FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1813, 329 aa 1>>>pF1KE1813 329 - 329 aa - 329 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6154+/-0.000945; mu= 14.1730+/- 0.056 mean_var=64.2241+/-12.761, 0's: 0 Z-trim(104.3): 22 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.160039 statistics sampled from 7836 (7855) to 7836 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.62), E-opt: 0.2 (0.241), width: 16 Scan time: 2.520 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS969.1 CTSK gene_id:1513|Hs108|chr1 ( 329) 2258 530.2 8.9e-151 CCDS968.1 CTSS gene_id:1520|Hs108|chr1 ( 331) 1226 291.9 4.8e-79 CCDS6675.1 CTSL gene_id:1514|Hs108|chr9 ( 333) 1131 270.0 1.9e-72 CCDS6723.1 CTSV gene_id:1515|Hs108|chr9 ( 334) 1130 269.7 2.3e-72 CCDS55634.1 CTSS gene_id:1520|Hs108|chr1 ( 281) 804 194.4 8.9e-50 CCDS10308.1 CTSH gene_id:1512|Hs108|chr15 ( 335) 803 194.2 1.2e-49 CCDS8144.1 CTSF gene_id:8722|Hs108|chr11 ( 484) 587 144.4 1.8e-34 CCDS3794.1 CTSO gene_id:1519|Hs108|chr4 ( 321) 466 116.4 3.1e-26 CCDS8117.1 CTSW gene_id:1521|Hs108|chr11 ( 376) 372 94.7 1.2e-19 CCDS8282.1 CTSC gene_id:1075|Hs108|chr11 ( 463) 286 74.9 1.4e-13 >>CCDS969.1 CTSK gene_id:1513|Hs108|chr1 (329 aa) initn: 2258 init1: 2258 opt: 2258 Z-score: 2820.4 bits: 530.2 E(32554): 8.9e-151 Smith-Waterman score: 2258; 100.0% identity (100.0% similar) in 329 aa overlap (1-329:1-329) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MWGLKVLLLPVVSFALYPEEILDTHWELWKKTHRKQYNNKVDEISRRLIWEKNLKYISIH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS96 MWGLKVLLLPVVSFALYPEEILDTHWELWKKTHRKQYNNKVDEISRRLIWEKNLKYISIH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 NLEASLGVHTYELAMNHLGDMTSEEVVQKMTGLKVPLSHSRSNDTLYIPEWEGRAPDSVD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS96 NLEASLGVHTYELAMNHLGDMTSEEVVQKMTGLKVPLSHSRSNDTLYIPEWEGRAPDSVD 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 YRKKGYVTPVKNQGQCGSCWAFSSVGALEGQLKKKTGKLLNLSPQNLVDCVSENDGCGGG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS96 YRKKGYVTPVKNQGQCGSCWAFSSVGALEGQLKKKTGKLLNLSPQNLVDCVSENDGCGGG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 YMTNAFQYVQKNRGIDSEDAYPYVGQEESCMYNPTGKAAKCRGYREIPEGNEKALKRAVA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS96 YMTNAFQYVQKNRGIDSEDAYPYVGQEESCMYNPTGKAAKCRGYREIPEGNEKALKRAVA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 RVGPVSVAIDASLTSFQFYSKGVYYDESCNSDNLNHAVLAVGYGIQKGNKHWIIKNSWGE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS96 RVGPVSVAIDASLTSFQFYSKGVYYDESCNSDNLNHAVLAVGYGIQKGNKHWIIKNSWGE 