)
initn: 805 init1: 712 opt: 802 Z-score: 1005.7 bits: 194.3 E(85289): 2.8e-49
Smith-Waterman score: 802; 43.3% identity (76.2% similar) in 261 aa overlap (20-280:33-292)
10 20 30 40
pF1KE6 MVFTQAPAEIMGHLRIRSLLARQCLAEFLGVFVLMLLTQGAVAQAVTSG
..:. ::::....:.:.. :.::. : .
NP_001 QASGHRRSTRGSKMVSWSVIAKIQEILQRKMVREFLAEFMSTYVMMVFGLGSVAHMVLN-
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 ETKGNFFTMFLAGSLAVTIAIYVGGNVSGAHLNPAFSLAMCIVGRLPWVKLPIYILVQLL
. :... . :. ...::....:.: .::::.: : ..: : .::.:: :.:.:.: :.:
NP_001 KKYGSYLGVNLGFGFGVTMGVHVAGRISGAHMNAAVTFANCALGRVPWRKFPVYVLGQFL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 SAFCASGATYVLYYDALQNYTGGNLTVTGPKETASIFATYPAPYLSLNNGFLDQVLGTGM
..: :... : :.: :. ...::.: :::: ::.::::: ...: :::... :::
NP_001 GSFLAAATIYSLFYTAILHFSGGQLMVTGPVATAGIFATYLPDHMTLWRGFLNEAWLTGM
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 LIVGLLAILDRRNKGVPAGLEPVVVGMLILALGLSMGANCGIPLNPARDLGPRLFTYVAG
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10 20 30 40
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]