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE1 NWGNKGYILMARNKNNACGIANLASFPKM ::::::::::::::::::::::::::::: CCDS96 NWGNKGYILMARNKNNACGIANLASFPKM 310 320 >>CCDS968.1 CTSS gene_id:1520|Hs108|chr1 (331 aa) initn: 1079 init1: 449 opt: 1226 Z-score: 1532.6 bits: 291.9 E(32554): 4.8e-79 Smith-Waterman score: 1226; 55.5% identity (79.9% similar) in 328 aa overlap (6-329:7-331) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MWGLKVLLLPVVSFA-LYPEEILDTHWELWKKTHRKQYNNKVDEISRRLIWEKNLKYIS :::. . : :. . :: ::.:::::. :::..: .: ::::::::::.. 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CCDS96 NSWGHNFGEEGYIRMARNKGNHCGIASFPSYPEI 300 310 320 330 >>CCDS6675.1 CTSL gene_id:1514|Hs108|chr9 (333 aa) initn: 887 init1: 321 opt: 1131 Z-score: 1414.0 bits: 270.0 E(32554): 1.9e-72 Smith-Waterman score: 1131; 50.9% identity (76.7% similar) in 330 aa overlap (4-327:7-331) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MWGLKVLLLPVVSFALYPEEILDTHWELWKKTHRKQYNNKVDEISRRLIWEKNLKYI : .. : ..: .: .. :...: :: : . :. . .: :: .::::.:.: CCDS66 MNPTLILAAFCLGIASATLTFDHSLEAQWTKWKAMHNRLYGMN-EEGWRRAVWEKNMKMI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 SIHNLEASLGVHTYELAMNHLGDMTSEEVVQKMTGLKVPLSHSRSNDTLYIPEWEGRAPD .:: : : :.. .::: .::::::: : :.:.. . :.. .. : . .:: CCDS66 ELHNQEYREGKHSFTMAMNAFGDMTSEEFRQVMNGFQN--RKPRKGKVFQEPLFY-EAPR 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 SVDYRKKGYVTPVKNQGQCGSCWAFSSVGALEGQLKKKTGKLLNLSPQNLVDCVSE--ND :::.:.::::::::::::::::::::..::::::. .:::.:..:: :::::: . :. CCDS66 SVDWREKGYVTPVKNQGQCGSCWAFSATGALEGQMFRKTGRLISLSEQNLVDCSGPQGNE 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 GCGGGYMTNAFQYVQKNRGIDSEDAYPYVGQEESCMYNPTGKAAKCRGYREIPEGNEKAL ::.:: : :::::: : :.:::..::: . :::: ::: ..:. :. .::. .:::: CCDS66 GCNGGLMDYAFQYVQDNGGLDSEESYPYEATEESCKYNPKYSVANDTGFVDIPK-QEKAL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 KRAVARVGPVSVAIDASLTSFQFYSKGVYYDESCNSDNLNHAVLAVGYGIQK----GNKH .::: :::.::::::. :: ::..:.:.. .:.:....:.::.::::... .::. CCDS66 MKAVATVGPISVAIDAGHESFLFYKEGIYFEPDCSSEDMDHGVLVVGYGFESTESDNNKY 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE1 WIIKNSWGENWGNKGYILMARNKNNACGIANLASFPKM :..::::::.:: ::. ::... : ::::. ::.: CCDS66 WLVKNSWGEEWGMGGYVKMAKDRRNHCGIASAASYPTV 300 310 320 330 >>CCDS6723.1 CTSV gene_id:1515|Hs108|chr9 (334 aa) initn: 1121 init1: 447 opt: 1130 Z-score: 1412.7 bits: 269.7 E(32554): 2.3e-72 Smith-Waterman score: 1130; 50.6% identity (76.5% similar) in 332 aa overlap (4-329:7-334) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MWGLKVLLLPVVSFALYPEEILDTHWELWKKTHRKQYNNKVDEISRRLIWEKNLKYI : .. : ..: . .. :::.: :: :::. :. . .: :: .::::.:.: CCDS67 MNLSLVLAAFCLGIASAVPKFDQNLDTKWYQWKATHRRLYGAN-EEGWRRAVWEKNMKMI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 SIHNLEASLGVHTYELAMNHLGDMTSEEVVQKMTGLKVPLSHSRSNDTLYIPEWEGRAPD .:: : : : : . .::: .::::.:: : : .. .. :.. .. : . : CCDS67 ELHNGEYSQGKHGFTMAMNAFGDMTNEEFRQMMGCFRN--QKFRKGKVFREPLFLD-LPK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 SVDYRKKGYVTPVKNQGQCGSCWAFSSVGALEGQLKKKTGKLLNLSPQNLVDCVSE--ND :::.:::::::::::: :::::::::..::::::. .:::::..:: :::::: :. CCDS67 SVDWRKKGYVTPVKNQKQCGSCWAFSATGALEGQMFRKTGKLVSLSEQNLVDCSRPQGNQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 GCGGGYMTNAFQYVQKNRGIDSEDAYPYVGQEESCMYNPTGKAAKCRGYREIPEGNEKAL ::.::.:. :::::..: :.:::..::::. .: : : : ...:. :. . :.:::: CCDS67 GCNGGFMARAFQYVKENGGLDSEESYPYVAVDEICKYRPENSVANDTGFTVVAPGKEKAL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 KRAVARVGPVSVAIDASLTSFQFYSKGVYYDESCNSDNLNHAVLAVGYGIQKGN----KH .::: :::.:::.::. .:::::..:.:.. .:.: ::.:.::.::::.. .: :. CCDS67 MKAVATVGPISVAMDAGHSSFQFYKSGIYFEPDCSSKNLDHGVLVVGYGFEGANSNNSKY 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE1 WIIKNSWGENWGNKGYILMARNKNNACGIANLASFPKM :..::::: .::..::. .:..::: ::::. ::.:.. CCDS67 WLVKNSWGPEWGSNGYVKIAKDKNNHCGIATAASYPNV 300 310 320 330 >>CCDS55634.1 CTSS gene_id:1520|Hs108|chr1 (281 aa) initn: 1078 init1: 354 opt: 804 Z-score: 1007.1 bits: 194.4 E(32554): 8.9e-50 Smith-Waterman score: 995; 48.2% identity (68.9% similar) in 328 aa overlap (6-329:7-281) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MWGLKVLLLPVVSFA-LYPEEILDTHWELWKKTHRKQYNNKVDEISRRLIWEKNLKYIS :::. . : :. . :: ::.:::::. :::..: .: ::::::::::.. CCDS55 MKRLVCVLLVCSSAVAQLHKDPTLDHHWHLWKKTYGKQYKEKNEEAVRRLIWEKNLKFVM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 IHNLEASLGVHTYELAMNHLGDMTSEEVVQKMTGLKVPLSHSRSNDTLYIPEWEGRAPDS .:::: :.:.:.:.:.::::::: CCDS55 LHNLEHSMGMHSYDLGMNHLGDM------------------------------------- 70 80 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 VDYRKKGYVTPVKNQGQCGSCWAFSSVGALEGQLKKKTGKLLNLSPQNLVDCVSE---ND :.::.:::::.:::::.::: :::::..:: :::::: .: : CCDS55 ---------------GSCGACWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSTEKYGNK 90 100 110 120 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 GCGGGYMTNAFQYVQKNRGIDSEDAYPYVGQEESCMYNPTGKAAKCRGYREIPEGNEKAL ::.::.::.::::. :.::::. .::: .....:.:. .:: : : :.: : : .: CCDS55 GCNGGFMTTAFQYIIDNKGIDSDASYPYKAMDQKCQYDSKYRAATCSKYTELPYGREDVL 130 140 150 160 170 180 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 KRAVARVGPVSVAIDASLTSFQFYSKGVYYDESCNSDNLNHAVLAVGYGIQKGNKHWIIK :.::: :::::..:: :: .: .::::. :: ..:.::.::.:::: .:...:..: CCDS55 KEAVANKGPVSVGVDARHPSFFLYRSGVYYEPSC-TQNVNHGVLVVGYGDLNGKEYWLVK 190 200 210 220 230 240 300 310 320 pF1KE1 NSWGENWGNKGYILMARNKNNACGIANLASFPKM ::::.:.:..::: :::::.: ::::.. :.:.. CCDS55 NSWGHNFGEEGYIRMARNKGNHCGIASFPSYPEI 250 260 270 280 >>CCDS10308.1 CTSH gene_id:1512|Hs108|chr15 (335 aa) initn: 422 init1: 225 opt: 803 Z-score: 1004.7 bits: 194.2 E(32554): 1.2e-49 Smith-Waterman score: 803; 41.9% identity (68.6% similar) in 334 aa overlap (3-327:11-331) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MWGLKVLLLPVVSFA-LYPEEILDTHWELWKKTHRKQYNNKVDEISRRL-IW : .: .:: . : : . . :.. : . ::: :.. .: .:: . CCDS10 MWATLPLLCAGAWLLGVPVCGAAELCVNSLEKFHFKSWMSKHRKTYST--EEYHHRLQTF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 EKNLKYISIHNLEASLGVHTYELAMNHLGDMTSEEVVQK-MTGLKVPLSHSRSNDTLYIP .: . :. :: : ::...:.:...::. :. .: . . : ..:: :. CCDS10 ASNWRKINAHNN----GNHTFKMALNQFSDMSFAEIKHKYLWSEPQNCSATKSN---YL- 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 EWEGRAPDSVDYRKKG-YVTPVKNQGQCGSCWAFSSVGALEGQLKKKTGKLLNLSPQNLV . : : :::.:::: .:.:::::: :::::.::..::::. . :::.:.:. :.:: CCDS10 RGTGPYPPSVDWRKKGNFVSPVKNQGACGSCWTFSTTGALESAIAIATGKMLSLAEQQLV 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 DCVSE--NDGCGGGYMTNAFQYVQKNRGIDSEDAYPYVGQEESCMYNPTGKAAK-CRGYR ::... : :: :: ..::.:. :.:: .::.::: :.. : ..: ::: . CCDS10 DCAQDFNNHGCQGGLPSQAFEYILYNKGIMGEDTYPYQGKDGYCKFQP-GKAIGFVKDVA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 EIPEGNEKALKRAVARVGPVSVAIDASLTSFQFYSKGVYYDESCNS--DNLNHAVLAVGY .: .:.:. .::: .::: :.... .:..: :.: . ::.. :..::::::::: CCDS10 NITIYDEEAMVEAVALYNPVSFAFEVT-QDFMMYRTGIYSSTSCHKTPDKVNHAVLAVGY 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE1 GIQKGNKHWIIKNSWGENWGNKGYILMARNKNNACGIANLASFPKM : ..: .::.::::: .:: .::.:. :.:: ::.: ::.: CCDS10 GEKNGIPYWIVKNSWGPQWGMNGYFLIERGKN-MCGLAACASYPIPLV 290 300 310 320 330 >>CCDS8144.1 CTSF gene_id:8722|Hs108|chr11 (484 aa) initn: 583 init1: 326 opt: 587 Z-score: 732.6 bits: 144.4 E(32554): 1.8e-34 Smith-Waterman score: 588; 35.7% identity (62.6% similar) in 305 aa overlap (32-325:193-479) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 WGLKVLLLPVVSFALYPEEILDTHWELWKKTHRKQYNNKVDEISRRL-IWEKNLKYISIH :. . :..: .: :: .. .:. . . CCDS81 FSSVISLLNEDPLSQDLPVKMASIFKNFVITYNRTYESK-EEARWRLSVFVNNM--VRAQ 170 180 190 200 210 70 80 90 100 110 pF1KE1 NLEASLGVHTYELAMNHLGDMTSEE--------VVQKMTGLKVPLSHSRSNDTLYIPEWE ...: : : . ......:.: :: ...: : : .....: : ::: CCDS81 KIQA-LDRGTAQYGVTKFSDLTEEEFRTIYLNTLLRKEPGNK--MKQAKSVGDLAPPEW- 220 230 240 250 260 270 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 GRAPDSVDYRKKGYVTPVKNQGQCGSCWAFSSVGALEGQLKKKTGKLLNLSPQNLVDCVS :.:.:: :: ::.::.:::::::: .: .::: . : ::.:: :.:.:: . CCDS81 -------DWRSKGAVTKVKDQGMCGSCWAFSVTGNVEGQWFLNQGTLLSLSEQELLDCDK 280 290 300 310 320 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 ENDGCGGGYMTNAFQYVQKNRGIDSEDAYPYVGQEESCMYNPTGKAAKCRGYREIPEGNE . .: :: .::.. ... :...:: : : :. .:: .. . :. . :: CCDS81 MDKACMGGLPSNAYSAIKNLGGLETEDDYSYQGHMQSCNFSAEKAKVYINDSVELSQ-NE 330 340 350 360 370 380 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 KALKRAVARVGPVSVAIDASLTSFQFYSKGVYYDES--CNSDNLNHAVLAVGYGIQKGNK . : .:. ::.::::.: ..::: .:. :. ..:::: :::: .. CCDS81 QKLAAWLAKRGPISVAINA--FGMQFYRHGISRPLRPLCSPWLIDHAVLLVGYGNRSDVP 390 400 410 420 430 440 300 310 320 pF1KE1 HWIIKNSWGENWGNKGYILMARNKNNACGIANLASFPKM : :::::: .::.::: . :. ..:::. ..:: CCDS81 FWAIKNSWGTDWGEKGYYYLHRG-SGACGVNTMASSAVVD 450 460 470 480 >>CCDS3794.1 CTSO gene_id:1519|Hs108|chr4 (321 aa) initn: 318 init1: 297 opt: 466 Z-score: 584.4 bits: 116.4 E(32554): 3.1e-26 Smith-Waterman score: 466; 36.6% identity (63.4% similar) in 213 aa overlap (116-325:109-317) 90 100 110 120 130 140 pF1KE1 VVQKMTGLKVPLSHSRSNDTLYIPEWEGRAPDSVDYRKKGYVTPVKNQGQCGSCWAFSSV : :.: : :: :.:: .::.::::: : CCDS37 EFKAIYLRSKPSKFPRYSAEVHMSIPNVSLPLRFDWRDKQVVTQVRNQQMCGGCWAFSVV 80 90 100 110 120 130 150 160 170 180 190 200 pF1KE1 GALEGQLKKKTGKLLNLSPQNLVDCVSENDGCGGGYMTNAFQYVQKNRGIDSEDA-YPYV ::.:. : : .:: :...:: .: ::.:: ::.....: . .:. ::. CCDS37 GAVESAYAIKGKPLEDLSVQQVIDCSYNNYGCNGGSTLNALNWLNKMQVKLVKDSEYPFK 140 150 160 170 180 190 210 220 230 240 250 260 pF1KE1 GQEESCMY-NPTGKAAKCRGYREIPEGN-EKALKRAVARVGPVSVAIDASLTSFQFYSKG .:. : : . . .. . .:: .. : . .:. ::. : .:: .:.: : : CCDS37 AQNGLCHYFSGSHSGFSIKGYSAYDFSDQEDEMAKALLTFGPLVVIVDA--VSWQDYLGG 200 210 220 230 240 250 270 280 290 300 310 320 pF1KE1 VYYDESCNSDNLNHAVLAVGYGIQKGNKHWIIKNSWGENWGNKGYILMARNKNNACGIAN . .. :.: . ::::: .:. .. .::..:::: .:: :: .. .:.::::. CCDS37 II-QHHCSSGEANHAVLITGFDKTGSTPYWIVRNSWGSSWGVDGYA-HVKMGSNVCGIAD 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 LASFPKM .: CCDS37 SVSSIFV 320 >>CCDS8117.1 CTSW gene_id:1521|Hs108|chr11 (376 aa) initn: 354 init1: 180 opt: 372 Z-score: 466.0 bits: 94.7 E(32554): 1.2e-19 Smith-Waterman score: 459; 29.0% identity (58.3% similar) in 345 aa overlap (10-327:25-358) 10 20 30 40 pF1KE1 MWGLKVLLLPVVSFALYPEEI-LDTHWELWKKTHRKQYNNKVDEI :. . : :. . : ..:.. ..: . .. CCDS81 MALTAHPSCLLALLVAGLAQGIRGPLRAQDLGPQPLELKEAFKLFQIQFNRSYLSPEEHA 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 SRRLIWEKNLKYISIHNLEASLGVHTYELAMNHLGDMTSEEVVQKMTGLKVPLSHSRS-N : :. .:: . . : .:: : :.... ..:.: :: : . : . . : . CCDS81 HRLDIFAHNLAQAQ-RLQEEDLG--TAEFGVTPFSDLTEEEFGQ-LYGYRRAAGGVPSMG 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 DTLYIPEWEGRAPDSVDYRK-KGYVTPVKNQGQCGSCWAFSSVGALEGQLKKKTGKLLNL . : : .: : :.:: . ..:.:.: .:. :::....: .: . . .... CCDS81 REIRSEEPEESVPFSCDWRKVASAISPIKDQKNCNCCWAMAAAGNIETLWRISFWDFVDV 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 SPQNLVDCVSENDGCGGGYMTNAFQYVQKNRGIDSEDAYPYVGQEES--CMYNPTGKAAK : :.:.:: .::: ::.. .:: : .: :. :: ::. :. .. : . :.: CCDS81 SVQELLDCGRCGDGCHGGFVWDAFITVLNNSGLASEKDYPFQGKVRAHRCHPKKYQKVAW 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KE1 CRGYREIPEGNEKALKRAVARVGPVSVAIDASLTSFQFYSKGVYY--DESCNSDNLNHAV . . . ..::. . . .: ::..:.:. . .:.: ::: .:. . ..:.: CCDS81 IQDFIML-QNNEHRIAQYLATYGPITVTIN--MKPLQLYRKGVIKATPTTCDPQLVDHSV 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 pF1KE1 LAVGYGIQKGNK--------------------HWIIKNSWGENWGNKGYILMARNKNNAC : ::.: :... .::.::::: .::.:::. . :. .:.: CCDS81 LLVGFGSVKSEEGIWAETVSSQSQPQPPHPTPYWILKNSWGAQWGEKGYFRLHRG-SNTC 300 310 320 330 340 350 320 pF1KE1 GIANLASFPKM ::.. :: CCDS81 GITK---FPLTARVQKPDMKPRVSCPP 360 370 >>CCDS8282.1 CTSC gene_id:1075|Hs108|chr11 (463 aa) initn: 401 init1: 113 opt: 286 Z-score: 357.3 bits: 74.9 E(32554): 1.4e-13 Smith-Waterman score: 432; 31.7% identity (61.1% similar) in 306 aa overlap (39-324:158-454) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 LPVVSFALYPEEILDTHWELWKKTHRKQYNNKVDEISRRLIWEKNLKYI-SIHNLEASLG :. .. : :: .. . ... .:. .. : CCDS82 DVLGRNWACFTGKKVGTASENVYVNIAHLKNSQEKYSNRL-YKYDHNFVKAINAIQKSWT 130 140 150 160 170 180 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 VHTY-ELAMNHLGDMT--SEEVVQKMTGLK-VPLSHSRSNDTLYIPE-WEGRAPDSVDYR . :: : :::: : .:. : .::. .. :..: :. : .... 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CCDS82 FPYLIAGKYAQ-DFGLVEEACFPYTGTDSPCKMKEDCFRYYSSEYHYVGGFYGGCNEALM 310 320 330 340 350 360 240 250 260 270 280 pF1KE1 KRAVARVGPVSVAIDASLTSFQFYSKGVYYD----ESCNSDNL-NHAVLAVGYGIQK--G : ... ::..::... .: :.::.:. . : .: ::::: :::: .. : CCDS82 KLELVHHGPMAVAFEV-YDDFLHYKKGIYHHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASG 370 380 390 400 410 290 300 310 320 pF1KE1 NKHWIIKNSWGENWGNKGYILMARNKNNACGIANLASFPKM .::.::::: .::..::. . :. .. :.: ..: CCDS82 MDYWIVKNSWGTGWGENGYFRIRRG-TDECAIESIAVAATPIPKL 420 430 440 450 460 329 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 18:55:15 2016 done: Sun Nov 6 18:55:15 2016 Total Scan time: 2.520 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]